SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_2373 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_2373 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
23% identity, 99% coverage: 5:411/413 of query aligns to 4:359/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
V
 
V
C
 
A
I
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
S
T
 
S
T
 
V
A
 
A
Y
 
H
A
 
F
L
 
L
V
 
A
R
 
E
D
 
R
G
 
G
I
 
H
D
 
K
V
 
V
M
 
A
L
 
I
I
x
V
E
|
E
A
 
-
R
x
K
D
 
Q
S
 
S
F
 
I
A
 
A
S
 
S
E
|
E
T
x
A
S
|
S
F
 
K
A
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
L
 
L
S
 
G
Y
 
V
R
 
A
Y
 
Y
V
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
W
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
F
L
 
E
R
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
S
P
 
R
A
 
A
Q
 
I
W
 
F
R
 
P
W
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
L
 
L
A
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
R
Q
 
E
R
 
K
N
 
T
G
 
G
A
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
V
R
 
D
L
 
I
A
 
G
L
 
Y
L
 
E
S
 
E
Q
 
K
A
 
G
T
 
I
L
 
Y
Q
 
R
G
 
I
W
 
A
R
 
Q
D
 
N
E
 
E
D
 
D
R
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
I
L
 
L
D
 
H
G
 
I
F
 
M
D
 
D
W
 
W
R
 
Q
-
 
Q
R
 
K
N
 
T
G
 
G
K
 
E
L
 
D
V
 
S
T
 
Y
F
 
F
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
T
R
 
G
T
 
D
E
 
H
C
 
V
A
 
R
Q
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
S
P
 
-
F
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
T
 
Y
P
 
P
D
 
K
E
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
D
C
 
G
H
 
H
A
 
V
F
 
I
C
 
A
L
 
P
Q
 
E
L
 
L
V
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
F
A
 
A
R
 
H
L
 
S
K
 
A
A
 
A
S
 
I
G
 
S
R
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
I
L
 
Y
P
 
E
G
 
Q
R
 
T
T
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
I
G
 
E
D
 
N
G
 
N
A
 
K
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
I
M
 
T
G
 
S
A
 
E
Q
 
G
V
 
I
L
 
V
P
 
T
V
 
C
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
x
G
G
|
G
H
 
S
R
x
W
S
 
S
P
 
T
A
 
K
L
 
L
-
 
L
A
 
S
L
 
Y
P
 
F
G
 
H
M
 
R
N
 
D
L
 
W
P
 
G
L
 
T
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
V
L
 
V
T
 
A
M
 
V
P
 
R
I
 
S
R
 
R
T
 
K
E
 
Q
H
 
L
-
 
L
R
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
I
L
 
F
S
 
Q
I
 
-
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
N
 
E
R
 
R
K
 
F
I
 
Y
V
 
I
Y
 
T
A
 
P
R
 
K
I
 
R
G
 
G
A
 
G
Q
 
R
L
 
Y
R
 
V
V
 
I
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
M
D
 
K
I
 
P
V
 
H
G
 
T
F
 
F
D
 
N
P
 
K
A
 
T
L
 
V
D
 
Q
P
 
P
K
 
E
R
 
S
L
 
I
A
 
T
L
 
S
I
 
I
K
 
L
R
 
E
Q
 
R
A
 
A
Q
 
Y
E
 
T
T
 
I
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
L
G
 
K
D
 
E
Y
 
A
D
 
E
A
 
W
A
 
E
I
 
S
E
 
T
W
 
W
A
 
A
G
|
G
M
 
L
R
|
R
P
|
P
A
 
Q
T
 
S
P
 
N
S
 
H
G
 
E
V
 
A
P
 
P
L
 
Y
I
 
M
G
 
G
A
 
E
-
 
H
T
 
E
A
 
E
Y
 
I
R
 
K
N
 
G
L
 
L
W
 
Y
L
 
A
N
 
C
L
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
Y
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
 
L
L
 
L
A
 
S
C
 
P
G
 
I
S
 
S
A
 
G
R
 
Q
L
 
Y
L
 
M
S
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
G
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
S
 
N
I
 
H
E
 
L
M
 
L
Q
 
D
G
 
S
L
 
L
A
 
L
P
 
S
R
 
R

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
28% identity, 58% coverage: 166:403/413 of query aligns to 121:359/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
L
 
L
S
 
N
R
 
A
T
 
R
E
 
R
C
 
C
A
 
R
Q
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
P
 
-
F
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
V
 
A
A
 
V
D
 
N
C
 
P
H
 
R
A
 
E
F
 
L
C
 
T
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
I
K
 
D
A
 
V
S
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
R
R
x
A
C
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
A
G
 
D
R
 
E
T
 
R
V
 
T
T
 
P
G
 
G
I
 
V
R
 
L
H
 
L
G
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
A
 
A
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
V
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
D
Q
 
R
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
H
 
C
R
x
W
S
 
T
P
 
H
A
 
R
L
 
L
A
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
M
 
G
N
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
E
L
 
I
Y
 
A
P
 
P
L
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
Q
S
x
I
L
 
L
T
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
T
 
L
E
 
R
H
 
S
R
 
A
A
 
A
P
 
P
E
 
F
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
x
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
Y
 
G
N
 
S
R
 
G
K
 
V
I
x
Y
V
 
L
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
T
G
 
D
A
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
x
Y
D
 
E
I
 
E
V
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
T
A
 
T
L
 
V
D
 
T
P
 
A
K
 
G
R
 
G
L
 
V
A
 
A
L
 
E
I
 
L
K
 
L
R
 
G
Q
 
K
A
 
V
Q
 
L
E
 
A
T
 
V
L
 
L
P
 
P
N
 
G
A
 
A
G
 
A
D
 
E
Y
 
L
D
 
E
A
 
L
A
 
A
I
 
E
E
 
T
W
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
S
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
W
T
 
T
A
 
A
Y
 
V
R
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
L
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
A
x
R
L
x
I
G
|
G
F
x
V
T
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
M
S
 
G
E
 
E
-
 
M
L
 
L
I
 
V
A
 
T
R
 
G
R
 
R
T
 
T
P
 
P
S
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
28% identity, 58% coverage: 166:403/413 of query aligns to 121:359/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
L
 
L
S
 
N
R
 
A
T
 
R
E
 
R
C
 
C
A
 
R
Q
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
P
 
-
F
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
V
 
A
A
 
V
D
 
N
C
 
P
H
 
R
A
 
E
F
 
L
C
 
T
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
I
K
 
D
A
 
V
S
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
R
R
x
A
C
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
A
G
 
D
R
 
E
T
 
R
V
 
T
T
 
P
G
 
G
I
 
V
R
 
L
H
 
L
G
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
A
 
A
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
V
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
D
Q
 
R
L
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
H
 
C
R
x
W
S
 
T
P
 
H
A
 
R
L
 
L
A
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
M
 
G
N
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
E
L
 
I
Y
 
A
P
 
P
L
 
A
K
 
K
G
|
G
Y
 
Q
S
 
I
L
 
L
T
 
-
M
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
T
 
L
E
 
R
H
 
S
R
 
A
A
 
A
P
 
P
E
 
F
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
Y
 
G
N
 
S
R
 
G
K
 
V
I
 
Y
V
 
L
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
T
G
 
D
A
 
G
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
Y
D
 
E
I
 
E
V
 
R
G
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
T
A
 
T
L
 
V
D
 
T
P
 
A
K
 
G
R
 
G
L
 
V
A
 
A
L
 
E
I
 
L
K
 
L
R
 
G
Q
 
K
A
 
V
Q
 
L
E
 
A
T
 
V
L
 
L
P
 
P
N
 
G
A
 
A
G
 
A
D
 
E
Y
 
L
D
 
E
A
 
L
A
 
A
I
 
E
E
 
T
W
 
A
A
 
A
G
|
G
M
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
S
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
W
T
 
T
A
 
A
Y
 
V
R
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
L
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
A
x
R
L
x
I
G
|
G
F
x
V
T
x
Q
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
D
L
 
V
L
 
M
S
 
G
E
 
E
-
 
M
L
 
L
I
 
V
A
 
T
R
 
G
R
 
R
T
 
T
P
 
P
S
 
E
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 64% coverage: 140:405/413 of query aligns to 96:360/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
K
 
K
L
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
D
-
 
D
-
 
L
F
 
Y
E
 
R
H
 
H
A
 
Y
C
 
T
H
 
F
S
 
W
L
 
R
A
 
G
D
 
I
P
 
G
R
 
E
Q
 
P
Q
 
V
Q
 
Q
V
 
W
L
 
L
S
 
T
R
 
K
T
 
G
E
 
E
C
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
P
 
-
F
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
E
 
D
E
 
G
V
 
Q
A
 
V
D
 
S
C
 
A
H
 
P
A
 
D
F
 
L
C
 
A
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
A
K
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
A
C
 
C
E
 
L
F
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
Y
R
 
T
T
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
-
G
 
S
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
G
Q
 
H
A
 
V
V
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
T
A
 
G
Q
 
G
V
 
T
L
 
F
P
 
A
V
 
A
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
H
 
A
R
x
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
-
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
V
T
 
M
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
L
E
 
Q
L
 
T
S
 
T
I
 
V
T
 
F
D
 
A
Y
 
K
N
 
N
R
x
G
K
 
C
I
x
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
K
I
 
S
G
 
G
A
 
N
Q
 
R
L
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
A
|
A
M
 
T
V
 
S
D
 
T
I
 
P
V
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
R
A
 
R
L
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
G
R
 
G
L
 
V
A
 
M
L
 
N
I
x
L
K
 
L
R
 
H
Q
 
R
A
 
A
Q
 
A
E
 
H
T
 
L
L
 
V
P
 
P
N
 
D
A
 
I
G
 
E
D
 
Q
Y
 
A
D
 
E
A
 
W
A
 
V
I
 
A
E
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
M
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
-
 
P
A
 
E
Y
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
x
L
L
 
L
A
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
R
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
E
R
 
R
R
 
K
T
 
E
P
 
T
S
 
A
I
 
F
E
 
D
M
 
L

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 64% coverage: 140:405/413 of query aligns to 96:360/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
K
 
K
L
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
D
-
 
D
-
 
L
F
 
Y
E
 
R
H
 
H
A
 
Y
C
 
T
H
 
F
S
 
W
L
 
R
A
 
G
D
 
I
P
 
G
R
 
E
Q
 
P
Q
 
V
Q
 
Q
V
 
W
L
 
L
S
 
T
R
 
K
T
 
G
E
 
E
C
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
P
 
-
F
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
E
 
D
E
 
G
V
 
Q
A
 
V
D
 
S
C
 
A
H
 
P
A
 
D
F
 
L
C
 
A
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
A
K
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
A
C
 
C
E
 
L
F
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
Y
R
 
T
T
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
-
G
 
S
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
G
Q
 
H
A
 
V
V
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
T
A
 
G
Q
 
G
V
 
T
L
 
F
P
 
A
V
 
A
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
H
 
A
R
x
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
-
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
V
T
 
M
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
L
E
 
Q
L
 
T
S
 
T
I
 
V
T
 
F
D
 
A
Y
 
K
N
 
N
R
 
G
K
 
C
I
 
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
K
I
 
S
G
 
G
A
 
N
Q
 
R
L
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
S
D
 
T
I
 
P
V
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
R
A
 
R
L
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
G
R
 
G
L
 
V
A
 
M
L
 
N
I
x
L
K
 
L
R
 
H
Q
 
R
A
 
A
Q
 
A
E
 
H
T
 
L
L
 
V
P
 
P
N
 
D
A
 
I
G
 
E
D
 
Q
Y
 
A
D
 
E
A
 
W
A
 
V
I
 
A
E
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
M
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
-
 
P
A
 
E
Y
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
x
L
L
 
L
A
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
R
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
E
R
 
R
R
 
K
T
 
E
P
 
T
S
 
A
I
 
F
E
 
D
M
 
L

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
24% identity, 64% coverage: 140:405/413 of query aligns to 97:362/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
K
 
K
L
 
L
V
 
A
T
 
T
F
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
D
-
 
D
-
 
L
F
 
Y
E
 
R
H
 
H
A
 
Y
C
 
T
H
 
F
S
 
W
L
 
R
A
 
G
D
 
I
P
 
G
R
 
E
Q
 
P
Q
 
V
Q
 
Q
V
 
W
L
 
L
S
 
T
R
 
K
T
 
G
E
 
E
C
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
E
P
 
A
F
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
E
 
D
E
 
G
V
 
Q
A
 
V
D
 
S
C
 
A
H
 
P
A
 
D
F
 
L
C
 
A
L
 
A
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
A
K
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
A
C
 
C
E
 
L
F
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
Y
R
 
T
T
 
E
V
|
V
T
 
F
G
 
D
I
 
I
R
 
R
H
 
-
G
 
S
D
 
D
G
 
S
A
 
S
V
 
G
Q
 
H
A
 
V
V
 
L
E
 
D
M
 
T
G
 
T
A
 
G
Q
 
G
V
 
T
L
 
F
P
 
A
V
 
A
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
H
 
A
R
 
W
S
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
L
-
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
S
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
V
T
 
M
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
L
E
 
Q
L
 
T
S
 
T
I
 
V
T
 
F
D
 
A
Y
 
K
N
 
N
R
 
G
K
 
C
I
 
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
K
I
 
S
G
 
G
A
 
N
Q
 
R
L
 
L
R
 
L
V
 
I
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
S
D
 
T
I
 
P
V
 
G
G
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
R
A
 
R
L
 
V
D
 
S
P
 
A
K
 
G
R
 
G
L
 
V
A
 
M
L
 
N
I
 
L
K
 
L
R
 
H
Q
 
R
A
 
A
Q
 
A
E
 
H
T
 
L
L
 
V
P
 
P
N
 
D
A
 
I
G
 
E
D
 
Q
Y
 
A
D
 
E
A
 
W
A
 
V
I
 
A
E
 
S
W
 
W
A
 
S
G
 
G
M
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
-
 
P
A
 
E
Y
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
Y
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
x
L
L
 
L
A
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
R
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
E
R
 
R
R
 
K
T
 
E
P
 
T
S
 
A
I
 
F
E
 
D
M
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9AGP8 Dimethylglycine oxidase; DMGO; EC 1.5.3.10 from Arthrobacter globiformis (see 2 papers)
26% identity, 57% coverage: 162:396/413 of query aligns to 115:376/830 of Q9AGP8

query
sites
Q9AGP8
Q
 
E
Q
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
P
T
 
A
E
 
E
C
 
C
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
G
A
 
E
P
 
N
F
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
E
 
D
E
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
S
C
 
A
H
 
-
A
 
A
F
 
R
C
 
A
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
K
L
 
R
K
 
T
A
 
E
S
 
S
G
 
A
R
 
G
C
 
V
E
 
T
F
 
Y
L
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
T
T
 
T
V
|
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
E
H
 
Q
G
 
S
D
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
M
 
T
G
 
A
A
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
D
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
S
A
 
C
A
 
A
G
 
G
H
 
F
R
 
W
S
 
G
P
 
A
A
 
K
L
 
I
-
 
G
A
 
A
L
 
M
P
 
I
G
 
G
M
 
M
N
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
L
 
K
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
V
R
 
P
T
 
A
E
 
Q
H
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
R
 
N
A
 
G
P
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
P
I
 
I
T
 
L
D
 
R
Y
 
H
N
 
Q
R
 
D
K
 
Q
I
 
D
V
 
L
Y
|
Y
A
 
Y
R
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
S
-
 
Y
A
 
A
Q
 
H
L
 
R
R
 
P
V
 
M
A
 
P
A
 
V
M
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
A
F
 
Y
D
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
T
D
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
M
P
 
P
K
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
D
L
 
F
I
 
T
K
 
L
R
 
E
Q
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
Q
 
K
E
 
Q
T
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
L
G
 
A
D
 
D
Y
 
S
D
 
E
A
 
I
A
 
E
I
 
D
E
 
G
W
 
F
A
 
N
G
 
G
M
 
I
R
 
F
P
 
S
A
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
N
 
E
L
 
L
W
 
D
L
 
G
N
 
F
L
 
Y
G
 
V
H
 
A
G
 
E
A
 
A
L
x
V
G
x
W
F
x
V
T
|
T
L
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1pj6A Crystal structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folic acid (see paper)
26% identity, 57% coverage: 162:396/413 of query aligns to 113:374/828 of 1pj6A

query
sites
1pj6A
Q
 
E
Q
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
P
T
 
A
E
 
E
C
 
C
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
G
A
 
E
P
 
N
F
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
E
 
D
E
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
S
C
 
A
H
 
-
A
 
A
F
 
R
C
 
A
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
K
L
 
R
K
 
T
A
 
E
S
 
S
G
 
A
R
 
G
C
 
V
E
 
T
F
 
Y
L
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
T
T
 
T
V
|
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
E
H
 
Q
G
 
S
D
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
M
 
T
G
 
A
A
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
D
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
H
 
F
R
x
W
S
 
G
P
 
A
A
 
K
L
 
I
-
 
G
A
 
A
L
 
M
P
 
I
G
 
G
M
 
M
N
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
L
 
K
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
V
R
 
P
T
 
A
E
 
Q
H
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
R
 
N
A
 
G
P
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
P
I
 
I
T
 
L
D
 
R
Y
 
H
N
 
Q
R
 
D
K
 
Q
I
 
D
V
 
L
Y
|
Y
A
 
Y
R
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
S
-
 
Y
A
 
A
Q
 
H
L
 
R
R
 
P
V
 
M
A
 
P
A
 
V
M
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
A
F
 
Y
D
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
T
D
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
M
P
 
P
K
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
D
L
 
F
I
 
T
K
 
L
R
 
E
Q
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
Q
 
K
E
 
Q
T
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
L
G
 
A
D
 
D
Y
 
S
D
 
E
A
 
I
A
 
E
I
 
D
E
 
G
W
 
F
A
 
N
G
|
G
M
x
I
R
 
F
P
 
S
A
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
N
 
E
L
 
L
W
 
D
L
 
G
N
 
F
L
 
Y
G
 
V
H
 
A
G
 
E
A
 
A
L
x
V
G
x
W
F
x
V
T
|
T
L
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1pj7A Structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folinic acid (see paper)
26% identity, 57% coverage: 162:396/413 of query aligns to 112:373/827 of 1pj7A

query
sites
1pj7A
Q
 
E
Q
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
P
T
 
A
E
 
E
C
 
C
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
G
A
 
E
P
 
N
F
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
E
 
D
E
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
S
C
 
A
H
 
-
A
 
A
F
 
R
C
 
A
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
K
L
 
R
K
 
T
A
 
E
S
 
S
G
 
A
R
 
G
C
 
V
E
 
T
F
 
Y
L
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
T
T
|
T
V
|
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
E
H
 
Q
G
 
S
D
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
M
 
T
G
 
A
A
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
D
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
H
 
F
R
x
W
S
 
G
P
 
A
A
 
K
L
 
I
-
 
G
A
 
A
L
 
M
P
 
I
G
 
G
M
 
M
N
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
L
 
K
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
V
R
 
P
T
 
A
E
 
Q
H
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
R
 
N
A
 
G
P
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
P
I
 
I
T
 
L
D
 
R
Y
 
H
N
 
Q
R
 
D
K
 
Q
I
 
D
V
 
L
Y
|
Y
A
 
Y
R
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
S
-
 
Y
A
 
A
Q
 
H
L
 
R
R
 
P
V
 
M
A
 
P
A
 
V
M
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
A
F
 
Y
D
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
T
D
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
M
P
 
P
K
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
D
L
 
F
I
 
T
K
 
L
R
 
E
Q
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
Q
 
K
E
 
Q
T
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
L
G
 
A
D
 
D
Y
 
S
D
 
E
A
 
I
A
 
E
I
 
D
E
 
G
W
 
F
A
 
N
G
 
G
M
x
I
R
 
F
P
 
S
A
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
N
 
E
L
 
L
W
 
D
L
 
G
N
 
F
L
 
Y
G
 
V
H
 
A
G
 
E
A
 
A
L
x
V
G
x
W
F
x
V
T
|
T
L
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3gsiA Crystal structure of d552a dimethylglycine oxidase mutant of arthrobacter globiformis in complex with tetrahydrofolate (see paper)
26% identity, 57% coverage: 162:396/413 of query aligns to 112:373/827 of 3gsiA

query
sites
3gsiA
Q
 
E
Q
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
P
T
 
A
E
 
E
C
 
C
A
 
Q
Q
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
G
A
 
E
P
 
N
F
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
E
 
D
E
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
S
C
 
A
H
 
-
A
 
A
F
 
R
C
 
A
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
K
L
 
R
K
 
T
A
 
E
S
 
S
G
 
A
R
 
G
C
 
V
E
 
T
F
 
Y
L
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
T
T
|
T
V
|
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
E
H
 
Q
G
 
S
D
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
M
 
T
G
 
A
A
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
D
Q
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
H
 
F
R
x
W
S
 
G
P
 
A
A
 
K
L
 
I
-
 
G
A
 
A
L
 
M
P
 
I
G
 
G
M
 
M
N
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
L
 
K
T
 
T
M
 
T
P
 
P
I
 
V
R
 
P
T
 
A
E
 
Q
H
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
R
 
N
A
 
G
P
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
P
I
 
I
T
 
L
D
 
R
Y
 
H
N
 
Q
R
 
D
K
 
Q
I
x
D
V
 
L
Y
|
Y
A
 
Y
R
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
S
-
 
Y
A
 
A
Q
 
H
L
 
R
R
 
P
V
 
M
A
 
P
A
 
V
M
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
A
F
 
Y
D
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
T
D
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
M
P
 
P
K
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
D
L
 
F
I
 
T
K
 
L
R
 
E
Q
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
Q
 
K
E
 
Q
T
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
L
G
 
A
D
 
D
Y
 
S
D
 
E
A
 
I
A
 
E
I
 
D
E
 
G
W
 
F
A
 
N
G
|
G
M
x
I
R
x
F
P
 
S
A
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
A
 
-
Y
 
-
R
 
K
N
 
E
L
 
L
W
 
D
L
 
G
N
 
F
L
 
Y
G
 
V
H
 
A
G
 
E
A
 
A
L
x
V
G
x
W
F
x
V
T
|
T
L
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
24% identity, 75% coverage: 92:399/413 of query aligns to 46:349/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
A
|
A
A
|
A
F
x
G
L
x
M
A
 
L
A
 
S
C
 
A
R
 
H
R
 
R
S
 
E
V
 
C
N
 
E
Q
 
E
R
 
R
N
 
D
G
 
A
A
 
-
H
 
-
L
 
F
L
 
F
R
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
R
T
 
L
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
W
 
L
R
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
L
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
H
N
 
N
G
 
G
K
 
G
L
 
M
V
 
-
T
 
-
F
 
F
R
 
K
E
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
S
F
 
E
E
 
E
H
 
D
A
 
V
C
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
R
S
 
Q
L
 
M
A
 
D
D
 
D
P
 
L
R
 
D
Q
 
S
Q
 
V
Q
 
S
V
 
W
L
 
Y
S
 
S
R
 
K
T
 
E
E
 
E
C
 
V
A
 
L
Q
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
-
L
 
Y
A
 
A
E
 
S
A
 
G
P
 
D
F
 
I
V
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
D
 
D
E
 
D
E
 
V
V
 
H
A
 
V
D
 
E
C
 
P
H
 
Y
A
 
F
F
 
V
C
 
C
L
 
K
Q
 
A
L
 
Y
V
 
V
A
 
K
R
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
M
S
 
L
G
 
G
R
 
-
C
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
F
P
 
E
G
 
H
R
 
T
T
x
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
I
 
V
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
E
V
 
A
Q
 
L
A
 
F
V
 
I
E
 
K
M
 
T
G
 
P
A
 
S
Q
 
G
V
 
D
L
 
V
P
 
W
V
 
A
E
 
N
Q
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
x
S
G
|
G
H
 
V
R
x
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
x
F
A
 
F
L
 
K
P
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
N
L
 
N
P
 
A
L
 
F
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
L
T
 
S
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
W
E
 
N
H
 
D
R
 
D
A
 
I
P
 
P
E
 
L
L
 
T
S
 
K
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
Y
 
H
N
 
D
R
 
A
K
 
C
I
x
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
K
G
 
S
A
 
G
Q
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
M
D
 
K
I
 
P
V
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
P
 
E
A
 
T
L
 
P
D
 
D
P
 
L
K
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
E
L
 
S
I
 
V
K
 
M
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
T
T
 
M
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
I
G
 
Q
D
 
N
Y
 
M
D
 
K
A
 
V
A
 
D
I
 
R
E
 
F
W
 
W
A
 
A
G
|
G
M
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
A
 
P
Y
 
E
R
 
D
N
 
S
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
R
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
S
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
M
R
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
24% identity, 70% coverage: 110:399/413 of query aligns to 62:349/369 of O31616

query
sites
O31616
L
 
F
L
 
F
R
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
R
T
 
L
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
W
 
L
R
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
L
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
H
N
 
N
G
 
G
K
 
G
L
 
M
V
 
-
T
 
-
F
 
F
R
 
K
E
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
S
F
 
E
E
 
E
H
 
D
A
 
V
C
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
R
S
 
Q
L
 
M
A
 
D
D
 
D
P
 
L
R
 
D
Q
 
S
Q
 
V
Q
 
S
V
 
W
L
 
Y
S
 
S
R
 
K
T
 
E
E
 
E
C
 
V
A
 
L
Q
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
-
L
 
Y
A
 
A
E
 
S
A
 
G
P
 
D
F
 
I
V
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
D
 
D
E
 
D
E
 
V
V
 
H
A
 
V
D
 
E
C
 
P
H
 
Y
A
 
F
F
 
V
C
 
C
L
 
K
Q
 
A
L
 
Y
V
 
V
A
 
K
R
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
M
S
 
L
G
 
G
R
 
-
C
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
F
P
 
E
G
 
H
R
 
T
T
 
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
I
 
V
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
E
V
 
A
Q
 
L
A
 
F
V
 
I
E
 
K
M
 
T
G
 
P
A
 
S
Q
 
G
V
 
D
L
 
V
P
 
W
V
 
A
E
 
N
Q
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
G
H
 
V
R
 
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
 
F
A
 
F
L
 
K
P
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
N
L
 
N
P
 
A
L
 
F
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
L
T
 
S
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
W
E
 
N
H
 
D
R
 
D
A
 
I
P
 
P
E
 
L
L
 
T
S
 
K
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
Y
 
H
N
 
D
R
x
H
K
 
C
I
 
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
K
G
 
S
A
 
G
Q
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
M
D
 
K
I
 
P
V
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
P
 
E
A
 
T
L
 
P
D
 
D
P
 
L
K
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
E
L
 
S
I
 
V
K
 
M
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
T
T
 
M
L
 
L
P
 
P
N
 
A
A
 
I
G
 
Q
D
 
N
Y
 
M
D
 
K
A
 
V
A
 
D
I
 
R
E
 
F
W
 
W
A
 
A
G
 
G
M
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
A
 
P
Y
 
E
R
 
D
N
 
S
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
x
L
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
R
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
S
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
M
R
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
24% identity, 70% coverage: 110:399/413 of query aligns to 62:349/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
L
 
F
L
 
F
R
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
M
L
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
R
T
 
L
L
 
Y
Q
 
K
G
 
G
W
 
L
R
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
L
D
 
Y
R
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
I
R
|
R
R
 
Q
-
 
H
N
 
N
G
 
G
K
 
G
L
 
M
V
 
-
T
 
-
F
 
F
R
 
K
E
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
S
F
 
E
E
 
E
H
 
D
A
 
V
C
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
R
S
 
Q
L
 
M
A
 
D
D
 
D
P
 
L
R
 
D
Q
 
S
Q
 
V
Q
 
S
V
 
W
L
 
Y
S
 
S
R
 
K
T
 
E
E
 
E
C
 
V
A
 
L
Q
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
-
L
 
Y
A
 
A
E
 
S
A
 
G
P
 
D
F
 
I
V
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
D
 
D
E
 
D
E
 
V
V
 
H
A
 
V
D
 
E
C
 
P
H
 
Y
A
 
F
F
 
V
C
 
C
L
 
K
Q
 
A
L
 
Y
V
 
V
A
 
K
R
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
M
S
 
L
G
 
G
R
 
-
C
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
F
P
 
E
G
 
H
R
 
T
T
 
P
V
|
V
T
 
L
G
 
H
I
 
V
R
 
E
H
 
R
G
 
-
D
 
D
G
 
G
A
 
E
V
 
A
Q
 
L
A
 
F
V
 
I
E
 
K
M
 
T
G
 
P
A
 
S
Q
 
G
V
 
D
L
 
V
P
 
W
V
 
A
E
 
N
Q
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
x
S
G
|
G
H
 
V
R
x
W
S
 
S
P
 
G
A
 
M
L
x
F
A
 
F
L
 
K
P
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
N
L
 
N
P
 
A
L
 
F
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
L
T
 
S
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
W
E
 
N
H
 
D
R
 
D
A
 
I
P
 
P
E
 
L
L
 
T
S
 
K
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
Y
 
H
N
 
D
R
 
H
K
 
C
I
x
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
K
G
 
S
A
 
G
Q
x
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
M
D
 
K
I
 
P
V
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
S
P
 
E
A
 
T
L
 
P
D
 
D
P
 
L
K
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
E
L
 
S
I
 
V
K
 
M
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
T
T
 
M
L
 
L
P
 
P
N
 
P
A
 
I
G
 
Q
D
 
N
Y
 
M
D
 
K
A
 
V
A
 
D
I
 
R
E
 
F
W
 
W
A
 
A
G
|
G
M
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
G
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
A
 
P
Y
 
E
R
 
D
N
 
S
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
F
A
x
R
L
x
N
G
|
G
F
x
I
T
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
R
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
S
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
M
R
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
25% identity, 65% coverage: 130:396/413 of query aligns to 83:346/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
L
 
I
D
 
S
G
 
G
F
 
I
D
 
D
W
 
I
R
 
R
R
 
R
-
 
H
N
 
D
G
 
G
K
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
K
F
 
L
R
 
A
E
 
F
A
 
S
A
 
E
S
 
S
F
 
D
E
 
R
H
 
E
A
 
H
C
 
L
H
 
M
S
 
Q
L
 
M
A
 
G
D
 
A
P
 
L
R
 
D
Q
 
S
Q
 
V
Q
 
E
V
 
W
L
 
L
S
 
E
R
 
A
T
 
D
E
 
E
C
 
V
A
 
Y
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
N
L
 
A
A
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
-
F
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
N
Y
 
F
T
 
I
P
 
R
D
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
P
V
 
A
A
 
A
D
 
V
C
 
C
H
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
A
L
 
R
Q
 
G
L
 
-
V
 
-
A
 
A
R
 
R
L
 
M
K
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
D
R
 
V
C
 
F
E
 
E
F
 
Y
L
 
T
P
 
P
G
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
V
T
 
L
G
 
S
I
 
I
R
 
E
H
 
S
G
 
E
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
A
 
-
V
 
V
E
 
T
M
 
S
G
 
A
A
 
S
Q
 
G
V
 
T
L
 
A
P
 
E
V
 
A
E
 
E
Q
 
H
L
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
H
 
V
R
 
W
S
 
S
P
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
F
L
 
K
P
 
Q
-
 
I
G
 
G
M
 
L
N
 
D
L
 
K
P
 
R
L
 
F
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
L
 
L
T
 
S
M
 
V
P
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
W
H
 
N
R
 
D
A
 
G
P
 
I
E
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
R
T
 
T
D
 
L
Y
 
Y
N
 
H
R
 
D
K
 
H
-
 
C
I
 
Y
V
 
I
Y
 
V
A
 
P
R
 
R
I
 
H
G
 
S
A
 
G
Q
 
R
L
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
T
V
 
M
D
 
K
I
 
P
V
 
G
G
 
D
F
 
W
D
 
N
P
 
E
A
 
Q
L
 
P
D
 
E
P
 
L
K
 
G
R
 
G
L
 
I
A
 
E
L
 
E
I
 
L
K
 
I
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
S
T
 
M
L
 
L
P
 
P
N
 
G
A
 
I
G
 
E
D
 
S
Y
 
M
D
 
K
A
 
I
A
 
D
I
 
Q
E
 
C
W
 
W
A
 
A
G
 
G
M
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
E
T
 
T
P
 
G
S
 
D
G
 
G
V
 
N
P
 
P
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
A
 
P
Y
 
E
R
 
N
N
 
D
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
L
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
F
A
 
R
L
 
N
G
 
G
F
x
I
T
 
L
L
 
L
A
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
R
 
E
L
 
M
L
x
M
S
 
A
E
 
D
L
 
M
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_2373 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_2373
MAQRVCIIGGGVIGLTTAYALVRDGIDVMLIEARDSFASETSFANGGQLSYRYVAPLADA
GVPLQALGWMLRGDSPLKLRPRLDPAQWRWMAAFLAACRRSVNQRNGAHLLRLALLSQAT
LQGWRDEDRLDGFDWRRNGKLVTFREAASFEHACHSLADPRQQQVLSRTECAQLEPALAE
APFVGAIYTPDEEVADCHAFCLQLVARLKASGRCEFLPGRTVTGIRHGDGAVQAVEMGAQ
VLPVEQLVIAAGHRSPALALPGMNLPLYPLKGYSLTMPIRTEHRAPELSITDYNRKIVYA
RIGAQLRVAAMVDIVGFDPALDPKRLALIKRQAQETLPNAGDYDAAIEWAGMRPATPSGV
PLIGATAYRNLWLNLGHGALGFTLACGSARLLSELIARRTPSIEMQGLAPRVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory