SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_2375 Glutamate Aspartate periplasmic binding protein precursor GltI (TC 3.A.1.3.4) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
53% identity, 90% coverage: 24:294/300 of query aligns to 2:272/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
P
 
P
L
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
T
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
K
V
 
I
A
 
A
N
 
K
A
 
N
K
 
G
S
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
-
D
 
D
H
 
N
T
 
Q
G
 
Q
Q
 
K
P
 
V
M
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
K
K
 
K
L
 
L
E
 
N
L
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
G
x
T
V
 
N
T
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
M
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
T
F
 
I
I
 
F
Y
 
V
V
 
V
K
 
G
G
 
T
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
K
 
K
S
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
V
F
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
L
N
 
N
V
 
E
D
 
E
H
 
Q
K
 
K
I
 
M
D
 
N
M
 
M
F
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
Y
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
|
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
K
D
 
K
P
 
P
H
 
D
K
 
N
W
 
W
V
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
E
 
P
Q
 
Q
S
 
S
R
 
Q
E
|
E
I
 
A
Y
|
Y
S
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
L
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
S
 
D
T
 
T
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
Y
 
Q
S
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
G
 
K
I
 
W
Y
 
F
N
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
E
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
F
A
 
K
K
 
E
P
 
P

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
32% identity, 74% coverage: 49:270/300 of query aligns to 16:225/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
E
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
G
Q
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
L
 
F
P
 
K
D
 
P
L
 
M
Q
 
D
V
x
F
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
-
Y
 
F
V
 
E
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
Y
 
V
N
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
V
K
 
K
I
 
V
D
 
K
M
 
K
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
-
R
 
-
A
 
Y
K
 
V
A
 
K
R
 
Q
D
 
N
P
 
P
H
 
N
K
 
A
W
 
G
V
 
V
-
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
T
Q
 
F
S
 
S
R
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
S
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
S
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
33% identity, 69% coverage: 62:268/300 of query aligns to 38:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
T
E
 
K
R
 
K
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
L
P
 
G
D
 
D
L
 
N
-
 
G
Q
 
K
V
 
T
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
E
V
 
V
T
 
T
S
|
S
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
V
F
 
Y
I
 
F
Y
 
D
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
S
 
S
F
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
N
G
 
A
K
 
S
-
 
T
N
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
A
T
 
V
A
 
K
G
|
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
A
R
 
A
F
 
N
L
 
I
K
 
R
S
 
Q
Y
 
H
N
 
A
V
 
P
D
 
D
H
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
-
M
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
L
S
 
E
A
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
A
 
D
A
 
A
F
 
M
Y
 
T
M
x
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
I
A
 
A
R
 
D
D
 
E
P
 
N
H
 
P
K
 
E
W
 
Y
V
 
E
V
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
G
E
 
T
Q
 
F
S
 
T
R
 
N
E
|
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
Q
P
 
E
Q
 
N
F
 
F
L
 
L
E
 
K
L
 
A
V
 
V
N
 
N
S
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
H
S
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
32% identity, 73% coverage: 49:268/300 of query aligns to 16:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
E
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
G
Q
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
L
 
F
P
 
K
D
 
P
L
 
M
Q
 
D
V
x
F
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
-
Y
 
F
V
 
E
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
Y
 
V
N
 
A
V
 
K
D
 
D
H
 
A
K
 
G
I
 
V
D
 
K
M
 
-
F
 
-
V
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
Y
R
 
V
A
 
K
K
 
-
A
 
-
R
 
Q
D
 
N
P
 
P
H
 
N
K
 
A
W
 
G
V
 
V
-
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
T
Q
 
F
S
 
S
R
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
S
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
S
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
N
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
31% identity, 80% coverage: 29:269/300 of query aligns to 2:229/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
E
V
 
I
A
 
M
N
 
K
A
 
R
K
 
G
S
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
x
D
D
 
A
A
 
D
S
x
Y
V
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
K
T
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
Y
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
I
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
E
I
 
L
K
 
G
Q
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
F
N
 
V
L
 
P
V
 
T
T
 
T
S
x
W
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
M
Y
 
T
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
N
G
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
I
K
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
N
G
 
K
K
 
P
N
 
D
V
 
V
V
 
K
T
 
V
T
 
A
A
 
V
-
x
Q
-
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
E
Y
 
F
N
 
L
V
 
P
D
 
K
H
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
R
M
 
T
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
E
D
 
N
H
 
N
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
V
Q
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
A
 
A
F
 
M
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
S
-
 
P
-
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
R
 
L
A
 
A
K
 
V
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
K
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
D
E
 
E
E
 
P
Q
 
F
S
 
T
R
 
H
E
 
E
I
 
P
Y
 
L
S
 
G
C
 
F
M
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
N
T
 
W
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
L
Y
 
Y
N
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
K

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
31% identity, 74% coverage: 49:270/300 of query aligns to 22:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
P
 
P
F
 
F
S
x
E
Y
 
F
V
 
V
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
N
G
 
G
Q
 
N
P
 
I
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
R
R
 
R
I
 
L
K
 
G
Q
 
V
K
 
E
L
 
L
E
 
K
L
 
I
P
 
V
D
 
D
L
 
M
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
T
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
F
Y
 
D
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
V
A
 
R
K
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
D
I
 
F
-
 
R
-
 
P
K
 
K
S
 
T
F
 
Y
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
G
E
 
D
R
 
I
F
 
E
L
 
V
K
 
S
S
 
K
Y
 
Y
N
 
D
V
 
-
D
 
-
H
 
-
K
 
-
I
 
-
D
 
G
M
 
I
F
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
G
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
A
Y
 
R
G
 
A
E
 
F
R
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
N
R
 
P
D
 
D
P
 
-
H
 
-
K
 
-
W
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
S
G
 
S
E
 
G
E
 
V
Q
 
L
S
 
S
R
 
S
E
 
E
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
E
D
 
D
P
 
T
Q
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
I
N
 
N
S
 
S
T
 
V
L
 
L
A
 
R
D
 
E
L
 
L
Y
 
K
S
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
Y
N
 
D
G
 
V
I
 
L
Y
 
I
N
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
S
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
28% identity, 76% coverage: 39:266/300 of query aligns to 13:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
V
 
V
G
 
-
D
 
D
H
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
N
M
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
K
K
 
D
I
 
L
V
 
A
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
K
Q
 
D
K
 
L
L
 
L
E
 
G
L
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
-
Q
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
T
T
x
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
G
x
T
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
M
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
A
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
M
Y
 
K
V
 
V
K
 
A
G
 
L
Q
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
S
A
 
P
K
 
K
D
 
N
S
 
K
G
 
P
I
 
I
K
 
T
S
 
D
F
 
M
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
Q
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
A
E
 
D
R
 
A
F
 
F
L
 
F
K
 
T
S
 
K
Y
 
S
N
x
H
V
 
P
D
x
E
H
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
L
M
 
K
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
x
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
Q
 
D
M
 
A
L
 
L
Q
 
K
S
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
A
 
V
A
 
A
F
 
L
Y
 
A
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
G
 
A
E
 
-
R
 
W
A
 
A
K
 
K
A
 
-
R
 
E
D
 
N
P
 
P
H
 
N
K
 
F
W
 
E
V
 
V
V
 
A
V
 
I
G
 
G
E
 
N
E
 
L
Q
 
G
S
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
F
Y
 
I
S
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
Q
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
A
Q
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
G
T
 
E
L
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
L
N
 
K
G
 
A
I
 
A
Y
 
Y
N
 
E
R
 
K

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 75% coverage: 50:274/300 of query aligns to 65:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
F
E
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
x
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
M
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
S
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
x
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
x
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
R
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
x
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
E
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
S
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
N
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
Q
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 75% coverage: 50:274/300 of query aligns to 64:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
F
E
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
x
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
M
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
S
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
R
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
x
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
E
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
S
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
N
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
Q
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 75% coverage: 50:274/300 of query aligns to 64:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
F
E
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
x
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
M
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
S
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
R
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
x
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
E
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
S
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
N
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
Q
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
28% identity, 77% coverage: 39:270/300 of query aligns to 3:224/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
I
 
I
T
 
V
L
 
M
G
 
G
Y
 
T
R
x
S
D
 
A
A
x
D
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
x
E
Y
 
F
V
 
H
G
 
K
D
 
V
H
 
E
T
 
G
G
 
G
Q
 
K
P
 
D
-
 
E
-
 
I
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
K
 
G
Q
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
K
D
 
D
L
 
M
Q
 
D
V
x
F
K
 
K
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
M
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
L
F
 
Y
I
 
Y
Y
 
D
V
 
S
K
 
R
G
 
Q
Q
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
V
A
 
K
K
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
S
S
 
K
F
 
F
A
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
V
K
 
K
N
 
T
V
 
I
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
E
F
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
K
Y
 
I
-
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
K
H
 
L
K
 
K
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
Q
A
 
L
K
 
N
D
 
R
H
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
E
F
 
F
Q
 
M
M
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
A
 
D
A
 
A
F
 
I
Y
 
V
M
 
V
D
x
E
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
A
Y
 
K
G
 
A
E
 
Y
R
 
L
A
 
K
K
 
E
A
 
Y
R
 
K
D
 
D
P
 
-
H
 
M
K
 
K
W
 
I
V
 
L
V
 
Y
V
 
M
G
 
D
E
 
E
E
 
I
Q
 
N
S
 
N
R
 
V
E
 
E
I
 
N
Y
 
G
S
 
S
C
 
A
M
 
V
-
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
N
S
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
L
Y
 
K
S
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
L
Y
 
V
N
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
K
Q
 
Q

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 9:241/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
T
 
S
L
 
F
N
 
E
K
 
E
V
 
I
A
 
K
N
 
R
A
 
S
K
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
x
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
R
G
 
N
Q
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
|
S
T
x
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
A
Q
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
S
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
R
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
S
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 9:241/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
T
 
S
L
 
F
N
 
E
K
 
E
V
 
I
A
 
K
N
 
R
A
 
S
K
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
R
G
 
N
Q
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
|
S
T
x
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
A
Q
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
S
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
R
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
S
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

3vvdA Crystal structure of ttc0807 complexed with ornithine (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 9:241/241 of 3vvdA

query
sites
3vvdA
T
 
S
L
 
F
N
 
E
K
 
E
V
 
I
A
 
K
N
 
R
A
 
S
K
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
R
G
 
N
Q
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
|
S
T
x
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
A
Q
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
S
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
R
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
S
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 5:237/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
T
 
S
L
 
F
N
 
E
K
 
E
V
 
I
A
 
K
N
 
R
A
 
S
K
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
x
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
R
G
 
N
Q
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
S
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
|
S
T
x
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
M
 
A
Q
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
S
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
R
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
S
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

4ohnA Crystal structure of an abc uptake transporter substrate binding protein from streptococcus pneumoniae with bound histidine
25% identity, 81% coverage: 32:275/300 of query aligns to 8:246/246 of 4ohnA

query
sites
4ohnA
K
 
K
V
 
Y
A
 
Q
N
 
S
A
 
N
K
 
K
S
 
S
I
 
I
T
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
 
F
R
x
D
D
 
S
A
 
T
S
x
F
V
 
V
P
 
P
F
 
M
S
 
G
Y
 
F
V
 
A
G
 
-
D
 
Q
H
 
K
T
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
Y
M
 
A
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
A
I
 
V
V
 
F
E
 
E
R
 
K
I
 
Y
K
 
G
Q
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
I
Q
 
T
V
 
V
K
 
N
Y
 
W
N
 
Q
L
 
P
V
 
I
T
 
D
S
x
W
Q
 
D
T
 
L
R
 
K
I
 
E
P
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
T
N
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
W
G
x
N
S
x
G
T
x
Y
G
x
S
V
 
A
T
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
M
 
R
Q
 
E
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
N
G
 
S
F
 
Y
I
 
M
Y
 
K
V
 
N
K
 
E
G
 
Q
Q
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
T
S
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
M
R
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
L
V
 
G
T
 
A
T
x
Q
A
 
A
G
 
G
T
x
S
T
x
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
A
N
 
N
E
 
P
R
 
E
F
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
N
Y
 
I
N
 
V
V
 
A
D
 
N
H
 
K
K
 
E
I
 
A
D
 
N
M
 
Q
F
 
Y
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
Q
D
 
T
H
 
F
G
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
L
Q
 
I
M
 
D
L
 
L
Q
 
K
S
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
G
F
 
L
Y
 
L
M
 
I
D
|
D
D
 
R
-
 
V
-
 
Y
A
 
A
L
 
N
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
E
K
 
G
A
 
V
R
 
L
D
 
N
P
 
D
H
 
Y
K
 
N
W
 
V
V
 
F
V
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
L
E
 
E
Q
 
-
S
 
-
R
 
T
E
 
E
I
 
A
Y
 
F
S
 
A
C
 
V
M
 
G
V
 
S
R
 
R
K
 
K
G
 
E
D
 
D
P
 
T
Q
 
T
F
 
L
L
 
V
E
 
K
L
 
K
V
 
I
N
 
N
S
 
E
T
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
S
L
 
L
Y
 
Y
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
F
N
 
Q
G
 
E
I
 
I
Y
 
S
N
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
Q
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
A
P
 
T
K
 
K

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
26% identity, 75% coverage: 29:254/300 of query aligns to 6:220/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
T
 
S
L
 
L
N
 
D
K
 
K
V
 
I
A
 
K
N
 
Q
A
 
N
K
 
G
S
 
V
I
 
V
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
V
 
V
G
 
-
D
 
D
H
 
E
T
 
K
G
 
G
Q
 
N
P
 
N
M
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
D
V
 
I
D
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
K
R
 
R
I
 
I
K
 
A
Q
 
K
K
 
E
L
 
L
E
 
F
L
 
G
P
 
D
D
 
E
L
 
N
Q
 
K
V
 
V
K
 
Q
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
F
V
 
L
Q
 
K
N
 
S
G
 
N
T
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
G
x
T
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
E
 
Q
R
|
R
M
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
C
Y
 
S
G
 
P
F
 
Y
I
 
M
Y
 
K
V
 
V
K
 
A
G
 
L
Q
 
G
L
 
V
L
 
A
T
 
V
A
 
P
K
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
N
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
K
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
L
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
A
E
 
D
R
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
A
Y
 
Y
N
 
F
V
 
T
D
 
Q
H
 
N
K
 
Y
I
 
P
D
 
N
M
 
I
F
 
K
V
 
T
I
 
L
S
 
K
A
 
Y
K
 
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
Q
 
A
M
 
A
L
 
L
Q
 
M
S
 
D
G
 
K
R
 
R
A
 
G
A
 
D
A
 
A
F
 
L
Y
 
S
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
T
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
G
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
K
 
W
A
 
V
R
 
K
D
 
D
-
 
H
P
 
P
H
 
D
K
 
F
W
 
K
V
 
M
V
 
G
V
 
I
G
 
K
E
 
E
E
 
L
Q
 
G
S
 
N
R
 
K
E
 
D
I
 
V
Y
 
I
S
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
P
 
K
Q
 
E
F
 
L
L
 
K
E
 
E
L
 
F
V
 
I
N
 
D
S
 
N
T
 
L
L
 
I
A
 
I
D
 
K
L
 
L

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
25% identity, 80% coverage: 28:267/300 of query aligns to 1:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
G
 
G
T
 
K
L
 
L
N
 
E
K
 
S
V
 
I
A
 
K
N
 
S
A
 
K
K
 
G
S
 
Q
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
Y
 
V
R
x
K
D
 
N
A
 
D
S
 
V
V
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
V
 
L
G
 
D
D
 
Q
H
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
A
S
 
K
K
 
L
I
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
S
I
 
I
K
 
L
Q
 
G
K
 
D
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
L
 
K
Q
 
K
V
 
I
K
 
K
Y
 
L
N
 
V
L
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
F
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
M
 
K
Q
 
R
Q
 
I
V
 
Y
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
E
G
 
P
F
 
Y
I
 
Y
Y
 
Q
V
 
D
K
 
A
G
 
I
Q
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
K
G
 
K
I
 
Y
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
M
R
 
K
G
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
I
-
 
G
V
 
V
T
 
A
T
 
Q
A
 
A
G
x
A
T
|
T
T
 
T
N
 
K
E
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
K
Y
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
H
 
V
K
 
K
I
 
F
D
 
S
M
 
E
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
P
D
 
D
H
x
Y
G
 
P
E
 
S
A
 
I
F
 
K
Q
 
A
M
 
A
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
F
Y
 
S
M
 
V
D
|
D
D
 
K
A
 
S
L
x
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
E
 
Y
R
 
V
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
D
H
 
D
K
 
K
W
 
S
V
 
E
V
 
I
V
 
L
G
 
P
E
 
D
E
 
S
Q
 
F
S
 
E
R
 
P
E
x
Q
I
 
S
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
V
V
 
T
R
 
K
K
 
K
G
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
K
L
 
Y
V
 
V
N
 
D
S
 
D
T
 
F
L
 
V
A
 
K
D
 
E
L
 
-
Y
 
-
S
 
H
S
 
K
G
 
N
E
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
A
I
 
L
Y
 
A
N
 
K
R
 
K
W
 
W

4z9nB Abc transporter / periplasmic binding protein from brucella ovis with glutathione bound
28% identity, 67% coverage: 58:259/300 of query aligns to 35:236/324 of 4z9nB

query
sites
4z9nB
G
 
G
Q
 
E
P
 
W
M
 
S
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
Y
A
 
C
S
 
R
K
 
A
I
 
V
V
 
A
E
 
S
R
 
A
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
K
 
-
L
 
F
E
 
G
L
 
D
P
 
P
D
 
-
L
 
T
Q
 
K
V
 
V
K
 
K
Y
 
F
N
 
T
L
 
P
V
 
L
T
x
N
S
x
A
Q
 
K
T
 
E
R
|
R
I
 
F
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
L
C
 
I
G
x
R
S
x
N
T
|
T
G
x
T
V
 
W
T
 
T
A
 
I
E
 
S
R
|
R
M
 
D
Q
 
T
Q
 
S
V
 
L
A
 
G
F
 
L
S
 
D
Y
 
F
-
 
A
G
 
G
F
 
I
I
 
N
Y
 
Y
V
 
Y
K
 
D
G
 
G
Q
 
Q
-
 
G
-
 
F
-
 
M
L
 
I
L
 
N
T
 
S
A
 
K
K
 
K
D
 
L
S