SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_3233 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_3233 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

5mzyB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with a possible transition state analog (see paper)
27% identity, 95% coverage: 1:245/259 of query aligns to 3:233/244 of 5mzyB

query
sites
5mzyB
M
 
L
T
 
D
Y
 
I
T
 
T
T
 
P
N
 
A
E
 
E
M
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
K
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
G
V
 
V
C
 
V
F
 
A
V
 
T
G
|
G
I
x
V
G
 
A
L
 
S
P
 
P
S
 
L
K
 
A
-
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
I
N
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
T
S
 
H
S
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
x
C
S
 
V
G
 
G
P
 
S
I
 
L
G
 
D
A
 
P
K
 
E
-
 
I
P
 
P
S
 
T
V
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
S
S
 
S
I
 
E
G
 
D
D
 
L
G
 
G
E
 
Y
L
 
L
-
 
D
A
 
G
E
 
R
T
 
S
A
 
A
D
 
E
T
 
I
V
 
T
V
x
I
P
 
P
T
 
-
G
 
-
E
 
D
I
 
L
F
|
F
R
 
D
Y
 
H
W
 
-
L
 
A
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
E
G
 
G
N
 
R
I
 
T
N
 
N
T
 
M
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
H
 
D
A
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
G
x
A
G
|
G
A
 
A
P
 
A
E
 
T
I
x
L
A
 
R
G
 
Q
S
 
W
A
 
V
K
 
R
S
 
R
-
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
V
L
 
P
K
 
R
Q
 
Q
S
 
S
A
 
R
R
 
R
S
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
I
 
A
T
 
T
S
 
T
V
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
R
D
 
D
S
 
P
R
 
R
K
 
R
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
G
 
T
I
 
L
I
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
C
 
G
I
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
G
H
 
A
E
 
R
F
 
L
V
 
L
V
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
R
H
 
H
P
 
P
G
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
A
E
 
A
Q
 
H
V
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
A
 
A
I
 
F
R
 
Q
F
 
V
A
 
S
D
 
E
Q
 
A
V
 
L
E
 
S
N
 
V
T
 
T
A
 
S
E
 
L
P
 
P
T
 
D
K
 
A
L
 
R
E
 
T
L
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
A
L
 
I
E
 
D

5mzzB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 3- methylglutaconate (see paper)
28% identity, 93% coverage: 4:245/259 of query aligns to 3:230/241 of 5mzzB

query
sites
5mzzB
T
 
T
T
 
P
N
 
A
E
 
E
M
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
K
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
G
V
 
V
C
 
V
F
 
A
V
 
T
G
|
G
I
x
V
G
 
A
L
 
S
P
 
P
S
 
L
K
 
A
-
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
I
N
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
T
S
 
H
S
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
x
C
S
 
V
G
 
G
P
 
S
I
 
L
G
 
D
A
 
P
K
 
E
-
 
I
P
 
P
S
 
T
V
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
S
S
 
S
I
 
E
G
 
D
D
 
L
G
 
G
E
 
Y
L
 
L
-
 
D
A
 
G
E
 
R
T
 
S
A
 
A
D
 
E
T
 
I
V
 
T
V
x
I
P
 
P
T
 
-
G
 
-
E
 
D
I
 
L
F
|
F
R
 
D
Y
 
H
W
 
-
L
 
A
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
E
G
 
G
N
 
R
I
 
T
N
 
N
T
 
M
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
H
 
D
A
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
G
x
A
G
|
G
A
|
A
P
 
A
E
 
T
I
x
L
A
 
R
G
 
Q
S
 
W
A
 
V
K
 
R
S
 
R
-
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
V
L
 
P
K
 
R
Q
 
Q
S
 
S
A
 
R
R
 
R
S
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
I
 
A
T
 
T
S
 
T
V
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
R
D
 
D
S
 
P
R
 
R
K
 
R
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
G
 
T
I
 
L
I
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
C
 
G
I
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
G
H
 
A
E
 
R
F
 
L
V
 
L
V
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
R
H
 
H
P
 
P
G
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
A
E
 
A
Q
 
H
V
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
A
 
A
I
 
F
R
 
Q
F
 
V
A
 
S
D
 
E
Q
 
A
V
 
L
E
 
S
N
 
V
T
 
T
A
 
S
E
 
L
P
 
P
T
 
D
K
 
A
L
 
R
E
 
T
L
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
A
L
 
I
E
 
D

5mzxB Crystal structure of the decarboxylase aiba/aibb in complex with 4'- diphospho pantetheine (see paper)
28% identity, 93% coverage: 4:245/259 of query aligns to 3:230/241 of 5mzxB

query
sites
5mzxB
T
 
T
T
 
P
N
 
A
E
 
E
M
 
T
M
 
V
T
 
V
V
 
S
A
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
K
 
D
N
 
D
G
 
G
S
 
G
V
 
V
C
 
V
F
 
A
V
 
T
G
|
G
I
x
V
G
x
A
L
x
S
P
 
P
S
 
L
K
 
A
-
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
I
N
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
A
T
 
T
S
 
H
S
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
A
E
 
C
S
 
V
G
 
G
P
 
S
I
 
L
G
 
D
A
 
P
K
 
E
-
 
I
P
 
P
S
 
T
V
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
S
S
 
S
I
 
E
G
 
D
D
 
L
G
 
G
E
 
Y
L
 
L
-
 
D
A
 
G
E
 
R
T
 
S
A
 
A
D
 
E
T
 
I
V
 
T
V
 
I
P
 
P
T
 
-
G
 
-
E
 
D
I
 
L
F
 
F
R
 
D
Y
 
H
W
 
-
L
 
A
Q
 
R
G
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
T
G
 
V
F
 
F
L
x
F
G
|
G
A
|
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
E
G
 
G
N
 
R
I
 
T
N
 
N
T
x
M
T
 
T
V
 
A
V
 
S
G
 
G
D
 
S
Y
 
L
H
 
D
A
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
T
R
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
G
 
A
G
 
G
A
|
A
P
 
A
E
 
T
I
 
L
A
 
R
G
 
Q
S
 
W
A
 
V
K
 
R
S
 
R
-
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
V
L
 
P
K
 
R
Q
 
Q
S
 
S
A
 
R
R
 
R
S
 
N
F
 
L
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
F
 
V
I
 
A
T
 
T
S
 
T
V
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
R
D
 
D
S
 
P
R
 
R
K
 
R
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
G
 
T
I
 
L
I
 
I
T
 
S
D
 
D
L
 
L
C
 
G
I
 
V
M
 
F
E
 
E
P
 
L
E
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
G
H
 
A
E
 
R
F
 
L
V
 
L
V
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
R
H
 
H
P
 
P
G
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
A
E
 
A
Q
 
H
V
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
A
 
A
I
 
F
R
 
Q
F
 
V
A
 
S
D
 
E
Q
 
A
V
 
L
E
 
S
N
 
V
T
 
T
A
 
S
E
 
L
P
 
P
T
 
D
K
 
A
L
 
R
E
 
T
L
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
A
L
 
I
E
 
D

6cojB Crystal structure of rhodococcus jostii rha1 ipdab e105a cochea-coa complex (see paper)
28% identity, 83% coverage: 29:244/259 of query aligns to 31:235/248 of 6cojB

query
sites
6cojB
L
 
L
P
 
P
S
 
L
K
 
I
A
 
G
A
 
A
N
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
T
S
 
T
S
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
L
I
 
I
Y
 
F
E
 
A
S
 
D
G
 
T
P
 
P
-
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
P
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
G
V
 
W
V
 
M
P
 
P
T
 
F
G
 
R
E
 
K
I
x
V
F
|
F
R
 
D
Y
 
V
W
 
V
L
 
A
Q
 
S
G
 
G
G
 
R
R
|
R
I
 
H
D
 
V
V
 
V
G
 
-
F
 
-
L
x
M
G
|
G
A
|
A
A
x
N
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
R
F
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
Q
N
 
N
T
x
L
T
 
S
V
 
A
V
x
F
G
 
G
D
 
P
Y
 
L
H
 
Q
A
 
Q
P
 
P
K
x
T
V
x
R
R
 
Q
L
 
M
P
 
F
G
 
G
A
 
V
G
x
R
G
|
G
A
 
A
P
 
P
E
 
G
I
x
N
A
 
T
G
 
I
S
 
N
A
 
H
K
 
P
S
 
T
V
 
S
L
 
Y
I
 
W
I
 
V
L
 
G
K
 
K
Q
 
H
S
 
T
A
 
S
R
|
R
S
 
V
F
 
F
V
 
C
D
 
D
K
 
T
L
 
V
D
 
D
F
 
I
I
 
V
T
 
S
S
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
D
E
 
Q
G
 
I
G
 
D
D
 
P
S
 
E
R
 
N
K
 
P
R
 
A
L
 
Y
G
 
R
L
 
F
P
 
H
G
 
H
A
 
L
G
 
H
P
 
R
V
 
V
G
 
-
I
 
-
I
 
V
T
 
S
D
 
N
L
 
L
C
 
G
I
 
V
M
 
F
E
 
D
P
 
F
E
 
G
A
 
G
D
 
P
T
 
D
H
 
H
E
 
T
F
 
F
V
 
R
V
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
A
E
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
D
A
 
N
T
 
T
G
 
S
W
 
F
A
 
E
I
 
V
R
 
A
F
 
G
A
 
L
D
 
A
Q
 
D
V
 
A
E
 
G
N
 
V
T
 
T
A
 
R
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
D
L
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
L
L
 
I
R
 
R
D
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Q0S7Q0 Cholesterol ring-cleaving hydrolase IpdB subunit; (3E)-2-(2-carboxylatoethyl)-3-methyl-6-oxocyclohex-1-ene-1-carboxyl-CoA hydrolase beta subunit; COCHEA-CoA hydrolase beta subunit; EC 4.1.99.- from Rhodococcus jostii (strain RHA1) (see paper)
28% identity, 83% coverage: 29:244/259 of query aligns to 36:240/253 of Q0S7Q0

query
sites
Q0S7Q0
L
 
L
P
 
P
S
 
L
K
 
I
A
 
G
A
 
A
N
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
T
S
 
T
S
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
L
V
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
x
E
-
 
A
L
 
L
I
 
I
Y
 
F
E
 
A
S
 
D
G
 
T
P
 
P
-
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
P
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
G
V
 
W
V
 
M
P
 
P
T
 
F
G
 
R
E
 
K
I
 
V
F
 
F
R
 
D
Y
 
V
W
 
V
L
 
A
Q
 
S
G
 
G
G
 
R
R
|
R
I
 
H
D
 
V
V
 
V
G
 
-
F
 
-
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
N
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
R
 
R
F
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
Q
N
 
N
T
 
L
T
 
S
V
 
A
V
 
F
G
 
G
D
 
P
Y
 
L
H
 
Q
A
 
Q
P
 
P
K
 
T
V
 
R
R
 
Q
L
 
M
P
 
F
G
 
G
A
 
V
G
x
R
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
G
I
 
N
A
 
T
G
 
I
S
 
N
A
 
H
K
 
P
S
 
T
V
 
S
L
 
Y
I
 
W
I
 
V
L
 
G
K
 
K
Q
 
H
S
 
T
A
 
S
R
 
R
S
 
V
F
 
F
V
 
C
D
 
D
K
 
T
L
 
V
D
 
D
F
 
I
I
 
V
T
 
S
S
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
Y
G
 
D
E
 
Q
G
 
I
G
 
D
D
 
P
S
 
E
R
 
N
K
 
P
R
 
A
L
 
Y
G
 
R
L
 
F
P
 
H
G
 
H
A
 
L
G
 
H
P
 
R
V
 
V
G
 
-
I
 
-
I
 
V
T
 
S
D
 
N
L
 
L
C
 
G
I
 
V
M
 
F
E
 
D
P
 
F
E
 
G
A
 
G
D
 
P
T
 
D
H
 
H
E
 
T
F
 
F
V
 
R
V
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
A
E
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
D
A
 
N
T
 
T
G
 
S
W
 
F
A
 
E
I
 
V
R
 
A
F
 
G
A
 
L
D
 
A
Q
 
D
V
 
A
E
 
G
N
 
V
T
 
T
A
 
R
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
D
L
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
R
A
 
L
L
 
I
R
 
R
D
 
E
L
 
V

Q29551 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial; SCOT; 3-oxoacid CoA-transferase 1; Somatic-type succinyl-CoA:3-oxoacid CoA-transferase; SCOT-s; Succinate-coenzyme A transferase; Succinyl-CoA:3-oxoacid CoA transferase; EC 2.8.3.5 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
27% identity, 58% coverage: 7:155/259 of query aligns to 303:452/520 of Q29551

query
sites
Q29551
E
 
E
M
 
R
M
 
I
T
 
I
V
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
F
K
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
M
V
 
Y
C
 
A
F
 
N
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
S
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
S
N
 
N
L
 
F
A
 
-
R
 
-
L
 
I
T
 
S
S
 
P
S
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
P
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
Y
V
 
P
L
 
L
P
 
Q
L
 
N
S
 
E
I
 
V
G
 
-
D
 
D
G
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
N
T
 
A
A
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
P
 
P
T
 
G
G
 
A
E
 
S
I
 
Y
F
 
F
R
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
W
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
N
 
D
I
 
L
N
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
D
 
N
Y
 
W
H
 
M
A
 
I
P
 
P
K
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
T
-
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
V
I
 
T
L
 
M
K
 
E
Q
 
H
S
 
S
A
 
A
R
 
K
S
 
G
F
 
N
V
 
A
D
 
H
K
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3k6mC Dynamic domains of succinyl-coa:3-ketoacid-coenzyme a transferase from pig heart. (see paper)
27% identity, 58% coverage: 7:155/259 of query aligns to 250:399/466 of 3k6mC

query
sites
3k6mC
E
 
E
M
 
R
M
 
I
T
 
I
V
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
F
K
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
M
V
 
Y
C
 
A
F
 
N
V
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
S
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
S
N
 
N
L
 
F
A
 
-
R
 
-
L
 
I
T
 
S
S
 
P
S
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
P
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
Y
V
 
P
L
 
L
P
 
Q
L
 
N
S
 
E
I
 
V
G
 
-
D
 
D
G
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
N
T
x
A
A
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
P
 
P
T
 
G
G
 
A
E
 
S
I
 
Y
F
 
F
R
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
W
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
N
 
D
I
 
L
N
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
D
 
N
Y
 
W
H
 
M
A
 
I
P
 
P
K
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
|
G
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
D
I
 
L
A
x
V
G
 
S
S
|
S
A
|
A
K
 
K
S
x
T
-
 
K
V
|
V
L
 
V
I
 
V
I
 
T
L
 
M
K
 
E
Q
 
H
S
 
S
A
 
A
R
 
K
S
 
G
F
 
N
V
 
A
D
 
H
K
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1o9lA Succinate:coenzyme-a transferase (pig heart)
27% identity, 58% coverage: 7:155/259 of query aligns to 251:400/468 of 1o9lA

query
sites
1o9lA
E
 
E
M
 
R
M
 
I
T
 
I
V
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
F
K
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
M
V
 
Y
C
 
A
F
 
N
V
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
S
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
S
N
 
N
L
 
F
A
 
-
R
 
-
L
 
I
T
 
S
S
 
P
S
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
 
E
S
 
N
G
 
G
P
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
Y
V
 
P
L
 
L
P
 
Q
L
 
N
S
 
E
I
 
V
G
 
-
D
 
D
G
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
N
T
 
A
A
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
P
 
P
T
 
G
G
 
A
E
 
S
I
 
Y
F
 
F
R
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
W
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
N
 
D
I
 
L
N
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
D
 
N
Y
 
W
H
 
M
A
 
I
P
 
P
K
 
G
V
 
K
R
 
L
L
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
T
-
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
V
I
 
T
L
 
M
K
 
E
Q
 
H
S
 
S
A
 
A
R
 
K
S
 
G
F
 
N
V
 
A
D
 
H
K
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3oxoE Succinyl-coa:3-ketoacid coa transferase from pig heart covalently bound to coa (see paper)
28% identity, 55% coverage: 13:155/259 of query aligns to 252:395/462 of 3oxoE

query
sites
3oxoE
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
E
L
 
F
K
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
M
V
 
Y
C
 
A
F
 
N
V
 
L
G
 
G
I
|
I
G
|
G
L
x
I
P
 
P
S
 
L
K
 
L
A
 
A
A
 
S
N
 
N
L
 
F
A
 
-
R
 
-
L
 
I
T
 
S
S
 
P
S
 
N
P
 
M
D
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
L
I
 
Q
Y
 
S
E
|
E
S
 
N
G
 
G
P
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
Y
V
 
P
L
 
L
P
 
Q
L
 
N
S
 
E
I
 
V
G
 
-
D
 
D
G
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
N
T
 
A
A
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
P
 
P
T
 
G
G
 
A
E
 
S
I
 
Y
F
 
F
R
 
S
Y
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
A
W
 
M
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
D
 
N
V
 
L
G
 
T
F
 
M
L
 
L
G
|
G
A
|
A
A
x
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
N
 
D
I
 
L
N
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
A
D
x
N
Y
 
W
H
 
M
A
x
I
P
 
P
K
 
G
V
 
K
R
x
L
L
 
V
P
x
K
G
|
G
A
x
M
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
T
-
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
V
I
 
T
L
 
M
K
x
E
Q
 
H
S
 
S
A
|
A
R
x
K
S
 
G
F
 
N
V
 
A
D
 
H
K
|
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_3233 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_3233
MTYTTNEMMTVAAARRLKNGSVCFVGIGLPSKAANLARLTSSPDVVLIYESGPIGAKPSV
LPLSIGDGELAETADTVVPTGEIFRYWLQGGRIDVGFLGAAQVDRFGNINTTVVGDYHAP
KVRLPGAGGAPEIAGSAKSVLIILKQSARSFVDKLDFITSVGHGEGGDSRKRLGLPGAGP
VGIITDLCIMEPEADTHEFVVTALHPGVTREQVIAATGWAIRFADQVENTAEPTKLELTA
LRDLEARTAAAHGQAPGEA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory