SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_3564 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_3564 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5vwrA E.Coli aspartate aminotransferase-(1r,3s,4s)-3-amino-4- fluorocyclopentane-1-carboxylic acid (fcp)-alpha-ketoglutarate (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 5vwrA

query
sites
5vwrA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
|
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

5t4lA Plp and gaba trigger gabr-mediated transcription regulation in bacillus subsidies via external aldimine formation (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 5t4lA

query
sites
5t4lA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
|
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

3qpgA Crystal structures of escherichia coli aspartate aminotransferase reconstituted with 1-deaza-pyridoxal 5'-phosphate: internal aldimine and stable l-aspartate external aldimine (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 3qpgA

query
sites
3qpgA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
|
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

3pa9A Mechanism of inactivation of e. Coli aspartate aminotransferase by (s)-4-amino-4,5-dihydro-2-furancarboxylic acid (s-adfa) ph 7.5 (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 3pa9A

query
sites
3pa9A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1x2aA Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-d- glutamic acid (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1x2aA

query
sites
1x2aA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
|
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
|
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
|
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1x29A Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-2- methyl-l-glutamic acid (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1x29A

query
sites
1x29A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
|
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
|
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1x28A Crystal structure of e.Coli aspat complexed with n-phosphopyridoxyl-l- glutamic acid (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1x28A

query
sites
1x28A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
|
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
|
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
|
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1cq8A Aspartate aminotransferase (E.C. 2.6.1.1) complexed with c6-pyridoxal- 5p-phosphate (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1cq8A

query
sites
1cq8A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1cq7A Aspartate aminotransferase (E.C. 2.6.1.1) complexed with c5-pyridoxal- 5p-phosphate (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1cq7A

query
sites
1cq7A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
G
|
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
|
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1cq6A Aspartate aminotransferase complex with c4-pyridoxal-5p-phosphate (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1cq6A

query
sites
1cq6A
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1c9cA Aspartate aminotransferase complexed with c3-pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1c9cA

query
sites
1c9cA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
V
K
 
K
L
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
L
 
L
V
 
L
D
 
E
R
 
N
Q
 
E
P
 
T
T
 
T
K
 
K
T
 
N
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
I
H
 
D
G
 
G
D
 
I
A
 
P
A
 
E
F
 
F
G
 
G
K
 
R
V
 
C
I
 
T
N
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
N
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
R
A
 
T
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
S
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
N
L
 
T
P
 
S
G
 
V
R
 
K
G
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
W
|
W
P
 
P
I
 
N
H
 
H
E
 
K
T
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
R
H
 
E
Y
 
Y
P
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
D
S
 
A
D
 
E
N
 
N
R
 
H
-
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
N
V
 
S
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
P
 
Q
K
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
F
H
 
H
A
 
G
C
 
C
C
 
C
H
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
I
D
 
D
L
 
P
S
 
T
H
 
L
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
T
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
V
 
L
V
 
S
R
 
V
S
 
E
R
 
K
D
 
G
L
 
W
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
F
D
|
D
F
 
F
A
|
A
Y
|
Y
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
W
 
E
S
 
G
T
 
L
R
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
M
L
 
H
P
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
I
I
 
V
T
 
A
S
 
S
S
|
S
C
 
Y
S
|
S
K
|
K
N
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
R
 
N
D
 
E
R
|
R
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
C
I
 
T
V
 
L
C
 
V
A
 
A
K
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
E
K
 
T
L
 
V
V
 
D
D
 
R
I
 
A
R
 
F
S
 
S
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
N
 
A
I
 
A
A
 
I
R
 
R
N
 
A
L
 
N
W
 
Y
S
 
S
T
 
N
P
 
P
P
 
P
D
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
S
D
 
N
P
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
R
S
 
A
R
 
I
W
 
W
A
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
Q
Q
 
R
L
 
M
R
 
R
S
 
Q
G
 
L
L
 
F
V
 
V
E
 
N
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
N
E
 
R
R
 
D
F
 
F
A
 
S
H
 
F
I
 
I
G
 
I
V
 
K
Q
 
Q
R
 
N
G
 
G
M
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
H
 
F
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
T
A
 
P
T
 
D
R
 
N
L
 
M
D
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
A
V
 
V

1aslA Crystal structures of escherichia coli aspartate aminotransferase in two conformations: comparison of an unliganded open and two liganded closed forms (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:395/397 of query aligns to 2:395/396 of 1aslA

query
sites
1aslA
F
 
F
D
 
E
A
 
N
I
 
I
G
 
T
R
 
A
V
 
A
P
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
P
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
 
F
A
 
R
Q
 
A
D
 
D
P
 
E
N
 
R
P
 
P
R
 
G
K
 
K
F
 
I
D
 
N