SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_3585 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_3585 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2gnaA Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-gal (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 3:320/329 of 2gnaA

query
sites
2gnaA
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
 
P
I
 
I
T
|
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
x
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

2gn9A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glc (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 3:320/329 of 2gn9A

query
sites
2gn9A
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
|
L
S
|
S
T
|
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
|
P
I
 
I
T
|
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
x
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

2gn6A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glcnac (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 3:320/329 of 2gn6A

query
sites
2gn6A
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
 
L
S
|
S
T
 
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
V
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
|
P
I
|
I
T
 
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
x
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

2gn4A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADPH and udp-glcnac (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 3:320/329 of 2gn4A

query
sites
2gn4A
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
|
L
S
|
S
T
|
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
V
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
|
P
I
 
I
T
|
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
x
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

2gn8A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 1:318/327 of 2gn8A

query
sites
2gn8A
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
V
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
|
P
I
|
I
T
|
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
x
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

O25511 UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting); Pseudaminic acid biosynthesis protein B; UDP-GlcNAc-inverting 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.115 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
61% identity, 96% coverage: 1:319/333 of query aligns to 7:324/333 of O25511

query
sites
O25511
M
 
M
F
 
L
N
 
D
G
 
N
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
K
N
 
C
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
T
Y
 
T
Q
 
N
P
 
A
K
 
K
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
|
E
L
|
L
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
S
E
 
E
M
 
M
Q
 
A
Q
 
M
T
 
E
F
 
F
N
 
N
A
 
D
P
 
P
C
 
R
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
N
Q
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
V
 
C
V
 
I
H
 
H
A
|
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
L
E
 
E
C
 
C
I
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
S
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
I
K
 
S
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
A
L
|
L
S
|
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
A
 
S
A
 
A
N
 
N
N
 
N
I
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
E
L
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
I
R
 
R
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
G
 
G
V
 
V
K
 
S
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
R
M
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
I
P
 
P
S
 
S
I
 
M
R
 
K
I
 
M
V
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
A
G
 
P
H
 
N
L
 
T
P
 
P
H
 
T
K
 
K
N
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
L
H
 
H
E
 
E
L
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
H
M
 
L
T
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
E
D
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
S
 
T
I
 
I
R
 
S
F
 
F
T
 
Q
S
 
T
V
 
P
D
 
K
V
 
-
D
 
D
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
D
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
H
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
K
V
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
R
 
S
S
 
S
D
 
H
T
 
N
N
 
N
P
 
N
H
 
Q
F
 
W
L
 
L

3w1vA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with inihibitor (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:326/333 of query aligns to 11:331/347 of 3w1vA

query
sites
3w1vA
F
 
F
N
 
D
G
 
D
K
 
K
S
 
I
I
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
G
R
 
N
N
 
A
F
 
V
I
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
Y
 
-
Q
 
N
P
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
R
V
 
I
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
D
M
 
I
Q
 
R
Q
 
K
T
 
K
F
 
Y
N
 
N
A
 
N
P
 
S
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
R
 
S
L
 
V
R
 
E
Q
 
T
A
 
A
M
 
M
R
 
R
G
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
K
|
K
Q
|
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
C
E
 
E
Y
 
F
N
 
F
P
 
P
T
 
V
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
I
G
 
G
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
H
N
 
Q
G
 
N
V
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
C
L
 
L
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
I
T
 
S
K
 
K
L
 
A
L
 
M
S
 
M
D
 
E
K
 
K
L
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
S
N
 
R
I
 
N
A
 
I
G
 
R
E
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
L
F
 
I
A
 
C
V
 
G
V
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
A
 
M
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
F
x
L
F
 
F
S
 
I
K
 
D
L
 
K
I
 
I
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
-
K
 
E
E
 
P
L
 
L
P
x
T
I
|
I
T
|
T
D
 
D
E
 
P
R
 
D
M
|
M
T
 
T
R
|
R
F
 
F
W
 
L
I
 
M
T
 
S
L
 
L
D
 
E
H
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
E
F
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
H
S
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
H
M
 
A
H
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
P
 
Q
K
 
K
I
 
A
P
 
P
S
 
S
I
 
S
R
 
T
I
x
V
V
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
A
M
 
L
A
 
L
G
 
E
H
 
L
L
 
F
P
 
E
H
 
A
K
 
D
N
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
T
R
|
R
P
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
K
H
 
A
E
 
E
L
 
T
M
 
L
V
 
L
P
 
T
L
 
R
D
 
E
D
 
E
A
 
Y
R
 
A
M
 
Q
T
 
C
L
 
E
E
 
D
F
 
M
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
T
 
R
I
 
V
Q
 
P
P
 
A
S
 
D
I
 
S
R
 
R
F
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
L
A
 
N
V
 
Y
D
 
S
K
 
N
L
 
Y
G
 
V
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
-
 
N
R
 
E
P
 
K
V
 
I
S
 
T
E
 
Q
D
 
S
F
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
R
 
N
S
 
S
D
 
D
T
 
-
N
 
N
P
 
T
H
 
H
F
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
E
Q
 
E
I
 
I
A
 
K
D
 
E

4g5hA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with by-product (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:326/333 of query aligns to 11:331/346 of 4g5hA

query
sites
4g5hA
F
 
F
N
 
D
G
 
D
K
 
K
S
 
I
I
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
N
N
 
A
F
 
V
I
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
Y
 
-
Q
 
N
P
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
R
V
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
K
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
D
M
 
I
Q
 
R
Q
 
K
T
 
K
F
 
Y
N
 
N
A
 
N
P
 
S
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
R
 
S
L
 
V
R
 
E
Q
 
T
A
 
A
M
 
M
R
 
R
G
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
|
Q
V
|
V
P
 
P
A
 
S
A
 
C
E
 
E
Y
 
F
N
 
F
P
 
P
T
 
V
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
I
G
 
G
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
H
N
 
Q
G
 
N
V
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
C
L
|
L
S
 
S
T
|
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
I
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
M
S
 
M
D
 
E
K
 
K
L
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
S
N
 
R
I
 
N
A
 
I
G
 
R
E
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
L
F
 
I
A
 
C
V
 
G
V
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
A
 
M
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
F
x
L
F
 
F
S
 
I
K
 
D
L
 
K
I
 
I
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
-
K
 
E
E
 
P
L
 
L
P
x
T
I
 
I
T
|
T
D
 
D
E
 
P
R
 
D
M
|
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
L
I
 
M
T
 
S
L
 
L
D
 
E
H
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
E
F
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
H
S
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
H
M
 
A
H
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
P
 
Q
K
 
K
I
 
A
P
 
P
S
 
S
I
 
S
R
 
T
I
x
V
V
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
A
M
 
L
A
 
L
G
 
E
H
 
L
L
 
F
P
 
E
H
 
A
K
 
D
N
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
T
R
|
R
P
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
K
H
 
A
E
 
E
L
 
T
M
 
L
V
 
L
P
 
T
L
 
R
D
 
E
D
 
E
A
x
Y
R
 
A
M
 
Q
T
 
C
L
 
E
E
 
D
F
 
M
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
T
 
R
I
 
V
Q
 
P
P
 
A
S
 
D
I
 
S
R
 
R
F
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
L
A
 
N
V
 
Y
D
 
S
K
 
N
L
 
Y
G
 
V
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
-
 
N
R
 
E
P
 
K
V
 
I
S
 
T
E
 
Q
D
x
S
F
x
Y
E
|
E
Y
|
Y
R
 
N
S
 
S
D
 
D
T
 
-
N
|
N
P
 
T
H
 
H
F
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
E
Q
 
E
I
 
I
A
 
K
D
 
E

3vvcA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape , k126e, in apo form (see paper)
38% identity, 98% coverage: 2:326/333 of query aligns to 3:303/318 of 3vvcA

query
sites
3vvcA
F
 
F
N
 
D
G
 
D
K
 
K
S
 
I
I
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
 
S
F
|
F
G
 
G
R
 
N
N
 
A
F
 
V
I
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
Y
 
-
Q
 
N
P
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
R
V
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
K
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
D
M
 
I
Q
 
R
Q
 
K
T
 
K
F
 
Y
N
 
N
A
 
N
P
 
S
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
|
R
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
R
 
S
L
 
V
R
 
E
Q
 
T
A
 
A
M
 
M
R
 
R
G
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
C
E
 
E
Y
 
F
N
 
F
P
 
P
T
 
V
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
I
G
 
G
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
H
N
 
Q
G
 
N
V
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
C
L
 
L
S
|
S
T
|
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
I
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
M
S
 
M
D
 
E
K
 
K
L
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
S
N
 
R
I
 
N
A
 
I
G
 
R
E
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
L
F
 
I
A
 
C
V
 
G
V
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
A
 
M
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
P
F
 
L
F
 
F
S
 
I
K
 
D
L
 
K
I
 
I
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
-
K
 
E
E
 
P
L
 
L
P
 
T
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
P
R
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
L
I
 
M
T
 
S
L
 
L
D
 
E
H
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
E
F
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
H
S
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
H
M
 
A
H
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
P
 
Q
K
 
K
I
 
A
P
 
P
S
 
S
I
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
A
M
 
L
A
 
L
G
 
E
H
 
L
L
 
F
P
 
E
H
 
A
K
 
D
N
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
T
R
 
R
P
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
K
H
 
A
E
 
E
L
 
T
M
 
L
V
 
L
P
 
T
L
 
R
D
 
E
D
 
E
A
 
Y
R
 
A
M
 
Q
T
 
C
L
 
E
E
 
D
F
 
M
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
T
 
R
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
V
S
 
P
E
 
A
D
 
D
F
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
R
 
N
S
 
S
D
 
D
T
 
-
N
 
N
P
 
T
H
 
H
F
 
I
L
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
E
Q
 
E
I
 
I
A
 
K
D
 
E

4j2oC Crystal structure of NADP-bound wbjb from a. Baumannii community strain d1279779 (see paper)
43% identity, 84% coverage: 1:279/333 of query aligns to 1:282/316 of 4j2oC

query
sites
4j2oC
M
 
M
F
 
F
N
 
K
G
 
D
K
 
K
S
 
V
I
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
N
N
 
A
F
 
V
I
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
E
Q
 
T
Y
 
-
Q
 
D
P
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
R
V
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
K
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
D
M
 
M
Q
 
R
Q
 
K
T
 
K
F
 
Y
N
 
H
A
 
S
P
 
A
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
Y
E
 
N
R
 
S
L
 
I
R
 
L
Q
 
N
A
 
A
M
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
Y
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
C
E
 
E
Y
 
F
N
 
H
P
 
P
T
 
M
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
K
T
|
T
N
 
N
V
 
V
N
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
Q
N
 
N
G
 
H
V
 
V
K
 
K
K
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
C
L
|
L
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
V
S
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
I
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
M
S
 
M
D
 
E
K
 
K
L
 
V
F
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
S
N
 
R
I
 
N
A
 
L
G
 
E
E
 
G
Q
 
L
Q
 
D
T
 
T
R
 
V
F
 
I
A
 
C
V
 
G
V
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
M
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
P
F
 
L
F
 
F
S
 
V
K
 
D
L
 
Q
I
 
I
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
-
K
 
K
E
 
P
L
 
L
P
 
T
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
P
R
 
N
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
M
I
 
M
T
 
T
L
 
L
D
 
E
H
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
D
F
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
Y
S
 
A
F
 
F
A
 
E
R
 
H
M
 
G
H
 
E
G
 
N
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
Q
K
 
K
I
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
A
R
 
T
I
 
I
V
 
A
D
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
E
G
 
A
M
 
L
A
 
K
G
 
Q
H
 
L
L
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
H
P
 
P
H
 
I
K
 
S
N
 
I
V
 
M
G
 
G
I
 
T
R
 
R
P
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
A
H
 
F
E
 
E
L
 
A
M
 
L
V
 
L
P
 
S
L
 
R
D
 
E
D
 
E
A
 
M
R
 
V
M
 
H
T
 
A
L
 
F
E
 
D
F
 
Q
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
F
T
 
R
I
 
V

6bwcC X-ray structure of pen from bacillus thuringiensis (see paper)
40% identity, 84% coverage: 2:282/333 of query aligns to 3:291/327 of 6bwcC

query
sites
6bwcC
F
 
F
N
 
K
G
 
D
K
 
K
S
 
N
I
 
V
F
 
L
I
 
I
S
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
R
 
K
N
 
S
F
 
I
I
 
L
R
 
S
R
 
N
L
 
V
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
Y
 
-
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
R
 
V
V
 
V
V
 
R
V
 
V
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
x
S
E
 
E
L
 
Y
K
 
N
Q
 
Q
Y
 
F
E
 
L
M
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
T
 
E
F
 
F
N
 
R
A
 
D
P
 
K
C
 
N
-
 
R
-
 
N
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
F
 
L
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
D
 
N
A
 
Y
E
 
D
R
 
R
L
 
V
R
 
F
Q
 
S
A
 
A
M
 
M
R
 
E
G
 
N
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
V
A
|
A
A
 
A
L
 
M
K
|
K
Q
x
H
V
 
V
P
 
S
A
 
F
A
 
C
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
F
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
L
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
F
G
 
G
A
 
T
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
A
N
 
Q
G
 
K
V
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
F
L
x
T
S
 
S
T
x
S
D
x
N
K
 
A
A
 
A
A
 
I
S
 
S
P
 
P
I
 
T
N
 
N
L
 
N
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
L
 
L
L
 
T
S
 
A
D
 
E
K
 
R
L
 
L
F
 
I
V
 
T
A
 
S
A
 
A
N
 
E
N
 
Y
I
 
S
A
 
K
G
 
G
E
 
S
Q
 
S
Q
 
E
T
 
T
R
 
T
F
 
F
A
 
T
V
 
S
V
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
 
G
N
|
N
V
|
V
A
 
M
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
F
x
L
F
 
F
S
 
E
K
 
N
L
 
Q
I
 
I
A
 
K
E
 
E
G
 
N
A
 
Q
K
 
K
E
 
-
L
 
I
P
x
T
I
 
V
T
|
T
D
 
D
E
 
L
R
 
S
M
|
M
T
 
S
R
|
R
F
 
F
W
 
M
I
 
M
T
 
T
L
 
L
D
 
N
H
 
Q
G
 
A
V
 
T
K
 
M
F
 
L
V
 
T
L
 
I
D
 
E
S
 
A
F
 
M
A
 
K
R
 
I
M
 
A
H
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
T
F
 
F
V
 
I
P
 
L
K
 
K
I
 
M
P
 
P
S
 
V
I
 
I
R
 
S
I
x
L
V
 
N
D
 
D
L
 
L
A
 
S
L
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
I
G
 
E
H
 
E
L
 
V
P
 
T
H
 
K
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
I
K
 
E
N
 
E
V
 
I
G
 
G
I
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
M
H
 
Y
E
 
E
L
 
E
M
 
L
V
 
M
P
 
T
L
 
H
D
 
D
D
 
E
A
 
S
R
 
L
M
 
Q
T
 
A
L
 
F
E
 
E
F
 
L
D
 
P
D
 
D
H
 
M
Y
 
F
T
 
I
I
 
I
Q
 
-
P
 
P
S
 
S

3vvbA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in apo form (see paper)
40% identity, 72% coverage: 2:240/333 of query aligns to 1:213/270 of 3vvbA

query
sites
3vvbA
F
 
F
N
 
D
G
 
D
K
 
K
S
 
I
I
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
F
|
F
G
 
G
R
 
N
N
 
A
F
 
V
I
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
Y
 
-
Q
 
N
P
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
R
V
 
I
F
 
F
S
|
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
K
K
|
K
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
D
M
 
I
Q
 
R
Q
 
K
T
 
K
F
 
Y
N
 
N
A
 
N
P
 
S
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
F
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
R
 
S
L
 
V
R
 
E
Q
 
T
A
 
A
M
 
M
R
 
R
G
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
C
E
 
E
Y
 
F
N
 
F
P
 
P
T
 
V
E
 
E
C
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
I
G
 
G
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
H
N
 
Q
G
 
N
V
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
C
L
|
L
S
 
S
T
|
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
P
 
P
I
 
I
N
 
N
L
 
A
Y
 
M
G
 
G
A
 
I
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
M
S
 
M
D
 
E
K
 
K
L
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
S
N
 
R
I
 
N
A
 
I
G
 
R
E
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
L
F
 
I
A
 
C
V
 
G
V
 
T
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
A
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
M
P
 
P
I
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
D
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
L
I
 
M
T
 
S
L
 
L
D
 
E
H
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
E
F
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
H
S
 
A
F
 
F
A
 
K
R
 
H
M
 
A
H
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
P
 
Q
K
 
K
I
 
A
P
 
P
S
 
S
I
 
S
R
 
T
I
 
V
V
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
A
M
 
L

4tqgA Crystal structure of megavirus udp-glcnac 4,6-dehydratase, 5-epimerase mg534 (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:292/333 of query aligns to 3:276/297 of 4tqgA

query
sites
4tqgA
F
 
I
N
 
N
G
 
D
K
 
K
S
 
T
I
 
I
F
 
M
I
 
I
S
 
F
G
|
G
G
 
G
T
x
S
G
|
G
S
|
S
F
x
L
G
 
G
R
 
N
N
 
-
F
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
I
E
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
Q
 
I
P
 
N
K
 
N
R
 
N
V
 
I
V
 
I
V
 
V
-
 
N
F
 
Y
S
 
S
R
|
R
D
|
D
E
 
E
L
 
S
K
 
K
Q
 
H
Y
 
W
E
 
S
M
 
M
Q
 
E
Q
 
L
T
 
K
F
 
Y
N
 
K
A
 
S
P
 
D
C
 
K
M
 
L
R
 
K
Y
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
D
 
D
A
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
V
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
I
R
 
M
G
 
R
I
 
I
-
 
N
-
 
P
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
V
 
I
H
 
I
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
I
P
 
D
A
 
R
A
 
C
E
 
E
Y
 
Y
N
 
E
P
 
I
T
 
N
E
 
E
C
 
C
I
 
L
R
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
I
N
 
K
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
V
A
 
T
I
 
E
D
 
I
N
 
N
-
 
R
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
S
G
 
N
V
 
L
K
 
K
K
 
A
V
 
V
V
 
C
A
 
F
L
x
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
C
S
 
S
P
 
P
I
 
V
N
 
N
L
 
S
Y
|
Y
G
 
G
A
 
M
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
I
S
 
C
D
 
E
K
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
K
N
 
S
N
 
K
I
 
Y
A
 
I
G
 
-
E
 
-
Q
 
K
Q
 
D
T
 
I
R
 
K
F
 
Y
A
 
V
V
 
C
V
 
V
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
A
 
L
G
 
N
S
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
F
P
 
T
I
 
L
T
 
T
D
 
H
E
 
T
R
 
S
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
W
 
I
I
 
M
T
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
D
G
 
S
V
 
V
K
 
K
F
 
L
V
 
I
L
 
E
D
 
Y
S
 
A
F
 
I
A
 
I
R
 
N
M
 
G
H
 
N
G
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
I
P
 
P
K
 
K
I
 
L
P
 
N
S
 
S
I
 
M
R
 
Y
I
 
I
V
 
K
D
 
D
L
 
M
A
 
I
L
 
E
G
 
L
M
 
F
A
 
A
G
 
D
H
 
K
L
 
Y
P
 
P
H
 
I
K
 
V
N
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
R
P
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
R
L
 
M
H
 
Y
E
 
E
L
 
S
M
 
L
V
 
I
P
 
N
L
 
D
D
 
T
D
 
Q
A
 
S
R
 
M
M
 
K
T
 
T
L
 
V
E
 
P
F
 
K
D
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
Y
T
 
H
I
 
I
Q
 
L
P
 
P
S
 
T
I
 
Y
R
 
D
F
 
P
T
 
T
S
 
I
V
 
V
D
 
T
V
 
E
D
 
E
F
 
F

5bjuA X-ray structure of the pglf dehydratase from campylobacter jejuni in complex with udp and NAD(h) (see paper)
30% identity, 81% coverage: 2:272/333 of query aligns to 22:297/340 of 5bjuA

query
sites
5bjuA
F
 
L
N
 
K
G
 
D
K
 
K
S
 
V
I
 
V
F
 
L
I
 
V
S
 
S
G
|
G
G
 
A
T
 
G
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
R
 
S
N
 
E
F
 
L
I
 
C
R
 
K
R
 
Q
L
 
C
L
 
I
E
 
-
Q
 
K
Y
 
F
Q
 
G
P
 
A
K
 
K
R
 
H
V
 
L
V
 
I
V
 
M
F
 
V
S
x
D
R
x
H
D
 
S
E
 
E
L
 
Y
K
 
N
Q
 
L
Y
 
Y
E
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
D
T
 
D
F
 
L
N
 
N
-
 
L
-
 
Y
A
 
K
P
 
E
C
 
K
M
 
I
R
 
T
Y
 
P
F
 
I
I
 
L
G
 
L
D
x
S
V
x
I
R
 
L
D
 
D
A
 
K
E
 
Q
R
 
S
L
 
L
R
 
D
Q
 
E
A
 
V
M
 
L
R
 
K
G
 
T
I
 
Y
-
 
K
-
 
P
D
 
E
Y
 
L
V
 
I
V
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
Y
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
C
E
 
E
Y
 
Q
N
 
N
P
 
P
T
 
H
E
 
S
C
 
A
I
 
V
R
 
I
T
x
N
N
 
N
V
 
I
N
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
K
N
 
I
I
 
L
I
 
C
A
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
K
D
 
E
N
 
N
G
 
K
V
 
V
K
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
V
A
 
M
L
x
I
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
A
 
V
S
 
R
P
 
P
I
 
T
N
 
N
L
 
I
Y
 
M
G
 
G
A
 
C
T
 
T
K
|
K
L
 
R
L
 
V
S
 
C
D
 
E
K
 
-
L
 
L
F
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
S
N
 
-
N
 
-
I
 
-
A
 
M
G
 
S
E
 
D
Q
 
E
Q
 
N
T
 
F
R
 
E
F
 
V
A
 
A
V
 
C
V
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
L
G
 
G
S
|
S
R
x
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
F
 
K
F
 
F
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
N
G
 
N
A
 
-
K
 
E
E
 
P
L
 
L
P
x
T
I
x
L
T
|
T
D
 
H
E
 
P
R
 
D
M
x
I
T
 
V
R
|
R
F
 
Y
W
 
F
I
 
M
T
 
L
L
 
V
D
 
A
H
 
E
G
 
A
V
 
V
K
 
Q
F
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
A
F
 
G
A
 
A
R
 
I
M
 
A
H
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
F
 
F
V
 
V
P
 
L
K
 
D
I
 
M
-
 
G
P
 
K
S
 
P
I
 
V
R
 
K
I
 
I
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
K
M
 
M
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
R
G
 
N
H
 
D
L
 
L
P
 
E
H
 
I
K
 
K
N
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
L
R
 
R
P
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
Y
-
 
E
E
 
E
L
 
L
M
 
L
V
 
I
P
 
D
L
 
E
D
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
K
M
 
T
T
 
Q
L
 
Y
E
 
E

5bjvA X-ray structure of the pglf udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from campylobacterjejuni, d396n/k397a variant in complex with udp-n- acrtylglucosamine (see paper)
29% identity, 80% coverage: 5:272/333 of query aligns to 25:297/339 of 5bjvA

query
sites
5bjvA
K
 
K
S
 
V
I
 
V
F
 
L
I
 
V
S
 
S
G
|
G
G
 
A
T
 
G
G
|
G
S
x
T
F
x
I
G
 
G
R
 
S
N
 
E
F
 
L
I
 
C
R
 
K
R
 
Q
L
 
C
L
 
I
E
 
-
Q
 
K
Y
 
F
Q
 
G
P
 
A
K
 
K
R
 
H
V
 
L
V
 
I
V
 
M
F
 
V
S
x
D
R
x
H
D
 
S
E
 
E
L
 
Y
K
 
N
Q
 
L
Y
 
Y
E
 
K
M
 
I
Q
 
N
Q
 
D
T
 
D
F
 
L
N
 
N
-
 
L
-
 
Y
A
 
K
P
 
E
C
 
K
M
 
I
R
 
T
Y
 
P
F
 
I
I
 
L
G
 
L
D
x
S
V
x
I
R
 
L
D
 
D
A
 
K
E
 
Q
R
 
S
L
 
L
R
 
D
Q
 
E
A
 
V
M
 
L
R
 
K
G
 
T
I
 
Y
-
 
K
-
 
P
D
 
E
Y
 
L
V
 
I
V
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
L
 
Y
K
|
K
Q
x
H
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
C
E
 
E
Y
 
Q
N
 
N
P
 
P
T
 
H
E
 
S
C
 
A
I
 
V
R
 
I
T
x
N
N
 
N
V
 
I
N
 
L
G
 
G
A
 
T
E
 
K
N
 
I
I
 
L
I
 
C
A
 
D
A
 
S
A
 
A
I
 
K
D
 
E
N
 
N
G
 
K
V
 
V
K
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
V
A
 
M
L
x
I
S
 
S
T
|
T
D
 
N
K
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
R
P
 
P
I
 
T
N
 
N
L
 
I
Y
 
M
G
 
G
A
 
C
T
 
T
K
|
K
L
 
R
L
 
V
S
 
C
D
 
E
K
 
-
L
 
L
F
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
S
N
 
-
N
 
-
I
 
-
A
 
M
G
 
S
E
 
D
Q
 
E
Q
 
N
T
 
F
R
 
E
F
 
V
A
 
A
V
 
C
V
 
V
R
 
R
Y
x
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
L
G
 
G
S
|
S
R
x
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
F
 
K
F
 
F
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
N
G
 
N
A
 
-
K
 
E
E
 
P
L
 
L
P
x
T
I
x
L
T
|
T
D
 
H
E
 
P
R
 
D
M
x
I
T
 
V
R
|
R
F
 
Y
W
 
F
I
 
M
T
 
L
L
 
V
D
 
A
H
 
E
G
 
A
V
 
V
K
 
Q
F
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
A
F
 
G
A
 
A
R
 
I
M
 
A
H
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
F
 
F
V
 
V
P
 
L
K
 
D
I
 
M
-
 
G
P
 
K
S
 
P
I
 
V
R
 
K
I
 
I
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
K
M
 
M
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
N
-
 
R
G
 
N
H
 
D
L
 
L
P
 
E
H
 
I
K
 
K
N
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
L
R
|
R
P
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
L
 
L
H
 
Y
-
 
E
E
 
E
L
 
L
M
 
L
V
 
I
P
 
D
L
 
E
D
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
K
M
 
T
T
 
Q
L
 
Y
E
 
E

3pvzA Udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from vibrio fischeri
26% identity, 72% coverage: 8:246/333 of query aligns to 34:281/372 of 3pvzA

query
sites
3pvzA
F
 
L
I
 
V
S
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
|
S
F
x
I
G
 
G
R
 
Q
N
 
A
F
 
V
I
 
T
R
 
K
R
 
E
L
 
I
L
 
F
E
 
K
Q
 
R
Y
 
-
Q
 
N
P
 
P
K
 
Q
R
 
K
V
 
L
V
 
H
V
 
V
F
 
V
S
x
D
R
x
I
D
 
S
E
 
E
L
 
N
K
 
N
Q
 
M
Y
 
V
E
 
E
M
 
L
Q
 
V
Q
 
R
T
 
D
F
 
I
N
 
R
A
 
S
P
 
S
C
 
-
M
 
F
R
 
G
Y
 
Y
F
 
I
I
 
N
G
 
G
D
 
D
V
 
F
R
 
Q
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
x
D
-
x
I
-
 
G
-
 
S
-
 
I
D
 
E
A
 
Y
E
 
D
R
 
A
L
 
F
R
 
I
Q
 
K
A
 
A
M
 
D
R
 
G
G
 
Q
I
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
L
H
 
N
A
x
L
A
x
S
A
|
A
L
 
L
K
|
K
Q
 
H
V
 
V
P
 
-
A
 
R
A
 
S
E
 
E
Y
 
K
N
 
D
P
 
P
T
 
F
E
 
T
C
 
L
I
 
M
R
 
R
-
 
M
-
 
I
-
 
D
T
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
F
G
 
N
A
 
T
E
 
D
N
 
K
I
 
T
I
 
I
A
 
Q
A
 
Q
A
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
F
A
 
C
L
x
V
S
 
S
T
 
T
D
|
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
V
N
 
N
L
 
M
Y
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
L
 
R
L
 
I
S
 
M
D
 
E
K
 
M
L
 
F
F
 
L
V
 
M
A
 
R
A
 
K
N
 
S
N
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
E
Q
 
E
T
 
I
R
 
A
F
 
I
A
 
S
V
 
T
V
 
A
R
 
R
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
V
|
V
A
 
A
G
 
F
S
|
S
R
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
L
V
 
L
P
 
H
F
 
G
F
 
F
S
 
N
K
 
Q
L
 
R
I
 
I
A
 
Q
E
 
K
G
 
N
A
 
Q
K
 
P
E
 
I
L
 
V
P
 
A
I
 
P
T
 
N
D
 
D
E
 
-
R
 
-
M
 
I
T
 
K
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
P
D
 
Q
H
 
E
G
 
S
V
 
G
K
 
E
F
 
L
V
 
C
L
 
L
D
 
M
S
 
S
F
 
C
A
 
I
R
 
F
M
 
G
H
 
E
G
 
N
G
 
R
E
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
F
P
 
P
K
 
K
I
 
L
P
 
S
S
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
I
 
I
R
 
S
I
 
F
V
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
Y
L
 
L
G
 
K
M
 
Q
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
L
 
E
P
 
P
H
 
H

1r66A Crystal structure of desiv (dtdp-glucose 4,6-dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and tyd bound (see paper)
27% identity, 65% coverage: 7:224/333 of query aligns to 3:240/322 of 1r66A

query
sites
1r66A
I
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
R
 
S
N
 
H
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
G
Y
 
A
Q
 
Y
P
 
P
K
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
-
R
 
-
D
|
D
E
x
S
L
|
L
K
x
T
Q
 
-
Y
 
Y
E
 
A
M
x
G
Q
 
N
Q
 
R
T
 
A
F
 
N
N
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
R
M
 
L
R
 
R
Y
 
F
F
 
V
I
 
H
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
G
R
 
L
L
 
L
R
 
A
Q
 
R
A
 
E
M
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
A
x
F
A
|
A
A
|
A
L
 
E
K
x
S
Q
x
H
V
 
V
P
 
D
A
 
R
A
 
S
E
 
I
Y
 
A
N
 
G
P
 
A
T
 
S
E
 
V
C
 
F
I
 
T
R
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
E
 
Q
N
 
T
I
 
L
I
 
L
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
I
 
V
D
 
D
N
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
H
L
x
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
K
x
E
A
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
E
A
 
S
S
 
S
P
 
P
I
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
N
N
 
S
L
 
P
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
L
L
 
V
F
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
Y
N
 
H
N
 
R
I
 
T
A
 
Y
G
 
G
-
 
L
E
 
D
Q
 
V
Q
 
R
T
 
I
R
 
T
F
 
R
A
 
C
V
 
C
V
x
N
R
x
N
Y
 
Y
G
 
G
N
 
P
V
 
Y
A
 
Q
G
 
H
S
 
P
R
 
E
G
 
-
S
x
K
V
x
L
V
 
I
P
 
P
F
 
L
F
 
F
S
 
V
K
 
T
L
 
N
I
 
L
A
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
G
K
 
T
E
 
L
L
x
P
P
 
L
I
x
Y
T
 
G
D
 
D
E
 
G
R
 
A
M
 
N
T
 
V
R
|
R
F
 
E
W
 
W
I
 
V
T
 
H
L
 
T
D
 
D
H
 
D
G
 
H
V
 
C
K
 
R
F
 
G
V
 
I
L
 
A
D
 
L
S
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
G
M
 
G
H
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

1r6dA Crystal structure of desiv double mutant (dtdp-glucose 4,6- dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and dau bound (see paper)
26% identity, 65% coverage: 7:224/333 of query aligns to 3:240/322 of 1r6dA

query
sites
1r6dA
I
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
R
 
S
N
 
H
F
 
F
I
 
V
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
G
Y
 
A
Q
 
Y
P
 
P
K
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
E
V
 
V
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
-
R
 
-
D
|
D
E
x
S
L
|
L
K
x
T
Q
 
-
Y
 
Y
E
x
A
M
x
G
Q
 
N
Q
 
R
T
 
A
F
 
N
N
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
R
M
 
L
R
 
R
Y
 
F
F
 
V
I
 
H
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
G
R
 
L
L
 
L
R
 
A
Q
 
R
A
 
E
M
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
A
x
F
A
|
A
A
|
A
L
 
E
K
x
S
Q
x
H
V
 
V
P
 
D
A
 
R
A
 
S
E
 
I
Y
 
A
N
 
G
P
 
A
T
 
S
E
 
V
C
 
F
I
 
T
R
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
A
 
T
E
 
Q
N
 
T
I
 
L
I
 
L
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
I
 
V
D
 
D
N
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
H
L
x
V
S
|
S
T
|
T
D
x
N
K
x
Q
A
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
E
A
 
S
S
 
S
P
 
P
I
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
N
N
 
S
L
 
P
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
L
 
A
L
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
L
L
 
V
F
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
Y
N
 
H
N
 
R
I
 
T
A
 
Y
G
 
G
-
 
L
E
 
D
Q
 
V
Q
 
R
T
 
I
R
 
T
F
 
R
A
 
C
V
 
C
V
x
N
R
x
N
Y
 
Y
G
 
G
N
 
P
V
 
Y
A
 
Q
G
 
H
S
 
P
R
 
E
G
 
-
S
x
K
V
x
L
V
 
I
P
 
P
F
 
L
F
 
F
S
 
V
K
 
T
L
 
N
I
 
L
A
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
G
K
 
T
E
 
L
L
x
P
P
 
L
I
x
Y
T
 
G
D
 
D
E
 
G
R
 
A
M
 
N
T
 
V
R
|
R
F
 
E
W
 
W
I
 
V
T
 
H
L
 
T
D
 
D
H
 
D
G
 
H
V
 
C
K
 
R
F
 
G
V
 
I
L
 
A
D
 
L
S
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
G
M
 
G
H
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

6jkhA The NAD+-bound form of human nsdhl (see paper)
27% identity, 44% coverage: 5:151/333 of query aligns to 3:139/212 of 6jkhA

query
sites
6jkhA
K
 
K
S
 
R
I
 
C
F
 
T
I
 
V
S
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
|
G
S
x
F
F
x
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
H
F
 
M
I
 
V
R
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
R
Y
 
G
Q
 
Y
P
 
A
K
 
V
R
 
N
V
 
V
V
 
-
V
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
Y
 
F
E
x
D
M
x
I
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
N
P
 
P
C
 
Q
M
 
V
R
 
R
Y
 
F
F
 
F
I
 
L
G
|
G
D
 
D
V
x
L
R
 
C
D
 
S
A
 
R
E
 
Q
R
 
D
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
A
 
A
M
 
L
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
N
Y
 
T
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
 
C
A
|
A
A
x
S
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
P
P
 
P
A
 
P
A
 
S
E
 
S
Y
 
N
N
 
N
P
 
K
T
 
E
E
 
L
C
 
F
I
 
Y
R
 
R
T
 
V
N
 
N
V
 
Y
N
 
I
G
 
G
A
 
T
E
 
K
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
T
A
 
C
I
 
K
D
 
E
N
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
L
L
 
T
S
 
S
T
 
S
D
 
A
K
 
S
A
 
V
-
 
I
-
 
F
-
 
E
A
 
G
S
 
K
P
 
P
I
 
I
N
 
D
L
 
Y
Y
|
Y
G
 
T
A
 
E
T
 
T
K
|
K
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
D
 
E
K
 
R
L
 
A
F
 
V
V
 
L
A
 
G
A
 
A
N
 
N
N
 
D

8rdhA Crystal structure of udp-galactose 4-epimerase from pyrococcus horikoshii with bound NAD and gdp-l-fucose
26% identity, 65% coverage: 7:222/333 of query aligns to 3:232/319 of 8rdhA

query
sites
8rdhA
I
 
V
F
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
A
G
|
G
S
x
F
F
x
I
G
 
G
R
 
S
N
 
H
F
 
L
I
 
V
R
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
M
E
 
E
Q
 
E
-
 
G
Y
 
Y
Q
 
K
P
 
V
K
 
R
R
 
V
V
 
L
V
x
D
V
x
D
F
 
L
S
|
S
R
x
A
D
x
G
E
 
S
L
 
L
K
 
K
Q
 
N
Y
 
-
E
 
-
M
 
I
Q
 
E
Q
 
G
T
 
W
F
 
L
N
 
G
A
 
N
P
 
E
C
 
N
M
 
F
R
 
E
Y
 
F
F
 
I
I
 
K
G
 
G
D
 
D
V
x
M
R
 
R
D
 
D
A
 
V
E
 
E
R
 
I
L
 
V
R
 
S
Q
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
K
G
 
D
I
 
V
D
 
D
Y
 
A
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
L
 
N
K
x
P
Q
 
E
V
 
V
P
x
R
A
 
I
A
 
G
E
 
S
Y
 
Q
N
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
L
C
 
L
I
 
Y
R
 
E
T
 
T
N
 
N
V
 
V
N
 
L
G
 
I
A
 
T
E
 
Y
N
 
N
I
 
L
I
 
L
A
 
N
A
 
A
A
 
V
I
 
R
D
 
N
N
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
K
-
 
Y
-
 
L
-
 
V
-
 
F
-
x
T
-
 
S
-
x
S
-
 
S
-
 
T
-
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
P
L
 
T
S
 
P
T
 
E
D
 
D
K
 
Y
A
 
A
-
 
P
A
 
L
S
 
E
P
 
P
I
 
I
N
 
S
L
 
V
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
A
K
|
K
L
 
L
L
 
A
S
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
L
F
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
I
A
 
S
G
 
G
E
 
Y
Q
 
A
Q
 
H
T
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
F
R
 
R
F
 
A
A
 
L
V
 
I
V
 
I
R
 
R
Y
x
L
G
x
A
N
|
N
V
x
I
A
 
I
G
 
G
S
 
K
R
 
R
-
 
S
-
 
N
-
x
H
G
|
G
S
x
V
V
 
I
V
 
Y
P
x
D
F
|
F
F
 
I
S
 
N
K
|
K
L
 
L
I
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
P
A
 
N
K
 
E
E
 
L
L
 
E
P
 
I
I
x
L
T
 
G
D
 
D
E
 
G
R
 
T
M
x
Q
T
 
R
R
x
K
F
 
S
W
 
Y
I
 
L
T
 
H
L
 
I
D
 
S
H
 
D
G
 
T
V
 
I
K
 
D
F
 
G
V
 
I
L
 
M
D
 
K
S
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
H
M
 
F
H
 
L
G
 
N
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_3585 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_3585
MFNGKSIFISGGTGSFGRNFIRRLLEQYQPKRVVVFSRDELKQYEMQQTFNAPCMRYFIG
DVRDAERLRQAMRGIDYVVHAAALKQVPAAEYNPTECIRTNVNGAENIIAAAIDNGVKKV
VALSTDKAASPINLYGATKLLSDKLFVAANNIAGEQQTRFAVVRYGNVAGSRGSVVPFFS
KLIAEGAKELPITDERMTRFWITLDHGVKFVLDSFARMHGGEVFVPKIPSIRIVDLALGM
AGHLPHKNVGIRPGEKLHELMVPLDDARMTLEFDDHYTIQPSIRFTSVDVDFAVDKLGEQ
GRPVSEDFEYRSDTNPHFLSVGQIADLHAELSA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory