SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4042 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4042 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A9G6 Isocitrate lyase; ICL; Isocitrase; Isocitratase; EC 4.1.3.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
72% identity, 99% coverage: 4:440/441 of query aligns to 3:434/434 of P0A9G6

query
sites
P0A9G6
T
 
T
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
D
 
E
W
 
W
A
 
T
E
 
Q
N
 
-
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
C
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
K
 
K
L
 
M
W
 
W
N
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
H
Q
 
G
G
 
E
A
 
S
K
 
K
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
N
C
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
K
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
I
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
A
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
V
H
 
H
F
 
F
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
|
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
C
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
S
P
 
E
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
K
 
R
V
 
T
R
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
W
 
W
C
 
C
E
 
E
T
 
T
A
 
S
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
H
K
 
A
E
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
 
S
P
 
P
S
 
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
Q
K
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
S
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
A
 
D
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
N
 
S
M
 
M
W
 
W
H
 
F
S
 
N
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
N
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
G
D
 
E
-
 
G
M
 
M
T
 
K
A
 
H
Y
 
Y
V
 
V
-
 
E
K
 
K
L
 
V
Q
 
Q
E
 
Q
Q
 
P
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
D
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
V
 
V
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
K
M
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
S
Q
 
Q
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1igwC Crystal structure of the isocitrate lyase from the a219c mutant of escherichia coli (see paper)
71% identity, 95% coverage: 4:423/441 of query aligns to 2:416/416 of 1igwC

query
sites
1igwC
T
 
T
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
D
 
E
W
 
W
A
 
T
E
 
Q
N
 
-
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
C
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
K
 
K
L
 
M
W
 
W
N
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
H
Q
 
G
G
 
E
A
 
S
K
 
K
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
N
C
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
K
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
I
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
A
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
A
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
V
H
|
H
F
 
F
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
C
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
S
P
 
E
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
K
 
R
V
 
T
R
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
W
 
W
C
 
C
E
|
E
T
 
T
A
 
S
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
H
K
 
A
E
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
Q
x
K
L
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
|
S
P
 
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
Q
K
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
S
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
A
 
D
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
N
 
S
M
 
M
W
 
W
H
 
F
S
 
N
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
N
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
G
D
 
E
-
 
G
M
 
M
T
 
K
A
 
H
Y
 
Y
V
 
V
-
 
E
K
 
K
L
 
V
Q
 
Q
E
 
Q
Q
 
P
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
D
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
V
 
V
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
K
M
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G

6lrtA Crystal structure of isocitrate lyase (caur_3889) from chloroflexus aurantiacus in complex with isocitrate and manganese ion
66% identity, 99% coverage: 3:440/441 of query aligns to 1:423/423 of 6lrtA

query
sites
6lrtA
L
 
M
T
 
D
R
 
R
E
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
K
A
 
Q
L
 
I
E
 
A
K
 
D
D
 
S
W
 
W
A
 
-
E
 
N
N
 
T
P
 
P
R
 
R
W
 
F
K
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
V
R
 
R
N
 
P
Y
 
Y
S
 
T
A
 
P
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
P
 
I
E
 
E
H
 
Y
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
R
L
 
L
W
 
W
N
 
N
L
 
L
V
 
L
T
 
H
Q
 
T
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
E
D
 
P
F
 
Y
V
 
I
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
A
E
 
G
S
 
Q
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
G
P
 
P
T
 
Q
V
 
L
V
 
V
K
 
R
R
 
N
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Y
W
 
H
K
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
R
N
 
N
P
 
D
G
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
I
D
 
Y
Y
 
W
F
 
F
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
P
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
E
 
E
L
 
I
M
 
M
K
 
K
S
 
A
M
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
F
 
F
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
|
K
K
 
K
C
 
C
G
 
G
H
 
H
M
 
M
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
R
K
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
M
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
I
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
C
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
M
I
 
I
W
 
W
C
 
C
E
 
E
T
 
T
A
 
S
K
 
E
P
 
P
D
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
H
K
 
A
E
 
Q
Y
 
F
P
 
P
D
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
 
S
P
 
P
S
 
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
K
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
A
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
R
D
 
N
Y
 
Y
A
 
R
R
 
D
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
S
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
Q
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
A
K
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
R
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
M
 
V
T
 
A
T
 
Q
V
 
V
I
 
I
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
E
S
 
I
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F

1igwA Crystal structure of the isocitrate lyase from the a219c mutant of escherichia coli (see paper)
67% identity, 95% coverage: 4:423/441 of query aligns to 2:396/396 of 1igwA

query
sites
1igwA
T
 
T
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
D
 
E
W
 
W
A
 
T
E
 
Q
N
 
-
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
N
P
 
P
E
 
E
H
 
C
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
K
 
K
L
 
M
W
 
W
N
 
R
L
 
L
V
 
L
T
 
H
Q
 
G
G
 
E
A
 
S
K
 
K
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
Y
V
 
I
N
 
N
C
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
 
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
K
 
S
A
 
A
G
 
G
K
 
I
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
A
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
A
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
V
H
|
H
F
 
F
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
-
H
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
C
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
L
I
 
L
L
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
C
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
S
P
 
E
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
K
 
R
V
 
T
R
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
W
 
W
C
 
C
E
|
E
T
 
T
A
 
S
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
H
K
 
A
E
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
Q
x
K
L
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
 
S
P
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
W
 
-
K
 
-
K
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
A
 
D
M
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
H
N
 
S
M
 
M
W
 
W
H
 
F
S
 
N
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
N
D
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
G
D
 
E
-
 
G
M
 
M
T
 
K
A
 
H
Y
 
Y
V
 
V
-
 
E
K
 
K
L
 
V
Q
 
Q
E
 
Q
Q
 
P
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
D
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
F
V
 
V
A
 
S
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
K
M
 
V
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G

7cmyC Isocitrate lyase from bacillus cereus atcc 14579 in complex with magnessium ion, glyoxylate, and succinate
63% identity, 99% coverage: 5:440/441 of query aligns to 1:417/417 of 7cmyC

query
sites
7cmyC
R
 
K
E
 
N
Q
 
E
Q
 
R
I
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
Q
K
 
E
D
 
S
W
 
W
A
 
E
E
 
L
N
 
D
P
 
E
R
 
R
W
 
W
K
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
N
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
Q
 
D
P
 
I
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
K
L
 
L
W
 
W
N
 
T
L
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
S
F
 
L
R
 
H
P
 
T
E
 
E
K
 
-
D
 
D
F
 
Y
V
 
I
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
K
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
Q
S
 
T
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
W
 
H
K
 
M
A
 
E
G
 
G
K
 
S
N
 
D
P
 
D
G
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
T
D
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
S
 
G
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
F
 
F
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
S
 
S
V
 
E
K
|
K
K
 
K
C
 
C
G
 
G
H
 
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
K
 
N
L
 
L
T
 
I
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
M
G
 
G
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
I
D
 
D
P
 
P
Y
 
V
D
 
D
Q
 
K
P
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
P
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
W
 
W
C
 
C
E
 
E
T
 
T
A
 
S
K
 
E
P
 
P
D
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
H
K
 
K
E
 
E
Y
 
H
P
 
P
D
 
G
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
 
S
P
 
P
S
 
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
Q
N
 
K
L
 
L
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
K
 
S
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
A
A
 
S
M
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
S
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
G
M
 
M
F
 
F
N
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
R
D
 
G
Y
 
Y
A
 
K
R
 
E
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
S
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
Q
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
F
 
A
V
 
T
A
 
R
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
M
 
V
T
 
A
T
 
Q
V
 
V
I
 
I
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
A
Q
 
Q
F
 
F

P9WKK7 Isocitrate lyase; ICL; Isocitrase; Isocitratase; EC 4.1.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
63% identity, 98% coverage: 12:441/441 of query aligns to 13:428/428 of P9WKK7

query
sites
P9WKK7
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
 
H
F
 
W
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
W
 
W
C
 
M
E
 
E
T
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
|
N
C
|
C
S
|
S
P
|
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
Q
 
Q
R
x
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
D
 
Q
M
 
M
T
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
R
M
 
I
T
 
A
T
 
T
V
 
T
I
 
V
Q
 
D
G
 
-
G
 
P
T
 
N
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H

6xppA Crystal structure of itaconate modified mycobaterium tuberculosis isocitrate lyase (see paper)
62% identity, 97% coverage: 12:440/441 of query aligns to 12:426/426 of 6xppA

query
sites
6xppA
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
|
H
F
 
W
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
|
A
P
 
P
F
 
F
A
|
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
W
 
W
C
 
M
E
|
E
T
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
|
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
|
N
C
 
C
S
|
S
P
 
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
D
 
Q
M
 
M
T
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
R
M
 
I
T
 
A
T
 
T
V
 
T
I
 
V
Q
 
D
G
 
-
G
 
P
T
 
N
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F

7rb1A Isocitrate lyase-1 from mycobacterium tuberculosis covalently modified by 5-descarboxy-5-nitro-d-isocitric acid (see paper)
62% identity, 97% coverage: 12:440/441 of query aligns to 13:427/427 of 7rb1A

query
sites
7rb1A
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
 
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
 
H
F
 
W
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
|
A
P
 
P
F
 
F
A
|
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
W
 
W
C
 
M
E
 
E
T
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
|
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
|
S
P
 
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
D
 
Q
M
 
M
T
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
R
M
 
I
T
 
A
T
 
T
V
 
T
I
 
V
Q
 
D
G
 
-
G
 
P
T
 
N
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F

6wsiA Intact cis-2,3-epoxysuccinic acid bound to isocitrate lyase-1 from mycobacterium tuberculosis (see paper)
62% identity, 97% coverage: 12:440/441 of query aligns to 13:427/427 of 6wsiA

query
sites
6wsiA
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
|
H
F
 
W
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
|
A
P
 
P
F
 
F
A
|
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
W
 
W
C
 
M
E
|
E
T
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
|
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
|
N
C
 
C
S
|
S
P
 
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
D
 
Q
M
 
M
T
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
R
M
 
I
T
 
A
T
 
T
V
 
T
I
 
V
Q
 
D
G
 
-
G
 
P
T
 
N
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F

6vb9A Covalent adduct of cis-2,3-epoxysuccinic acid with isocitrate lyase-1 from mycobacterium tuberculosis (see paper)
62% identity, 97% coverage: 12:440/441 of query aligns to 13:427/427 of 6vb9A

query
sites
6vb9A
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
|
H
F
 
W
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
D
T
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
V
D
 
D
P
 
E
Y
 
R
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
V
 
T
R
 
K
A
 
N
G
 
G
L
 
I
D
 
E
Q
 
P
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
|
A
P
 
P
F
 
F
A
|
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
W
|
W
C
 
M
E
|
E
T
 
T
A
 
G
K
 
T
P
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
A
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
|
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
N
 
N
C
 
C
S
|
S
P
 
P
S
|
S
F
 
F
N
 
N
W
 
W
K
 
K
K
 
K
N
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
H
 
F
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
T
|
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
F
H
 
H
N
 
A
M
 
L
W
 
N
H
 
Y
S
 
S
M
 
M
F
 
F
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
D
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
D
 
Q
M
 
M
T
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
E
 
E
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
F
 
A
V
 
T
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Q
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
R
M
 
I
T
 
A
T
 
T
V
 
T
I
 
V
Q
 
D
G
 
-
G
 
P
T
 
N
S
 
S
S
 
S
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F

5dqlA Crystal structure of 2-vinyl glyoxylate modified isocitrate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
62% identity, 97% coverage: 12:440/441 of query aligns to 13:427/427 of 5dqlA

query
sites
5dqlA
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
D
E
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
W
 
W
K
 
K
G
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
N
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
V
P
 
E
E
 
E
H
 
H
T
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
V
L
 
L
W
 
W
N
 
E
L
 
Q
V
 
L
T
 
H
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
L
D
 
E
F
 
W
V
 
V
N
 
N
C
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
N
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
|
W
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
D
N
 
A
N
 
N
S
 
L
A
 
S
E
 
G
S
 
H
M
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
A
F
 
L
R
 
Q
R
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
N
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
T
G
 
S
Y
 
V
I
 
E
D
 
N
Y
 
W
F
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
A
D
|
D
A
 
G
E
|
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Q
K
 
K
S
 
A
M
 
L
I
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
S
H
|
H
F
 
W
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
E
K
 
K
K
 
K
C
|
C
G
 
G
H
|
H
M
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
Q
 
R
K
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A