SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_412 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase (EC 1.1.1.100) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
38% identity, 93% coverage: 17:269/272 of query aligns to 3:254/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
E
 
Q
R
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
K
T
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
L
Q
 
N
Q
 
D
A
 
S
R
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
A
S
 
V
D
x
E
I
x
L
Q
 
L
G
 
E
E
 
D
K
x
R
V
 
L
E
 
N
K
 
Q
V
 
I
A
 
V
A
 
Q
H
 
E
W
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
M
G
 
G
A
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
G
I
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
K
Q
 
K
Q
 
K
D
 
D
L
 
V
H
 
E
A
 
E
M
 
F
A
 
V
R
 
R
L
 
R
A
 
T
I
 
F
E
 
E
L
 
T
H
 
Y
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
M
V
 
D
F
 
G
R
 
V
D
 
T
P
 
P
L
 
V
-
 
A
Q
 
E
M
 
V
T
 
S
E
 
D
E
 
E
D
 
L
W
 
W
H
 
E
R
 
R
C
 
V
F
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
Y
G
 
S
A
 
A
W
 
F
Y
 
Y
G
 
S
C
 
S
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
I
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
T
 
-
H
 
-
I
 
-
I
 
I
P
 
R
G
 
G
C
 
G
F
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
P
 
D
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
 
G
Y
 
T
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
x
N
L
x
I
N
 
G
V
 
L
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
G
F
 
S
A
 
S
D
 
K
P
 
P
H
x
S
A
 
E
E
 
L
R
 
G
Q
 
M
R
 
R
A
 
T
F
 
L
D
 
T
-
 
K
-
 
L
L
 
M
H
 
S
P
 
L
P
 
S
R
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
N
A
 
G
S
 
D
C
 
A
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
S
 
T
V
 
V
M
 
L

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 92% coverage: 19:269/272 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
A
A
 
H
T
 
S
F
 
Y
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
D
|
D
I
|
I
Q
 
N
G
 
E
E
 
D
K
 
H
V
 
G
E
 
N
K
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
E
H
 
D
W
 
I
R
 
K
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
A
V
 
S
A
 
F
I
 
V
K
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
R
 
N
Q
 
P
Q
 
E
D
 
E
L
 
V
H
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
V
R
 
K
L
 
R
A
 
T
I
 
V
E
 
E
L
 
I
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
G
V
 
G
F
 
E
R
 
Q
D
 
A
-
 
L
P
 
A
L
 
G
Q
 
D
M
 
Y
T
 
G
E
 
L
E
 
D
D
 
S
W
 
W
H
 
R
R
 
K
C
 
V
F
 
L
A
 
S
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
K
 
K
A
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
N
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
H
S
 
G
T
 
I
H
 
V
I
 
A
I
 
A
P
 
P
G
 
L
C
 
S
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
Q
K
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
I
|
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
P
L
|
L
N
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
L
A
 
E
D
 
S
P
 
L
H
 
T
A
 
K
E
 
E
R
 
M
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
L
-
 
I
D
 
S
L
 
K
H
 
H
P
 
P
P
 
M
R
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
E
T
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
P
 
S
F
 
F
I
 
M
N
 
T
A
 
G
S
 
G
C
 
Y
I
 
Y
T
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
V
 
A
M
 
V

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
L
T
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
|
D
I
|
I
Q
 
S
G
 
D
E
 
E
K
 
W
V
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
I
R
 
E
E
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
V
A
 
F
I
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
R
 
H
Q
 
P
Q
 
E
D
 
D
L
 
H
H
 
D
A
 
E
M
 
L
A
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
K
E
 
R
L
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
S
-
x
G
V
 
E
F
 
F
R
 
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
Q
 
E
M
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
A
D
 
Q
W
 
W
H
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
Q
 
A
M
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
T
 
Q
H
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
I
|
I
E
 
N
T
|
T
Q
 
T
L
 
L
-
 
V
-
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
L
A
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
A
 
L
F
 
E
D
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
P
x
L
R
|
R
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
T
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
S
C
 
Y
I
 
Y
T
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
L
T
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
|
D
I
|
I
Q
 
S
G
 
D
E
 
E
K
x
W
V
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
I
R
 
E
E
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
V
A
 
F
I
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
R
 
H
Q
 
P
Q
 
E
D
 
D
L
 
H
H
 
D
A
 
E
M
 
L
A
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
K
E
 
R
L
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
x
S
-
x
G
V
x
E
F
 
F
R
x
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
Q
x
E
M
 
T
T
|
T
E
 
D
E
 
A
D
x
Q
W
 
W
H
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
Q
 
A
M
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
T
 
Q
H
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
x
S
K
 
K
G
|
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
A
Y
 
F
I
|
I
E
 
N
T
|
T
Q
 
T
L
 
L
-
 
V
-
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
L
A
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
A
 
L
F
 
E
D
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
P
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
T
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
|
S
C
x
Y
I
 
Y
T
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
L
T
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
 
D
I
 
I
Q
 
S
G
 
D
E
 
E
K
 
W
V
 
G
E
 
R
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
H
 
L
W
 
I
R
 
E
E
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
V
A
 
F
I
 
Q
K
 
H
A
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
R
 
H
Q
 
P
Q
 
E
D
 
D
L
 
H
H
 
D
A
 
E
M
 
L
A
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
K
E
 
R
L
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
S
-
 
G
V
 
E
F
 
F
R
 
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
Q
 
E
M
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
A
D
 
Q
W
 
W
H
 
Q
R
 
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
Q
 
A
M
 
M
I
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
T
 
Q
H
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
I
 
I
E
 
N
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
-
 
V
-
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
L
A
 
E
E
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
A
 
L
F
 
E
D
 
Q
L
 
M
H
 
H
P
 
A
P
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
T
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
S
C
 
Y
I
 
Y
T
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
36% identity, 93% coverage: 18:270/272 of query aligns to 10:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
L
 
F
K
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
L
|
L
L
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
E
x
R
A
|
A
I
x
T
V
x
A
A
x
V
T
x
R
F
x
L
A
|
A
S
x
A
Q
x
E
Q
x
G
A
|
A
R
x
K
L
|
L
V
x
S
I
x
L
S
 
V
D
 
D
I
 
V
Q
 
S
G
 
S
E
 
E
K
 
G
V
 
L
E
 
E
K
 
A
V
 
S
A
 
K
A
 
A
H
 
A
W
 
V
R
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
A
-
 
P
-
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
T
I
 
T
K
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
R
 
D
Q
 
E
Q
 
A
D
 
Q
L
 
V
H
 
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
V
R
 
T
L
 
A
A
 
T
I
 
T
E
 
E
L
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
x
E
V
 
G
F
 
K
R
 
Q
D
 
N
P
 
P
L
 
T
Q
 
E
-
 
S
M
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
A
D
 
E
W
 
F
H
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
V
A
 
S
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
Q
 
I
M
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
V
H
 
G
S
 
G
T
 
I
H
 
R
I
 
G
I
 
I
P
 
G
G
 
N
C
 
Q
F
 
S
P
 
G
Y
 
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
R
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
I
 
I
E
 
W
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
N
 
-
V
 
V
D
 
E
Y
 
N
W
 
S
N
 
M
G
 
K
F
 
Q
A
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
E
A
 
N
E
 
P
R
 
R
Q
 
K
R
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
F
F
 
I
D
 
Q
L
 
V
H
 
N
P
 
P
P
 
S
R
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
I
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
T
C
 
V
I
 
V
T
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
A
M
 
A
Y
 
Y

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
36% identity, 93% coverage: 18:270/272 of query aligns to 1:258/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
L
 
F
K
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
T
V
 
A
A
 
V
T
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
S
I
 
L
S
 
V
D
|
D
I
x
V
Q
 
S
G
 
S
E
 
E
K
 
G
V
 
L
E
 
E
K
 
A
V
 
S
A
 
K
A
 
A
H
 
A
W
 
V
R
 
L
E
 
E
Q
 
T
G
 
A
-
 
P
-
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
L
A
 
T
I
 
T
K
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
D
Q
 
E
Q
 
A
D
 
Q
L
 
V
H
 
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
V
R
 
T
L
 
A
A
 
T
I
 
T
E
 
E
L
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
E
V
 
G
F
 
K
R
 
Q
D
 
N
P
 
P
L
 
T
Q
 
E
-
 
S
M
 
F
T
 
T
E
 
A
E
 
A
D
 
E
W
 
F
H
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
V
A
 
S
I
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
Q
 
I
M
 
M
I
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
G
S
 
G
T
 
I
H
 
R
I
 
G
I
 
I
P
 
G
G
 
N
C
x
Q
F
 
S
P
 
G
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
R
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
I
 
I
E
 
W
T
|
T
Q
x
P
L
x
M
N
 
-
V
 
V
D
 
E
Y
 
N
W
 
S
N
 
M
G
 
K
F
 
Q
A
 
L
D
 
D
P
 
P
H
 
E
A
 
N
E
 
P
R
 
R
Q
 
K
R
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
F
F
 
I
D
 
Q
L
 
V
H
 
N
P
 
P
P
 
S
R
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
I
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
T
C
 
V
I
 
V
T
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
S
 
S
V
 
A
M
 
A
Y
 
Y

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 92% coverage: 19:269/272 of query aligns to 3:246/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
I
 
T
V
 
A
A
 
L
T
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
N
D
|
D
I
 
I
Q
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
E
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
H
 
E
W
 
F
R
 
S
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
H
D
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
G
I
 
A
K
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
R
 
N
Q
 
K
Q
 
A
D
 
A
L
 
V
H
 
D
A
 
G
M
 
M
A
 
V
R
 
K
L
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
D
L
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
R
 
G
D
 
A
P
 
L
L
 
R
Q
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
A
D
 
D
W
 
W
H
 
D
R
 
V
C
 
T
F
 
I
A
 
N
I
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
T
W
 
F
Y
 
L
G
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
I
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
-
H
 
R
S
 
A
T
 
W
H
 
L
I
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
S
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
N
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
W
 
W
N
 
D
G
 
E
F
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
E
A
 
K
E
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
A
 
L
F
 
L
D
 
S
L
 
R
H
 
Q
P
 
P
P
 
T
R
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
P
 
G
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
Q
C
 
V
I
 
L
T
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S
V
 
L
M
 
F

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
35% identity, 92% coverage: 19:269/272 of query aligns to 2:245/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
I
 
T
V
 
A
A
 
L
T
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
N
D
|
D
I
|
I
Q
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
E
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
V
A
 
D
H
 
E
W
 
F
R
 
S
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
H
D
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
G
I
 
A
K
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
R
 
N
Q
 
K
Q
 
A
D
 
A
L
 
V
H
 
D
A
 
G
M
 
M
A
 
V
R
 
K
L
 
Q
A
 
T
I
 
I
E
 
D
L
 
A
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
R
 
G
D
 
A
P
 
L
L
 
R
Q
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
A
D
 
D
W
 
W
H
 
D
R
 
V
C
 
T
F
 
I
A
 
N
I
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
T
W
 
F
Y
 
L
G
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
I
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
T
 
-
H
 
R
S
 
A
T
 
W
H
 
L
I
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
S
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
R
K
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
|
I
E
 
H
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
N
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
W
 
W
N
 
D
G
 
E
F
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
E
A
 
K
E
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
A
 
L
F
 
L
D
 
S
L
 
R
H
 
Q
P
 
P
P
 
T
R
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
P
 
G
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
Q
C
 
V
I
 
L
T
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S
V
 
L
M
 
F

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
33% identity, 92% coverage: 19:267/272 of query aligns to 5:251/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
x
V
L
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
A
x
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
E
x
K
A
x
S
I
x
M
V
x
A
A
x
I
T
x
R
F
|
F
A
|
A
S
x
T
Q
x
E
Q
x
K
A
|
A
R
x
K
L
x
V
V
|
V
I
 
V
S
 
N
D
 
Y
I
 
R
Q
 
S
G
 
K
E
 
E
-
 
D
K
 
E
V
 
A
E
 
N
K
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
H
 
E
W
 
I
R
 
K
E
 
K
Q
 
V
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
V
Q
 
E
Q
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
I
A
 
N
M
 
L
A
 
V
R
 
Q
L
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
K
L
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
x
E
V
 
N
F
 
P
R
 
V
D
 
S
P
 
S
L
 
H
Q
 
E
M
 
M
T
 
S
E
 
L
E
 
S
D
|
D
W
 
W
H
 
N
R
 
K
C
x
V
F
 
I
A
 
D
I
 
T
D
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
E
|
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
-
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
T
 
V
H
 
H
S
 
E
T
 
K
H
 
I
I
 
P
I
 
W
P
 
P
G
 
L
C
 
F
F
 
V
P
 
H
Y
 
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
S
K
 
K
H
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
A
 
T
L
 
L
G
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
I
 
I
E
 
N
T
 
T
Q
x
P
L
 
I
N
 
N
V
 
A
D
 
E
Y
 
K
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
E
A
 
-
E
 
Q
R
 
R
Q
 
A
R
 
D
A
 
V
F
x
E
D
 
S
L
 
M
H
 
I
P
 
P
P
 
M
R
 
G
R
x
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
I
C
 
T
I
 
L
T
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
33% identity, 92% coverage: 19:267/272 of query aligns to 5:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
K
A
 
S
I
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
T
Q
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
N
D
 
Y
I
x
R
Q
 
S
G
 
K
E
 
E
-
 
D
K
 
E
V
 
A
E
 
N
K
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
H
 
E
W
 
I
R
 
K
E
 
K
Q
 
V
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
V
Q
 
E
Q
 
S
D
 
D
L
 
V
H
 
I
A
 
N
M
 
L
A
 
V
R
 
Q
L
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
K
L
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
N
 
A
V
 
N
F
 
P
R
 
V
D
 
S
P
 
S
L
 
H
Q
 
E
M
 
M
T
 
S
E
 
L
E
 
S
D
 
D
W
 
W
H
 
N
R
 
K
C
 
V
F
 
I
A
 
D
I
 
T
D
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
-
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
H
S
 
E
T
 
K
H
 
I
I
 
P
I
 
W
P
 
P
G
 
L
C
 
F
F
 
V
P
 
H
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
A
 
T
L
 
L
G
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
I
|
I
E
 
N
T
|
T
Q
 
P
L
 
I
N
 
N
V
 
A
D
 
E
Y
 
K
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
E
A
 
-
E
 
Q
R
 
R
Q
 
A
R
 
D
A
 
V
F
 
E
D
 
S
L
 
M
H
 
I
P
 
P
P
 
M
R
 
G
R
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
I
C
 
T
I
 
L
T
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
S
 
T

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
34% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 3:246/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
L
 
L
K
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
A
x
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
R
T
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
Q
Q
 
D
Q
 
G
A
 
A
R
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
x
S
I
x
R
Q
x
K
G
 
Q
E
 
E
K
x
N
V
 
V
E
 
D
K
 
R
V
 
T
A
 
V
A
 
A
H
 
T
W
 
L
R
 
Q
E
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
G
I
 
T
K
 
V
A
 
C
D
x
H
V
 
V
S
 
G
R
 
K
Q
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
R
H
 
E
A
 
R
M
 
L
A
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
N
L
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
x
N
A
 
A
G
x
A
V
 
V
N
 
N
-
 
P
V
 
F
F
 
F
R
 
G
D
 
N
P
 
I
L
 
I
Q
 
D
M
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
D
 
V
W
 
W
H
 
D
R
 
K
C
 
I
F
 
L
A
 
H
I
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
T
W
 
V
Y
 
L
G
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
M
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
R
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
I
x
V
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
G
S
 
A
T
 
Y
H
 
H
I
 
P
I
 
F
P
 
P
G
 
N
C
x
L
F
 
G
P
 
P
Y
|
Y
P
 
N
V
 
V
A
 
S
K
|
K
H
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
L
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
L
I
|
I
E
 
K
T
|
T
Q
 
N
L
x
F
N
x
S
V
 
Q
D
 
V
Y
 
L
W
 
W
N
 
M
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
D
H
x
K
A
 
A
E
 
R
R
 
K
Q
 
E
R
 
Y
A
 
M
F
 
K
D
 
E
L
 
S
H
 
L
P
 
R
P
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
M
 
G
T
 
I
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
I
N
 
T
A
 
G
S
 
E
C
 
T
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
34% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 31:274/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
L
 
L
K
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
|
L
L
x
V
T
|
T
G
x
A
A
x
S
A
x
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
L
A
|
A
I
|
I
V
x
A
A
x
R
T
x
R
F
x
L
A
|
A
S
x
Q
Q
x
D
Q
x
G
A
|
A
R
x
H
L
x
V
V
|
V
I
 
V
S
 
S
D
 
S
I
 
R
Q
 
K
G
 
Q
E
 
E
K
 
N
V
 
V
E
 
D
K
 
R
V
 
T
A
 
V
A
 
A
H
 
T
W
 
L
R
 
Q
E
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
G
I
 
T
K
 
V
A
 
C
D
 
H
V
 
V
S
 
G
R
 
K
Q
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
R
H
 
E
A
 
R
M
 
L
A
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
N
L
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
V
N
 
N
-
 
P
V
 
F
F
 
F
R
 
G
D
 
N
P
 
I
L
 
I
Q
 
D
M
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
D
 
V
W
 
W
H
 
D
R
 
K
C
 
I
F
 
L
A
 
H
I
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
T
W
 
V
Y
 
L
G
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
M
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
R
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
I
 
V
A
 
S
S
 
S
T
 
V
H
 
G
S
 
A
T
 
Y
H
 
H
I
 
P
I
x
F
P
 
P
G
 
N
C
x
L
F
 
G
P
 
P
Y
|
Y
P
 
N
V
 
V
A
 
S
K
|
K
H
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
x
N
L
 
L
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
T
Q
 
N
L
 
F
N
 
S
V
 
Q
D
 
V
Y
 
L
W
 
W
N
 
M
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
D
H
 
K
A
 
A
E
 
R
R
 
K
Q
 
E
R
 
Y
A
 
M
F
 
K
D
 
E
L
 
S
H
 
L
P
 
R
P
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
M
 
G
T
 
I
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
I
N
 
T
A
 
G
S
 
E
C
 
T
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
35% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
K
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
A
x
T
Q
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
R
T
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
Q
Q
 
D
Q
 
G
A
 
A
R
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
x
S
I
x
R
Q
x
K
G
 
Q
E
 
Q
K
x
N
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
V
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
T
W
 
L
R
 
Q
E
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
G
I
 
T
K
 
V
A
 
C
D
x
H
V
|
V
S
 
G
R
 
K
Q
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
R
H
 
E
A
 
R
M
 
L
A
 
V
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
V
E
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
x
N
A
 
A
G
x
A
V
 
V
N
 
N
-
 
P
V
 
F
F
 
F
R
 
G
D
 
S
P
 
I
L
 
M
Q
 
D
M
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
D
 
V
W
 
W
H
 
D
R
 
K
C
 
T
F
 
L
A
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
P
W
 
A
Y
 
L
G
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
M
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
R
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
I
 
V
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
A
T
 
F
H
 
S
I
 
P
I
 
S
P
 
P
G
 
G
C
x
F
F
 
S
P
 
P
Y
|
Y
P
 
N
V
 
V
A
 
S
K
|
K
H
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
L
I
|
I
E
 
K
T
|
T
Q
 
S
L
x
F
N
x
S
V
 
R
D
 
M
Y
 
L
W
 
W
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
M
D
 
D
P
x
K
H
 
E
A
 
K
E
 
E
R
 
E
Q
 
S
R
 
M
A
 
K
F
 
E
D
 
T
L
 
L
H
 
R
P
 
-
P
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
M
 
G
T
 
I
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
I
N
 
T
A
 
G
S
 
E
C
 
T
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
35% identity, 91% coverage: 19:265/272 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
K
 
A
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
S
A
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
R
T
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
Q
Q
 
D
Q
 
G
A
 
A
R
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
D
 
S
I
 
R
Q
 
K
G
 
Q
E
 
Q
K
 
N
V
 
V
E
 
D
K
 
Q
V
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
T
W
 
L
R
 
Q
E
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
G
I
 
T
K
 
V
A
 
C
D
 
H
V
 
V
S
 
G
R
 
K
Q
 
A
Q
 
E
D
 
D
L
 
R
H
 
E
A
 
R
M
 
L
A
 
V
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
V
E
 
K
L
 
L
H
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
V
N
 
N
-
 
P
V
 
F
F
 
F
R
 
G
D
 
S
P
 
I
L
 
M
Q
 
D
M
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
D
 
V
W
 
W
H
 
D
R
 
K
C
 
T
F
 
L
A
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
P
W
 
A
Y
 
L
G
 
M
C
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
E
M
 
M
I
 
E
E
 
K
Q
 
R
G
 
G
I
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
I
 
V
A
 
S
S
 
S
T
 
I
H
 
A
S
 
A
T
 
F
H
 
S
I
 
P
I
x
S
P
 
P
G
 
G
C
x
F
F
 
S
P
 
P
Y
 
Y
P
 
N
V
 
V
A
 
S
K
 
K
H
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
x
T
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
K
T
 
T
Q
 
S
L
 
F
N
 
S
V
 
R
D
 
M
Y
 
L
W
 
W
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
M
D
 
D
P
 
K
H
 
E
A
 
K
E
 
E
R
 
E
Q
 
S
R
 
M
A
 
K
F
 
E
D
 
T
L
 
L
H
 
R
P
 
-
P
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
M
 
G
T
 
I
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
I
N
 
T
A
 
G
S
 
E
C
 
T
I
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
34% identity, 92% coverage: 19:267/272 of query aligns to 11:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
M
V
 
A
A
 
V
T
 
R
F
 
F
A
 
G
S
 
Q
Q
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
N
D
 
Y
I
x
Y
Q
 
N
G
 
N
E
 
E
K
 
E
V
 
-
E
 
E
K
 
A
V
 
L
A
 
D
A
 
A
-
 
K
-
 
K
H
 
E
W
 
V
R
 
E
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
Q
V
 
A
V
 
I
A
 
I
I
 
V
K
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
Q
 
E
Q
 
E
D
 
D
L
 
V
H
 
V
A
 
N
M
 
L
A
 
V
R
 
Q
L
 
T
A
 
A
I
 
I
E
 
K
L
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
N
x
E
V
 
N
F
 
P
R
 
V
D
 
P
P
 
S
L
 
H
Q
 
E
M
 
L
T
 
S
E
 
L
E
 
D
D
 
N
W
 
W
H
 
N
R
 
K
C
 
V
F
 
I
A
 
D
I
 
T
D
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
S
K
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
Q
 
Y
M
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
-
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
|
H
S
 
E
T
 
M
H
 
I
I
 
P
I
x
W
P
 
P
G
 
L
C
 
F
F
 
V
P
 
H
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
A
 
T
L
 
L
G
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
I
x
M
E
 
N
T
|
T
Q
x
P
L
x
I
N
|
N
V
 
A
D
 
E
Y
x
K
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
-
A
 
V
E
 
Q
R
 
R
Q
 
A
R
 
D
A
 
V
F
 
E
D
 
S
L
 
M
H
 
I
P
 
P
P
 
M
R
 
G
R
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
Q
A
 
A
P
 
S
F
 
Y
I
 
V
N
 
T
A
 
G
S
 
I
C
 
T
I
 
L
T
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
S
 
T

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 91% coverage: 18:265/272 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
I
 
A
V
 
A
A
 
R
T
 
V
F
 
F
A
 
M
S
 
K
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
A
D
|
D
I
x
F
Q
 
N
G
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
A
V
 
A
A
 
G
A
 
K
H
 
E
W
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
A
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
F
I
 
I
K
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
D
Q
 
R
Q
 
E
D
 
S
L
 
V
H
 
H
A
 
R
M
 
L
A
 
V
R
 
E
L
 
N
A
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
V
 
-
F
 
-
R
 
R
D
|
D
P
 
S
L
 
M
-
 
L
-
 
S
Q
x
K
M
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
D
 
Q
W
 
F
H
 
Q
R
 
Q
C
 
V
F
 
I
A
 
N
I
 
V
D
x
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
Y
 
H
G
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
T
S
 
G
T
 
T
H
 
Y
I
 
G
I
x
N
P
x
V
G
 
G
C
x
Q
F
 
T
P
 
N
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
W
G
 
A
I
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
Q
 
A
L
x
M
N
 
V
V
 
A
D
 
E
Y
 
V
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
E
A
 
K
E
 
V
R
 
I
Q
 
E
R
x
K
A
 
M
F
 
K
D
 
A
L
 
Q
H
 
V
P
 
P
P
 
M
R
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
P
 
D
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
G
S
 
H
C
 
V
I
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
35% identity, 92% coverage: 21:269/272 of query aligns to 2:250/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
T
T
 
R
F
 
F
A
 
L
S
 
A
Q
 
R
Q
 
G
A
 
D
R
 
R
L
 
V
V
 
A
I
 
A
S
 
L
D
|
D
I
x
L
Q
 
S
G
 
A
E
 
E
K
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
A
 
T
H
 
H
W
 
W
R
 
H
E
 
A
Q
 
Y
G
 
A
A
 
D
D
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
R
I
 
V
K
 
R
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
D
Q
 
E
Q
 
G
D
 
D
L
 
V
H
 
N
A
 
A
M
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
T
I
 
M
E
 
E
L
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
N
 
N
V
 
S
F
 
E
R
 
A
D
 
G
P
 
V
L
 
L
Q
 
H
M
 
T
T
 
T
E
 
P
-
 
V
E
 
E
D
 
Q
W
 
F
H
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
R
G
 
G
A
 
I
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
I
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
I
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
A
S
 
S
T
 
L
H
 
V
I
 
A
I
x
F
P
 
P
G
 
G
C
x
R
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
T
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
G
K
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
M
I
|
I
E
 
E
T
|
T
Q
x
P
L
x
M
N
x
T
V
 
-
D
 
-
Y
 
Q
W
|
W
N
x
R
G
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
P
A
 
E
E
 
L
R
 
R
Q
 
D
R
 
Q
A
 
V
F
 
L
D
 
A
L
 
R
H
 
I
P
 
P
P
 
Q
R
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
I
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
M
 
D
T
 
A
A
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
G
S
 
A
C
 
A
I
 
L
T
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
S
 
T
V
 
A
M
 
I

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
35% identity, 92% coverage: 21:269/272 of query aligns to 2:250/250 of Q56840

query
sites
Q56840
N
 
S
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
T
T
 
R
F
 
F
A
 
L
S
 
A
Q
 
R
Q
 
G
A
 
D
R
 
R
L
 
V
V
 
A
I
 
A
S
 
L
D
|
D
I
 
L
Q
 
S
G
 
A
E
 
E
K
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
A
 
T
H
 
H
W
 
W
R
 
H
E
 
A
Q
 
Y
G
 
A
A
 
D
D
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
R
I
 
V
K
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
D
Q
 
E
Q
 
G
D
 
D
L
 
V
H
 
N
A
 
A
M
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
T
I
 
M
E
 
E
L
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
N
 
N
V
 
S
F
 
E
R
 
A
D
 
G
P
 
V
L
 
L
Q
 
H
M
 
T
T
 
T
E
 
P
-
 
V
E
 
E
D
 
Q
W
 
F
H
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
D
 
N
L
 
V
D
 
R
G
 
G
A
 
I
W
 
F
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
M
I
 
L
E
 
L
Q
 
Q
G
 
G
I
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
A
S
 
S
T
 
L
H
 
V
I
 
A
I
 
F
P
 
P
G
 
G
C
x
R
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
T
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
G
K
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
M
I
|
I
E
|
E
T
|
T
Q
x
P
L
x
M
N
 
T
V
 
-
D
 
-
Y
 
Q
W
|
W
N
x
R
G
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
P
A
 
E
E
 
L
R
|
R
Q
 
D
R
 
Q
A
 
V
F
 
L
D
 
A
L
x
R
H
 
I
P
 
P
P
 
Q
R
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
I
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
M
 
D
T
 
A
A
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
G
S
 
A
C
 
A
I
 
L
T
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
S
 
T
V
 
A
M
 
I

Sites not aligning to the query:

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
36% identity, 92% coverage: 18:267/272 of query aligns to 2:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
L
 
F
K
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
A
V
 
A
A
 
R
T
 
R
F
 
F
A
 
S
S
 
A
Q
 
E
Q
 
G
A
 
A
R
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
L
S
 
A
D
|
D
I
 
W
Q
 
A
G
 
K
E
 
E
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
S
W
 
L
R
 
P
E
 
K
Q
 
G
G
 
R
A
 
A
D
 
-
V
 
-
V
 
M
A
 
A
I
 
V
K
 
H
A
 
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
D
Q
 
H
Q
 
V
D
 
A
L
 
V
H
 
E
A
 
K
M
 
M
A
 
M
R
 
N
L
 
E
A
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
K
H
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
H
V
 
V
F
 
A
R
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
L
Q
 
E
M
 
T
T
 
S
E
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
H
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
V
W
 
V
Y
 
F
G
 
C
C
 
S
K
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
M
 
L
I
 
L
E
 
K
Q
 
T
G
 
K
I
 
-
G
 
G
S
 
C
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
T
x
V
H
x
S
S
 
G
T
 
L
H
 
G
I
 
G
I
 
D
P
 
W
G
 
G
C
 
A
F
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
P
 
G
K
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
Y
 
L
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
 
N
L
 
M
N
 
T
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
W
 
-
N
 
N
G
 
G
F
 
W
A
 
-
D
 
-
P
 
P
H
 
Q
A
 
E
E
 
I
R
|
R
Q
x
D
R
x
K
A
 
F
F
 
N
D
 
E
L
 
R
H
 
I
P
 
A
P
 
L
R
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
 
G
S
 
A
C
 
N
I
 
I
T
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_412 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase (EC 1.1.1.100)
MAEPLSLPPVPEPPKGERLKNKVVLLTGAAQGIGEAIVATFASQQARLVISDIQGEKVEK
VAAHWREQGADVVAIKADVSRQQDLHAMARLAIELHGRIDVLVNCAGVNVFRDPLQMTEE
DWHRCFAIDLDGAWYGCKAVLPQMIEQGIGSIINIASTHSTHIIPGCFPYPVAKHGLLGL
TRALGIEYAPKGIRVNAIAPGYIETQLNVDYWNGFADPHAERQRAFDLHPPRRIGQPIEV
AMTAVFLASDEAPFINASCITIDGGRSVMYHD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory