SitesBLAST
Comparing Pf1N1B4_4245 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4245 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.
Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures
Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)
5dm3C Crystal structure of glutamine synthetase from chromohalobacter salexigens dsm 3043(csal_0679, target efi-550015) with bound adp
54% identity, 98% coverage: 7:455/457 of query aligns to 1:396/396 of 5dm3C
- active site: E115 (= E144), E117 (= E146), E162 (= E207), E169 (= E214), H218 (= H263), R286 (= R336), E303 (= E353), R305 (= R355)
- binding adenosine-5'-diphosphate: R173 (= R218), C174 (≠ Y219), H220 (= H265), S222 (= S267), R301 (= R351)
5dm3A Crystal structure of glutamine synthetase from chromohalobacter salexigens dsm 3043(csal_0679, target efi-550015) with bound adp
51% identity, 98% coverage: 6:455/457 of query aligns to 2:374/374 of 5dm3A
- active site: E107 (= E144), E109 (= E146), E146 (= E207), E150 (= E214), H199 (= H263), R265 (= R336), E282 (= E353), R284 (= R355)
- binding adenosine-5'-diphosphate: I103 (≠ M140), E141 (= E202), R154 (= R218), C155 (≠ Y219), H201 (= H265), S203 (= S267), R280 (= R351)
7tdpA Structure of paenibacillus polymyxa gs bound to met-sox-p-adp (transition state complex) to 1.98 angstom (see paper)
33% identity, 81% coverage: 82:449/457 of query aligns to 65:431/439 of 7tdpA
- binding adenosine-5'-diphosphate: N123 (vs. gap), G125 (≠ A142), E127 (= E144), E179 (= E202), D193 (≠ N216), Y196 (= Y219), N242 (≠ H265), S244 (= S267), R316 (= R341), R326 (= R351)
- binding magnesium ion: E127 (= E144), E127 (= E144), E129 (= E146), E184 (= E207), E191 (= E214), E191 (= E214), H240 (= H263), E328 (= E353)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E127 (= E144), E129 (= E146), E184 (= E207), E191 (= E214), G236 (= G259), H240 (= H263), R293 (= R318), E299 (≠ F324), R311 (= R336), R330 (= R355)
8oozA Glutamine synthetase (see paper)
32% identity, 85% coverage: 69:457/457 of query aligns to 45:430/430 of 8oozA
- binding adenosine-5'-triphosphate: G117 (≠ A142), E170 (= E202), F185 (≠ I217), K186 (≠ R218), Y187 (= Y219), N233 (≠ H265), S235 (= S267), S315 (≠ A349), R317 (= R351)
- binding magnesium ion: E119 (= E144), H231 (= H263), E319 (= E353)
7tfaB Glutamine synthetase (see paper)
32% identity, 81% coverage: 81:449/457 of query aligns to 64:433/441 of 7tfaB
- binding glutamine: E131 (= E146), Y153 (≠ H170), E186 (= E207), G238 (= G259), H242 (= H263), R295 (= R318), E301 (≠ F324)
- binding magnesium ion: E129 (= E144), E131 (= E146), E186 (= E207), E193 (= E214), H242 (= H263), E330 (= E353)
- binding : V187 (≠ W208), N237 (≠ A258), G299 (= G322), Y300 (≠ T323), R313 (= R336), M424 (≠ E440)
Sites not aligning to the query:
8ooqB Glutamine synthetase from Methanothermococcus thermolithotrophicus (see paper)
31% identity, 91% coverage: 34:449/457 of query aligns to 24:439/446 of 8ooqB
Sites not aligning to the query:
8oooA Glutamine synthetase from methanothermococcus thermolithotrophicus in complex with 2-oxoglutarate and mgatp at 2.15 a resolution (see paper)
31% identity, 91% coverage: 34:449/457 of query aligns to 25:440/447 of 8oooA
- binding 2-oxoglutaric acid: A33 (≠ E42), R87 (≠ L98), V93 (≠ T101), P170 (= P185), R173 (≠ L187), R174 (= R188), S190 (= S204)
- binding adenosine-5'-triphosphate: E136 (= E144), E188 (= E202), F203 (≠ I217), K204 (≠ R218), F205 (≠ Y219), H251 (= H265), S253 (= S267), R325 (= R341), R335 (= R351)
Sites not aligning to the query:
8ooxB Glutamine synthetase (see paper)
33% identity, 82% coverage: 82:457/457 of query aligns to 64:438/438 of 8ooxB
7tf6A Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 82:457/457 of query aligns to 65:438/438 of 7tf6A
- binding glutamine: E128 (= E146), E183 (= E207), G235 (= G259), H239 (= H263), R292 (= R318), E298 (≠ F324)
- binding magnesium ion: E126 (= E144), E128 (= E146), E183 (= E207), E190 (= E214), H239 (= H263), E327 (= E353)
- binding : G232 (≠ D256), N234 (≠ A258), G296 (= G322), Y297 (≠ T323), R310 (= R336), Y367 (= Y393), Y421 (≠ E440), Q433 (≠ R452), Q437 (≠ R456)
Sites not aligning to the query:
7tdvC Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 82:457/457 of query aligns to 66:443/443 of 7tdvC
- binding adenosine-5'-diphosphate: G129 (≠ A142), E131 (= E144), E183 (= E202), D197 (≠ N216), F198 (≠ I217), K199 (≠ R218), Y200 (= Y219), N246 (≠ H265), V247 (≠ N266), S248 (= S267), R320 (= R341), S328 (≠ A349), R330 (= R351)
- binding magnesium ion: E131 (= E144), E131 (= E144), E133 (= E146), E188 (= E207), E195 (= E214), E195 (= E214), H244 (= H263), E332 (= E353)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E131 (= E144), E133 (= E146), E188 (= E207), E195 (= E214), G240 (= G259), H244 (= H263), R297 (= R318), E303 (≠ F324), R315 (= R336)
8tfkA Glutamine synthetase (see paper)
32% identity, 81% coverage: 82:452/457 of query aligns to 64:435/440 of 8tfkA
- binding adenosine-5'-diphosphate: E128 (= E144), D194 (≠ N216), F195 (≠ I217), F197 (≠ Y219), N243 (≠ H265), R312 (= R336), R317 (= R341), G325 (≠ A349), R327 (= R351)
- binding magnesium ion: E128 (= E144), E128 (= E144), E130 (= E146), E185 (= E207), E192 (= E214), E192 (= E214), H241 (= H263), E329 (= E353)
- binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E128 (= E144), E130 (= E146), E185 (=