SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4393 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4393 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3lxdA Crystal structure of ferredoxin reductase arr from novosphingobium aromaticivorans (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:411/413 of query aligns to 4:408/409 of 3lxdA

query
sites
3lxdA
A
 
A
P
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
H
|
H
A
x
G
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
N
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
V
I
 
I
G
 
G
D
x
R
E
|
E
S
 
P
H
 
E
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
E
 
E
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
E
L
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
R
T
 
E
V
 
K
E
 
T
L
 
F
A
 
E
G
 
R
Y
 
I
S
 
C
L
 
I
C
 
R
D
 
P
T
 
A
A
 
Q
Q
 
F
L
 
W
A
 
E
E
 
D
L
 
K
G
 
A
I
 
V
E
 
E
H
 
M
L
 
K
A
 
L
G
 
G
N
 
A
P
x
E
V
|
V
K
 
V
C
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
W
 
A
L
 
I
H
 
E
Y
 
Y
A
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
W
A
 
A
T
|
T
G
 
G
G
 
G
R
 
D
S
 
P
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
S
S
 
C
V
 
V
P
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
L
L
 
A
N
 
G
V
 
V
L
 
H
Y
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
T
H
 
K
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
D
A
 
R
L
 
L
R
 
M
A
 
A
S
 
E
L
 
L
Q
 
D
P
 
A
D
 
G
T
 
A
R
 
K
-
 
N
V
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
V
A
 
L
R
 
T
A
 
K
L
 
F
G
 
G
C
 
V
T
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
A
P
 
G
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
E
V
 
F
L
 
Y
L
 
Q
E
 
A
L
 
E
H
 
H
R
 
R
S
 
A
R
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
T
N
 
G
V
 
A
A
 
A
I
 
M
E
 
D
A
 
C
V
 
I
Q
 
E
G
 
G
T
 
D
-
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
V
E
 
T
S
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
M
V
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
S
L
 
V
L
 
I
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
I
Q
 
V
P
 
P
N
 
C
T
 
V
E
 
G
L
 
A
A
 
L
A
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
A
E
 
S
V
 
G
G
 
G
Q
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
E
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
T
 
T
S
 
S
A
 
L
P
 
T
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
C
C
 
A
E
 
A
F
 
H
-
 
A
R
 
N
L
 
D
H
 
F
P
 
A
Q
 
D
G
 
G
V
 
A
F
 
V
Q
 
I
R
 
R
Q
 
L
E
 
E
T
x
S
W
x
V
R
 
Q
N
 
N
A
 
A
E
x
N
T
 
D
Q
 
M
G
 
A
R
 
T
H
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
K
N
 
D
L
 
I
L
 
C
G
 
G
G
 
A
E
 
P
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
E
 
K
V
 
A
I
 
T
P
 
P
G
 
W
F
|
F
W
|
W
S
 
S
D
 
N
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
W
 
L
G
 
K
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
S
A
 
T
N
 
G
T
 
H
Q
 
D
P
 
N
T
 
A
A
 
V
S
 
L
R
 
R
T
 
G
T
 
D
P
 
P
G
 
A
G
 
T
-
 
R
G
 
S
F
 
F
L
 
S
L
 
V
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
A
 
G
E
 
G
Q
 
K
C
 
V
L
 
V
Q
 
A
G
 
L
A
 
D
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
M
A
 
V
K
 
K
D
 
D
I
 
Y
K
 
V
L
 
Q
C
 
G
E
 
K
R
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
E
H
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
Q
L
 
I
S
 
A
V
 
P
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
L
 
M
L
 
L

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
44% identity, 81% coverage: 5:340/413 of query aligns to 1:336/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
N
 
N
A
 
D
P
 
T
L
 
V
V
 
L
I
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
H
|
H
A
|
A
G
 
G
G
 
F
R
 
Q
A
 
V
A
 
A
L
 
V
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
K
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
N
D
|
D
E
|
E
S
 
K
H
 
H
A
 
L
P
 
P
Y
 
Y
E
 
Q
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
|
S
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
S
T
 
G
V
 
G
E
 
D
L
 
P
A
 
N
G
 
S
Y
 
L
S
 
M
L
 
F
C
 
R
D
 
P
T
 
E
A
 
K
Q
 
F
L
 
F
A
 
Q
E
 
D
L
 
Q
G
 
A
I
 
I
E
 
E
H
 
-
L
 
L
A
 
I
G
 
S
N
 
D
P
x
R
V
x
M
K
 
V
C
 
S
L
 
I
D
 
D
P
 
R
Q
 
E
Q
 
G
H
 
R
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
G
S
 
T
W
 
A
L
 
I
H
 
E
Y
 
Y
A
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
 
G
G
 
A
R
 
R
S
 
N
R
 
R
R
 
M
L
 
L
A
 
D
S
 
V
V
 
P
P
 
N
E
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
P
N
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
S
L
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
S
 
R
L
 
M
Q
 
P
P
 
D
D
 
K
T
 
K
R
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
F
 
F
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
T
 
E
V
 
V
T
 
D
L
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
M
G
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
T
E
 
P
Q
 
E
L
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
Y
L
 
F
L
 
H
E
 
D
L
 
R
H
 
H
R
 
S
S
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
R
V
 
M
R
 
H
L
 
Y
N
 
G
V
 
V
-
 
R
A
 
A
I
 
T
E
 
E
A
 
I
V
 
A
Q
 
A
G
 
E
T
 
G
T
 
D
H
 
R
V
 
V
E
 
T
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
N
L
 
T
L
 
L
P
 
P
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
V
Q
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
P
V
 
T
G
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
R
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
D
P
 
P
D
 
H
I
 
I
F
 
S
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
C
C
 
A
E
 
L
F
 
F
R
 
E
L
 
S
H
 
V
P
 
R
Q
 
F
G
 
G
V
 
E
F
 
T
Q
 
M
R
 
R
Q
 
V
E
 
E
T
x
S
W
x
V
R
 
Q
N
 
N
A
 
A
E
 
T
T
 
D
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
H
 
C
A
 
V
A
 
A
L
 
A
N
 
R
L
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
A
L
 
K
P
 
P
F
 
Y
E
 
D
V
 
G
I
 
Y
P
 
P
G
 
W
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
D
W
 
D
G
 
K
L
 
L
Q
 
Q
T
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
T
A
 
A

P16640 Putidaredoxin reductase CamA; Pdr; Putidaredoxin--NAD(+) reductase; EC 1.18.1.5 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
37% identity, 100% coverage: 1:411/413 of query aligns to 1:412/422 of P16640

query
sites
P16640
M
 
M
N
 
N
P
 
-
A
 
A
N
 
N
A
 
D
P
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
T
G
 
G
H
 
L
A
|
A
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
F
T
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
E
 
S
G
 
G
Y
 
W
S
 
E
G
 
G
R
 
N
L
 
I
I
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
A
S
 
T
H
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
H
E
 
H
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
A
E
 
T
L
 
A
A
 
E
G
 
S
Y
 
L
S
 
Y
L
 
L
C
 
R
D
 
T
T
 
P
A
 
D
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
A
L
 
Q
G
 
N
I
 
I
E
 
Q
H
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
Q
V
|
V
K
 
T
C
 
A
L
 
I
D
 
N
P
 
R
Q
 
D
Q
 
R
H
 
Q
R
 
Q
L
 
V
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
A
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
A
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
P
R
 
R
R
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
A
 
S
S
 
G
V
 
A
P
 
V
E
 
G
H
 
K
L
 
A
L
 
N
N
 
N
V
 
F
L
 
R
Y
 
Y
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
R
S
 
Q
L
 
L
Q
 
I
P
 
A
D
 
D
T
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
K
L
 
A
G
 
N
C
 
M
T
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
T
G
 
A
P
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
L
G
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
T
P
 
A
E
 
P
Q
 
P
L
 
V
S
 
S
S
 
A
V
 
F
L
 
Y
L
 
E
E
 
H
L
 
L
H
 
H
R
 
R
S
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
T
N
 
G
V
 
T
A
 
Q
I
 
V
E
 
C
A
 
G
V
 
F
Q
 
E
G
 
M
T
 
S
T
 
T
H
 
D
V
 
Q
E
 
Q
S
 
K
V
 
V
Q
 
T
L
 
A
V
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
L
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
L
Q
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
C
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
G
 
D
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
R
 
V
V
 
I
D
 
N
A
 
E
Q
 
H
L
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
A
 
D
P
 
P
D
 
L
I
 
I
F
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
C
C
 
A
E
 
R
F
 
F
R
 
H
L
 
S
H
 
Q
P
 
L
Q
 
Y
G
 
D
V
 
R
F
 
W
Q
 
V
R
 
R
Q
 
I
E
 
E
T
 
S
W
x
V
R
 
P
N
 
N
A
 
A
E
 
L
T
 
E
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
H
 
K
A
 
I
A
 
A
L
 
A
N
 
I
L
 
L
L
 
C
G
 
G
G
 
K
E
 
V
L
 
P
P
 
R
F
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
A
P
 
P
G
 
W
F
 
F
W
 
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
E
W
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
T
 
M
V
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
S
A
 
E
N
 
G
T
 
Y
Q
 
D
P
 
R
T
 
I
A
 
I
S
 
V
R
 
R
-
 
G
T
 
S
T
 
L
P
 
A
G
 
Q
G
 
P
G
 
D
F
 
F
L
 
S
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
D
 
Q
A
 
G
E
 
D
Q
 
R
C
 
V
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
A
G
 
V
N
 
D
S
 
T
I
 
V
A
 
N
K
 
R
D
 
P
I
 
V
K
 
E
L
 
F
-
 
N
-
 
Q
C
 
S
E
 
K
R
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
T
H
 
D
R
 
R
N
 
L
L
 
P
L
 
V
S
 
E
V
 
P
D
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
A
 
E
D
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
L
 
I
L
 
I

1q1wA Crystal structure of putidaredoxin reductase from pseudomonas putida (see paper)
37% identity, 99% coverage: 4:411/413 of query aligns to 2:411/422 of 1q1wA

query
sites
1q1wA
A
 
A
N
 
N
A
 
D
P
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
T
G
|
G
H
x
L
A
|
A
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
F
T
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
E
 
S
G
 
G
Y
 
W
S
 
E
G
 
G
R
 
N
L
 
I
I
 
R
L
 
L
I
 
V
G
|
G
D
|
D
E
 
A
S
 
T
H
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
H
E
 
H
R
x
L
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
A
E
 
T
L
 
A
A
 
E
G
 
S
Y
 
L
S
 
Y
L
 
L
C
 
R
D
 
T
T
 
P
A
 
D
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
A
L
 
Q
G
 
N
I
 
I
E
 
Q
H
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
Q
V
|
V
K
 
T
C
 
A
L
 
I
D
 
N
P
 
R
Q
 
D
Q
 
R
H
 
Q
R
 
Q
L
 
V
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
A
L
 
L
H
 
D
Y
 
Y
A
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
G
 
G
R
 
R
S
 
P
R
 
R
R
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
A
 
S
S
 
G
V
 
A
P
 
V
E
 
G
H
 
K
L
 
A
L
 
N
N
 
N
V
 
F
L
 
R
Y
 
Y
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
C
L
 
I
R
 
R
A
 
R
S
 
Q
L
 
L
Q
 
I
P
 
A
D
 
D
T
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
K
L
 
A
G
 
N
C
 
M
T
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
T
G
 
A
P
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
L
G
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
T
P
 
A
E
 
P
Q
 
P
L
 
V
S
 
S
S
 
A
V
 
F
L
 
Y
L
 
E
E
 
H
L
 
L
H
 
H
R
 
R
S
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
T
N
 
G
V
 
T
A
 
Q
I
 
V
E
 
C
A
 
G
V
 
F
Q
 
E
G
 
M
T
 
S
T
 
T
H
 
D
V
 
Q
E
 
Q
S
 
K
V
 
V
Q
 
T
L
 
A
V
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
L
P
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
L
Q
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
C
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
G
 
D
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
R
 
V
V
 
I
D
 
N
A
 
E
Q
 
H
L
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
A
 
D
P
 
P
D
 
L
I
 
I
F
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
C
C
 
A
E
 
R
F
 
F
R
 
H
L
 
S
H
 
Q
P
 
L
Q
 
Y
G
 
D
V
 
R
F
 
W
Q
 
V
R
 
R
Q
 
I
E
 
E
T
x
S
W
x
V
R
 
P
N
 
N
A
 
A
E
x
L
T
 
E
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
H
 
K
A
 
I
A
 
A
L
 
A
N
 
I
L
 
L
L
 
C
G
 
G
G
 
K
E
 
V
L
 
P
P
 
R
F
 
D
E
 
E
V
 
A
I
 
A
P
 
P
G
 
W
F
 
F
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
E
W
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
T
 
M
V
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
S
A
 
E
N
 
G
T
 
Y
Q
 
D
P
 
R
T
 
I
A
 
I
S
 
V
R
 
R
-
 
G
T
 
S
T
 
L
P
 
A
G
 
Q
G
 
P
G
 
D
F
 
F
L
 
S
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
D
 
Q
A
 
G
E
 
D
Q
 
R
C
 
V
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
A
G
 
V
N
 
D
S
 
T
I
 
V
A
 
N
K
 
R
D
 
P
I
 
V
K
 
E
L
 
F
-
 
N
-
 
Q
C
 
S
E
 
K
R
 
Q
L
 
I
I
 
I
A
 
T
H
 
D
R
 
R
N
 
L
L
 
P
L
 
V
S
 
E
V
 
P
D
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
A
 
E
D
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
L
 
I
L
 
I

1f3pA Ferredoxin reductase (bpha4)-nadh complex (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 3:398/401 of 1f3pA

query
sites
1f3pA
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
H
x
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
x
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
x
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
|
E
A
x
T
G
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
|
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
|
I
G
|
G
M
x
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
x
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
|
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

2yvjA Crystal structure of the ferredoxin-ferredoxin reductase (bpha3- bpha4)complex (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 3:398/402 of 2yvjA

query
sites
2yvjA
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
G
|
G
H
x
L
A
 
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
|
G
D
|
D
E
|
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
x
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
x
V
E
|
E
A
x
T
G
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
|
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
|
I
G
|
G
M
x
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
x
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

8pxkA Structure of nadh-dependent ferredoxin reductase, bpha4, solved at wavelength 5.76 a (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 4:399/403 of 8pxkA

query
sites
8pxkA
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
H
 
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
T
G
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
 
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

2gr2A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 2:397/401 of 2gr2A

query
sites
2gr2A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
H
x
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
|
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
x
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
|
E
A
x
T
G
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
|
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
|
I
G
|
G
M
 
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
x
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

2gr0A Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 (oxidized form, NAD+ complex) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 2:397/401 of 2gr0A

query
sites
2gr0A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
H
x
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
|
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
x
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
x
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
|
E
A
x
T
G
 
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
|
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
|
I
G
|
G
M
 
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
x
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
 
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

4h4uA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 t176r mutant (reduced form)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 3:398/401 of 4h4uA

query
sites
4h4uA
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
H
x
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
|
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
|
E
A
x
R
G
x
Q
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G
 
S
R
 
R
V
 
A
L
 
A
P
 
P
E
 
A
Q
 
T
L
 
L
S
 
A
S
 
D
V
 
F
L
 
V
L
 
A
E
 
R
L
 
Y
H
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
F
N
 
E
V
 
R
A
 
S
I
 
V
E
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
G
H
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
G
V
 
V
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
-
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
R
L
 
I
P
 
A
C
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
I
|
I
G
|
G
M
 
V
Q
 
L
P
 
A
N
 
N
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
A
V
 
C
G
 
D
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Q
 
Y
L
 
G
R
 
R
T
 
T
S
 
T
A
 
C
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
C
 
T
E
 
R
F
 
Q
R
 
R
L
 
N
H
 
P
P
 
L
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
x
I
E
|
E
T
|
T
W
|
W
R
 
S
N
 
N
A
|
A
E
x
Q
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
R
 
I
H
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
H
L
 
L
L
 
V
G
 
D
G
 
P
E
 
T
L
 
A
P
 
P
-
 
G
F
 
Y
E
 
A
V
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
W
F
x
Y
W
|
W
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
D
 
A
W
 
L
G
 
R
L
 
I
Q
 
Q
T
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
G
T
 
D
Q
 
E
P
 
E
T
 
I
A
 
V
-
 
R
-
 
G
S
 
E
R
 
V
T
 
S
T
 
L
P
 
D
G
 
A
G
 
P
G
 
K
F
 
F
L
 
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
E
L
 
L
D
 
Q
A
 
K
E
 
G
Q
 
R
C
 
I
L
 
V
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
C
 
C
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
V
S
 
N
I
 
N
A
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
A
L
 
P
C
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
A
H
 
V
R
 
G
N
 
A
L
 
K
L
 
P
S
 
D
V
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
A
V
 
T
P
 
D
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
L
 
L

4h4wA Crystal structure of ferredoxin reductase, bpha4 e175c/t176r/q177g mutant (reduced form)
37% identity, 98% coverage: 5:410/413 of query aligns to 2:397/399 of 4h4wA

query
sites
4h4wA
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
|
G
H
x
L
A
|
A
G
 
S
G
 
V
R
 
S
A
 
F
A
 
V
L
 
A
T
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
I
I
 
T
L
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
E
 
E
S
 
A
H
 
E
A
 
R
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
R
|
R
P
|
P
P
 
P
L
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
D
L
 
F
L
 
M
-
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
K
S
 
I
L
 
R
C
 
L
D
 
D
T
 
C
A
 
K
Q
 
R
L
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
T
V
x
A
K
 
Q
C
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
H
R
 
T
L
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
G
 
G
S
 
R
W
 
T
L
 
L
H
 
P
Y
 
Y
A
 
G
R
 
T
L
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
 
P
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
P
S
 
T
V
 
L
P
 
Q
E
 
G
H
 
A
L
 
T
L
 
M
N
 
P
V
 
V
L
 
H
Y
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
H
 
L
D
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
Q
T
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
F
 
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
G
C
 
V
T
 
H
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
C
A
x
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
M
G