SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4688 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4688 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
36% identity, 83% coverage: 23:286/317 of query aligns to 16:280/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
D
I
 
A
G
 
G
Q
 
L
V
 
E
S
 
V
F
 
I
I
 
Y
H
 
E
D
 
E
Y
 
Y
P
 
P
A
 
-
D
 
D
N
 
E
E
 
D
T
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
V
G
 
K
A
 
D
F
 
V
E
 
E
V
 
A
I
 
I
C
 
I
V
 
V
M
 
-
R
 
R
E
 
S
R
 
K
T
 
P
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
R
D
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
E
R
 
S
L
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
V
L
 
I
V
 
A
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
V
R
 
G
N
 
L
A
 
D
A
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
V
 
V
C
 
V
G
 
N
T
 
A
D
 
P
S
 
A
-
 
A
Y
x
S
K
 
S
H
 
R
A
 
S
A
x
V
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
A
W
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
M
M
 
F
A
 
S
A
 
V
T
 
A
R
 
R
N
 
K
L
 
I
V
 
A
A
 
F
E
 
A
A
 
D
N
 
R
A
 
K
L
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
-
 
A
-
 
K
Q
 
K
Q
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
I
D
 
E
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Y
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
K
F
 
I
G
 
A
Q
 
N
V
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
N
V
 
I
I
 
L
A
 
L
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
Y
L
 
P
T
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
N
V
 
G
T
 
K
Y
 
F
V
 
V
S
 
D
K
 
L
Q
 
E
E
 
T
L
 
L
F
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
T
V
 
I
H
 
H
L
x
V
V
x
P
L
 
L
S
 
V
E
 
E
R
 
S
S
x
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
A
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
K
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
T
 
T
A
 
A
W
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
S
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
K
 
E
K
 
G
R
 
W
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
K
H
 
D
H
 
H
P
 
P
F
 
L
R
 
T
T
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
32% identity, 85% coverage: 41:311/317 of query aligns to 37:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
K
A
 
D
F
 
V
E
 
D
V
 
A
I
 
L
C
 
V
V
 
T
M
|
M
R
x
L
E
 
S
R
 
E
T
 
-
R
 
R
F
 
I
D
 
D
E
 
Q
D
 
E
L
 
V
L
 
F
R
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
T
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
N
G
x
Y
G
x
A
M
x
V
R
x
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
C
 
T
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
D
S
 
V
Y
x
L
K
 
T
H
 
N
A
 
A
A
x
T
P
 
A
E
 
D
L
 
H
T
 
A
W
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
T
T
 
A
R
 
R
N
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
K
E
 
G
A
 
D
N
 
K
A
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
G
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
Y
D
 
E
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
R
G
 
A
Q
 
K
V
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
Y
W
 
Y
S
|
S
E
x
R
N
 
T
L
 
R
T
 
K
A
 
S
E
 
Q
R
 
A
A
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
L
D
 
G
V
 
A
T
 
E
Y
 
Y
V
 
R
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
I
V
 
L
H
x
A
L
x
V
V
x
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
R
 
E
S
x
T
R
 
M
G
 
Y
L
 
M
V
 
I
D
 
N
A
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
K
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
T
A
 
A
W
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
K
 
E
K
 
G
R
 
W
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
R
 
N
H
 
E
H
 
E
P
 
L
F
 
F
R
 
-
T
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
Y
 
S
V
 
A
S
 
T
R
 
F
Q
 
E
N
 
A
Y
 
R
Q
 
E
L
 
A
F
 
M
F
 
A
S
 
E
Q
 
L
M
 
V
I
 
A
E
 
R
D
 
N
I
 
L
Q
 
I
A
 
A
W
 
F
A
 
K
A
 
R
G
 
G
E
 
E

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 44:282/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 48:286/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
x
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
|
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
 
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 46:284/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
x
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
|
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
x
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
x
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 48:286/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
x
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
|
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 46:284/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
35% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 52:290/533 of O43175

query
sites
O43175
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
R
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
x
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
x
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
 
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
Y
x
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
38% identity, 65% coverage: 86:291/317 of query aligns to 69:276/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
L
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
H
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
x
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
x
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
34% identity, 87% coverage: 38:312/317 of query aligns to 43:330/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
A
 
A
D
 
D
N
 
T
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
V
C
 
C
V
 
A
M
 
F
R
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
V
D
 
N
E
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
S
R
 
R
R
 
-
L
 
-
P
 
P
T
 
V
L
 
L
K
 
E
L
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
R
 
R
N
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
H
-
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
C
 
V
G
 
H
T
 
V
D
 
P
S
 
A
Y
|
Y
K
x
S
-
 
P
H
 
H
A
 
A
A
 
V
P
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
L
T
 
N
R
 
R
N
 
R
L
 
L
V
 
H
A
 
R
E
 
A
A
 
Y
N
 
N
A
 
R
L
 
T
R
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
D
W
 
F
Q
 
S
-
 
L
Q
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
G
-
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
A
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
S
x
Q
I
|
I
G
 
G
Q
 
E
R
 
T
V
 
F
A
 
A
R
 
R
F
 
I
G
 
M
Q
 
A
V
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
C
R
 
E
V
 
L
I
 
L
A
 
A
W
x
Y
S
 
-
E
x
D
N
x
P
L
 
Y
T
 
P
A
 
N
E
 
P
R
 
R
A
 
I
A
 
Q
E
 
A
V
 
L
D
 
G
V
 
G
T
 
R
Y
 
Y
V
 
L
S
 
A
K
 
L
Q
 
D
E
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
A
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
V
S
 
S
V
 
L
H
 
H
L
x
C
V
x
P
L
 
L
S
 
T
E
 
A
R
 
D
S
x
T
R
 
R
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
D
 
A
W
 
T
M
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
A
W
 
M
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
N
E
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
Y
A
 
L
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
H
 
E
E
|
E
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
R
 
D
H
 
D
H
 
V
P
 
L
F
 
A
R
 
R
T
 
L
L
 
L
D
 
S
-
 
F
-
 
P
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
V
 
Q
G
x
A
Y
 
F
V
 
L
S
 
T
R
 
R
Q
 
E
N
 
A
Y
 
L
Q
 
A
L
 
A
F
 
I
F
 
A
S
 
D
Q
 
T
M
 
T
I
 
L
E
 
D
D
 
N
I
 
I
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
E
 
T
P
 
P

7cvpA The crystal structure of human phgdh from biortus.
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 54:239/254 of 7cvpA

query
sites
7cvpA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

6rj6A Crystal structure of phgdh in complex with bi-4924 (see paper)
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 5:190/204 of 6rj6A

query
sites
6rj6A
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

5ofwA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 3-chloro-4-fluorobenzamide (see paper)
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 6:191/195 of 5ofwA

query
sites
5ofwA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
 
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
x
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

5ofvA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 5-fluoro-2-methylbenzoic acid (see paper)
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 6:191/195 of 5ofvA

query
sites
5ofvA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
 
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

5ofmA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 5-amino-1-methyl-1h-indole
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 6:191/195 of 5ofmA

query
sites
5ofmA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
 
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
x
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

5nzqA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 3-(1,3-oxazol-5-yl)aniline. (see paper)
38% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 6:191/195 of 5nzqA

query
sites
5nzqA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
A
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
V
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
 
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
V
 
F
D
 
G
V
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
A
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
T
 
G
A
 
V
W
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
S
K
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
H
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
R
 
R
H
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_4688 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4688
MAVQIAVIDDWQDVARDVVDWSVLDSIGQVSFIHDYPADNETLAERLGAFEVICVMRERT
RFDEDLLRRLPTLKLLVTGGMRNAALDLKAAAALGIQVCGTDSYKHAAPELTWALIMAAT
RNLVAEANALRAGQWQQGLGGDLQGKTLAILGLGSIGQRVARFGQVFGMRVIAWSENLTA
ERAAEVDVTYVSKQELFEQADVLSVHLVLSERSRGLVDAQALDWMKPTAWLVNTARGPIV
DESALIKALQKKRLAGAALDVFEHEPLPRHHPFRTLDNVLATPHVGYVSRQNYQLFFSQM
IEDIQAWAAGEPIRILS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory