SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4786 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4786 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gqnA X-ray structure of thiolase with coa
63% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 3:390/390 of 8gqnA

query
sites
8gqnA
I
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
A
A
 
G
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
A
S
 
G
L
 
V
T
 
S
A
 
A
P
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
A
E
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
C
V
 
V
L
 
L
S
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
K
Q
 
Q
A
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
A
S
 
A
T
 
T
R
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
L
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
H
D
 
D
M
 
L
L
 
L
I
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
T
A
 
N
D
 
Q
V
 
V
V
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
L
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
K
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
Y
 
R
D
 
-
K
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
T
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
C
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
K
N
 
Y
G
 
G
F
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
E
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
E
S
 
S
T
 
L
T
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
N
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
S
G
 
R
K
 
K
E
 
G
Q
 
E
V
 
S
L
 
V
I
 
V
S
 
K
H
 
D
D
 
D
E
 
E
Q
|
Q
P
 
P
P
 
L
K
 
T
A
 
A
K
 
N
L
 
L
D
 
E
K
 
K
I
|
I
A
 
P
S
 
S
L
|
L
K
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
I
T
 
T
A
|
A
A
|
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
S
I
|
I
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
T
R
 
A
S
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
K
 
R
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
T
F
 
Q
A
 
S
D
 
Q
T
 
D
P
 
P
G
 
S
L
 
E
F
 
F
P
 
T
V
 
L
A
 
A
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
K
 
T
K
 
N
L
 
L
M
 
F
K
 
A
K
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
S
L
 
K
D
 
D
E
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
M
V
 
V
S
 
T
L
 
M
V
 
L
T
 
A
M
 
M
T
 
R
K
 
E
L
 
H
E
 
G
I
 
L
P
 
D
H
 
H
E
 
A
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
T
G
 
G
A
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
I
V
 
L
T
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
L
 
G
K
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
L
E
 
E
C
 
L
L
 
L

6aqpA Aspergillus fumigatus cytosolic thiolase: acetylated enzyme in complex with coa and potassium ions
52% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 8:397/397 of 6aqpA

query
sites
6aqpA
I
 
V
V
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
S
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
V
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
H
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
V
-
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
S
S
 
D
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
N
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
E
S
 
S
T
 
T
R
 
I
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
G
H
 
A
D
 
Q
M
 
T
L
 
I
I
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Y
 
A
R
 
K
M
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
Q
R
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
G
M
 
I
F
 
M
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
-
D
 
G
K
 
K
G
 
Q
R
 
E
L
 
L
M
 
M
G
 
G
T
 
L
F
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
E
C
 
C
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
N
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
R
S
 
T
T
x
Y
T
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
P
V
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
T
I
 
V
S
 
T
H
 
Q
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
P
P
 
K
K
x
N
A
 
L
K
x
N
L
 
P
D
 
E
K
|
K
I
 
L
A
 
R
S
 
A
L
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
I
D
 
P
G
 
G
-
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
x
P
N
 
N
S
 
S
S
|
S
S
 
P
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
V
R
 
S
R
 
E
S
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
L
G
 
G
H
 
W
A
 
G
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
Q
T
 
Q
P
 
P
G
 
S
L
 
K
F
 
F
P
 
T
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
A
G
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
P
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
K
K
 
H
T
 
A
G
 
G
W
 
V
S
 
G
L
 
Q
D
 
D
E
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
M
T
 
K
K
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
K
 
K
G
 
K
L
 
G
K
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
I
C
|
C
I
 
N
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
V
V
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
L

Q4WCL5 Acetyl-CoA acetyltransferase erg10B, cytosolic; Acetoacetyl-CoA thiolase erg10B; ACAT; Cytosolic thiolase erg10B; CT; Ergosterol biosynthesis protein 10B; EC 2.3.1.9 from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata)
52% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 7:398/398 of Q4WCL5

query
sites
Q4WCL5
I
 
V
V
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
S
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
V
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
H
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
V
-
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
S
S
 
D
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
N
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
E
S
 
S
T
 
T
R
 
I
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
 
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
G
H
 
A
D
 
Q
M
 
T
L
 
I
I
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Y
 
A
R
 
K
M
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
Q
R
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
G
M
 
I
F
 
M
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
-
D
 
G
K
 
K
G
 
Q
R
 
E
L
 
L
M
 
M
G
 
G
T
 
L
F
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
E
C
 
C
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
N
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
R
S
 
T
T
x
Y
T
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
P
-
 
G
-
 
F
V
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
T
I
 
V
S
 
T
H
 
Q
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
P
P
 
K
K
 
N
A
 
L
K
x
N
L
 
P
D
 
E
K
|
K
I
 
L
A
 
R
S
 
A
L
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
I
D
 
P
G
 
G
-
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
x
P
N
 
N
S
|
S
S
|
S
S
 
P
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
V
R
 
S
R
 
E
S
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
L
G
 
G
H
 
W
A
 
G
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
Q
T
 
Q
P
 
P
G
 
S
L
 
K
F
 
F
P
 
T
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
A
G
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
P
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
K
K
 
H
T
 
A
G
 
G
W
 
V
S
 
G
L
 
Q
D
 
D
E
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
M
T
 
K
K
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
x
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
K
 
K
G
 
K
L
 
G
K
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
I
C
 
C
I
x
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
V
V
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
L

6aqpC Aspergillus fumigatus cytosolic thiolase: acetylated enzyme in complex with coa and potassium ions
52% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 8:399/399 of 6aqpC

query
sites
6aqpC
I
 
V
V
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
S
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
V
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
H
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
V
-
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
S
S
 
D
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
F
F
 
F
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
N
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
K
 
E
S
 
S
T
 
T
R
 
I
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
G
H
 
A
D
 
Q
M
 
T
L
 
I
I
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Y
 
A
R
 
K
M
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
Q
R
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
G
M
 
I
F
 
M
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
-
D
 
G
K
 
K
G
 
Q
R
 
E
L
 
L
M
|
M
G
 
G
T
 
L
F
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
E
C
 
C
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
N
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
R
S
 
T
T
x
Y
T
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
I
T
 
Q
V
 
L
T
 
P
-
 
G
-
 
F
V
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
T
I
 
V
S
 
T
H
 
Q
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
P
P
 
K
K
 
N
A
 
L
K
x
N
L
 
P
D
 
E
K
|
K
I
x
L
A
 
R
S
 
A
L
x
I
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
I
D
 
P
G
 
G
-
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
x
P
N
 
N
S
 
S
S
|
S
S
 
P
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
V
R
 
S
R
 
E
S
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
L
G
 
G
H
 
W
A
 
G
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
Q
T
 
Q
P
 
P
G
 
S
L
 
K
F
|
F
P
 
T
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
A
G
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
P
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
K
K
 
H
T
 
A
G
 
G
W
 
V
S
 
G
L
 
Q
D
 
D
E
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
M
T
 
K
K
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
L
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
A
K
 
K
G
 
K
L
 
G
K
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
C
A
 
A
A
 
G
I
 
I
C
|
C
I
 
N
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
L
A
 
V
V
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
L

P45359 Acetyl-CoA acetyltransferase; Acetoacetyl-CoA thiolase; CaTHL; EC 2.3.1.9 from Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / IAM 19013 / LMG 5710 / NBRC 13948 / NRRL B-527 / VKM B-1787 / 2291 / W) (see paper)
48% identity, 97% coverage: 8:394/397 of query aligns to 4:390/392 of P45359

query
sites
P45359
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
Y
Q
 
G
G
 
K
E
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
V
T
 
P
A
 
A
P
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
L
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
F
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
x
V
S
 
E
T
 
I
R
 
P
C
 
A
T
 
M
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
R
A
 
T
T
 
V
I
x
S
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
M
 
I
L
 
I
I
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
R
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
D
 
N
R
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
N
G
 
A
R
 
K
V
 
F
L
 
V
D
 
D
H
 
E
M
 
M
F
 
I
L
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
W
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
D
x
N
K
 
D
G
 
Y
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
R
N
 
W
G
 
N
F
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
S
T
 
Q
T
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
Q
F
 
F
N
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
K
V
 
G
G
 
R
K
 
K
E
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
V
I
 
V
S
 
D
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
H
P
 
P
P
 
R
-
 
F
K
 
G
A
 
S
K
 
T
L
 
I
D
 
E
K
 
G
I
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
K
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
 
S
S
 
G
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
M
 
M
R
 
S
R
 
A
S
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
V
G
 
S
H
 
Y
A
x
G
A
x
S
F
 
A
A
 
G
D
 
V
T
 
D
P
 
P
G
x
A
L
 
I
F
 
M
P
 
G
V
 
Y
A
 
G
P
 
P
V
 
F
G
 
Y
A
 
A
I
 
T
K
 
K
K
 
A
L
 
A
M
 
I
K
 
E
K
 
K
T
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
I
E
 
E
V
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
A
T
 
K
K
 
D
L
 
L
E
 
K
I
 
F
P
 
D
H
 
M
E
 
N
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
V
S
 
H
A
 
A
L
 
M
R
 
Q
Q
 
K
K
 
R
G
 
D
L
 
A
K
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
L
C
|
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
T
A
|
A
M
 
I
A
 
L
V
 
L
E
 
E

4xl4A Crystal structure of thiolase from clostridium acetobutylicum in complex with coa (see paper)
48% identity, 97% coverage: 8:394/397 of query aligns to 4:390/392 of 4xl4A

query
sites
4xl4A
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
Y
Q
 
G
G
 
K
E
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
V
T
 
P
A
 
A
P
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
K
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
L
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
F
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
V
S
 
E
T
 
I
R
 
P
C
 
A
T
 
M
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
R
A
 
T
T
 
V
I
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
M
 
I
L
 
I
I
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
R
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
D
 
N
R
 
N
A
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
N
G
 
A
R
 
K
V
 
F
L
 
V
D
 
D
H
 
E
M
 
M
F
 
I
L
 
T
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
W
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
D
 
N
K
 
D
G
 
Y
R
x
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
R
N
 
W
G
 
N
F
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
S
T
 
Q
T
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
Q
F
 
F
N
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
K
V
 
G
G
 
R
K
 
K
E
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
V
I
 
V
S
 
D
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
H
P
 
P
P
x
R
-
 
F
K
 
G
A
 
S
K
 
T
L
 
I
D
 
E
K
 
G
I
 
L
A
 
A
S
 
K
L
|
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
K
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
M
 
M
R
 
S
R
 
A
S
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
V
G
 
S
H
 
Y
A
 
G
A
 
S
F
 
A
A
 
G
D
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
M
P
 
G
V
 
Y
A
 
G
P
 
P
V
 
F
G
 
Y
A
 
A
I
 
T
K
 
K
K
 
A
L
 
A
M
 
I
K
 
E
K
 
K
T
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
I
E
 
E
V
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
A
T
 
K
K
 
D
L
 
L
E
 
K
I
 
F
P
 
D
H
 
M
E
 
N
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
V
S
 
H
A
 
A
L
 
M
R
 
Q
Q
 
K
K
 
R
G
 
D
L
 
A
K
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
L
C
x
S
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
L
V
 
L
E
 
E

7cw5B Acetyl-coa acetyltransferase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
48% identity, 97% coverage: 9:395/397 of query aligns to 4:391/394 of 7cw5B

query
sites
7cw5B
V
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
V
G
 
G
G
 
K
F
 
F
Q
 
G
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
D
L
 
V
T
 
K
A
 
A
P
 
T
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
A
E
 
S
S
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
C
 
T
V
 
V
L
 
I
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
A
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
P
K
 
W
S
 
E
T
 
V
R
 
Q
C
 
T
T
 
E
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
R
A
 
A
T
 
V
I
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
D
D
 
Q
M
 
I
L
 
I
I
 
R
A
 
T
G
 
G
S
 
D
A
 
Q
D
 
S
V
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
S
P
 
P
F
 
Y
L
 
I
L
 
L
D
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
N
G
 
N
R
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
H
 
L
M
 
N
F
 
V
L
 
A
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
T
D
 
C
A
 
A
Y
 
F
D
 
-
K
 
S
G
 
G
R
 
T
L
x
H
M
|
M
G
 
G
T
 
V
F
 
Y
A
 
G
E
 
G
D
 
E
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
D
G
 
G
F
 
I
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
W
A
 
A
I
 
Y
A
 
R
S
 
S
T
 
H
T
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
V
Q
 
S
A
 
A
I
 
H
K
 
K
D
 
E
G
 
G
S
 
R
F
 
F
N
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
I
T
 
P
V
 
Q
G
 
R
K
 
K
-
 
G
E
 
D
Q
 
P
V
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
A
H
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
P
 
P
P
x
R
K
 
E
-
 
D
A
x
T
K
 
T
L
 
I
D
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
K
G
 
T
G
 
A
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
x
P
S
 
G
I
x
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
S
R
 
E
S
 
D
E
 
R
A
 
A
E
 
K
K
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
I
 
I
H
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
A
D
 
V
T
 
E
P
 
S
G
 
K
L
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
R
A
 
T
P
 
P
V
 
G
G
 
Y
A
 
A
I
 
I
K
 
N
K
 
A
L
 
L
M
 
L
K
 
E
K
 
K
T
 
T
G
 
G
W
 
K
S
 
T
L
 
I
D
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
A
V
 
V
S
 
A
L
 
I
V
 
A
T
 
S
M
 
T
T
 
E
K
 
I
L
 
A
E
 
G
I
 
I
P
 
D
H
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
G
K
 
G
R
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
I
 
S
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
M
V
 
I
E
 
E
C
 
V

6bn2A Crystal structure of acetyl-coa acetyltransferase from elizabethkingia anophelis nuhp1
46% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 4:392/393 of 6bn2A

query
sites
6bn2A
I
 
V
V
 
F
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
M
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
G
L
 
V
T
 
P
A
 
A
P
 
T
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
I
G
 
N
I
 
L
A
 
N
P
 
P
E
 
A
S
 
E
V
 
I
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
E
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
N
S
 
T
T
 
T
R
 
P
C
 
T
T
 
T
T
 
A
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
M
L
 
M
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
M
 
A
L
 
V
I
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
D
A
 
V
D
 
E
V
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
Q
A
 
V
P
 
P
F
 
H
L
 
Y
L
 
I
D
 
D
R
 
-
A
 
G
R
 
R
S
 
N
G
 
G
Y
 
V
R
 
K
M
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
I
R
 
K
V
 
L
L
 
Q
D
 
D
H
 
G
M
 
L
F
 
L
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
S
K
 
K
G
 
-
R
 
Q
L
 
H
M
 
M
G
 
G
T
 
N
F
 
C
A
 
A
E
 
E
D
 
L
C
 
C
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
Y
G
 
N
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
T
x
Y
T
 
E
R
 
R
A
 
S
Q
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
W
K
 
S
D
 
E
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
K
A
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
S
V
 
I
T
 
P
V
 
Q
G
 
R
K
 
K
-
 
G
E
 
E
Q
 
P
V
 
I
L
 
I
I
 
F
S
 
A
H
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
Y
P
 
K
K
 
N
A
 
V
K
 
K
L
 
F
D
 
D
K
 
R
I
 
I
A
 
P
S
 
T
L
 
L
K
 
P
P
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
Q
R
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
|
A
N
 
N
S
x
A
S
 
S
S
 
T
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
S
R
 
K
S
 
E
E
 
K
A
 
M
E
 
E
K
 
S
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
K
I
 
I
H
 
V
G
 
S
H
 
Y
A
 
A
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
Q
T
 
A
P
 
P
G
 
E
L
 
W
F
 
F
P
 
T
V
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
A
G
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
P
K
 
I
L
 
A
M
 
L
K
 
A
K
 
K
T
 
A
G
 
N
W
 
L
S
 
T
L
 
I
D
 
N
E
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
F
F
 
F
E
 
E
V
 
F
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
N
T
 
K
K
 
I
L
 
L
E
 
G
I
 
L
P
 
D
H
 
A
E
 
A
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
x
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
S
R
 
R
I
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
I
S
 
N
A
 
V
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
K
 
N
G
 
N
L
 
A
K
 
K
R
 
Y
G
 
G
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
C
|
C
I
 
N
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
V
 
I
E
 
E
C
 
N
L
 
I

P41338 Acetyl-CoA acetyltransferase; Acetoacetyl-CoA thiolase; Ergosterol biosynthesis protein 10; EC 2.3.1.9 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
48% identity, 97% coverage: 8:394/397 of query aligns to 5:396/398 of P41338

query
sites
P41338
I
 
V
V
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
T
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
K
T
 
T
A
 
A
P
 
V
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
V
G
 
P
-
 
E
-
 
L
I
 
D
A
 
A
P
 
S
E
 
K
S
 
D
V
 
F
E
 
D
E
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
F
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
N
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
S
K
 
N
S
 
H
T
 
I
R
 
V
C
 
A
T
 
S
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
 
C
G
 
A
S
 
S
G
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
G
H
 
A
D
 
Q
M
 
S
L
 
I
I
 
K
A
 
C
G
 
G
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
C
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
T
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
Y
L
 
M
D
 
P
R
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
A
G
 
G
Y
 
A
R
 
K
M
 
F
G
 
G
H
 
Q
G
 
T
R
 
V
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
G
M
 
V
F
 
E
L
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
N
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
-
G
 
G
R
 
L
L
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
V
F
 
H
A
 
A
E
 
E
D
 
K
C
 
C
A
 
A
E
 
R
T
 
D
N
 
W
G
 
D
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
A
 
N
F
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
E
S
 
S
T
 
Y
T
 
Q
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
S
I
 
Q
K
 
K
D
 
E
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
D
A
 
N
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
I
T
 
K
-
 
G
-
 
F
V
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
P
Q
 
D
V
 
T
L
 
Q
I
 
V
S
 
T
H
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
P
P
 
A
K
 
R
A
 
L
K
 
H
L
 
V
D
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
R
S
 
S
L
 
A
K
 
R
P
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
Q
R
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
 
S
S
 
P
I
 
I
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
I
L
 
L
M
 
V
R
 
S
R
 
E
S
 
K
E
 
V
A
 
L
E
 
K
K
 
E
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
I
H
 
K
G
 
G
H
 
W
A
 
G
A
 
E
F
 
A
A
 
A
D
 
H
T
 
Q
P
 
P
G
 
A
L
 
D
F
 
F
P
 
T
V
 
W
A
 
A
P
 
P
V
 
S
G
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
P
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
K
K
 
H
T
 
A
G
 
G
W
 
I
-
 
E
S
 
D
L
 
I
D
 
N
E
 
S
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
F
 
F
E
 
E
V
 
F
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
N
M
 
T
T
 
K
K
 
I
L
 
L
E
 
K
I
 
L
P
 
D
H
 
P
E
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
C
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
I
L
 
L
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
E
G
 
G
L
 
G
K
 
K
R
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
S
M
 
I
A
 
V
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2ib8D Crystallographic and kinetic studies of human mitochondrial acetoacetyl-coa thiolase (t2): the importance of potassium and chloride for its structure and function (see paper)
48% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 8:393/393 of 2ib8D

query
sites
2ib8D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
L
L
 
L
T
 
P
A
 
A
P
 
T
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
I
S
 
S
T
 
T
R
 
P
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
L
 
M
A
 
A
H
 
S
D
 
Q
M
 
S
L
 
L
I
 
M
A
 
C
G
 
G
S
 
H
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
L
 
M
D
 
N
R
 
R
A
 
G
R
 
S
S
 
T
G
 
P
Y
 
Y
R
 
-
M
 
-
G
 
G
H
 
G
G
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
E
D
 
D
H
 
L
M
 
I
F
 
V
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
N
K
 
K
G
 
I
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
T
A
 
A
E
 
K
T
 
K
N
 
L
G
 
N
F
 
I
T
 
A
R
 
R
E
 
N
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
S
T
x
Y
T
 
T
R
 
R
A
 
S
Q
 
K
Q
 
A
A
 
A
I
 
W
K
 
E
D
 
A
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
G
A
 
N
E
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
-
 
K
G
 
G
K
 
Q
E
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
K
H
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
Y
P
 
K
K
 
R
A
 
V
K
 
D
L
 
F
D
 
S
K
 
K
I
 
V
A
 
P
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
Q
R
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
|
A
N
 
N
S
x
A
S
|
S
S
 
T
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
T
R
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
R
Q
 
L
G
 
N
L
 
V
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
V
G
 
A
H
 
F
A
 
A
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
I
L
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
I
 
A
K
 
S
K
 
M
L
 
V
M
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
V
G
 
G
W
 
L
S
 
K
L
 
K
D
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
A
L
 
M
F
 
W
E
 
E
V
 
V
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
L
V
 
V
S
 
V
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
I
T
 
K
K
 
M
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
D
H
 
P
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
x
V
A
 
S
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
K
 
G
G
 
-
L
 
-
K
 
E
R
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
I
 
N
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
M
A
 
L
V
 
I
E
 
Q
C
 
K
L
 
L

P24752 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial; Acetoacetyl-CoA thiolase; T2; EC 2.3.1.9 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
48% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 42:427/427 of P24752

query
sites
P24752
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
L
L
 
L
T
 
P
A
 
A
P
 
T
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
C
x
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
I
S
 
S
T
 
T
R
 
P
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
 
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
L
 
M
A
 
A
H
 
S
D
 
Q
M
 
S
L
 
L
I
 
M
A
 
C
G
 
G
S
 
H
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
|
N
A
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
L
 
M
D
 
N
R
 
R
A
 
G
R
 
S
S
 
T
G
 
P
Y
 
Y
R
 
-
M
 
-
G
 
G
H
 
G
G
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
E
D
 
D
H
 
L
M
 
I
F
 
V
L
 
K
D
 
D
G
|
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
N
K
 
K
G
 
I
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
T
A
 
A
E
 
K
T
 
K
N
 
L
G
 
N
F
 
I
T
 
A
R
 
R
E
 
N
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
S
T
x
Y
T
 
T
R
 
R
A
 
S
Q
 
K
Q
 
A
A
 
A
I
 
W
K
 
E
D
 
A
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
G
A
 
N
E
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
-
 
K
G
 
G
K
 
Q
E
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
S
 
K
H
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
Y
P
 
K
K
x
R
A
x
V
K
x
D
L
 
F
D
 
S
K
|
K
I
 
V
A
 
P
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
T
A
 
V
F
 
F
-
 
Q
R
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
|
A
N
 
N
S
x
A
S
|
S
S
 
T
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
x
T
R
 
A
S
 
D
E
 
A
A
|
A
E
 
K
K
 
R
Q
 
L
G
 
N
L
 
V
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
|
I
H
 
V
G
 
A
H
 
F
A
 
A
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
I
L
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
I
x
A
K
 
S
K
 
M
L
 
V
M
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
V
G
 
G
W
 
L
S
 
K
L
 
K
D
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
A
L
 
M
F
 
W
E
 
E
V
 
V
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
L
V
 
V
S
 
V
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
I
T
 
K
K
 
M
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
D
H
 
P
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
|
A
C
x
V
A
 
S
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
K
 
G
G
 
-
L
 
-
K
 
E
R
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
I
C
 
C
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
M
A
 
L
V
 
I
E
 
Q
C
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P14611 Acetyl-CoA acetyltransferase; Acetoacetyl-CoA thiolase; Beta-ketothiolase; EC 2.3.1.9 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
48% identity, 97% coverage: 8:394/397 of query aligns to 4:391/393 of P14611

query
sites
P14611
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
V
G
 
G
G
 
K
F
 
F
Q
 
G
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
A
S
 
K
L
 
I
T
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
Q
V
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
S
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
A
S
 
M
T
 
V
R
 
P
C
 
A
T
 
M
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
N
M
 
A
L
 
I
I
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
V
L
 
L
D
 
P
R
 
G
A
 
S
R
 
R
S
 
D
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
D
G
 
A
R
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
T
M
 
M
F
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
W
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
N
K
 
Q
G
 
Y
R
x
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
I
 
V
A
 
G
S
 
S
T
 
Q
T
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
D
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
L
V
 
I
T
 
P
V
 
Q
G
 
R
K
 
K
-
 
G
E
 
D
Q
 
P
V
 
V
L
 
A
I
 
F
S
 
K
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
x
F
P
 
V
P
x
R
K
 
Q
-
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
D
K
 
S
I
 
M
A
 
S
S
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
D
D
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
M
 
M
R
 
S
R
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
A
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
I
 
I
H
 
K
G
 
S
H
 
Y
A
 
A
A
 
N
F
 
A
A
 
G
D
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
K
L
 
V
F
 
M
P
 
G
V
 
M
A
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
S
K
 
K
K
 
R
L
 
A
M
 
L
K
 
S
K
 
R
T
 
A
G
 
E
W
 
W
S
 
T
L
 
P
D
 
Q
E
 
D
V
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
M
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
H
T
 
Q
K
 
Q
L
 
M
E
 
G
I
 
W
P
 
D
H
 
T
E
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
E
L
 
M
R
 
K
Q
 
R
K
 
R
G
 
D
L
 
A
K
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
C
|
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
G
T
 
V
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E

Q9BWD1 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic; Acetyl-CoA transferase-like protein; Cytosolic acetoacetyl-CoA thiolase; EC 2.3.1.9 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
47% identity, 99% coverage: 1:394/397 of query aligns to 1:395/397 of Q9BWD1

query
sites
Q9BWD1
M
 
M
T
 
N
L
 
A
S
 
G
N
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
I
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
V
T
 
P
A
 
V
P
 
Q
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
T
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
C
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
C
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
P
K
 
Y
S
 
S
T
 
V
R
 
P
C
 
A
T
 
W
T
 
S
L
 
C
N
 
Q
K
 
M
M
 
I
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
C
L
 
L
A
 
A
H
 
V
D
 
Q
M
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
D
A
 
S
D
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
K
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
L
L
 
A
D
 
-
R
 
Y
A
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Y
 
V
R
 
K
M
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
M
R
 
P
V
 
L
L
 
T
D
 
D
H
 
S
M
 
I
F
 
L
L
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
D
 
H
K
 
N
G
 
C
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
K
N
 
W
G
 
Q
F
 
V
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
D
Q
 
Q
D
 
D
A
 
K
F
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
L
S
 
S
T
 
Q
T
 
N
R
 
R
A
 
T
Q
 
E
Q
 
N
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
H
F
 
F
N
 
D
A
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
L
V
 
V
T
 
S
V
 
T
G
 
R
K
|
K
E
 
G
Q
 
L
V
 
I
L
 
E
I
 
V
S
 
K
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
F
P
 
P
P
x
R
K
 
H
-
 
G
A
x
S
K
 
N
L
 
I
D
 
E
K
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
F
 
F
-
 
L
R
 
T
D
 
D
G
 
G
-
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
P
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
 
I
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
K
S
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
V
G
 
S
H
 
W
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
A
 
G
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
S
L
 
I
F
 
M
P
 
G
V
 
I
A
 
G
P
 
P
V
 
I
G
 
P
A
 
A
I
 
I
K
 
K
K
 
Q
L
 
A
M
 
V
K
 
T
K
 
K
T
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
A
V
 
V
S
 
S
L
 
A
V
 
A
T
 
I
M
 
V
T
 
K
K
 
E
L
 
L
E
 
G
I
 
L
P
 
N
H
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
T
L
 
L
R
 
E
Q
 
R
K
 
M
G
 
G
L
 
R
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
C
V
 
V
E
 
Q

1wl4A Human cytosolic acetoacetyl-coa thiolase complexed with coa (see paper)
47% identity, 98% coverage: 5:394/397 of query aligns to 2:392/394 of 1wl4A

query
sites
1wl4A
N
 
S
D
 
D
P
 
P
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
I
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
A
S
 
A
L
 
V
T
 
P
A
 
V
P
 
Q
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
T
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
C
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
C
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
V
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
P
K
 
Y
S
 
S
T
 
V
R
 
P
C
 
A
T
 
W
T
 
S
L
 
C
N
 
Q
K
 
M
M
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
C
L
 
L
A
 
A
H
 
V
D
 
Q
M
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
D
A
 
S
D
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
K
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
L
L
 
A
D
 
-
R
 
Y
A
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Y
 
V
R
 
K
M
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
M
R
 
P
V
 
L
L
 
T
D
 
D
H
 
S
M
 
I
F
 
L
L
 
C
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
D
 
H
K
 
N
G
 
C
R
 
H
L
 
-
M
|
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
K
N
 
W
G
 
Q
F
 
V
T
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
D
Q
 
Q
D
 
D
A
 
K
F
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
L
S
 
S
T
 
Q
T
 
N
R
 
R
A
 
T
Q
 
E
Q
 
N
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
H
F
 
F
N
 
D
A
 
K
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
L
V
 
V
T
 
S
V
 
T
G
 
R
K
 
K
E
 
G
Q
 
L
V
 
I
L
 
E
I
 
V
S
 
K
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
F
P
 
P
P
x
R
K
 
H
-
 
G
A
 
S
K
 
N
L
 
I
D
 
E
K
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
x
Y
F
 
F
-
 
L
R
 
T
D
 
D
G
 
G
-
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
x
P
A
|
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
 
I
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
K
R
 
K
S
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
D
K
 
K
Q
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
V
G
 
S
H
 
W
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
A
 
G
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
S
L
 
I
F
 
M
P
 
G
V
 
I
A
 
G
P
 
P
V
 
I
G
 
P
A
 
A
I
 
I
K
 
K
K
 
Q
L
 
A
M
 
V
K
 
T
K
 
K
T
 
A
G
 
G
W
 
W
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
V
S
 
S
L
 
A
V
 
A
T
 
I
M
 
V
T
 
K
K
 
E
L
 
L
E
 
G
I
 
L
P
 
N
H
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
T
L
 
L
R
 
E
Q
 
R
K
 
M
G
 
G
L
 
R
K
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
C
V
 
V
E
 
Q

4o9cC Crystal structure of beta-ketothiolase (phaa) from ralstonia eutropha h16 (see paper)
48% identity, 97% coverage: 8:394/397 of query aligns to 4:391/393 of 4o9cC

query
sites
4o9cC
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
V
G
 
G
G
 
K
F
 
F
Q
 
G
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
A
S
 
K
L
 
I
T
 
P
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
K
P
 
P
E
 
E
S
 
Q
V
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
S
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
A
S
 
M
T
 
V
R
 
P
C
 
A
T
 
M
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
x
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
N
M
 
A
L
 
I
I
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
D
A
 
A
D
 
E
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
H
L
 
V
L
 
L
D
 
P
R
 
G
A
 
S
R
 
R
S
 
D
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
D
G
 
A
R
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
D
H
 
T
M
 
M
F
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
W
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
N
K
 
Q
G
 
Y
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
I
 
V
A
 
G
S
 
S
T
 
Q
T
 
N
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
I
 
Q
K
 
K
D
 
A
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
D
A
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
L
V
 
I
T
 
P
V
 
Q
G
 
R
K
 
K
-
 
G
E
 
D
Q
 
P
V
 
V
L
 
A
I
 
F
S
 
K
H
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
F
P
 
V
P
x
R
K
 
Q
-
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
D
K
 
S
I
 
M
A
 
S
S
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
|
F
R
 
D
D
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
x
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
M
 
M
R
 
S
R
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
A
E
 
K
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
I
 
I
H
 
K
G
 
S
H
 
Y
A
 
A
A
 
N
F
 
A
A
 
G
D
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
K
L
 
V
F
 
M
P
 
G
V
 
M
A
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
S
K
 
K
K
 
R
L
 
A
M
 
L
K
 
S
K
 
R
T
 
A
G
 
E
W
 
W
S
 
T
L
 
P
D
 
Q
E
 
D
V
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
M
E
 
E
V
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
H
T
 
Q
K
 
Q
L
 
M
E
 
G
I
 
W
P
 
D
H
 
T
E
 
S
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
E
L
 
M
R
 
K
Q
 
R
K
 
R
G
 
D
L
 
A
K
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
G
T
 
V
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E

2f2sA Human mitochondrial acetoacetyl-coa thiolase
48% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 11:389/389 of 2f2sA

query
sites
2f2sA
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
L
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
L
L
 
L
T
 
P
A
 
A
P
 
T
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
A
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
E
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
K
 
I
S
 
S
T
 
T
R
 
P
C
 
C
T
 
T
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
L
 
M
A
 
A
H
 
S
D
 
Q
M
 
S
L
 
L
I
 
M
A
 
C
G
 
G
S
 
H
A
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
L
 
M
D
 
N
R
 
R
A
 
G
R
 
S
S
 
T
G
 
P
Y
 
Y
R
 
-
M
 
-
G
 
G
H
 
G
G
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
E
D
 
D
H
 
L
M
 
I
F
 
V
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
T
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
D
 
N
K
 
K
G
 
I
R
x
H
L
 
-
M
|
M
G
 
G
T
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
T
A
 
A
E
 
K
T
 
K
N
 
L
G
 
N
F
 
I
T
 
A
R
 
R
E
 
N
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
S
T
x
Y
T
 
T
R
 
R
A
 
S
Q
 
K
Q
 
A
A
 
A
I
 
W
K
 
E
D
 
A
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
G
A
 
N
E
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
V
K
 
K
E
 
E
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
Y
P
 
K
K
x
R
A
x
V
K
x
D
L
 
F
D
 
S
K
|
K
I
 
V
A
 
P
S
 
K
L
|
L
K
 
K
P
 
T
A
 
V
F
|
F
-
 
Q
R
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
T
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
T
R
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
R
Q
 
L
G
 
N
L
 
V
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
V
G
 
A
H
 
F
A
 
A
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
I
L
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
Y
A
 
A
I
 
A
K
 
S
K
 
M
L
 
V
M
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
V
G
 
G
W
 
L
S
 
K
L
 
K
D
 
E
E
 
D
V
 
I
E
 
A
L
 
M
F
 
W
E
 
E
V
 
V
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
S
V
 
L
V
 
V
S
 
V
L
 
L
V
 
A
T
 
N
M
 
I
T
 
K
K
 
M
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
D
H
 
P
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
S
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
T
S
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
K
 
G
G
 
-
L
 
-
K
 
E
R
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
I
 
N
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
M
 
M
A
 
L
V
 
I
E
 
Q
C
 
K
L
 
L

5f38D X-ray crystal structure of a thiolase from escherichia coli at 1.8 a resolution (see paper)
50% identity, 97% coverage: 9:394/397 of query aligns to 7:393/394 of 5f38D

query
sites
5f38D
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
A
S
 
S
L
 
T
T
 
S
A
 
A
P
 
I
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
K
I
 
I
A
 
D
P
 
S
E
 
Q
S
 
H
V
 
V
E
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
K
 
E
S
 
T
T
 
V
R
 
C
C
 
G
T
 
F
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
S
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
M
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
H
 
V
M
 
I
F
 
L
L
 
R
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
M
D
 
C
A
 
A
Y
 
-
D
 
T
K
 
H
G
 
G
R
 
Y
L
 
H
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
H
S
 
S
T
 
Q
T
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
E
D
 
S
G
 
G
S
 
A
F
 
F
N
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
N
V
 
V
T
 
V
V
 
T
G
 
R
K
 
K
E
 
K
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
I
 
F
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
E
 
E
Q
 
F
P
 
P
P
 
K
-
 
A
K
 
N
A
 
S
K
 
T
L
 
A
D
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
G
S
 
A
L
 
L
K
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
D
D
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
|
I
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
M
 
M
R
 
E
R
 
E
S
 
S
E
 
A
A
 
A
E
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
K
G
 
S
H
 
Y
A
 
A
A
 
S
F
 
G
A
 
G
D
 
V
T
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
M
P
 
G
V
 
M
A
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
T
K
 
Q
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
Q
K
 
L
T
 
A
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
L
 
L
D
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
F
 
I
E
 
E
V
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
F
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
G
T
 
K
K
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
F
P
 
D
H
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
|
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
A
L
 
M
R
 
Q
Q
 
A
K
 
R
G
 
D
L
 
K
K
 
T
R
 
L
G
 
G
V
 
L
A
|
A
A
 
T
I
x
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
V
V
 
I
E
 
E

5f38B X-ray crystal structure of a thiolase from escherichia coli at 1.8 a resolution (see paper)
50% identity, 98% coverage: 9:396/397 of query aligns to 5:391/391 of 5f38B

query
sites
5f38B
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
A
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
E
 
S
L
 
L
K
 
A
S
 
S
L
 
T
T
 
S
A
 
A
P
 
I
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
T
A
 
V
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
K
I
 
I
A
 
D
P
 
S
E
 
Q
S
 
H
V
 
V
E
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
N
V
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
A
K
 
E
S
 
T
T
 
V
R
 
C
C
 
G
T
 
F
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
S
T
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
A
D
 
Q
M
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
D
 
Q
V
 
S
V
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
N
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
G
 
G
H
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
H
 
V
M
 
I
F
 
L
L
 
R
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
M
D
 
C
A
 
A
Y
 
-
D
 
T
K
 
H
G
 
G
R
 
Y
L
 
H
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
V
A
 
A
E
 
K
T
 
E
N
 
Y
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
A
I
 
L
A
 
H
S
 
S
T
 
Q
T
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
E
D
 
S
G
 
G
S
 
A
F
 
F
N
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
N
V
 
V
T
 
V
V
 
T
G
 
-
K
 
-
E
 
K
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
I
 
F
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
E
 
E
Q
 
F
P
 
P
P
x
K
-
 
A
K
 
N
A
 
S
K
 
T
L
 
A
D
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
G
S
 
A
L
 
L
K
 
R
P
 
P
A
 
A
F
|
F
R
 
D
D
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
 
I
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
M
 
M
R
 
E
R
 
E
S
 
S
E
 
A
A
 
A
E
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
K
G
 
S
H
 
Y
A
 
A
A
 
S
F
 
G
A
 
G
D
 
V
T
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
M
P
 
G
V
 
M
A
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
T
K
 
Q
K
 
K
L
 
A
M
 
L
K
 
Q
K
 
L
T
 
A
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
L
 
L
D
 
A
E
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
F
 
I
E
 
E
V
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
F
L
 
L
V
 
A
T
 
V
M
 
G
T
 
K
K
 
N
L
 
L
E
 
G
I
 
F
P
 
D
H
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
H
A
 
A
L
 
M
R
 
Q
Q
 
A
K
 
R
G
 
D
L
 
K
K
 
T
R
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
V
V
 
I
E
 
E
C
 
R
L
 
L

8jg2A Crystal structure of a biosynthetic thiolase from megasphaera hexanoica soaked with hexanoyl-coa
45% identity, 98% coverage: 8:396/397 of query aligns to 5:393/393 of 8jg2A

query
sites
8jg2A
I
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
E
 
Q
L
 
F
K
 
K
S
 
D
L
 
V
T
 
T
A
 
A
P
 
V
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
I
A
 
V
A
 
A
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
K
I
 
V
A
 
P
P
 
V
E
 
D
S
 
Q
V
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
I
F
 
M
G
 
G
C
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
C
G
 
G
Q
 
E
A
 
N
P
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
H
A
 
S
G
 
G
L
 
I
D
 
P
K
 
Q
S
 
E
T
 
V
R
 
P
C
 
A
T
 
F
T
 
T
L
 
I
N
 
N
K
 
K
M
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
R
A
 
A
T
 
V
I
 
S
L
 
L
A
 
G
H
 
A
D
 
Q
M
 
Q
L
 
I
I
 
E
A
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
A
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
L
 
I
D
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
H
 
N
G
 
G
R
 
V
V
 
L
L
 
E
D
 
D
H
 
T
M
 
M
F
 
L
L
 
R
D
 
D
G
 
G
L
|
L
E
 
V
D
 
-
A
 
C
Y
 
T
D
 
E
K
 
N
G
 
G
R
 
Y
L
x
H
M
 
M
G
 
G
T
 
V
F
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
N
C
 
I
A
 
A
E
 
S
T
 
R
N
 
F
G
 
G
F
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
Q
A
 
Q
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
C
A
 
A
I
 
Y
A
 
N
S
 
S
T
 
Q
T
 
M
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
Q
K
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
K
F
 
F
N
 
D
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
I
T
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
H
Q
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
I
S
 
T
H
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
H
-
 
I
P
x
R
P
 
P
K
 
E
A
x
T
K
 
T
L
 
L
D
 
E
K
 
G
I
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
F
 
F
R
 
T
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
A
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
S
 
G
I
|
I
S
 
N
D
 
D
G
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
R
 
S
R
 
K
S
 
K
E
 
K
A
 
A
E
 
E
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
I
A
 
A
V
 
E
I
 
I
H
 
L
G
 
D
H
 
W
A
 
A
A
 
S
F
 
A
A
 
G
D
 
V
T
 
E
P
 
P
G
 
A
L
 
I
F
 
M
P
 
G
V
 
T
A
 
G
P
 
P
V
 
I
G
 
P
A
 
A
I
 
C
K
 
H
K
 
K
L
 
L
M
 
F
K
 
K
K
 
K
T
 
T
G
 
G
W
 
L
S
 
K
L
 
M
D
 
E
E
 
D
V
 
F
E
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
E
V
 
L
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
V
 
A
V
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
Y
T
 
C
M
 
C
T
 
Q
K
 
Q
L
 
L
E
 
G
I
 
A
P
 
D
H
 
M
E
 
S
K
 
K
I
 
T
N
 
N
V
 
I
H
 
Y
G
 
G
G
 
S
A
 
G
C
 
I
A
 
S
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
V
G
 
G
A
 
C
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
A
Q
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
R
K
 
N
G
 
G
L
 
S
K
 
R
R
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
K
-
 
M
C
 
C
L
 
L

Q22100 Acetyl-CoA acetyltransferase homolog, mitochondrial; 3-ketoacyl-CoA thiolase; EC 2.3.1.- from Caenorhabditis elegans (see 2 papers)
44% identity, 99% coverage: 3:396/397 of query aligns to 19:407/407 of Q22100

query
sites
Q22100
L
 
L
S
 
S
N
 
N
D
 
K
P
 
H
I
 
A
V
 
F
I
 
I
V
 
V
S
 
G
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
S
F
 
F
Q
 
R
G
 
S
E
 
S
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
V
T
 
T
A
 
A
P
 
P
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
R
A
 
G
G
 
A
I
 
V
A
 
K
P
 
P
E
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
F
F
 
L
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
L
 
C
S
 
Q
A
 
A
G
 
N
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
K
 
L
S
 
S
T
 
V
R
 
A
C
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
V
N
 
N
K
 
K
M
 
V
C
 
C
G
 
S
S
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
H
x
A
D
 
Q
M
 
Q
L
 
I
I
 
Q
A
 
T
G
 
G
S
 
H
A
 
Q
D
 
D
V
 
F
V
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
N
 
Q
A
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
Y
L
 
V
D
 
Q
R
 
R
A
 
G
R
 
E
S
 
I
G
 
P
Y
 
Y
R
 
-
M
 
-
G
 
G
H
 
G
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
D
H
 
G
M
 
I
F
 
V
L
 
K
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
T
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
G
 
V
R
 
H
L
 
-
M
 
M
G
 
G
T
 
N
F
 
C
A
 
G
E
 
E
D
 
K
C
 
T
A
 
S
E
 
K
T
 
E
N
 
M
G
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
K
A
 
D
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
S
T
 
Y
T
 
K
R
 
K
A
 
S
Q
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
W
K
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
N
F
 
I
N
 
G
A
 
P
E
 
E
I
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
N
V
 
V
T
 
K
V
 
S
G
 
K
K
 
K
E
 
G
Q
 
V
V
 
T
L
 
I
I
 
V
S
 
D
H
 
K
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
P
 
F
P
 
T
K
 
K
A
 
V
K
 
N
L
 
F
D
 
D
K
 
K
I
 
F
A
 
T
S
 
S
L
 
L
K
 
R
P
 
T
A
 
V
F
 
F
R
 
Q
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
S
 
S
S
 
T
I
 
L
S
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
A
R
 
S
R
 
Q
S
 
E
E
 
A
A
 
V
E
 
S
K
 
E
Q
 
Q
G
 
S
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
R
I
 
I
H
 
L
G
 
A
H
 
Y
A
 
G
A
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
T
T
 
H
P
 
P
G
 
L
L
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
T
G
 
L
A
 
M
I
 
F
K
 
P
K
 
K
L
 
I
M
 
L
K
 
E
K
 
R
T
 
A
G
 
G
W
 
V
S
 
K
L
 
Q
D
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
A
L
 
Q
F
 
W
E
 
E
V
 
V
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
C
V
 
V
S
 
P
L
 
L
V
 
A
T
 
F
M
 
I
T
 
K
K
 
K
L
 
L
E
 
G
I
 
V
P
 
D
H
 
P
E
 
S
K
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
V
A
 
S
L
 
I
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
M
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
L
L
 
I
V
 
T
T
 
H
L
 
L
L
 
V
S
 
H
A
 
T
L
 
L
R
 
K
Q
 
S
K
 
G
G
 
Q
L
 
I
K
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
G
A
 
S
T
 
S
A
 
G
M
 
M
A
 
V
V
 
I
E
 
Q
C
 
K
L
 
L

Query Sequence

>Pf1N1B4_4786 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4786
MTLSNDPIVIVSAVRTPMGGFQGELKSLTAPQLGAAAIRAAVERAGIAPESVEEVLFGCV
LSAGLGQAPARQAALGAGLDKSTRCTTLNKMCGSGMEATILAHDMLIAGSADVVVAGGME
SMSNAPFLLDRARSGYRMGHGRVLDHMFLDGLEDAYDKGRLMGTFAEDCAETNGFTREAQ
DAFAIASTTRAQQAIKDGSFNAEIVPLTVTVGKEQVLISHDEQPPKAKLDKIASLKPAFR
DGGTVTAANSSSISDGAAALVLMRRSEAEKQGLKPLAVIHGHAAFADTPGLFPVAPVGAI
KKLMKKTGWSLDEVELFEVNEAFAVVSLVTMTKLEIPHEKINVHGGACALGHPIGASGAR
ILVTLLSALRQKGLKRGVAAICIGGGEATAMAVECLY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory