SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4845 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4845 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3i8bA The crystal structure of xylulose kinase from bifidobacterium adolescentis
31% identity, 90% coverage: 4:449/498 of query aligns to 3:473/506 of 3i8bA

query
sites
3i8bA
Q
 
R
Q
 
T
L
 
L
F
 
V
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
T
G
 
S
T
 
T
Q
 
Q
G
 
S
T
 
C
K
 
K
A
 
V
V
 
R
I
 
V
L
 
T
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
V
G
 
R
Q
 
F
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
A
 
K
H
 
H
S
 
P
L
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
T
R
 
-
E
 
S
Q
 
V
D
 
D
T
 
P
A
 
S
Q
 
Y
W
 
W
L
 
W
E
 
S
A
 
A
F
 
F
T
 
Q
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
R
 
E
R
 
Q
A
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
G
N
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
V
A
 
S
I
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
V
G
 
G
V
 
-
S
 
-
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
M
V
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
D
 
N
R
 
Q
G
 
G
Q
 
N
A
 
V
L
 
I
R
 
R
P
 
D
A
 
A
K
 
M
L
 
L
W
 
W
C
 
N
D
 
D
T
 
T
E
 
S
S
 
S
T
 
A
L
 
P
E
 
Q
N
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
E
H
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
R
G
 
G
E
 
K
K
 
Q
G
 
R
S
 
W
L
 
V
E
 
K
R
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
S
V
 
S
I
 
P
A
 
V
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
T
 
T
V
 
L
S
 
T
K
 
K
L
 
V
L
 
A
W
 
W
T
 
V
K
 
A
E
 
E
Q
 
N
H
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
N
F
 
V
A
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
A
I
 
I
L
 
C
L
 
L
P
 
P
H
 
H
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
N
 
S
Y
 
W
W
 
R
L
 
I
T
 
A
G
 
G
R
 
Y
S
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
H
-
 
L
-
x
E
-
 
A
-
x
L
C
 
F
S
 
T
E
 
D
Y
 
R
G
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
I
Y
 
Y
F
 
Y
N
 
D
V
 
A
R
 
A
T
 
S
R
 
N
Q
 
E
W
 
Y
D
 
R
L
 
R
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
M
I
 
V
D
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
E
P
 
G
E
 
A
L
 
K
I
 
A
D
 
A
A
 
Q
H
 
S
Q
 
H
P
 
A
V
 
E
G
 
A
T
 
I
I
 
V
L
 
L
P
 
P
S
x
T
I
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
D
A
 
A
E
 
A
H
 
P
L
 
V
G
 
K
I
 
A
N
 
D
P
 
P
H
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
G
A
 
C
L
 
L
V
 
L
S
 
A
S
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
M
 
A
M
 
M
G
 
A
A
 
S
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
N
 
-
I
 
M
K
 
A
P
 
V
G
 
G
A
 
D
I
 
V
T
 
S
M
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
A
Y
 
A
A
 
A
Y
 
I
A
 
S
E
 
E
Q
 
N
A
 
P
N
 
T
V
 
Y
S
 
D
P
 
L
D
 
T
A
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
G
F
 
F
C
 
A
S
 
D
S
 
C
S
 
T
G
 
G
G
 
H
W
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
A
C
 
C
T
 
T
M
 
I
N
 
N
L
 
G
T
 
S
N
 
R
A
 
I
T
 
L
G
 
D
A
 
A
I
 
G
R
 
R
E
 
A
L
 
A
F
 
L
E
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
Y
E
 
D
A
 
E
F
 
L
N
 
A
A
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
F
Q
 
A
A
 
S
P
 
K
I
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
V
 
I
C
 
T
M
 
L
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
F
N
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
T
P
 
P
A
 
N
L
 
R
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
T
G
 
A
S
 
T
L
 
F
L
 
S
G
 
G
L
 
M
T
 
T
M
 
L
T
 
A
N
 
N
L
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
E
N
 
N
L
 
L
C
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
L
F
 
C
G
 
S
L
 
Q
R
 
R
Y
 
D
G
 
C
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
N
 
L
G
 
G
L
 
A
Q
 
S
S
 
I
L
 
T
R
 
R
I
 
I
C
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
S
 
S
P
 
E
V
 
A
W
 
I
R
 
R
Q
 
T
I
 
L
V
 
A
A
 
P
D
 
S
I
 
I
M
 
L
N
 
G
T
 
M
P
 
D
V
 
V
I
 
T
C
 
R
T
 
P
E
 
A
Q
 
T
S
 
D
E
 
E
A
 
Y
A
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
W
 
W
C
 
V
K
 
L
S
 
S

P09099 Xylulose kinase; XK; Xylulokinase; 1-deoxy-D-xylulokinase; EC 2.7.1.17; EC 2.7.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 6:493/498 of query aligns to 1:474/484 of P09099

query
sites
P09099
L
 
M
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
I
 
I
D
|
D
C
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
S
G
 
G
T
 
V
K
 
K
A
 
V
V
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
E
Q
 
Q
S
 
-
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
A
Q
 
A
G
 
Q
A
 
T
A
 
E
A
 
K
H
 
L
S
 
T
L
 
V
I
 
S
S
 
R
G
 
P
A
 
H
N
 
P
G
 
L
R
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
Q
D
 
D
T
 
P
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
L
 
W
E
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
R
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
M
-
 
K
-
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
D
N
 
Q
V
 
H
D
 
S
G
 
L
Q
 
Q
A
 
D
I
 
V
L
 
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
x
M
H
|
H
G
 
G
L
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
A
R
 
Q
G
 
Q
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
A
K
 
I
L
 
L
W
 
W
C
 
N
D
 
D
T
 
G
E
 
R
S
 
C
T
 
A
L
 
Q
E
 
E
N
 
C
D
 
T
R
 
L
L
 
L
L
 
E
A
 
A
H
 
R
L
 
V
G
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
P
G
 
Q
S
 
S
L
 
R
E
 
V
R
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
L
I
 
M
A
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
V
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
V
K
 
Q
E
 
R
Q
 
H
H
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
D
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
R
Y
 
L
W
 
R
L
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
F
C
 
A
S
 
S
E
 
D
Y
 
M
G
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
M
Y
 
W
F
 
L
N
 
D
V
 
V
R
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
D
 
S
L
 
D
Q
 
V
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
D
 
A
I
 
C
D
 
D
P
 
L
T
 
S
G
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
M
P
 
P
E
 
A
L
 
L
I
 
Y
D
 
E
A
 
G
H
 
S
Q
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
A
I
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
K
H
 
A
L
 
W
G
 
G
I
 
M
N
 
A
P
 
-
H
 
T
A
 
V
L
 
P
V
 
V
S
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
|
D
N
 
N
M
 
A
M
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
M
I
 
V
K
 
D
P
 
A
G
 
N
A
 
Q
I
 
A
T
 
M
M
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
Y
Y
 
F
A
 
A
Y
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
G
A
 
F
N
 
L
V
 
S
S
 
K
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
H
T
 
S
F
 
F
C
 
C
S
 
H
S
 
A
-
 
L
S
 
P
G
 
Q
G
 
R
W
 
W
L
 
H
P
 
L
L
 
M
I
 
S
C
 
V
T
 
M
M
 
L
N
 
S
L
 
A
T
 
A
N
 
S
A
 
C
T
 
L
G
 
D
A
 
W
I
 
A
R
 
A
E
 
K
L
 
L
F
 
T
E
 
G
L
 
L
-
 
S
D
 
N
I
 
V
E
 
P
A
 
A
F
 
L
N
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
P
 
D
I
 
E
G
 
S
A
 
A
G
 
E
G
 
P
V
 
V
C
 
W
M
 
F
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
N
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
T
P
 
P
A
 
H
-
 
N
L
 
N
P
 
P
H
 
Q
A
 
A
G
 
K
G
 
G
S
 
V
L
 
F
L
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
H
T
 
Q
N
 
H
L
 
G
T
 
P
R
 
N
A
 
-
N
 
E
L
 
L
C
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
G
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
R
 
A
Y
 
D
G
 
G
L
 
M
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
H
Q
 
A
N
 
C
G
 
G
L
 
I
Q
 
K
S
 
P
L
 
Q
R
 
S
I
 
V
C
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
R
S
 
S
P
 
E
V
 
Y
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
V
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
M
 
S
N
 
G
T
 
Q
P
 
Q
V
 
L
I
 
-
C
 
-
T
 
-
E
 
D
Q
 
Y
S
 
R
E
 
T
A
 
G
A
 
G
A
 
D
L
 
V
G
 
G
A
 
P
A
 
A
I
 
L
Q
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
R
C
 
L
K
 
A
S
 
Q
W
 
I
A
 
A
N
 
A
G
 
N
Q
 
P
E
 
E
D
 
K
S
 
S
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
C
 
I
E
 
E
R
 
L
C
 
L
V
 
P
K
 
Q
L
 
L
D
 
P
L
 
L
A
 
E
S
 
Q
E
 
S
T
 
H
L
 
L
P
 
P
I
 
D
A
 
A
E
 
Q
N
 
R
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
Y
Q
 
Q
Q
 
P
A
 
R
Y
 
R
E
 
E
R
 
T
Y
 
F
R
 
R
Q
 
R

2itmA Crystal structure of the e. Coli xylulose kinase complexed with xylulose (see paper)
32% identity, 98% coverage: 6:493/498 of query aligns to 1:466/476 of 2itmA

query
sites
2itmA
L
 
M
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
S
G
 
G
T
 
V
K
 
K
A
 
V
V
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
E
Q
 
Q
S
 
-
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
A
Q
 
A
G
 
Q
A
 
T
A
 
E
A
 
K
H
 
L
S
 
T
L
 
V
I
 
S
S
 
R
G
 
P
A
 
H
N
 
P
G
 
L
R
 
W
R
 
S
E
 
E
Q
 
Q
D
 
D
T
 
P
A
 
E
Q
 
Q
W
 
W
L
 
W
E
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
R
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
M
-
 
K
-
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
D
N
 
Q
V
 
H
D
 
S
G
 
L
Q
 
Q
A
 
D
I
 
V
L
 
K
G
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
x
M
H
|
H
G
 
G
L
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
A
R
 
Q
G
 
Q
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
A
K
 
I
L
 
L
W
|
W
-
 
N
-
 
D
-
 
G
-
 
R
C
 
C
D
 
A
T
 
Q
E
 
E
S
 
C
T
 
T
L
 
L
E
 
L
N
 
E
D
 
A
R
 
R
L
 
V
L
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
P
G
 
Q
S
 
S
L
 
R
E
 
V
R
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
L
I
 
M
A
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
V
 
A
S
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
V
K
 
Q
E
 
R
Q
 
H
H
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
F
 
F
A
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
D
R
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
R
Y
 
L
W
 
R
L
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
F
C
 
A
S
 
S
E
 
D
Y
 
M
G
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
M
Y
 
W
F
 
L
N
 
D
V
 
V
R
 
A
T
 
K
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
D
 
S
L
 
D
Q
 
V
L
 
M
L
 
L
R
 
Q
D
 
A
I
 
C
D
 
D
P
 
L
T
 
S
G
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
R
A
 
D
A
 
Q
L
 
M
P
 
P
E
 
A
L
 
L
I
 
Y
D
 
E
A
 
G
H
 
S
Q
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
A
I
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
K
H
 
A
L
 
W
G
 
G
I
 
M
N
 
A
P
 
-
H
 
T
A
 
V
L
 
P
V
 
V
S
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
|
D
N
|
N
M
 
A
M
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
M
I
 
V
K
 
D
P
 
A
G
 
N
A
 
Q
I
 
A
T
 
M
M
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
Y
Y
 
F
A
 
A
Y
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
G
A
 
F
N
 
L
V
 
S
S
 
K
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
H
T
 
S
F
 
F
C
 
C
S
 
H
S
 
A
-
 
L
S
 
P
G
 
Q
G
 
R
W
 
W
L
 
H
P
 
L
L
x
M
I
 
S
C
 
V
T
 
M
M
 
L
N
 
S
L
 
A
T
 
A
N
 
S
A
 
C
T
 
L
G
 
D
A
 
W
I
 
A
R
 
A
E
 
K
L
 
L
F
 
T
E
 
G
L
 
L
-
 
S
D
 
N
I
 
V
E
 
P
A
 
A
F
 
L
N
 
I
A
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
P
 
D
I
 
E
G
 
S
A
 
A
G
 
E
G
 
P
V
 
V
C
 
W
M
 
F
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
N
 
S
G
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
P
H
 
Q
A
 
A
G
 
K
G
 
G
S
 
V
L
 
F
L
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
H
T
 
Q
N
 
H
L
 
G
T
 
P
R
 
N
A
 
-
N
 
E
L
 
L
C
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
V
T
 
G
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
R
 
A
Y
 
D
G
 
G
L
 
M
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
H
Q
 
A
N
 
C
G
 
G
L
 
I
Q
 
K
S
 
P
L
 
Q
R
 
S
I
 
V
C
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
R
S
 
S
P
 
E
V
 
Y
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
I
 
M
V
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
M
 
S
N
 
G
T
 
Q
P
 
Q
V
 
L
I
 
-
C
 
-
T
 
-
E
 
D
Q
 
Y
S
 
R
E
 
T
A
 
G
A
 
G
A
 
D
L
 
V
G
 
G
A
 
P
A
 
A
I
 
L
Q
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
R
C
 
L
K
 
A
S
 
Q
W
 
I
A
 
A
N
 
A
G
 
N
Q
 
P
E
 
E
D
 
K
S
 
S
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
C
 
I
E
 
E
R
 
L
C
 
L
V
 
P
K
 
Q
L
 
L
D
 
P
L
 
L
A
 
E
S
 
Q
E
 
S
T
 
H
L
 
L
P
 
P
I
 
D
A
 
A
E
 
Q
N
 
R
V
 
Y
A
 
A
A
 
A
C
 
Y
Q
 
Q
Q
 
P
A
 
R
Y
 
R
E
 
E
R
 
T
Y
 
F
R
 
R
Q
 
R

3ll3A The crystal structure of ligand bound xylulose kinase from lactobacillus acidophilus
28% identity, 88% coverage: 5:444/498 of query aligns to 3:437/492 of 3ll3A

query
sites
3ll3A
Q
 
K
L
 
Y
F
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
M
D
 
D
C
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
G
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
I
Q
 
-
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
L
 
V
G
 
A
Q
 
S
G
 
V
A
 
S
A
 
K
A
 
G
H
 
Y
S
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
Q
G
 
T
A
 
K
N
 
V
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
T
 
P
A
 
K
Q
 
L
W
 
I
L
 
F
E
 
D
A
 
A
F
 
V
T
 
Q
Q
 
E
A
 
I
T
 
I
R
 
F
R
 
D
A
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
N
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
-
I
 
I
L
 
A
G
 
A
I
 
I
G
 
S
V
 
W
S
 
S
G
 
S
Q
|
Q
Q
x
M
H
|
H
G
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
G
L
 
L
D
 
G
D
 
S
R
 
D
G
 
D
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
T
P
 
N
A
 
S
K
 
I
L
 
T
W
 
W
C
 
A
D
 
D
T
 
N
-
 
C
-
 
A
E
 
K
S
 
S
T
 
I
L
 
V
E
 
Q
N
 
D
D
 
A
R
 
K
L
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
N
L
 
R
G
 
G
G
 
F
E
 
A
K
 
Q
G
 
Q
S
 
I
L
 
Y
E
 
R
R
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
M
V
 
P
I
 
M
A
x
H
P
 
P
G
 
M
Y
 
A
T
 
P
V
 
I
S
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
L
K
 
K
E
 
N
Q
 
K
H
 
K
P
 
T
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
A
 
S
R
 
Q
I
 
A
A
 
Q
R
 
K
I
 
W
L
 
I
L
 
G
P
 
I
H
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
N
 
I
Y
 
F
W
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
L
C
 
V
S
 
T
E
 
D
Y
 
T
G
 
T
D
 
M
A
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
I
F
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
K
T
 
T
R
 
L
Q
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
D
I
 
I
D
 
L
P
 
K
T
 
I
G
 
K
R
 
K
L
 
E
Q
 
Q
A
 
-
A
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
G
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
F
P
 
P
S
 
I
I
 
K
A
 
T
E
 
E
H
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
D
P
 
S
H
 
D
A
 
T
L
 
K
V
 
I
S
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
S
D
|
D
N
 
G
M
 
Y
M
 
L
G
 
S
A
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
V
G
 
N
N
 
A
I
 
I
K
 
D
P
 
S
G
 
D
A
 
H
I
 
C
T
 
A
M
 
L
S
 
N
L
 
V
G
|
G
S
x
T
S
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
I
Y
 
R
A
 
T
Y
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
Q
A
 
P
N
 
K
V
 
I
S
 
D
P
 
P
D
 
S
A
 
A
S
 
S
V
 
Y
A
 
F
T
 
C
F
 
Y
C
 
P
S
 
A
S
 
D
S
 
K
G
 
T
G
 
H
W
 
Y
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
G
P
 
P
L
 
V
I
x
N
C
 
N
T
 
G
M
x
G
N
 
I
L
 
V
T
 
F
N
 
N
A
 
-
T
 
-
G
 
W
A
 
A
I
 
R
R
 
Q
E
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
D
L
 
A
D
 
D
I
 
E
E
 
T
A
x
P
F
 
Q
N
 
D
A
 
F
L
|
L
-
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
-
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
R
G
 
N
V
 
L
C
 
I
M
 
F
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
N
 
G
G
 
G
E
|
E
R
|
R
V
 
A
P
 
P
A
 
I
L
 
W
P
 
D
-
x
A
H
 
N
A
 
A
G
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
R
T
 
M
N
 
H
L
 
-
T
 
Q
R
 
K
A
 
P
N
 
E
L
 
M
C
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
I
T
 
I
F
 
F
G
 
N
L
 
L
R
 
Y
Y
 
D
G
 
A
L
 
A
D
 
S
L
 
N
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
N
 
N
G
 
T
L
 
K
Q
 
K
S
 
P
L
 
V
R
 
A
I
 
I
C
 
N
L
 
A
I
 
T
G
|
G
G
|
G
G
x
F
S
 
L
K
 
K
S
 
S
P
 
D
V
 
F
W
 
V
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
C
A
 
A
D
 
N
I
 
I
M
 
F
N
 
N
T
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
V
C
 
T
T
 
M
E
 
K
Q
 
E
S
 
Q
E
 
Q
A
 
S
A
 
G
A
 
T
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
M
I
 
F
Q
 
L
A
 
A

3ll3B The crystal structure of ligand bound xylulose kinase from lactobacillus acidophilus
28% identity, 88% coverage: 5:444/498 of query aligns to 2:435/490 of 3ll3B

query
sites
3ll3B
Q
 
K
L
 
Y
F
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
M
D
 
D
C
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
G
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
I
Q
 
-
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
L
 
V
G
 
A
Q
 
S
G
 
V
A
 
S
A
 
K
A
 
G
H
 
Y
S
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
Q
G
 
T
A
 
K
N
 
V
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
E
 
E
Q
 
E
D
 
D
T
 
P
A
 
K
Q
 
L
W
 
I
L
 
F
E
 
D
A
 
A
F
 
V
T
 
Q
Q
 
E
A
 
I
T
 
I
R
 
F
R
 
D
A
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
N
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
-
I
 
I
L
 
A
G
 
A
I
 
I
G
 
S
V
 
W
S
 
S
G
 
S
Q
 
Q
Q
 
M
H
 
H
G
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
G
L
 
L
D
 
G
D
 
S
R
 
D
G
 
D
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
T
P
 
N
A
 
S
K
 
I
L
 
T
W
 
W
C
 
A
D
 
D
T
 
N
-
 
C
-
 
A
E
 
K
S
 
S
T
 
I
L
 
V
E
 
Q
N
 
D
D
 
A
R
 
K
L
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
N
L
 
R
G
 
G
G
 
F
E
 
A
K
 
Q
G
 
Q
S
 
I
L
 
Y
E
 
R
R
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
M
V
 
P
I
 
M
A
x
H
P
 
P
G
 
M
Y
 
A
T
 
P
V
 
I
S
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
L
K
 
K
E
 
N
Q
 
K
H
 
K
P
 
T
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
A
 
S
R
 
Q
I
 
A
A
 
Q
R
 
K
I
 
W
L
 
I
L
 
G
P
 
I
H
 
K
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
N
 
I
Y
 
F
W
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
L
C
 
V
S
 
T
E
 
D
Y
 
T
G
 
T
D
 
M
A
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
I
F
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
K
T
 
T
R
 
L
Q
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
D
I
 
I
D
 
L
P
 
K
T
 
I
G
 
K
R
 
K
L
 
E
Q
 
Q
A
 
-
A
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
K
L
 
I
I
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
G
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
F
P
 
P
S
 
I
I
 
K
A
 
T
E
 
E
H
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
D
P
 
S
H
 
D
A
 
T
L
 
K
V
 
I
S
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
S
D
 
D
N
 
G
M
 
Y
M
 
L
G
 
S
A
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
V
G
 
N
N
 
A
I
 
I
K
 
D
P
 
S
G
 
D
A
 
H
I
 
C
T
 
A
M
 
L
S
 
N
L
 
V
G
|
G
S
x
T
S
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
I
Y
 
R
A
 
T
Y
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
Q
A
 
P
N
 
K
V
 
I
S
 
D
P
 
P
D
 
S
A
 
A
S
 
S
V
 
Y
A
 
F
T
 
C
F
 
Y
C
 
P
S
 
A
S
 
D
S
 
K
G
 
T
G
 
H
W
 
Y
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
G
P
 
P
L
 
V
I
x
N
C
 
N
T
 
G
M
x
G
N
 
I
L
 
V
T
 
F
N
 
N
A
 
-
T
 
-
G
 
W
A
 
A
I
 
R
R
 
Q
E
 
T
L
 
L
F
 
F
E
 
A
L
 
D
D
 
E
I
 
T
-
x
P
E
 
Q
A
 
D
F
 
F
N
 
L
A
 
D
L
 
V
V
 
A
A
 
Q
Q
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
R
G
 
N
V
 
L
C
 
I
M
 
F
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
N
x
G
G
 
G
E
|
E
R
 
R
V
 
A
P
 
P
A
 
I
L
 
W
P
 
D
-
x
A
H
 
N
A
 
A
G
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
R
T
 
M
N
 
H
L
 
-
T
 
Q
R
 
K
A
 
P
N
 
E
L
 
M
C
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
I
T
 
I
F
 
F
G
 
N
L
 
L
R
 
Y
Y
 
D
G
 
A
L
 
A
D
 
S
L
 
N
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
N
 
N
G
 
T
L
 
K
Q
 
K
S
 
P
L
 
V
R
 
A
I
 
I
C
 
N
L
 
A
I
 
T
G
 
G
G
|
G
G
x
F
S
 
L
K
|
K
S
 
S
P
 
D
V
 
F
W
 
V
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
C
A
 
A
D
 
N
I
 
I
M
 
F
N
 
N
T
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
V
C
 
T
T
 
M
E
 
K
Q
 
E
S
 
Q
E
 
Q
A
 
S
A
 
G
A
 
T
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
M
I
 
F
Q
 
L
A
 
A

3kzbA Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
27% identity, 90% coverage: 10:458/498 of query aligns to 9:461/498 of 3kzbA

query
sites
3kzbA
I
 
F
D
 
D
C
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
G
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
A
I
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
R
Q
 
D
S
 
G
G
 
G
Q
 
L
V
 
H
L
 
F
G
 
Q
Q
 
R
G
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
L
H
 
E
S
 
T
L
 
Y
I
 
G
S
 
D
G
 
G
A
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
P
R
 
V
E
 
E
Q
 
Q
D
 
D
T
 
A
A
 
G
Q
 
D
W
 
W
L
 
Y
E
 
D
A
 
A
F
 
-
T
 
V
Q
 
Q
A
 
R
T
 
I
R
 
A
R
 
S
A
 
S
L
 
W
L
 
W
A
 
Q
A
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
A
Q
 
R
A
 
R
I
 
V
L
 
S
G
 
A
I
 
I
G
 
V
V
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
M
H
 
Q
G
 
N
L
 
F
V
 
L
L
 
P
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
R
 
D
G
 
H
Q
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
H
P
 
R
A
 
A
K
 
V
L
 
L
W
 
Y
C
 
S
D
 
D
T
 
K
E
 
R
S
 
P
T
 
L
L
 
K
E
 
E
N
 
A
D
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
N
A
 
A
H
 
R
L
 
H
G
 
G
G
 
A
E
 
D
K
 
N
-
 
L
-
 
W
G
 
S
S
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
N
L
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
P
I
 
M
A
 
T
P
 
A
G
 
A
Y
 
S
T
 
I
V
 
L
S
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
V
W
 
F
T
 
W
K
 
R
E
 
A
Q
 
S
H
 
F
P
 
P
Q
 
Q
V
 
A
F
 
F
A
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
R
R
 
H
I
 
V
L
 
V
L
 
L
-
 
G
P
 
A
H
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
V
N
 
V
Y
 
L
W
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
H
C
 
A
S
 
T
E
 
D
Y
 
R
G
 
T
D
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
T
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
F
 
Y
N
 
R
V
 
P
R
 
K
T
 
D
R
 
D
Q
 
A
W
 
W
D
 
H
L
 
V
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
Y
D
 
G
P
 
F
T
 
S
G
 
L
R
 
D
L
 
L
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
M
P
 
P
E
 
R
L
 
L
I
 
L
D
 
E
A
 
P
H
 
G
Q
 
E
P
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
G
I
 
V
L
 
S
P
 
A
S
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
R
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
I
 
F
N
 
V
P
 
S
H
 
G
A
 
T
L
 
P
V
 
V
S
 
L
S
 
C
G
 
G
G
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
A
M
 
G
M
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
V
I
 
L
K
 
D
P
 
D
G
 
E
A
 
D
I
 
A
T
 
Y
M
 
L
S
 
H
L
 
L
G
|
G
S
x
T
S
 
T
G
 
G
T
 
W
V
 
L
Y
 
-
A
 
A
Y
 
R
A
 
L
E
 
T
Q
 
Q
A
 
T
N
 
D
V
 
P
S
 
V
P
 
G
D
 
D
A
 
M
S
 
P
V
 
V
A
 
G
T
 
T
F
 
I
C
 
F
S
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
I
S
 
I
S
 
A
G
 
G
G
 
K
W
 
T
L
 
L
P
 
Q
L
 
V
I
 
A
C
 
P
T
 
V
M
 
L
N
 
N
L
 
A
T
x
G
N
 
N
A
 
I
T
 
L
G
x
Q
A
 
W
I
 
A
R
 
L
E
 
T
L
 
L
F
 
V
-
 
G
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
G
E
 
E
L
 
D
D
 
C
I
 
A
E
 
E
A
 
Y
F
|
F
N
 
H
A
 
M
L
 
A
V
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
V
Q
 
Q
A
 
G
P
 
V
I
 
T
G
 
V
A
 
P
G
 
D
G
 
G
V
 
L
C
 
L
M
 
F
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
N
 
H
G
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
C
P
 
P
A
 
V
-
 
E
L
 
L
P
 
P
H
 
A
A
 
P
G
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
V
T
 
T
M
 
G
T
 
A
N
 
T
L
 
-
T
 
T
R
 
R
A
 
A
N
 
Q
L
 
I
C
 
L
R
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
A
T
 
A
F
 
L
G
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
 
W
G
 
C
L
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
G
Q
 
M
N
 
E
G
 
K
L
 
V
Q
 
G
S
 
L
L
 
L
R
 
K
I
 
V
C
 
-
L
 
-
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
A
K
x
R
S
 
S
P
 
E
V
 
A
W
 
W
R
 
L
Q
 
R
I
 
M
V
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
N
M
 
L
N
 
N
T
 
V
P
 
S
V
 
L
I
 
L
C
 
V
T
 
K
E
 
P
Q
 
D
S
 
A
E
 
H
A
 
L
A
 
H
A
 
P
L
 
L
-
 
R
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
A
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
V
C
 
E
K
 
L
S
 
E
W
 
W
A
 
S
N
 
H
G
 
S
Q
 
I
E
 
Q
D
 
D
S
 
F
L
 
L

3qdkA Structural insight on mechanism and diverse substrate selection strategy of ribulokinase (see paper)
22% identity, 97% coverage: 8:491/498 of query aligns to 4:524/546 of 3qdkA

query
sites
3qdkA
L
 
I
G
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
Y
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
G
 
S
T
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
L
Q
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
E
L
 
L
G
 
A
Q
 
D
G
 
H
A
 
V
A
 
T
A
 
P
H
 
Y
-
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
D
S
 
Q
L
 
Y
I
 
L
S
 
P
G
 
N
A
 
T
N
 
N
G
 
I
R
 
K
R
 
L
E
 
G
Q
 
H
D
 
E
T
 
W
A
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
L
Q
 
D
W
 
Y
L
 
V
E
 
E
A
 
V
F
 
L
T
 
T
Q
 
T
A
 
S
T
 
V
R
 
P
R
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
K
V
 
E
D
 
D
G
 
A
Q
 
D
A
 
D
I
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
D
G
 
F
Q
x
T
Q
x
A
H
 
C
G
 
T
L
 
M
V
 
L
L
 
P
L
 
V
D
 
D
D
 
E
R
 
E
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
L
 
L
-
 
C
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
K
-
 
D
R
 
N
P
 
P
-
 
H
-
 
S
-
 
W
A
 
V
K
 
K
L
 
L
W
|
W
C
 
-
D
 
K
T
 
H
E
 
H
S
 
A
T
 
A
L
 
Q
E
 
D
N
 
K
D
 
A
R
 
N
L
 
A
L
 
I
A
 
N
H
 
E
L
 
M
G
 
A
G
 
E
E
 
K
K
 
R
G
 
G
S
 
E
-
 
A
-
 
F
L
 
L
E
 
P
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
V
 
G
V
 
K
I
 
I
A
 
S
P
 
S
G
 
E
Y
 
W
T
 
M
V
 
I
S
 
A
K
 
K
L
 
V
L
 
W
W
 
Q
T
 
I
K
 
L
E
 
D
Q
 
E
H
 
A
P
 
E
Q
 
D
V
 
V
F
 
Y
A
 
N
R
 
R
I
 
T
A
 
D
R
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
E
P
 
A
H
 
T
D
 
D
Y
 
W
L
 
I
N
 
V
Y
 
S
W
 
Q
L
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
I
C
 
V
S
 
K
E
 
N
Y
 
S
G
 
C
D
 
T
A
 
A
S
 
G
G
 
Y
T
 
K
G
 
A
Y
 
I
F
 
W
N
 
H
V
 
K
R
 
R
T
 
E
R
 
G
Q
 
Y
W
 
P
D
 
S
L
 
N
Q
 
E
L
 
F
L
 
F
R
 
K
D
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
T
T
 
T
G
 
T
R
 
K
L
 
L
Q
 
R
A
 
G
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
D
L
 
I
I
 
V
D
 
P
A
 
L
H
 
G
Q
 
E
P
 
R
V
 
A
G
 
G
T
 
G
I
 
L
L
 
L
P
 
P
S
 
E
I
 
M
A
 
A
E
 
E
H
 
K
L
 
M
G
 
G
I
 
L
N
 
N
P
 
P
H
 
G
A
 
I
L
 
A
V
 
V
S
 
A
S
 
V
G
 
G
G
 
N
G
 
V
D
|
D
N
 
A
M
 
H
M
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
P
G
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
V
I
 
T
K
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
L
T
 
V
M
 
M
S
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
T
S
 
S
G
 
I
T
 
C
V
 
H
Y
 
M
A
 
L
Y
 
L
A
 
G
E
 
E
Q
 
K
A
 
E
N
 
Q
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
C
-
 
G
V
 
V
S
 
V
P
 
E
D
 
D
A
 
G
S
 
I
V
 
I
A
 
P
T
 
G
F
 
Y
C
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
S
 
S
S
 
A
S
 
V
G
 
G
G
 
D
W
 
I
L
 
F
P
 
A
L
 
W
I
 
F
C
 
V
T
 
K
M
 
H
N
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
F
A
 
D
I
 
E
R
 
A
E
 
Q
L
 
E
F
 
K
E
 
G
L
 
V
D
 
N
I
 
V
E
 
H
A
 
A
-
 
L
F
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
K
V
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
L
P
 
R
I
 
P
G
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
L
C
 
L
M
 
A
L
 
L
P
 
D
F
 
W
L
 
W
N
 
N
G
 
G
E
 
N
R
 
R
-
 
S
V
 
I
P
 
L
A
 
V
L
 
D
P
 
T
H
 
E
A
 
L
G
 
S
G
 
G
S
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
M
 
L
T
 
Q
N
 
T
L
 
K
T
 
P
R
 
E
A
 
-
N
 
E
L
 
I
C
 
Y
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
A
T
 
T
T
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
T
R
 
R
Y
 
A
G
 
I
L
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
F
R
 
H
Q
 
G
N
 
R
G
 
G
L
 
V
Q
 
E
S
 
V
L
 
H
R
 
E
I
 
L
C
 
Y
L
 
A
I
 
C
G
 
G
G
 
G
-
 
L
G
 
P
S
 
Q
K
 
K
S
 
N
P
 
H
V
 
L
W
 
L
R
 
M
Q
 
Q
I
 
I
V
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
V
M
 
T
N
 
N
T
 
R
P
 
E
V
 
I
I
 
K
C
 
V
T
 
A
E
 
A
Q
 
S
S
 
K
E
 
Q
A
 
T
A
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
M
Q
 
F
A
 
A
A
 
S
W
 
V
C
 
A
K
 
A
S
 
G
W
 
S
A
 
E
N
 
V
G
 
G
Q
 
G
E
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
A
C
 
A
E
 
K
R
 
K
C
 
M
V
 
G
K
 
R
L
 
-
D
 
-
L
 
V
A
 
K
S
 
D
E
 
E
T
 
T
L
 
F
-
 
K
P
 
P
I
 
I
A
 
P
E
 
E
N
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
I
C
 
Y
Q
 
E
Q
 
K
A
 
L
Y
 
Y
E
 
Q
R
 
E
Y
 
Y

O34154 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) (see 2 papers)
23% identity, 89% coverage: 1:444/498 of query aligns to 1:447/501 of O34154

query
sites
O34154
M
|
M
A
 
A
N
 
E
Q
 
E
Q
 
K
L
 
Y
F
 
I
L
 
M
G
 
A
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
G
 
S
T
 
S
K
 
R
A
 
A
V
 
I
I
 
I
L
 
F
D
 
D
A
 
-
Q
 
K
S
 
K
G
 
G
Q
 
N
V
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
A
 
Q
A
 
K
A
 
E
H
 
F
S
 
T
L
 
Q
I
 
Y
S
 
F
G
 
P
A
 
N
N
 
A
G
 
G
R
 
W
R
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
N
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
W
 
I
L
 
W
E
 
N
A
 
S
F
 
V
T
 
Q
Q
 
S
A
 
V
T
 
I
R
 
A
R
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
K
G
 
P
Q
 
T
A
 
D
I
 
I
L
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
N
Q
 
Q
Q
 
R
H
 
E
G
 
T
L
 
T
V
 
V
L
 
V
L
 
W
D
 
D
D
 
K
-
 
A
R
 
T
G
 
G
Q
 
L
A
 
P
L
 
I
R
 
Y
P
 
N
A
 
A
K
 
I
L
 
V
W
 
W
C
 
Q
D
 
S
T
 
R
E
 
Q
S
 
T
T
 
T
L
 
P
E
 
I
N
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
L
L
 
K
A
 
E
H
 
D
L
 
-
G
 
G
G
 
Y
E
 
S
K
 
E
G
 
M
S
 
I
L
 
H
E
 
E
R
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
D
P
 
A
G
 
Y
Y
 
F
T
 
S
V
 
A
S
 
T
K
 
K
L
 
V
L
 
R
W
 
W
T
 
I
K
 
L
E
 
D
Q
 
H
H
 
V
P
 
E
Q
 
G
V
 
A
F
 
Q
A
 
E
R
 
R
I
 
A
A
 
E
R
 
N
I
 
G
L
 
E
L
 
L
P
 
M
H
 
F
D
 
G
Y
 
T
L
 
I
N
 
D
Y
 
T
W
 
W
L
 
L
T
 
V
G
 
W
R
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
T
S
 
H
C
 
V
S
 
T
E
 
D
Y
 
Y
G
 
S
D
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
R
T
 
T
G
 
M
Y
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
I
R
 
H
T
 
D
R
 
L
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
Q
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
L
T
 
L
G
 
N
R
 
I
L
 
P
Q
 
R
A
 
V
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
S
A
 
N
H
 
S
Q
 
E
P
 
V
V
 
Y
G
 
G
T
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
G
 
T
I
 
K
N
 
N
P
 
Y
H
|
H
A
 
F
L
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
A
S
 
G
G
 
M
G
 
A
G
 
G
D
 
D
N
 
Q
M
 
Q
M
 
A
G
 
A
A
 
L
I
 
F
G
 
G
T
 
Q
G
 
M
N
 
A
I
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
M
I
 
V
T
 
K
M
 
N
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
S
 
T
-
 
G
S
 
S
G
 
F
T
 
I
V
 
V
Y
 
M
A
 
N
Y
 
T
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
A
 
P
N
 
Q
V
 
L
S
 
S
P
 
K
D
 
N
A
 
N
S
 
L
V
 
L
A
 
T
T
 
T
F
 
I
C
 
G
S
 
Y
S
 
G
S
 
I
G
 
N
G
 
G
W
 
K
L
 
V
P
 
Y
L
 
Y
I
 
A
C
 
L
T
 
E
M
 
G
N
 
S
L
 
I
T
 
F
N
 
V
A
 
A
T
 
G
G
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
E
 
W
L
 
L
F
 
R
E
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
M
L
 
L
D
 
Q
I
 
T
E
 
A
A
 
A
F
 
E
N
 
S
A
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
P
 
S
I
 
T
G
 
G
A
 
H
G
 
N
G
 
E
V
 
V
C
 
Y
M
 
V
L
 
V
P
 
P
F
 
A
L
 
F
N
 
T
G
 
G
E
 
L
R
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
Y
L
 
W
-
 
D
P
 
S
H
 
Q
A
 
A
G
 
R
G
 
G
S
 
A
L
 
V
L
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
R
T
 
-
N
 
G
L
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
E
N
 
D
L
 
F
C
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
T
V
 
L
E
 
Q
G
 
A
T
 
V
T
 
A
F
 
Y
G
 
Q
L
 
V
R
 
R
Y
 
D
G
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
T
L
 
M
R
 
K
Q
 
E
N
 
D
-
 
T
G
 
G
L
 
I
Q
 
D
S
 
I
L
 
P
R
 
V
I
 
L
C
 
K
L
 
V
I
 
D
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
A
K
 
N
S
 
N
P
 
D
V
 
F
W
 
L
R
 
M
Q
 
Q
I
 
F
V
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
I
M
 
L
N
 
N
T
 
T
P
 
A
V
 
V
I
 
Q
C
 
R
T
 
A
E
 
H
Q
 
N
S
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
F
Q
 
L
A
 
A

5ya2A Crystal structure of lsrk-hpr complex with adp (see paper)
24% identity, 89% coverage: 3:444/498 of query aligns to 1:438/478 of 5ya2A

query
sites
5ya2A
N
 
S
Q
 
K
Q
 
Y
L
 
Y
F
 
L
L
 
M
G
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
A
G
 
G
T
 
T
Q
 
G
G
 
S
T
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
F
D
 
D
A
 
L
Q
 
E
S
 
G
G
 
N
Q
 
Q
V
 
I
-
 
A
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
A
 
E
A
 
W
A
 
R
H
 
H
S
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
M
E
 
E
Q
 
F
D
 
D
T
 
L
A
 
N
Q
 
K
W
 
N
L
 
W
E
 
Q
A
 
L
F
 
A
T
 
C
Q
 
E
A
 
C
T
 
M
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
H
A
 
N
A
 
A
N
 
G
V
 
I
D
 
A
G
 
P
Q
 
E
A
 
Y
I
 
I
L
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
S
V
 
A
S
 
C
G
 
S
Q
 
M
Q
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
Y
D
 
N
D
 
N
R
 
E
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
A
K
 
P
L
 
I
W
 
W
C
 
A
D
 
C
T
 
A
E
 
N
S
 
V
T
 
D
L
 
A
E
 
R
N
 
A
D
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
V
A
 
S
H
 
E
L
 
L
G
 
K
G
 
E
E
 
L
K
 
H
G
 
N
S
 
N
L
 
T
E
 
F
R
 
E
L
 
N
G
 
E
V
 
V
V
 
Y
I
 
R
A
 
A
P
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
V
 
I
S
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
L
K
 
A
E
 
H
Q
 
H
H
 
R
P
 
S
Q
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
R
R
 
Q
I
 
A
A
 
S
R
 
T
I
 
I
L
 
T
L
 
M
P
 
I
H
 
S
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
N
 
A
Y
 
Y
W
 
M
L
 
L
T
 
S
G
 
G
R
 
E
S
 
L
C
 
A
S
 
V
E
 
D
Y
 
P
G
 
S
D
 
N
A
 
A
S
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
F
 
L
N
 
D
V
 
L
R
 
T
T
 
T
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
D
 
K
L
 
P
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
M
T
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
R
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
L
 
L
P
 
S
E
 
P
L
 
V
I
 
K
D
 
E
A
 
T
H
 
G
Q
 
T
P
 
L
V
 
L
G
 
G
T
 
V
I
 
V
L
 
S
P
 
S
S
 
Q
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
C
G
 
G
I
 
L
N
 
K
P
 
A
H
 
G
A
 
T
L
 
P
V
 
V
S
 
V
S
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
V
M
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
C
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
N
 
V
I
 
V
K
 
R
P
 
P
G
 
-
A
 
A
I
 
Q
T
 
T
M
 
A
S
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
T
-
 
F
-
 
W
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
A
G
 
A
T
 
P
V
 
V
Y
 
T
A
 
D
Y
 
P
A
 
E
E
 
M
Q
 
N
A
 
V
N
 
R
V
 
V
S
 
N
P
 
P
D
 
H
A
 
V
S
 
I
V
 
P
A
 
G
T
 
M
F
 
V
C
 
Q
S
 
A
S
 
E
S
 
S
G
 
I
G
 
S
W
 
F
L
 
F
P
 
T
L
x
G
I
 
L
C
 
T
T
 
M
M
x
R
N
 
W
L
 
F
T
x
R
N
 
D
A
 
A
T
 
F
G
 
C
A
 
A
I
 
E
R
 
E
E
 
K
L
 
L
F
 
I
-
 
A
-
 
E
E
 
R
L
 
L
D
 
G
I
 
I
E
 
D
A
 
T
F
x
Y
N
 
T
A
 
L
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
M
V
 
A
A
 
S
Q
 
R
A
 
V
P
 
P
I
 
P
G
 
G
A
 
S
G
 
W
G
 
G
V
 
V
C
 
-
M
 
-
L
 
M
P
 
P
F
 
I
L
 
F
N
 
S
G
 
D
E
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
H
A
 
A
G
 
A
G
 
P
S
 
S
L
 
F
L
 
I
G
 
N
L
 
L
T
 
S
M
 
I
-
 
D
-
 
P
T
 
D
N
 
K
L
 
C
T
 
N
R
 
K
A
 
A
N
 
T
L
 
L
C
 
F
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
E
E
 
E
G
 
N
T
 
A
T
 
A
F
 
I
G
 
V
L
 
S
R
 
A
Y
 
C
G
 
N
L
 
L
D
 
Q
L
 
Q
L
 
I
R
 
A
Q
 
D
-
 
F
N
 
S
G
 
N
L
 
I
Q
 
H
S
 
P
L
 
S
R
 
S
I
 
L
C
 
V
L
 
F
I
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
K
 
K
S
x
G
P
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
M
 
S
N
 
G
T
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
N
C
 
I
T
 
P
E
 
V
Q
 
V
S
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
A

5ya1A Crystal structure of lsrk-hpr complex with atp (see paper)
25% identity, 89% coverage: 3:444/498 of query aligns to 1:438/478 of 5ya1A

query
sites
5ya1A
N
 
S
Q
 
K
Q
 
Y
L
 
Y
F
 
L
L
 
M
G
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
A
G
 
G
T
 
T
Q
 
G
G
 
S
T
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
F
D
 
D
A
 
L
Q
 
E
S
 
G
G
 
N
Q
 
Q
V
 
I
-
 
A
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
A
 
E
A
 
W
A
 
R
H
 
H
S
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
M
E
 
E
Q
 
F
D
 
D
T
 
L
A
 
N
Q
 
K
W
 
N
L
 
W
E
 
Q
A
 
L
F
 
A
T
 
C
Q
 
E
A
 
C
T
 
M
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
H
A
 
N
A
 
A
N
 
G
V
 
I
D
 
A
G
 
P
Q
 
E
A
 
Y
I
 
I
L
 
A
G
 
A
I
 
V
G
 
S
V
 
A
S
 
C
G
 
S
Q
 
M
Q
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
Y
D
 
N
D
 
N
R
 
E
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
A
K
 
P
L
 
I
W
 
W
C
 
A
D
 
C
T
 
A
E
 
N
S
 
V
T
 
D
L
 
A
E
 
R
N
 
A
D
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
V
A
 
S
H
 
E
L
 
L
G
 
K
G
 
E
E
 
L
K
 
H
G
 
N
S
 
N
L
 
T
E
 
F
R
 
E
L
 
N
G
 
E
V
 
V
V
 
Y
I
 
R
A
 
A
P
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
A
V
 
I
S
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
L
W
 
W
T
 
L
K
 
A
E
 
H
Q
 
H
H
 
R
P
 
S
Q
 
D
V
 
I
F
 
Y
A
 
R
R
 
Q
I
 
A
A
 
S
R
 
T
I
 
I
L
 
T
L
 
M
P
 
I
H
 
S
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
N
 
A
Y
 
Y
W
 
M
L
 
L
T
 
S
G
 
G
R
 
E
S
 
L
C
 
A
S
 
V
E
 
D
Y
 
P
G
 
S
D
 
N
A
 
A
S
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
F
 
L
N
 
D
V
 
L
R
 
T
T
 
T
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
D
 
K
L
 
P
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
M
T
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
R
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
L
 
L
P
 
S
E
 
P
L
 
V
I
 
K
D
 
E
A
 
T
H
 
G
Q
 
T
P
 
L
V
 
L
G
 
G
T
 
V
I
 
V
L
 
S
P
 
S
S
 
Q
I
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
C
G
 
G
I
 
L
N
 
K
P
 
A
H
 
G
A
 
T
L
 
P
V
 
V
S
 
V
S
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
V
M
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
C
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
N
 
V
I
 
V
K
 
R
P
 
P
G
 
-
A
 
A
I
 
Q
T
 
T
M
 
A
S
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
T
G
 
F
T
 
W
V
 
Q
Y
 
Q
A
 
V
Y
 
V
A
 
N
E
 
L
Q
 
A
A
 
A
N
 
P
V
 
V
S
 
T
-
 
D
P
 
P
D
 
E
A
 
M
S
 
N
V
 
V
A
 
R
T
 
V
F
 
N
C
 
P
S
 
H
S
 
V
S
 
I
G
 
P
G
 
G
W
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
M
I
 
V
C
 
Q
T
 
A
M
 
E
N
 
S
L
 
I
T
 
S
N
 
F
A
 
F
T
 
T
G
|
G
A
 
L
I
 
T
R
 
M
E
x
R
L
 
W
F
 
F
E
x
R
L
 
D
D
 
A
I
 
F
E
 
C
A
 
A
F
 
E
N
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
P
 
-
I
 
L
G
 
G
A
 
I
G
 
D
G
 
T
V
x
Y
C
 
T
M
 
L
L
 
L
P
 
E
F
 
E
L
 
M
N
 
-
G
 
A
E
 
S
R
 
R
V
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
G
A
 
V
L
 
M
P
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
S
-
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
A
G
 
P
S
 
S
L
 
F
L
 
I
G
 
N
L
 
L
T
 
S
M
 
I
T
 
D
-
 
P
-
 
D
N
 
K
L
 
C
T
 
N
R
 
K
A
 
A
N
 
T
L
 
L
C
 
F
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
E
E
 
E
G
 
N
T
 
A
T
 
A
F
 
I
G
 
V
L
 
S
R
 
A
Y
 
C
G
 
N
L
 
L
D
 
Q
L
 
Q
L
 
I
R
 
A
Q
 
D
-
 
F
N
 
S
G
 
N
L
 
I
Q
 
H
S
 
P
L
 
S
R
 
S
I
 
L
C
 
V
L
 
F
I
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
K
 
K
S
x
G
P
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
M
 
S
N
 
G
T
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
N
C
 
I
T
 
P
E
 
V
Q
 
V
S
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
A

6k76A Glycerol kinase form thermococcus kodakarensis, complex structure with substrate.
24% identity, 94% coverage: 8:474/498 of query aligns to 2:462/485 of 6k76A

query
sites
6k76A
L
 
L
G
 
S
I