SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_5039 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5039 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
82% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
N
 
D
L
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
I
W
 
G
P
 
P
N
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
M
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
R
Q
 
Q
Q
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
V
A
 
E
T
 
H
T
 
A
G
 
G
K
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
E
S
 
S
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
I
P
 
K
H
 
H
N
 
R
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
|
H
W
|
W
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
|
F
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
R
 
R
P
 
P
L
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
K
 
R
L
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
E
 
A
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
M
 
M
S
 
S

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
N
 
N
L
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
W
 
G
P
 
G
N
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
x
R
Q
x
D
S
 
Q
I
 
V
D
x
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
V
 
A
I
 
R
A
 
K
T
 
T
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
S
I
 
I
S
 
T
R
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
S
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
V
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
P
H
x
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
x
V
A
 
S
K
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
K
 
A
L
 
E
A
 
F
G
 
A
Q
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
T
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
S
x
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
K
T
x
A
F
x
I
A
|
A
Q
x
L
A
x
R
Y
x
L
I
x
V
R
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
T
x
A
V
|
V
A
|
A
I
|
I
A
|
A
D
|
D
I
 
Y
N
 
N
L
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
W
 
G
P
 
G
N
 
R
A
 
A
Y
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
K
M
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
Q
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
V
 
A
I
 
R
A
 
K
T
 
T
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
S
I
 
I
S
 
T
R
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
S
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
T
E
 
P
H
 
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
 
V
A
 
S
K
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
K
 
A
L
 
E
A
 
F
G
 
A
Q
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
T
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
38% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
N
 
N
L
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
W
 
G
P
 
G
N
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
Q
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
V
 
A
I
 
R
A
 
K
T
 
T
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
T
 
L
E
 
E
I
 
V
S
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
K
 
K
L
 
E
A
 
Y
G
 
S
Q
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
T
 
E
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
Y
 
F
I
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
L
 
-
E
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
G
A
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
A
W
 
N
P
 
P
N
 
G
A
 
V
Y
 
V
A
 
F
V
 
I
E
 
R
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
Q
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
H
G
 
R
A
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
N
V
 
V
I
 
A
A
 
E
T
 
R
T
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
x
D
A
 
S
P
 
M
I
 
L
T
 
S
E
x
K
I
 
M
S
 
T
R
 
V
D
 
D
S
 
Q
Y
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
V
F
 
I
S
 
N
I
 
V
N
|
N
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
H
T
 
C
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
K
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
A
x
V
L
 
G
V
x
Q
A
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
G
 
A
L
 
K
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
R
H
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
x
T
A
 
A
L
x
M
F
 
V
A
 
A
K
 
E
Y
 
V
E
 
P
N
 
E
R
 
K
P
 
V
L
 
I
G
 
-
E
 
E
K
|
K
K
 
M
K
 
K
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
A
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
H
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
V
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
Y
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
M
M
 
M

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
36% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
G
F
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
K
Y
 
L
I
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
L
N
 
P
L
 
Q
E
x
Q
R
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
-
W
 
-
P
 
Q
N
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
E
 
G
M
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
Q
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
G
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
V
 
A
I
 
A
A
 
E
T
 
K
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
T
 
L
E
 
E
I
 
V
S
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
R
 
E
Q
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
G
x
T
E
 
G
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
 
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
K
 
K
L
 
E
A
 
Y
G
 
S
Q
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
G
F
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
K
Y
 
L
I
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
N
 
P
L
 
Q
E
x
Q
R
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
-
W
 
-
P
 
Q
N
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
E
 
G
M
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
Q
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
G
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
V
 
A
I
 
A
A
 
E
T
 
K
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
T
 
L
E
 
E
I
 
V
S
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
E
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
R
 
E
Q
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
K
 
K
L
 
E
A
 
Y
G
 
S
Q
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 1:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
K
 
K
R
 
K
L
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
C
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
R
 
L
T
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
T
T
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
L
D
|
D
I
x
M
N
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
V
A
 
R
E
 
E
L
 
K
W
 
G
P
 
V
N
 
E
A
 
A
Y
 
R
A
 
S
V
 
Y
E
 
V
M
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
S
Q
 
E
Q
 
E
S
 
A
I
 
V
D
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
V
A
 
D
A
 
S
V
 
V
I
 
V
A
 
R
T
 
D
T
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
Y
F
 
Q
D
 
G
-
 
A
L
 
F
A
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
Q
E
 
D
I
 
Y
S
 
P
R
 
S
D
 
D
S
 
D
Y
 
F
E
 
A
R
 
R
L
 
V
F
 
L
S
 
T
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
F
 
H
T
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
R
 
T
Q
 
Q
G
 
N
H
 
Y
G
 
G
G
 
-
K
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
P
A
 
P
L
 
N
V
 
M
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
C
 
G
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
Y
N
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
M
-
 
G
D
 
P
G
 
G
E
 
F
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
R
V
 
Q
D
 
V
A
 
E
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
K
 
K
Y
 
V
E
 
G
N
 
S
R
 
Q
P
 
Y
L
 
F
G
 
S
E
 
T
K
x
D
K
 
P
K
 
K
L
 
V
A
 
V
G
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
-
 
M
-
 
I
-
 
G
-
 
S
V
 
V
P
 
P
Y
 
M
G
 
R
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
T
 
D
A
 
I
D
 
N
D
 
E
L
 
I
V
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
G
A
 
D
E
 
D
S
 
S
D
 
S
Y
 
F
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
V
T
 
N
Y
 
L
N
 
P
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
37% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 13:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
G
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
T
 
T
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
Y
 
L
I
 
A
R
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
I
A
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
D
I
x
R
N
 
N
L
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
T
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
L
 
F
W
 
R
P
 
D
N
 
E
A
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
A
E
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
V
M
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
Q
 
H
Q
 
A
S
 
Q
I
 
V
D
 
R
G
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
E
V
 
F
I
 
E
A
 
A
T
 
R
T
 
V
G
 
G
K
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
Q
D
 
R
L
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
D
E
 
A
I
 
F
S
 
E
R
 
P
D
 
D
S
 
D
Y
 
W
E
 
H
R
 
A
L
 
L
F
 
M
S
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
L
S
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
V
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
R
Q
 
H
M
 
M
I
 
I
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
R
 
L
G
 
A
E
 
R
A
 
P
L
 
T
V
 
I
A
 
A
V
 
P
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
G
A
 
M
G
 
C
L
 
A
N
 
D
L
 
W
I
 
A
P
 
R
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
F
D
 
E
G
x
T
E
 
E
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
x
L
N
|
N
R
 
R
P
 
A
L
 
L
G
 
V
E
 
D
K
 
D
K
 
A
K
 
A
L
 
F
A
 
S
G
 
D
-
 
W
-
 
L
-
 
C
Q
 
K
E
 
R
V
 
T
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
I
 
V
V
 
N
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
D
F
 
I
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
Y
 
L
I
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
I
A
 
F
I
 
F
A
x
N
-
x
Y
D
x
N
I
x
G
N
x
S
L
 
P
E
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
T
 
T
A
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
W
 
G
P
 
V
N
 
E
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
K
M
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
Q
 
A
Q
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
F
I
 
F
A
 
K
A
 
Q
V
 
A
I
 
I
A
 
E
T
 
R
T
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
T
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
R
 
E
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
M
R
 
K
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
T
K
 
K
L
 
E
A
 
A
G
 
M
-
 
L
Q
 
A
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
M

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
35% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
N
K
 
R
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
I
F
 
Y
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
L
 
E
E
 
P
R
 
K
A
 
A
Q
 
T
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
I
-
 
T
E
 
S
L
 
L
W
 
G
P
 
G
N
 
R
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
A
E
 
A
M
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
V
Q
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
N
G
 
R
A
 
M
I
 
V
A
 
D
A
 
S
V
 
A
I
 
V
A
 
E
T
 
A
T
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
L
 
I
F
 
F
D
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
L
 
M
A
 
K
P
 
P
I
 
F
T
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
G
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
R
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
S
K
 
P
Q
 
V
M
 
M
I
 
-
R
 
R
Q
 
K
G
 
N
H
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
x
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
P
L
 
N
V
 
Y
A
 
A
V
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
N
 
E
L
 
M
I
 
G
P
 
T
H
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
x
H
G
 
G
V
x
I
D
 
I
A
 
T
L
 
E
F
x
I
A
 
P
K
 
R
Y
 
E
E
 
T
N
 
I
R
 
S
P
 
E
L
 
E
G
 
G
E
 
W
K
 
R
K
 
R
K
 
N
L
 
L
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
E
 
E
V
 
Q
P
 
A
Y
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
T
 
D
A
 
A
D
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
E
S
 
S
D
 
K
Y
 
F
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
V
N
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
N
 
G
L
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
G
Q
 
R
A
 
A
T
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
S
L
 
L
W
 
A
P
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
N
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
Q
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
E
T
 
A
T
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
x
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
T
 
L
E
 
D
I
 
M
S
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
 
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
A
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
P
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
K
x
N
Y
 
K
E
 
E
N
 
D
R
 
L
P
 
S
L
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
K
 
E
L
 
R
A
 
M
G
 
T
Q
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
x
D
E
x
M
S
 
A
D
x
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
 
S
N
 
G
L
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
G
Q
 
R
A
 
A
T
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
S
L
 
L
W
 
A
P
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
N
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
Q
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
E
T
 
A
T
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
T
 
L
E
 
D
I
 
M
S
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
P
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
K
 
N
Y
 
K
E
 
E
N
 
D
R
 
L
P
 
S
L
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
K
 
E
L
 
R
A
 
M
G
 
T
Q
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
33% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 5:257/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
T
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
Y
 
L
I
 
D
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
N
 
D
L
 
V
E
 
M
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
G
L
 
L
W
 
E
P
 
N
N
 
G
A
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
Q
 
R
Q
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
I
 
I
A
 
D
T
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
V
F
 
S
D
 
T
L
 
M
A
 
R
P
 
P
I
 
A
T
 
V
E
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
D
D
 
E
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
R
 
F
L
 
N
F
 
F
S
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
L
T
 
A
L
 
N
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
C
K
 
R
Q
 
H
M
 
F
I
 
L
R
 
A
Q
 
S
G
 
N
H
 
T
G
 
K
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
V
G
 
G
E
 
A
A
 
P
L
 
L
V
x
L
A
 
A
V
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
L
 
W
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
M
I
 
A
P
 
P
H
 
K
N
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
V
 
F
V
|
V
D
 
K
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
x
T
K
 
A
Y
x
M
E
 
Q
N
 
E
R
 
R
P
 
E
L
 
I
G
 
I
E
 
W
K
x
E
K
 
A
K
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
M
E
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
L
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
V
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
A
S
 
A
D
 
R
Y
 
F
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
G
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
V
W
 
R
M
 
M

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
G
D
x
H
I
x
S
N
 
G
L
 
S
E
 
D
R
 
E
A
x
G
Q
 
R
A
 
A
T
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
S
L
 
L
W
 
A
P
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
N
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
Q
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
V
A
 
E
T
 
A
T
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
T
 
L
E
 
D
I
 
M
S
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
E
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
P
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
A
D
 
D
A
 
L
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
R
K
 
E
L
 
R
A
 
M
G
 
T
Q
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 3:257/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
K
 
K
R
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
T
 
E
F
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
Y
 
F
I
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
L
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
C
Q
 
Q
A
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
N
E
 
S
L
 
L
W
 
K
P
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
N
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
S
V
 
A
E
 
P
M
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
D
S
 
A
I
 
Y
D
 
K
G
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
L
V
 
T
I
 
Q
A
 
K
T
 
T
T
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
F
F
x
Q
D
 
H
L
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
I
 
F
S
 
P
R
 
T
D
 
A
S
 
V
Y
 
F
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
Q
I
 
V
N
 
M
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
G
L
 
I
Q
 
K
A
 
H
A
 
V
A
 
L
K
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
K
R
 
A
Q
 
Q
G
 
K
H
 
Y
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
|
M
A
|
A
S
|
S
Q
 
I
A
x
N
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
L
 
G
V
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
N
 
E
L
 
C
I
 
A
P
 
R
H
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
Y
V
|
V
D
 
D
G
x
T
E
 
P
H
x
L
W
 
V
D
 
R
G
 
G
V
x
Q
D
 
I
A
 
A
L
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
Y
 
T
E
 
R
N
 
N
R
 
V
P
 
S
L
 
L
G
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
L
E
 
E
K
 
D
K
 
V
K
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
-
Q
 
-
E
 
M
V
 
V
P
 
P
Y
 
Q
G
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
L
T
 
S
A
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
D
M
 
Y
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
K
S
 
A
D
 
G
Y
 
G
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
V
N
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
38% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 2:256/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
K
 
K
R
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
T
 
E
F
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
Y
 
F
I
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
L
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
C
Q
 
Q
A
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
N
E
 
S
L
 
L
W
 
K
P
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
N
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
S
V
 
A
E
 
P
M
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
Q
 
D
S
 
A
I
 
Y
D
 
K
G
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
L
V
 
T
I
 
Q
A
 
K
T
 
T
T
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
F
F
x
Q
D
 
H
L
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
I
 
F
S
 
P
R
 
T
D
 
A
S
 
V
Y
 
F
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
Q
I
 
V
N
 
M
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
G
L
 
I
Q
 
K
A
 
H
A
 
V
A
 
L
K
 
P
Q
 
I
M
 
M
I
 
K
R
 
A
Q
 
Q
G
 
K
H
 
Y
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
|
M
A
|
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
L
 
G
V
x
K
A
 
A
V
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
N
 
E
L
 
C
I
 
A
P
 
R
H
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
x
Y
V
|
V
D
 
D
G
x
T
E
 
P
H
 
L
W
 
V
D
 
R
G
 
G
V
x
Q
D
 
I
A
 
A
L
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
Y
 
T
E
 
R
N
 
N
R
 
V
P
 
S
L
 
L
G
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
L
E
 
E
K
 
D
K
 
V
K
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
-
Q
 
-
E
 
M
V
 
V
P
 
P
Y
 
Q
G
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
L
T
 
S
A
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
I
V
 
A
G
 
D
M
 
Y
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
K
S
 
A
D
 
G
Y
 
G
I
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
V
N
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
35% identity, 98% coverage: 1:253/257 of query aligns to 6:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
M
 
M
K
 
S
R
 
K
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
T
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
Y
 
L
I
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
N
L
 
Y
E
x
A
R
x
S
A
x
S
Q
 
K
A
 
A
T
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
I
A
 
T
E
 
E
L
 
A
W
 
G
P
 
G
N
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
x
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
K
Q
 
A
Q
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
Q
G
 
R
A
 
I
I
 
V
A
 
D
A
 
T
V
 
A
I
 
I
A
 
E
T
 
T
T
 
Y
G
 
G
K
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
A
x
G
L
 
V
F
x
Y
D
 
E
L
 
F
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
H
Y
 
Y
E
 
R
R
 
R
L
 
Q
F
 
F
S
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
G
T
 
V
L
 
L
F
 
L
T
 
T
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
K
Q
 
H
M
 
L
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
T
R
 
S
R
 
I
G
 
T
E
 
P
A
 
P
L
 
A
V
 
S
A
 
A
V
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
D
S
 
A
L
 
I
T
 
T
Q
 
G
S
 
V
A
 
L
G
 
A
L
 
L
N
 
E
L
 
L
I
 
G
P
 
P
H
 
R
N
 
K
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
-
x
M
-
x
I
V
 
V
V
x
T
D
 
E
G
|
G
E
x
T
H
 
H
W
 
S
D
 
A
G
 
G
V
x
I
D
 
-
A
 
-
L
 
I
F
 
G
A
 
S
K
 
D
Y
 
L
E
 
E
N
 
A
R
 
Q
P
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
D
 
N
D
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
S
M
 
V
A
 
A
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
D
S
 
A
D
 
R
Y
 
W
I
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
H
Y
 
L
N
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
Q
Y
 
L
I
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
Y
I
 
A
-
 
G
N
 
S
L
 
K
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
W
 
K
P
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
N
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
M
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
Q
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
M
I
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
S
T
 
Q
T
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
T
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
R
 
E
D
 
Q
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
K
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
S
H
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
V
W
 
S
D
 
D
G
 
M
V
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
D
K
 
E
Y
 
L
E
 
K
N
 
E
R
 
Q
P
 
M
L
 
L
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
T
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
34% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
T
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
Q
Y
 
L
I
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
x
N
D
x
Y
I
x
A
-
x
G
N
x
S
L
 
K
E
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
W
 
K
P
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
N
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
M
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
Q
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
M
I
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
S
T
 
Q
T
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
T
 
M
E
 
R
I
 
M
S
 
K
R
 
E
D
 
Q
S
 
E
Y
 
W
E
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
K
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
P
 
S
H
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
L
K
 
K
K
 
E
L
 
Q
A
 
M
G
 
L
Q
 
T
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
E
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>Pf1N1B4_5039 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5039
MKRLEGKSALITGSARGIGRTFAQAYIREGATVAIADINLERAQATAAELWPNAYAVEMD
VTDQQSIDGAIAAVIATTGKLDILINNAALFDLAPITEISRDSYERLFSINVSGTLFTLQ
AAAKQMIRQGHGGKIINMASQAGRRGEALVAVYCATKAAVISLTQSAGLNLIPHNINVNA
IAPGVVDGEHWDGVDALFAKYENRPLGEKKKLAGQEVPYGRMGTADDLVGMAIFLASAES
DYIVAQTYNVDGGNWMS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory