SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_5042 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5042 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8a56B Coenzyme a-persulfide reductase (coapr) from enterococcus faecalis (see paper)
31% identity, 33% coverage: 60:360/899 of query aligns to 3:312/539 of 8a56B

query
sites
8a56B
L
 
I
I
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
N
x
G
G
x
V
M
x
A
V
x
G
G
 
G
H
 
M
H
 
S
C
 
A
V
 
A
E
x
T
Q
x
R
L
 
L
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
x
R
A
 
L
L
 
M
D
 
E
H
 
D
Y
 
A
R
 
E
L
 
I
H
 
V
V
 
V
F
x
M
S
x
E
E
x
K
E
 
G
P
 
P
M
 
F
R
 
V
A
 
S
Y
 
F
D
 
A
R
x
N
V
x
C
H
 
G
L
 
L
S
x
P
E
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
G
 
S
G
 
G
R
 
E
D
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
R
L
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
Q
S
 
L
L
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
L
G
 
K
V
 
A
T
 
R
L
x
F
H
 
N
L
 
L
G
 
D
V
 
V
-
 
R
-
 
P
-
 
H
-
x
H
P
x
E
V
|
V
L
 
V
E
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
I
R
 
E
R
 
K
Q
 
-
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
H
C
 
E
V
 
T
A
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
H
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
x
S
T
x
P
G
|
G
S
 
A
Y
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
E
 
T
G
 
G
-
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
A
D
 
K
S
 
N
R
 
V
L
 
F
V
 
S
Y
x
L
R
|
R
T
 
N
L
 
V
E
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
I
 
I
R
 
M
A
 
T
A
 
A
-
 
L
A
 
T
A
 
P
N
 
E
A
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
M
A
 
A
N
 
E
A
 
N
L
 
L
K
 
Q
S
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
K
A
 
A
P
 
P
R
 
H
L
 
V
M
 
L
P
 
P
V
 
-
Q
 
P
L
 
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
M
G
 
A
L
 
A
A
 
F
L
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
E
 
S
R
 
K
L
 
N
G
 
N
V
 
V
G
 
Q
V
 
V
H
 
I
L
 
T
S
 
G
R
 
-
G
 
-
T
 
-
Q
 
Q
S
 
S
I
 
A
S
 
V
A
 
A
G
 
F
E
 
E
E
 
E
Y
 
E
R
 
G
Y
 
Q
R
 
V
M
 
I
N
 
R
F
 
L
A
 
E
N
 
D
D
 
G
E
 
Q
F
 
T
L
 
L
E
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
T
V
 
I
F
 
L
S
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
Q
A
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
V
Q
 
E
C
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
A
I
 
T
G
 
G
P
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
D
D
 
E
Q
 
H
C
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
Q
P
 
P
N
 
D
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
A
 
I
A
 
T
W
 
Q
N
 
E
G
 
D
S
 
A
L
 
L
F
 
I
G
x
S
L
|
L
V
x
A
A
 
S
P
 
P
G
x
A
Y
 
N
Q
 
R
M
 
Q
A
 
G
R
|
R
G
 
Q
V
 
V
A
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
C
 
A

Sites not aligning to the query:

6pfzA Structure of a NAD-dependent persulfide reductase from a. Fulgidus (see paper)
31% identity, 32% coverage: 138:428/899 of query aligns to 88:399/541 of 6pfzA

query
sites
6pfzA
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
K
Q
 
T
V
 
V
-
 
K
I
 
I
T
 
V
A
 
R
Q
 
N
G
 
G
C
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
E
V
 
L
A
 
N
Y
 
Y
D
 
D
K
 
Y
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
Y
 
R
P
 
P
F
 
A
V
 
K
P
 
P
P
 
P
I
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
I
E
 
E
G
 
A
D
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
V
V
 
T
Y
x
L
R
 
T
T
 
S
L
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
I
-
 
I
R
 
E
A
 
M
A
 
W
A
 
E
A
 
E
N
 
G
A
 
A
R
 
E
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
M
E
 
E
A
 
V
H
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
E
F
 
M
A
 
M
P
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
A
P
 
P
V
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
R
Q
 
E
G
 
M
G
 
A
L
 
V
A
 
L
L
 
V
K
 
E
A
 
N
Q
 
H
I
 
L
E
 
R
R
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
N
V
 
V
H
 
V
L
 
T
S
 
S
R
 
T
G
 
R
T
 
V
Q
 
E
S
 
K
I
 
I
S
 
V
A
 
S
G
 
Q
E
 
D
E
 
D
Y
 
-
R
 
K
Y
 
V
R
 
R
M
 
A
N
 
V
F
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
G
E
 
K
F
 
E
L
 
Y
E
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
A
A
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
K
A
 
P
Q
 
N
D
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
K
C
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
K
I
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
W
I
 
V
D
 
D
D
 
E
Q
 
Y
C
 
M
L
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
E
N
 
S
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
I
 
G
G
|
G
E
x
D
C
 
C
A
 
V
A
 
E
W
 
T
N
 
T
G
 
C
S
 
L
L
 
V
F
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
F
Y
x
G
Q
x
D
M
 
V
A
|
A
R
x
N
G
 
K
V
 
Q
A
 
G
T
x
R
L
 
V
L
 
I
C
 
G
N
 
E
Q
 
N
V
 
I
A
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
E
 
A
P
 
V
F
 
F
Q
 
P
G
 
G
A
 
V
D
 
I
M
 
R
S
x
T
T
 
A
K
 
I
L
 
F
K
 
K
L
 
V
L
 
F
G
 
D
V
 
F
D
 
T
V
 
A
G
 
A
S
 
S
I
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
N
D
 
E
A
 
Q
H
 
M
A
 
A
Q
 
K
T
 
E
P
 
A
G
 
G
A
 
L
R
 
D
S
 
Y
Y
 
F
Q
 
T
F
 
V
I
 
I
-
x
A
-
 
P
-
 
S
-
 
P
D
 
D
E
 
R
A
 
A
-
 
H
-
x
Y
-
 
Y
-
 
P
T
 
Q
A
 
A
S
 
N
Y
 
Y
R
 
I
R
 
R
-
 
L
-
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
K
D
 
G
S
 
S
K
 
W
R
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
Q
L
 
G
V
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9HTK9 Rubredoxin-NAD(+) reductase; RdxR; EC 1.18.1.1 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
28% identity, 42% coverage: 54:428/899 of query aligns to 1:366/384 of Q9HTK9

query
sites
Q9HTK9
L
 
M
N
 
S
K
 
E
L
 
R
Q
 
A
T
 
P
L
 
L
I
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
N
x
T
G
|
G
M
x
L
V
x
A
G
 
G
H
 
Y
H
 
N
C
 
L
V
 
A
E
 
R
Q
 
E
L
 
W
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
 
K
A
 
L
L
 
D
D
 
G
H
 
E
Y
 
T
R
 
P
L
 
L
H
 
L
V
 
M
F
 
I
S
x
T
E
x
A
E
 
D
P
 
D
M
 
G
R
 
R
A
 
S
Y
 
Y
D
 
S
R
x
K
V
 
P
H
 
M
L
 
L
S
 
S
E
 
T
Y
 
G
F
 
F
G
 
S
-
 
K
G
 
N
R
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
D
S
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
A
E
 
E
-
 
P
A
 
G
S
 
A
L
 
M
Y
 
A
Q
 
E
T
 
Q
P
 
L
G
 
N
V
 
A
T
 
R
L
 
I
H
 
L
L
 
T
G
 
H
V
 
T
P
 
R
V
|
V
L
 
T
E
 
G
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
G
R
 
H
R
 
Q
Q
 
R
V
 
I
I
 
W
T
 
I
A
 
G
Q
 
E
G
 
E
C
 
E
V
 
V
A
 
R
Y
 
Y
D
 
R
K
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
W
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
P
 
P
F
 
I
V
 
R
P
 
V
P
 
P
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
D
E
 
A
G
 
Q
D
 
D
S
 
A
R
 
L
L
 
Y
V
 
P
Y
 
I
R
 
N
T
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
R
I
 
F
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
G
A
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
C
E
|
E
A
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
D
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
G
G
 
G
L
 
Y
E
 
Q
A
 
L
H
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
A
F
 
P
A
 
C
P
 
E
R
 
Q
L
 
V
M
 
M
P
 
P
V
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
F
H
 
H
L
 
L
S
 
G
R
 
P
G
 
V
T
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
A
E
 
G
E
 
E
Y
 
-
R
 
G
Y
 
L
R
 
E
M
 
A
N
 
H
F
 
L
A
 
S
N
 
D
D
 
G
E
 
E
F
 
V
L
 
I
E
 
P
A
 
C
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
S
S
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
R
A
 
P
Q
 
R
D
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
F
Q
 
A
C
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
A
I
 
V
G
 
-
P
 
-
R
 
N
G
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
D
D
 
R
Q
 
S
C
 
L
L
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
H
P
 
A
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
G
 
G
E
x
D
C
 
C
A
 
A
A
 
E
W
 
V
N
 
D
G
 
G
S
 
L
L
 
N
F
 
L
G
 
L
L
 
Y
V
|
V
A
 
M
P
 
P
G
 
L
Y
 
M
Q
 
A
M
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
Q
L
 
T
L
 
L
C
 
A
N
 
G
Q
 
N
V
 
P
A
 
S
E
 
Q
P
 
V
F
 
A
Q
 
Y
G
 
G
A
 
P
D
 
-
M
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
T
L
 
V
K
|
K
L
 
T
L
 
P
G
 
A
V
 
C
D
 
P
V
 
L
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
V
H
 
V
A
 
S
Q
 
P
T
 
P
P
 
P
G
 
R
A
 
G
R
 
M
S
 
D
Y
 
G
Q
 
Q
F
 
W
I
 
L
D
 
V
E
 
E
A
 
G
T
 
S
A
 
G
S
 
T
Y
 
D
R
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
L
V
 
C
D
 
R
A
 
D
D
 
T
S
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
A
L
 
L
V
 
T
G
 
G

2v3aA Crystal structure of rubredoxin reductase from pseudomonas aeruginosa. (see paper)
28% identity, 41% coverage: 60:428/899 of query aligns to 4:363/381 of 2v3aA

query
sites
2v3aA
L
 
L
I
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
N
x
T
G
|
G
M
x
L
V
x
A
G
 
G
H
 
Y
H
 
N
C
 
L
V
 
A
E
 
R
Q
 
E
L
 
W
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
 
K
A
 
L
L
 
D
D
 
G
H
 
E
Y
 
T
R
 
P
L
 
L
H
 
L
V
 
M
F
x
I
S
x
T
E
x
A
E
x
D
P
 
D
M
 
G
R
 
R
A
 
S
Y
 
Y
D
 
S
R
x
K
V
x
P
H
 
M
L
 
L
S
|
S
E
 
T
Y
 
G
F
 
F
G
 
S
-
 
K
G
 
N
R
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
D
S
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
A
E
 
E
-
 
P
A
 
G
S
 
A
L
 
M
Y
 
A
Q
 
E
T
 
Q
P
 
L
G
 
N
V
 
A
T
 
R
L
 
I
H
 
L
L
 
T
G
 
H
V
x
T
P
x
R
V
|
V
L
 
T
E
 
G
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
G
R
 
H
R
 
Q
Q
 
R
V
 
I
I
 
W
T
 
I
A
 
G
Q
 
E
G
 
E
C
 
E
V
 
V
A
 
R
Y
 
Y
D
 
R
K
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
x
W
G
|
G
S
 
A
Y
 
E
P
 
P
F
 
I
V
 
R
P
 
V
P
 
P
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
D
E
 
A
G
 
Q
D
 
D
S
 
A
R
 
L
L
 
Y
V
 
P
Y
 
I
R
 
N
T
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
Y
D
 
A
A
 
R
I
 
F
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
G
A
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
V
V
 
L
V
 
L
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
x
I
G
 
G
L
 
C
E
|
E
A
x
F
A
 
A
N
 
N
A
 
D
L
 
L
K
 
S
S
 
S
L
 
G
G
 
G
L
 
Y
E
 
Q
A
 
L
H
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
A
F
 
P
A
 
C
P
 
E
R
 
Q
L
 
V
M
 
M
P
 
P
V
 
G
Q
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
R
V
 
F
H
 
H
L
 
L
S
 
G
R
 
P
G
 
V
T
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
A
E
 
G
E
 
E
Y
 
-
R
 
G
Y
 
L
R
 
E
M
 
A
N
 
H
F
 
L
A
 
S
N
 
D
D
 
G
E
 
E
F
 
V
L
 
I
E
 
P
A
 
C
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
S
S
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
R
A
 
P
Q
x
R
D
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
F
Q
 
A
C
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
A
I
 
V
G
 
-
P
 
-
R
 
N
G
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
D
D
 
R
Q
 
S
C
 
L
L
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
H
P
 
A
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
G
|
G
E
x
D
C
 
C
A
 
A
A
 
E
W
 
V
N
 
D
G
 
G
S
 
L
L
 
N
F
 
L
G
x
L
L
x
Y
V
|
V
A
 
M
P
 
P
G
x
L
Y
x
M
Q
 
A
M
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
Q
L
 
T
L
 
L
C
 
A
N
 
G
Q
 
N
V
 
P
A
 
S
E
 
Q
P
 
V
F
 
A
Q
 
Y
G
 
G
A
 
P
D
 
-
M
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
T
L
 
V
K
|
K
L
 
T
L
 
P
G
 
A
V
 
C
D
 
P
V
 
L
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
V
H
 
V
A
 
S
Q
 
P
T
 
P
P
 
P
G
 
R
A
 
G
R
 
M
S
 
D
Y
 
G
Q
 
Q
F
 
W
I
 
L
D
 
V
E
 
E
A
 
G
T
 
S
A
 
G
S
 
T
Y
 
D
R
 
L
R
 
K
L
 
V
V
 
L
V
 
C
D
 
R
A
 
D
D
 
T
S
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
Y
V
 
A
L
 
L
V
 
T
G
 
G

Q8U1K9 NAD(P)H:rubredoxin oxidoreductase; NROR; Rubredoxin--NAD(P)(+) reductase; EC 1.18.1.4 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1)
29% identity, 41% coverage: 60:429/899 of query aligns to 3:343/359 of Q8U1K9

query
sites
Q8U1K9
L
 
V
I
 
V
V
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
N
G
 
G
M
 
P
V
x
G
G
 
G
H
 
F
H
 
E
C
 
L
V
 
A
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
I
 
S
E
 
Q
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
T
Y
 
Y
R
 
E
L
 
V
H
 
T
V
 
V
F
 
I
S
x
D
E
x
K
E
 
E
P
 
P
M
 
V
R
 
P
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
S
R
x
K
V
x
P
H
 
M
L
 
L
S
 
S
E
 
H
Y
 
Y
F
 
I
G
 
A
G
 
G
R
 
F
D
 
I
A
 
P
E
 
R
S
 
N
-
 
R
L
 
L
A
 
F
L
 
P
G
 
Y
E
 
S
A
 
L
S
 
D
L
 
W
Y
 
Y
Q
 
R
T
 
K
P
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
R
L
 
L
G
 
A
V
 
E
P
 
E
V
x
A
L
 
K
E
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
G
R
 
R
R
 
K
Q
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
C
 
E
V
 
V
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
x
A
Y
 
R
P
 
A
F
 
R
V
 
E
P
 
P
P
 
Q
I
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
-
D
 
-
S
 
Y
R
 
L
L
 
L
V
 
T
Y
 
L
R
|
R
T
 
T
L
 
I
E
 
F
D
 
D
L
 
A
D
 
D
A
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
S
A
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
R
 
G
R
 
E
G
 
A
V
 
I
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
N
L
 
L
K
 
A
S
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
E
 
H
A
 
V
H
 
K
V
 
L
V
 
I
E
 
H
F
 
R
A
 
G
P
 
A
R
 
-
L
 
-
M
 
M
P
 
F
V
 
L
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
L
G
 
S
L
 
N
A
 
M
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
M
I
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
F
H
 
F
L
 
L
S
 
N
R
 
-
G
 
-
T
 
S
Q
 
E
S
 
L
I
 
L
S
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
E
E
 
E
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
G
N
 
V
F
 
L
A
 
T
N
 
N
D
 
S
E
 
G
F
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
G
D
 
K
L
 
V
I
 
K
V
 
I
F
 
C
S
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
V
A
 
P
Q
 
N
D
 
V
A
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
C
 
S
A
 
G
L
 
I
D
 
H
I
 
T
G
 
G
P
 
R
R
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
L
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Q
 
N
C
 
F
L
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
A
P
 
K
N
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
x
D
C
 
C
A
 
A
A
 
E
W
 
Y
N
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
I
F
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
K
P
 
A
G
 
A
Y
 
M
Q
 
E
M
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
D
L
 
I
L
 
L
C
 
K
N
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
G
E
 
E
P
 
P
-
 
R
-
 
R
F
 
Y
Q
 
N
G
 
F
A
 
K
D
 
F
M
 
R
S
 
S
T
 
T
K
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
F
L
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
Q
V
 
I
G
 
A
S
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
A
 
T
H
 
K
A
 
G
Q
 
E
T
 
G
P
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
E
E
 
D
A
 
N
T
 
T
A
 
K
S
 
V
Y
 
F
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
Y
D
 
E
S
 
N
K
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
F
G
 
N
D
 
D

1xhcA Nadh oxidase /nitrite reductase from pyrococcus furiosus pfu-1140779- 001
30% identity, 37% coverage: 60:392/899 of query aligns to 3:318/346 of 1xhcA

query
sites
1xhcA
L
 
V
I
 
V
V
 
I
I
x
V
G
|
G
N
 
N
G
|
G
M
x
P
V
x
G
G
 
G
H
 
F
H
 
E
C
 
L
V
 
A
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
I
 
S
E
 
Q
R
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
T
Y
 
Y
R
 
E
L
 
V
H
 
T
V
 
V
F
x
I
S
x
D
E
x
K
E
|
E
P
 
P
M
 
V
R
 
P
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
S
R
x
K
V
x
P
H
 
M
L
 
L
S
 
S
E
 
H
Y
 
Y
F
 
I
G
 
A
G
 
G
R
 
F
D
 
I
A
 
P
E
 
R
S
 
N
-
 
R
L
 
L
A
 
F
L
 
P
G
 
Y
E
 
S
A
 
L
S
 
D
L
 
W
Y
 
Y
Q
 
R
T
 
K
P
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
H
 
R
L
 
L
G
 
A
V
x
E
P
x
E
V
x
A
L
 
K
E
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
G
R
 
R
R
 
K
Q
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
C
 
E
V
 
V
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
x
A
Y
 
R
P
 
A
F
 
R
V
 
E
P
 
P
P
 
Q
I
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
K
E
 
E
G
 
-
D
 
-
S
 
Y
R
 
L
L
 
L
V
 
T
Y
x
L
R
|
R
T
 
T
L
 
I
E
 
F
D
 
D
L
 
A
D
 
D
A
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
S
A
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
R
 
G
R
 
E
G
 
A
V
 
I
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
x
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
N
L
 
L
K
 
A
S
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
E
 
H
A
 
V
H
 
K
V
 
L
V
 
I
E
 
H
F
 
R
A
 
G
P
 
A
R
 
-
L
 
-
M
 
M
P
 
F
V
 
L
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
L
G
 
S
L
 
N
A
 
M
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
M
I
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
F
H
 
F
L
 
L
S
 
N
R
 
-
G
 
-
T
 
S
Q
 
E
S
 
L
I
 
L
S
 
E
A
 
A
G
 
N
E
 
E
E
 
E
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
G
N
 
V
F
 
L
A
 
T
N
 
N
D
 
S
E
 
G
F
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
G
D
 
K
L
 
V
I
 
K
V
 
I
F
 
C
S
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
R
 
V
A
 
P
Q
 
N
D
 
V
A
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
C
 
S
A
 
G
L
 
I
D
 
H
I
 
T
G
 
G
P
 
R
R
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
L
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Q
 
N
C
 
F
L
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
A
P
 
K
N
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
E
x
D
C
 
C
A
 
A
A
 
E
W
 
Y
N
 
S
G
 
G
S
 
I
L
 
I
F
 
A
G
|
G
L
x
T
V
x
A
A
 
K
P
 
A
G
x
A
Y
x
M
Q
 
E
M
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
D
L
 
I
L
 
L
C
 
K
N
 
G
Q
 
E
V
 
-
A
 
P
E
 
R
P
 
R
F
 
Y
Q
 
N
G
 
F
A
 
K
D
 
F
M
 
R
S
 
S
T
 
T
K
 
V
L
x
F
K
 
K
L
 
F
L
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
Q
V
 
I
G
 
A
S
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
A
 
T
H
 
K
A
 
G
Q
 
E

3nt6A Structure of the shewanella loihica pv-4 nadh-dependent persulfide reductase c43s/c531s double mutant (see paper)
30% identity, 29% coverage: 136:392/899 of query aligns to 81:367/565 of 3nt6A

query
sites
3nt6A
V
|
V
L
 
V
E
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
L
V
 
L
I
 
D
T
 
G
A
 
S
Q
 
E
G
 
Y
C
 
Q
V
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
T
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
x
S
T
x
P
G
|
G
S
 
A
Y
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
V
E
 
D
G
 
N
D
 
P
S
 
L
R
 
T
L
 
H
V
 
S
Y
x
L
R
|
R
T
 
N
L
 
I
E
 
P
D
 
D
L
 
M
D
 
D
A
 
R
I
 
I
R
 
L
A
 
Q
A
 
T
A
 
I
A
 
Q
-
 
M
-
 
N
N
 
N
A
 
V
R
 
E
R
 
H
G
 
A
V
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
x
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
M
A
 
M
N
 
E
A
 
S
L
 
L
K
 
H
S
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
K
A
 
T
H
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
D
R
 
Q
L
 
V
M
 
M
P
 
T
V
 
P
Q
 
V
L
 
D
D
 
R
E
 
E
Q
 
M
G
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
L
 
H
K
 
Q
A
 
A
Q
 
-
I
 
I
E
 
R
R
 
D
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
L
H
 
R
L
 
L
S
 
G
R
 
T
G
 
A
T
 
L
Q
 
S
S
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
Y
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
H
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
D
Y
 
T
R
 
A
Y
 
H
R
 
Q
-
 
H
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
S
M
 
L
N
 
T
F
 
L
A
 
S
N
 
N
D
 
G
E
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
I
F
 
M
S
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
P
Q
 
E
D
 
T
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
D
C
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
K
I
 
V
D
 
N
D
 
A
Q
 
M
C
 
M
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
N
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
G
|
G
E
x
D
C
 
A
A
 
V
A
 
E
W
 
E
N
 
Q
G
 
D
S
 
F
L
 
V
F
 
T
G
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
V
-
x
P
L
|
L
V
x
A
A
 
G
P
 
P
G
x
A
Y
x
N
Q
 
R
M
 
Q
A
 
G
R
|
R
G
 
M
V
 
A
A
 
A
T
 
D
L
 
N
L
 
M
C
 
F
N
 
G
Q
 
R
V
 
-
A
 
E
E
 
E
P
 
R
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
D
 
Q
M
 
G
S
 
T
T
 
A
K
 
I
L
 
C
K
 
K
L
 
V
L
 
F
G
 
D
V
 
L
D
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
A
I
 
T
G
 
G
D
 
K
A
 
N
H
 
E
A
 
K
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

6rvhA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with menadione (see paper)
32% identity, 24% coverage: 123:335/899 of query aligns to 68:283/443 of 6rvhA

query
sites
6rvhA
Y
 
F
Q
 
R
T
 
K
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
T
G
 
R
V
 
H
P
x
E
V
|
V
L
 
V
E
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
Y
A
 
E
R
 
L
R
 
R
Q
 
T
V
 
L
I
 
T
T
 
V
-
 
H
-
 
D
-
 
H
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
C
 
R
V
 
T
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
A
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
x
A
Y
 
R
P
 
P
F
 
S
V
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
T
E
 
E
G
 
Q
D
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
Y
V
 
T
Y
x
L
R
|
R
T
 
T
L
 
M
E
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
E
A
 
R
I
 
L
R
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
P
N
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
R
S
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
F
 
A
A
 
K
P
 
D
R
 
R
L
 
P
M
 
L
P
 
P
V
 
-
Q
 
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
Q
 
E
G
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
E
R
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
W
L
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
V
H
 
E
L
 
A
S
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
M
Q
 
G
S
 
R
I
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
E
E
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
T
N
 
S
D
 
E
E
 
G
F
 
V
L
 
V
E
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
F
 
L
S
 
A
A
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
P
Q
 
N
D
 
T
A
 
E
L
|
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
C
 
M
A
 
G
L
 
V
D
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
A
I
 
T
D
 
D
D
 
E
Q
 
R
C
 
M
L
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
N
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
I
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6rvbA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with nadh (see paper)
32% identity, 24% coverage: 123:335/899 of query aligns to 68:283/443 of 6rvbA

query
sites
6rvbA
Y
 
F
Q
 
R
T
 
K
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
T
G
 
R
V
 
H
P
x
E
V
|
V
L
 
V
E
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
Y
A
 
E
R
 
L
R
 
R
Q
 
T
V
 
L
I
 
T
T
 
V
-
 
H
-
 
D
-
 
H
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
C
 
R
V
 
T
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
A
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
x
A
Y
 
R
P
 
P
F
 
S
V
 
L
P
|
P
P
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
T
E
 
E
G
 
Q
D
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
Y
V
 
T
Y
x
L
R
|
R
T
 
T
L
 
M
E
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
E
A
 
R
I
 
L
R
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
P
N
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
V
 
A
V
 
I
V
x
L
G
|
G
G
 
A
G
|
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
R
S
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
x
L
E
|
E
F
x
A
A
 
K
P
 
D
R
 
R
L
 
P
M
 
L
P
 
P
V
 
-
Q
x
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
Q
 
E
G
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
E
R
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
W
L
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
V
H
 
E
L
 
A
S
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
M
Q
 
G
S
 
R
I
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
E
E
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
T
N
 
S
D
 
E
E
 
G
F
 
V
L
 
V
E
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
F
 
L
S
x
A
A
x
T
G
|
G
I
|
I
R
 
R
A
 
P
Q
 
N
D
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
C
 
M
A
 
G
L
 
V
D
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
A
I
 
T
D
 
D
D
 
E
Q
 
R
C
 
M
L
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
N
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
I
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6ruzA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase (see paper)
32% identity, 24% coverage: 123:335/899 of query aligns to 68:283/443 of 6ruzA

query
sites
6ruzA
Y
 
F
Q
 
R
T
 
K
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
T
G
 
R
V
 
H
P
x
E
V
|
V
L
 
V
E
 
D
I
 
V
D
 
D
R
 
Y
A
 
E
R
 
L
R
 
R
Q
 
T
V
 
L
I
 
T
T
 
V
-
 
H
-
 
D
-
 
H
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
C
 
R
V
 
T
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
A
 
R
Y
 
F
D
 
D
K
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
x
A
Y
 
R
P
 
P
F
 
S
V
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
T
E
 
E
G
 
Q
D
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
Y
V
 
T
Y
x
L
R
|
R
T
 
T
L
 
M
E
 
E
D
 
D
L
 
G
D
 
E
A
 
R
I
 
L
R
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
P
N
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
F
K
 
R
S
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
 
L
E
 
E
F
 
A
A
 
K
P
 
D
R
 
R
L
 
P
M
 
L
P
 
P
V
 
-
Q
 
H
L
 
W
D
 
D
E
 
P
Q
 
E
G
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
E
R
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
W
L
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
V
H
 
E
L
 
A
S
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
M
Q
 
G
S
 
R
I
 
V
S
 
E
A
 
A
G
 
V
E
 
E
E
 
-
Y
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
T
N
 
S
D
 
E
E
 
G
F
 
V
L
 
V
E
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
F
 
L
S
 
A
A
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
P
Q
 
N
D
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
C
 
M
A
 
G
L
 
V
D
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
A
I
 
T
D
 
D
D
 
E
Q
 
R
C
 
M
L
 
R
T
 
T
S
 
N
D
 
L
P
 
E
N
 
G
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
I
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
28% identity, 36% coverage: 59:384/899 of query aligns to 3:337/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
T
 
T
L
 
V
I
 
L
V
 
I
I
 
A
G
|
G
N
x
A
G
|
G
M
x
H
V
x
A
G
 
G
H
 
F
H
 
Q
C
 
V
V
 
A
E
 
V
Q
 
S
L
 
L
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
 
Q
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
H
 
P
Y
 
G
R
 
R
L
 
I
H
 
A
V
 
L
F
x
I
S
 
N
E
x
D
E
|
E
P
 
K
M
 
H
R
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
Q
R
|
R
V
x
P
H
 
P
L
 
L
S
|
S
E
x
K
Y
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
K
G
 
S
G
 
G
R
 
G
D
 
D
A
 
P
E
 
N
S
 
S
L
 
L
A
 
M
L
 
F
G
 
R
E
 
P
A
 
E
S
 
K
L
 
F
Y
 
F
Q
 
Q
T
 
D
P
 
Q
G
 
A
V
 
I
T
 
E
L
 
L
H
 
-
L
 
I
G
 
S
V
 
D
P
x
R
V
x
M
L
 
V
E
 
S
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
E
R
 
G
R
 
R
Q
 
K
V
 
L
I
 
L
T
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
-
 
T
C
 
A
V
 
I
A
 
E
Y
 
Y
D
 
G
K
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
Y
 
R
P
 
N
F
 
R
V
 
M
P
 
L
P
 
D
I
 
V
E
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
S
G
 
L
D
 
P
S
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
Y
Y
 
L
R
|
R
T
 
T
L
 
L
E
 
D
D
 
E
L
 
S
D
 
E
A
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
Q
A
 
R
A
 
M
A
 
P
N
 
D
A
 
K
R
 
K
R
 
H
G
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
F
A
 
A
N
 
A
A
 
T
L
 
A
K
 
R
S
 
A
L
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
V
H
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
V
M
 
M
P
 
A
V
 
R
Q
 
V
L
 
V
D
 
T
E
 
P
Q
 
E
G
 
I
G
 
S
L
 
S
A
 
Y
L
 
F
K
 
H
A
 
D
Q
 
R
I
 
H
E
 
S
R
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
R
V
 
M
H
 
H
L
 
Y
S
 
G
R
 
V
G
 
R
T
 
A
Q
 
T
S
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
G
 
E
E
 
G
E
 
D
Y
 
R
R
 
V
Y
 
T
R
 
G
M
 
V
N
 
V
F
 
L
A
 
S
N
 
D
D
 
G
E
 
N
F
 
T
L
 
L
E
 
P
A
 
C
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
V
F
 
V
S
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
V
R
 
I
A
 
P
Q
 
N
D
 
V
A
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
A
C
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
P
I
 
T
G
 
-
P
 
-
R
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
D
 
Q
Q
 
Q
C
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
N
 
H
I
 
I
Y
 
S
A
 
A
I
 
I
G
|
G
E
x
D
C
 
C
A
 
A
A
 
L
W
 
F
N
 
E
G
 
S
S
 
V
L
 
R
F
 
F
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
R
-
 
V
-
x
E
L
x
S
V
|
V
A
 
Q
P
 
N
G
x
A
Y
 
T
Q
 
D
M
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
C
V
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
R
L
 
L
C
 
T
N
 
G
Q
 
D
V
 
-
A
 
A
E
 
K
P
 
P
F
 
Y
Q
 
D
G
 
G
-
 
Y
-
 
P
-
 
W
-
 
F
-
x
W
A
 
S
D
 
D
M
 
Q
-
 
G
S
 
D
T
 
D
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
T
V
 
A
G
 
G

5er0A Water-forming nadh oxidase from lactobacillus brevis (lbnox) (see paper)
25% identity, 42% coverage: 60:434/899 of query aligns to 4:395/450 of 5er0A

query
sites
5er0A
L
 
V
I
 
T
V
 
V
I
x
V
G
|
G
N
x
C
G
x
T
M
x
H
V
x
A
G
 
G
H
 
T
H
 
F
C
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
Q
L
 
I
I
 
L
E
 
A
R
 
E
G
 
H
A
 
P
L
 
-
D
 
-
H
 
D
Y
 
A
R
 
E
L
 
V
H
 
T
V
 
V
F
x
Y
S
x
E
E
x
R
E
x
N
P
 
D
M
 
V
R
x
I
A
 
S
Y
 
F
D
x
L
R
x
S
V
x
C
H
 
G
L
 
I
S
 
A
E
 
L
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
D
 
D
A
 
P
E
 
Q
S
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
P
S
 
E
L
 
E
Y
 
L
Q
 
Q
T
 
K
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
N
L
 
V
H
x
Q
L
 
M
G
 
N
V
x
H
P
x
N
V
|
V
L
 
L
E
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
D
R
 
Q
R
 
K
Q
 
T
V
 
V
I
 
T
T
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
N
-
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
T
C
x
T
V
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
M
A
x
T
T
x
S
G
|
G
S
|
S
Y
 
W
P
 
P
F
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
K
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
I
E
 
D
G
 
S
D
 
D
S
 
R
R
 
V
L
 
K
V
 
L
Y
x
C
R
x
K
T
 
N
L
 
W
E
 
A
D
 
H
L
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
I
A
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
K
N
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
I
V
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
Y
K
 
S
S
 
T
L
 
T
G
 
G
L
 
H
E
 
D
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
A
A
 
M
P
 
A
R
 
R
L
 
V
M
 
M
P
 
P
V
 
K
Q
 
Y
L
 
F
D
 
D
E
 
A
Q
 
D
G
 
F
G
 
T
L
 
D
A
 
V
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
Q
 
D
I
 
Y
E
 
R
R
 
D
L
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
Q
V
 
L
H
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
E
G
 
T
T
 
V
Q
 
E
S
 
S
I
 
F
S
 
T
A
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
D
Y
 
S
R
 
A
Y
 
T
R
 
G
M
 
L
N
 
T
F
 
I
A
 
K
N
 
T
D
 
D
E
 
K
-
 
N
F
 
S
L
 
Y
E
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
L
I
 
A
V
 
I
F
 
L
S
 
C
A
 
I
G
 
G
I
x
F
R
 
R
A
 
P
Q
x
N
D
 
T
A
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
K
Q
 
-
C
 
G
A
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
A
P
 
P
R
 
N
G
 
G
G
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
T
D
 
D
D
 
D
Q
 
Y
C
 
M
L
 
R
T
 
S
S
 
S
D
 
N
P
 
P
N
 
D
I
 
I
Y
 
F
A
|
A
I
 
A
G
|
G
E
x
D
C
 
S
A
|
A
A
|
A
-
 
V
-
 
H
W
 
Y
N
 
N
G
 
P
S
 
T
L
 
H
F
 
Q
G
 
N
L
 
A
V
 
Y
A
 
I
P
|
P
G
x
L
Y
x
A
Q
x
T
M
 
N
A
|
A
R
x
V
G
 
R
V
 
Q
A
 
G
T
 
I
L
 
L
L
 
V
C
 
G
N
 
K
Q
 
N
V
 
L
A
 
V
E
 
K
P
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
K
F
 
Y
Q
 
M
G
 
G
A
 
T
D
 
Q
M
 
S
S
 
S
T
 
S
K
 
G
L
 
L
K
 
A
L
 
L
L
 
Y
G
 
D
V
 
R
D
 
T
V
 
I
G
 
V
S
 
S
I
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
D
 
L
A
 
A
H
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
Q
P
 
Q
G
 
G
A
 
L
R
 
N
S
 
A
Y
 
E
Q
 
Q
F
 
V
I
 
I
D
 
V
E
 
E
A
 
-
T
 
-
A
 
D
S
 
N
Y
 
Y
R
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
M
-
 
P
-
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
M
R
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
F
D
 
D
A
 
P
D
 
D
S
 
T
K
 
H
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
M
G
 
-
D
 
-
N
 
-
S
 
S
Y
 
K
Y
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5vn0A Water-forming nadh oxidase from lactobacillus brevis (lbnox) bound to nadh. (see paper)
25% identity, 42% coverage: 60:434/899 of query aligns to 4:395/449 of 5vn0A

query
sites
5vn0A
L
 
V
I
 
T
V
 
V
I
 
V
G
|
G
N
x
C
G
x
T
M
x
H
V
x
A
G
 
G
H
 
T
H
 
F
C
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
Q
L
 
I
I
 
L
E
 
A
R
 
E
G
 
H
A
 
P
L
 
-
D
 
-
H
 
D
Y
 
A
R
 
E
L
 
V
H
 
T
V
 
V
F
x
Y
S
x
E
E
x
R
E
x
N
P
 
D
M
 
V
R
x
I
A
 
S
Y
 
F
D
x
L
R
x
S
V
x
C
H
 
G
L
 
I
S
 
A
E
 
L
Y
 
Y
F
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
V
-
 
A
D
 
D
A
 
P
E
 
Q
S
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
P
S
 
E
L
 
E
Y
 
L
Q
 
Q
T
 
K
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
N
L
 
V
H
x
Q
L
 
M
G
 
N
V
x
H
P
x
N
V
|
V
L
 
L
E
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
D
R
 
Q
R
 
K
Q
 
T
V
 
V
I
 
T
T
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
N
-
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
T
C
x
T
V
 
E
A
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
M
A
x
T
T
x
S
G
|
G
S
|
S
Y
 
W
P
 
P
F
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
K
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
I
E
 
D
G
 
S
D
 
D
S
 
R
R
 
V
L
 
K
V
 
L
Y
x
C
R
x
K
T
 
N
L
 
W
E
 
A
D
 
H
L
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
I
A
 
E
A
 
D
A
 
A
A
 
K
N
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
I
V
 
T
V
 
V
V
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
L
x
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
A
E
|
E
A
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
Y
K
 
S
S
 
T
L
 
T
G
 
G
L
 
H
E
 
D
A
 
V
H
 
T
V
 
L
V
 
I
E
x
D
F
x
A
A
x
M
P
 
A
R
 
R
L
 
V
M
 
M
P
|
P
V
x
K
Q
x
Y
L
 
F
D
 
D
E
 
A
Q
 
D
G
 
F
G
 
T
L
 
D
A
 
V
L
 
I
K
 
E
A
 
Q
Q
 
D
I
 
Y
E
 
R
R
 
D
L
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
Q
V
 
L
H
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
E
G
 
T
T
 
V
Q
 
E
S
 
S
I
 
F
S
 
T
A
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
D
Y
 
S
R
 
A
Y
 
T
R
 
G
M
 
L
N
 
T
F
 
I
A
 
K
N
 
T
D
 
D
E
 
K
-
 
N
F
 
S
L
 
Y
E
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
L
<