SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_5057 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5057 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4it1D Crystal structure of enolase pfl01_3283 (target efi-502286) from pseudomonas fluorescens pf0-1 with bound magnesium, potassium and tartrate
93% identity, 100% coverage: 1:424/424 of query aligns to 4:427/427 of 4it1D

query
sites
4it1D
L
 
M
K
 
K
I
 
I
K
 
T
R
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
D
P
 
P
P
 
P
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
H
 
H
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
I
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
S
D
 
D
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
|
S
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
F
 
F
N
 
N
L
 
L
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
R
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
A
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
H
K
 
K
T
 
P
Q
 
A
G
 
S
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
|
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
H
 
H
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
H
 
R
S
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
I
 
V
D
 
D
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
D
 
D
S
 
N
W
 
W
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
N
E
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
A
R
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
H
 
H
E
 
E
V
 
V
S
 
A
C
 
C
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
I
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
|
Y
Y
 
Y
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
H
K
 
K
R
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
|
T
N
|
N
M
|
M
V
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
Q
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
H
H
 
H
Y
 
Y
W
 
W
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
C
 
C
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
M
 
M
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
V
P
 
P
N
 
N
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
C
|
C
D
|
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
L
S
 
P
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
C
 
C
V
 
V
K
 
K
I
 
I
T
 
T
R
 
R
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
H
 
H
D
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
S
 
T
C
 
C
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
E
 
D
W
 
W
K
 
K
T
 
A
I
 
L
K
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
F

3vc6A Crystal structure of enolase tbis_1083(target efi-502310) from thermobispora bispora dsm 43833 complexed with magnesium and formate
50% identity, 99% coverage: 1:419/424 of query aligns to 2:415/420 of 3vc6A

query
sites
3vc6A
L
 
M
K
 
L
I
 
I
K
 
R
R
 
E
V
 
V
T
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
D
P
 
P
P
 
P
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
H
E
 
Q
P
 
P
F
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
T
I
 
I
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
V
S
 
T
D
 
D
N
 
E
G
 
G
Y
 
I
I
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
T
Y
 
Y
G
 
G
D
|
D
A
 
L
P
 
A
A
x
H
L
 
L
A
 
E
I
 
Q
Q
 
V
Q
 
R
Q
 
A
L
 
A
Q
 
A
S
 
A
Q
 
R
L
 
L
I
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
N
 
H
Q
 
R
L
 
I
R
 
Y
A
 
R
I
 
R
V
 
V
Q
 
A
A
 
D
T
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
A
N
 
N
K
 
I
T
 
V
Q
 
T
G
 
D
I
 
M
A
 
H
G
 
G
A
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
T
P
 
G
G
 
S
S
 
S
H
 
S
A
 
R
S
 
V
K
 
K
A
 
T
V
 
V
S
 
D
N
 
R
A
 
V
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
C
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
A
 
G
H
 
K
S
 
A
L
 
A
N
 
G
V
 
R
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
Q
 
G
H
 
H
I
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
P
Y
 
G
K
 
K
P
 
P
-
 
E
D
 
D
S
 
R
W
 
F
G
 
G
E
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
D
Q
 
G
I
 
I
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
R
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
G
A
 
E
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
R
S
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
E
H
 
Q
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
D
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
A
N
 
A
W
 
W
S
 
T
L
 
V
E
 
E
T
 
T
S
 
S
I
 
I
R
 
R
M
 
V
A
 
G
E
 
R
L
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
G
D
 
V
L
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
Y
 
L
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
R
L
 
V
H
 
A
K
 
A
R
 
E
T
 
V
G
 
P
L
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
V
 
C
V
 
V
T
 
V
D
 
T
F
 
P
D
 
E
E
 
H
F
 
L
R
 
P
R
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
E
L
 
R
N
 
R
S
 
P
V
 
I
Q
 
G
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
I
D
|
D
H
 
H
H
 
H
Y
 
Y
W
 
W
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
V
D
 
R
T
 
S
Q
 
A
A
 
H
L
 
I
A
 
A
K
 
T
M
 
L
C
 
C
D
 
A
T
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
I
G
 
E
V
 
L
S
 
S
M
 
M
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
S
H
|
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
T
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
T
P
 
P
N
 
A
L
 
I
D
 
T
Y
 
H
A
 
A
C
|
C
D
|
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
T
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
P
 
-
D
 
G
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
I
 
V
K
 
A
G
 
P
G
 
G
K
 
A
L
 
L
S
 
R
I
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
V
K
 
P
I
 
V
T
 
P
R
 
D
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
R
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
V
L
 
M
H
 
H
D
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
E
S
 
R
C
 
C
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Q
 
T
R
 
R
D
 
D
D
 
D
V
 
E
K
 
G
Q
 
Y
M
 
M
Q
 
R
R
 
S
Y
 
F
K
 
D
P
 
P
E
 
S
W
 
F
K
 
S
T
 
T

3va8A Crystal structure of enolase fg03645.1 (target efi-502278) from gibberella zeae ph-1 complexed with magnesium, formate and sulfate
50% identity, 100% coverage: 3:424/424 of query aligns to 13:427/427 of 3va8A

query
sites
3va8A
I
 
I
K
 
K
R
 
E
V
 
I
T
 
V
V
 
I
T
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
F
R
 
H
D
 
D
P
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
S
S
 
V
G
 
G
I
 
V
H
 
H
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
S
I
 
I
I
 
I
E
 
E
I
 
I
E
 
I
S
 
T
D
 
E
N
 
D
G
 
S
Y
 
Y
I
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
A
A
 
H
L
 
L
A
 
D
I
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
L
 
A
Q
 
A
S
 
D
Q
 
K
L
 
I
I
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
S
P
 
V
F
 
Y
N
 
S
L
 
T
N
 
N
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
V
I
 
I
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
R
T
 
C
V
 
V
A
 
E
A
 
S
-
 
L
-
 
R
N
 
N
K
 
D
T
 
T
Q
 
N
G
 
G
I
 
D
A
 
G
-
 
M
G
 
G
A
 
G
E
 
M
L
 
V
A
 
V
P
 
T
G
 
A
S
 
S
H
 
V
A
 
A
S
 
D
K
 
K
A
 
V
V
 
-
S
 
-
N
 
-
A
 
-
Y
 
F
S
 
S
A
 
P
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
C
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
G
H
 
K
S
 
L
L
 
A
N
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
V
V
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
S
V
 
V
P
 
Q
F
 
Y
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
K
 
K
Y
 
W
A
 
G
Q
 
G
H
 
H
I
 
P
D
 
G
S
 
D
P
 
-
Y
 
-
K
 
E
P
 
D
D
 
D
S
 
E
W
 
Y
G
 
G
E
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
P
E
 
E
Q
 
G
I
 
V
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
I
I
 
I
E
 
D
A
 
E
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
S
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
A
H
 
D
E
 
E
V
 
V
S
 
A
C
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
K
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
P
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
A
N
 
A
W
 
W
S
 
T
L
 
V
E
 
E
T
 
T
S
 
S
I
 
K
R
 
W
M
 
V
A
 
A
E
 
K
L
 
E
L
 
L
G
 
E
D
 
G
D
 
I
L
 
V
Q
 
E
Y
 
Y
Y
 
L
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
A
P
 
G
G
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
A
K
 
K
R
 
E
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
A
V
 
V
T
 
V
D
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
H
F
 
L
R
 
P
R
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
L
L
 
Q
N
 
D
S
 
A
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
D
 
K
T
 
S
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
S
M
 
I
C
 
C
D
 
A
T
 
T
F
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
R
V
 
L
S
 
S
M
 
M
H
 
H
S
 
S
N
 
N
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
T
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
S
S
 
A
V
 
T
P
 
P
N
 
N
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
C
 
C
D
 
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
W
P
 
P
W
 
W
Q
 
K
E
 
R
P
 
R
D
 
D
E
 
E
E
 
D
V
 
V
I
 
V
K
 
I
G
 
E
G
 
G
K
 
A
L
 
L
S
 
K
I
 
W
V
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
G
V
 
V
K
 
I
I
 
V
T
 
P
R
 
S
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
R
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
K
L
 
L
H
 
H
D
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
S
 
D
C
 
C
G
 
G
I
 
L
R
 
K
Q
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
V
 
T
K
 
T
Q
 
Y
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
K
 
K
P
 
P
E
 
E
W
 
F
K
 
S
T
 
E
I
 
K
K
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
W

3nfuA Crystal structure of probable glucarate dehydratase from chromohalobacter salexigens dsm 3043 complexed with magnesium
36% identity, 98% coverage: 2:418/424 of query aligns to 4:431/441 of 3nfuA

query
sites
3nfuA
K
 
K
I
 
I
K
 
T
R
 
K
V
 
M
T
 
N
V
 
V
T
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
G
H
 
H
E
 
E
P
 
P
F
 
W
A
 
F
L
 
I
R
 
R
S
 
C
I
 
V
I
 
L
E
 
V
I
 
L
E
 
E
S
 
D
D
 
E
N
 
S
G
 
G
Y
 
N
I
 
R
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
S
D
 
S
A
 
E
P
 
G
A
 
I
L
 
L
A
 
N
I
 
G
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
K
L
 
C
Q
 
R
S
 
S
Q
 
L
L
 
V
I
 
E
G
 
G
L
 
A
D
 
R
P
 
V
F
 
N
N
 
E
L
 
V
N
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
L
A
 
S
I
 
R
V
 
A
Q
 
R
A
 
G
T
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
N
 
G
K
 
G
T
 
P
Q
 
E
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
L
 
R
A
 
G
P
 
R
G
 
Q
S
 
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
V
V
 
A
S
 
V
N
 
H
A
 
V
Y
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
S
A
 
A
F
 
L
L
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
F
A
 
G
H
 
Q
S
 
A
L
 
L
N
 
G
V
 
M
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
Q
-
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
A
S
 
L
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
L
-
 
L
K
 
G
Y
 
D
A
 
P
Q
 
D
H
 
K
I
 
T
D
 
D
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
P
P
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
V
D
 
D
S
 
A
W
 
W
G
 
D
E
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
E
Q
 
A
I
 
V
V
 
A
A
 
N
Q
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
D
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
R
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
D
C
 
C
I
 
I
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
E
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
E
Y
 
A
P
 
R
L
 
L
R
 
A
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
K
L
 
L
E
 
D
T
 
E
S
 
A
I
 
V
R
 
R
M
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
P
L
 
I
G
 
K
D
 
H
D
 
L
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
|
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
K
K
 
K
R
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
K
E
 
Q
F
 
L
R
 
Q
R
 
Y
S
 
A
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
C
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
A
Q
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
G
K
 
E
M
 
L
C
 
C
D
 
N
T
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
M
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
M
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
C
P
 
P
N
 
G
L
 
E
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
 
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
G
E
 
Q
V
 
R
I
 
I
K
 
T
G
 
R
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
Q
I
 
I
V
 
R
D
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
L
K
 
T
I
 
V
T
 
P
R
 
K
A
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
D
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
G
 
M
K
 
E
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
T
Y
 
Y
L
 
K
S
 
R
C
 
L
G
 
D
I
 
V
R
 
T
Q
 
Q
R
 
R
D
 
N
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
A
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W
K
 
E

P0AES2 Glucarate dehydratase; GDH; GlucD; D-glucarate dehydratase; EC 4.2.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
35% identity, 98% coverage: 3:417/424 of query aligns to 10:435/446 of P0AES2

query
sites
P0AES2
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
A
H
 
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
I
E
 
K
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
K
A
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
D
L
 
A
Q
 
I
S
 
P
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
P
 
L
F
 
G
N
 
E
L
 
Y
N
 
K
Q
 
N
L
 
V
R
 
L
A
 
T
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
T
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
-
N
 
D
K
 
R
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
T
V
 
T
S
 
I
N
 
H
A
 
V
Y
 
V
S
 
T
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
M
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
N
K
 
R
Y
 
K
A
 
A
Q
 
T
H
 
P
I
 
L
D
 
P
S
 
Y
P
 
Q
Y
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
S
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
D
W
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
G
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
E
A
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
K
 
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
S
I
 
I
K
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
G
 
K
D
 
G
D
 
S
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
A
-
x
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
C
 
C
D
 
H
T
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
K
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
 
I
D
|
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
N
E
 
Q
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
M
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
S
 
K
C
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
G
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W

Sites not aligning to the query:

1ecqA E. Coli glucarate dehydratase bound to 4-deoxyglucarate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:417/424 of query aligns to 8:433/444 of 1ecqA

query
sites
1ecqA
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
I
E
 
K
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
K
A
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
D
L
 
A
Q
 
I
S
 
P
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
P
 
L
F
 
G
N
 
E
L
 
Y
N
 
K
Q
 
N
L
 
V
R
 
L
A
 
T
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
T
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
-
N
 
D
K
 
R
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
x
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
T
V
 
T
S
 
I
N
 
H
A
 
V
Y
 
V
S
 
T
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
M
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
N
K
 
R
Y
 
K
A
 
A
Q
 
T
H
 
P
I
 
L
D
 
P
S
 
Y
P
 
Q
Y
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
S
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
D
W
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
G
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
E
A
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
S
I
 
I
K
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
G
 
K
D
 
G
D
 
S
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
C
 
C
D
 
H
T
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
K
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
x
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
N
E
 
Q
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
M
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
S
 
K
C
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
G
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W

1ec9D E. Coli glucarate dehydratase bound to xylarohydroxamate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:417/424 of query aligns to 8:433/444 of 1ec9D

query
sites
1ec9D
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
I
E
 
K
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
K
A
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
D
L
 
A
Q
 
I
S
 
P
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
P
 
L
F
 
G
N
 
E
L
 
Y
N
 
K
Q
 
N
L
 
V
R
 
L
A
 
T
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
T
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
-
N
 
D
K
 
R
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
x
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
T
V
 
T
S
 
I
N
 
H
A
 
V
Y
 
V
S
 
T
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
M
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
N
K
 
R
Y
 
K
A
 
A
Q
 
T
H
 
P
I
 
L
D
 
P
S
 
Y
P
 
Q
Y
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
S
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
D
W
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
G
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
E
A
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
S
I
 
I
K
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
G
 
K
D
 
G
D
 
S
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
C
 
C
D
 
H
T
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
K
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
x
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
N
E
 
Q
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
M
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
S
 
K
C
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
G
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W

1ec8A E. Coli glucarate dehydratase bound to product 2,3-dihydroxy-5-oxo- hexanedioate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:417/424 of query aligns to 6:431/442 of 1ec8A

query
sites
1ec8A
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
I
E
 
K
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
K
A
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
D
L
 
A
Q
 
I
S
 
P
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
P
 
L
F
 
G
N
 
E
L
 
Y
N
 
K
Q
 
N
L
 
V
R
 
L
A
 
T
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
T
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
-
N
 
D
K
 
R
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
x
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
T
V
 
T
S
 
I
N
 
H
A
 
V
Y
 
V
S
 
T
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
M
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
N
K
 
R
Y
 
K
A
 
A
Q
 
T
H
 
P
I
 
L
D
 
P
S
 
Y
P
 
Q
Y
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
S
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
D
W
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
G
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
E
A
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
S
I
 
I
K
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
G
 
K
D
 
G
D
 
S
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
C
 
C
D
 
H
T
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
K
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
x
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
N
E
 
Q
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
M
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
S
 
K
C
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
G
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W

1jctA Glucarate dehydratase, n341l mutant orthorhombic form (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:417/424 of query aligns to 7:432/443 of 1jctA

query
sites
1jctA
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
I
E
 
K
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
I
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
K
A
 
I
L
 
R
A
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
D
L
 
A
Q
 
I
S
 
P
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
T
P
 
L
F
 
G
N
 
E
L
 
Y
N
 
K
Q
 
N
L
 
V
R
 
L
A
 
T
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
A
 
N
T
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
-
N
 
D
K
 
R
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
I
 
G
A
 
R
G
 
G
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
x
T
H
 
F
A
 
D
S
 
L
K
 
R
A
 
T
V
 
T
S
 
I
N
 
H
A
 
V
Y
 
V
S
 
T
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
E
F
 
M
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
N
K
 
R
Y
 
K
A
 
A
Q
 
T
H
 
P
I
 
L
D
 
P
S
 
Y
P
 
Q
Y
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
S
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
D
W
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
G
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
M
N
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
Y
E
 
E
A
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
N
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
A
P
 
G
E
 
E
H
 
E
E
 
E
V
 
A
S
 
E
C
 
S
I
 
I
K
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
G
 
K
D
 
G
D
 
S
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
F
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
C
 
C
D
 
H
T
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
|
S
N
x
L
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
K
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
x
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
N
E
 
Q
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
F
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
K
 
Q
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
G
 
M
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
S
 
K
C
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
G
Q
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
G
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
W

3pfrA Crystal structure of d-glucarate dehydratase related protein from actinobacillus succinogenes complexed with d-glucarate
34% identity, 99% coverage: 3:423/424 of query aligns to 5:421/426 of 3pfrA

query
sites
3pfrA
I
 
I
K
 
T
R
 
D
V
 
M
T
 
K
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
A
 
V
S
 
G
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
S
P
 
P
F
 
Y
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
L
E
 
T
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
A
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
A
T
 
T
V
 
I
A
 
E
A
 
N
N
 
A
K
 
L
T
 
T
Q
 
E
G
 
A
I
 
I
A
 
P
G
 
H
A
 
V
E
 
V
L
 
G
A
 
R
P
 
P
G
 
I
S
 
S
H
 
I
A
 
L
S
 
N
K
 
K
A
 
I
V
 
V
S
 
N
N
 
D
A
 
M
Y
 
H
S
 
N
A
 
T
F
 
F
E
 
E
V
 
L
A
 
R
F
 
V
-
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
M
A
 
G
H
 
Q
S
 
F
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
P
 
T
F
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
Y
K
 
V
Y
 
G
A
 
D
Q
 
D
H
 
K
I
 
I
-
 
T
D
 
D
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
Q
P
 
Q
D
 
P
S
 
V
W
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
W
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
K
E
 
K
A
 
A
L
 
M
N
 
D
E
 
T
E
 
Q
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
A
M
 
S
I
 
K
E
 
D
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
F
P
 
E
P
 
G
E
 
S
H
 
K
E
 
E
V
 
I
S
 
D
C
 
T
I
 
V
K
 
I
A
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
D
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
D
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
Q
M
 
L
A
 
C
E
 
K
L
 
G
L
 
L
G
 
N
D
 
D
D
 
V
L
 
L
Q
 
T
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
P
 
I
G
 
G
L
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
N
F
 
W
D
 
R
E
 
E
F
 
M
R
 
C
R
 
H
S
 
A
V
 
I
A
 
M
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
L
R
 
T
D
 
G
T
 
A
Q
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
C
 
C
D
 
N
T
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
C
H
|
H
S
|
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
N
D
 
P
Y
 
T
A
 
A
C
 
L
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
D
E
 
F
E
 
Y
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
N
K
 
P
L
 
L
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
I
K
 
K
I
 
L
T
 
N
R
 
D
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
H
 
M
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
G
 
L
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
H
L
 
K
S
 
K
C
 
L
G
 
P
I
 
N
R
 
G
Q
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
V
 
A
K
 
I
Q
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
F
Y
 
Y
K
 
Y
P
 
P
E
 
G
W
 
W
K
 
K
T
 
F
I
 
D
K
 
R
P
 
K
R
 
R

3n6hB Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing protein from actinobacillus succinogenes 130z complexed with magnesium/sulfate
35% identity, 99% coverage: 3:423/424 of query aligns to 6:425/432 of 3n6hB

query
sites
3n6hB
I
 
I
K
 
T
R
 
D
V
 
M
T
 
K
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
H
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
A
 
V
S
 
G
G
 
G
I
 
A
H
 
H
E
 
S
P
 
P
F
 
Y
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
I
I
 
V
E
 
I
I
 
L
E
 
T
S
 
D
D
 
N
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
A
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
A
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
I
 
I
Q
 
E
Q
 
N
Q
 
A
L
 
L
Q
 
T
S
 
E
Q
 
A
L
 
I
I
 
P
G
 
H
L
 
V
D
 
V
P
 
G
F
 
R
N
 
P
L
 
I
N
 
S
Q
 
I
L
 
L
R
 
N
A
 
K
I
 
I
V
 
V
Q
 
N
A
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
D
L
 
M
A
 
H
P
 
N
G
 
G
S
 
Y
H
 
W
A
 
T
S
 
F
K
 
E
A
 
L
V
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
A
Y
 
V
S
 
A
A
 
A
F
 
L
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
M
A
 
G
H
 
Q
S
 
F
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
P
 
T
F
 
V
S
 
L
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
K
 
V
Y
 
G
A
 
D
Q
 
D
H
 
K
I
 
I
-
 
T
D
 
D
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
Q
P
 
Q
D
 
P
S
 
V
W
 
T
G
 
G
E
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
W
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
K
A
 
A
L
 
M
N
 
D
E
 
T
E
 
Q
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
R
 
A
R
 
A
M
 
S
I
 
K
E
 
D
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
K
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
F
P
 
E
P
 
G
E
 
S
H
 
K
E
 
E
V
 
I
S
 
D
C
 
T
I
 
V
K
 
I
A
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
D
Y
 
A
P
 
R
L
 
I
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
D
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
Q
M
 
L
A
 
C
E
 
K
L
 
G
L
 
L
G
 
N
D
 
D
D
 
V
L
 
L
Q
 
T
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
P
 
I
G
 
G
L
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
N
F
 
W
D
 
R
E
 
E
F
 
M
R
 
C
R
 
H
S
 
A
V
 
I
A
 
M
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
L
R
 
T
D
 
G
T
 
A
Q
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
C
 
C
D
 
N
T
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
C
H
|
H
S
 
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
N
D
 
P
Y
 
T
A
 
A
C
 
L
D
 
D
T
 
T
H
 
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
D
E
 
F
E
 
Y
V
 
L
I
 
T
K
 
K
G
 
-
G
 
N
K
 
P
L
 
L
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
I
K
 
K
I
 
L
T
 
N
R
 
D
A
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
H
 
M
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
G
 
L
K
 
K
L
 
A
H
 
H
D
 
E
Q
 
L
Y
 
H
L
 
K
S
 
K
C
 
L
G
 
P
I
 
N
R
 
G
Q
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
V
 
A
K
 
I
Q
 
P
M
 
M
Q
 
Q
R
 
F
Y
 
Y
K
 
Y
P
 
P
E
 
G
W
 
W
K
 
K
T
 
F
I
 
D
K
 
R
P
 
K
R
 
R

3p0wB Crystal structure of d-glucarate dehydratase from ralstonia solanacearum complexed with mg and d-glucarate
34% identity, 100% coverage: 2:423/424 of query aligns to 4:424/428 of 3p0wB

query
sites
3p0wB
K
 
R
I
 
V
K
 
T
R
 
E
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
L
S
 
C
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
L
I
 
V
E
 
-
I
 
I
E
 
L
S
 
K
D
 
D
N
 
N
G
 
A
Y
 
-
I
 
-
G
 
G
L
 
R
G
 
T
E
 
G
S
 
V
Y
 
G
G
 
E
D
 
V
A
 
P
P
 
G
A
 
G
L
 
E
A
 
G
I
 
I
Q
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
R
Q
 
V
L
 
I
I
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
F
 
L
N
 
V
L
 
V
N
 
G
Q
 
Q
L
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
S
A
 
I
N
 
G
K
 
R
T
 
T
Q
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
S
A
 
S
E
 
I
L
 
R
A
 
R
P
 
A
G
 
L
S
 
A
H
 
E
A
 
I
S
 
N
K
 
L
A
 
R
V
 
M
S
 
D
N
 
N
A
 
V
Y
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
F
L
 
L
N
 
E
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
A
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
S
V
 
A
P
 
P
F
 
M
S
 
L
A
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
-
 
V
K
 
G
Y
 
D
A
 
R
Q
 
R
H
 
K
I
 
T
D
 
D
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
N
K
 
G
P
 
A
D
 
D
S
 
D
W
 
W
G
 
L
E
 
R
A
 
L
L
 
R
N
 
H
E
 
E
E
 
A
Q
 
A
I
 
M
V
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
A
A
 
R
Q
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
T
E
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
A
S
 
D
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
M
P
 
P
P
 
G
E
 
A
H
 
E
E
 
E
V
 
M
S
 
E
C
 
A
I
 
I
K
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
K
 
A
A
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
H
Y
 
A
P
 
R
L
 
V
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
N
T
 
E
S
 
A
I
 
I
R
 
A
M
 
L
A
 
C
E
 
K
L
 
G
L
 
Q
G
 
G
D
 
H
D
 
L
L
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
K
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
G
R
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
N
 
H
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
C
 
C
D
 
D
T
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
N
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
D
 
Q
E
 
E
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
R
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
L
S
 
R
I
 
I
V
 
Q
D
 
G
G
 
G
C
 
H
V
 
V
K
 
A
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
G
 
M
K
 
A
L
 
A
H
 
H
D
 
A
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
K
S
 
T
C
 
L
G
 
G
I
 
P
R
 
G
Q
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
M
Q
 
A
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
E
 
G
W
 
W
K
 
-
T
 
T
I
 
Y
K
 
D
P
 
P
R
 
K

3nxlC Crystal structure of glucarate dehydratase from burkholderia cepacia complexed with magnesium
34% identity, 100% coverage: 2:423/424 of query aligns to 4:420/425 of 3nxlC

query
sites
3nxlC
K
 
R
I
 
V
K
 
T
R
 
R
V
 
M
T
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
A
F
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
L
S
 
C
G
 
G
I
 
A
H
|
H
E
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
F
L
 
T
R
 
R
S
 
N
I
 
L
I
 
V
E
 
I
I
 
L
E
 
D
S
 
D
D
 
S
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
V
Y
 
P
G
 
G
D
 
G
A
 
E
P
 
G
A
 
I
L
 
R
A
 
H
I
 
A
Q
 
L
Q
 
E
Q
 
R
L
 
M
Q
 
T
S
 
D
Q
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
Q
L
 
S
R
 
I
A
 
G
I
 
R
V
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
N
A
 
A
N
 
V
K
 
R
T
 
A
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
A
 
A
S
 
L
K
 
S
A
 
R
V
 
L
S
 
D
N
 
N
A
 
V
Y
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
L
A
 
G
H
 
Q
S
 
H
L
 
L
N
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
A
D
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
E
G
 
G
A
 
Q
I
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
M
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
K
 
I
Y
 
G
A
 
D
Q
 
R
-
 
G
H
 
R
I
 
T
D
 
D
S
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
R
P
 
D
D
 
E
S
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
P
W
 
W
G
 
F
E
 
R
A
 
L
L
 
R
N
 
N
E
 
E
E
 
E
Q
 
A
I
 
L
V
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
K
 
A
S
 
D
I
 
F
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
M
P
 
A
P
 
G
E
 
A
H
 
D
E
 
E
V
 
M
S
 
E
C
 
A
I
 
I
K
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
K
 
A
A
 
C
F
 
F
P
 
P
G
 
D
Y
 
A
P
 
R
L
 
A
R
 
T
I
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
D
T
 
E
S
 
A
I
 
V
R
 
A
M
 
L
A
 
C
E
 
R
L
 
G
L
 
Q
G
 
G
D
 
H
D
 
L
L
 
L
Q
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
T
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
P
 
S
G
 
G
L
 
R
D
 
E
G
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
F
H
 
R
K
 
R
R
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
V
 
I
V
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
W
D
 
R
E
 
Q
F
 
M
R
 
D
R
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
R
L
 
L
N
 
Q
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
V
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
H
 
P
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
G
 
-
G
 
T
L
 
M
R
 
Q
D
 
G
T
 
S
Q
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
C
 
C
D
 
R
T
 
D
F
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
T
V
 
W
S
 
G
M
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
S
 
N
H
 
H
L
 
F
G
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
A
A
 
M
M
 
F
A
 
T
H
 
H
V
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
G
L
 
T
D
 
I
Y
 
T
A
 
A
C
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
Y
 
W
P
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
P
 
G
D
 
D
E
 
A
E
 
R
V
 
L
I
 
T
K
 
R
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
L
S
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
G
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
K
 
A
I
 
V
T
 
P
R
 
E
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
M
D
 
A
Q
 
Q
L
 
V
G
 
E
K
 
A
L
 
A
H
 
H
D
 
A
Q
 
L
Y
 
Y
L
 
K
S
 
E
C
 
V
G
 
G
I
 
G
R
 
T
Q
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
V
 
A
K
 
V
Q
 
A
M
 
M
Q
 
R
R
 
Y
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
E
 
G
W
 
W
K
 
-
T
 
T
I
 
Y
K
 
D
P
 
P
R
 
K

2qq6B Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme- like protein from rubrobacter xylanophilus dsm 9941
32% identity, 81% coverage: 44:387/424 of query aligns to 31:381/396 of 2qq6B

query
sites
2qq6B
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
C
Y
 
Y
G
x
P
D
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
A
A
 
G
I
 
I
Q
 
H
Q
 
H
-
 
I
-
 
V
-
 
M
Q
 
N
L
 
M
Q
 
E
S
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
E
D
 
D
P
 
P
F
 
R
N
 
D
L
 
V
N
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
Y
A
 
E
I
 
K
V
 
M
Q
 
R
A
 
R
T
 
W
V
 
N
A
 
I
A
 
F
N
 
-
K
 
-
T
 
T
Q
 
G
G
|
G
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
I
N
 
T
A
 
A
Y
 
L
S
 
S
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
T
A
 
A
F
 
L
L
 
W
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
A
 
G
H
 
K
S
 
L
L
 
Q
N
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
Y
D
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
F
R
 
R
D
 
R
E
 
R
V
 
V
P
 
R
F
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
x
D
-
 
C
S
 
N
A
 
A
Y
 
G
L
 
T
F
 
V
F
 
D
K
 
A
Y
 
A
A
 
A
Q
 
H
H
 
H
I
 
I
D
 
E
S
 
G
P
 
G
Y
 
L
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
F
G
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
S
N
 
N
E
 
E
E
 
E
Q
 
Y
I
 
I
V
 
-
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
M
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
-
Y
 
R
G
 
G
F
 
F
K
 
D
S
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
L
K
x
D
A
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
D
-
 
F
-
 
W
-
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
I
P
 
S
P
 
P
-
 
R
E
 
E
H
 
H
E
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
S
 
A
C
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
A
L
 
V
K
 
R
K
 
E
A
 
A
F
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
E
Y
 
V
P
 
E
L
 
V
R
 
A
I
 
I
D
|
D
P
 
M
N
x
H
G
 
G
N
 
R
W
 
F
S
 
D
L
 
I
E
 
P
T
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
M
G
 
E
D
 
P
-
 
F
D
 
G
L
 
L
Q
 
L
Y
 
W
Y
 
L
E
|
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
P
 
P
-
 
P
-
 
E
G
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
V
H
 
R
K
 
R
R
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
T
P
 
P
L
 
I
-
 
C
A
 
A
T
x
G
N
x
E
M
 
N
V
 
V
V
 
Y
T
 
T
D
 
R
F
 
F
D
 
D
E
 
-
F
 
F
R
 
R
R
 
E
S
 
L
V
 
F
A
 
A
L
 
K
N
 
R
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
I
 
Y
V
 
V
L
x
M
A
 
P
D
|
D
H
 
V
H
 
A
Y
 
K
W
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
A
D
 
E
T
 
A
Q
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
N
M
 
L
C
 
A
D
 
E
T
 
L
F
 
D
G
 
Y
L
 
I
G
 
P
V
 
F
S
 
A
M
 
P
H
|
H
S
x
N
-
 
V
N
 
S
S
 
S
H
 
P
L
 
V
G
 
G
I
 
T
S
 
V
L
 
A
M
 
A
A
 
A
M
 
H
A
 
V
H
 
C
V
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
S
V
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
N
Y
 
F
A
 
A
C
 
V
D
 
L
T
x
E
H
 
W
Y
 
H
P
 
A
W
 
I
Q
x
D
E
 
M
P
 
P
D
 
H
E
 
W
E
 
E
-
 
D
-
 
F
V
 
V
I
 
R
K
 
Y
G
 
P
G
 
G
K
 
G
L
 
P
S
 
V
I
 
I
V
 
R
D
 
E
G
 
G
C
 
H
V
 
I
K
 
E
I
 
L
T
 
T
R
 
E
A
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
D
 
D
H
 
E
D
 
E

3i4kA Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from corynebacterium glutamicum
27% identity, 66% coverage: 110:389/424 of query aligns to 102:365/370 of 3i4kA

query
sites
3i4kA
A
 
A
Y
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
M
L
 
H
D
 
D
L
 
A
Q
 
W
A
 
A
H
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
R
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
K
V
 
V
P
 
D
F
 
V
S
 
T
A
 
W
Y
x
A
L
 
L
F
 
G
F
 
V
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
N
 
P
E
 
L
E
 
D
Q
 
V
I
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
R
 
E
R
 
E
M
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
F
G
 
G
F
 
N
K
 
R
S
 
S
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
G
P
 
D
P
 
P
E
 
A
H
 
E
E
 
D
V
 
T
S
 
R
C
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
E
L
 
L
K
 
A
K
 
R
A
 
E
F
 
V
P
 
G
G
 
D
-
 
R
Y
 
V
P
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
I
D
|
D
P
 
I
N
|
N
G
 
A
N
 
R
W
 
W
S
 
D
L
 
R
E
 
R
T
 
T
S
 
A
I
 
L
R
 
H
M
 
Y
A
 
L
E
 
P
L
 
I
L
 
L
G
 
A
D
 
E
-
 
A
D
 
G
L
 
V
Q
 
E
Y
 
L
Y
 
F
E
|
E
D
 
Q
P
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
A
-
 
D
-
 
D
L
 
L
D
 
E
G
 
T
M
 
L
A
 
R
E
 
E
L
 
I
H
 
T
K
 
R
R
 
R
T
 
T
G
 
N
L
 
V
P
 
S
L
 
V
A
 
M
T
 
A
N
x
D
M
x
E
V
x
S
V
 
V
T
 
W
D
 
T
F
 
P
D
 
A
E
 
E
F
 
A
R
 
L
R
 
A
S
 
V
V
 
V
A
 
K
L
 
A
N
 
Q
S
 
A
V
 
A
Q
 
D
I
 
V
V
 
I
L
x
A
A
 
L
D
x
K
H
x
T
H
 
T
Y
 
K
W
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
L
D
 
E
T
 
S
Q
 
K
A
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
A
M
 
I
C
 
A
D
 
E
T
 
A
F
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
C
S
 
H
M
 
G
H
x
A
S
x
T
N
x
S
S
 
L
H
 
E
L
 
G
G
 
P
I
 
I
S
 
G
L
 
T
M
 
A
A
 
A
M
 
S
A
 
L
H
 
Q
V
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
T
P
 
K
N
 
A
L
 
I
D
 
S
Y
 
Y
A
 
G
C
x
T
D
x
E
T
x
L
H
 
F
Y
 
G
P
 
P
W
 
Q
Q
 
L
E
 
L
P
 
K
D
 
D
E
 
T
E
 
Y
V
 
I
I
 
V
K
 
Q
G
 
-
G
 
-
K
 
E
L
 
F
S
 
E
I
 
Y
V
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
K
 
A
I
 
I
T
 
P
R
 
Q
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
D
L
 
V
D
 
D
H
 
M
D
 
D
Q
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1nu5A Crystal structure of pseudomonas sp. P51 chloromuconate lactonizing enzyme (see paper)
25% identity, 81% coverage: 46:389/424 of query aligns to 56:363/369 of 1nu5A

query
sites
1nu5A
G
 
G
E
 
S
S
 
E
Y
 
S
G
 
A
D
 
E
A
 
T
P
 
I
A
 
K
L
 
V
A
 
I
I
 
I
Q
 
D
Q
 
N
Q
 
Y
L
 
L
Q
 
A
S
 
P
Q
 
L
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
K
D
 
D
P
 
A
F
 
S
N
 
N
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
L
 
A
R
 
R
A
 
V
I
 
L
V
 
M
Q
 
D
A
 
R
T
 
A
V
 
V
A
 
T
A
 
G
N
 
N
K
 
L
T
 
S
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
A
 
A
Y
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
L
L
 
H
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
H
 
R
S
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
L
P
 
S
L
 
I
V
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
M
R
 
R
D
 
T
E
 
S
V
 
I
P
 
P
F
 
I
S
 
A
A
 
W
Y
x
T
L
 
L
F
 
A
F
 
S
-
 
G
K
 
D
Y
 
T
A
 
A
Q
 
R
H
 
D
I
 
I
D
 
D
S
 
S
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
L
R
 
E
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
T
Y
 
R
G
 
R
F
 
H
K
 
N
S
 
R
I
 
F
K
|
K
L
 
V
K
|
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
T
P
 
P
E
 
A
H
 
Q
E
 
D
V
 
L
S
x
E
C
 
H
I
 
I
K
 
R
A
 
S
L
 
I
K
 
V
K
 
K
A
 
A
F
 
V
P
 
G
G
 
D
Y
 
R
-
 
A
P
 
S
L
 
V
R
 
R
I
 
V
D
|
D
P
 
V
N
|
N
G
 
Q
N
 
G
W
 
W
S
 
D
L
 
E
E
 
Q
T
 
T
-
 
A
S
 
S
I
 
I
R
 
W
M
 
I
A
 
P
E
 
R
L
 
L
L
 
E
G
 
E
D
 
A
D
 
G
L
 
V
Q
 
E
Y
 
L
Y
 
V
E
|
E
D
 
Q
P
 
P
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
A
G
 
N
L
 
F
D
 
G
G
 
A
M
 
L
A
 
R
E
 
R
L
 
L
H
x
T
K
 
E
R
 
Q
T
x
N
G
 
G
L
 
V
P
 
A
L
 
I
A
 
L
T
 
A
N
x
D
M
x
E
V
x
S
V
 
L
T
 
S
D
 
S
F
 
L
D
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
F
E
 
E
F
 
L
R
 
A
R
 
R
S
 
D
V
 
H
A
 
A
L
 
V
N
 
D
S
 
A
V
 
F
Q
 
S
I
 
L
V
x
K
L
 
L
A
 
C
D
 
N
H
 
M
H
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
A
D
 
N
T
 
T
Q
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
K
 
A
M
 
V
C
 
A
D
 
E
T
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
S
V
 
S
S
 
Y
M
 
G
H
x
G
S
x
T
N
x
M
S
 
L
H
 
D
L
 
S
G
 
T
I
 
V
S
 
G
L
 
T
M
 
A
A
 
A
M
 
A
A
 
L
H
 
H
V
 
V
A
 
Y
A
 
A
S
 
T
V
 
L
P
 
P
N
 
S
L
 
L
D
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
|
C
D
x
E
T
x
L
H
 
I
Y
 
G
P
 
P
W
 
W
Q
 
V
E
 
L
P
 
G
D
 
D
E
 
R
E
 
-
V
 
-
I
 
L
K
 
T
G
 
Q
G
 
Q
K
 
D
L
 
L
S
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
D
G
 
F
C
 
E
V
 
V
K
 
H
I
 
L
T
 
P
R
 
L
A
 
G
P
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
Q
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3ck5A Crystal structure of a racemase from streptomyces coelicolor a3(2) with bound magnesium
27% identity, 85% coverage: 34:392/424 of query aligns to 34:355/357 of 3ck5A

query
sites
3ck5A
I
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
D
D
 
S
N
 
D
G
 
G
Y
 
A
I
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
-
x
T
-
 
V
-
 
N
-
 
H
-
 
G
G
 
G
D
 
A
A
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
T
A
 
M
I
 
V
Q
 
D
Q
 
K
Q
 
D
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
Q
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
D
P
 
A
F
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
E
Q
 
Q
L
 
I
R
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
W
Q
 
Q
A
 
S
T
 
M
V
 
W
A
 
W
A
 
R
N
 
L
K
 
H
T
 
Y
Q
 
A
G
 
G
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
R
G
 
G
S
 
G
H
 
H
A
 
A
S
 
T
K
 
S
A
 
A
V
 
I
S
 
S
N
 
-
A
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
F
 
V
E
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
L
L
 
W
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
A
 
G
H
 
I
S
 
R
L
 
A
N
 
R
V
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
W
D
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
Y
R
 
D
D
 
P
E
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
V
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
Y
 
Y
A
 
A
Q
x
G
H
 
G
I
 
I
D
 
D
S
 
L
P
 
E
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
N
 
P
E
 
V
E
 
A
Q
 
D
I
 
L
V
 
K
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
R
 
D
R
 
R
M
 
F
I
 
L
E
 
-
A
 
A
Y
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
R
S
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
M
K
|
K
A
 
V
G
 
G
A
 
R
L
 
P
P
 
D
P
 
L
E
 
K
H
 
E
E
 
D
V
 
V
S
 
D
C
 
R
I
 
V
K
 
S
A
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
E
A
 
H
F
 
L
-
 
G
P
 
D
G
 
S
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
R
 
M
I
 
V
D
|
D
P
 
A
N
|
N
G
 
M
N
 
K
W
 
W
S
 
T
L
 
V
E
 
D
T
 
G
S
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
A
A
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
P
-
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
H
Y
 
W
Y
x
I
E
|
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
-
 
I
-
 
P
P
 
D
G
 
D
L
 
L
D
 
V
G
 
G
M
 
N
A
 
A
E
 
R
L
 
I
H
 
V
K
 
R
R
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
H
P
 
T
L
x
I
A
 
A
T
 
G
N
x
G
M
x
E
V
 
N
V
 
L
T
 
H
D
 
T
F
 
L
D
 
Y
E
 
D
F
 
F
R
 
H
R
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
R
L
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
L
Q
 
T
I
 
L
V
 
P
L
x
E
A
 
P
D
|
D
H
 
V
H
 
S
Y
 
N
W
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
R
 
T
D
 
T
T
 
F
Q
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
A
K
 
A
M
 
L
C
 
A
D
 
E
T
 
A
F
 
N
G
 
N
L
 
M
G
 
L
V
 
L
S
 
T
M
 
S
H
|
H
S
x
G
N
x
V
S
 
H
H
 
D
L
 
L
G
 
T
I
 
V
S
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
H
V
 
A
A
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
H
L
 
R
D
 
T
Y
|
Y
A
 
M
-
x
E
C
 
A
D
 
H
T
 
L
H
 
H
Y
 
A
P
 
Y
W
 
M
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
M
S
 
A
I
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
G
C
 
C
V
 
V
K
 
S
I
 
A
T
 
P
R
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
F
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9RKF7 3,6-anhydro-alpha-L-galactonate cycloisomerase; AHGA cycloisomerase; EC 5.5.1.25 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145)
27% identity, 85% coverage: 34:392/424 of query aligns to 34:358/361 of Q9RKF7

query
sites
Q9RKF7
I
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
E
S
 
D
D
 
S
N
 
D
G
 
G
Y
 
A
I
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
H
-
 
G
G
 
G
D
 
A
A
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
T
A
 
M
I
 
V
Q
 
D
Q
 
K
Q
 
D
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
Q
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
A
D
 
D
P
 
A
F
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
E
Q
 
Q
L
 
I
R
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
W
Q
 
Q
A
 
S
T
 
M
V
 
W
A
 
W
A
 
R
N
 
L
K
 
H
T
 
Y
Q
 
A
G
 
G
I
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
R
G
 
G
S
 
G
H
 
H
A
 
A
S
 
T
K
 
S
A
 
A
V
 
I
S
 
S
N
 
-
A
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
F
 
V
E
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
L
L
 
W
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
A
 
G
H
 
I
S
 
R
L
 
A
N
 
R
V
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
W
D
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
Y
R
 
D
D
 
P
E
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
V
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
G
H
 
G
I
 
I
D
 
D
S
 
L
P
 
E
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
N
 
P
E
 
V
E
 
A
Q
 
D
I
 
L
V
 
K
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
R
 
D
R
 
R
M
 
F
I
 
L
E
 
-
A
 
A
Y
 
G
G
 
G
F
 
F
K
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
M
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
R
L
 
P
P
 
D
P
 
L
E
 
K
H
 
E
E
 
D
V
 
V
S
 
D
C
 
R
I
 
V
K
 
S
A
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
E
A
 
H
F
 
L
-
 
G
P
 
D
G
 
S
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
R
 
M
I
 
V
D
|
D
P
 
A
N
 
N
G
 
M
N
 
K
W
 
W
S
 
T
L
 
V
E
 
D
T
 
G
S
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
A
A
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
P
-
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
H
Y
 
W
Y
 
I
E
|
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
-
 
I
-
 
P
P
 
D
G
 
D
L
 
L
D
 
V
G
 
G
M
 
N
A
 
A
E
 
R
L
 
I
H
 
V
K
 
R
R
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
H
P
 
T
L
 
I
A
 
A
T
 
G
N
 
G
M
x
E
V
 
N
V
 
L
T
 
H
D
 
T
F
 
L
D
 
Y
E
 
D
F
 
F
R
 
H
R
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
R
L
 
A
N
 
G
S
 
S
V
 
L
Q
 
T
I
 
L
V
 
P
L
 
E
A
 
P
D
 
D
H
 
V
H
 
S
Y
 
N
W
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
R
 
T
D
 
T
T
 
F
Q
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
A
K
 
A
M
 
L
C
 
A
D
 
E
T
 
A
F
 
N
G
 
N
L
 
M
G
 
L
V
 
L
S
 
T
M
 
S
H
 
H
S
 
G
N
 
V
S
 
H
H
 
D
L
 
L
G
 
T
I
 
V
S
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
H
V
 
A
A
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
H
L
 
R
D
 
T
Y
 
Y
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
H
A
 
G
C
 
F
D
 
G
T
 
L
H
 
H
Y
 
A
P
 
Y
W
 
M
Q
 
A
E
 
E
P
 
P
D
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
M
S
 
A
I
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
G
C
 
C
V
 
V
K
 
S
I
 
A
T
 
P
R
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
F
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
L

1f9cA Crystal structure of mle d178n variant (see paper)
25% identity, 68% coverage: 104:392/424 of query aligns to 86:358/360 of 1f9cA

query
sites
1f9cA
S
 
A
K
 
K
A
 
G
V
 
N
S
 
T
N
 
F
A
 
A
Y
 
K
S
 
S
A
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
S
A
 
A
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
A
Q
 
Q
A
 
G
H
 
K
S
 
R
L
 
L
N
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
S
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
I
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
S
V
 
L
P
 
E
F
 
V
S
 
A
A
 
W
Y
x
T
L
 
L
F
 
-
F
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
S
 
A
W
 
S
G
 
G
E
 
D
A
 
T
L
 
A
N
 
R
E
 
D
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
H
M
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
I
Y
 
R
G
 
R
F
 
H
K
 
R
S
 
V
I
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
A
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
N
P
 
P
P
 
V
E
 
E
H
 
Q
E
 
N
V
 
L
S
 
K
C
 
H
I
 
V
K
 
V
A
 
T
L
 
I
K
 
K
K
 
R
A
 
E
F
 
L
-
 
G
P
 
D
G
 
S
Y
 
A
P
 
S
L
 
V
R
 
R
I
 
V
D
|
D
P
 
V
N
|
N
G
 
Q
N
 
Y
W
 
W
S
 
D
L
 
E
E
 
S
T
 
Q
S
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
A
A
 
C
E
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
N
-
 
G
L
 
I
Q
 
D
Y
 
L
Y
 
I
E
|
E
D
 
Q
P
 
P
T
 
I
P
 
S
G
 
R
L
 
I
D
 
N
-
 
R
-
 
G
G
 
G
M
 
Q
A
 
V
E
 
R
L
 
L
H
 
N
K
 
Q
R
 
R
T
 
T
G
 
P
L
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
M
T
 
A
N
x
D
M
x
E
V
x
S
V
 
I
T
 
E
D
 
S
F
 
V
D
 
E
E
 
D
F
 
A
R
 
F
R
 
S
S
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
D
N
 
G
S
 
A
V
 
A
Q
 
S
I
 
I
V
 
F
L
 
A
A
 
L
D
x
K
H
 
I
H
 
A
Y
 
K
W
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
P
R
 
R
D
 
A
T
 
V
Q
 
L
A
 
R
L
 
T
A
 
A
K
 
Q
M
 
I
C
 
A
D
 
E
T
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
L
S
 
Y
M
 
G
H
x
G
S
x
T
N
x
M
S
 
L
H
 
E
L
 
G
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
T
M
 
L
A
 
A
M
 
S
A
 
A
H
 
H
V
 
A
A
 
F
A
 
L
S
 
T
V
 
L
P
 
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
T
Y
 
W
A
 
G
C
x
T
D
x
E
T
x
L
H
 
F
Y
 
G
P
 
P
W
 
L
Q
 
L
E
 
L
P
 
T
D
 
E
E
 
E
E
 
I
V
 
V
I
 
N
K
 
E
G
 
P
G
 
P
K
 
Q
L
 
Y
S
 
R
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
F
C
 
Q
V
 
L
K
 
H
I
 
I
T
 
P
R
 
R
A
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
E
D
 
A
Q
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
R
L
 
F

Sites not aligning to the query:

Q9RYA6 N-succinylamino acid racemase; NSAAR; NSAR; N-acylamino acid racemase; NAAAR; o-succinylbenzoate synthase; OSB synthase; OSBS; EC 5.1.1.-; EC 5.1.1.-; EC 4.2.1.113 from Deinococcus radiodurans (strain ATCC 13939 / DSM 20539 / JCM 16871 / CCUG 27074 / LMG 4051 / NBRC 15346 / NCIMB 9279 / VKM B-1422 / R1) (see 2 papers)
27% identity, 67% coverage: 110:394/424 of query aligns to 106:368/375 of Q9RYA6

query
sites
Q9RYA6
A
 
A
Y
 
R
S
 
A
A
 
M
F
 
V
E
 
E
V
 
M
A
 
A
F
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
L
Q
 
W
A
 
A
H
x
R
S
 
T
L
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
x
G
D
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
H
I
 
K
D
 
E
S
 
Q
P
 
V
Y
 
E
K
 
V
P
 
G
D
 
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
Q
L
 
A
N
 
G
E
|
E
E
 
Q
Q
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
D
Q
 
L
A
 
V
R
 
R
R
 
K
M
 
H
I
 
V
E
 
E
A
 
-
Y
 
Q
G
|
G
F
 
Y
K
 
R
S
 
R
I
 
I
K
|
K
L
|
L
K
|
K
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
I
P
 
K
P
 
P
E
 
G
H
 
W
E
 
D
V
 
V
S
 
Q
C
 
P
I
 
V
K
 
R
A
|
A
L
 
T
K
 
R
K
 
E
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
D
Y
 
I
P
 
R
L
 
L
R
 
T
I
 
V
D
|
D
P
 
A
N
 
N
G
 
S
N
 
A
W
 
Y
S
 
T
L
 
L
E
 
A
T
 
D
S
 
A
I
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
L
 
D
G
 
E
D
 
Y
D
 
D
L
 
L
Q
 
T
Y
|
Y
Y
 
I
E
|
E
D
 
Q
P
 
P
T
 
L
P
 
A
G
 
W
L
 
D
D
 
D
G
 
L
M
 
V
-
 
D
-
 
H
A
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
A
K
 
R
R
 
R
T
 
I
G
 
R
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
C
T
 
L
N
x
D
M
 
E
V
 
S
V
 
V
T
 
A
D
 
S
F
 
A
D
 
A
E
 
D
F
 
A
R
 
R
R
 
K
S
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
G
S
 
A
V
 
G
Q
 
G
I
x
V
V
 
I
L
 
N
A
 
L
D
x
K
H
 
V
H
 
A
Y
 
R
W
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
H
R
 
A
D
 
E
T
 
S
Q
 
R
A
 
R
L
 
V
A
 
H
K
 
D
M
 
V
C
 
A
D
 
Q
T
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
A
G
 
P
V
 
V
S
 
W
M
 
C
H
 
G
S
 
G
N
 
M
S
x
L
H
 
E
L
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
G
L
 
R
M
 
A
A
 
H
M
 
N
A
 
I
H
 
H
V
 
L
A
 
-
A
 
S
S
x
T
V
 
L
P
 
P
N
 
N
L
 
F
D
 
R
Y
 
L
A
 
P
C
 
G
D
 
D
T
 
T
H
 
S
Y
 
S
P
 
A
W
 
S
Q
 
R
E
 
Y
P
 
W
D
 
E
E
 
R
E
 
D
V
 
L
I
 
I
K
 
Q
G
 
-
G
 
E
K
 
P
L
 
L
S
 
E
I
 
A
V
 
V
D
|
D
G
 
G
C
 
L
V
 
M
K
 
P
I
 
V
T
 
P
R
 
Q
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
T
G
 
G
L
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
R
D
 
E
Q
 
F
L
 
L
G
 
A
K
 
T
L
 
V
H
 
T
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_5057 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5057
LKIKRVTVTPIAFRDPPLLNASGIHEPFALRSIIEIESDNGYIGLGESYGDAPALAIQQQ
LQSQLIGLDPFNLNQLRAIVQATVAANKTQGIAGAELAPGSHASKAVSNAYSAFEVAFLD
LQAHSLNVPLVDLLGGAIRDEVPFSAYLFFKYAQHIDSPYKPDSWGEALNEEQIVAQARR
MIEAYGFKSIKLKAGALPPEHEVSCIKALKKAFPGYPLRIDPNGNWSLETSIRMAELLGD
DLQYYEDPTPGLDGMAELHKRTGLPLATNMVVTDFDEFRRSVALNSVQIVLADHHYWGGL
RDTQALAKMCDTFGLGVSMHSNSHLGISLMAMAHVAASVPNLDYACDTHYPWQEPDEEVI
KGGKLSIVDGCVKITRAPGLGLELDHDQLGKLHDQYLSCGIRQRDDVKQMQRYKPEWKTI
KPRF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory