SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_512 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
80% identity, 98% coverage: 5:253/253 of query aligns to 3:251/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
F
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
D
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
E
L
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
I
R
 
R
C
|
C
N
x
D
V
|
V
T
 
T
V
 
R
E
 
D
S
 
A
E
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
A
L
 
L
M
 
V
D
 
E
E
 
G
V
 
C
V
 
A
N
 
A
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
D
G
 
G
T
 
N
I
 
E
D
 
A
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
M
 
M
G
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
W
 
W
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
K
Y
 
H
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
K
M
 
M
S
 
S
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
A
|
A
V
|
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
P
 
P
K
 
R
K
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
A
N
 
A
A
 
A
M
 
M
H
 
H
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
G
 
N
A
 
A
A
 
G
F
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
H
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
A
F
 
I

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
43% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 3:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
F
 
L
S
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
H
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
S
D
|
D
L
x
I
D
 
N
A
 
E
A
 
D
G
 
H
G
 
G
E
 
N
G
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
E
L
 
D
I
 
I
R
 
K
T
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
S
F
 
F
V
 
V
R
 
K
C
x
A
N
x
D
V
x
T
T
 
S
V
 
N
E
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
E
N
 
A
L
 
L
M
 
V
D
 
K
E
 
R
V
 
T
V
 
V
N
 
E
T
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
I
 
G
E
 
E
K
 
Q
G
 
A
K
 
L
L
 
A
A
 
G
E
 
D
G
 
Y
T
 
G
I
 
L
D
 
D
E
 
S
F
 
W
D
 
R
A
 
K
I
 
V
M
 
L
G
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
Y
C
 
G
M
 
C
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
P
 
E
L
 
Q
L
 
M
L
 
E
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
H
G
 
G
L
 
I
G
 
V
A
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
L
M
 
S
S
 
S
I
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
A
 
I
A
 
G
I
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
Q
K
 
K
K
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
G
P
|
P
A
|
A
V
x
Y
I
|
I
D
 
E
T
 
T
D
 
P
M
x
L
F
 
L
R
 
E
R
 
S
A
 
L
Y
 
T
E
 
K
A
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
E
K
 
M
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
L
N
 
I
A
 
S
M
 
K
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
E
G
 
K
A
 
S
A
 
S
F
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
G
S
 
Y
L
 
Y
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
T
A
 
A

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 1:247/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
M
 
M
T
 
L
F
 
L
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
L
x
I
D
 
S
A
 
D
A
 
E
G
 
W
G
 
G
E
 
R
G
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
E
T
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
Q
R
 
H
C
 
A
N
x
D
V
x
T
T
 
A
V
 
H
E
 
P
S
 
E
E
 
D
V
 
H
K
 
D
N
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
R
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
E
 
S
I
x
G
E
 
E
K
 
F
G
 
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
E
 
E
G
 
T
T
 
T
I
 
D
D
 
A
E
 
Q
F
 
W
D
 
Q
A
x
R
I
 
V
M
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
Y
C
 
G
M
 
V
K
 
R
Y
 
A
Q
 
Q
L
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
G
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
M
x
I
S
 
T
I
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
S
K
 
K
K
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
A
|
A
V
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
D
 
T
M
 
L
F
 
V
R
 
Q
R
 
N
A
 
V
Y
 
P
E
 
L
A
 
E
D
 
T
P
 
R
K
 
R
K
 
Q
G
 
L
E
 
E
F
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
Q
M
 
M
H
 
H
P
 
A
V
x
L
G
x
R
R
|
R
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
N
A
 
L
V
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
C
 
S
S
|
S
D
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
S
S
 
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
L
A
 
A

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 1:247/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
M
 
M
T
 
L
F
 
L
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
L
x
I
D
 
S
A
 
D
A
 
E
G
x
W
G
 
G
E
 
R
G
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
E
T
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
Q
R
 
H
C
 
A
N
x
D
V
x
T
T
 
A
V
 
H
E
 
P
S
 
E
E
 
D
V
 
H
K
 
D
N
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
R
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
E
x
S
I
x
G
E
|
E
K
 
F
G
x
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
E
|
E
G
 
T
T
|
T
I
 
D
D
 
A
E
x
Q
F
 
W
D
 
Q
A
x
R
I
 
V
M
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
Y
C
 
G
M
 
V
K
 
R
Y
 
A
Q
 
Q
L
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
G
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
M
x
I
S
 
T
I
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
x
S
K
 
K
K
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
A
 
A
V
 
F
I
|
I
D
 
N
T
|
T
D
 
T
M
 
L
F
 
V
R
 
Q
R
 
N
A
 
V
Y
 
P
E
 
L
A
 
E
D
 
T
P
 
R
K
 
R
K
 
Q
G
 
L
E
 
E
F
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
Q
M
 
M
H
 
H
P
 
A
V
 
L
G
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
N
A
 
L
V
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
H
x
S
S
x
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
L
A
 
A

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 1:247/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
M
 
M
T
 
L
F
 
L
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
I
D
 
S
A
 
D
A
 
E
G
 
W
G
 
G
E
 
R
G
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
E
T
 
G
A
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
T
 
V
F
 
F
V
 
Q
R
 
H
C
 
A
N
 
D
V
 
T
T
 
A
V
 
H
E
 
P
S
 
E
E
 
D
V
 
H
K
 
D
N
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
R
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
F
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
E
 
S
I
 
G
E
 
E
K
 
F
G
 
T
K
 
P
L
 
T
A
 
A
E
 
E
G
 
T
T
 
T
I
 
D
D
 
A
E
 
Q
F
 
W
D
 
Q
A
 
R
I
 
V
M
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
Y
C
 
G
M
 
V
K
 
R
Y
 
A
Q
 
Q
L
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
G
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
M
x
I
S
 
T
I
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
S
K
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
G
P
|
P
A
|
A
V
 
F
I
 
I
D
 
N
T
 
T
D
 
T
M
 
L
F
 
V
R
 
Q
R
 
N
A
 
V
Y
 
P
E
 
L
A
 
E
D
 
T
P
 
R
K
 
R
K
 
Q
G
 
L
E
 
E
F
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
Q
M
 
M
H
 
H
P
 
A
V
 
L
G
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
N
A
 
L
V
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
S
S
 
Y
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
L
A
 
A

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:252/253 of query aligns to 1:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
S
 
I
M
 
M
T
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
M
I
 
V
R
 
R
T
 
K
A
 
E
G
 
N
G
 
N
E
 
D
A
 
R
T
 
L
-
 
H
F
 
F
V
 
V
R
 
Q
C
x
T
N
 
D
V
x
I
T
 
T
V
 
D
E
 
E
S
 
A
E
 
A
V
 
C
K
 
Q
N
 
H
L
 
A
M
 
V
D
 
E
E
 
S
V
 
A
V
 
V
N
 
H
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
E
 
E
I
 
I
E
 
-
K
 
V
G
 
A
K
 
P
L
 
I
A
 
H
E
 
E
G
 
M
T
 
E
I
 
L
D
 
S
E
 
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
I
 
V
M
 
L
G
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
W
 
F
L
 
L
C
 
M
M
 
S
K
 
K
Y
 
H
Q
 
A
L
 
L
P
 
K
L
 
H
L
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
C
S
|
S
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
W
P
 
P
K
 
D
M
 
I
S
 
P
I
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
H
K
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
A
x
G
V
x
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
D
 
P
M
 
L
F
 
N
R
 
E
R
 
K
A
 
S
Y
 
F
E
 
L
A
 
E
D
 
N
P
 
N
K
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
K
 
K
G
 
K
E
 
E
F
 
K
A
 
A
N
 
K
A
 
-
M
 
V
H
 
N
P
 
P
V
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
S
S
 
A
L
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
T
A
 
A

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
37% identity, 100% coverage: 1:252/253 of query aligns to 4:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
M
 
L
S
 
T
M
 
Q
T
 
R
F
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
D
|
D
L
x
I
D
 
D
A
 
P
A
 
T
G
 
T
G
 
G
E
 
K
G
 
A
T
 
A
V
 
A
A
 
D
L
 
E
I
 
L
R
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
G
T
 
L
F
 
F
V
 
V
R
 
P
C
x
V
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
E
E
 
Q
S
 
E
E
 
A
V
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
T
V
 
A
V
 
A
N
 
S
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
S
I
 
P
E
 
P
K
 
E
G
 
D
K
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
E
G
 
N
T
 
T
-
 
D
I
 
L
D
 
P
E
 
A
F
 
W
D
 
Q
A
 
R
I
 
V
M
 
Q
G
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
S
V
 
V
W
 
Y
L
 
L
C
 
S
M
 
C
K
 
R
Y
 
A
Q
 
A
L
 
L
P
 
R
L
 
H
L
 
M
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
-
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
A
P
 
T
K
 
S
M
x
Q
S
 
I
I
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
R
S
 
E
A
 
L
A
 
G
I
 
V
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
A
 
G
V
x
P
I
x
V
D
 
N
T
 
T
D
 
P
M
 
L
F
 
L
R
 
Q
R
 
E
A
 
L
Y
 
F
E
 
A
A
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
E
K
 
R
G
 
A
E
 
A
F
 
R
A
 
R
N
 
L
A
 
V
M
 
H
H
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
S
S
 
T
L
 
F
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I
T
 
S
A
 
S

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:250/253 of query aligns to 5:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
F
 
L
S
 
Q
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
A
 
E
A
 
A
G
 
A
G
 
G
E
 
K
G
 
E
T
 
A
V
 
V
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
E
 
G
A
 
V
T
 
V
F
 
F
V
 
I
R
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
R
S
 
E
E
 
S
V
 
V
K
 
H
N
 
R
L
 
L
M
 
V
D
 
E
E
 
N
V
 
V
V
 
A
N
 
E
T
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
Y
 
I
A
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
E
 
-
I
 
T
E
 
R
K
x
D
G
 
S
K
 
M
L
 
L
A
 
S
E
x
K
G
 
M
T
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
I
 
V
M
 
I
G
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
H
C
 
C
M
 
T
K
 
Q
Y
 
A
Q
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
L
 
A
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
T
G
 
Y
A
 
G
A
x
N
P
x
V
K
 
G
M
x
Q
S
 
T
I
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
A
 
G
V
x
F
I
x
T
D
 
E
T
|
T
D
 
A
M
|
M
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
V
Y
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
P
P
 
E
K
 
K
K
 
V
G
 
I
E
 
E
F
x
K
A
 
M
N
 
K
A
 
A
M
 
Q
H
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
H
G
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
V
L
 
L
A
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:252/253 of query aligns to 1:226/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
M
 
M
S
 
I
M
 
M
T
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
L
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
M
I
 
V
R
 
R
T
 
K
A
 
E
G
 
N
G
 
N
E
 
D
A
 
R
T
 
L
-
 
H
F
 
F
V
 
V
R
 
Q
C
x
T
N
x
D
V
x
I
T
 
T
V
 
D
E
 
E
S
 
A
E
 
A
V
 
C
K
 
Q
N
 
H
L
 
A
M
 
V
D
 
E
E
 
S
V
 
A
V
 
V
N
 
H
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
I
E
 
-
K
 
V
G
 
A
K
 
P
L
 
I
A
 
H
E
 
E
G
 
M
T
 
E
I
 
L
D
 
S
E
 
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
I
 
V
M
 
L
G
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
W
 
F
L
 
L
C
 
M
M
 
S
K
 
K
Y
 
H
Q
 
A
L
 
L
P
 
K
L
 
H
L
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
C
S
|
S
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
W
P
 
P
K
 
D
M
 
I
S
 
P
I
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
K
 
H
K
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
A
x
G
V
 
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
D
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
L
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
H
 
S
S
 
A
L
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
T
 
T
A
 
A

4qecA Elxo with NADP bound (see paper)
34% identity, 94% coverage: 11:249/253 of query aligns to 6:244/248 of 4qecA

query
sites
4qecA
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
F
N
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
F
 
F
A
 
L
A
 
K
E
 
N
G
 
D
L
 
Y
K
 
H
V
 
V
V
 
C
V
 
I
A
 
T
D
x
S
L
x
R
D
 
Y
A
 
F
A
 
E
G
x
K
G
 
E
E
 
K
G
 
R
T
 
I
V
 
P
A
 
H
L
 
L
I
 
F
R
 
S
T
 
S
A
 
Y
G
 
E
G
 
E
E
 
N
A
 
I
T
 
S
F
 
F
V
 
Y
R
 
Q
C
 
L
N
x
D
V
|
V
T
 
T
V
 
D
E
 
E
S
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
N
N
 
E
L
 
I
M
 
I
D
 
N
E
 
K
V
 
I
V
 
V
N
 
K
T
 
K
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
E
 
S
I
 
L
E
 
S
K
 
D
G
 
G
K
 
L
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
T
T
 
K
I
 
T
D
 
T
E
 
D
F
 
F
D
 
N
A
 
K
I
 
M
M
 
I
G
 
N
V
 
T
N
|
N
V
 
I
K
 
L
G
 
G
V
 
T
W
 
Y
L
 
F
C
 
C
M
 
M
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
A
L
 
L
P
 
K
L
 
H
L
 
M
L
 
Q
A
 
K
Q
 
V
G
 
S
G
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
S
A
 
G
A
 
F
P
 
P
K
 
Y
M
 
S
S
 
I
I
 
L
Y
|
Y
A
 
G
A
 
S
S
 
T
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
D
K
 
K
K
 
G
I
 
I
R
 
K
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
A
 
G
V
 
I
I
|
I
D
 
K
T
 
T
D
 
E
M
 
T
F
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
E
Y
 
I
E
 
D
A
 
S
D
 
-
P
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
E
F
 
F
A
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
S
-
 
I
N
 
S
A
 
S
M
 
I
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
Q
R
 
K
I
 
L
G
 
G
K
 
T
V
 
T
E
 
L
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
K
A
 
G
V
 
I
L
 
Y
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
N
D
 
E
G
 
D
A
 
N
A
 
N
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
H
S
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 11:265/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
F
 
F
S
 
T
G
 
D
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
V
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
N
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
T
|
T
A
|
A
L
x
V
A
x
R
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
|
E
G
|
G
L
x
A
K
|
K
V
x
L
V
x
S
V
x
L
A
 
V
D
 
D
L
 
V
D
 
S
A
 
S
A
 
E
G
 
G
G
 
L
E
 
E
G
 
A
T
 
S
V
 
K
A
 
A
L
 
A
I
 
V
R
 
L
T
 
E
A
 
T
G
 
A
G
 
P
E
 
D
A
 
A
T
 
E
F
 
V
V
 
L
R
 
T
C
 
T
-
 
V
-
 
A
N
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
D
E
 
E
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
K
 
E
N
 
A
L
 
Y
M
 
V
D
 
T
E
 
A
V
 
T
V
 
T
N
 
E
T
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
G
A
 
F
F
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
|
E
I
 
G
E
 
K
K
 
Q
G
 
N
K
 
P
L
 
T
A
 
E
E
 
S
G
 
F
T
 
T
I
 
A
D
 
A
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
V
M
 
V
G
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
G
M
 
L
K
 
E
Y
 
K
Q
 
V
L
 
L
P
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
R
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
R
A
 
G
A
 
I
P
 
G
K
 
N
M
 
Q
S
 
S
I
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
N
A
 
S
A
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
R
K
 
Y
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
A
 
G
V
 
A
I
 
I
D
 
W
T
 
T
D
 
P
M
 
M
F
 
V
R
 
E
R
 
N
A
 
S
Y
 
M
E
 
K
A
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
R
K
 
K
G
 
A
-
 
A
-
 
E
E
 
E
F
 
F
A
 
I
N
 
Q
A
 
-
M
 
V
H
 
N
P
 
P
V
 
S
G
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
K
 
E
V
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
A
H
 
T
S
 
V
L
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
T
 
S
A
 
A

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 2:256/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
F
 
F
S
 
T
G
 
D
Q
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
N
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
V
D
|
D
L
x
V
D
 
S
A
 
S
A
 
E
G
 
G
G
 
L
E
 
E
G
 
A
T
 
S
V
 
K
A
 
A
L
 
A
I
 
V
R
 
L
T
 
E
A
 
T
G
 
A
G
 
P
E
 
D
A
 
A
T
 
E
F
 
V
V
 
L
R
 
T
C
 
T
-
 
V
-
x
A
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
E
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
K
 
E
N
 
A
L
 
Y
M
 
V
D
 
T
E
 
A
V
 
T
V
 
T
N
 
E
T
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
G
A
 
F
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
E
 
E
I
 
G
E
 
K
K
 
Q
G
 
N
K
 
P
L
 
T
A
 
E
E
 
S
G
 
F
T
 
T
I
 
A
D
 
A
E
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
V
M
 
V
G
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
G
M
 
L
K
 
E
Y
 
K
Q
 
V
L
 
L
P
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
R
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
R
A
 
G
A
 
I
P
 
G
K
 
N
M
x
Q
S
 
S
I
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
N
A
 
S
A
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
K
 
R
K
 
Y
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
|
P
A
x
G
V
 
A
I
 
I
D
 
W
T
|
T
D
x
P
M
|
M
F
 
V
R
 
E
R
 
N
A
 
S
Y
 
M
E
 
K
A
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
R
K
 
K
G
 
A
-
 
A
-
 
E
E
 
E
F
 
F
A
 
I
N
 
Q
A
 
-
M
 
V
H
 
N
P
 
P
V
 
S
G
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
K
 
E
V
 
A
E
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
A
H
 
T
S
 
V
L
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
T
 
S
A
 
A

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
41% identity, 96% coverage: 8:251/253 of query aligns to 8:246/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
N
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
S
A
 
I
A
 
H
G
 
D
G
 
P
E
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
K
F
 
Y
-
 
D
-
 
H
V
 
I
R
 
E
C
 
C
N
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
N
E
 
P
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
N
 
A
L
 
S
M
 
I
D
 
D
E
 
H
V
 
I
V
 
F
N
 
K
T
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
S
L
 
I
D
 
S
Y
 
V
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
-
E
 
S
K
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
I
A
 
E
E
 
S
G
 
M
T
 
S
I
 
M
D
 
G
E
 
E
F
 
W
D
 
R
A
 
R
I
 
I
M
 
I
G
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
F
G
 
G
V
 
Y
W
 
Y
L
 
Y
C
 
A
M
 
S
K
 
K
Y
 
F
Q
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
L
 
I
A
 
R
Q
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
A
 
S
S
|
S
V
|
V
A
x
Q
G
 
A
L
 
S
G
 
I
A
 
I
A
 
T
P
 
K
K
 
N
M
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
A
 
I
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
-
K
 
P
K
 
L
I
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
A
|
A
V
x
T
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
P
M
 
L
F
 
V
R
 
R
R
 
K
A
 
A
Y
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
K
K
 
K
K
 
I
G
 
S
E
 
E
F
 
W
A
 
G
N
 
H
A
 
E
M
 
-
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
R
G
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
T
S
 
C
L
 
L
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
L
T
 
S

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
41% identity, 96% coverage: 8:251/253 of query aligns to 8:246/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
N
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
L
D
x
S
A
x
I
A
 
H
G
 
D
G
 
P
E
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
K
F
 
Y
-
 
D
-
 
H
V
 
I
R
 
E
C
|
C
N
x
D
V
|
V
T
 
T
V
 
N
E
 
P
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
N
 
A
L
 
S
M
 
I
D
 
D
E
 
H
V
 
I
V
 
F
N
 
K
T
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
S
L
 
I
D
 
S
Y
 
V
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
-
E
 
S
K
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
I
A
 
E
E
 
S
G
 
M
T
 
S
I
 
M
D
 
G
E
 
E
F
 
W
D
 
R
A
 
R
I
 
I
M
 
I
G
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
F
G
 
G
V
 
Y
W
 
Y
L
 
Y
C
 
A
M
 
S
K
 
K
Y
 
F
Q
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
L
 
I
A
 
R
Q
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
Q
G
 
A
L
 
S
G
 
I
A
 
I
A
 
T
P
 
K
K
 
N
M
 
A
S
 
S
I
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
A
 
I
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
K
 
-
K
 
P
K
 
L
I
 
L
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
A
|
A
V
x
T
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
x
P
M
x
L
F
x
V
R
 
R
R
 
K
A
 
A
Y
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
K
K
 
K
K
 
I
G
 
S
E
 
E
F
 
W
A
 
G
N
 
H
A
 
E
M
 
-
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
R
G
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
T
S
 
C
L
 
L
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
L
T
 
S

5h5xC Crystal structure of nadh bound carbonyl reductase from streptomyces coelicolor
43% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 11:256/257 of 5h5xC

query
sites
5h5xC
F
 
F
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
G
A
 
A
E
 
G
G
 
G
L
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
F
D
 
N
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
A
E
 
E
G
 
K
T
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
E
I
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
G
G
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
A
F
 
A
V
 
V
R
 
E
C
x
L
N
x
D
V
 
V
T
 
T
V
 
R
E
 
P
S
 
E
E
 
S
V
 
V
K
 
E
N
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
G
E
 
F
V
 
A
V
 
V
N
 
D
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
L
A
 
A
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
I
 
G
E
 
P
K
 
S
G
 
A
K
 
P
L
 
T
A
 
G
E
 
E
G
 
Y
T
 
D
I
 
V
D
 
A
E
 
A
F
 
Y
D
 
Q
A
 
R
I
 
V
M
 
V
G
 
R
V
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
F
L
 
Y
C
 
S
M
 
M
K
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
L
G
 
G
L
 
S
G
 
V
A
 
G
A
 
F
P
 
A
K
 
G
M
 
S
S
 
P
I
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
K
 
A
K
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
G
P
|
P
A
x
G
V
 
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
P
M
 
L
F
 
L
R
 
K
R
 
T
A
 
M
Y
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
A
P
 
Y
K
 
K
K
 
G
G
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
L
N
 
V
A
 
A
M
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
R
V
 
S
E
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
L
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
R
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
A
G
 
G
H
 
S
S
 
Y
L
 
H
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
V
 
Y
T
 
T
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 98% coverage: 3:250/253 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
T
 
T
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
A
x
N
-
x
Y
D
x
N
L
x
G
D
x
S
A
 
P
A
 
E
G
 
A
G
 
A
E
 
E
G
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
A
T
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
V
T
 
E
F
 
A
V
 
M
R
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
V
 
I
E
 
A
S
 
E
E
 
D
V
 
V
K
 
D
N
 
A
L
 
F
M
 
F
D
 
K
E
 
Q
V
 
A
V
 
I
N
 
E
T
 
R
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
Y
 
I
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
E
 
-
I
 
T
E
 
R
K
 
D
G
 
N
K
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
R
G
 
M
T
 
K
I
 
E
D
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
I
 
V
M
 
I
G
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
L
 
L
C
 
C
M
 
T
K
 
K
Y
 
A
Q
 
V
L
 
S
P
 
R
L
 
T
L
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
I
A
 
G
A
 
N
P
 
A
K
 
G
M
x
Q
S
 
A
I
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
P
K
 
R
K
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
A
 
G
V
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
D
 
D
M
 
M
F
 
T
R
 
D
R
 
K
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
L
D
 
D
P
 
E
K
 
K
K
 
T
G
 
K
E
 
E
F
 
A
A
 
M
N
 
L
A
 
A
M
 
Q
H
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
A
I
 
Y
G
 
G
K
 
T
V
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
A
A
 
S
A
 
K
F
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
Q
S
 
T
L
 
L
A
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 3:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
S
 
A
M
 
M
T
 
K
F
 
L
S
 
A
G
 
S
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
R
D
 
D
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
-
E
 
E
G
 
A
T
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
L
F
 
F
V
 
I
R
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
T
 
A
V
 
E
E
 
K
S
 
T
E
 
Q
V
 
V
K
 
E
N
 
A
L
 
L
M
 
F
D
 
S
E
 
Q
V
 
A
V
 
E
N
 
E
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
Y
 
I
A
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
E
 
N
I
 
-
E
 
R
K
 
D
G
 
A
K
 
M
L
 
L
A
 
H
E
 
K
G
 
L
T
 
T
I
 
E
D
 
A
E
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
T
I
 
V
M
 
I
G
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
Q
Y
 
Q
Q
 
A
L
 
A
P
 
I
L
 
R
L
 
M
L
 
R
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
S
G
 
W
L
 
L
G
 
G
A
 
N
A
 
V
P
 
G
K
 
Q
M
 
T
S
 
N
I
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
C
I
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
K
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
A
 
G
V
 
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
 
M
F
x
T
R
 
R
R
 
G
A
 
V
Y
 
P
E
 
E
A
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
N
K
 
V
G
 
W
E
 
Q
F
 
I
A
 
M
N
 
V
A
 
S
M
 
K
H
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
A
 
C
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
R
F
 
Y
T
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
E
S
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
M

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:252/253 of query aligns to 1:243/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
M
 
M
T
 
R
F
 
F
S
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
N
|
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
D
|
D
L
 
W
D
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
A
G
 
V
E
 
D
G
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
P
T
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
R
A
 
A
T
 
M
F
 
A
V
 
V
R
 
H
C
 
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
S
 
V
E
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
M
D
 
N
E
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
E
T
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
H
I
 
V
E
 
-
K
 
A
G
 
G
K
 
S
L
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
D
 
R
A
 
R
I
 
I
M
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
L
 
F
C
 
C
M
 
S
K
 
K
Y
 
F
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
-
Q
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
V
|
V
A
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
P
 
W
K
 
G
M
 
A
S
 
A
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
K
 
D
K
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
A
 
S
V
 
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
D
 
N
M
 
M
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
T
E
 
N
A
 
G
D
 
W
P
 
P
K
 
Q
-
 
E
-
 
I
K
x
R
G
x
D
E
x
K
F
 
F
A
 
-
N
 
N
A
 
E
M
 
R
H
 
I
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
S
 
N
L
 
I
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 3:243/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
F
 
F
S
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
N
|
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
D
|
D
L
x
W
D
x
A
A
 
K
A
 
E
G
 
A
G
 
V
E
 
D
G
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
P
T
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
R
A
 
A
T
 
M
F
 
A
V
 
V
R
 
H
C
x
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
S
 
V
E
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
M
D
 
N
E
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
E
T
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
E
 
H
I
 
V
E
 
-
K
 
A
G
 
G
K
 
S
L
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
D
 
R
A
 
R
I
 
I
M
 
A
G
 
G
V
|
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
L
 
F
C
 
C
M
 
S
K
 
K
Y
 
F
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
-
Q
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
P
 
W
K
 
G
M
 
A
S
 
A
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
K
 
D
K
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
C
P
|
P
A
x
S
V
x
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
D
x
N
M
|
M
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
x
T
E
 
N
A
 
G
D
 
W
P
 
P
K
 
Q
-
 
E
-
 
I
K
 
R
G
 
D
E
 
K
F
 
F
A
 
-
N
 
N
A
 
E
M
 
R
H
 
I
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
S
 
N
L
 
I
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
A

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:252/253 of query aligns to 5:245/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
F
 
F
S
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
N
|
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
D
|
D
L
x
W
D
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
A
G
 
V
E
 
D
G
 
K
T
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
P
T
 
K
A
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
R
A
 
A
T
 
M
F
 
A
V
 
V
R
 
H
C
x
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
V
 
D
E
 
H
S
 
V
E
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
M
D
 
N
E
 
E
V
 
V
V
 
A
N
 
E
T
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
Y
 
V
A
 
L
F
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
E
 
H
I
 
V
E
 
-
K
 
A
G
 
G
K
 
S
L
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
D
F
 
W
D
 
R
A
 
R
I
 
I
M
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
L
 
F
C
 
C
M
 
S
K
 
K
Y
 
F
Q
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
-
Q
 
K
G
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
P
 
W
K
 
G
M
 
A
S
 
A
I
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
S
 
A
K
 
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
A
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
K
 
G
K
 
D
K
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
A
 
S
V
 
L
I
 
V
D
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
M
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
T
E
 
N
A
 
G
D
 
W
P
 
P
K
 
Q
-
 
E
-
 
I
K
 
R
G
 
D
E
 
K
F
 
F
A
 
-
N
 
N
A
 
E
M
 
R
H
 
I
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
V
V
 
M
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
N
G
 
G
H
 
A
S
 
N
L
 
I
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
A

Query Sequence

>Pf1N1B4_512 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
MSMTFSGQVAVVTGAANGIGRATALAFAAEGLKVVVADLDAAGGEGTVALIRTAGGEATF
VRCNVTVESEVKNLMDEVVNTYGRLDYAFNNAGIEIEKGKLAEGTIDEFDAIMGVNVKGV
WLCMKYQLPLLLAQGGGAIVNTASVAGLGAAPKMSIYAASKHAVIGLTKSAAIEYAKKKI
RVNAVCPAVIDTDMFRRAYEADPKKGEFANAMHPVGRIGKVEEIASAVLYLCSDGAAFTT
GHSLAVDGGVTAF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory