SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_5638 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5638 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ebuA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502312) from oceanicola granulosus, with bound amp/adp crystal form i
41% identity, 95% coverage: 13:308/310 of query aligns to 16:304/306 of 4ebuA

query
sites
4ebuA
R
 
H
I
 
I
A
 
L
L
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
C
M
 
M
I
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
Q
 
P
R
 
-
A
 
A
D
 
D
-
 
L
-
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
L
S
 
G
F
 
F
G
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
L
 
L
G
 
R
D
 
P
G
 
E
G
 
S
T
 
R
V
 
I
D
 
S
Y
 
Y
V
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
A
F
 
L
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
M
 
M
C
 
R
Q
 
A
S
 
A
W
 
M
A
 
S
S
 
A
E
 
A
N
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
G
D
 
G
M
 
G
V
 
L
Q
 
R
R
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
T
P
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
Q
 
T
T
 
L
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
R
 
S
F
 
F
F
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
C
 
L
F
 
A
T
 
G
T
 
D
P
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
L
P
 
A
I
 
A
L
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
R
P
 
-
D
 
-
Y
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
D
V
 
Q
Q
 
C
G
 
G
R
 
R
E
 
A
K
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
R
 
T
D
 
G
A
 
R
R
 
T
I
 
I
V
 
A
F
 
F
D
 
D
N
 
P
N
 
N
Y
 
L
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
S
 
G
I
 
T
E
 
G
E
 
E
A
 
M
Q
 
T
A
 
E
A
 
T
Y
 
I
R
 
M
N
 
Q
V
 
G
L
 
A
P
 
A
Y
 
V
I
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
P
T
x
S
V
 
F
D
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
W
F
 
F
H
 
G
F
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
P
A
 
D
A
 
A
V
 
T
F
 
A
A
 
D
A
 
R
Y
 
Y
E
 
A
Q
 
R
M
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
R
E
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
|
K
R
 
N
G
|
G
A
x
P
E
 
H
A
 
A
C
 
V
L
 
H
I
 
F
H
 
L
C
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
R
S
 
R
F
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
A
x
V
Q
 
P
V
 
P
V
|
V
E
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
|
F
S
 
N
A
 
A
A
 
G
Y
 
L
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
V
L
 
L
K
 
A
G
 
-
G
 
G
S
 
Q
P
 
P
V
 
L
E
 
E
A
 
T
-
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
A
H
x
A
R
 
A
L
 
L
A
|
A
S
 
G
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
Q
 
Q
V
 
G
P
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
V

4eumA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502132) from oceanicola granulosus with bound amp, crystal form ii
41% identity, 89% coverage: 13:288/310 of query aligns to 16:279/294 of 4eumA

query
sites
4eumA
R
 
H
I
 
I
A
 
L
L
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
C
M
 
M
I
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
Q
 
P
R
 
-
A
 
A
D
 
D
-
 
L
-
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
Q
 
R
Q
 
L
S
 
G
F
 
F
G
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
L
 
L
G
 
R
D
 
P
G
 
E
G
 
S
T
 
R
V
 
I
D
 
S
Y
 
Y
V
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
A
F
 
L
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
M
 
M
C
 
R
Q
 
A
S
 
A
W
 
M
A
 
S
S
 
A
E
 
A
N
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
G
D
 
G
M
 
G
V
 
L
Q
 
R
R
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
T
P
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
Q
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
A
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
E
C
 
L
F
 
A
T
 
G
T
 
D
P
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
L
P
 
A
I
 
A
L
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
R
P
 
-
D
 
-
Y
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
D
V
 
Q
Q
 
C
G
 
G
R
 
R
E
 
A
K
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
R
 
T
D
 
G
A
 
R
R
 
T
I
 
I
V
 
A
F
 
F
D
 
D
N
 
P
N
 
N
Y
 
L
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
S
 
G
I
 
T
E
 
G
E
 
E
A
 
M
Q
 
T
A
 
E
A
 
T
Y
 
I
R
 
M
N
 
Q
V
 
G
L
 
A
P
 
A
Y
 
V
I
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
P
T
x
S
V
 
F
D
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
W
F
 
F
H
 
G
F
 
D
S
 
A
D
 
G
C
 
P
A
 
D
A
 
A
V
 
T
F
 
A
A
 
D
A
 
R
Y
 
Y
E
 
A
Q
 
R
M
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
R
E
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
|
K
R
x
N
G
|
G
A
x
P
E
 
H
A
 
A
C
 
V
L
 
H
I
 
F
H
 
L
C
 
Q
D
 
D
G
 
G
E
 
R
S
 
R
F
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
A
x
V
Q
 
P
V
 
P
V
|
V
E
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
|
F
S
 
N
A
 
A
A
 
G
Y
 
L
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
V
L
 
L
K
 
A
G
 
-
G
 
G
S
 
Q
P
 
P
V
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
36% identity, 85% coverage: 27:288/310 of query aligns to 23:268/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
R
 
R
A
 
G
D
 
K
G
 
R
T
 
L
L
 
L
Q
 
E
Q
 
V
S
 
Y
F
 
V
G
 
G
G
|
G
D
x
A
T
x
E
L
x
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
L
G
 
G
G
 
V
T
 
K
V
 
V
D
 
G
Y
 
F
V
 
V
T
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
S
 
E
F
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
C
 
E
Q
 
E
S
 
R
W
 
L
A
 
R
S
 
A
E
 
E
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
L
D
 
T
M
 
H
V
 
F
Q
 
R
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
-
L
 
F
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
C
 
L
I
 
R
Q
 
E
T
 
Y
D
 
L
A
 
P
A
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
R
 
R
F
 
V
F
 
F
Y
|
Y
W
x
Y
R
|
R
N
 
K
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
G
P
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
F
L
 
D
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
D
 
R
V
 
F
L
 
L
Y
 
H
F
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
-
L
 
L
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
R
 
R
E
 
A
K
 
F
L
 
S
L
 
L
E
 
W
T
 
A
L
 
M
I
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
D
 
G
A
 
V
R
 
R
I
 
V
V
 
S
F
 
L
D
 
D
N
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
|
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
A
 
-
S
 
S
I
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
L
R
 
E
N
 
R
V
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
L
L
 
F
L
 
L
T
x
S
V
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
-
F
 
-
S
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
F
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
L
E
 
R
Q
 
A
M
 
L
G
 
S
T
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
R
|
R
G
|
G
A
|
A
E
x
K
A
x
G
C
x
A
L
 
W
I
 
A
H
 
F
C
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
S
 
R
F
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
 
A
Q
 
F
V
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
-
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
G
R
 
A
L
 
V
K
 
W
G
 
-
G
 
G
S
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
36% identity, 85% coverage: 27:288/310 of query aligns to 23:268/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
R
 
R
A
 
G
D
 
K
G
 
R
T
 
L
L
 
L
Q
 
E
Q
 
V
S
 
Y
F
 
V
G
|
G
G
|
G
D
x
A
T
 
E
L
 
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
L
G
 
G
G
 
V
T
 
K
V
 
V
D
 
G
Y
 
F
V
 
V
T
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
S
 
E
F
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
C
 
E
Q
 
E
S
 
R
W
 
L
A
 
R
S
 
A
E
 
E
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
L
D
 
T
M
 
H
V
 
F
Q
 
R
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
-
L
 
F
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
C
 
L
I
 
R
Q
 
E
T
 
Y
D
 
L
A
 
P
A
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
R
 
R
F
 
V
F
 
F
Y
|
Y
W
 
Y
R
|
R
N
 
K
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
G
P
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
F
L
 
D
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
D
 
R
V
 
F
L
 
L
Y
 
H
F
 
L
S
 
S
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
-
L
 
L
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
R
 
R
E
 
A
K
 
F
L
 
S
L
 
L
E
 
W
T
 
A
L
 
M
I
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
D
 
G
A
 
V
R
 
R
I
 
V
V
 
S
F
 
L
D
 
D
N
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
|
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
A
 
-
S
 
S
I
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
L
R
 
E
N
 
R
V
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
L
L
 
F
L
 
L
T
 
S
V
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
-
F
 
-
S
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
F
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
L
E
 
R
Q
 
A
M
 
L
G
 
S
T
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
|
G
A
|
A
E
 
K
A
 
G
C
 
A
L
 
W
I
 
A
H
 
F
C
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
S
 
R
F
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
 
A
Q
x
F
V
 
A
V
|
V
E
 
E
R
 
-
V
x
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
A
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
G
R
 
A
L
 
V
K
 
W
G
 
-
G
 
G
S
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
36% identity, 85% coverage: 27:288/310 of query aligns to 23:268/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
R
 
R
A
 
G
D
 
K
G
 
R
T
 
L
L
 
L
Q
 
E
Q
 
V
S
 
Y
F
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
A
T
 
E
L
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
L
G
 
G
G
 
V
T
 
K
V
 
V
D
 
G
Y
 
F
V
 
V
T
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
D
S
 
E
F
 
L
S
 
G
D
 
A
A
 
M
M
 
V
C
 
E
Q
 
E
S
 
R
W
 
L
A
 
R
S
 
A
E
 
E
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
L
D
 
T
M
 
H
V
 
F
Q
 
R
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
-
L
 
F
P
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
C
 
L
I
 
R
Q
 
E
T
 
Y
D
 
L
A
 
P
A
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
G
R
 
R
F
 
V
F
 
F
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
R
N
 
K
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
G
P
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
G
L
 
-
A
 
A
A
 
F
L
 
D
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
V
D
 
R
V
 
F
L
 
L
Y
 
H
F
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
-
L
 
L
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
R
 
R
E
 
A
K
 
F
L
 
S
L
 
L
E
 
W
T
 
A
L
 
M
I
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
D
 
G
A
 
V
R
 
R
I
 
V
V
 
S
F
 
L
D
 
D
N
 
V
N
|
N
Y
 
Y
R
 
R
P
 
Q
R
 
T
L
 
L
W
 
W
A
 
-
S
 
S
I
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
A
 
F
Y
 
L
R
 
E
N
 
R
V
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
L
L
 
F
L
 
L
T
x
S
V
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
F
H
 
-
F
 
-
S
 
-
D
 
-
C
 
-
A
 
G
A
 
R
V
 
V
F
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
L
E
 
R
Q
 
A
M
 
L
G
 
S
T
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
|
K
R
 
R
G
|
G
A
 
A
E
 
K
A
x
G
C
 
A
L
 
W
I
 
A
H
 
F
C
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
S
 
R
F
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
|
A
Q
x
F
V
 
A
V
|
V
E
 
E
R
 
-
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
x
P
T
x
V
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
A
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
G
R
 
A
L
 
V
K
 
W
G
 
-
G
 
G
S
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:277/310 of query aligns to 6:259/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
R
 
K
I
 
V
A
 
W
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
D
C
 
A
M
 
S
I
 
V
E
x
D
L
 
L
Q
 
V
Q
 
P
R
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
T
 
S
L
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
S
 
C
F
 
P
G
 
G
G
|
G
D
 
A
T
 
S
L
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
Y
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
L
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
C
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
T
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
D
F
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
C
 
R
Q
 
Q
S
 
V
W
 
F
A
 
Q
S
 
D
E
 
N
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
T
M
 
F
V
 
L
Q
 
R
R
 
L
L
 
D
P
 
A
G
 
D
R
 
L
L
 
T
P
 
S
G
 
A
L
 
V
Y
 
L
C
 
I
I
 
V
Q
 
N
T
 
L
D
 
T
A
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
S
F
 
F
F
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
N
 
H
E
 
P
A
 
G
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
D
C
 
T
F
 
Y
T
 
V
T
 
S
P
 
P
A
 
Q
A
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
Q
Y
 
Y
D
 
E
V
 
W
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
-
L
 
-
G
 
D
V
 
R
Q
 
P
G
 
A
R
 
R
E
 
E
K
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
T
 
G
L
 
A
I
 
R
E
 
R
A
 
M
R
 
R
Q
 
E
R
 
A
D
 
G
A
 
G
R
 
Y
I
 
V
V
 
L
F
 
F
D
 
D
N
 
V
N
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
 
M
W
 
W
A
 
G
S
 
N
I
 
T
E
 
D
E
 
E
A
 
I
Q
 
P
A
 
E
A
 
L
Y
 
I
R
 
A
N
 
R
V
 
S
L
x
A
P
x
A
Y
 
L
I
x
A
D
 
S
L
 
I
A
 
C
L
 
K
L
 
V
T
 
S
V
 
A
D
 
D
D
 
E
E
 
L
Q
 
C
A
 
Q
L
 
L
F
 
S
H
 
G
F
 
A
S
 
S
D
 
H
C
 
W
A
 
Q
A
 
D
V
 
A
F
 
R
A
 
Y
A
 
Y
Y
 
L
E
 
R
Q
 
D
M
 
L
G
|
G
T
 
C
P
 
D
E
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
K
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
-
 
G
A
 
A
C
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
T
C
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
-
F
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
P
V
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
-
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
Y
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
21% identity, 93% coverage: 17:305/310 of query aligns to 6:292/311 of 2varA

query
sites
2varA
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
x
L
I
 
I
E
 
Q
L
 
F
Q
 
N
Q
 
S
R
 
F
A
 
N
D
 
P
G
 
G
T
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
Q
 
E
Q
 
K
S
 
H
F
 
V
G
x
A
G
|
G
D
x
S
T
 
E
L
 
L
N
|
N
T
 
F
A
 
C
V
 
I
Y
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
R
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
N
G
 
H
G
 
L
T
 
S
V
 
C
D
 
S
Y
 
L
V
 
I
T
 
A
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
S
 
E
F
 
F
S
 
G
D
 
K
A
 
N
M
 
I
C
 
I
Q
 
E
S
 
Y
W
 
S
A
 
R
S
 
A
E
 
Q
N
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
T
D
 
S
M
 
H
V
 
I
Q
 
K
R
 
V
L
 
D
P
 
N
G
 
E
R
 
S
L
 
F
P
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
|
Y
C
 
F
I
 
I
Q
 
Q
T
 
R
D
 
G
-
 
Y
-
 
P
A
 
I
A
 
P
G
 
M
E
 
K
R
 
S
R
 
E
F
x
L
F
 
V
Y
|
Y
W
 
Y
R
|
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
N
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
D
 
N
C
 
S
F
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
R
V
 
L
L
 
V
Y
 
H
F
 
S
S
 
T
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
-
G
 
S
V
 
D
Q
 
N
G
 
A
R
 
K
E
 
E
K
 
A
L
 
V
L
 
I
E
 
K
T
 
A
L
 
F
I
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
S
R
 
R
D
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
F
 
L
D
 
D
N
 
T
N
|
N
Y
 
I
R
|
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
W
 
W
A
 
S
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
A
 
T
Y
 
I
R
 
L
N
 
S
V
 
I
L
 
L
P
 
K
Y
 
K
I
 
Y
D
 
D
L
 
I
A
 
E
L
 
V
L
 
L
T
 
I
V
 
T
-
 
D
-
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
T
Q
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
L
H
 
D
F
 
V
S
 
T
D
 
D
C
 
P
A
 
D
A
 
E
V
 
A
F
 
Y
A
 
R
A
 
K
Y
 
Y
E
 
K
Q
 
E
M
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
K
E
 
V
V
 
L
V
 
L
L
 
Y
K
|
K
R
 
L
G
|
G
A
x
S
E
 
K
A
x
G
C
x
A
L
 
I
I
 
A
H
 
Y
C
 
K
D
 
D
G
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
E
 
D
S
x
A
F
x
Y
E
 
K
V
 
V
P
 
P
A
x
V
Q
 
E
V
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
D
T
 
P
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
x
M
S
 
A
A
 
G
A
 
T
Y
 
F
L
 
V
A
 
S
C
 
L
R
 
Y
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
G
 
K
S
 
D
P
 
I
V
 
E
E
 
Y
A
 
S
A
 
L
E
 
A
A
 
H
G
 
G
H
x
I
R
 
A
L
 
A
A
x
S
S
 
T
R
 
L
V
 
V
I
|
I
Q
 
T
V
 
V
P
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
21% identity, 93% coverage: 17:305/310 of query aligns to 7:293/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
P
M
 
L
I
 
I
E
 
Q
L
 
F
Q
 
N
Q
 
S
R
 
F
A
 
N
D
 
P
G
 
G
T
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
Q
 
E
Q
 
K
S
 
H
F
 
V
G
 
A
G
|
G
D
x
S
T
x
E
L
|
L
N
|
N
T
 
F
A
 
C
V
 
I
Y
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
R
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
N
G
 
H
G
 
L
T
 
S
V
 
C
D
 
S
Y
 
L
V
 
I
T
 
A
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
S
 
E
F
 
F
S
 
G
D
 
K
A
 
N
M
 
I
C
 
I
Q
 
E
S
 
Y
W
 
S
A
 
R
S
 
A
E
 
Q
N
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
T
D
 
S
M
 
H
V
 
I
Q
 
K
R
 
V
L
 
D
P
 
N
G
 
E
R
 
S
L
 
F
P
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
|
Y
C
 
F
I
 
I
Q
 
Q
T
 
R
D
 
G
-
 
Y
-
 
P
A
 
I
A
 
P
G
 
M
E
 
K
R
 
S
R
 
E
F
 
L
F
 
V
Y
|
Y
W
x
Y
R
|
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
N
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
D
 
N
C
 
S
F
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
R
V
 
L
L
 
V
Y
 
H
F
 
S
S
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
-
G
 
S
V
 
D
Q
 
N
G
 
A
R
 
K
E
 
E
K
 
A
L
 
V
L
 
I
E
 
K
T
 
A
L
 
F
I
 
E
E
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
S
R
 
R
D
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
F
 
L
D
 
D
N
 
T
N
|
N
Y
x
I
R
|
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
W
 
W
A
 
S
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
A
 
T
Y
 
I
R
 
L
N
 
S
V
 
I
L
 
L
P
 
K
Y
 
K
I
 
Y
D
 
D
L
 
I
A
 
E
L
 
V
L
 
L
T
 
I
V
 
T
-
 
D
-
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
T
Q
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
L
H
 
D
F
 
V
S
 
T
D
 
D
C
 
P
A
 
D
A
 
E
V
 
A
F
 
Y
A
 
R
A
 
K
Y
 
Y
E
 
K
Q
 
E
M
 
L
G
 
G
T
 
V
P
 
K
E
 
V
V
 
L
V
 
L
L
 
Y
K
|
K
R
x
L
G
|
G
A
x
S
E
x
K
A
x
G
C
 
A
L
 
I
I
 
A
H
 
Y
C
 
K
D
 
D
G
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
E
 
D
S
 
A
F
 
Y
E
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
M
S
 
A
A
 
G
A
 
T
Y
 
F
L
 
V
A
 
S
C
 
L
R
 
Y
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
G
 
K
S
 
D
P
 
I
V
 
E
E
 
Y
A
 
S
A
 
L
E
 
A
A
 
H
G
 
G
H
 
I
R
 
A
L
 
A
A
 
S
S
 
T
R
 
L
V
 
V
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
P
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:277/310 of query aligns to 2:248/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
R
 
K
I
 
V
A
 
W
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
x
D
C
 
A
M
x
S
I
 
V
E
x
D
L
 
L
Q
 
V
Q
 
P
R
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
T
 
S
L
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
S
x
C
F
 
P
G
|
G
G
|
G
D
x
A
T
 
S
L
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
Y
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
L
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
C
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
T
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
D
F
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
C
 
R
Q
 
Q
S
 
V
W
 
F
A
 
Q
S
 
D
E
 
N
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
T
M
 
F
V
 
L
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
P
 
D
G
 
A
R
 
D
L
 
L
P
 
T
G
 
S
L
 
A
Y
 
V
C
x
L
I
 
I
Q
 
V
T
 
N
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
S
F
|
F
F
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
N
 
H
E
 
P
A
 
G
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
D
C
 
T
F
 
Y
T
 
V
T
 
S
P
 
P
A
 
Q
A
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
Q
Y
 
Y
D
 
E
V
 
W
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
-
L
 
-
G
 
D
V
 
R
Q
 
P
G
 
A
R
 
R
E
 
E
K
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
T
 
G
L
 
A
I
 
R
E
 
R
A
 
M
R
 
R
Q
 
E
R
 
A
D
 
G
A
 
G
R
 
Y
I
 
V
V
 
L
F
 
F
D
 
D
N
 
V
N
 
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
x
M
W
 
W
A
 
G
S
 
N
I
 
T
E
 
D
E
 
E
A
 
I
Q
 
P
A
 
E
A
 
L
Y
 
I
R
 
A
N
 
R
V
 
S
L
 
A
P
 
A
Y
 
L
I
 
A
D
 
S
L
 
I
A
 
C
L
 
K
L
 
V
T
 
S
V
 
A
D
 
D
D
 
E
E
 
L
Q
 
C
A
 
Q
L
 
L
F
 
S
H
 
G
F
 
A
S
 
S
D
 
H
C
 
W
A
 
Q
A
 
D
V
 
A
F
 
R
A
 
Y
A
 
Y
Y
 
L
E
 
R
Q
 
D
M
 
L
G
 
G
T
 
C
P
 
D
E
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
K
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
-
 
G
A
 
A
C
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
T
C
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
-
F
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
P
V
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
-
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
Y
 
L
L
 
L

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
26% identity, 72% coverage: 60:283/310 of query aligns to 55:268/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
V
 
I
T
 
S
A
 
C
L
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
S
 
G
F
 
F
S
 
G
D
 
D
A
 
I
M
 
N
C
 
I
Q
 
H
S
 
R
W
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
D
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
I
D
 
R
M
 
G
V
 
I
Q
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
L
R
 
E
L
 
A
P
 
T
G
 
G
L
 
S
Y
 
A
C
 
F
I
 
V
Q
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
T
A
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
R
R
 
D
F
 
F
F
 
I
Y
 
F
W
 
N
R
 
I
N
 
K
E
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
C
F
 
G
T
 
K
T
 
L
P
 
S
A
 
A
A
 
Q
A
 
H
P
 
V
I
 
D
L
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
D
Y
 
C
D
 
T
V
 
H
L
 
F
Y
 
H
F
 
I
S
 
M
G
 
G
I
 
S
T
 
S
L
 
L
A
 
F
V
 
S
L
 
F
G
 
H
V
 
M
Q
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
V
K
 
K
L
 
K
L
 
A
E
 
V
T
 
T
L
 
I
I
 
V
E
 
K
A
 
A
R
 
N
Q
 
-
R
 
-
D
 
G
A
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
P
N
|
N
Y
 
I
R
 
R
P
 
K
R
 
E
L
 
M
W
 
L
A
 
-
S
 
D
I
 
I
E
 
P
E
 
E
A
 
M
Q
 
R
A
 
D
A
 
A
Y
 
L
R
 
H
N
 
F
V
 
V
L
 
L
P
 
E
Y
 
L
I
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
Y
L
 
M
L
 
P
T
x
S
V
 
E
D
 
G
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
L
L
 
L
F
 
S
H
 
P
F
 
H
S
 
S
D
 
T
C
 
P
A
 
E
A
 
R
V
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
E
 
L
Q
 
E
M
 
E
G
 
G
T
 
V
P
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
V
K
|
K
R
|
R
G
|
G
A
x
N
E
 
Q
A
x
G
C
 
A
L
 
S
I
 
Y
H
 
Y
C
 
S
D
 
A
G
 
N
E
 
E
S
 
Q
F
 
F
E
 
H
V
 
V
P
 
E
A
 
S
Q
x
Y
V
 
P
V
|
V
E
 
E
R
x
E
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
C
F
|
F
S
 
G
A
 
G
A
 
A
Y
 
W
L
 
I
A
 
A
C
 
C
R
 
R
L
 
Q
K
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
26% identity, 85% coverage: 13:277/310 of query aligns to 2:248/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
R
 
K
I
 
V
A
 
W
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
x
D
C
 
A
M
x
S
I
 
V
E
x
D
L
 
L
Q
 
V
Q
 
P
R
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
N
T
 
S
L
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
S
x
C
F
 
P
G
|
G
G
|
G
D
x
A
T
 
S
L
 
A
N
|
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
Y
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
L
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
C
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
T
 
G
A
 
C
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
D
F
 
A
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
L
C
 
R
Q
 
Q
S
 
V
W
 
F
A
 
Q
S
 
D
E
 
N
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
T
M
 
F
V
 
L
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
P
 
D
G
 
A
R
 
D
L
 
L
P
 
T
G
 
S
L
 
A
Y
 
V
C
x
L
I
 
I
Q
 
V
T
 
N
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
S
F
|
F
F
 
T
Y
|
Y
W
 
L
R
 
V
N
 
H
E
 
P
A
 
G
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
D
C
 
T
F
 
Y
T
 
V
T
 
S
P
 
P
A
 
Q
A
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
P
L
 
F
P
 
R
D
 
Q
Y
 
Y
D
 
E
V
 
W
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
-
L
 
-
G
 
D
V
 
R
Q
 
P
G
 
A
R
 
R
E
 
E
K
 
A
L
 
C
L
 
L
E
 
E
T
 
G
L
 
A
I
 
R
E
 
R
A
 
M
R
 
R
Q
 
E
R
 
A
D
 
G
A
 
G
R
 
Y
I
 
V
V
 
L
F
 
F
D
|
D
N
 
V
N
|
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
S
R
 
K
L
x
M
W
 
W
A
 
G
S
 
N
I
 
T
E
 
D
E
 
E
A
 
I
Q
 
P
A
 
E
A
 
L
Y
 
I
R
 
A
N
 
R
V
 
S
L
 
A
P
 
A
Y
 
L
I
 
A
D
 
S
L
 
I
A
 
C
L
x
K
L
 
V
T
x
S
V
 
A
D
 
D
D
x
E
E
 
L
Q
 
C
A
 
Q
L
 
L
F
 
S
H
 
G
F
 
A
S
 
S
D
 
H
C
 
W
A
 
Q
A
 
D
V
 
A
F
 
R
A
 
Y
A
 
Y
Y
 
L
E
 
R
Q
 
D
M
 
L
G
 
G
T
 
C
P
 
D
E
 
T
V
 
T
V
 
I
L
 
I
K
x
S
R
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
D
-
x
G
A
 
A
C
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
T
C
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
-
F
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
|
A
Q
 
P
V
 
R
V
|
V
E
 
D
R
 
-
V
|
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
Y
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
23% identity, 85% coverage: 13:277/310 of query aligns to 3:256/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
R
 
R
I
 
V
A
 
W
L
 
L
I
 
T
G
 
G
E
x
D
C
 
A
M
x
V
I
 
V
E
x
D
L
 
L
Q
 
I
Q
 
P
R
 
D
A
 
G
D
 
Q
G
 
Q
T
 
H
L
 
Y
Q
 
L
Q
 
K
S
 
C
F
 
P
G
|
G
G
|
G
D
x
A
T
 
P
L
 
A
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
L
L
 
S
G
 
G
D
 
R
G
 
S
G
 
A
T
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
F
V
 
F
T
 
G
A
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
N
D
 
D
S
 
P
F
 
F
S
 
G
D
 
R
A
 
F
M
 
M
C
 
Q
Q
 
Q
S
 
T
W
 
L
A
 
T
S
 
D
E
 
E
N
 
Q
I
 
V
G
 
D
L
 
C
D
 
Q
M
 
H
V
 
L
Q
 
H
R
 
F
L
 
D
P
 
P
G
 
V
R
 
H
L
 
R
P
 
T
G
 
S
L
 
T
Y
x
V
C
 
V
I
 
V
Q
 
D
T
 
L
D
 
D
A
 
E
A
x
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
S
F
|
F
F
 
T
Y
x
F
W
 
M
R
 
V
N
 
K
E
 
P
A
 
S
A
 
A
V
 
-
R
 
-
D
 
D
C
 
Q
F
 
F
T
 
L
T
 
Q
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
A
 
S
A
 
D
L
 
I
P
 
P
D
 
S
Y
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
D
 
E
V
 
W
L
 
L
Y
 
H
F
 
V
S
 
C
G
 
S
I
|
I
T
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
-
L
 
-
G
 
N
V
 
Q
Q
 
P
G
 
S
R
 
R
E
 
S
K
 
S
L
 
T
L
 
F
E
 
A
T
 
A
L
 
I
I
 
A
E
 
Q
A
 
M
R
 
K
Q
 
E
R
 
V
D
 
G
A
 
G
R
 
Y
I
 
V
V
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
P
N
|
N
Y
 
L
R
|
R
P
 
E
R
 
E
L
 
V
W
 
W
A
 
S
S
 
E
I
 
P
E
 
Q
E
 
E
A
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
R
 
M
N
 
R
V
 
A
L
 
V
P
 
G
Y
 
L
I
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
L
 
K
L
 
F
T
 
S
V
 
E
D
 
E
D
 
E
E
 
L
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
F
 
T
H
 
G
F
 
T
S
 
Q
D
 
S
C
 
I
A
 
E
A
 
E
V
 
G
F
 
L
A
 
Q
A
 
A
Y
 
I
E
 
A
Q
 
D
M
 
F
G
 
Q
T
 
I
P
 
P
E
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
V
K
x
T
R
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
K
A
x
G
C
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
A
C
 
T
D
 
P
G
 
N
E
 
S
S
 
Q
F
 
Q
E
 
I
V
 
V
P
 
S
A
 
G
Q
 
K
V
x
A
V
|
V
E
 
-
R
 
K
V
x
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
Y
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
23% identity, 87% coverage: 13:283/310 of query aligns to 2:268/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
R
 
K
I
 
L
A
 
I
L
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
E
C
 
I
M
x
L
I
 
I
E
 
E
L
 
F
Q
 
N
Q
 
A
R
 
L
A
 
S
D
 
P
G
 
G
T
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
Q
 
E
Q
 
K
S
 
H
F
 
V
G
x
A
G
|
G
D
x
S
T
 
E
L
 
A
N
|
N
T
 
Y
A
 
C
V
 
V
Y
 
A
L
 
F
A
 
I
R
 
K
E
 
Q
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
N
T
 
E
V
 
C
D
 
G
Y
 
I
V
 
I
T
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
S
 
E
F
 
F
S
 
G
D
 
Y
A
 
N
M
 
A
C
 
I
Q
 
E
S
 
W
W
 
L
A
 
R
S
 
G
E
 
Q
N
 
G
I
 
V
G
 
D
L
 
V
D
 
S
M
 
H
V
 
M
Q
 
K
R
 
I
L
 
D
P
 
P
G
 
S
R
 
A
L
 
P
P
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
x
F
C
 
F
I
 
I
Q
 
Q
T
 
R
D
 
H
-
 
Y
-
 
P
A
 
V
A
 
P
G
 
L
E
 
K
R
 
S
R
 
E
F
 
S
F
 
I
Y
|
Y
W
 
Y
R
|
R
N
 
K
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
G
R
 
S
D
 
K
C
 
L
F
 
S
T
 
P
T
 
E
P
 
D
A
 
V
A
 
D
A
 
E
P
 
E
I
 
Y
L
 
V
A
 
K
A
 
S
L
 
A
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
V
 
L
L
 
V
Y
 
H
F
 
S
S
 
S
G
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
-
G
 
S
V
 
S
Q
 
T
G
 
A
R
 
K
E
 
E
K
 
A
L
 
V
L
 
Y
E
 
K
T
 
A
L
 
F
I
 
E
E
 
I
A
 
A
R
 
S
Q
 
N
R
 
R
D
 
S
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
F
 
F
D
 
D
N
 
T
N
 
N
Y
 
I
R
|
R
P
 
L
R
 
K
L
 
L
W
 
W
A
 
-
S
 
S
I
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
A
 
E
Y
 
I
R
 
L
N
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
S
Y
 
K
I
 
F
D
 
H
L
 
L
A
 
K
L
 
F
L
 
L
T
 
I
V
 
T
D
|
D
-
 
T
-
 
D
D
 
D
E
 
S
Q
 
K
A
 
I
L
 
I
F
 
L
H
 
G
F
 
E
S
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
K
C
 
A
A
 
A
A
 
K
V
 
A
F
 
F
A
 
S
A
 
D
Y
 
Y
E
 
A
Q
 
E
M
 
I
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
I
V
 
V
L
 
M
K
|
K
R
x
L
G
|
G
A
x
P
E
 
K
A
x
G
C
 
A
L
 
I
I
 
V
H
 
Y
C
 
Y
D
 
D
G
 
G
E
 
K
S
 
K
F
 
Y
E
 
Y
V
 
S
P
 
S
A
 
G
Q
x
Y
V
 
Q
V
 
V
E
 
P
R
 
-
V
|
V
V
 
E
D
 
D
T
x
V
T
|
T
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
x
L
S
 
G
A
 
G
A
 
T
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
C
 
L
R
 
Y
L
 
Y
K
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
26% identity, 72% coverage: 54:277/310 of query aligns to 43:260/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
G
 
G
G
 
G
T
 
A
V
 
V
D
 
Q
Y
 
F
V
 
V
T
 
G
A
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
S
D
 
D
S
 
M
F
 
F
S
 
G
D
 
D
A
 
F
M
 
L
C
 
F
Q
 
D
S
 
S
W
 
F
A
 
A
S
 
E
E
 
A
N
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
T
D
 
D
M
 
G
V
 
I
Q
 
V
R
 
R
L
 
T
P
 
S
G
 
T
R
 
A
L
 
K
P
 
T
G
 
A
L
 
L
Y
 
A
C
 
F
I
 
V
Q
 
A
T
 
L
D
 
D
A
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
S
F
 
F
F
 
S
Y
 
F
W
 
Y
R
 
R
N
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
C
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
P
A
 
P
A
 
A
A
 
A
P
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
F
A
 
R
L
 
V
P
 
E
D
 
H
Y
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
S
D
 
D
V
 
A
L
 
L
Y
 
I
F
 
F
S
 
H
G
 
A
I
 
C
T
 
S
L
 
N
A
 
S
V
 
M
L
 
T
G
 
D
V
 
A
Q
 
D
G
 
I
R
 
A
E
 
E
K
 
V
L
 
T
L
 
F
E
 
E
T
 
G
L
 
M
I
 
R
E
 
R
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
R
 
A
D
 
G
A
 
A
R
 
I
I
 
V
V
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
L
N
 
N
Y
 
F
R
|
R
P
 
P
R
 
M
L
 
L
W
 
W
A
 
P
S
 
N
I
 
G
E
 
E
E
 
N
A
 
P
Q
 
A
A
 
S
A
 
R
Y
 
L
R
 
W
N
 
K
V
 
G
L
 
L
P
 
S
Y
 
L
I
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
L
x
K
L
 
L
T
 
S
V
 
S
D
 
E
D
 
E
E
 
L
Q
 
D
A
 
Y
L
 
L
F
 
A
H
 
N
F
 
T
-
 
L
-
 
A
S
 
A
D
 
D
C
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
V
F
 
I
A
 
Q
A
 
Q
Y
 
L
E
 
W
Q
 
Q
M
 
G
G
 
R
T
 
A
P
 
Q
E
 
L
V
 
L
V
 
L
L
 
V
K
x
T
R
x
D
G
x
A
A
|
A
E
 
G
A
 
P
C
x
V
L
 
H
I
 
W
H
 
Y
C
 
T
D
 
R
G
 
T
E
 
A
S
 
G
F
 
G
E
 
E
V
 
V
P
 
P
A
x
T
Q
x
F
V
 
R
V
|
V
E
 
Q
R
 
-
V
|
V
V
 
Q
D
 
D
T
 
S
T
 
N
A
|
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
S
 
V
A
 
G
A
 
G
Y
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
24% identity, 89% coverage: 32:306/310 of query aligns to 34:294/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
L
 
I
Q
 
A
Q
 
M
S
 
T
F
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
A
L
 
I
N
 
N
T
 
E
A
 
A
V
 
T
Y
 
I
L
 
I
A
 
S
R
 
R
E
 
L
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
H
T
 
R
V
 
T
D
 
A
Y
 
L
V
 
M
T
 
S
A
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
K
D
 
D
S
 
A
F
 
A
S
 
G
D
 
Q
A
 
F
M
 
I
C
 
L
Q
 
D
S
 
H
W
 
C
A
 
R
S
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
G
 
D
L
 
I
D
 
Q
M
 
S
V
 
L
Q
 
K
R
 
Q
L
 
D
P
 
V
G
 
S
R
 
I
L
 
D
P
 
T
G
 
S
L
 
I
Y
 
N
C
 
V
I
 
G
Q
 
L
T
 
V
D
 
T
A
 
E
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
|
R
R
 
T
F
 
F
F
 
V
Y
 
T
W
 
N
R
 
R
N
 
N
E
 
G
A
 
S
A
 
L
V
 
W
R
 
K
D
 
-
C
 
-
F
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
N
L
 
I
P
 
D
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
F
L
 
A
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
G
 
Q
I
 
A
T
 
K
L
 
L
A
 
L
V
 
S
L
 
L
G
 
A
V
 
S
Q
 
I
G
 
F
R
 
N
E
 
S
K
 
P
L
 
L
L
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
T
E
 
E
T
 
I
L
 
F
I
 
T
E
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
R
 
R
D
 
Q
A
 
M
R
 
I
I
 
I
V
 
C
F
 
A
D
 
D
N
 
M
N
 
-
Y
 
I
R
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
W
 
N
A
 
E
S
 
T
I
 
L
E
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
C
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
A
 
Y
Y
 
V
R
 
D
N
 
Y
V
 
L
L
 
F
P
 
P
-
x
N
Y
 
F
I
 
A
D
 
E
L
 
A
A
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
-
D
 
-
D
 
G
E
 
K
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
F
 
D
H
 
E
F
 
I
S
 
A
D
 
D
C
 
C
A
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
L
Q
 
A
M
 
C
G
 
G
T
 
V
P
 
K
E
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
I
K
|
K
R
x
T
G
|
G
A
x
K
E
 
D
A
x
G
C
 
C
L
 
F
I
 
I
H
 
K
C
 
R
D
 
G
G
 
D
E
 
M
S
 
T
F
 
M
E
 
K
V
 
V
P
 
P
A
|
A
Q
 
V
V
 
A
V
 
G
E
x
I
R
 
T
V
 
A
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
 
I
A
x
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
N
F
|
F
S
 
A
A
 
S
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
C
 
A
R
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
G
 
K
S
 
N
P
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
C
A
 
A
E
 
R
A
 
F
G
 
A
H
x
N
R
 
A
L
 
T
A
|
A
S
 
A
R