SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_5803 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5803 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2azqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas arvilla c-1 (see paper)
67% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 1:308/309 of 2azqA

query
sites
2azqA
V
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
S
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
D
A
 
I
Q
 
Q
K
 
A
F
 
F
L
 
F
E
 
N
D
 
Q
A
 
V
S
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
D
N
 
H
E
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
R
V
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
I
 
I
Y
 
L
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
Q
D
 
D
S
 
T
V
 
A
N
 
R
I
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
E
E
 
D
E
 
E
F
 
F
W
 
W
K
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
R
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
H
 
H
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
E
 
K
D
 
D
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
L
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
V
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
D
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
M
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
F
N
 
D
T
 
A
A
 
N
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
S
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
I
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
D
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
C
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
S
 
S
A
 
A
P
 
F
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
F
D
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
H
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
K
 
E
I
 
L
T
 
R
F
 
F
S
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
A
Q
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
D
H
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
Q
G
 
G
-
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
F
T
 
R
L
 
L
Q
 
Q
S
 
G
S
 
A
A
 
Q
Q
 
S
P
 
P
E
 
D
E
 
A
Q
 
E
Q
 
A
R
 
R
H
 
S
E
 
H
R
 
R
V
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
E

P07773 Catechol 1,2-dioxygenase; 1,2-CTD; EC 1.13.11.1 from Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) (see paper)
56% identity, 99% coverage: 1:305/309 of query aligns to 1:308/311 of P07773

query
sites
P07773
M
 
M
N
 
E
V
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
F
H
 
N
T
 
T
A
 
Q
S
 
D
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
R
D
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
H
 
E
N
 
Q
E
 
E
A
 
G
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
I
 
I
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
S
D
 
D
S
 
L
V
 
Y
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
V
 
I
T
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
V
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
R
 
F
N
 
D
T
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
G
 
N
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
E
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
|
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
T
H
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
K
 
D
I
 
A
T
 
V
F
 
E
S
 
H
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
R
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
D
V
 
V
S
 
E
G
 
G
R
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
Q
 
T
S
 
R
S
 
L
A
 
V
Q
 
D
P
 
G
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
V
H
 
V
E
 
D
R
 
R
V
 
P
R
 
R

1dmhA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound 4-methylcatechol (see paper)
56% identity, 98% coverage: 3:305/309 of query aligns to 1:306/309 of 1dmhA

query
sites
1dmhA
V
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
F
H
 
N
T
 
T
A
 
Q
S
 
D
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
R
D
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
H
 
E
N
 
Q
E
 
E
A
 
G
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
I
 
I
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
S
D
 
D
S
 
L
V
 
Y
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
V
 
I
T
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
|
L
V
 
L
V
 
S
A
x
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
V
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
R
 
F
N
 
D
T
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
G
 
N
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
E
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
T
H
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
K
 
D
I
 
A
T
 
V
F
 
E
S
 
H
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
R
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
D
V
 
V
S
 
E
G
 
G
R
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
Q
 
T
S
 
R
S
 
L
A
 
V
Q
 
D
P
 
G
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
V
H
 
V
E
 
D
R
 
R
V
 
P
R
 
R

1dltA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound catechol (see paper)
56% identity, 98% coverage: 3:305/309 of query aligns to 1:306/309 of 1dltA

query
sites
1dltA
V
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
F
H
 
N
T
 
T
A
 
Q
S
 
D
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
R
D
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
H
 
E
N
 
Q
E
 
E
A
 
G
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
I
 
I
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
S
D
 
D
S
 
L
V
 
Y
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
V
 
I
T
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
V
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
R
 
F
N
 
D
T
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
G
 
N
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
E
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
T
H
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
K
 
D
I
 
A
T
 
V
F
 
E
S
 
H
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
R
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
D
V
 
V
S
 
E
G
 
G
R
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
Q
 
T
S
 
R
S
 
L
A
 
V
Q
 
D
P
 
G
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
V
H
 
V
E
 
D
R
 
R
V
 
P
R
 
R

1dlmA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter calcoaceticus native data (see paper)
56% identity, 98% coverage: 3:305/309 of query aligns to 1:306/309 of 1dlmA

query
sites
1dlmA
V
 
V
K
 
K
I
 
I
S
 
F
H
 
N
T
 
T
A
 
Q
S
 
D
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
R
D
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
H
 
E
N
 
Q
E
 
E
A
 
G
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
A
 
Q
L
 
I
I
 
I
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
S
D
 
D
S
 
L
V
 
Y
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
V
 
I
T
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
E
 
Y
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
V
 
H
V
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
R
 
F
N
 
D
T
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
G
 
N
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
E
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
V
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
V
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
A
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
T
H
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
K
 
D
I
 
A
T
 
V
F
 
E
S
 
H
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
R
 
A
A
 
I
A
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
D
V
 
V
S
 
E
G
 
G
R
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
I
 
M
D
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
Q
 
T
S
 
R
S
 
L
A
 
V
Q
 
D
P
 
G
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
V
H
 
V
E
 
D
R
 
R
V
 
P
R
 
R

5umhB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase protein from burkholderia multivorans
52% identity, 100% coverage: 2:309/309 of query aligns to 1:309/310 of 5umhB

query
sites
5umhB
N
 
S
V
 
V
K
 
K
I
 
V
S
 
F
H
 
D
T
 
T
A
 
K
S
 
E
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
N
L
 
L
H
 
N
N
 
G
E
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
F
K
 
R
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
Y
 
H
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
S
D
 
D
S
 
L
V
 
F
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
D
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
D
V
 
A
D
 
D
P
 
A
G
 
G
V
 
-
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
R
 
T
N
 
G
T
 
T
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
G
 
K
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
E
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
V
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
L
L
 
I
H
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
K
 
H
I
 
V
T
 
V
F
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
D
P
 
K
Q
 
T
R
 
G
A
 
G
A
 
A
A
 
A
H
 
L
G
 
G
V
 
M
-
 
K
S
 
S
G
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
I
T
 
V
L
 
L
Q
 
T
S
 
P
S
 
L
A
 
L
Q
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
V
H
 
V
E
 
H
R
 
R
V
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
S
E
 
A
D
 
D

5td3A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia vietnamiensis
50% identity, 98% coverage: 3:306/309 of query aligns to 1:305/307 of 5td3A

query
sites
5td3A
V
 
I
K
 
K
I
 
V
S
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
R
S
 
E
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
S
L
 
A
H
 
N
N
 
A
E
 
S
A
 
T
G
 
G
D
 
D
P
 
A
R
 
R
V
 
T
K
 
Q
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
Y
 
L
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
G
D
 
D
S
 
L
V
 
F
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
D
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
D
 
D
E
 
A
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
V
 
A
D
 
D
P
 
A
G
 
G
V
 
A
-
 
G
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
R
 
K
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
G
 
H
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
R
E
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
V
 
R
T
 
T
D
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
R
 
A
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
I
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
L
L
 
I
H
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
K
 
P
I
 
V
T
 
T
F
 
T
S
 
K
D
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
T
R
 
G
A
 
G
A
 
A
A
 
A
H
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
K
G
 
A
-
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
Q
E
 
D
I
 
I
D
 
T
F
 
F
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
A
 
V
Q
 
G
P
 
G
E
 
A
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
I
H
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
P
R
 
R
A
 
A

2xsrA Crystal structure of wild type acinetobacter radioresistens catechol 1,2 dioxygenase (see paper)
52% identity, 91% coverage: 27:306/309 of query aligns to 26:307/309 of 2xsrA

query
sites
2xsrA
D
 
D
P
 
E
R
 
R
V
 
I
K
 
Q
A
 
Q
L
 
V
I
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
G
D
 
D
S
 
L
V
 
F
N
 
Q
I
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
V
 
I
T
 
Q
P
 
P
E
 
S
E
 
E
F
 
V
W
 
W
K
 
K
A
 
G
V
 
L
N
 
E
Y
|
Y
L
|
L
N
 
T
V
x
D
L
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
A
Q
 
N
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
x
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
R
M
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
A
D
 
D
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
S
 
S
E
 
V
G
 
G
E
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
E
P
 
S
G
 
D
V
 
K
V
 
V
-
 
D
-
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
T
A
 
E
G
 
G
E
 
N
P
 
I
L
 
I
A
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
G
 
L
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
T
 
K
T
 
S
Q
 
Q
S
 
S
E
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
T
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
V
F
 
A
R
 
L
S
 
T
I
 
T
V
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
x
T
T
 
T
Q
 
Q
Q
x
A
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
S
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
Y
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
L
H
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
A
T
 
T
F
 
D
S
 
V
D
 
T
D
 
D
P
 
E
Q
 
A
R
 
E
A
 
I
A
 
A
A
 
R
H
 
R
G
 
E
V
 
L
S
 
D
G
 
K
R
 
P
F
 
F
A
 
K
E
 
H
I
 
I
D
 
T
F
 
F
D
 
N
F
 
V
T
 
E
L
 
L
Q
 
V
S
 
K
S
 
E
A
 
A
Q
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
P
Q
 
S
Q
 
S
R
 
E
H
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
R
R
 
R
A
 
A

5vxtB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia ambifaria
51% identity, 99% coverage: 1:306/309 of query aligns to 5:309/312 of 5vxtB

query
sites
5vxtB
M
 
M
N
 
S
V
 
V
K
 
K
I
 
V
S
 
F
H
 
D
T
 
T
A
 
K
S
 
E
A
 
V
Q
 
Q
K
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
N
L
 
A
H
 
G
N
 
A
E
 
G
A
 
N
G
 
A
D
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
T
K
 
Q
A
 
Q
L
 
I
I
 
V
Y
 
H
R
 
R
I
 
L
L
 
L
R
 
G
D
 
D
S
 
L
V
 
F
N
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
D
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
V
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
I
G
 
G
K
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
V
 
A
D
 
D
P
 
E
G
 
G
V
 
A
-
 
G
V
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
R
 
T
N
 
G
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
G
 
H
G
 
G
T
 
F
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
K
Q
 
Q
S
 
S
E
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
V
 
K
T
 
T
D
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
V
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
I
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
D
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
L
L
 
I
H
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
K
 
P
I
 
V
T
 
T
F
 
A
S
 
K
D
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
A
R
 
G
A
 
G
A
 
A
A
 
A
H
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
K
G
 
A
-
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
Q
E
 
D
I
 
I
D
 
E
F
 
F
D
 
N
F
 
F
T
 
V
L
 
L
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
A
 
V
Q
 
E
P
 
G
E
 
K
E
 
D
Q
 
N
Q
 
Q
R
 
I
H
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
R
A
 
A

3o6rA Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with pyrogallol (see paper)
35% identity, 83% coverage: 34:290/309 of query aligns to 5:254/256 of 3o6rA

query
sites
3o6rA
I
 
V
Y
 
I
R
 
E
I
 
L
L
 
F
R
 
D
D
 
E
S
 
F
V
 
T
N
 
D
I
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
D
L
 
F
A
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
E
-
 
I
T
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
K
 
T
A
 
I
V
 
M
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
N
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
-
V
 
-
V
 
E
A
 
W
G
 
P
L
 
L
G
 
W
L
 
L
E
 
D
H
 
A
Y
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
L
 
T
M
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
V
D
 
-
E
 
-
Q
 
S
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
F
Y
 
F
V
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
T
G
 
G
E
 
K
-
 
P
A
 
A
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
V
 
A
D
 
D
-
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
D
V
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
R
 
R
N
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
F
F
 
F
D
 
S
T
 
P
T
 
A
-
 
L
Q
 
P
S
 
D
E
 
Q
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
T
 
P
D
 
A
A
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
I
 
I
V
 
R
P
 
P
S
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
 
I
P
 
P
P
 
K
D
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
M
D
 
N
Q
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
I
 
I
S
 
T
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
Y
R
 
R
H
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
L
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
Y
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
L
K
 
P
I
 
V
T
 
N
F
 
K
S
 
I
D
 
D
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
I
S
 
D
G
 
G
R
 
E
-
 
T
F
 
W
A
 
Q
E
 
L
I
 
V
D
 
D
F
 
F
D
 
N
F
 
F
T
 
I
L
 
L
Q
 
Q

3o6jA Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with hydroxyquinol (see paper)
35% identity, 83% coverage: 34:290/309 of query aligns to 5:254/256 of 3o6jA

query
sites
3o6jA
I
 
V
Y
 
I
R
 
E
I
 
L
L
 
F
R
 
D
D
 
E
S
 
F
V
 
T
N
 
D
I
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
D
L
 
F
A
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
E
-
 
I
T
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
K
 
T
A
 
I
V
 
M
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
N
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
-
V
 
-
V
 
E
A
 
W
G
 
P
L
 
L
G
 
W
L
 
L
E
 
D
H
 
A
Y
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
L
 
T
M
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
V
D
 
-
E
 
-
Q
 
S
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
T
G
 
G
E
 
K
-
 
P
A
 
A
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
V
 
A
D
 
D
-
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
D
V
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
R
 
R
N
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
F
F
 
F
D
 
S
T
 
P
T
 
A
-
 
L
Q
 
P
S
 
D
E
 
Q
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
T
 
P
D
 
A
A
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
I
 
I
V
 
R
P
 
P
S
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
 
I
P
 
P
P
 
K
D
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
M
D
 
N
Q
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
I
 
I
S
 
T
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
Y
R
 
R
H
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
L
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
Y
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
L
K
 
P
I
 
V
T
 
N
F
 
K
S
 
I
D
 
D
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
I
S
 
D
G
 
G
R
 
E
-
 
T
F
 
W
A
 
Q
E
 
L
I
 
V
D
 
D
F
 
F
D
 
N
F
 
F
T
 
I
L
 
L
Q
 
Q

3o32A Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
35% identity, 83% coverage: 34:290/309 of query aligns to 5:254/256 of 3o32A

query
sites
3o32A
I
 
V
Y
 
I
R
 
E
I
 
L
L
 
F
R
 
D
D
 
E
S
 
F
V
 
T
N
 
D
I
 
L
I
 
I
E
 
R
D
 
D
L
 
F
A
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
E
-
 
I
T
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
K
 
T
A
 
I
V
 
M
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
N
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
-
V
 
-
V
 
E
A
 
W
G
 
P
L
 
L
G
 
W
L
 
L
E
x
D
H
x
A
Y
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
L
 
T
M
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
V
D
 
-
E
 
-
Q
 
S
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
G
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
F
Y
 
F
V
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
T
G
 
G
E
 
K
-
 
P
A
 
A
R
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
M
G
 
R
V
 
A
D
 
D
-
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
D
V
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
R
 
R
N
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
F
F
 
F
D
 
S
T
 
P
T
 
A
-
 
L
Q
 
P
S
 
D
E
 
Q
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
T
 
P
D
 
A
A
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
I
 
I
V
 
R
P
 
P
S
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
 
I
P
 
P
P
 
K
D
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
M
D
 
N
Q
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
I
 
I
S
 
T
A
 
A
P
 
D
D
 
G
H
 
Y
R
 
R
H
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
L
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
Y
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
L
K
 
P
I
 
V
T
 
N
F
 
K
S
 
I
D
 
D
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
I
S
 
D
G
 
G
R
 
E
-
 
T
F
 
W
A
 
Q
E
 
L
I
 
V
D
 
D
F
 
F
D
 
N
F
 
F
T
 
I
L
 
L
Q
 
Q

3th1A Crystal structure of chlorocatechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas putida
33% identity, 78% coverage: 27:266/309 of query aligns to 2:233/246 of 3th1A

query
sites
3th1A
D
 
D
P
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
A
A
 
E
L
 
V
I
 
A
Y
 
G
R
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
E
D
 
A
S
 
V
V
 
R
N
 
K
I
 
I
I
 
L
E
 
L
D
 
D
L
 
K
A
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
E
E
 
A
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
K
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
T
V
 
E
L
 
V
G
 
A
A
 
Q
R
 
T
Q
 
R
E
 
E
A
 
T
G
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
F
M
 
L
D
 
N
A
 
S
E
 
T
-
 
I
-
 
I
D
 
E
E
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
R
A
 
S
G
 
R
G
 
T
T
 
S
P
 
A
R
 
P
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
F
V
 
L
A
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
V
A
 
L
R
 
K
L
 
T
D
 
Y
D
 
D
G
 
-
V
 
T
D
 
D
P
 
D
G
 
H
V
 
K
V
 
P
L
 
L
F
 
I
M
 
I
Q
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
S
T
 
D
A
 
T
G
 
G
E
 
E
P
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
T
 
P
G
 
D
G
 
G
T
 
L
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
G
F
 
I
D
 
H
T
 
D
T
 
N
Q
 
I
S
 
P
E
 
V
F
 
D
N
 
Y
L
 
Y
R
 
R
R
 
G
R
 
K
I
 
L
V
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
R
 
N
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
T
V
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
Y
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
S
H
 
H
G
 
T
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
K
I
 
V
S
 
R
A
 
K
P
 
D
D
 
G
H
 
F
R
 
E
H
 
P
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
Y
N
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
G
D
 
G
Q
 
K
Y
 
W
L
 
V
H
 
D
D
 
D
D
 
D
F
 
C
A
 
C
Y
 
H
A
 
G
T
 
V
R
 
T
D
 
P
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
T
K
 
P
I
 
E
T
 
T
F
 
I
S
 
E
D
 
D

3hgiA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from the gram-positive rhodococcus opacus 1cp (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 56:244/258 of 3hgiA

query
sites
3hgiA
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
|
H
A
|
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

3i51A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4,5-dichlorocatechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3i51A

query
sites
3i51A
Y
 
F
L
 
L
D
|
D
L
x
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

3i4yA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3i4yA

query
sites
3i4yA
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
x
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3i4vA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-chlorocatechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3i4vA

query
sites
3i4vA
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

3hjsA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4-methylcatechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3hjsA

query
sites
3hjsA
Y
 
F
L
 
L
D
|
D
L
x
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

3hjqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-methylcatechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3hjqA

query
sites
3hjqA
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
x
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

3hhyA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with catechol (see paper)
38% identity, 60% coverage: 83:267/309 of query aligns to 54:242/256 of 3hhyA

query
sites
3hhyA
Y
 
F
L
 
L
D
 
D
L
x
V
L
 
F
M
 
I
D
 
E
-
 
H
-
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
V
Q
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
S
A
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
S
 
L
E
 
P
G
 
S
E
 
K
A
 
C
R
 
T
L
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
E
D
 
D
D
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
T
P
 
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
T
N
 
D
T
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
G
 
D
G
 
G
T
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
Y
 
Q
F
 
F
D
 
A
T
 
P
T
 
H
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
Q
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
G
H
 
K
R
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
D
 
K
G
 
G
D
 
G
Q
 
E
Y
 
W
L
 
I
H
x
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
T
|
T
R
 
K
D
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
K
 
D
I
 
P
T
 
K
F
 
T
S
 
G
D
 
D
D
 
D

Query Sequence

>Pf1N1B4_5803 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_5803
MNVKISHTASAQKFLEDASGLHNEAGDPRVKALIYRILRDSVNIIEDLAVTPEEFWKAVN
YLNVLGARQEAGLVVAGLGLEHYLDLLMDAEDEQAGKAGGTPRTIEGPLYVAGAPLSEGE
ARLDDGVDPGVVLFMQGQVRNTAGEPLAGAVVDVWHANTGGTYSYFDTTQSEFNLRRRIV
TDAEGRYRFRSIVPSGYGCPPDGPTQQLLDQLGRHGQRPAHIHFFISAPDHRHLTTQINL
DGDQYLHDDFAYATRDELIAKITFSDDPQRAAAHGVSGRFAEIDFDFTLQSSAQPEEQQR
HERVRALED

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory