SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_771 Glutamate Aspartate periplasmic binding protein precursor GltI (TC 3.A.1.3.4) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
61% identity, 89% coverage: 29:298/304 of query aligns to 8:276/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
A
 
-
D
 
D
A
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
K
P
 
P
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
V
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
T
K
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
A
 
D
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
Q
S
 
S
N
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
A
 
P
P
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
A
A
 
Q
T
 
V
Y
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
M
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
F
A
 
K
N
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
A

2vhaA Debp (see paper)
61% identity, 89% coverage: 29:298/304 of query aligns to 7:275/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
A
 
-
D
 
D
A
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
K
P
 
P
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
V
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
T
K
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
A
 
D
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
Q
S
 
S
N
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
A
 
P
P
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
A
A
 
Q
T
 
V
Y
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
M
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
F
A
 
K
N
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
A

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
59% identity, 80% coverage: 29:272/304 of query aligns to 5:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
I
 
Y
A
 
-
D
 
D
A
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
N
M
 
K
P
 
P
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
V
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
 
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
D
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
T
K
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
A
 
D
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
G
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
 
M
D
|
D
D
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
Q
S
 
S
N
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
A
 
P
P
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
I
 
A
A
 
Q
T
 
V
Y
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
34% identity, 76% coverage: 37:268/304 of query aligns to 4:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
E
D
 
A
A
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
I
 
-
A
 
K
D
 
D
A
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
L
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
-
M
 
-
P
 
-
N
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
E
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
A
L
 
I
L
 
V
S
 
V
K
 
K
K
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
A
 
S
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
M
 
V
N
 
A
A
 
K
D
 
D
K
 
-
Q
 
-
M
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
K
V
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
A
G
 
L
E
 
A
M
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
K
 
N
K
 
P
P
 
N
T
 
A
D
 
G
W
 
V
A
 
K
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
E
A
 
T
Q
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
S
P
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
D
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
E
A
 
E
T
 
M
Y
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
34% identity, 76% coverage: 37:268/304 of query aligns to 4:223/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
E
D
 
A
A
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
I
 
-
A
 
K
D
 
D
A
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
L
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
-
M
 
-
P
 
-
N
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
E
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
A
L
 
I
L
 
V
S
 
V
K
 
K
K
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
A
 
S
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
M
 
V
N
 
A
A
 
A
D
 
-
K
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
M
 
V
N
 
K
V
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
A
G
 
L
E
 
A
M
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
K
 
N
K
 
P
P
 
N
T
 
A
D
 
G
W
 
V
A
 
K
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
E
A
 
T
Q
 
F
S
 
S
N
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
S
P
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
D
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
E
A
 
E
T
 
M
Y
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
34% identity, 66% coverage: 69:268/304 of query aligns to 41:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
L
 
V
K
 
D
I
 
I
V
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
T
K
 
K
D
 
K
L
 
I
D
 
L
M
 
G
P
 
D
N
 
N
L
 
G
Q
 
K
V
 
T
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
E
V
 
V
T
 
T
S
|
S
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
V
I
 
Y
F
 
F
E
 
D
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
V
K
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
Q
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
A
K
 
S
-
 
T
N
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
A
T
 
V
A
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
N
L
 
I
K
 
R
S
 
Q
M
 
H
N
 
A
A
 
P
D
 
D
K
 
A
Q
 
K
M
 
-
G
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
L
S
 
E
A
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
G
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
Q
 
T
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
M
M
 
T
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
I
A
 
A
K
 
D
K
 
E
P
 
N
T
 
P
D
 
E
W
 
Y
A
 
E
V
 
L
T
 
V
G
 
G
T
 
G
A
 
T
Q
 
F
S
 
T
N
 
N
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
Q
A
 
E
P
 
N
F
 
F
K
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
N
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
I
 
E
A
 
E
T
 
M
Y
 
H
K
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
29% identity, 78% coverage: 29:266/304 of query aligns to 3:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
T
 
T
L
 
V
K
 
A
K
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
S
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
H
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
I
 
V
A
 
-
D
 
D
A
 
A
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
N
V
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
-
D
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
V
K
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
K
A
 
D
I
 
L
K
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
L
M
 
G
P
 
S
N
 
P
L
 
D
Q
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
T
T
x
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
M
E
 
K
I
 
V
G
 
A
T
 
L
K
 
G
L
 
V
L
 
V
S
 
S
K
 
P
K
 
K
D
 
N
S
 
K
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
M
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
Q
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
A
E
 
D
R
 
A
I
 
F
L
 
F
K
 
T
S
 
K
M
 
S
N
x
H
A
 
P
D
x
E
K
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
-
M
 
V
N
 
K
V
 
L
I
 
L
S
 
K
A
 
F
K
x
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
S
 
T
F
 
F
Q
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
T
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
L
M
 
A
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
W
A
 
A
K
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
E
P
 
N
T
 
P
D
 
N
W
 
F
A
 
E
V
 
V
T
 
A
-
 
I
G
 
G
T
 
N
A
 
L
Q
 
G
S
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
F
Y
 
I
G
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
Q
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
A
P
 
D
F
 
L
K
 
L
K
 
N
A
 
W
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
T
 
M
Y
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
L
N
 
K
K
 
A
I
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
31% identity, 79% coverage: 29:268/304 of query aligns to 2:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
M
E
 
K
S
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
D
D
 
A
A
 
D
S
x
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
I
 
-
A
 
K
D
 
D
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
Y
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
L
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
V
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
D
 
-
M
 
-
P
 
-
N
 
G
L
 
V
Q
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
P
V
 
T
T
 
T
S
x
W
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
M
E
 
T
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
V
K
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
N
A
 
A
-
 
D
-
 
K
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
F
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
K
K
 
P
N
 
D
-
 
V
-
 
K
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
E
M
 
F
N
 
L
A
 
P
D
 
K
K
 
A
Q
 
K
M
 
-
G
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
R
S
 
T
A
 
F
K
 
E
D
 
N
H
 
N
G
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
V
E
 
V
T
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
-
M
 
M
M
 
V
D
 
T
D
|
D
A
 
S
L
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
M
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
L
K
 
A
K
 
V
P
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
V
V
 
V
T
 
V
G
 
D
T
 
E
A
 
P
Q
 
F
S
 
T
N
 
H
E
 
E
I
 
P
Y
 
L
G
 
G
C
 
F
M
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
P
P
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
N
A
 
W
V
 
V
D
 
N
D
 
N
A
 
W
I
 
L
I
 
K
A
 
Q
T
 
M
Y
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
28% identity, 79% coverage: 30:270/304 of query aligns to 3:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
K
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
S
S
 
R
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
T
 
L
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
S
D
 
A
A
 
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
I
 
V
A
 
-
D
 
D
A
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
N
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
L
 
K
K
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
R
A
 
R
I
 
L
K
 
G
K
 
V
D
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
I
P
 
V
N
 
D
L
 
M
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
T
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
V
V
 
V
D
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
D
I
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
V
L
 
I
L
 
V
S
 
V
K
 
R
K
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
D
Y
 
F
-
 
R
-
 
P
K
 
K
D
 
T
F
 
Y
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
D
R
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
I
N
 
E
A
 
V
D
 
S
K
 
K
Q
 
Y
M
 
D
G
 
G
M
 
I
N
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
G
 
T
E
 
D
S
 
A
F
 
F
Q
 
L
M
 
E
L
 
L
E
 
K
T
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
A
 
A
L
 
-
L
 
-
A
 
T
G
 
A
E
 
R
M
 
A
A
 
F
K
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
N
P
 
P
T
 
-
D
 
D
W
 
L
A
 
V
V
 
I
T
 
S
G
 
S
T
 
G
A
 
V
Q
 
L
S
 
S
N
 
S
E
 
E
I
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
T
P
 
D
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
F
V
 
I
D
 
N
D
 
S
A
 
V
I
 
L
I
 
R
A
 
E
T
 
L
Y
 
K
K
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
Y
N
 
D
K
 
V
I
 
L
Y
 
I
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
S
Q
 
E

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
28% identity, 79% coverage: 28:267/304 of query aligns to 1:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
G
 
G
T
 
K
L
 
L
K
 
E
K
 
S
I
 
I
K
 
K
E
 
S
S
 
K
G
 
G
T
 
Q
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
V
R
x
K
D
 
N
A
 
D
S
 
V
I
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
I
 
L
A
 
D
D
 
Q
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
K
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
H
 
V
D
 
D
I
 
V
Q
 
A
L
 
K
K
 
L
I
 
L
V
 
A
E
 
K
A
 
S
I
 
I
K
 
L
K
 
G
D
 
D
L
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
-
N
 
D
L
 
K
Q
 
K
V
 
I
K
 
K
Y
 
L
N
 
V
L
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
 
F
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
R
Q
 
I
V
 
Y
D
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
E
G
 
P
I
 
Y
F
 
Y
E
 
Q
I
 
D
G
 
A
T
 
I
K
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
V
K
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
K
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
D
 
S
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
M
K
 
K
G
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
I
-
 
G
V
 
V
T
 
A
T
 
Q
A
 
A
G
x
A
T
|
T
T
 
T
S
 
K
E
 
K
R
 
A
I
 
I
L
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
G
N
 
E
A
 
A
D
 
A
K
 
K
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
M
 
I
N
 
D
V
 
V
I
 
K
S
 
F
A
 
S
K
 
E
-
 
F
-
 
P
D
 
D
H
x
Y
G
 
P
E
 
S
S
 
I
F
 
K
Q
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
S
M
 
V
D
|
D
D
 
K
A
 
S
L
x
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
Y
M
 
V
A
 
D
K
 
D
A
 
K
K
 
S
K
 
E
P
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
I
T
 
L
G
 
P
T
 
D
A
 
S
Q
 
F
S
 
E
N
 
P
E
 
Q
I
 
S
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
V
V
 
T
R
 
K
K
 
K
G
 
D
D
 
D
A
 
P
P
 
A
F
 
F
K
 
A
K
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
-
I
 
F
I
 
V
A
 
K
T
 
E
Y
 
H
K
 
K
S
 
N
G
 
-
E
 
E
I
 
I
N
 
D
K
 
A
I
 
L
Y
 
A
E
 
K
K
 
K
W
 
W

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 24:274/304 of query aligns to 38:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
A
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
I
 
R
A
 
D
D
 
P
A
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
A
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
F
D
 
G
M
 
V
P
 
P
N
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
K
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
A
K
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
I
N
 
-
A
 
A
D
 
P
K
 
P
Q
 
P
M
 
V
G
 
I
M
 
V
N
 
S
V
 
V
I
 
V
S
 
N
A
x
W
K
 
A
D
 
D
H
 
C
G
 
L
E
 
V
S
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
Q
L
 
R
E
 
E
T
 
I
G
 
D
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
K
 
P
K
 
Y
P
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
L
A
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
D
Q
 
M
S
 
A
N
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
A
 
T
P
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
I
 
E
A
 
R
T
 
I
Y
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 24:274/304 of query aligns to 38:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
A
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
I
 
R
A
 
D
D
 
P
A
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
A
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
F
D
 
G
M
 
V
P
 
P
N
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
K
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
A
K
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
I
N
 
-
A
 
A
D
 
P
K
 
P
Q
 
P
M
 
V
G
 
I
M
 
V
N
 
S
V
 
V
I
 
V
S
 
N
A
x
W
K
 
A
D
 
D
H
 
C
G
 
L
E
 
V
S
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
Q
L
 
R
E
 
E
T
 
I
G
 
D
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
K
 
P
K
 
Y
P
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
L
A
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
D
Q
 
M
S
 
A
N
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
A
 
T
P
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
I
 
E
A
 
R
T
 
I
Y
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 24:274/304 of query aligns to 39:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
A
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
I
 
R
A
 
D
D
 
P
A
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
A
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
F
D
 
G
M
 
V
P
 
P
N
 
S
L
 
-
Q
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
I
 
A
G
 
N
T
 
Q
K
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
A
K
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
D
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
I
N
 
-
A
 
A
D
 
P
K
 
P
Q
 
P
M
 
V
G
 
I
M
 
V
N
 
S
V
 
V
I
 
V
S
 
N
A
x
W
K
 
A
D
 
D
H
 
C
G
 
L
E
 
V
S
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
Q
L
 
R
E
 
E
T
 
I
G
 
D
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
K
 
P
K
 
Y
P
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
L
A
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
A
 
D
Q
 
M
S
 
A
N
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
A
 
T
P
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
I
 
E
A
 
R
T
 
I
Y
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
28% identity, 77% coverage: 37:270/304 of query aligns to 1:224/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
M
G
 
G
H
 
T
R
x
S
D
 
A
A
x
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
I
 
H
A
 
K
D
 
V
A
 
E
S
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
D
-
 
E
-
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
A
 
K
I
 
L
K
 
G
K
 
V
D
 
K
L
 
L
D
 
E
M
 
I
P
 
K
N
 
D
L
 
M
Q
 
D
V
x
F
K
 
K
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
M
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
P
N
 
T
V
 
A
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
L
I
 
Y
F
 
Y
E
 
D
I
 
S
G
 
R
T
 
Q
K
 
V
L
 
V
L
 
V
S
 
V
K
 
K
K
 
N
D
 
D
S
 
S
A
 
P
Y
 
I
K
 
S
D
 
K
F
 
F
A
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
V
K
 
K
N
 
T
V
 
I
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
E
I
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
K
M
 
I
N
 
P
A
 
N
D
 
V
K
 
K
Q
 
L
M
 
K
G
 
Q
M
 
L
N
 
N
V
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
D
S
 
E
F
 
F
Q
 
M
M
 
D
L
 
L
E
 
Q
T
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
V
 
D
A
 
A
F
 
I
M
 
V
M
 
V
D
x
E
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
A
E
 
Y
M
 
L
A
 
K
K
 
E
A
 
Y
K
 
K
K
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
D
W
 
M
A
 
K
V
 
I
T
 
L
G
 
Y
T
 
M
A
 
D
Q
 
E
S
 
I
N
 
N
E
 
N
I
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
G
Y
 
S
G
 
A
C
 
V
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
K
P
 
S
F
 
L
K
 
L
K
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
N
D
 
E
A
 
V
I
 
I
I
 
K
A
 
E
T
 
L
Y
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
N
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
Q

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
26% identity, 78% coverage: 29:266/304 of query aligns to 6:232/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
T
 
S
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
V
T
 
R
L
 
I
G
 
G
H
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
I
 
V
A
 
-
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
N
P
 
N
V
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
L
K
 
-
I
 
-
V
 
A
E
 
K
A
 
R
I
 
I
K
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
L
D
 
F
M
 
G
P
 
D
N
 
E
L
 
N
Q
 
K
V
 
V
K
 
Q
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
F
V
 
L
Q
 
K
N
 
S
G
 
N
T
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
 
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
V
 
P
E
 
Q
R
|
R
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
C
V
 
S
G
 
P
I
 
Y
F
 
M
E
 
K
I
 
V
G
 
A
T
 
L
K
 
G
L
 
V
L
 
A
S
 
V
K
 
P
K
 
K
D
 
D
S
 
S
A
 
N
Y
 
I
K
 
T
D
 
S
F
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
D
K
 
K
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
L
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
A
E
 
D
R
 
A
I
 
Y
L
 
F
K
 
T
S
 
Q
M
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
N
Q
 
Y
M
 
P
G
 
N
M
 
I
N
 
K
V
 
T
I
 
L
S
 
K
A
 
Y
K
 
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
S
 
T
F
 
F
Q
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
M
T
 
D
G
 
K
R
 
R
A
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
L
M
 
S
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
F
A
 
A
K
 
W
A
 
V
K
 
K
K
 
D
P
 
H
T
 
P
D
 
D
W
 
F
A
 
K
V
 
M
T
 
G
G
 
I
T
 
K
A
 
E
Q
 
L
S
 
G
N
 
N
-
 
K
E
 
D
I
 
V
Y
 
I
G
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
K
P
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
F
V
 
I
D
 
D
D
 
N
A
 
L
I
 
I
I
 
I
A
 
K
T
 
L
Y
 
G
K
 
Q
S
 
E
G
 
Q
E
 
F
I
 
F
N
 
H
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
E
 
D
K
 
E

2y7iA Structural basis for high arginine specificity in salmonella typhimurium periplasmic binding protein stm4351. (see paper)
25% identity, 76% coverage: 38:268/304 of query aligns to 7:227/228 of 2y7iA

query
sites
2y7iA
T
 
T
I
 
L
T
x
H
L
 
F
G
 
G
H
 
T
R
 
S
D
 
A
A
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
x
E
Y
 
F
I
 
V
A
 
-
D
|
D
A
 
A
S
x
D
G
 
N
K
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
V
Q
 
A
L
 
N
K
 
A
I
 
V
V
 
C
E
 
K
A
 
E
I
 
M
K
 
Q
K
 
A
D
 
E
L
 
C
D
 
S
M
 
F
P
 
T
N
 
N
L
 
Q
Q
 
S
V
x
F
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
x
D
T
 
S
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
R
N
 
F
G
 
K
T
 
K
V
 
F
D
|
D
V
 
A
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
 
M
T
x
D
N
 
M
N
 
T
V
 
P
E
 
K
R
|
R
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
F
 
F
S
 
S
V
 
Q
G
 
P
I
 
Y
F
 
Y
E
 
E
I
 
G
G
 
L
T
 
S
K
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
V
K
 
T
K
 
R
D
 
K
S
 
G
A
 
A
Y
 
Y
K
 
H
D
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
L
T
x
E
A
 
N
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
H
E
 
Q
R
 
R
I
 
Y
L
 
L
K
 
Q
S
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
D
K
 
K
Q
 
Q
M
 
Q
G
 
A
M
 
I
N
 
T
V
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
x
D
D
 
S
H
 
Y
G
 
L
E
 
N
S
 
A
F
 
F
Q
 
T
M
 
D
L
 
L
E
 
K
T
 
N
G
 
N
R
 
R
A
 
L
V
 
E
A
 
G
F
 
V
M
 
F
M
 
G
D
|
D
D
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
K
E
 
W
M
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
K
K
 
N
P
 
N
T
 
P
D
 
D
W
 
Y
A
 
A
V
 
I
T
 
M
G
 
D
T
 
E
A
 
R
Q
 
A
S
 
S
N
 
D
E
 
P
I
 
D
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
N
A
 
D
P
 
A
F
 
L
K
 
L
K
 
Q
A
 
E
V
 
I
D
 
N
D
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
D
A
 
K
T
 
V
Y
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
P
E
 
E
I
 
Y
N
 
A
K
 
Q
I
 
M
Y
 
Q
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

5lomB Crystal structure of the pbp soca from agrobacterium tumefaciens c58 in complex with dfg at 1.5 a resolution (see paper)
26% identity, 78% coverage: 38:273/304 of query aligns to 13:237/250 of 5lomB

query
sites
5lomB
T
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
D
 
G
A
 
D
S
 
A
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
Y
 
F
I
 
T
A
 
T
D
 
-
A
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
L
 
L
K
 
F
I
 
L
V
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
G
K
 
R
K
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
G
M
 
F
P
 
K
N
 
K
L
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
V
Y
 
F
N
 
T
L
 
G
V
 
Q
T
 
E
S
x
F
Q
 
S
T
 
A
R
 
L
I
 
M
P
 
P
L
 
S
V
 
V
Q
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
V
 
V
E
 
A
C
 
A
G
x
A
S
x
A
T
 
I
T
x
G
N
 
T
N
 
T
V
 
A
E
 
K
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
G
I
 
Y
F
 
L
E
x
A
I
x
G
G
 
F
T
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
L
S
 
T
K
 
S
K
 
-
D
 
E
S
 
A
A
 
G
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
L
V
 
G
T
 
V
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
K
x
Q
S
 
E
M
 
I
N
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
Q
 
N
M
 
F
-
 
A
G
 
G
M
 
T
N
 
D
V
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
F
K
 
P
D
 
D
H
 
N
G
 
N
E
 
S
S
 
A
F
 
V
Q
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
N
T
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
H
M
 
F
M
 
L
D
|
D
D
 
-
A
 
-
L
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
K
M
 
D
A
 
Y
K
 
S
A
 
A
K
 
R
K
 
Y
P
 
P
T
 
A
D
 
L
W
 
K
A
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
T
 
I
A
 
P
Q
x
S
S
 
F
N
 
D
E
x
A
I
 
P
Y
 
A
G
 
G
C
 
F
M
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
D
P
 
A
F
 
L
K
 
R
K
 
N
A
 
A
V
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
G
I
 
L
I
 
K
A
 
E
T
 
A
Y
 
M
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
K
K
 
K
I
 
L
Y
 
H
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
P
M
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
M
P
 
P

5l9oB Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
26% identity, 78% coverage: 38:273/304 of query aligns to 12:236/243 of 5l9oB

query
sites
5l9oB
T
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
D
 
G
A
 
D
S
 
A
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
Y
 
F
I
 
T
A
 
T
D
 
-
A
 
A
S
 
D
G
 
G
K
x
N
P
x
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
L
 
L
K
 
F
I
 
L
V
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
G
K
 
R
K
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
G
M
 
F
P
 
K
N
 
K
L
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
V
Y
 
F
N
 
T
L
 
G
V
 
Q
T
 
E
S
x
F
Q
 
S
T
 
A
R
 
L
I
 
M
P
 
P
L
 
S
V
 
V
Q
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
V
 
V
E
 
A
C
 
A
G
x
A
S
x
A
T
 
I
T
x
G
N
 
T
N
 
T
V
 
A
E
 
K
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
G
I
 
Y
F
 
L
E
x
A
I
x
G
G
 
F
T
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
L
S
 
T
K
 
S
K
 
-
D
 
E
S
 
A
A
 
G
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
L
V
 
G
T
 
V
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
K
x
Q
S
 
E
M
 
I
N
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
Q
 
N
M
 
F
-
 
A
G
 
G
M
 
T
N
 
D
V
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
F
K
 
P
D
 
D
H
 
N
G
 
N
E
 
S
S
 
A
F
 
V
Q
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
N
T
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
H
M
 
F
M
 
L
D
|
D
D
 
-
A
 
-
L
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
K
M
 
D
A
 
Y
K
 
S
A
 
A
K
 
R
K
 
Y
P
 
P
T
 
A
D
 
L
W
 
K
A
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
T
 
I
A
 
P
Q
x
S
S
 
F
N
 
D
E
x
A
I
 
P
Y
 
A
G
 
G
C
 
F
M
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
D
P
 
A
F
 
L
K
 
R
K
 
N
A
 
A
V
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
G
I
 
L
I
 
K
A
 
E
T
 
A
Y
 
M
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
K
K
 
K
I
 
L
Y
 
H
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
P
M
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
M
P
 
P

5l9oA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
26% identity, 78% coverage: 38:273/304 of query aligns to 11:235/241 of 5l9oA

query
sites
5l9oA
T
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
D
 
G
A
 
D
S
 
A
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
Y
 
F
I
 
T
A
 
T
D
 
-
A
 
A
S
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
L
 
L
K
 
F
I
 
L
V
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
G
K
 
R
K
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
G
M
 
F
P
 
K
N
 
K
L
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
V
Y
 
F
N
 
T
L
 
G
V
 
Q
T
 
E
S
x
F
Q
 
S
T
 
A
R
 
L
I
 
M
P
 
P
L
 
S
V
 
V
Q
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
V
 
V
E
 
A
C
 
A
G
x
A
S
x
A
T
 
I
T
x
G
N
 
T
N
 
T
V
 
A
E
 
K
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
G
I
 
Y
F
 
L
E
x
A
I
x
G
G
 
F
T
 
L
K
 
S
L
 
V
L
 
L
S
 
T
K
 
S
K
 
-
D
 
E
S
 
A
A
 
G
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
L
V
 
G
T
 
V
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
K
x
Q
S
 
E
M
 
I
N
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
Q
 
N
M
 
F
-
 
A
G
 
G
M
 
T
N
 
D
V
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
F
K
 
P
D
 
D
H
 
N
G
 
N
E
 
S
S
 
A
F
 
V
Q
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
N
T
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
H
M
 
F
M
 
L
D
|
D
D
 
-
A
 
-
L
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
K
M
 
D
A
 
Y
K
 
S
A
 
A
K
 
R
K
 
Y
P
 
P
T
 
A
D
 
L
W
 
K
A
 
I
V
 
A
T
 
V
G
 
N
T
 
I
A
 
P
Q
x
S
S
 
F
N
 
D
E
x
A
I
 
P
Y
 
A
G
 
G
C
 
F
M
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
A
 
D
P
 
A
F
 
L
K
 
R
K
 
N
A
 
A
V
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
G
I
 
L
I
 
K
A
 
E
T
 
A
Y
 
M
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
K
K
 
K
I
 
L
Y
 
H
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
P
M
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
M
P
 
P

2pvuA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
27% identity, 76% coverage: 39:268/304 of query aligns to 7:224/235 of 2pvuA

query
sites
2pvuA
I
 
V
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
D
D
 
A
A
 
A
S
x
F
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
I
 
M
A
 
Q
D
 
-
A
 
-
S
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
L
Q
 
L
L
 
D
K
 
A
I
 
V
V
 
M
E
 
K
A
 
A
I
 
A
K
 
G
K
 
L
D
 
D
L
 
Y
D
 
E
M
 
L
P
 
K
N
 
N
L
 
I
Q
 
G
V
x
W
K
 
D
Y
 
P
N
 
L
L
 
F
V
 
A
T
 
S
S
 
L
Q
 
Q
T
 
S
R
 
K
I
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
M
E
 
G
C
 
I
G
 
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
D
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
E
I
 
A
G
 
T
T
 
Q
K
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
V
K
 
K
K
 
Q
D
 
G
S
 
S
A
 
P
Y
 
V
K
 
K
D
 
N
F
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
I
-
 
G
-
 
V
-
x
Q
-
 
N
V
 
A
T
|
T
T
|
T
A
 
G
G
 
Q
T
 
E
T
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
K
I
 
L
L
 
F
K
 
G
S
 
K
M
 
G
N
 
P
A
 
H
D
 
I
K
 
K
Q
 
K
M
 
F
G
 
E
M
 
T
N
 
T
V
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
I
K
 
M
D
 
E
H
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
Q
 
-
M
 
-
L
 
L
E
 
L
T
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
-
L
 
V
A
 
A
G
 
N
E
 
E
M
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
N
K
 
N
K
 
P
P
 
N
T
 
K
D
 
K
W
 
L
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
G
 
E
T
 
D
A
 
P
Q
 
K
-
 
N
-
 
F
S
 
A
N
 
S
E
 
E
I
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
C
 
M
M
 
I
V
 
F
R
 
P
K
 
K
G
 
-
D
 
N
A
 
S
P
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
K
A
 
N
T
 
V
Y
 
I
K
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
Y
N
 
T
K
 
E
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Query Sequence

>Pf1N1B4_771 Glutamate Aspartate periplasmic binding protein precursor GltI (TC 3.A.1.3.4)
MRIVPHILGAAIAAALISTPVFAAELTGTLKKIKESGTITLGHRDASIPFSYIADASGKP
VGYSHDIQLKIVEAIKKDLDMPNLQVKYNLVTSQTRIPLVQNGTVDVECGSTTNNVERQQ
QVDFSVGIFEIGTKLLSKKDSAYKDFADLKGKNVVTTAGTTSERILKSMNADKQMGMNVI
SAKDHGESFQMLETGRAVAFMMDDALLAGEMAKAKKPTDWAVTGTAQSNEIYGCMVRKGD
APFKKAVDDAIIATYKSGEINKIYEKWFMQPIPPKGLNLMFPMSEELKALIANPTDKAAD
EKKS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory