SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_847 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_847 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

P9WQB3 2-isopropylmalate synthase; Alpha-IPM synthase; Alpha-isopropylmalate synthase; EC 2.3.3.13 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
51% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 42:642/644 of P9WQB3

query
sites
P9WQB3
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
x
E
-
x
E
-
x
V
-
x
E
T
x
P
I
|
I
D
x
R
I
x
L
P
x
R
D
x
N
R
|
R
T
|
T
W
|
W
P
|
P
S
x
D
K
x
R
T
x
V
I
|
I
T
x
D
A
x
R
A
|
A
P
|
P
I
x
L
W
|
W
C
|
C
S
x
A
S
x
V
D
|
D
L
|
L
R
|
R
D
|
D
G
|
G
N
|
N
Q
|
Q
S
x
A
L
|
L
I
|
I
E
x
D
P
|
P
M
|
M
D
x
S
A
x
P
V
x
A
K
x
R
K
|
K
L
x
R
R
|
R
F
x
M
W
x
F
K
x
D
T
x
L
L
|
L
V
|
V
Q
x
R
V
x
M
G
|
G
V
x
Y
K
|
K
E
|
E
I
|
I
E
|
E
A
x
V
S
x
G
F
|
F
P
|
P
A
x
S
A
|
A
S
|
S
Q
|
Q
T
|
T
D
|
D
F
|
F
D
|
D
F
|
F
V
|
V
R
|
R
T
x
E
L
x
I
I
|
I
E
|
E
D
x
Q
G
|
G
H
x
A
I
|
I
P
|
P
D
|
D
D
|
D
T
x
V
T
|
T
I
|
I
Q
|
Q
V
|
V
L
|
L
T
|
T
Q
|
Q
G
x
C
R
|
R
E
x
P
D
x
E
L
|
L
I
|
I
A
x
E
R
|
R
T
|
T
F
|
F
E
x
Q
S
x
A
L
x
C
R
x
S
G
|
G
A
|
A
K
x
P
K
x
R
A
|
A
I
|
I
V
|
V
H
|
H
L
x
F
Y
|
Y
N
|
N
A
x
S
T
|
T
S
|
S
P
x
I
S
x
L
F
x
Q
R
|
R
R
|
R
I
x
V
V
|
V
F
|
F
N
x
R
Q
x
A
D
x
N
K
x
R
D
x
A
G
x
E
I
x
V
K
x
Q
A
|
A
I
|
I
A
|
A
V
x
T
N
x
D
A
x
G
A
|
A
K
x
R
L
x
K
F
x
C
V
|
V
K
x
E
Y
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
x
K
Q
x
Y
P
|
P
D
x
G
T
|
T
E
x
Q
W
|
W
T
x
R
F
|
F
E
|
E
Y
|
Y
S
|
S
P
|
P
E
|
E
T
x
S
F
x
Y
S
x
T
A
x
G
T
|
T
E
|
E
L
|
L
E
|
E
F
x
Y
A
|
A
K
|
K
E
x
Q
V
|
V
C
|
C
D
|
D
A
|
A
V
|
V
I
x
G
E
|
E
V
|
V
W
x
I
N
x
A
P
|
P
T
|
T
P
|
P
E
|
E
H
x
R
K
x
P
V
x
I
I
|
I
L
x
F
N
|
N
L
|
L
P
|
P
A
|
A
T
|
T
V
|
V
E
|
E
C
x
M
A
x
T
T
|
T
P
|
P
N
|
N
I
x
V
Y
|
Y
A
|
A
D
|
D
Q
x
S
I
|
I
E
|
E
W
|
W
F
x
M
G
x
S
R
|
R
H
x
N
I
x
L
N
x
A
R
x
N
R
|
R
D
x
E
S
|
S
V
|
V
I
|
I
I
x
L
S
|
S
L
|
L
H
|
H
T
x
P
H
|
H
N
|
N
D
|
D
R
|
R
G
|
G
T
|
T
G
x
A
V
|
V
A
|
A
A
|
A
T
x
A
E
|
E
L
|
L
G
|
G
L
x
F
M
x
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
R
|
R
V
x
I
E
|
E
G
|
G
C
|
C
L
|
L
F
|
F
G
|
G
N
|
N
G
|
G
E
|
E
R
|
R
T
|
T
G
|
G
N
|
N
V
|
V
D
x
C
L
|
L
V
|
V
T
|
T
V
x
L
A
x
G
L
|
L
N
|
N
L
|
L
Y
x
F
T
x
S
Q
x
R
G
|
G
V
|
V
D
|
D
P
|
P
E
x
Q
L
x
I
D
|
D
F
|
F
S
|
S
D
x
N
I
|
I
D
|
D
G
x
E
V
x
I
R
|
R
K
x
R
V
x
T
V
|
V
E
|
E
E
x
Y
C
|
C
N
|
N
Q
|
Q
I
x
L
Q
x
P
V
|
V
H
|
H
P
x
E
R
|
R
H
|
H
P
|
P
Y
|
Y
V
x
G
G
|
G
D
|
D
L
|
L
V
|
V
H
x
Y
T
|
T
A
|
A
F
|
F
S
|
S
G
|
G
S
|
S
H
|
H
Q
|
Q
D
|
D
A
|
A
I
|
I
R
x
N
K
|
K
G
|
G
F
x
L
A
x
D
Q
x
A
Q
x
M
Q
x
K
-
x
L
-
x
D
-
x
A
-
x
D
-
x
A
-
x
A
-
x
D
-
x
C
-
x
D
-
x
V
P
x
D
D
|
D
A
x
M
L
|
L
W
|
W
E
x
Q
V
|
V
P
|
P
Y
|
Y
L
|
L
P
|
P
I
|
I
D
|
D
P
|
P
A
x
R
D
|
D
I
x
V
G
|
G
R
|
R
S
x
T
Y
|
Y
E
|
E
A
|
A
V
|
V
I
|
I
R
|
R
V
|
V
N
|
N
S
|
S
Q
|
Q
S
|
S
G
|
G
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
x
V
A
|
A
Y
|
Y
L
x
I
L
x
M
E
x
K
Q
x
T
E
x
D
Y
x
H
G
|
G
I
x
L
N
x
S
L
|
L
P
|
P
R
|
R
R
|
R
M
x
L
Q
|
Q
I
|
I
E
|
E
F
|
F
S
|
S
Q
|
Q
V
|
V
V
x
I
Q
|
Q
R
x
K
-
x
I
-
x
A
-
x
E
E
x
G
T
|
T
D
x
A
R
x
G
L
x
E
G
|
G
L
x
G
E
|
E
M
x
V
T
x
S
A
x
P
Q
x
K
Q
x
E
I
x
M
H
x
W
A
x
D
L
x
A
L
x
F
H
x
A
S
x
E
E
|
E
Y
|
Y
L
|
L
Q
x
A
A
x
P
N
x
V
T
x
R
P
|
P
Y
x
L
A
x
E
L
x
R
V
x
I
S
x
R
H
x
Q
R
x
H
L
x
V
-
x
D
-
x
A
-
x
A
Q
x
D
E
x
D
E
x
D
N
x
G
G
|
G
H
x
T
S
x
T
A
x
S
V
x
I
E
x
T
V
x
A
E
x
T
V
|
V
S
x
K
S
x
I
K
x
N
G
|
G
Q
x
V
G
 
-
E
|
E
T
|
T
N
x
E
L
x
I
H
x
S
W
 
-
R
 
-
G
|
G
K
x
S
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
x
P
L
|
L
E
x
A
A
|
A
L
x
F
V
|
V
A
x
H
G
x
A
L
|
L
P
x
A
-
x
D
-
x
V
-
x
G
I
x
F
P
x
D
V
|
V
E
x
A
I
x
V
M
x
L
D
|
D
Y
|
Y
N
x
Y
E
|
E
H
|
H
A
|
A
I
x
M
G
x
S
A
|
A
G
|
G
T
x
D
N
x
D
A
|
A
K
x
Q
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
|
Y
I
x
V
E
|
E
L
x
A
R
x
S
V
|
V
N
x
T
-
x
I
-
x
A
-
x
S
-
x
P
-
x
A
-
x
Q
-
x
P
G
|
G
E
|
E
R
x
A
A
x
G
V
x
R
H
|
H
-
x
A
-
x
S
-
x
D
-
x
P
-
x
V
-
x
T
-
x
I
-
x
A
-
x
S
-
x
P
-
x
A
-
x
Q
-
x
P
-
x
G
-
x
E
-
x
A
-
x
G
-
x
R
-
x
H
-
x
A
-
x
S
-
x
D
-
x
P
-
x
V
-
x
T
-
x
S
-
x
K
-
x
T
-
x
V
-
x
W
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
|
I
D
x
A
E
x
P
N
x
S
I
|
I
T
|
T
T
|
T
A
|
A
S
|
S
F
x
L
K
x
R
A
|
A
L
x
V
F
x
V
S
|
S
A
|
A
L
x
V
N
|
N
R
|
R
S
x
A

Sites not aligning to the query:

3hq1A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with citrate and mn2+
53% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 25:572/573 of 3hq1A

query
sites
3hq1A
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
E
T
 
P
I
 
I
D
 
R
I
 
L
P
 
R
D
 
N
R
 
R
T
 
T
W
 
W
P
 
P
S
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
I
T
 
D
A
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
W
 
W
C
 
C
S
 
A
S
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
D
P
 
P
M
 
M
D
 
S
A
 
P
V
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
R
R
 
R
F
 
M
W
 
F
K
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
V
 
M
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
V
S
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
G
 
C
R
 
R
E
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
S
 
A
L
 
C
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
F
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
I
S
 
L
F
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
R
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
A
G
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
F
 
C
V
 
V
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
Q
W
 
W
T
 
R
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
S
F
 
Y
S
 
T
A
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
C
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
V
 
V
W
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
R
K
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
F
N
 
N
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
C
 
M
A
 
T
T
 
T
P
 
P
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
E
W
 
W
F
 
M
G
 
S
R
 
R
H
 
N
I
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
R
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
L
S
 
S
L
 
L
H
|
H
T
 
P
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
G
C
 
C
L
 
L
F
 
F
G
 
G
N
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
|
N
V
 
V
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
R
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
Y
C
 
C
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
V
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
T
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
F
 
L
A
 
D
Q
 
A
Q
 
M
Q
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
V
P
 
D
D
 
D
A
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
-
V
 
-
N
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
T
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
R
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
I
E
 
E
M
 
V
T
 
S
A
 
P
Q
 
K
Q
 
E
I
 
M
H
 
W
A
 
D
L
 
A
L
 
F
H
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
A
A
 
P
N
 
V
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
L
 
R
V
 
I
S
 
R
H
 
Q
R
 
H
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
E
 
D
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
T
S
 
T
A
 
S
V
 
I
E
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
V
S
 
K
S
 
I
K
 
N
G
 
G
Q
 
V
G
 
-
E
 
E
T
 
T
N
 
E
L
 
I
H
 
S
W
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
V
E
 
A
I
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
N
 
Y
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
D
N
 
D
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
S
V
 
V
N
 
T
G
 
I
E
 
S
R
 
K
A
 
T
V
 
V
H
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
A
E
 
P
N
 
S
I
 
I
T
 
T
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
V
F
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A

1sr9A Crystal structure of leua from mycobacterium tuberculosis (see paper)
53% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 25:572/573 of 1sr9A

query
sites
1sr9A
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
E
T
 
P
I
 
I
D
 
R
I
 
L
P
 
R
D
 
N
R
 
R
T
 
T
W
 
W
P
 
P
S
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
I
T
 
D
A
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
W
 
W
C
 
C
S
 
A
S
 
V
D
 
D
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
D
P
 
P
M
 
M
D
 
S
A
 
P
V
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
R
R
 
R
F
 
M
W
 
F
K
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
V
 
M
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
V
S
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
G
 
C
R
 
R
E
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
S
 
A
L
 
C
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
F
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
I
S
 
L
F
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
R
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
A
G
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
F
 
C
V
 
V
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
Q
W
 
W
T
 
R
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
S
F
 
Y
S
 
T
A
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
C
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
V
 
V
W
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
R
K
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
F
N
 
N
L
 
L
P
|
P
A
 
A
T
|
T
V
 
V
E
 
E
C
 
M
A
 
T
T
 
T
P
 
P
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
E
W
 
W
F
 
M
G
 
S
R
 
R
H
 
N
I
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
R
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
L
S
 
S
L
 
L
H
|
H
T
 
P
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
G
C
 
C
L
 
L
F
 
F
G
 
G
N
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
R
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
Y
C
 
C
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
V
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
T
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
F
 
L
A
 
D
Q
 
A
Q
 
M
Q
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
V
P
 
D
D
 
D
A
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
-
V
 
-
N
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
T
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
R
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
I
E
 
E
M
 
V
T
 
S
A
 
P
Q
 
K
Q
 
E
I
 
M
H
 
W
A
 
D
L
 
A
L
 
F
H
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
A
A
 
P
N
 
V
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
L
 
R
V
 
I
S
 
R
H
 
Q
R
 
H
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
E
 
D
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
T
S
 
T
A
 
S
V
 
I
E
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
V
S
 
K
S
 
I
K
 
N
G
 
G
Q
 
V
G
 
-
E
 
E
T
 
T
N
 
E
L
 
I
H
 
S
W
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
V
E
 
A
I
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
N
 
Y
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
D
N
 
D
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
S
V
 
V
N
 
T
G
 
I
E
 
S
R
 
K
A
 
T
V
 
V
H
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
A
E
 
P
N
 
S
I
 
I
T
 
T
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
V
F
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A

3figB Crystal structure of leucine-bound leua from mycobacterium tuberculosis (see paper)
53% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 25:575/577 of 3figB

query
sites
3figB
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
E
T
 
P
I
 
I
D
 
R
I
 
L
P
 
R
D
 
N
R
 
R
T
 
T
W
 
W
P
 
P
S
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
I
T
 
D
A
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
W
 
W
C
 
C
S
 
A
S
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
D
P
 
P
M
 
M
D
 
S
A
 
P
V
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
R
R
 
R
F
 
M
W
 
F
K
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
V
 
M
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
V
S
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
G
 
C
R
 
R
E
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
S
 
A
L
 
C
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
F
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
I
S
 
L
F
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
R
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
A
G
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
F
 
C
V
 
V
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
Q
W
 
W
T
 
R
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
S
F
 
Y
S
 
T
A
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
C
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
V
 
V
W
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
R
K
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
F
N
 
N
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
C
 
M
A
 
T
T
 
T
P
 
P
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
E
W
 
W
F
 
M
G
 
S
R
 
R
H
 
N
I
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
R
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
L
S
 
S
L
 
L
H
|
H
T
 
P
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
G
C
 
C
L
 
L
F
 
F
G
 
G
N
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
R
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
Y
C
 
C
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
V
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
T
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
F
 
L
A
 
D
Q
 
A
Q
 
M
Q
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
V
P
 
D
D
 
D
A
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
T
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
R
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
V
T
 
S
A
 
P
Q
 
K
Q
 
E
I
 
M
H
 
W
A
 
D
L
 
A
L
 
F
H
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
A
A
 
P
N
 
V
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
L
 
R
V
 
I
S
 
R
H
 
Q
R
 
H
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
E
 
D
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
T
S
 
T
A
 
S
V
 
I
E
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
V
S
 
K
S
 
I
K
 
N
G
 
G
Q
 
V
G
 
-
E
 
E
T
 
T
N
 
E
L
 
I
H
 
S
W
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
S
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
x
P
L
|
L
E
x
A
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
V
E
 
A
I
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
N
 
Y
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
x
D
N
 
D
A
|
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
S
V
 
V
N
 
T
-
 
I
-
 
A
G
 
T
E
 
S
R
 
K
A
 
T
V
 
V
H
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
A
E
x
P
N
 
S
I
|
I
T
 
T
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
V
F
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A

3hpzB Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with bromopyruvate
53% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 25:575/576 of 3hpzB

query
sites
3hpzB
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
E
T
 
P
I
 
I
D
 
R
I
 
L
P
 
R
D
 
N
R
 
R
T
 
T
W
 
W
P
 
P
S
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
I
T
 
D
A
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
W
 
W
C
 
C
S
 
A
S
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
D
P
 
P
M
 
M
D
 
S
A
 
P
V
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
R
R
 
R
F
 
M
W
 
F
K
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
V
 
M
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
V
S
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
G
 
C
R
 
R
E
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
S
 
A
L
 
C
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
F
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
I
S
 
L
F
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
R
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
A
G
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
F
 
C
V
 
V
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
Q
W
 
W
T
 
R
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
E
|
E
T
 
S
F
 
Y
S
 
T
A
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
C
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
V
 
V
W
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
R
K
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
F
N
 
N
L
 
L
P
|
P
A
 
A
T
|
T
V
 
V
E
 
E
C
 
M
A
 
T
T
 
T
P
 
P
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
E
W
 
W
F
 
M
G
 
S
R
 
R
H
 
N
I
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
R
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
L
S
 
S
L
 
L
H
|
H
T
 
P
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
G
C
 
C
L
 
L
F
 
F
G
 
G
N
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
R
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
Y
C
 
C
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
V
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
T
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
F
 
L
A
 
D
Q
 
A
Q
 
M
Q
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
V
P
 
D
D
 
D
A
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
T
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
R
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
V
T
 
S
A
 
P
Q
 
K
Q
 
E
I
 
M
H
 
W
A
 
D
L
 
A
L
 
F
H
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
A
A
 
P
N
 
V
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
L
 
R
V
 
I
S
 
R
H
 
Q
R
 
H
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
E
 
D
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
T
S
 
T
A
 
S
V
 
I
E
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
V
S
 
K
S
 
I
K
 
N
G
 
G
Q
 
V
G
 
-
E
 
E
T
 
T
N
 
E
L
 
I
H
 
S
W
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
S
G
 
G
N
 
N
G
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
V
E
 
A
I
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
N
 
Y
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
D
N
 
D
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
S
V
 
V
N
 
T
-
 
I
-
 
A
G
 
T
E
 
S
R
 
K
A
 
T
V
 
V
H
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
A
E
 
P
N
 
S
I
 
I
T
 
T
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
V
F
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A

3hpsA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with ketoisocaproate (kic)
53% identity, 97% coverage: 7:550/559 of query aligns to 25:574/575 of 3hpsA

query
sites
3hpsA
P
 
P
S
 
V
S
 
N
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
A
 
P
F
 
F
P
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
E
T
 
P
I
 
I
D
 
R
I
 
L
P
 
R
D
 
N
R
 
R
T
 
T
W
 
W
P
 
P
S
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
I
T
 
D
A
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
W
 
W
C
 
C
S
 
A
S
 
V
D
 
D
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
D
P
 
P
M
 
M
D
 
S
A
 
P
V
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
R
R
 
R
F
 
M
W
 
F
K
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
V
 
M
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
V
S
 
G
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
R
T
 
E
L
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
G
 
G
H
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
G
 
C
R
 
R
E
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
R
 
R
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
S
 
A
L
 
C
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
H
|
H
L
 
F
Y
|
Y
N
 
N
A
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
I
S
 
L
F
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
N
 
R
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
A
G
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
D
A
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
K
F
 
C
V
 
V
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Y
P
 
P
D
 
G
T
 
T
E
 
Q
W
 
W
T
 
R
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
S
F
 
Y
S
 
T
A
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
Q
V
 
V
C
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
G
E
 
E
V
 
V
W
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
R
K
 
P
V
 
I
I
 
I
L
 
F
N
 
N
L
 
L
P
|
P
A
 
A
T
|
T
V
 
V
E
 
E
C
 
M
A
 
T
T
 
T
P
 
P
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
E
W
 
W
F
 
M
G
 
S
R
 
R
H
 
N
I
 
L
N
 
A
R
 
N
R
 
R
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
L
S
 
S
L
 
L
H
|
H
T
 
P
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
G
C
 
C
L
 
L
F
 
F
G
 
G
N
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
L
A
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
T
 
S
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
F
 
F
S
 
S
D
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
R
V
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
Y
C
 
C
N
 
N
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
H
 
H
P
 
E
R
 
R
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
V
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
T
 
T
A
 
A
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
F
 
L
A
 
D
Q
 
A
Q
 
M
Q
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
V
P
 
D
D
 
D
A
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
I
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
-
V
 
-
N
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
L
 
M
E
 
K
Q
 
T
E
 
D
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
N
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
R
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
F
 
F
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
I
E
 
E
M
 
V
T
 
S
A
 
P
Q
 
K
Q
 
E
I
 
M
H
 
W
A
 
D
L
 
A
L
 
F
H
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
A
A
 
P
N
 
V
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
L
 
R
V
 
I
S
 
R
H
 
Q
R
 
H
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
E
 
D
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
T
S
 
T
A
 
S
V
 
I
E
 
T
V
 
A
E
 
T
V
 
V
S
 
K
S
 
I
K
 
N
G
 
G
Q
 
V
G
 
-
E
 
E
T
 
T
N
 
E
L
 
I
H
 
S
W
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
S
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
x
P
L
|
L
E
x
A
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
H
G
 
A
L
 
L
P
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
I
 
F
P
 
D
V
 
V
E
 
A
I
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
Y
N
 
Y
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
M
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
x
D
N
 
D
A
|
A
K
x
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
A
R
 
S
V
 
V
N
 
T
-
 
I
-
 
A
G
 
T
E
 
S
R
 
K
A
 
T
V
 
V
H
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
A
E
x
P
N
 
S
I
|
I
T
 
T
T
 
T
A
 
A
S
 
S
F
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
V
F
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A

Q9JZG1 2-isopropylmalate synthase; Alpha-IPM synthase; Alpha-isopropylmalate synthase; EC 2.3.3.13 from Neisseria meningitidis serogroup B (strain MC58) (see 2 papers)
26% identity, 94% coverage: 34:559/559 of query aligns to 8:514/517 of Q9JZG1

query
sites
Q9JZG1
I
 
I
W
 
I
C
 
F
S
 
D
S
 
T
D
 
T
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
N
 
E
Q
 
Q
S
 
S
L
 
P
I
 
G
E
 
A
P
 
A
M
 
M
D
 
T
A
 
K
V
 
E
K
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
R
F
 
V
W
 
A
K
 
R
T
 
Q
L
 
L
V
 
E
Q
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
D
E
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
 
P
T
 
G
D
 
D
F
 
F
D
 
E
F
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
A
L
 
I
I
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
A
H
 
K
I
 
T
P
 
I
D
 
T
D
 
K
T
 
S
T
 
T
I
 
V
Q
 
C
V
 
S
L
 
L
T
 
S
Q
 
R
G
 
A
R
 
I
E
 
E
D
 
R
L
 
D
I
 
I
A
 
R
R
 
Q
T
 
A
F
 
G
E
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
A
G
 
P
A
 
A
K
 
P
K
 
K
A
 
K
I
 
R
V
 
I
H
 
H
L
 
T
Y
 
F
N
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
S
 
I
F
 
H
R
 
M
R
 
E
I
 
Y
V
 
K
F
 
L
N
 
K
Q
 
M
D
 
K
K
 
P
D
 
K
G
 
Q
I
 
V
K
 
I
A
 
E
I
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
K
L
 
I
F
 
A
V
 
R
K
 
E
Y
 
Y
A
 
T
A
 
D
Q
 
D
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
T
 
-
F
 
V
E
 
E
Y
 
F
S
 
S
P
 
C
E
 
E
T
 
D
F
 
A
S
 
L
A
 
R
T
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
D
F
 
F
A
 
L
K
 
A
E
 
E
V
 
I
C
 
C
D
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
E
V
 
A
W
 
G
N
 
A
P
 
T
T
 
T
P
 
-
E
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
I
 
-
L
 
I
N
 
N
L
 
I
P
 
P
A
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
G
C
 
Y
A
 
S
T
 
I
P
 
P
N
 
-
I
 
-
Y
 
Y
A
 
K
D
 
T
Q
 
E
I
 
-
E
 
E
W
 
F
F
 
F
G
 
R
R
 
E
H
 
L
I
 
I
N
 
A
R
 
K
R
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
G
D
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
W
S
 
S
L
 
A
H
|
H
T
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
R
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
N
T
 
S
E
 
L
L
 
A
G
 
A
L
 
L
M
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
C
C
 
T
L
 
V
F
 
N
G
 
G
N
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
A
G
 
G
N
|
N
V
 
A
D
 
S
L
 
V
V
 
E
T
 
E
V
 
I
A
 
V
L
 
M
N
 
A
L
 
L
Y
 
K
T
 
V
Q
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
F
G
 
G
V
 
L
D
 
E
P
 
T
E
 
G
L
 
I
D
 
D
F
 
T
S
 
T
D
 
Q
I
 
I
D
 
V
G
 
P
V
 
S
R
 
S
K
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
S
E
 
T
C
 
I
N
 
T
Q
 
G
I
 
Y
Q
 
P
V
 
V
H
 
Q
P
 
P
R
 
N
H
 
K
P
 
A
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
A
L
 
N
V
 
A
H
 
F
T
 
S
A
 
H
F
 
E
S
 
S
G
 
G
S
 
I
H
 
H
Q
 
Q
D
 
D
A
 
G
I
 
V
R
 
L
K
 
K
G
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
H
E
 
R
V
 
E
P
 
T
Y
 
Y
L
 
E
P
 
I
I
 
M
D
 
S
P
 
A
A
 
E
D
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
W
S
 
A
Y
 
T
E
 
N
A
 
R
V
 
-
I
 
L
R
 
S
V
 
L
N
 
G
S
 
K
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
K
 
R
G
 
N
G
 
A
I
 
F
A
 
K
Y
 
T
L
 
K
L
 
L
E
 
-
Q
 
A