SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1002 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1002 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4n54A Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei with bound cofactor NAD(h) and scyllo-inositol
30% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:338/340 of 4n54A

query
sites
4n54A
L
 
I
R
 
K
I
 
I
A
 
G
V
 
I
L
x
V
G
|
G
A
x
L
G
|
G
R
|
R
I
x
L
G
 
G
K
 
K
I
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
T
N
 
N
V
 
I
A
 
A
T
 
T
N
 
K
-
 
I
P
 
Q
R
 
H
T
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
Q
V
 
A
I
 
A
A
 
T
D
x
S
P
x
V
W
 
V
K
 
P
E
 
A
G
x
E
V
 
L
N
 
D
A
 
W
L
 
A
A
 
K
M
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
V
Y
 
F
-
 
E
D
 
D
Y
 
F
A
 
D
S
 
D
A
 
M
I
 
V
E
 
Q
R
 
H
T
 
A
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
V
T
x
S
P
|
P
T
 
S
E
 
G
F
|
F
H
|
H
I
 
L
E
 
Q
L
 
Q
M
 
I
L
 
E
Q
 
S
A
 
A
V
 
L
R
 
N
L
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
I
 
F
C
 
S
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
I
D
 
G
M
 
L
D
 
D
Y
 
I
E
 
E
R
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
V
 
I
D
 
E
E
 
H
L
 
T
E
 
Q
R
 
Q
L
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
N
 
N
G
 
L
R
 
K
V
 
F
M
 
Q
L
 
L
A
 
G
F
 
F
N
x
M
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
P
 
D
D
 
S
Y
 
Y
L
 
R
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
R
 
Q
A
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
Q
G
 
G
E
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
D
V
 
I
R
 
T
Q
 
L
V
 
I
I
 
R
I
 
S
T
 
Y
S
 
S
R
 
I
D
|
D
P
 
P
A
 
A
L
 
A
A
 
G
A
 
M
R
 
A
A
 
S
Y
 
F
L
 
V
E
 
K
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
A
T
 
N
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
F
 
F
R
 
L
D
|
D
M
|
M
T
 
S
I
 
I
H
|
H
D
 
D
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
I
R
 
R
S
 
W
L
 
F
L
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
E
P
 
I
V
 
D
E
 
K
V
 
V
F
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
S
 
L
R
 
N
L
 
R
V
 
A
D
 
Y
P
 
P
T
 
V
L
 
L
E
 
D
S
 
K
I
 
A
P
 
G
D
 
E
Y
 
L
D
 
E
S
 
T
V
 
G
M
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
T
 
L
A
 
E
S
 
D
G
 
K
R
 
T
Q
 
M
C
 
A
H
 
I
I
 
L
N
 
V
C
 
A
C
 
G
R
|
R
E
 
N
A
 
A
V
 
A
Y
 
H
G
 
G
F
x
Y
D
 
H
Q
 
V
R
 
E
L
 
T
E
 
E
V
 
I
S
 
I
G
 
G
S
 
T
K
 
K
G
 
G
M
 
M
L
 
L
-
 
R
L
 
I
N
 
A
E
 
Q
N
 
V
H
 
P
R
 
E
T
 
K
N
 
N
S
 
L
V
 
V
R
 
T
R
 
V
Y
 
M
G
 
N
A
 
E
E
 
E
A
 
G
T
 
-
D
 
-
V
 
I
A
 
I
D
 
R
P
 
P
L
 
T
L
 
S
N
 
Q
F
 
N
F
|
F
L
 
P
E
 
E
R
 
R
H
 
F
A
 
A
D
 
Q
S
 
A
Y
 
F
K
 
L
I
 
S
E
 
E
L
 
E
N
 
Q
S
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
N
A
 
S
V
 
I
E
 
L
N
 
N
N
 
N
S
 
Q
P
 
D
M
 
V
P
 
G
A
 
I
T
 
T
P
 
A
R
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
A
 
G
L
 
T
R
 
K
L
 
A
A
 
A
N
 
L
C
 
A
A
 
L
S
 
Q
E
 
E
S
 
A
A
 
F
E
 
E
T
 
K
G
 
N
K
 
D
V
 
I
V
 
V
R
 
Q
V
 
V

3ceaA Crystal structure of myo-inositol 2-dehydrogenase (np_786804.1) from lactobacillus plantarum at 2.40 a resolution
30% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 5:340/342 of 3ceaA

query
sites
3ceaA
L
 
L
R
 
R
I
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
I
G
|
G
A
 
L
G
|
G
R
|
R
I
x
L
G
 
G
K
 
E
I
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
R
N
 
H
V
 
L
A
 
V
T
 
N
N
 
K
P
 
I
R
 
Q
-
 
G
T
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
C
D
 
A
P
x
L
W
 
D
K
 
S
E
 
N
G
x
Q
V
 
L
N
 
E
A
 
W
L
 
A
A
 
K
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
T
Y
 
Y
-
 
T
D
 
N
Y
 
Y
A
 
K
S
 
D
A
 
M
I
 
I
E
 
D
R
 
T
T
 
E
D
 
N
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
I
F
 
F
I
 
I
G
x
V
T
x
A
P
|
P
T
|
T
E
 
P
F
|
F
H
|
H
I
 
P
E
 
E
L
x
M
M
 
T
L
 
I
Q
 
Y
A
 
A
V
 
M
R
 
N
L
 
A
G
 
G
K
 
L
P
 
N
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
D
Y
 
F
E
 
N
R
 
E
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
M
E
 
A
R
 
K
L
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
H
-
 
P
N
 
N
G
 
Q
R
 
I
V
 
F
M
 
Q
L
 
S
A
 
G
F
 
F
N
x
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
D
D
 
S
Y
 
Y
L
 
R
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
R
 
K
A
 
I
I
 
V
D
 
D
D
 
N
G
 
G
E
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
K
V
 
I
R
 
I
Q
 
Y
V
 
M
I
 
R
I
 
G
T
 
Y
S
 
G
R
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
I
L
 
S
A
 
G
A
 
M
R
 
E
A
 
S
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
A
T
 
D
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
V
D
 
D
M
 
M
T
 
N
I
 
I
H
|
H
D
 
D
F
 
I
D
 
D
M
 
L
A
 
I
R
 
R
S
 
W
L
 
F
L
 
T
G
 
G
E
 
Q
E
 
D
P
 
P
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
F
 
Y
A
 
G
V
 
L
G
 
T
S
 
S
R
 
N
L
 
I
V
 
A
D
 
A
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
E
 
A
S
 
D
I
 
I
P
 
G
D
 
E
Y
 
F
D
 
E
S
 
T
V
 
G
M
 
V
V
 
A
L
 
Q
M
 
L
R
 
K
T
 
M
A
 
S
S
 
D
G
 
G
R
 
V
Q
 
I
C
 
A
H
 
T
I
 
L
N
 
I
C
 
G
C
 
G
R
 
R
E
 
H
A
 
A
V
 
A
Y
 
H
G
 
G
F
 
N
D
 
Q
Q
 
V
R
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
S
 
M
G
 
G
S
 
S
K
 
N
G
 
G
M
 
W
L
 
V
-
 
R
L
 
I
N
 
G
E
 
E
N
 
H
H
 
P
R
 
D
T
 
L
N
 
N
S
 
R
V
 
V
R
 
T
R
 
V
Y
 
F
G
 
N
A
 
D
E
 
Q
A
 
G
T
 
-
D
 
-
V
 
V
A
 
V
D
 
R
P
 
P
L
 
S
L
 
L
N
 
Q
F
 
S
F
|
F
L
 
G
E
 
E
R
 
R
H
 
F
A
 
D
D
 
T
S
 
A
Y
 
F
K
 
T
I
 
D
E
 
E
L
 
V
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
V
D
 
N
A
 
N
V
 
V
E
 
I
N
 
V
N
 
G
S
 
K
P
 
Q
M
 
P
P
 
E
A
 
V
T
 
T
P
 
V
R
 
D
D
 
D
G
 
G
L
 
I
R
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
I
A
 
A
N
 
K
C
 
A
A
 
C
S
 
Q
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
E
 
N
T
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
V
 
V
R
 
D
V
 
I

3ec7A Crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2
29% identity, 97% coverage: 2:325/333 of query aligns to 3:321/336 of 3ec7A

query
sites
3ec7A
L
 
L
R
 
K
I
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
I
G
|
G
R
x
M
I
|
I
G
 
G
K
 
S
I
 
D
H
 
H
A
 
L
A
 
R
N
 
R
V
 
L
A
 
A
-
 
N
T
 
T
N
 
V
P
 
S
R
 
G
T
 
V
K
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
C
D
|
D
P
x
I
W
 
V
K
 
A
E
 
G
G
x
R
V
 
A
N
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
L
M
 
D
Q
 
K
L
 
Y
G
 
A
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
K
-
 
D
-
 
Y
Y
 
N
D
 
D
Y
 
Y
A
 
H
S
 
D
A
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
D
T
 
K
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
V
V
 
V
F
 
I
I
 
I
G
x
T
T
x
A
P
x
S
T
x
N
E
 
E
F
 
A
H
|
H
I
 
A
E
 
D
L
 
V
M
 
A
L
 
V
Q
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
N
L
 
A
G
 
N
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
V
D
 
T
Y
 
A
E
 
A
R
 
D
A
 
C
K
 
Q
A
 
R
A
 
V
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
K
-
 
R
-
 
M
V
 
V
M
 
Q
L
 
I
A
 
G
F
 
F
N
x
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
K
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
N
A
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
-
V
 
-
R
 
Q
Q
 
P
V
 
L
I
 
M
I
 
V
T
 
H
S
 
G
R
 
R
D
 
H
P
 
Y
A
 
N
L
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
V
A
 
P
Y
 
E
L
 
Y
E
 
K
T
 
T
S
 
P
G
 
Q
G
 
A
I
 
I
F
 
Y
R
 
E
D
 
T
M
 
L
T
 
-
I
 
I
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
M
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
L
G
 
N
E
 
E
E
 
D
-
 
Y
-
 
K
P
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
V
F
 
Y
A
 
F
V
 
P
G
 
R
S
 
Q
R
 
S
L
 
S
V
 
L
D
 
V
P
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
R
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
L
V
 
V
L
 
V
M
 
M
R
 
E
T
 
T
A
 
T
S
 
S
G
 
G
R
 
I
Q
 
N
C
 
I
H
 
V
I
 
V
N
 
E
C
 
V
C
 
F
R
 
V
E
 
N
A
 
C
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
H
L
 
C
E
 
D
V
 
V
S
 
T
G
 
G
S
 
E
K
 
K
G
 
G
M
 
M
L
 
A
L
 
E
N
 
L
E
 
P
N
 
T
H
 
V
R
 
A
T
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
R
R
 
K
Y
 
A
G
 
A
A
 
K
E
 
Y
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
V
F
 
D
F
x
W
L
 
K
E
 
Q
R
 
R
H
 
F
A
 
I
D
 
D
S
 
A
Y
|
Y
K
 
D
I
 
I
E
 
E
L
 
F
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
F
D
 
D
A
 
R
V
 
L
E
 
N
N
 
A
N
 
G
S
 
L
P
 
P
M
 
-
P
 
P
A
 
A
T
 
G
P
 
P
R
 
T
-
 
S
-
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
L
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
T
 
T
G
 
G

3nt5A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor and product inosose (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:327/337 of 3nt5A

query
sites
3nt5A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
K
 
K
I
 
E
H
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
N
V
 
R
A
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
K
R
 
L
T
 
S
-
 
G
-
 
A
K
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
P
x
V
W
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
V
 
A
N
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
Q
C
 
L
E
 
N
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
-
 
Y
-
 
P
D
 
N
Y
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
V
G
 
T
T
x
S
P
x
W
T
x
G
E
 
P
F
 
A
H
 
H
I
 
E
E
 
S
L
 
S
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
K
L
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
T
D
 
T
Y
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
C
K
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
E
 
I
R
 
K
L
 
V
N
 
G
G
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
M
 
Q
L
 
V
A
 
G
F
 
F
N
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
S
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
E
V
 
P
R
 
L
Q
 
M
V
 
I
I
 
H
I
 
C
T
 
A
S
x
H
R
 
R
D
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
Y
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
T
G
 
D
G
 
M
I
 
A
F
 
V
R
 
V
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
L
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
V
G
 
N
E
 
D
-
 
D
-
 
Y
E
 
E
P
 
S
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
-
 
I
F
 
Y
A
 
P
V
 
K
G
 
K
S
 
S
R
 
K
L
 
N
V
 
A
D
 
L
P
 
P
T
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
V
M
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
A
Q
 
E
C
 
I
H
 
Y
I
 
V
N
 
N
C
 
C
C
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
x
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
Q
L
 
C
E
 
E
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
E
K
 
D
G
 
G
M
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
L
E
 
P
N
 
E
H
 
P
R
 
S
T
 
S
N
 
I
S
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
E
 
F
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
M
F
 
D
F
 
W
L
 
Q
E
 
R
R
 
R
H
 
F
A
 
V
D
 
A
S
 
A
Y
|
Y
K
 
D
I
 
V
E
 
E
L
 
I
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
Q
N
 
K
N
 
K
S
 
G
P
 
E
M
 
V
P
 
S
A
 
G
-
 
P
T
 
T
P
 
A
R
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
T
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
V
 
E
R
 
K
V
 
V

3nt4A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor nadh and inositol (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:327/337 of 3nt4A

query
sites
3nt4A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
T
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
K
 
K
I
 
E
H
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
N
V
 
R
A
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
K
R
 
L
T
 
S
-
 
G
-
 
A
K
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
P
x
V
W
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
V
 
A
N
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
Q
C
 
L
E
 
N
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
-
 
Y
-
 
P
D
 
N
Y
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
V
G
 
T
T
x
S
P
x
W
T
x
G
E
 
P
F
 
A
H
 
H
I
 
E
E
 
S
L
 
S
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
K
L
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
T
D
 
T
Y
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
C
K
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
E
 
I
R
 
K
L
 
V
N
 
G
G
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
M
 
Q
L
 
V
A
 
G
F
 
F
N
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
S
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
E
V
 
P
R
 
L
Q
 
M
V
 
I
I
 
H
I
 
C
T
 
A
S
x
H
R
 
R
D
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
Y
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
T
G
 
D
G
 
M
I
 
A
F
 
V
R
 
V
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
L
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
V
G
 
N
E
 
D
-
 
D
-
 
Y
E
 
E
P
 
S
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
-
 
I
F
 
Y
A
 
P
V
 
K
G
 
K
S
 
S
R
 
K
L
 
N
V
 
A
D
 
L
P
 
P
T
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
V
M
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
A
Q
 
E
C
 
I
H
 
Y
I
 
V
N
 
N
C
 
C
C
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
x
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
Q
L
 
C
E
 
E
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
E
K
 
D
G
 
G
M
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
L
E
 
P
N
 
E
H
 
P
R
 
S
T
 
S
N
 
I
S
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
E
 
F
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
M
F
 
D
F
x
W
L
 
Q
E
 
R
R
 
R
H
 
F
A
 
V
D
 
A
S
 
A
Y
 
Y
K
 
D
I
 
V
E
 
E
L
 
I
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
Q
N
 
K
N
 
K
S
 
G
P
 
E
M
 
V
P
 
S
A
 
G
-
 
P
T
 
T
P
 
A
R
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
T
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
V
 
E
R
 
K
V
 
V

3nt2B Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:327/337 of 3nt2B

query
sites
3nt2B
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
R
x
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
E
H
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
N
V
 
R
A
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
K
R
 
L
T
 
S
-
 
G
-
 
A
K
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
P
x
V
W
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
V
 
A
N
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
Q
C
 
L
E
 
N
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
-
 
Y
-
 
P
D
 
N
Y
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
V
G
 
T
T
x
S
P
x
W
T
 
G
E
 
P
F
x
A
H
 
H
I
 
E
E
 
S
L
 
S
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
K
L
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
 
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
T
D
 
T
Y
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
C
K
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
E
 
I
R
 
K
L
 
V
N
 
G
G
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
M
 
Q
L
 
V
A
 
G
F
 
F
N
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
S
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
E
V
 
P
R
 
L
Q
 
M
V
 
I
I
 
H
I
 
C
T
 
A
S
 
H
R
 
R
D
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
Y
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
T
G
 
D
G
 
M
I
 
A
F
 
V
R
 
V
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
L
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
V
G
 
N
E
 
D
-
 
D
-
 
Y
E
 
E
P
 
S
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
-
 
I
F
 
Y
A
 
P
V
 
K
G
 
K
S
 
S
R
 
K
L
 
N
V
 
A
D
 
L
P
 
P
T
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
V
M
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
A
Q
 
E
C
 
I
H
 
Y
I
 
V
N
 
N
C
 
C
C
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
Q
L
 
C
E
 
E
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
E
K
 
D
G
 
G
M
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
L
E
 
P
N
 
E
H
 
P
R
 
S
T
 
S
N
 
I
S
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
E
 
F
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
M
F
 
D
F
x
W
L
 
Q
E
 
R
R
 
R
H
 
F
A
 
V
D
 
A
S
 
A
Y
|
Y
K
 
D
I
 
V
E
 
E
L
 
I
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
Q
N
 
K
N
 
K
S
 
G
P
 
E
M
 
V
P
 
S
A
 
G
-
 
P
T
 
T
P
 
A
R
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
T
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
V
 
E
R
 
K
V
 
V

3nt2A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:327/337 of 3nt2A

query
sites
3nt2A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
|
G
A
 
T
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
K
 
K
I
 
E
H
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
N
V
 
R
A
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
K
R
 
L
T
 
S
-
 
G
-
 
A
K
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
P
x
V
W
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
V
 
A
N
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
Q
C
 
L
E
 
N
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
-
 
Y
-
 
P
D
 
N
Y
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
V
G
 
T
T
x
S
P
x
W
T
x
G
E
 
P
F
x
A
H
|
H
I
 
E
E
 
S
L
 
S
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
K
L
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
T
D
 
T
Y
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
C
K
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
E
 
I
R
 
K
L
 
V
N
 
G
G
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
M
 
Q
L
 
V
A
 
G
F
 
F
N
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
S
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
E
V
 
P
R
 
L
Q
 
M
V
 
I
I
 
H
I
 
C
T
 
A
S
 
H
R
 
R
D
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
Y
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
T
G
 
D
G
 
M
I
 
A
F
 
V
R
 
V
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
L
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
V
G
 
N
E
 
D
-
 
D
-
 
Y
E
 
E
P
 
S
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
-
 
I
F
 
Y
A
 
P
V
 
K
G
 
K
S
 
S
R
 
K
L
 
N
V
 
A
D
 
L
P
 
P
T
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
V
M
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
A
Q
 
E
C
 
I
H
 
Y
I
 
V
N
 
N
C
 
C
C
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
Q
L
 
C
E
 
E
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
E
K
 
D
G
 
G
M
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
L
E
 
P
N
 
E
H
 
P
R
 
S
T
 
S
N
 
I
S
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
E
 
F
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
M
F
 
D
F
 
W
L
 
Q
E
 
R
R
 
R
H
 
F
A
 
V
D
 
A
S
 
A
Y
|
Y
K
 
D
I
 
V
E
 
E
L
 
I
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
Q
N
 
K
N
 
K
S
 
G
P
 
E
M
 
V
P
 
S
A
 
G
-
 
P
T
 
T
P
 
A
R
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
T
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
V
 
E
R
 
K
V
 
V

4l8vA Crystal structure of a12k/d35s mutant myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor NADP (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 3:327/337 of 4l8vA

query
sites
4l8vA
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
T
G
 
G
R
x
K
I
|
I
G
 
G
K
 
K
I
 
E
H
 
H
A
 
I
A
 
-
N
 
N
V
 
R
A
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
K
R
 
L
T
 
S
-
 
G
-
 
A
K
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
T
D
 
S
P
 
V
W
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
V
 
A
N
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
V
M
 
E
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
Q
C
 
L
E
 
N
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
-
 
Y
-
 
P
D
 
N
Y
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
V
G
 
T
T
x
S
P
x
W
T
 
G
E
 
P
F
 
A
H
|
H
I
 
E
E
 
S
L
 
S
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
K
L
 
A
G
 
Q
K
 
K
P
 
Y
V
 
V
I
 
F
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
T
D
 
T
Y
 
A
E
 
E
R
 
G
A
 
C
K
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
E
 
I
R
 
K
L
 
V
N
 
G
G
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
M
 
Q
L
 
V
A
 
G
F
 
F
N
x
M
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
P
 
S
D
 
G
Y
 
Y
L
 
V
R
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
E
V
 
P
R
 
L
Q
 
M
V
 
I
I
 
H
I
 
C
T
 
A
S
 
H
R
 
R
D
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
Y
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
S
 
T
G
 
D
G
 
M
I
 
A
F
 
V
R
 
V
D
 
D
M
 
T
T
 
L
I
 
V
H
|
H
D
 
E
F
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
L
R
 
H
S
 
W
L
 
L
L
 
V
G
 
N
E
 
D
-
 
D
-
 
Y
E
 
E
P
 
S
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
-
 
I
F
 
Y
A
 
P
V
 
K
G
 
K
S
 
S
R
 
K
L
 
N
V
 
A
D
 
L
P
 
P
T
 
H
L
 
L
E
 
K
S
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
P
V
 
Q
M
 
I
V
 
V
L
 
V
M
 
I
R
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
I
-
 
N
R
 
A
Q
 
E
C
 
I
H
 
Y
I
 
V
N
 
N
C
 
C
C
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
Q
 
I
R
 
Q
L
 
C
E
 
E
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
E
K
 
D
G
 
G
M
 
I
L
 
I
L
 
K
N
 
L
E
 
P
N
 
E
H
 
P
R
 
S
T
 
S
N
 
I
S
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
E
 
F
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
N
 
M
F
 
D
F
x
W
L
 
Q
E
 
R
R
 
R
H
 
F
A
 
V
D
 
A
S
 
A
Y
|
Y
K
 
D
I
 
V
E
 
E
L
 
I
N
 
Q
S
 
D
F
 
F
L
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
I
E
 
Q
N
 
K
N
 
K
S
 
G
P
 
E
M
 
V
P
 
S
A
 
G
-
 
P
T
 
T
P
 
A
R
 
W
D
 
D
G
 
G
L
 
Y
R
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
V
L
 
T
A
 
T
N
 
D
C
 
A
A
 
C
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
K
V
 
E
R
 
K
V
 
V

8qc8D Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ (see paper)
26% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 2:338/339 of 8qc8D

query
sites
8qc8D
L
 
I
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
x
H
I
x
M
G
 
A
K
 
R
I
 
E
H
 
H
A
 
V
A
 
R
N
 
N
V
 
L
A
 
A
T
 
L
N
 
I
P
 
P
R
 
G
T
 
S
K
 
L
L
 
I
V
 
T
V
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
P
|
P
W
x
T
K
 
P
E
 
S
G
x
S
V
 
L
N
 
E
A
 
E
L
 
T
A
 
A
M
 
R
Q
 
E
L
 
I
G
 
G
C
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
A
 
Q
S
 
T
A
 
F
I
 
S
E
 
A
R
 
H
T
 
K
D
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
F
 
V
I
 
I
G
x
A
T
x
S
P
|
P
T
x
N
E
 
D
F
 
T
H
|
H
I
 
L
E
 
E
L
 
I
M
 
L
L
 
K
Q
 
D
A
 
I
V
 
F
R
 
A
L
 
S
G
 
G
K
 
T
-
 
N
-
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
L
C
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
V
D
 
C
M
 
T
D
 
S
Y
 
A
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
K
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
N
 
T
G
 
A
R
 
P
V
 
V
M
 
W
L
 
V
A
 
A
F
 
M
N
x
E
R
 
Y
R
 
R
F
 
Y
D
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
V
L
 
Q
R
 
E
L
 
I
R
 
I
R
 
Q
A
 
A
I
 
A
D
 
H
D
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
N
V
 
I
R
 
H
Q
 
M
V
 
L
-
 
S
I
 
I
I
 
V
T
 
E
S
 
H
R
 
R
D
 
F
P
 
P
A
 
F
L
 
L
-
 
H
-
x
K
-
x
V
-
 
D
A
 
A
A
x
W
R
 
N
A
 
R
Y
 
F
L
 
A
E
 
E
T
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
T
F
 
L
R
 
V
D
 
E
M
 
K
T
 
C
I
 
C
H
 
H
D
 
F
F
 
F
D
 
D
M
 
L
A
 
M
R
 
R
S
 
L
L
 
I
L
 
L
G
 
Q
E
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
E
 
R
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
V
 
S
G
 
G
S
 
G
R
 
H
L
 
D
V
 
V
D
 
N
P
 
H
T
 
S
L
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
D
D
 
M
Y
 
V
D
 
D
S
 
N
V
 
A
M
 
Y
V
 
V
L
 
I
M
 
V
R
 
D
T
 
F
A
 
K
S
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
R
C
 
A
H
 
M
I
 
L
N
 
E
C
 
L
C
 
S
R
 
M
E
 
F
A
 
A
V
 
E
-
 
G
Y
 
S
G
 
K
F
 
F
D
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
S
V
 
I
S
 
V
G
 
G
S
 
D
K
 
A
G
 
A
M
 
K
L
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
P
L
 
V
N
 
A
E
 
A
N
 
N
H
 
H
R
 
W
T
 
I
N
 
E
S
 
G
V
 
D
R
 
E
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
T
E
 
E
A
 
A
T
 
T
D
 
V
V
 
E
A
 
F
D
 
S
P
 
P
L
 
R
L
 
S
N
 
P
F
 
L
F
 
G
L
 
P
E
 
E
R
 
K
H
 
H
A
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
T
K
 
Y
I
 
Y
E
 
E
L
 
H
N
 
L
S
 
G
F
 
Y
L
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
L
N
 
G
N
 
E
S
 
G
P
 
P
M
 
V
P
 
D
A
 
V
T
 
T
P
 
V
R
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
M
A
 
G
N
 
L
C
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
Q
S
 
S
A
 
I
E
 
I
T
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
A
V
 
V
R
 
E
V
 
L

1rydA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis
27% identity, 83% coverage: 52:328/333 of query aligns to 85:369/381 of 1rydA

query
sites
1rydA
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
S
 
N
-
 
F
-
 
D
-
 
K
A
 
I
I
 
A
E
 
K
R
 
D
T
 
P
D
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
G
 
I
T
x
L
P
|
P
T
x
N
E
 
S
F
x
L
H
|
H
I
 
A
E
 
E
L
 
F
M
 
A
L
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
R
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
D
 
A
M
 
T
D
 
S
Y
 
V
E
 
A
R
 
D
A
 
C
K
 
Q
A
 
R
A
 
M
V
 
I
D
 
D
E
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
K
V
 
L
M
 
M
L
 
I
A
 
G
F
 
Y
N
x
R
R
 
C
R
 
H
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
D
 
A
Y
 
A
L
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
N
D
 
Q
D
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
M
V
 
V
-
 
T
-
 
T
-
 
D
R
 
N
Q
 
S
V
 
D
I
 
V
I
 
M
T
 
D
S
 
Q
R
 
N
D
 
D
P
 
P
A
|
A
L
 
Q
A
 
Q
A
x
W
R
|
R
A
 
L
Y
 
R
L
 
R
E
 
E
-
 
L
T
 
A
S
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
S
F
 
L
R
 
M
D
 
D
M
 
I
T
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
G
F
 
L
D
 
N
M
 
G
A
 
T
R
 
R
S
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
R
A
 
A
V
x
Y
G
 
-
S
 
-
R
 
T
L
 
Y
V
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
N
L
 
D
E
 
E
S
 
R
I
 
F
P
 
V
D
 
E
Y
 
V
-
 
E
D
 
D
S
 
R
V
 
I
M
x
I
V
 
W
L
x
Q
M
 
M
R
 
R
T
 
F
A
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
Q
 
L
C
 
S
H
 
H
I
 
-
N
 
-
C
 
G
C
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
Y
V
 
S
Y
 
T
G
 
T
F
 
T
D
 
T
Q
 
S
R
 
R
L
 
F
E
 
S
V
 
V
S
 
Q
G
 
G
S
 
D
K
 
K
G
 
A
M
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
-
E
 
-
N
 
-
H
 
-
R
 
-
T
 
M
N
 
D
S
 
P
V
 
A
R
 
T
R
 
G
Y
|
Y
G
 
Y
A
 
Q
E
 
N
A
 
L
T
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
Q
D
 
T
P
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
A
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
L
 
M
L
 
M
N
 
P
F
 
Q
F
 
F
L
 
I
E
 
M
R
 
P
H
 
A
A
 
N
D
 
N
S
 
Q
Y
 
F
K
 
S
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
D
S
 
H
F
 
L
L
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
K
P
 
P
M
 
V
P
 
R
A
 
S
T
 
P
P
 
G
R
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
Q
A
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
I
N
 
Q
C
 
A
A
 
I
S
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
A
E
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1h6dA Oxidized precursor form of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis complexed with glycerol (see paper)
27% identity, 83% coverage: 52:328/333 of query aligns to 87:371/383 of 1h6dA

query
sites
1h6dA
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
S
 
N
-
 
F
-
 
D
-
 
K
A
 
I
I
 
A
E
 
K
R
 
D
T
 
P
D
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
G
x
I
T
x
L
P
|
P
T
x
N
E
 
S
F
 
L
H
|
H
I
 
A
E
 
E
L
 
F
M
 
A
L
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
R
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
D
 
A
M
 
T
D
 
S
Y
 
V
E
 
A
R
 
D
A
 
C
K
 
Q
A
 
R
A
 
M
V
 
I
D
 
D
E
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
K
V
 
L
M
 
M
L
 
I
A
 
G
F
 
Y
N
x
R
R
 
C
R
 
H
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
D
 
A
Y
 
A
L
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
N
D
 
Q
D
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
M
V
 
V
-
 
T
-
 
T
-
 
D
R
 
N
Q
 
S
V
 
D
I
 
V
I
 
M
T
 
D
S
 
Q
R
 
N
D
 
D
P
 
P
A
|
A
L
 
Q
A
 
Q
A
x
W
R
|
R
A
 
L
Y
 
R
L
 
R
E
 
E
-
 
L
T
 
A
S
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
S
F
 
L
R
 
M
D
|
D
M
 
I
T
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
G
F
 
L
D
 
N
M
 
G
A
 
T
R
 
R
S
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
R
A
 
A
V
 
Y
G
 
-
S
 
-
R
 
T
L
 
Y
V
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
N
L
 
D
E
 
E
S
 
R
I
 
F
P
 
V
D
 
E
Y
 
V
-
 
E
D
 
D
S
 
R
V
 
I
M
 
I
V
 
W
L
 
Q
M
 
M
R
 
R
T
 
F
A
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
Q
 
L
C
 
S
H
 
H
I
 
-
N
 
-
C
 
G
C
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
Y
V
 
S
Y
 
T
G
 
T
F
 
T
D
 
T
Q
 
S
R
 
R
L
 
F
E
 
S
V
 
V
S
 
Q
G
 
G
S
 
D
K
 
K
G
 
A
M
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
-
E
 
-
N
 
-
H
 
-
R
 
-
T
 
M
N
 
D
S
 
P
V
 
A
R
 
T
R
 
G
Y
|
Y
G
 
Y
A
 
Q
E
 
N
A
 
L
T
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
Q
D
 
T
P
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
A
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
L
 
M
L
 
M
N
 
P
F
 
Q
F
 
F
L
 
I
E
 
M
R
 
P
H
 
A
A
 
N
D
 
N
S
 
Q
Y
 
F
K
 
S
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
D
S
 
H
F
 
L
L
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
K
P
 
P
M
 
V
P
 
R
A
 
S
T
 
P
P
 
G
R
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
Q
A
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
I
N
 
Q
C
 
A
A
 
I
S
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
A
E
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1evjA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase (gfor) delta1-22 s64d (see paper)
26% identity, 91% coverage: 26:328/333 of query aligns to 28:328/340 of 1evjA

query
sites
1evjA
T
 
S
K
 
R
L
 
I
V
 
E
V
 
A
I
 
L
A
 
V
D
|
D
P
 
G
W
 
N
K
 
A
E
 
E
G
 
K
V
 
A
N
 
K
A
 
I
L
 
V
A
 
A
M
 
A
Q
 
E
L
 
Y
G
 
G
C
 
V
E
 
D
-
 
P
-
 
R
A
 
K
A
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
A
 
S
S
 
N
-
 
F
-
 
D
-
 
K
A
 
I
I
 
A
E
 
K
R
 
D
T
 
P
D
 
K
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
G
 
I
T
x
L
P
|
P
T
x
N
E
 
S
F
 
L
H
|
H
I
 
A
E
 
E
L
 
F
M
 
A
L
 
I
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
R
 
K
L
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
I
 
M
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
M
D
 
A
M
 
T
D
 
S
Y
 
V
E
 
A
R
 
D
A
 
C
K
 
Q
A
 
R
A
 
M
V
 
I
D
 
D
E
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
K
V
 
L
M
 
M
L
 
I
A
 
G
F
 
Y
N
x
R
R
 
C
R
 
H
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
D
 
A
Y
 
A
L
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
N
D
 
Q
D
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
M
V
 
V
-
 
T
-
 
T
-
 
D
R
 
N
Q
 
S
V
 
D
I
 
V
I
 
M
T
 
D
S
 
Q
R
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
Q
A
 
Q
A
x
W
R
|
R
A
 
L
Y
 
R
L
 
R
E
 
E
-
 
L
T
 
A
S
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
S
F
 
L
R
 
M
D
 
D
M
 
I
T
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
G
F
 
L
D
 
N
M
 
G
A
 
T
R
 
R
S
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
R
A
 
A
V
 
Y
G
 
-
S
 
-
R
 
T
L
 
Y
V
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
N
L
 
D
E
 
E
S
 
R
I
 
F
P
 
V
D
 
E
Y
 
V
-
 
E
D
 
D
S
 
R
V
 
I
M
 
I
V
 
W
L
 
Q
M
 
M
R
 
R
T
 
F
A
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
Q
 
L
C
 
S
H
 
H
I
 
-
N
 
-
C
 
G
C
 
A
R
 
S
E
 
S
A
 
Y
V
 
S
Y
 
T
G
 
T
F
 
T
D
 
T
Q
 
S
R
 
R
L
 
F
E
 
S
V
 
V
S
 
Q
G
 
G
S
 
D
K
 
K
G
 
A
M
 
V
L
 
L
L
 
L
N
 
-
E
 
-
N
 
-
H
 
-
R
 
-
T
 
M
N
 
D
S
 
P
V
 
A
R
 
T
R
 
G
Y
|
Y
G
 
Y
A
 
Q
E
 
N
A
 
L
T
 
I
D
 
S
V
 
V
A
 
Q
D
 
T
P
 
P
L
 
M
L
 
-
N
 
-
F
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
P
H
 
A
A
 
N
D
 
N
S
 
Q
Y
 
F
K
 
S
I
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
D
S
 
H
F
 
L
L
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
K
P
 
P
M
 
V
P
 
R
A
 
S
T
 
P
P
 
G
R
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
Q
A
 
D
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
I
N
 
Q
C
 
A
A
 
I
S
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
A
E
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2glxA Crystal structure analysis of bacterial 1,5-af reductase (see paper)
30% identity, 81% coverage: 62:330/333 of query aligns to 62:328/332 of 2glxA

query
sites
2glxA
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
G
x
S
T
|
T
P
 
T
T
x
N
E
 
E
F
 
L
H
|
H
I
 
R
E
 
E
L
 
Q
M
 
T
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
V
I
 
L
C
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
I
 
L
D
 
A
M
 
M
D
 
T
Y
 
L
E
 
E
R
 
D
A
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
M
V
 
V
D
 
-
E
 
-
L
 
V
E
 
A
R
 
A
L
 
R
N
 
E
G
 
A
R
 
G
V
 
V
M
 
V
L
 
L
A
 
G
F
 
T
N
 
N
R
 
H
-
x
H
-
 
L
R
 
R
F
 
N
D
 
A
P
 
A
D
 
A
Y
 
H
L
 
R
R
 
A
L
 
M
R
 
R
R
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
-
 
R
-
 
P
V
 
I
V
 
A
R
 
A
Q
 
R
V
 
V
I
 
F
I
 
H
T
 
A
S
 
V
R
 
Y
D
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
H
A
 
L
A
 
Q
R
 
G
A
x
W
Y
x
R
L
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
P
E
 
E
T
 
A
S
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
F
 
I
R
 
L
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
V
H
|
H
D
 
D
F
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
L
R
 
R
S
 
F
L
 
V
L
 
L
G
 
N
E
 
D
E
 
D
P
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
-
S
 
S
R
 
H
L
 
S
V
 
A
D
 
G
P
 
M
T
 
G
L
 
K
E
 
E
S
 
G
I
 
V
P
 
E
D
 
-
Y
 
-
D
 
D
S
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
G
L
 
V
M
 
L
R
 
R
T
 
F
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
V
Q
 
I
C
 
A
H
 
Q
I
 
F
N
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
F
C
 
T
C
 
T
R
 
K
E
 
F
A
 
A
V
 
E
Y
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
E
V
 
V
S
 
H
G
 
G
S
 
T
K
 
E
G
 
G
M
 
S
L
 
L
L
 
I
N
 
G
E
 
R
N
 
N
H
 
V
R
 
M
T
 
T
N
 
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
V
S
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
N
Y
 
A
G
 
E
A
 
G
E
 
E
A
 
S
T
 
Q
D
 
L
V
 
P
A
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
L
 
-
N
 
-
F
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
A
D
 
N
S
 
L
Y
|
Y
K
 
E
I
 
T
E
 
A
L
 
L
N
 
A
S
 
A
F
 
F
L
 
H
D
 
S
A
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
G
N
 
H
S
 
G
P
 
Q
M
 
P
P
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
G
R
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
V
R
 
W
A
 
S
L
 
L
R
 
A
L
 
T
A
 
G
N
 
L
C
 
A
A
 
V
S
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
E
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
V
 
A
V
 
A
R
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6jw6A The crystal structure of kand2 in complex with NAD (see paper)
28% identity, 99% coverage: 2:330/333 of query aligns to 2:336/341 of 6jw6A

query
sites
6jw6A
L
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
x
F
I
x
M
G
 
G
K
 
G
I
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
E
N
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
A
N
 
H
P
 
P
R
 
G
T
 
A
K
 
R
L
 
L
V
 
E
V
 
A
I
 
V
A
 
H
D
|
D
P
x
L
W
 
D
K
 
P
E
 
A
G
 
A
V
 
A
N
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
R
C
 
A
E
 
E
-
 
R
A
 
A
A
 
E
Y
 
P
D
 
S
Y
 
W
A
 
A
S
 
D
A
 
L
I
 
L
E
 
A
R
 
D
T
 
P
D
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
L
V
 
L
F
 
I
I
 
I
G
x
T
T
|
T
P
|
P
T
x
N
E
 
G
F
x
L
H