SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1005 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1005 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4irxA Crystal structure of caulobacter myo-inositol binding protein bound to myo-inositol (see paper)
47% identity, 89% coverage: 31:312/317 of query aligns to 10:292/296 of 4irxA

query
sites
4irxA
K
 
E
I
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
F
Q
 
N
T
 
D
L
 
L
S
 
S
I
x
Q
P
 
P
Y
x
F
F
 
F
I
 
V
Y
 
A
M
 
M
H
 
R
E
 
R
Q
 
E
A
 
L
S
 
E
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
K
 
A
V
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
V
E
 
K
L
 
V
L
 
Q
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
N
S
 
N
S
 
S
T
 
S
K
 
K
Q
 
Q
S
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
L
E
 
Q
N
 
A
A
 
A
L
 
A
T
 
V
Q
 
Q
G
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
V
M
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
T
D
 
D
V
 
S
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
G
A
 
A
L
 
A
N
 
D
E
 
D
V
 
L
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
K
 
G
V
 
V
P
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
S
V
 
V
D
|
D
R
|
R
R
 
N
V
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
G
D
 
K
T
 
T
P
 
A
V
 
V
P
 
P
Y
 
H
V
 
V
T
 
G
A
 
A
D
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
A
E
 
D
L
 
W
V
 
V
T
 
V
S
 
K
N
 
T
M
 
Y
K
 
P
N
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
F
 
V
I
 
I
G
 
T
G
x
N
T
x
D
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
T
x
S
A
 
S
I
 
I
D
 
E
R
|
R
A
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
H
 
H
E
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
P
K
 
A
F
 
F
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
Q
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
x
S
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
T
V
 
V
A
 
T
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
L
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
M
S
 
R
A
 
D
N
 
T
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
C
A
 
L
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
A
G
 
G
L
 
L
-
 
D
K
 
S
G
 
A
K
 
K
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
A
Y
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
R
I
 
I
R
 
K
D
 
A
G
 
G
D
 
E
I
 
M
A
 
V
G
 
A
I
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
|
Q
S
 
N
P
 
P
S
 
G
K
 
L
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
V
 
V
K
 
D
K
 
K
V
 
I
R
 
K
G
 
S
E
 
G
G
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
K
T
 
S
V
 
V
I
 
S
V
 
L
Q
 
K
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
S
E
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
A
 
A
E
 
S
Q
 
R

4rxmA Crystal structure of periplasmic abc transporter solute binding protein a7jw62 from mannheimia haemolytica phl213, target efi-511105, in complex with myo-inositol
39% identity, 91% coverage: 30:316/317 of query aligns to 5:290/291 of 4rxmA

query
sites
4rxmA
E
 
E
K
 
L
I
 
V
L
 
V
I
 
F
N
 
S
F
 
L
Q
 
P
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
 
S
P
 
P
Y
 
F
F
x
E
I
 
V
Y
 
Q
M
 
L
H
 
Q
E
 
K
Q
 
V
A
 
A
S
 
V
Q
 
E
E
 
T
A
 
S
K
 
K
V
 
K
L
 
L
N
x
E
V
x
I
E
 
K
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
S
 
S
T
 
T
K
 
K
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
D
V
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
G
M
 
I
V
 
I
V
 
I
A
 
S
P
 
P
N
 
N
D
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
S
P
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
I
S
 
K
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
A
T
 
T
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
D
 
-
T
 
K
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Y
 
H
V
 
F
T
 
G
A
 
A
D
 
N
S
 
N
V
 
Y
A
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
L
 
E
M
 
V
A
 
A
E
 
K
L
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
A
N
 
K
M
 
Y
K
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
A
 
I
F
 
L
I
 
L
G
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
T
x
S
A
 
N
I
 
I
D
 
E
R
|
R
A
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
R
E
 
D
G
 
E
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
D
K
 
K
F
 
Y
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
E
 
N
W
|
W
E
 
L
R
 
R
A
 
S
K
 
E
A
 
G
M
 
L
S
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
N
 
S
I
 
V
L
 
L
T
 
P
S
 
T
L
 
L
S
 
K
A
 
E
N
 
K
P
 
-
P
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
I
I
 
I
C
 
S
A
 
A
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
-
 
A
G
 
G
K
 
D
V
 
I
K
 
L
V
 
V
I
 
T
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
S
Y
 
T
P
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
R
I
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
W
I
 
L
A
 
Y
G
 
L
I
 
T
V
 
A
E
 
D
Q
|
Q
S
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
F
Q
 
A
I
 
V
R
 
S
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
M
 
Q
A
 
V
V
 
V
K
 
G
K
 
N
V
 
I
R
 
R
G
 
E
E
 
S
G
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
S
T
 
G
V
 
A
I
 
D
V
 
Y
Q
 
P
P
 
P
F
 
K
M
 
I
I
 
I
T
 
L
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
Y
 
F
S
 
A
A
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4rxmB Crystal structure of periplasmic abc transporter solute binding protein a7jw62 from mannheimia haemolytica phl213, target efi-511105, in complex with myo-inositol
39% identity, 91% coverage: 30:316/317 of query aligns to 3:288/288 of 4rxmB

query
sites
4rxmB
E
 
E
K
 
L
I
 
V
L
 
V
I
 
F
N
 
S
F
 
L
Q
 
P
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
 
S
P
 
P
Y
 
F
F
x
E
I
 
V
Y
 
Q
M
 
L
H
 
Q
E
 
K
Q
 
V
A
 
A
S
 
V
Q
 
E
E
 
T
A
 
S
K
 
K
V
 
K
L
 
L
N
 
E
V
 
I
E
 
K
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
S
 
S
T
 
T
K
 
K
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
D
V
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
G
M
 
I
V
 
I
V
 
I
A
 
S
P
 
P
N
 
N
D
 
D
V
 
V
T
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
S
P
 
G
A
 
A
L
 
V
N
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
I
S
 
K
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
A
T
 
T
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
S
T
 
S
D
 
-
T
 
K
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Y
 
H
V
 
F
T
 
G
A
 
A
D
 
N
S
 
N
V
 
Y
A
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
L
 
E
M
 
V
A
 
A
E
 
K
L
 
A
V
 
V
T
 
K
S
 
A
N
 
K
M
 
Y
K
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
A
 
I
F
 
L
I
 
L
G
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
T
T
x
S
A
 
N
I
 
I
D
 
E
R
|
R
A
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
R
E
 
D
G
 
E
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
D
K
 
K
F
 
Y
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
E
 
N
W
|
W
E
 
L
R
 
R
A
 
S
K
 
E
A
 
G
M
 
L
S
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
N
 
S
I
 
V
L
 
L
T
 
P
S
 
T
L
|
L
S
x
K
A
x
E
N
 
K
P
 
-
P
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
I
I
 
I
C
 
S
A
 
A
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
S
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
-
 
A
G
 
G
K
 
D
V
 
I
K
 
L
V
 
V
I
 
T
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
S
Y
 
T
P
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
R
I
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
W
I
 
L
A
 
Y
G
 
L
I
 
T
V
 
A
E
 
D
Q
|
Q
S
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
F
Q
 
A
I
 
V
R
 
S
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
M
 
Q
A
 
V
V
 
V
K
 
G
K
 
N
V
 
I
R
 
R
G
 
E
E
 
S
G
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
S
T
 
G
V
 
A
I
 
D
V
 
Y
Q
 
P
P
 
P
F
 
K
M
 
I
I
 
I
T
 
L
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
Y
 
F
S
 
A
A
 
E
I
 
I

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
35% identity, 85% coverage: 38:307/317 of query aligns to 9:273/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
T
 
T
L
 
L
S
 
N
I
x
N
P
 
P
Y
x
F
F
|
F
I
 
V
Y
 
T
M
 
L
H
 
K
E
 
N
Q
 
G
A
 
A
S
 
E
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
K
L
 
I
L
 
I
V
 
V
Q
 
E
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
S
T
 
S
K
 
K
Q
 
E
S
 
L
S
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
L
 
I
T
 
Q
Q
 
Q
G
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
V
M
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
V
D
 
D
V
 
S
T
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
V
P
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
N
S
 
S
E
 
K
K
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
I
D
|
D
R
|
R
R
 
S
V
 
A
E
 
N
G
 
G
T
 
G
D
 
D
T
 
V
P
 
-
V
 
V
P
 
C
Y
 
H
V
 
I
T
 
A
A
 
S
D
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
M
M
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
F
V
 
I
T
 
A
S
 
K
N
 
A
M
 
L
K
 
K
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
V
A
 
V
F
 
E
I
 
L
G
 
E
G
 
G
T
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
A
S
 
S
T
x
A
A
 
A
I
 
R
D
 
D
R
|
R
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
H
 
D
E
 
E
G
 
A
L
 
I
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
Q
S
 
A
G
 
A
E
 
D
W
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
P
 
K
-
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
I
 
F
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
A
T
 
A
G
 
N
L
 
R
K
 
Q
G
 
G
K
 
-
V
 
I
K
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
G
Y
 
T
P
 
E
E
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
K
D
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
M
A
 
A
G
 
A
I
 
T
V
 
I
E
 
A
Q
|
Q
S
 
Q
P
 
P
S
 
A
K
 
L
Q
 
M
I
 
G
R
 
S
T
 
L
A
 
G
L
 
V
R
 
E
M
 
M
A
 
A
V
 
D
K
 
K
K
 
Y
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
K
E
 
I
L
 
P
E
 
N
T
 
F
V
 
I
I
 
P
V
 
A
Q
 
E
P
 
L
F
 
K
M
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
E
N
 
N
L
 
V

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
31% identity, 90% coverage: 31:314/317 of query aligns to 10:283/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
K
 
K
I
 
L
L
 
G
I
 
V
N
 
S
F
 
I
Q
 
S
T
 
T
L
 
T
S
 
N
I
x
N
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
I
 
V
Y
 
A
M
 
M
H
 
K
E
 
D
Q
 
G
A
 
I
S
 
D
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
K
 
S
V
 
N
L
 
K
N
 
K
V
 
I
E
 
S
L
 
I
L
 
K
V
 
V
Q
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
D
S
 
D
S
 
A
T
 
A
K
 
R
Q
 
Q
S
 
A
S
 
D
D
 
D
V
 
V
E
 
Q
N
 
N
A
 
F
L
 
I
T
 
S
Q
 
Q
G
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
V
D
 
D
V
 
S
T
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
V
P
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
K
E
 
S
V
 
A
L
 
N
S
 
N
E
 
A
K
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
T
 
L
V
 
M
D
|
D
R
|
R
R
 
G
V
 
S
E
 
E
G
 
G
T
 
G
D
 
K
T
 
V
P
 
-
V
 
L
P
 
T
Y
 
T
V
 
V
T
 
A
A
 
S
D
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
M
M
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
Y
V
 
A
T
 
V
S
 
K
N
 
K
M
 
L
K
 
G
N
 
K
G
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
A
A
 
F
F
 
E
I
 
L
G
 
S
G
 
G
T
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
S
 
S
T
 
A
A
 
T
I
 
V
D
 
D
R
|
R
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
H
 
H
E
 
S
G
 
V
L
 
A
K
 
K
A
 
S
G
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
K
F
 
L
Q
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
S
E
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
E
 
N
W
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
L
S
 
N
V
 
T
A
 
T
E
 
Q
N
 
N
I
 
M
L
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
I
S
 
Q
A
 
G
N
 
H
P
 
K
P
 
D
D
 
V
A
 
Q
I
 
I
I
 
I
C
 
F
A
 
A
S
 
Q
G
x
N
D
 
D
-
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
K
A
 
S
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
G
 
N
K
 
-
V
 
V
K
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
A
L
 
H
R
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
S
G
 
A
I
 
T
V
 
I
E
 
A
Q
|
Q
S
 
Q
P
 
P
S
 
A
K
 
K
Q
 
M
I
 
G
R
 
E
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
M
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
D
K
 
Y
V
 
Y
R
 
K
G
 
G
E
 
K
G
 
-
E
 
K
L
 
V
E
 
E
T
 
K
V
 
E
I
 
T
V
 
I
Q
 
S
P
 
P
-
 
I
F
 
Y
M
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
N

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
34% identity, 81% coverage: 31:287/317 of query aligns to 4:264/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
K
 
Q
I
 
I
L
 
A
I
 
L
N
 
L
F
 
M
Q
x
K
T
 
T
L
 
L
S
 
S
I
x
N
P
 
E
Y
|
Y
F
 
F
I
 
I
Y
 
S
M
 
M
H
 
R
E
 
Q
Q
 
G
A
 
A
S
 
E
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
K
 
K
V
 
Q
L
 
K
N
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
D
 
V
A
 
A
Q
 
E
S
 
K
-
 
E
S
 
D
S
 
S
T
 
T
K
 
E
Q
 
Q
S
 
L
S
 
V
D
 
G
-
 
L
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
M
L
 
I
T
 
A
Q
 
K
G
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
T
P
 
P
N
 
N
D
 
D
V
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
F
N
 
Q
E
 
K
V
 
A
L
 
E
S
 
K
E
 
A
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
T
 
D
V
 
L
D
|
D
R
 
V
R
 
R
V
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
A
E
 
E
G
 
A
T
 
A
D
 
G
T
 
L
P
 
K
V
 
F
P
 
N
Y
 
Y
V
 
V
T
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
N
V
 
F
A
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
M
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
N
V
 
L
T
 
A
S
 
E
N
 
A
M
 
I
K
 
G
N
 
K
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
I
 
L
G
 
E
G
 
G
T
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
V
S
 
D
T
x
N
A
 
G
I
 
E
D
 
Q
R
|
R
A
 
K
K
 
G
G
 
G
V
 
A
H
 
L
E
 
K
G
 
A
L
 
F
K
 
-
A
 
A
G
 
E
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
E
 
N
W
|
W
E
 
E
R
 
T
A
 
E
K
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
N
V
 
V
A
 
T
E
 
T
N
 
N
I
 
I
L
 
L
T
 
T
S
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
A
N
 
N
P
 
P
P
 
N
-
 
I
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
F
C
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
D
D
 
N
M
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
N
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
L
V
 
V
I
 
S
G
 
G
F
 
Y
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
 
P
E
 
L
V
 
A
L
 
I
R
 
E
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
D
 
K
I
 
M
A
 
Q
G
 
N
I
 
T
V
 
I
E
 
D
Q
|
Q
S
 
L
P
 
P
S
 
K
K
 
K
Q
 
Q
I
 
V
R
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
E
M
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
K
 
Q
V
 
I
R
 
N

4zjpA Structure of an abc-transporter solute binding protein (sbp_ipr025997) from actinobacillus succinogenes (asuc_0197, target efi-511067) with bound beta-d-ribopyranose
31% identity, 82% coverage: 30:289/317 of query aligns to 3:255/270 of 4zjpA

query
sites
4zjpA
E
 
E
K
 
T
I
 
I
L
 
A
I
 
L
N
 
T
F
 
V
Q
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
D
I
x
N
P
 
P
Y
x
F
F
|
F
I
 
V
Y
 
S
M
 
L
H
 
K
E
 
D
Q
 
G
A
 
A
S
 
Q
Q
 
K
E
 
K
A
 
A
K
 
T
V
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
P
T
 
S
K
 
K
Q
 
E
S
 
L
S
 
S
D
 
N
V
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
L
 
T
T
 
V
Q
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
V
M
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
T
D
 
D
V
 
S
T
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
S
P
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
A
E
 
I
V
 
A
L
 
N
S
 
R
E
 
N
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
G
V
 
A
E
 
A
G
 
K
T
 
G
D
 
E
T
 
V
P
 
-
V
 
V
P
 
S
Y
 
H
V
 
I
T
 
A
A
 
S
D
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
M
M
 
A
A
 
G
E
 
D
L
 
F
V
 
I
T
 
A
S
 
Q
N
 
K
M
 
L
K
 
G
N
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
Q
I
 
L
G
 
E
G
 
G
T
 
L
P
 
A
G
 
G
S
 
T
S
 
S
T
 
A
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
|
R
A
 
G
K
 
E
G
 
G
V
 
F
H
 
K
E
 
Q
G
 
A
L
 
I
K
 
E
A
 
A
G
 
-
G
 
-
G
 
H
K
 
K
F
 
F
Q
 
D
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
E
 
D
W
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
T
K
 
K
A
 
G
M
 
L
S
 
N
V
 
V
A
 
T
E
 
E
N
 
N
I
 
L
L
 
L
T
 
A
S
 
-
L
 
-
S
 
S
A
 
K
N
 
G
P
 
S
P
 
V
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
I
 
F
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
S
A
 
A
T
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
-
G
 
K
K
 
K
V
 
V
K
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
G
Y
 
T
P
 
E
E
 
D
V
 
G
L
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
T
V
 
V
E
 
A
Q
|
Q
S
 
Q
P
 
P
S
 
E
K
 
L
Q
 
I
I
 
G
R
 
S
T
 
L
A
 
G
L
 
V
R
 
E
M
 
T
A
 
A
V
 
D
K
 
K
K
 
I
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
E

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
29% identity, 90% coverage: 28:311/317 of query aligns to 4:284/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
A
 
S
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
L
 
I
-
 
G
I
 
V
N
 
S
F
 
I
Q
 
S
T
 
N
L
 
L
S
x
D
I
 
-
P
 
E
Y
 
F
F
 
L
I
 
T
Y
 
Y
M
 
M
H
 
Q
E
 
D
Q
 
A
A
 
M
S
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
A
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
N
 
D
V
 
F
E
 
E
L
 
F
L
 
I
V
 
F
Q
 
S
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
S
T
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
S
 
M
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
F
L
 
I
T
 
S
Q
 
R
G
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
P
N
 
V
D
 
D
V
 
T
T
 
T
A
 
S
L
 
A
A
 
V
P
 
D
A
 
I
L
 
V
N
 
N
E
 
M
V
 
V
L
 
N
S
 
D
E
 
A
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
I
T
 
I
V
 
A
D
x
N
R
|
R
R
 
T
V
 
F
E
 
D
G
 
G
T
 
V
D
 
D
T
 
Q
P
 
A
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
G
A
 
S
D
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
L
L
 
L
M
 
Q
A
 
M
E
 
E
L
 
E
V
 
V
T
 
A
S
 
K
N
 
L
M
 
L
K
 
N
N
 
N
G
 
E
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
I
I
 
M
G
 
D
G
 
G
T
 
E
P
 
L
G
 
G
S
 
H
S
 
E
T
 
A
A
 
Q
I
 
I
D
 
M
R
|
R
A
 
T
K
 
E
G
 
G
V
 
N
H
 
K
E
 
Q
G
 
I
L
 
I
K
 
E
A
 
E
G
 
H
G
 
D
G
 
G
K
 
-
F
 
L
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
L
E
 
Q
Q
 
G
S
 
T
G
 
A
E
 
K
W
 
F
E
 
D
R
 
R
A
 
S
K
 
E
A
 
G
M
 
M
S
 
R
V
 
L
A
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
W
L
 
L
T
 
N
S
 
-
L
 
-
S
 
S
A
 
G
N
 
T
P
 
E
P
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
N
S
x
N
G
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
E
A
 
A
T
 
V
G
 
G
L
 
K
K
x
L
G
 
D
K
 
D
V
|
V
K
 
I
V
 
V
I
 
A
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
E
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
K
D
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
L
A
 
D
G
 
V
I
 
T
V
 
V
E
 
F
Q
|
Q
S
 
D
P
 
A
S
 
K
K
 
G
Q
 
Q
I
 
G
R
 
A
T
 
T
A
 
S
L
 
V
R
 
K
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
K
 
A
V
 
A
R
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
-
E
 
D
L
 
V
E
 
E
T
 
D
V
 
A
I
 
M
V
 
I
Q
 
P
P
 
Y
F
 
E
M
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
N
L
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
Y
E
 
E

1dbpA Identical mutations at corresponding positions in two homologous proteins with non-identical effects (see paper)
30% identity, 79% coverage: 38:289/317 of query aligns to 10:255/271 of 1dbpA

query
sites
1dbpA
T
 
T
L
 
L
S
 
N
I
x
N
P
 
P
Y
x
F
F
 
F
I
 
V
Y
 
S
M
 
L
H
 
K
E
 
D
Q
 
G
A
 
A
S
 
Q
Q
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
D
V
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
N
S
 
P
T
 
A
K
 
K
Q
 
E
S
 
L
S
 
A
D
 
N
V
 
V
E
 
Q
N
 
D
A
 
L
L
 
T
T
 
V
Q
 
R
G
 
G
V
 
T
D
 
K
A
 
I
M
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
T
D
 
D
V
 
S
T
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
D
P
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
K
E
 
M
V
 
A
L
 
N
S
 
Q
E
 
A
K
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
Q
V
 
A
E
 
T
G
 
K
T
 
G
D
 
E
T
 
V
P
 
-
V
 
V
P
 
S
Y
 
H
V
 
I
T
 
A
A
 
S
D
 
D
S
 
N
V
 
V
A
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
I
M
 
A
A
 
G
E
 
D
L
 
Y
V
 
I
T
 
A
S
 
K
N
 
K
M
 
A
K
 
G
N
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
E
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
I
P
 
A
G
 
G
S
 
T
S
 
S
T
 
A
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
|
R
A
 
G
K
 
E
G
 
G
V
 
F
H
 
Q
E
 
Q
G
 
A
L
 
V
K
 
A
A
 
A
G
 
-
G
 
-
G
 
H
K
 
K
F
 
F
Q
 
N
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
S
 
P
G
 
A
E
 
D
W
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
I
K
 
K
A
 
G
M
 
L
S
 
N
V
 
V
A
 
M
E
 
Q
N
 
N
I
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
A
L
 
-
S
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
H
P
 
P
D
 
D
-
 
V
-
 
Q
A
 
A
I
 
V
I
 
F
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
L
R
 
Q
A
 
T
T
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
K
G
 
S
K
 
D
V
 
V
K
 
M
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
G
Y
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
G
L
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
V
R
 
N
D
 
D
G
 
G
D
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
T
V
 
I
E
 
A
Q
 
Q
S
 
L
P
 
P
S
 
D
K
 
Q
Q
 
I
I
 
G
R
 
A
T
 
K
A
 
G
L
 
V
R
 
E
M
 
T
A
 
A
V
 
D
K
 
K
K
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
E
 
E

2fn8A Thermotoga maritima ribose binding protein ribose bound form (see paper)
29% identity, 89% coverage: 31:313/317 of query aligns to 3:289/292 of 2fn8A

query
sites
2fn8A
K
 
K
I
 
M
L
 
A
I
 
I
N
 
V
F
 
I
Q
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
N
I
x
N
P
 
P
Y
x
W
F
|
F
I
 
V
Y
 
V
M
 
L
H
 
A
E
 
E
Q
 
T
A
 
A
S
 
K
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
K
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
E
L
 
A
L
 
T
V
 
I
Q
 
F
D
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
N
S
 
D
S
 
T
T
 
A
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
H
V
 
F
E
 
D
N
 
A
A
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
F
A
 
N
P
 
P
N
 
T
D
 
D
V
 
A
T
 
D
A
 
G
L
 
S
A
 
I
P
 
A
A
 
N
L
 
V
N
 
K
E
 
R
V
 
A
L
 
K
S
 
E
E
 
A
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
F
T
 
C
V
 
V
D
|
D
R
|
R
R
 
G
V
 
I
E
 
N
G
 
A
T
 
R
D
 
G
T
 
L
P
 
A
V
 
V
P
 
A
Y
 
Q
V
 
I
T
 
Y
A
 
S
D
 
D
S
 
N
V
 
Y
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
V
L
 
L
M
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
Y
V
 
F
T
 
V
S
 
K
N
 
F
M
 
L
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
N
 
D
G
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
I
A
 
P
F
 
Y
-
 
A
-
 
E
I
 
L
G
 
L
G
 
G
T
 
I
P
 
L
G
 
S
S
 
A
S
 
Q
T
 
P
A
 
T
I
 
W
D
 
D
R
|
R
A
 
S
K
 
N
G
 
G
V
 
F
H
 
H
E
 
S
G
 
V
L
 
V
K
 
D
A
 
Q
G
 
-
G
 
Y
G
 
P
K
 
E
F
 
F
Q
 
K
L
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
G
 
A
E
 
E
W
x
F
E
 
D
R
 
R
A
 
D
K
 
T
A
 
A
M
 
Y
S
 
K
V
 
V
A
 
T
E
 
E
N
 
Q
I
 
I
L
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
N
 
H
P
 
P
P
 
E
-
 
I
D
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
W
C
 
C
A
 
G
S
x
N
G
 
D
D
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
M
E
 
K
A
 
A
V
 
C
R
 
E
A
 
A
T
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
R
G
 
T
K
 
D
V
 
I
K
 
Y
V
 
I
I
 
F
G
 
G
F
 
F
D
|
D
A
 
G
Y
 
A
P
 
E
E
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
N
A
 
A
I
 
I
R
 
K
D
 
E
G
 
G
-
 
K
D
 
Q
I
 
I
A
 
V
G
 
A
I
 
T
V
 
I
E
 
M
Q
|
Q
S
 
F
P
 
P
S
 
K
K
 
L
Q
 
M
I
 
A
R
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
E
M
 
W
A
 
A
V
 
D
K
 
Q
K
 
Y
V
 
L
R
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
R
E
 
S
L
 
F
-
 
P
E
 
E
T
 
I
V
 
V
I
 
P
V
 
V
Q
 
T
P
 
V
F
 
E
M
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
I
S
 
D
Q
 
K
A
 
Y
E
 
T
Q
 
A
Y
 
Y

5ocpA The periplasmic binding protein component of the arabinose abc transporter from shewanella sp. Ana-3 bound to alpha and beta-l- arabinofuranose
33% identity, 71% coverage: 47:271/317 of query aligns to 18:245/302 of 5ocpA

query
sites
5ocpA
M
 
F
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
A
 
V
S
 
K
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
Q
L
 
R
N
 
G
V
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
K
V
 
F
Q
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
S
 
K
S
 
Q
T
 
E
K
 
N
Q
 
Q
S
 
I
S
 
K
D
 
A
V
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
V
D
 
V
V
 
E
T
 
T
A
 
G
L
 
W
A
 
K
P
 
P
A
 
V
L
 
L
N
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
K
S
 
R
E
 
A
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
V
T
 
I
V
 
V
D
|
D
R
|
R
R
 
N
V
 
I
E
 
K
G
 
V
T
 
D
D
 
D
T
 
D
P
 
S
-
 
L
-
 
F
V
 
L
P
 
T
Y
 
R
V
 
I
T
 
A
A
 
S
D
 
D
S
 
F
V
 
S
A
 
E
G
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
K
M
 
I
A
 
G
E
 
Q
L
 
W
V
 
L
T
 
M
S
 
D
N
 
K
M
 
T
K
 
Q
N
 
G
G
 
N
A
 
C
R
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
E
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
V
G
 
G
S
 
A
S
 
T
T
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
|
R
A
 
A
K
 
A
G
 
G
V
 
F
H
 
N
E
 
Q
G
 
V
L
 
I
K
 
-
A
 
A
G
 
N
G
 
Y
G
 
P
K
 
N
F
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
A
 
R
E
 
S
Q
 
Q
S
 
T
G
 
G
E
 
E
W
x
F
E
 
T
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
M
 
K
S
 
E
V
 
V
A
 
M
E
 
E
N
 
G
I
 
F
L
 
L
T
 
K
S
 
A
L
 
Q
S
 
N
A
 
G
N
 
Q
P
 
P
P
 
L
D
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
W
C
 
S
A
 
H
S
x
N
G
 
D
D
 
E
M
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
K
-
 
D
V
 
I
K
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
S
F
 
V
D
|
D
A
 
G
Y
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
Y
L
 
F
R
 
K
A
 
A
I
 
M
R
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
L
S
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4ry9B Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
30% identity, 82% coverage: 31:289/317 of query aligns to 4:267/297 of 4ry9B

query
sites
4ry9B
K
 
K
I
 
I
L
 
G
I
 
V
N
 
S
F
 
M
Q
x
K
T
 
T
L
 
L
S
 
S
I
 
A
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
I
 
A
Y
 
A
M
 
Q
H
 
M
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
S
 
K
Q
 
A
E
 
R
A
 
G
K
 
K
V
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
T
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
S
 
K
S
 
L
T
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
S
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
L
 
V
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
L
M
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
A
D
|
D
V
x
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
N
V
 
A
L
 
S
S
 
A
E
 
N
K
 
G
V
 
V
P
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
V
V
 
I
D
|
D
R
x
S
R
x
T
V
 
L
E
 
N
G
 
P
T
 
R
D
 
A
T
 
N
P
 
F
V
 
V
P
 
T
Y
 
Q
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
S
 
N
V
 
S
A
 
I
G
 
N
G
 
G
R
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
G
E
 
H
L
 
W
V
 
V
T
 
I
S
 
E
N
 
E
M
 
V
K
 
G
N
 
N
G
 
K
A
 
S
-
 
L
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
I
 
L
G
 
S
G
 
G
T
 
E
P
 
K
G
 
G
S
x
N
S
x
P
T
 
V
A
 
G
I
 
Q
D
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
K
 
K
A
 
F
G
 
G
G
 
K
G
 
A
K
 
D
F
 
L
Q
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
G
E
 
Q
Q
 
G
S
 
W
G
 
G
E
 
H
W
|
W
E
 
N
R
 
D
A
 
E
K
 
G
A
 
G
M
 
L
S
 
K
V
 
A
A
 
M
E
 
E
N
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
V
S
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
A
N
 
N
P
 
K
P
 
D
D
 
I
A
 
N
I
 
M
I
 
V
C
 
L
A
 
G
S
 
E
G
x
N
D
 
D
-
 
S
M
 
M
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
R
E
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
S
T
 
A
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
I
V
 
L
K
 
L
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
A
D
|
D
A
 
A
Y
 
Q
P
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
L
I
 
I
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
D
 
K
I
 
Y
A
 
G
G
 
V
I
 
T
V
 
G
E
 
L
Q
 
N
S
 
D
P
 
P
S
 
A
K
 
L
Q
 
V
I
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
D
M
 
L
A
 
G
V
 
V
K
 
K
K
 
V
V
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
E

4ry9A Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009, a complex with d-talitol
30% identity, 82% coverage: 31:289/317 of query aligns to 4:267/297 of 4ry9A

query
sites
4ry9A
K
 
K
I
 
I
L
 
G
I
 
V
N
 
S
F
 
M
Q
x
K
T
 
T
L
 
L
S
 
S
I
 
A
P
 
P
Y
|
Y
F
|
F
I
 
A
Y
 
A
M
 
Q
H
 
M
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
S
 
K
Q
 
A
E
 
R
A
 
G
K
 
K
V
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
Y
E
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
T
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
S
 
K
S
 
L
T
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
S
 
I
S
 
S
D
 
D
V
 
V
E
 
E
N
 
D
A
 
L
L
 
V
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
K
A
 
L
M
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
N
P
 
P
N
 
A
D
 
D
V
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
V
P
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
N
E
 
N
V
 
A
L
 
S
S
 
A
E
 
N
K
 
G
V
 
V
P
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
V
V
 
I
D
|
D
R
x
S
R
 
T
V
 
L
E
 
N
G
 
P
T
 
R
D
 
A
T
 
N
P
 
F
V
 
V
P
 
T
Y
 
Q
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
S
 
N
V
 
S
A
 
I
G
 
N
G
 
G
R
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
G
E
 
H
L
 
W
V
 
V
T
 
I
S
 
E
N
 
E
M
 
V
K
 
G
N
 
N
G
 
K
A
 
S
-
 
L
R
 
K
V
 
I
A
 
A
F
 
L
I
 
L
G
 
S
G
 
G
T
 
E
P
 
K
G
 
G
S
x
N
S
 
P
T
 
V
A
 
G
I
 
Q
D
 
E
R
|
R
A
 
R
K
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
K
 
K
A
 
F
G
 
G
G
 
K
G
 
A
K
 
D
F
 
L
Q
 
T
L
 
V
V
 
V
A
 
G
E
 
Q
Q
 
G
S
 
W
G
 
G
E
 
H
W
|
W
E
 
N
R
 
D
A
 
E
K
 
G
A
 
G
M
 
L
S
 
K
V
 
A
A
 
M
E
 
E
N
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
V
S
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
A
N
 
N
P
 
K
P
 
D
D
 
I
A
 
N
I
 
M
I
 
V
C
 
L
A
 
G
S
 
E
G
x
N
D
 
D
-
 
S
M
 
M
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
R
E
 
R
A
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
S
T
 
A
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
I
V
 
L
K
 
L
V
 
V
I
 
A
G
 
A
F
 
A
D
|
D
A
 
A
Y
 
Q
P
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
L
I
 
I
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
D
 
K
I
 
Y
A
 
G
G
 
V
I
 
T
V
 
G
E
 
L
Q
 
N
S
 
D
P
 
P
S
 
A
K
 
L
Q
 
V
I
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
D
M
 
L
A
 
G
V
 
V
K
 
K
K
 
V
V
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
E

5hkoA Crystal structure of abc transporter solute binding protein msmeg_3598 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with l-sorbitol
28% identity, 82% coverage: 55:313/317 of query aligns to 26:280/314 of 5hkoA

query
sites
5hkoA
A
 
A
K
 
K
V
 
A
L
 
N
N
 
N
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
W
Q
 
N
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
x
D
S
 
V
T
x
S
K
 
T
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
N
 
S
A
 
L
L
 
I
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
V
P
 
P
N
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
N
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
K
S
 
S
E
 
K
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
A
V
 
V
D
x
N
R
x
A
R
 
A
V
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
P
D
 
D
T
 
L
P
 
-
V
 
A
P
 
G
Y
 
N
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
Q
M
 
E
A
 
M
E
 
Q
L
 
M
V
 
M
T
 
A
S
 
D
N
 
R
M
 
L
K
 
G
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
I
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
S
T
 
G
A
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
D
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
|
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
N
V
 
K
A
 
M
E
 
K
N
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
S
 
S
L
 
F
S
 
G
A
 
P
N
 
Q
P
 
-
P
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
-
V
 
V
K
 
P
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
x
E
E
 
D
V
 
G
L
 
L
R
 
N
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
F
A
 
I
G
 
G
I
 
T
V
 
S
E
 
L
Q
|
Q
S
 
N
P
 
G
S
 
T
K
 
V
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
D
K
 
A
K
 
L
V
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
D
-
 
V
E
 
K
L
 
T
E
 
D
T
 
P
V
 
V
I
 
Y
V
 
V
Q
 
M
P
 
P
F
 
-
M
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
V
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

P39325 Galactofuranose-binding protein YtfQ from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 70% coverage: 51:272/317 of query aligns to 45:271/318 of P39325

query
sites
P39325
A
 
A
S
 
K
Q
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
R
N
 
G
V
 
I
E
 
T
L
 
L
L
 
K
V
 
I
Q
 
A
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
S
 
K
S
 
Q
T
 
E
K
 
N
Q
 
Q
S
 
I
S
 
K
D
 
A
V
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
L
 
V
T
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
V
D
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
W
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
L
N
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
K
S
 
D
E
 
A
K
 
E
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
F
T
 
L
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
V
T
 
K
D
 
D
T
 
K
P
 
S
V
 
L
-
 
Y
-
 
M
P
 
T
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
S
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
L
M
 
I
A
 
G
E
 
D
L
 
W
V
 
L
T
 
V
S
 
K
N
 
E
M
 
V
K
 
-
N
 
N
G
 
G
-
 
K
-
 
P
A
x
C
R
 
N
V
 
V
A
 
V
F
 
E
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
V
G
 
G
S
 
A
S
 
S
T
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
|
R
A
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
F
H
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
-
G
 
N
G
 
A
G
 
P
K
 
N
F
 
I
Q
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
R
E
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
D
W
 
F
E
 
T
R
 
R
A
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
K
S
 
E
V
 
V
A
 
M
E
 
E
N
 
S
I
 
F
L
 
I
T
 
K
S
 
A
L
 
E
S
 
N
A
 
N
N
 
G
P
 
K
P
 
N
D
 
I
A
x
C
I
 
M
I
 
V
C
 
Y
A
 
A
-
 
H
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
D
K
 
I
V
 
L
I
 
T
G
 
G
-
 
S
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
Y
R
 
K
A
 
A
I
 
M
R
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
A
A
 
N
G
 
A
I
 
S
V
 
V
E
 
E
Q
 
L
S
 
T
P
 
P
S
 
N

Sites not aligning to the query:

4rs3A Crystal structure of carbohydrate transporter a0qyb3 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510969, in complex with xylitol (see paper)
28% identity, 82% coverage: 55:313/317 of query aligns to 26:280/315 of 4rs3A

query
sites
4rs3A
A
 
A
K
 
K
V
 
A
L
 
N
N
 
N
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
W
Q
 
N
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
 
D
S
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
N
 
S
A
 
L
L
 
I
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
V
P
 
P
N
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
N
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
K
S
 
S
E
 
K
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
A
V
 
V
D
x
N
R
 
A
R
 
A
V
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
P
D
 
D
T
 
L
P
 
-
V
 
A
P
 
G
Y
 
N
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
Q
M
 
E
A
 
M
E
 
Q
L
 
M
V
 
M
T
 
A
S
 
D
N
 
R
M
 
L
K
 
G
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
I
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
S
T
 
G
A
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
D
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
|
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
N
V
 
K
A
 
M
E
 
K
N
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
S
 
S
L
 
F
S
 
G
A
 
P
N
 
Q
P
 
-
P
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
-
V
 
V
K
 
P
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
x
E
E
 
D
V
 
G
L
 
L
R
 
N
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
F
A
 
I
G
 
G
I
 
T
V
 
S
E
 
L
Q
|
Q
S
 
N
P
 
G
S
 
T
K
 
V
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
D
K
 
A
K
 
L
V
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
D
-
 
V
E
 
K
L
 
T
E
 
D
T
 
P
V
 
V
I
 
Y
V
 
V
Q
 
M
P
 
P
F
 
-
M
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
V
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

A0QYB3 Xylitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
28% identity, 82% coverage: 55:313/317 of query aligns to 59:313/349 of A0QYB3

query
sites
A0QYB3
A
 
A
K
 
K
V
 
A
L
 
N
N
 
N
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
W
Q
 
N
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
N
S
 
D
S
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
N
 
S
A
 
L
L
 
I
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
V
P
 
P
N
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
N
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
K
S
 
S
E
 
K
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
T
 
A
V
 
V
D
x
N
R
 
A
R
 
A
V
 
L
E
 
E
G
 
T
T
 
P
D
 
D
T
 
L
P
 
-
V
 
A
P
 
G
Y
 
N
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
Q
M
 
E
A
 
M
E
 
Q
L
 
M
V
 
M
T
 
A
S
 
D
N
 
R
M
 
L
K
 
G
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
I
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
S
T
 
G
A
 
E
I
 
I
D
 
N
R
|
R
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
D
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
 
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
N
V
 
K
A
 
M
E
 
K
N
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
S
 
S
L
 
F
S
 
G
A
 
P
N
 
Q
P
 
-
P
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
-
V
 
V
K
 
P
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
 
E
E
 
D
V
 
G
L
 
L
R
 
N
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
F
A
 
I
G
 
G
I
 
T
V
 
S
E
 
L
Q
|
Q
S
 
N
P
 
G
S
 
T
K
 
V
Q
 
E
I
 
L
R
 
S
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
D
K
 
A
K
 
L
V
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
D
-
 
V
E
 
K
L
 
T
E
 
D
T
 
P
V
 
V
I
 
Y
V
 
V
Q
 
M
P
 
P
F
 
-
M
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
V
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

2vk2A Crystal structure of a galactofuranose binding protein (see paper)
31% identity, 70% coverage: 51:272/317 of query aligns to 23:249/296 of 2vk2A

query
sites
2vk2A
A
 
A
S
 
K
Q
 
S
E
 
E
A
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
R
N
 
G
V
 
I
E
 
T
L
 
L
L
 
K
V
 
I
Q
 
A
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
S
 
K
S
 
Q
T
 
E
K
 
N
Q
 
Q
S
 
I
S
 
K
D
 
A
V
 
V
E
 
R
N
 
S
A
 
F
L
 
V
T
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
V
D
 
V
V
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
W
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
L
N
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
K
S
 
D
E
 
A
K
 
E
V
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
F
T
 
L
V
 
L
D
|
D
R
|
R
R
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
V
T
 
K
D
 
D
T
 
K
P
 
S
V
 
L
-
 
Y
-
 
M
P
 
T
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
S
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
L
M
 
I
A
 
G
E
 
D
L
 
W
V
 
L
T
 
V
S
 
K
N
 
E
M
 
V
K
 
-
N
 
N
G
 
G
-
 
K
-
 
P
A
 
C
R
 
N
V
 
V
A
 
V
F
 
E
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
V
G
 
G
S
 
A
S
 
S
T
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
|
R
A
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
F
H
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
-
G
 
N
G
 
A
G
 
P
K
 
N
F
 
I
Q
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
R
E
 
S
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
D
W
x
F
E
 
T
R
 
R
A
 
S
K
 
K
A
 
G
M
 
K
S
 
E
V
 
V
A
 
M
E
 
E
N
 
S
I
 
F
L
 
I
T
 
K
S
 
A
L
 
E
S
 
N
A
 
N
N
 
G
P
 
K
P
 
N
D
 
I
A
 
C
I
 
M
I
 
V
C
 
Y
A
 
A
-
 
H
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
D
K
 
I
V
 
L
I
 
T
G
 
G
-
 
S
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
V
P
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
Y
R
 
K
A
 
A
I
 
M
R
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
E
I
 
A
A
 
N
G
 
A
I
 
S
V
 
V
E
 
E
Q
x
L
S
 
T
P
 
P
S
 
N

Sites not aligning to the query:

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
28% identity, 82% coverage: 55:313/317 of query aligns to 59:313/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
A
 
A
K
 
K
V
 
D
L
 
N
N
 
N
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
W
Q
 
N
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
L
S
 
D
S
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
N
 
S
A
 
M
L
 
I
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
V
P
 
P
N
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
N
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
K
S
 
A
E
 
K
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
P
V
 
V
D
x
N
R
 
A
R
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
S
T
 
K
D
 
D
T
 
I
P
 
-
V
 
A
P
 
G
Y
 
N
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
Q
M
 
E
A
 
M
E
 
Q
L
 
M
V
 
M
T
 
A
S
 
D
N
 
R
M
 
L
K
 
G
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
I
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
T
 
G
A
 
E
I
 
L
D
 
D
R
|
R
A
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
E
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
 
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
N
V
 
K
A
 
M
E
 
K
N
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
S
 
G
L
 
F
S
 
G
A
 
P
N
 
Q
P
 
-
P
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
-
V
 
V
K
 
P
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
 
E
E
 
D
V
 
G
L
 
L
R
 
N
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
F
A
 
I
G
 
G
I
 
T
V
 
S
E
 
L
Q
|
Q
S
 
N
P
 
G
S
 
T
K
 
V
Q
 
E
I
 
L
R
 
A
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
N
K
 
R
K
 
L
V
 
A
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
P
-
 
V
E
 
N
L
 
K
E
 
E
T
 
P
V
 
V
I
 
Y
V
 
I
Q
 
M
P
 
P
F
 
-
M
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
V
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

4rsmA Crystal structure of carbohydrate transporter msmeg_3599 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510970, in complex with d-threitol (see paper)
28% identity, 82% coverage: 55:313/317 of query aligns to 27:281/315 of 4rsmA

query
sites
4rsmA
A
 
A
K
 
K
V
 
D
L
 
N
N
 
N
V
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
W
Q
 
N
D
 
S
A
 
A
Q
 
N
S
 
L
S
 
D
S
 
V
T
 
S
K
 
T
Q
 
Q
S
 
A
S
 
S
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
N
 
S
A
 
M
L
 
I
T
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
I
V
 
I
V
 
V
A
 
V
P
 
P
N
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
Q
L
 
V
N
 
A
E
 
S
V
 
A
L
 
K
S
 
A
E
 
K
K
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
P
V
 
V
D
x
N
R
 
A
R
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
S
T
 
K
D
 
D
T
 
I
P
 
-
V
 
A
P
 
G
Y
 
N
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
D
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
Q
M
 
E
A
 
M
E
 
Q
L
 
M
V
 
M
T
 
A
S
 
D
N
 
R
M
 
L
K
 
G
N
 
G
G
 
K
A
 
G
R
 
N
V
 
I
A
 
V
F
 
I
I
 
L
G
 
Q
G
 
G
T
 
P
P
 
L
G
 
G
S
 
Q
S
 
S
T
 
G
A
 
E
I
 
L
D
 
D
R
|
R
A
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
I
H
 
E
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
-
A
 
A
G
 
K
G
 
Y
G
 
P
K
 
D
F
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
D
S
 
T
G
 
A
E
 
N
W
|
W
E
 
K
R
 
R
A
 
D
K
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
N
V
 
K
A
 
M
E
 
K
N
 
N
I
 
W
L
 
I
T
 
S
S
 
G
L
 
F
S
 
G
A
 
P
N
 
Q
P
 
-
P
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
Q
S
x
N
G
 
D
D
 
D
M
 
M
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
T
G
 
G
K
 
-
V
 
V
K
 
P
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
D
|
D
A
 
G
Y
 
I
P
 
E
E
 
D
V
 
G
L
 
L
R
 
N
A
 
A
I
 
V
R
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
F
A
 
I
G
 
G
I
 
T
V
 
S
E
 
L
Q
|
Q
S
 
N
P
 
G
S
 
T
K
 
V
Q
 
E
I
 
L
R
 
A
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
N
K
 
R
K
 
L
V
 
A
R
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
P
-
 
V
E
 
N
L
 
K
E
 
E
T
 
P
V
 
V
I
 
Y
V
 
I
Q
 
M
P
 
P
F
 
-
M
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
D
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
V
A
 
A
E
 
I
Q
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf6N2E2_1005 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1005
MKAQKGGLLCSAVLAAGLTFQLSPAFAAGEKILINFQTLSIPYFIYMHEQASQEAKVLNV
ELLVQDAQSSSTKQSSDVENALTQGVDAMVVAPNDVTALAPALNEVLSEKVPLVTVDRRV
EGTDTPVPYVTADSVAGGRLMAELVTSNMKNGARVAFIGGTPGSSTAIDRAKGVHEGLKA
GGGKFQLVAEQSGEWERAKAMSVAENILTSLSANPPDAIICASGDMALGAAEAVRATGLK
GKVKVIGFDAYPEVLRAIRDGDIAGIVEQSPSKQIRTALRMAVKKVRGEGELETVIVQPF
MITPENLSQAEQYSAIQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory