SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1104 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1104 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ekgA Crystal structure of l-rhamnonate dehydratase from azotobacter vinelandii complexed with mg and l-tartrate
91% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 2:393/395 of 3ekgA

query
sites
3ekgA
M
 
L
G
 
S
I
 
I
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
K
H
 
Q
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
Q
 
Q
A
 
G
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
M
 
M
S
 
G
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
R
 
R
R
 
R
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
N
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
H
 
H
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
K
 
R
I
 
I
W
 
W
D
 
D
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
N
S
 
S
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
M
 
M
P
|
P
L
 
L
H
 
H
H
 
H
G
|
G
P
 
P
A
x
S
E
 
E
G
 
G
E
 
E
E
|
E
G
 
G
L
 
L
R
 
K
K
 
K
N
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
T
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
L
M
 
M
L
 
F
D
|
D
C
 
C
W
|
W
M
 
M
S
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
R
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
P
 
P
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
W
 
W
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
N
 
R
N
 
N
V
 
A
P
 
P
K
 
T
G
 
G
M
 
M
L
 
M
V
 
V
T
|
T
T
 
T
G
|
G
E
|
E
H
 
H
E
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
R
W
 
W
G
 
G
F
 
F
R
 
R
M
 
M
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
M
G
 
G
C
 
C
C
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
L
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
H
 
H
N
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
H
 
H
F
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R
H
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
F
A
 
A
E
|
E
F
 
F
L
 
L
M
 
M
M
 
M
A
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
D
|
D
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
M
F
 
F
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
M
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
R
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
D
 
E
C
 
C
Q
 
Q
L
 
L
H
 
H
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y

3cxoB Crystal structure of l-rhamnonate dehydratase from salmonella typhimurium complexed with mg and 3-deoxy-l-rhamnonate (see paper)
64% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 2:400/402 of 3cxoB

query
sites
3cxoB
M
 
M
G
 
T
I
 
L
P
 
P
T
 
K
I
 
I
K
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
F
L
 
I
R
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
H
|
H
D
 
D
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
N
H
 
H
W
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
D
H
 
H
I
|
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
M
 
M
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
R
D
 
D
Y
|
Y
R
 
E
Q
 
Q
S
 
S
R
|
R
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
E
D
 
N
G
 
R
T
 
Q
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
M
A
 
G
A
 
C
Y
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
H
 
H
L
 
L
A
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
C
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
K
K
 
L
I
 
I
W
 
H
D
 
D
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
L
Q
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
R
 
S
K
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
V
Q
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
M
 
M
P
|
P
L
 
T
H
 
H
H
 
W
G
|
G
P
 
P
A
x
H
E
 
D
G
 
G
E
 
D
E
x
A
G
 
G
L
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
D
L
 
A
E
 
A
A
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
D
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
K
V
 
C
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
|
D
C
 
C
W
|
W
M
 
M
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
H
G
 
A
A
 
C
H
 
A
E
 
P
H
 
F
G
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
W
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
R
N
 
N
V
 
A
P
 
P
K
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
M
V
 
V
T
|
T
T
 
S
G
|
G
E
|
E
H
 
H
E
 
H
A
 
G
T
 
T
R
 
L
W
 
Q
G
 
S
F
 
F
R
 
R
M
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
E
M
 
T
G
 
G
C
 
-
C
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
M
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
S
H
 
R
N
 
G
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
H
H
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
T
R
 
F
H
 
T
N
 
N
S
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
S
E
|
E
F
 
F
L
 
L
M
 
M
M
 
T
A
x
S
P
 
P
Q
 
D
A
 
C
D
 
S
E
 
T
V
 
L
V
 
R
P
 
P
M
 
Q
F
 
F
H
 
D
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
I
R
 
H
L
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
E
L
 
L
N
 
N
P
 
R
D
 
D
C
 
C
Q
 
H
L
 
L
H
 
K
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y

3cxoA Crystal structure of l-rhamnonate dehydratase from salmonella typhimurium complexed with mg and 3-deoxy-l-rhamnonate (see paper)
64% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 2:400/402 of 3cxoA

query
sites
3cxoA
M
 
M
G
 
T
I
 
L
P
 
P
T
 
K
I
 
I
K
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
F
L
 
I
R
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
N
H
 
H
W
|
W
I
 
I
D
 
D
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
M
 
M
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
R
D
 
D
Y
|
Y
R
 
E
Q
 
Q
S
 
S
R
|
R
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
E
D
 
N
G
 
R
T
 
Q
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
M
A
 
G
A
 
C
Y
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
H
 
H
L
 
L
A
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
C
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
K
K
 
L
I
 
I
W
 
H
D
 
D
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
L
Q
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
R
 
S
K
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
V
Q
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
M
 
M
P
|
P
L
 
T
H
 
H
H
 
W
G
|
G
P
 
P
A
x
H
E
 
D
G
 
G
E
 
D
E
x
A
G
 
G
L
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
D
L
 
A
E
 
A
A
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
D
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
K
V
 
C
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
|
D
C
 
C
W
|
W
M
 
M
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
H
G
 
A
A
 
C
H
 
A
E
 
P
H
 
F
G
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
W
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
R
N
 
N
V
 
A
P
 
P
K
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
M
V
 
V
T
|
T
T
 
S
G
|
G
E
|
E
H
 
H
E
 
H
A
 
G
T
 
T
R
 
L
W
 
Q
G
 
S
F
 
F
R
 
R
M
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
E
M
 
T
G
 
G
C
 
-
C
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
M
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
S
H
 
R
N
 
G
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
H
H
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
T
R
 
F
H
 
T
N
 
N
S
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
S
E
|
E
F
 
F
L
 
L
M
 
M
M
 
T
A
x
S
P
 
P
Q
 
D
A
 
C
D
 
S
E
 
T
V
 
L
V
 
R
P
 
P
M
 
Q
F
 
F
H
 
D
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
I
R
 
H
L
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
E
L
 
L
N
 
N
P
 
R
D
 
D
C
 
C
Q
 
H
L
 
L
H
 
K
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y

3d46A Crystal structure of l-rhamnonate dehydratase from salmonella typhimurium complexed with mg and l-tartrate
64% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 5:403/405 of 3d46A

query
sites
3d46A
M
 
M
G
 
T
I
 
L
P
 
P
T
 
K
I
 
I
K
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
F
L
 
I
R
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
Q
 
Q
A
 
G
D
 
G
G
 
N
H
 
H
W
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
M
 
M
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
R
D
 
D
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
E
D
 
N
G
 
R
T
 
Q
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
M
A
 
G
A
 
C
Y
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
H
 
H
L
 
L
A
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
C
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
K
K
 
L
I
 
I
W
 
H
D
 
D
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
L
Q
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
R
 
S
K
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
V
Q
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
K
|
K
M
 
M
P
|
P
L
 
T
H
 
H
H
 
W
G
|
G
P
 
P
A
x
H
E
 
D
G
 
G
E
 
D
E
x
A
G
 
G
L
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
D
L
 
A
E
 
A
A
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
D
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
K
V
 
C
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
|
D
C
 
C
W
|
W
M
 
M
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
H
G
 
A
A
 
C
H
 
A
E
 
P
H
 
F
G
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
W
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
R
N
 
N
V
 
A
P
 
P
K
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
M
V
 
V
T
|
T
T
 
S
G
 
G
E
|
E
H
 
H
E
 
H
A
 
G
T
 
T
R
 
L
W
 
Q
G
 
S
F
 
F
R
 
R
M
 
T
L
 
L
L
 
A
E
 
E
M
 
T
G
 
G
C
 
-
C
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
M
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
S
H
 
R
N
 
G
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
H
H
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
T
R
 
F
H
 
T
N
 
N
S
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
S
E
|
E
F
 
F
L
 
L
M
 
M
M
 
T
A
 
S
P
 
P
Q
 
D
A
 
C
D
 
S
E
 
T
V
 
L
V
 
R
P
|
P
M
 
Q
F
 
F
H
 
D
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
I
R
 
H
L
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
E
L
 
L
N
 
N
P
 
R
D
 
D
C
 
C
Q
 
H
L
 
L
H
 
K
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y

P77215 L-rhamnonate dehydratase; RhamD; EC 4.2.1.90 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
64% identity, 98% coverage: 1:392/399 of query aligns to 1:399/401 of P77215

query
sites
P77215
M
 
M
G
 
T
I
 
L
P
 
P
T
 
K
I
 
I
K
 
K
H
 
Q
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
W
V
 
F
L
 
T
R
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
H
|
H
D
 
D
Q
 
Q
A
 
G
D
 
A
G
 
N
H
 
H
W
 
W
I
 
I
D
 
D
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
M
 
M
S
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
R
D
 
D
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
E
D
 
N
G
 
G
T
 
Q
V
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
E
 
E
P
 
M
A
 
G
A
 
C
Y
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
H
 
H
L
 
L
A
 
N
R
 
R
F
 
F
V
 
I
E
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
C
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
K
K
 
L
I
 
I
W
 
H
D
 
D
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
L
Q
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
R
 
S
K
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
 
N
T
 
T
I
 
I
S
 
S
G
 
C
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
V
Q
 
G
E
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
K
M
 
M
P
 
P
L
 
T
H
 
H
H
 
W
G
 
G
P
 
P
A
 
H
E
 
D
G
 
G
E
 
D
E
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
R
K
 
K
N
 
D
L
 
A
E
 
A
A
 
M
L
 
V
A
 
A
T
 
D
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
K
V
 
C
G
 
G
P
 
E
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
 
D
C
 
C
W
 
W
M
 
M
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
H
G
 
A
A
 
C
H
 
A
E
 
P
H
 
Y
G
 
N
L
 
L
K
 
K
W
 
W
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
W
 
E
G
 
S
Y
 
Y
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
R
N
 
N
V
 
A
P
 
P
K
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
M
V
 
V
T
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
E
H
|
H
E
 
H
A
 
G
T
 
T
R
 
L
W
 
Q
G
 
S
F
 
F
R
 
R
M
 
T
L
 
L
L
 
S
E
 
E
M
 
T
G
 
G
C
 
-
C
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
S
H
 
R
N
 
G
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
H
H
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
I
T
 
T
R
 
F
H
 
T
N
 
N
S
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
S
E
 
E
F
 
F
L
 
L
M
 
M
M
 
T
A
 
S
P
 
P
Q
 
D
A
 
C
D
 
S
E
 
T
V
 
M
V
 
R
P
 
P
M
 
Q
F
 
F
H
 
D
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
N
E
 
E
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
I
R
 
H
L
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
E
L
 
L
N
 
N
P
 
R
D
 
D
C
 
C
Q
 
N
L
 
L
H
 
K
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y

3fxgA Crystal structure of rhamnonate dehydratase from gibberella zeae complexed with mg
50% identity, 96% coverage: 3:384/399 of query aligns to 7:390/407 of 3fxgA

query
sites
3fxgA
I
 
F
P
 
P
T
 
K
I
 
I
K
 
K
H
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
S
F
 
F
V
 
I
L
 
I
-
 
G
-
 
G
R
 
V
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
D
 
N
Q
 
V
A
 
K
D
 
G
G
 
G
H
 
H
W
 
W
-
 
L
I
 
I
D
 
D
D
 
S
H
 
D
I
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
M
 
A
S
 
S
K
 
K
Y
 
W
P
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
K
S
 
S
R
 
R
R
 
T
S
 
S
F
 
W
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
S
L
 
F
V
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
T
T
 
G
T
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
P
P
 
P
A
 
A
A
 
C
Y
 
W
I
 
L
V
 
V
E
 
H
K
 
Q
H
 
H
L
 
F
A
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
P
T
 
R
D
 
N
I
 
T
E
 
N
K
 
L
I
 
L
W
 
F
D
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
A
T
 
S
L
 
M
Y
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
P
I
 
I
N
 
A
T
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
Q
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
T
R
 
K
D
 
E
E
 
R
L
 
L
Q
 
D
F
 
F
Y
 
Y
A
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
P
R
 
E
P
 
P
D
 
T
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
M
 
M
G
 
G
F
 
F
I
 
W
G
 
G
G
 
G
K
|
K
M
 
V
P
|
P
L
 
L
H
 
P
H
 
F
G
 
C
P
 
P
A
 
D
E
 
D
G
 
G
E
 
H
E
|
E
G
 
G
L
 
L
R
 
R
K
 
K
N
 
N
L
 
V
E
 
E
A
 
F
L
 
L
A
 
R
T
 
K
M
 
H
R
 
R
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
F
W
 
P
L
 
I
M
 
M
L
 
V
D
|
D
C
 
C
W
x
Y
M
 
M
S
 
S
L
 
L
D
 
N
L
 
V
N
 
S
Y
 
Y
A
 
T
T
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
K
G
 
A
A
 
C
H
 
L
E
 
D
H
 
L
G
 
N
L
 
I
K
 
N
W
 
W
I
 
W
E
|
E
E
 
E
A
 
C
L
 
L
P
 
S
P
 
P
D
 
D
D
 
D
Y
 
T
W
 
D
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
A
 
L
L
 
I
R
 
K
N
 
R
N
 
A
V
 
H
P
 
P
K
 
T
G
 
-
M
 
V
L
 
K
V
 
F
T
 
T
T
 
T
G
|
G
E
|
E
H
 
H
E
 
E
A
 
Y
T
 
S
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
 
R
M
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
M
 
G
G
 
R
C
 
N
C
 
L
D
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
M
W
 
W
C
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
L
K
 
K
I
 
V
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
A
H
 
Y
N
 
D
A
 
V
L
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
A
S
 
S
S
 
G
V
 
P
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
H
 
H
F
 
F
V
 
Q
A
 
I
T
 
S
R
 
Q
H
 
P
N
 
N
S
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
Q
E
|
E
F
 
Y
L
 
L
M
 
A
M
 
N
A
 
S
P
 
P
Q
 
D
A
 
G
D
 
K
E
 
S
V
 
V
V
 
L
P
 
P
M
 
V
F
 
F
H
 
G
P
 
D
Q
 
L
L
 
F
L
 
I
G
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
I
P
 
P
V
 
T
E
 
K
G
 
G
R
 
Y
M
 
L
R
 
T
L
 
T
S
 
A
V
 
D
L
 
L
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
L
T
 
T
L
 
I
N
 
N
P
 
P

3sqsA Crystal structure of a putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein from dinoroseobacter shibae dfl 12
33% identity, 81% coverage: 59:383/399 of query aligns to 44:375/386 of 3sqsA

query
sites
3sqsA
L
 
L
V
 
T
V
 
C
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
T
S
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
G
-
 
N
V
 
A
T
 
A
T
x
L
G
 
A
G
 
P
E
x
N
P
 
V
A
 
V
A
 
K
Y
 
Q
I
 
A
V
 
I
E
 
D
K
 
E
H
 
W
L
 
Y
A
 
A
R
 
P
F
 
L
V
 
V
E
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
D
V
 
P
T
 
F
D
 
D
I
 
Y
E
 
A
K
 
Y
I
 
L
W
 
W
D
 
E
Q
 
K
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
R
T
 
T
L
 
H
Y
 
A
Y
 
W
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
V
 
G
I
 
M
N
 
T
T
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
I
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
L
R
 
V
Q
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
F
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
T
R
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
P
F
 
V
Y
 
Y
-
 
Y
-
x
S
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
P
A
 
A
T
 
M
G
 
Q
A
 
A
R
 
E
P
 
A
D
 
E
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
M
 
H
G
 
G
F
 
Y
I
 
Q
G
 
G
G
 
Y
K
|
K
M
 
T
P
x
R
L
 
F
H
x
G
H
 
Y
G
|
G
P
 
P
A
x
K
E
 
D
G
 
G
E
 
P
E
x
A
G
 
G
L
 
M
R
 
R
K
 
E
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
R
L
 
V
A
 
E
T
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
V
V
 
L
G
 
G
P
 
Y
D
 
D
F
 
V
W
 
D
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
x
E
C
 
C
W
x
Y
M
 
M
S
 
G
L
 
W
D
 
N
L
 
L
N
 
D
Y
 
Y
A
 
T
T
 
K
K
 
R
L
 
M
A
 
L
V
 
P
G
 
K
A
 
L
H
 
E
E
 
R
H
 
F
G
 
E
L
 
P
K
 
R
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
P
 
I
P
 
A
D
 
D
D
 
D
Y
 
V
W
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
-
N
 
-
N
 
N
V
 
A
P
 
M
K
 
G
G
 
I
M
 
V
L
 
P
V
 
I
T
 
S
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
|
H
E
 
E
A
 
F
T
 
S
R
 
V
W
 
M
G
 
G
F
 
C
R
 
A
M
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
N
M
 
R
G
 
K
C
 
A
C
 
V
D
 
S
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
P
 
Y
D
|
D
V
 
T
G
 
N
W
 
R
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
A
L
 
A
V
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
H
 
A
N
 
Q
A
x
I
L
 
I
V
 
V
I
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
A
S
x
G
S
 
Q
V
 
M
Y
 
H
S
 
N
Y
 
Y
H
 
H
F
 
L
V
 
T
A
 
M
T
 
A
R
 
N
H
 
M
N
 
N
S
 
C
P
 
P
F
 
I
A
 
S
E
|
E
F
 
Y
L
 
F
M
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
V
A
x
F
D
 
D
E
 
V
V
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
N
P
 
E
M
 
L
F
 
F
H
x
Y
P
 
Y
Q
 
I
L
x
F
L
x
D
G
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
E
P
 
A
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Y
M
 
L
R
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
D
L
 
-
D
 
D
Q
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
S

3stpA Crystal structure of a putative galactonate dehydratase
32% identity, 81% coverage: 59:383/399 of query aligns to 48:379/390 of 3stpA

query
sites
3stpA
L
 
L
V
 
T
V
 
C
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
T
S
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
G
-
 
N
V
 
A
T
 
A
T
x
L
G
 
A
G
 
P
E
x
S
P
 
V
A
 
V
A
 
K
Y
 
K
I
 
V
V
 
I
E
 
D
K
 
D
H
 
W
L
 
Y
A
 
A
R
 
P
F
 
L
V
 
V
E
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
D
V
 
P
T
 
F
D
 
D
I
 
Y
E
 
A
K
 
Y
I
 
I
W
 
W
D
 
E
Q
 
K
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
R
T
 
S
L
 
H
Y
 
A
Y
 
W
G
 
G
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
V
 
G
I
 
M
N
 
T
T
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
I
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
L
R
 
V
Q
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
F
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
T
R
 
K
D
 
D
E
 
R
L
 
I
Q
 
P
F
 
V
Y
 
Y
-
 
Y
-
x
S
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
E
A
 
A
T
 
M
G
 
Q
A
 
K
R
 
E
P
 
A
D
 
E
L
 
E
A
 
A
Q
 
M
K
 
K
M
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
 
K
G
 
A
G
 
F
K
|
K
M
 
S
P
x
R
L
 
F
H
 
G
H
 
Y
G
 
G
P
 
P
A
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
M
E
x
P
G
 
G
L
 
M
R
 
R
K
 
E
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
R
L
 
V
A
 
E
T
 
A
M
 
V
R
 
R
E
 
E
R
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
Y
D
 
D
F
 
N
W
 
D
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
x
E
C
 
C
W
x
Y
M
 
M
S
 
G
L
 
W
D
 
N
L
 
L
N
 
D
Y
 
Y
A
 
A
T
 
K
K
 
R
L
 
M
A
 
L
V
 
P
G
 
K
A
 
L
H
 
A
E
 
P
H
 
Y
G
 
E
L
 
P
K
 
R
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
P
 
I
P
 
A
D
 
D
D
 
D
Y
 
V
W
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
N
-
 
A
-
 
M
N
 
N
N
 
I
V
 
V
P
 
P
K
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
I
T
 
S
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
|
H
E
 
E
A
 
F
T
 
S
R
 
V
W
 
I
G
 
G
F
 
C
R
 
A
M
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
N
M
 
R
G
 
K
C
 
A
C
 
V
D
 
S
I
 
V
I
 
L
Q
|
Q
P
 
Y
D
|
D
V
 
T
G
 
N
W
 
R
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
A
L
 
A
V
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
H
 
A
N
 
Q
A
x
I
L
 
P
V
 
V
I
 
I
P
 
P
H
|
H
G
 
A
S
 
G
S
 
Q
V
 
M
Y
 
H
S
 
N
Y
 
Y
H
 
H
F
 
L
V
 
T
A
 
M
T
 
A
R
 
N
H
 
T
N
 
N
S
 
C
P
 
P
F
 
I
A
 
S
E
|
E
F
 
Y
L
 
F
M
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
P
Q
 
V
A
x
F
D
 
D
E
 
V
V
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
N
P
 
E
M
 
L
F
 
F
H
 
Y
P
 
Y
Q
 
I
L
 
F
L
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
P
V
 
E
P
 
A
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Y
M
 
L
R
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
D
L
 
-
D
 
D
Q
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
A
L
 
I
N
 
S

5olcC Crystal structure of the 3,6-anhydro-d-galactonate cycloisomerase from zobellia galactanivorans (see paper)
34% identity, 65% coverage: 60:318/399 of query aligns to 23:280/351 of 5olcC

query
sites
5olcC
V
 
I
V
 
V
E
 
K
I
 
I
E
 
T
A
 
L
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
Y
G
 
G
F
 
W
A
 
G
V
 
E
T
 
G
T
 
Y
G
 
G
G
 
-
E
 
-
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
V
I
 
I
V
 
K
E
 
S
-
 
G
-
 
I
K
 
D
H
 
F
L
 
F
A
 
T
R
 
P
F
 
F
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
E
V
 
A
T
 
I
D
 
G
I
 
H
E
 
E
K
 
V
I
 
L
W
 
W
D
 
Q
Q
 
E
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
R
T
 
S
L
 
M
Y
 
D
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
K
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
L
I
 
Q
N
 
A
T
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
L
R
 
L
Q
 
N
E
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
S
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
K
R
 
N
D
 
P
E
 
I
L
 
I
Q
 
E
F
 
P
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
L
R
 
Y
P
 
L
D
 
E
L
 
E
A
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
Q
 
K
K
 
S
M
 
Q
G
 
G
F
 
F
I
 
K
G
 
A
G
 
T
K
|
K
M
 
M
P
x
K
L
 
V
H
 
G
H
 
L
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
I
R
 
E
K
 
Q
N
 
D
L
 
L
E
 
K
A
 
Y
L
 
I
A
 
A
T
 
A
M
 
I
R
 
R
E
 
K
R
 
A
V
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
M
W
 
R
L
 
L
M
 
M
L
 
I
D
|
D
C
 
S
W
x
N
M
 
H
S
 
A
L
 
Y
D
 
C
L
 
Y
N
 
K
Y
 
E
A
 
A
T
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
H
 
E
E
 
K
H
 
F
G
 
D
L
 
I
K
 
S
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
P
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
D
Y
 
Y
W
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
K
A
 
R
L
 
L
R
 
R
N
 
Q
N
 
N
V
 
T
P
 
T
K
 
-
G
 
-
M
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
S
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
 
C
E
 
E
A
 
Y
T
 
L
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
 
K
M
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
D
M
 
K
G
 
D
C
 
C
C
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
I
G
 
C
W
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
L
 
V
V
 
K
K
 
K
I
 
I
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
T
H
 
Y
N
 
N
A
 
V
L
 
D
V
 
L
I
 
V
P
 
P
H
|
H

Sites not aligning to the query:

4hpnA Crystal structure of a proposed galactarolactone cycloisomerase from agrobacterium tumefaciens, target efi-500704, with bound ca, ordered loops (see paper)
30% identity, 90% coverage: 28:386/399 of query aligns to 9:369/378 of 4hpnA

query
sites
4hpnA
H
 
H
W
 
L
I
 
L
D
 
E
D
 
H
H
 
R
I
 
L
A
 
D
T
 
T
P
 
P
M
x
F
S
 
E
K
 
S
Y
 
-
P
 
A
D
 
S
Y
 
M
R
 
R
Q
 
F
S
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
A
F
 
H
G
 
-
I
 
-
N
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
V
V
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
C
S
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
W
A
 
G
V
 
E
T
 
C
T
 
L
G
|
G
-
 
P
G
 
A
E
x
R
P
 
P
A
 
N
A
 
A
Y
 
A
I
 
V
V
 
V
E
 
Q
K
 
A
H
 
Y
L
 
S
A
 
G
R
 
W
F
 
L
V
 
I
E
 
-
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
P
T
 
R
D
 
Q
I
 
T
E
 
E
K
 
K
I
 
I
W
 
W
D
 
A
Q
 
V
M
 
L
Y
 
Y
Q
 
N
S
 
A
T
 
L
L
 
R
Y
 
D
Y
 
Q
G
 
G
R
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
L
V
 
S
I
 
L
N
 
T
T
 
A
I
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
H
R
 
Y
Q
 
G
E
 
A
P
 
S
V
 
I
H
 
S
Q
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
W
R
 
R
D
 
E
E
 
S
L
 
V
Q
 
R
F
 
A
Y
 
Y
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
S
-
 
F
R
 
K
P
 
R
D
 
D
L
 
N
A
 
V
Q
 
D
K
 
R
M
 
V
G
 
S
F
 
D
I
 
N
G
 
A
G
 
S
K
 
E
M
 
M
P
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
G
L
 
F
H
 
H
H
 
A
G
 
C
P
x
K
A
 
I
E
x
K
G
 
I
E
 
G
E
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
E
K
 
E
N
 
D
L
 
L
E
 
R
A
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
A
M
 
V
R
 
R
E
 
E
R
 
A
V
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
F
 
M
W
 
R
L
 
L
M
 
M
L
 
I
D
|
D
C
 
A
W
x
N
M
 
H
S
 
G
L
 
Y
D
 
T
L
 
V
N
 
T
Y
 
E
A
 
A
T
 
I
K
 
T
L
 
L
A
 
G
V
x
D
G
 
R
A
 
A
H
 
A
E
 
G
H
 
F
G
 
G
L
 
I
K
 
D
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
P
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
Y
 
L
W
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
L
 
V
R
 
R
N
 
A
N
x
G
V
 
Q
P
 
P
K
 
-
G
 
-
M
 
I
L
 
P
V
 
V
T
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
x
T
E
 
W
A
 
H
T
 
G
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
F
 
M
R
 
W
M
 
Q
L
 
A
L
 
L
E
 
S
M
 
A
G
 
G
C
 
A
C
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
L
G
 
C
W
 
G
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
F
T
 
S
E
 
E
L
 
I
V
 
Q
K
 
K
I
 
I
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
T
A
 
L
H
 
H
N
 
G
A
 
V
L
 
R
V
 
I
I
 
V
P
 
P
H
|
H
-
x
V
-
x
W
G
 
G
S
 
T
S
 
G
V
 
V
Y
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
A
S
 
A
Y
 
L
H
 
Q
F
 
F
V
 
M
A
 
A
T
 
A
R
 
M
H
 
T
N
 
P
S
 
D
P
 
P
F
 
V
-
x
R
-
 
V
-
 
N
-
 
P
A
 
I
E
 
E
F
 
P
L
 
I
M
 
M
M
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
x
E
A
x
F
D
 
D
E
 
R
V
 
T
V
x
H
P
 
N
M
 
P
F
 
F
H
 
R
P
 
Q
Q
 
A
L
 
V
L
 
L
G
 
R
E
 
E
P
 
P
V
 
L
P
 
E
V
 
A
E
 
V
G
 
N
R
 
G
M
 
V
R
 
-
L
 
V
S
 
T
V
 
I
L
 
P
D
 
D
Q
 
G
P
 
P
G
 
G
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
I
N
 
N
P
 
R
D
 
D
C
 
A

3sjnA Crystal structure of enolase spea_3858 (target efi-500646) from shewanella pealeana with magnesium bound
29% identity, 74% coverage: 89:385/399 of query aligns to 67:365/373 of 3sjnA

query
sites
3sjnA
L
 
L
A
 
K
R
 
R
F
 
L
V
 
L
E
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
N
V
 
A
T
 
L
D
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
R
I
 
L
W
 
W
D
 
N
Q
 
K
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
W
S
 
G
T
 
S
L
 
N
Y
 
Y
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
A
V
 
G
I
 
I
N
 
H
T
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
Q
I
 
F
R
 
Y
Q
 
G
E
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
H
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
Y
R
 
R
D
 
D
E
 
K
L
 
I
Q
 
R
F
 
C
Y
 
Y
A
 
G
T
|
T
-
 
F
-
 
I
-
 
P
G
 
A
A
 
D
R
 
K
P
 
P
D
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
Q
K
 
G
M
 
L
G
 
K
F
 
D
I
 
Q
G
 
G
G
 
F
K
 
S
M
 
S
P
 
I
L
x
K
H
 
F
H
x
G
G
 
G
P
 
G
A
 
V
E
x
M
G
 
G
E
 
D
E
 
D
G
 
P
L
 
-
R
 
D
K
 
T
N
 
D
L
 
Y
E
 
A
A
 
I
L
 
V
A
 
K
T
 
A
M
 
V
R
 
R
E
 
E
R
 
A
V
 
A
G
 
G
P
 
P
D
 
E
F
 
M
W
 
E
L
 
V
M
 
Q
L
 
I
D
|
D
C
 
L
-
x
A
-
 
S
-
 
K
W
 
W
M
 
H
S
 
T
L
 
-
D
 
-
L
 
C
N
 
G
Y
 
H
A
 
S
T
 
A
K
 
M
L
 
M
A
 
A
V
 
K
G
 
R
A
 
L
H
 
E
E
 
E
H
 
F
G
 
N
L
 
L
K
 
N
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
P
 
L
P
 
A
D
 
D
D
 
S
Y
 
L
W
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
S
N
 
R
N
 
Q
V
 
V
P
 
S
K
 
Q
G
 
K
M
 
-
L
 
-
V
x
I
T
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
x
S
E
 
L
A
 
T
T
 
T
R
 
R
W
 
Y
G
 
E
F
 
F
R
 
Q
M
 
E
L
 
F
L
 
I
E
 
T
M
 
K
G
 
S
C
 
N
C
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
V
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
V
 
I
G
 
T
W
 
R
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
K
K
 
K
I
 
I
S
 
Y
A
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
M
H
 
N
N
 
G
A
 
T
L
 
Q
V
 
L
I
 
I
P
 
P
H
|
H
G
|
G
S
x
F
S
 
S
V
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
H
Y
 
A
S
 
S
Y
 
V
H
 
H
F
 
F
V
 
L
A
 
A
T
 
A
R
 
C
H
 
E
N
 
Q
S
 
G
P
 
T
F
 
L
A
x
M
E
|
E
F
 
F
L
 
-
M
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
S
D
x
Q
E
 
S
V
x
S
V
 
S
P
 
P
M
 
L
F
 
F
H
 
-
P
 
T
Q
 
S
L
 
L
L
 
V
G
 
K
E
 
N
P
 
Q
V
 
L
P
 
Q
V
 
F
E
 
D
G
 
N
R
 
G
M
 
F
R
 
-
L
 
V
S
 
A
V
 
V
L
 
S
D
 
D
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
L
 
L
N
 
D
P
 
E
D
 
E

Sites not aligning to the query:

3ck5A Crystal structure of a racemase from streptomyces coelicolor a3(2) with bound magnesium
31% identity, 81% coverage: 59:383/399 of query aligns to 32:348/357 of 3ck5A

query
sites
3ck5A
L
 
I
V
 
T
V
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
D
S
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
A
V
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
F
 
Y
A
x
T
V
 
V
T
 
N
T
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
A
P
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
T
I
 
M
V
 
V
E
 
D
K
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
R
R
 
G
F
 
C
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
A
T
 
E
D
 
Q
I
 
I
E
 
E
K
 
K
I
 
I
W
 
W
D
 
Q
Q
 
S
M
 
M
Y
 
W
Q
 
W
S
 
R
T
 
L
L
 
H
Y
 
Y
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
G
G
 
G
L
 
H
V
 
A
I
 
T
N
 
S
T
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
K
G
 
G
K
 
I
I
 
R
R
 
A
Q
 
R
E
 
T
P
 
P
V
 
L
H
 
W
Q
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
Y
-
 
A
G
|
G
A
 
G
V
 
I
R
 
D
D
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
P
F
 
V
Y
 
A
A
 
D
T
 
L
G
 
K
A
 
T
R
 
Q
P
 
A
D
 
D
L
 
R
A
 
F
Q
 
L
K
 
A
M
 
G
G
 
G
F
 
F
I
 
R
G
 
A
G
 
I
K
|
K
M
 
M
P
x
K
L
 
V
H
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
E
 
R
E
 
P
G
 
D
L
 
L
R
 
K
K
 
E
N
 
D
L
 
V
E
 
D
A
 
R
L
 
V
A
 
S
T
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
H
V
 
L
G
 
G
P
 
D
D
 
S
F
 
F
W
 
P
L
 
L
M
 
M
L
 
V
D
|
D
C
 
A
W
x
N
M
 
M
S
 
K
L
 
W
D
 
T
L
 
V
N
 
D
Y
 
G
A
 
A
T
 
I
K
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
R
G
 
A
A
 
L
H
 
A
E
 
P
H
 
F
G
 
D
L
 
L
K
 
H
W
 
W
I
|
I
E
|
E
E
 
E
A
 
P
L
 
T
P
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
W
 
V
G
 
G
Y
 
N
A
 
A
A
 
R
L
 
I
R
 
V
N
 
R
N
 
E
V
 
-
P
 
-
K
 
S
G
 
G
M
 
H
L
 
T
V
x
I
T
 
A
T
 
G
G
|
G
E
|
E
H
 
N
E
 
L
A
 
H
T
 
T
R
 
L
W
 
Y
G
 
D
F
 
F
R
 
H
M
 
N
L
 
A
L
 
V
E
 
R
M
 
A
G
 
G
C
 
S
C
 
L
D
 
T
I
 
L
I
 
P
Q
x
E
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
S
W
 
N
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
T
L
 
F
V
 
R
K
 
K
I
 
V
S
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
H
 
N
N
 
N
A
 
M
L
 
L
V
 
L
I
 
T
P
 
S
H
|
H
G
|
G
S
x
V
S
 
H
V
 
D
Y
 
L
S
 
T
Y
 
V
H
 
H
F
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
S
R
 
V
H
 
P
N
 
H
S
 
R
P
 
T
F
x
Y
A
 
M
E
|
E
F
 
A
L
 
H
M
 
L
M
 
H
A
 
A
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
M
 
-
F
 
-
H
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
Y
L
 
M
G
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
M
P
 
A
V
 
V
E
 
T
G
 
D
R
 
G
M
 
C
R
 
-
L
 
V
S
 
S
V
 
A
L
 
P
D
 
D
Q
 
R
P
 
P
G
 
G
F
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
V
L
 
L
N
 
D