SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1433 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1433 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 96% coverage: 9:257/260 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
I
L
 
L
E
 
R
L
 
T
D
 
E
H
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
S
 
Y
F
|
F
K
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
R
 
S
V
 
V
A
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
C
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
Q
 
K
A
 
A
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
H
 
R
I
 
V
R
 
Y
F
 
F
D
 
E
R
 
N
Q
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
R
 
N
M
 
K
R
 
E
P
 
P
H
 
A
D
 
E
V
 
L
A
 
Y
V
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
L
 
C
K
 
P
R
 
G
R
 
E
S
 
S
T
 
P
W
 
L
I
 
-
E
 
-
Q
 
N
A
 
S
L
 
L
R
 
F
I
 
Y
G
 
K
R
 
K
A
 
W
R
 
I
T
 
P
E
 
K
D
 
E
D
 
E
R
 
E
Q
 
M
R
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
F
R
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
E
F
 
F
L
 
L
H
 
K
L
 
L
Q
 
S
P
 
H
W
 
L
R
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
D
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
Q
 
D
M
 
I
S
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
V
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
K
R
 
A
E
 
K
L
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
I
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
R
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
D
 
N
V
 
V
R
 
L
Q
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 96% coverage: 9:257/260 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
I
L
 
L
E
 
R
L
 
T
D
 
E
H
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
S
 
Y
F
|
F
K
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
R
 
S
V
 
V
A
 
C
A
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
C
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
Q
 
K
A
 
A
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
H
 
R
I
 
V
R
 
Y
F
 
F
D
 
E
R
 
N
Q
 
K
E
 
D
R
 
I
R
 
T
R
 
N
M
 
K
R
 
E
P
 
P
H
 
A
D
 
E
V
 
L
A
 
Y
V
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
L
 
N
K
 
P
R
 
G
R
 
E
S
 
S
T
 
P
W
 
L
I
 
-
E
 
-
Q
 
N
A
 
S
L
 
L
R
 
F
I
 
Y
G
 
K
R
 
K
A
 
W
R
 
I
T
 
P
E
 
K
D
 
E
D
 
E
R
 
E
Q
 
M
R
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
F
R
 
K
V
 
I
I
 
L
A
 
E
F
 
F
L
 
L
H
 
K
L
 
L
Q
 
S
P
 
H
W
 
L
R
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
D
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
Q
 
D
M
 
I
S
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
V
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
K
R
 
A
E
 
K
L
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
I
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
H
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
R
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
D
 
N
V
 
V
R
 
L
Q
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
31% identity, 97% coverage: 9:259/260 of query aligns to 2:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
I
L
 
L
E
 
K
L
 
A
D
 
Q
H
 
H
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
S
F
 
Y
K
 
K
G
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
Q
V
 
V
A
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
L
 
S
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
V
 
L
Y
 
V
Q
 
A
A
 
R
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
H
 
T
I
 
I
R
 
T
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
N
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
I
M
 
L
R
 
P
P
 
M
H
 
H
D
 
S
V
 
R
A
 
S
V
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
V
 
I
L
 
M
T
 
A
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
I
 
T
G
 
R
R
 
E
A
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
H
D
x
E
D
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
-
E
x
D
A
 
K
A
 
L
E
 
E
R
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
E
F
 
E
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
Q
P
 
H
W
 
I
R
 
R
D
 
K
T
 
S
L
 
A
V
 
G
G
 
M
T
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
K
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
R
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
K
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
R
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
V
 
V
R
 
L
Q
 
N
N
 
N
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
I
 
K
S
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
T
 
E
R
 
Q

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:257/260 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
 
R
K
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
|
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:257/260 of query aligns to 3:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
V
 
R
K
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
x
R
G
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
x
M
V
x
G
G
x
Q
T
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:257/260 of query aligns to 3:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
x
R
K
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
 
Q
T
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:257/260 of query aligns to 4:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:256/260 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
x
L
H
|
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
N
 
E
I
x
A
A
x
S
L
 
I
F
|
F
K
x
R
G
x
R
M
x
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
x
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
x
Q
T
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:256/260 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 95% coverage: 10:255/260 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
E
 
T
L
 
A
D
 
K
H
 
N
I
 
L
S
 
A
L
 
K
S
 
A
F
x
Y
K
 
K
G
 
G
V
x
R
K
 
R
A
x
V
V
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
R
 
T
V
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
V
 
I
Y
 
V
Q
 
P
A
 
R
Q
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
R
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
D
Q
 
D
E
 
D
R
 
I
R
 
S
R
 
L
M
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
D
 
A
V
 
R
A
 
A
V
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
A
 
S
L
 
I
F
|
F
K
x
R
G
x
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
L
L
 
M
T
 
A
G
 
V
R
 
L
N
 
Q
L
 
I
K
 
R
R
 
D
R
 
D
S
 
L
T
 
S
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
T
 
Q
E
 
R
D
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
F
H
 
H
L
 
I
Q
 
E
P
 
H
W
 
L
R
 
R
D
 
D
T
 
S
L
 
M
V
 
G
G
 
Q
T
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
D
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
Q
 
D
M
 
I
S
 
K
R
 
R
F
 
I
I
 
I
V
 
E
D
 
H
I
 
L
N
 
-
R
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
T
 
L
T
 
G
V
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
H
 
R
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
R
 
H
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
T
D
 
E
V
 
I
R
 
L
Q
 
Q
N
 
D
P
 
E
E
 
H
V
 
V
I
 
K
S
 
R
A
 
V
Y
 
Y

P9WQI3 Trehalose import ATP-binding protein SugC; MtbSugC; Nucleotide-binding domain of SugABC transporter; NBD of SugABC transporter; SugABC transporter ATPase SugC; EC 7.5.2.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 12:258/260 of query aligns to 6:237/393 of P9WQI3

query
sites
P9WQI3
L
 
L
D
 
D
H
 
H
I
 
V
S
 
N
L
 
K
S
 
S
F
 
Y
K
 
P
-
 
D
G
 
G
V
 
H
K
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
R
D
 
D
I
 
L
S
 
N
F
 
L
R
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
L
A
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
D
A
 
I
Q
 
S
D
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
L
R
 
R
F
 
I
D
 
A
R
 
G
Q
 
E
E
 
R
R
 
V
R
 
N
R
 
E
M
 
K
R
 
A
P
 
P
H
 
K
D
 
D
V
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
R
D
 
Q
N
 
N
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
I
E
 
A
Q
 
F
A
 
P
L
 
L
R
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
K
A
 
M
R
 
R
T
 
K
E
 
A
D
 
D
D
 
I
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
S
R
 
E
V
 
T
I
 
A
A
 
K
F
 
I
L
 
L
H
 
D
L
 
L
Q
 
T
P
 
N
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
P
G
 
S
T
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
A
 
R
E
 
H
P
 
P
R
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
K
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
G
F
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
Q
I
 
L
N
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
T
V
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
Y
Y
 
G
G
 
G
R
 
I
K
 
A
I
 
Q
G
 
Q
D
 
I
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
E
N
 
R
P
 
P
E
 
A
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
28% identity, 98% coverage: 4:257/260 of query aligns to 12:249/378 of P69874

query
sites
P69874
T
 
S
A
 
S
I
 
L
T
 
S
H
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
A
H
 
G
I
 
I
S
 
R
L
 
K
S
x
C
F
|
F
K
 
D
G
 
G
V
 
K
K
 
E
A
 
V
V
 
I
T
 
P
D
 
Q
I
 
L
S
 
D
F
 
L
R
 
T
V
 
I
A
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
E
I
x
F
C
 
L
A
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
L
 
V
L
|
L
N
 
R
V
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
V
Q
 
D
D
 
S
G
 
G
H
 
R
I
 
I
R
 
M
F
x
L
D
 
D
R
 
N
Q
 
E
E
 
D
R
 
I
R
 
T
R
 
H
M
 
V
R
 
P
P
 
A
H
 
E
D
 
N
V
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
R
G
 
Y
I
 
V
A
 
N
R
 
T
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
A
T
 
F
G
 
G
R
 
L
N
 
R
L
 
M
K
 
Q
R
 
K
R
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
S
 
T
T
 
P
W
 
R
I
 
V
E
 
M
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
M
G
x
V
R
 
Q
A
 
L
R
 
E
T
 
T
E
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
F
L
 
A
H
 
Q
L
 
R
Q
 
K
P
 
P
W
 
H
R
 
Q
D
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
N
E
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
M
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
Y
D
 
K
E
 
L
K
 
R
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
M
S
 
Q
R
 
N
F
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
A
I
 
L
N
 
Q
R
 
R
E
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
I
T
 
T
V
 
F
V
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
E
V
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
T
I
 
M
S
 
S
D
 
D
H
 
R
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
R
Y
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
I
I
 
E
G
 
Q
D
 
D
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
R
D
 
E
V
 
I
R
 
Y
Q
 
E
N
 
E
P
 
P
E
 
K
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8hprD Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
29% identity, 95% coverage: 12:258/260 of query aligns to 5:236/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
L
 
L
D
 
D
H
 
R
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
S
F
x
Y
K
 
P
G
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
A
-
 
A
V
 
V
T
 
K
D
 
E
I
 
F
S
 
S
F
 
M
R
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
I
A
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
E
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
L
R
 
R
F
 
I
D
 
G
R
 
G
Q
 
E
E
 
R
R
 
V
R
 
N
R
 
E
M
 
K
R
 
A
P
 
P
H
 
K
D
 
D
V
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
R
D
 
Q
N
 
N
V
 
I
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
A
L
 
F
R
 
P
I
 
L
G
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
E
 
P
D
 
K
D
 
A
R
 
E
Q
 
I
R
 
A
E
 
A
A
 
K
A
 
V
E
 
E
R
 
E
V
 
T
I
 
A
A
 
K
F
 
I
L
 
L
H
 
D
L
 
L
Q
 
S
P
 
E
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
V
 
P
G
 
G
T
x
Q
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
A
 
R
E
 
S
P
 
P
R
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
K
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
A
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
Q
R
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
T
V
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
L
Y
 
A
G
 
G
R
 
E
K
 
V
I
 
Q
G
 
Q
D
 
I
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
D
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
S
N
 
S
P
 
P
E
 
A
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 3:235/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
x
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
 
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
29% identity, 95% coverage: 12:258/260 of query aligns to 5:236/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
L
 
L
D
 
D
H
 
R
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
S
F
x
Y
K
 
P
G
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
A
-
 
A
V
 
V
T
 
K
D
 
E
I
 
F
S
 
S
F
 
M
R
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
I
A
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
E
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
L
R
 
R
F
 
I
D
 
G
R
 
G
Q
 
E
E
 
R
R
 
V
R
 
N
R
 
E
M
 
K
R
 
A
P
 
P
H
 
K
D
 
D
V
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
R
D
 
Q
N
 
N
V
 
I
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
A
L
 
F
R
 
P
I
 
L
G
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
V
E
 
P
D
 
K
D
 
A
R
 
E
Q
 
I
R
 
A
E
 
A
A
 
K
A
 
V
E
 
E
R
 
E
V
 
T
I
 
A
A
 
K
F
 
I
L
 
L
H
 
D
L
 
L
Q
 
S
P
 
E
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
P
G
 
G
T
x
Q
L
 
L
P
 
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
A
 
R
E
 
S
P
 
P
R
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
K
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
A
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
Q
R
 
D
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
T
V
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
G
D
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
L
Y
 
A
G
 
G
R
 
E
K
 
V
I
 
Q
G
 
Q
D
 
I
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
D
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
S
N
 
S
P
 
P
E
 
A
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 1:233/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
x
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
 
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 4:236/371 of P68187

query
sites
P68187
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
 
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
A
|
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
x
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
x
V
E
 
N
R
 
Q
V
|
V
I
 
A
A
x
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
x
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
x
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 3:235/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
x
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
 
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 3:235/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
x
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
 
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
 
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:258/260 of query aligns to 3:235/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
Q
H
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
S
 
A
F
x
W
K
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
V
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
I
A
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
A
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
Q
 
T
A
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
H
 
D
I
 
L
R
 
F
F
 
I
D
 
G
R
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
R
M
 
M
R
 
N
P
 
D
H
 
T
D
 
P
V
 
P
A
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
I
 
L
G
 
A
R
 
G
A
 
A
R
 
K
T
 
K
E
 
E
D
 
V
D
 
I
R
 
N
Q
 
Q
R
 
R
E
 
-
A
 
-
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
A
 
E
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
L
 
L
Q
 
A
P
 
H
W
 
L
R
 
L
D
 
D
T
x
R
L
 
K
V
 
P
G
 
K
T
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
D
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
M
 
M
S
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
V
 
S
D
 
R
I
 
L
N
 
H
R
 
K
E
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
V
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
H
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
E
V
 
L
R
 
Y
Q
 
H
N
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
R
V
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
S

Query Sequence

>Pf6N2E2_1433 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1433
MTQTAITHLLELDHISLSFKGVKAVTDISFRVAAGEICALIGPNGAGKSSLLNVISGVYQ
AQDGHIRFDRQERRRMRPHDVAVRGIARTFQNIALFKGMSVLDNVLTGRNLKRRSTWIEQ
ALRIGRARTEDDRQREAAERVIAFLHLQPWRDTLVGTLPYGLQKRVELARALAAEPRLLL
LDEPMAGMNADEKQQMSRFIVDINRELGTTVVLIEHDIGVVMDISDHVVVLDYGRKIGDG
SPEDVRQNPEVISAYLGTRH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory