SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1635 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1635 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
43% identity, 88% coverage: 16:251/267 of query aligns to 26:262/265 of P07821

query
sites
P07821
I
 
L
L
 
L
N
 
H
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
T
I
 
F
P
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
K
F
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
N
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
K
V
 
M
L
 
L
A
 
G
H
 
R
M
 
H
L
 
Q
R
 
P
P
 
P
S
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
A
K
 
Q
R
 
P
L
 
L
G
 
E
Q
 
S
Y
 
W
S
 
S
R
 
S
R
 
K
T
 
A
L
 
F
A
 
A
Q
 
R
H
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
L
T
 
P
S
 
P
P
 
A
A
 
E
G
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
V
M
 
A
Q
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
W
 
W
Q
 
H
T
 
G
W
 
A
W
 
L
R
 
G
Q
 
R
W
 
F
S
 
G
E
 
A
Q
 
A
D
 
D
Q
 
R
Q
 
E
A
 
K
I
 
V
D
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
S
L
 
L
A
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
A
D
 
H
R
 
R
S
 
L
L
 
V
A
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
A
M
 
M
T
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
T
 
S
P
 
R
V
 
C
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
F
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
I
 
V
T
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
L
L
 
V
V
 
H
D
 
R
L
 
L
-
 
S
R
 
Q
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
Q
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
C
D
 
D
H
 
Y
L
 
L
V
 
V
M
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
M
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
E
V
 
I
F
 
M
T
 
R
R
 
G
D
 
E
N
 
T
L
 
L
K
 
E
A
 
M
V
 
I
F
 
Y
D
 
G
L
 
I
D
 
P
A
 
M
H
 
G
I
 
I
I
 
L
T
 
P
D
 
H
P
 
P
Y
 
A
S
 
G
G
 
A
D
 
A
P
 
P
L
 
V
C
 
S

3fvqB Crystal structure of the nucleotide binding domain fbpc complexed with atp (see paper)
37% identity, 86% coverage: 10:238/267 of query aligns to 12:234/350 of 3fvqB

query
sites
3fvqB
S
 
S
Y
x
F
G
x
Q
E
 
N
Q
x
T
Q
 
P
I
x
V
L
 
L
N
 
N
G
 
D
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
S
I
 
L
P
 
D
E
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
I
T
 
L
A
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
C
L
 
L
A
 
A
H
 
G
M
 
F
L
 
E
R
 
Q
P
 
P
S
 
D
A
 
S
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
-
Q
 
-
Y
 
F
S
 
S
R
 
K
R
 
N
T
 
T
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
V
R
 
R
T
 
E
T
 
R
S
 
R
P
 
-
A
 
L
G
 
G
M
 
Y
S
 
L
V
 
V
R
x
Q
E
 
E
L
 
G
V
 
V
M
 
L
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P
W
 
H
Q
 
L
T
 
T
W
 
V
W
 
Y
R
 
R
Q
 
N
W
 
I
-
 
A
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
R
S
 
T
E
 
A
Q
 
Q
D
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
R
I
 
I
D
 
E
R
 
A
A
 
M
I
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
E
L
 
L
L
 
A
D
 
G
R
|
R
S
 
Y
L
 
P
A
 
H
T
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
A
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
D
 
D
T
 
P
P
 
E
V
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
S
F
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
Q
I
 
L
A
 
R
H
 
R
Q
 
Q
I
 
I
T
 
R
L
 
-
L
 
E
E
 
D
L
 
M
L
 
I
V
 
A
D
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
S
I
 
A
V
 
V
A
 
F
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
R
N
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
 
R
L
 
I
V
 
A
M
 
V
M
 
M
R
 
K
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
Q
Q
 
T
G
 
A
A
 
S
P
 
P
A
 
H
K
 
E
V
 
L
F
 
Y
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
R
A
 
Q
V
 
P
F
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
A

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp- binding cassette of an abc transporter (see paper)
28% identity, 82% coverage: 1:219/267 of query aligns to 4:232/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
T
T
 
E
D
 
N
V
 
I
R
 
V
L
 
K
S
 
Y
Y
x
F
G
 
G
E
 
E
Q
x
F
Q
 
K
I
 
A
L
 
L
N
 
D
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
D
 
S
I
 
V
P
 
N
E
 
K
G
 
G
R
 
D
F
 
V
T
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
T
H
 
G
M
 
F
L
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
A
 
E
G
 
G
D
 
R
V
 
V
Q
 
Y
L
 
F
S
 
E
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
I
G
 
T
Q
 
N
Y
 
K
S
 
E
R
 
P
R
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
Y
Q
 
H
H
 
Y
L
 
G
A
 
I
L
 
V
L
 
R
P
 
T
Q
 
F
R
 
Q
T
 
T
T
 
P
S
 
Q
P
 
P
-
 
L
A
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
E
L
 
N
V
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
R
 
E
F
 
I
-
 
C
P
 
P
W
 
G
Q
 
E
T
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
W
 
F
W
 
Y
R
 
K
Q
 
K
W
 
W
S
 
I
E
 
P
Q
 
K
D
 
E
Q
 
E
Q
 
E
A
 
M
I
 
V
D
 
E
R
 
K
A
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
L
G
 
K
I
 
L
S
 
S
P
 
H
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
K
L
 
A
A
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
K
R
 
L
C
 
V
W
 
E
I
 
I
A
 
G
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
T
D
 
N
T
 
P
P
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
T
 
A
F
 
G
L
 
V
-
 
A
-
 
P
D
 
G
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
I
 
I
T
 
-
L
 
-
L
 
F
E
 
N
L
 
H
L
 
V
V
 
L
D
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
A
 
I
V
 
I
L
 
E
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
D
Q
 
I
A
 
V
A
 
L
R
 
N
Y
 
Y
A
 
I
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
Y
M
 
V
M
 
M
R
 
F
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
28% identity, 82% coverage: 1:219/267 of query aligns to 4:232/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
T
T
 
E
D
 
N
V
 
I
R
 
V
L
 
K
S
 
Y
Y
x
F
G
 
G
E
 
E
Q
x
F
Q
 
K
I
 
A
L
 
L
N
 
D
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
D
 
S
I
 
V
P
 
C
E
 
K
G
 
G
R
 
D
F
 
V
T
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
N
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
T
H
 
G
M
 
F
L
 
L
R
 
K
P
 
A
S
 
D
A
 
E
G
 
G
D
 
R
V
 
V
Q
 
Y
L
 
F
S
 
E
G
 
N
K
 
K
R
 
D
L
 
I
G
 
T
Q
 
N
Y
 
K
S
 
E
R
 
P
R
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
Y
Q
 
H
H
 
Y
L
 
G
A
 
I
L
 
V
L
 
R
P
 
T
Q
 
F
R
 
Q
T
 
T
T
 
P
S
 
Q
P
 
P
-
 
L
A
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
E
L
 
N
V
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
G
R
 
E
F
 
I
-
 
N
P
 
P
W
 
G
Q
 
E
T
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
W
 
F
W
 
Y
R
 
K
Q
 
K
W
 
W
S
 
I
E
 
P
Q
 
K
D
 
E
Q
 
E
Q
 
E
A
 
M
I
 
V
D
 
E
R
 
K
A
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
L
G
 
K
I
 
L
S
 
S
P
 
H
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
K
L
 
A
A
 
G
T
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
K
R
 
L
C
 
V
W
 
E
I
 
I
A
 
G
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
T
D
 
N
T
 
P
P
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
T
 
A
F
 
G
L
 
V
-
 
A
-
 
P
D
 
G
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
I
 
I
T
 
-
L
 
-
L
 
F
E
 
N
L
 
H
L
 
V
V
 
L
D
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
A
 
I
V
 
I
L
 
E
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
D
Q
 
I
A
 
V
A
 
L
R
 
N
Y
 
Y
A
 
I
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
Y
M
 
V
M
 
M
R
 
F
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
28% identity, 85% coverage: 1:227/267 of query aligns to 1:226/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
L
 
I
K
 
F
A
 
V
T
 
N
D
 
D
V
 
V
R
 
Y
L
 
K
S
 
N
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
Q
 
L
Q
 
E
I
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
L
D
 
K
I
 
V
P
 
N
E
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
V
T
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
C
L
 
I
A
 
N
H
 
L
M
 
L
L
 
E
R
 
E
P
 
P
S
 
T
A
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
S
 
D
G
 
G
K
 
V
R
 
K
L
 
I
-
 
N
-
 
N
G
 
G
Q
 
K
Y
 
V
S
 
N
R
 
I
R
 
N
T
 
K
L
 
V
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
L
 
V
A
 
G
L
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
R
 
H
T
 
F
T
 
N
S
 
L
P
 
F
A
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
N
V
 
I
M
 
T
Q
 
L
G
 
A
R
 
P
F
 
V
P
 
K
W
 
V
Q
 
K
T
 
K
W
 
M
W
 
N
R
 
K
Q
 
K
W
 
E
S
 
A
E
 
E
Q
 
E
D
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
L
G
 
A
I
 
K
S
 
V
P
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
K
S
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
L
 
P
A
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
Q
T
 
P
P
 
E
V
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
F
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
I
 
K
T
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
N
L
 
V
L
 
M
V
 
K
D
 
Q
L
 
L
R
 
A
E
 
N
Q
 
E
G
 
G
K
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
A
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
Q
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
H
 
R
L
 
V
V
 
I
M
 
F
M
 
M
R
 
D
E
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
K
 
E
V
 
I
F
 
F
T
 
Y
R
 
R

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
31% identity, 87% coverage: 1:231/267 of query aligns to 3:241/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
M
 
I
L
 
L
K
 
E
A
 
A
T
 
N
D
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
K
S
 
S
Y
|
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
N
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
I
D
 
H
I
 
I
P
 
E
E
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
F
T
 
V
A
 
S
L
 
I
I
 
M
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
 
G
C
x
S
G
 
G
K
 
K
T
|
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
S
H
 
S
M
 
I
L
 
D
R
 
Q
P
 
V
S
 
S
A
 
H
G
 
G
D
 
T
V
 
I
Q
 
H
L
 
I
S
 
N
G
 
G
K
 
N
R
 
D
L
 
M
G
 
T
Q
 
A
Y
 
M
S
 
K
R
 
E
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
R
-
 
K
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
R
 
D
T
 
Y
T
 
N
S
 
L
P
 
L
A
 
D
G
 
T
M
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
N
V
 
I
M
 
L
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
L
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
T
 
I
W
 
T
W
 
K
R
 
L
Q
 
S
W
 
K
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
D
 
N
Q
 
R
Q
 
K
A
 
F
I
 
E
D
 
E
R
 
V
A
 
A
I
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
-
G
 
G
I
 
I
S
 
Y
P
 
E
L
 
L
L
 
R
D
 
D
R
 
K
S
 
Y
L
 
P
A
 
N
T
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
T
W
 
S
I
 
A
A
 
G
M
 
R
T
 
A
L
 
F
A
 
I
Q
 
H
D
 
D
T
 
P
P
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
F
L
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
F
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
K
H
 
S
Q
 
A
I
 
S
T
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
N
L
 
K
L
 
L
V
 
S
D
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
Q
 
K
-
 
R
G
 
N
K
 
A
T
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
-
N
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
A
 
C
D
 
G
H
 
R
L
 
V
V
 
I
M
 
F
M
 
I
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
Y
A
 
T
Q
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
G
G
 
G
A
 
Q
P
 
D
A
 
R
K
 
Q
V
 
T
F
 
F
T
 
F
R
 
Q
D
 
D
N
 
I
L
 
M
K
 
K

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
30% identity, 87% coverage: 1:231/267 of query aligns to 2:240/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
M
 
I
L
 
L
K
 
E
A
 
A
T
 
N
D
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
K
S
 
S
Y
|
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
N
E
 
K
Q
|
Q
Q
 
E
I
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
I
D
 
H
I
 
I
P
 
E
E
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
F
T
 
V
A
 
S
L
 
I
I
 
M
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
S
H
 
S
M
 
I
L
 
D
R
 
Q
P
 
V
S
 
S
A
 
H
G
 
G
D
 
T
V
 
I
Q
 
H
L
 
I
S
 
N
G
 
G
K
 
N
R
 
D
L
 
M
G
 
T
Q
 
A
Y
 
M
S
 
K
R
 
E
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
R
-
 
K
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
R
 
D
T
 
Y
T
 
N
S
 
L
P
 
L
A
 
D
G
 
T
M
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
N
V
 
I
M
 
L
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
L
P
 
P
W
 
L
Q
 
S
T
 
I
W
 
T
W
 
K
R
 
L
Q
 
S
W
 
K
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
D
 
N
Q
 
R
Q
 
K
A
 
F
I
 
E
D
 
E
R
 
V
A
 
A
I
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
-
G
 
G
I
 
I
S
 
Y
P
 
E
L
 
L
L
 
R
D
 
D
R
 
K
S
 
Y
L
 
P
A
 
N
T
x
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
L
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
T
W
 
S
I
 
A
A
 
G
M
 
R
T
 
A
L
 
F
A
 
I
Q
 
H
D
 
D
T
 
P
P
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
F
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
G
F
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
K
H
 
S
Q
 
A
I
 
S
T
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
N
L
 
K
L
 
L
V
 
S
D
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
Q
 
K
-
 
R
G
 
N
K
 
A
T
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
-
N
 
P
Q
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
A
 
C
D
 
G
H
 
R
L
 
V
V
 
I
M
 
F
M
 
I
R
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
M
L
 
Y
A
 
T
Q
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
G
G
 
G
A
 
Q
P
 
D
A
 
R
K
 
Q
V
 
T
F
 
F
T
 
F
R
 
Q
D
 
D
N
 
I
L
 
M
K
 
K

8ipsA Cryo-em structure of heme transporter cyddc from escherichia coli in the inward facing heme loading state (see paper)
31% identity, 84% coverage: 6:229/267 of query aligns to 343:564/573 of 8ipsA

query
sites
8ipsA
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
P
 
N
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
H
T
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
 
T
G
 
G
C
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
T
H
 
R
M
 
A
L
 
W
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
N
G
 
D
K
 
S
R
 
P
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
Y
 
L
S
 
N
R
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
T
 
H
S
 
L
P
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
T
S
 
L
V
 
R
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
-
F
 
-
P
 
P
W
 
G
Q
 
S
T
 
S
W
 
D
W
 
E
R
 
A
Q
 
L
W
 
S
S
 
E
E
 
I
Q
 
L
D
 
R
Q
 
R
Q
 
V
A
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
S
L
 
W
L
 
L
D
 
G
R
 
E
S
 
G
L
 
G
A
 
R
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
E
F
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
S
T
 
Q
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
A
D
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
R
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
R
Q
 
G
A
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
A
 
-
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
V
 
I
M
 
V
M
 
M
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
H
A
 
A
K
 
E
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
R
D
 
Q
N
 
G

Sites not aligning to the query:

7zdkC If(apo/asym) conformation of cyddc in amp-pnp(cydc)/amp-pnp(cydd) bound state (dataset-8) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 6:229/267 of query aligns to 343:564/573 of 7zdkC

query
sites
7zdkC
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
E
 
E
Q
|
Q
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
P
 
N
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
H
T
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
 
T
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
T
H
 
R
M
 
A
L
 
W
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
N
G
 
D
K
 
S
R
 
P
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
Y
 
L
S
 
N
R
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
|
Q
R
 
R
T
 
V
T
 
H
S
 
L
P
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
T
S
 
L
V
 
R
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
-
F
 
-
P
 
P
W
 
G
Q
 
S
T
 
S
W
 
D
W
 
E
R
 
A
Q
 
L
W
 
S
S
 
E
E
 
I
Q
 
L
D
 
R
Q
 
R
Q
 
V
A
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
S
L
 
W
L
 
L
D
 
G
R
 
E
S
 
G
L
 
G
A
 
R
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
E
F
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
S
T
 
Q
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
A
D
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
R
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
R
Q
 
G
A
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
A
 
-
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
V
 
I
M
 
V
M
 
M
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
H
A
 
A
K
 
E
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
R
D
 
Q
N
 
G

7zdfC If(heme/confined) conformation of cyddc in amp-pnp(cydd) bound state (dataset-4) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 6:229/267 of query aligns to 343:564/573 of 7zdfC

query
sites
7zdfC
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
P
 
N
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
H
T
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
 
T
G
 
G
C
 
C
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
T
H
 
R
M
 
A
L
 
W
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
N
G
 
D
K
 
S
R
 
P
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
Y
 
L
S
 
N
R
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
T
 
H
S
 
L
P
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
T
S
 
L
V
 
R
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
-
F
 
-
P
 
P
W
 
G
Q
 
S
T
 
S
W
 
D
W
 
E
R
 
A
Q
 
L
W
 
S
S
 
E
E
 
I
Q
 
L
D
 
R
Q
 
R
Q
 
V
A
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
S
L
 
W
L
 
L
D
 
G
R
 
E
S
 
G
L
 
G
A
 
R
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
E
F
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
S
T
 
Q
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
A
D
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
R
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
R
Q
 
G
A
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
A
 
-
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
V
 
I
M
 
V
M
 
M
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
H
A
 
A
K
 
E
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
R
D
 
Q
N
 
G

Sites not aligning to the query:

8hf4A Cryo-em structure of nucleotide-bound coma at outward-facing state with ec gate closed conformation
29% identity, 87% coverage: 2:232/267 of query aligns to 332:558/563 of 8hf4A

query
sites
8hf4A
L
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
D
 
H
V
 
Y
R
 
K
L
x
Y
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
-
Q
 
R
Q
 
D
I
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
D
 
T
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
S
F
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
I
N
x
S
G
|
G
C
x
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
A
N
 
K
V
 
M
L
 
M
A
 
V
H
 
N
M
 
F
L
 
Y
R
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
V
R
 
N
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
R
 
Q
T
 
P
T
 
Y
S
 
V
P
 
F
A
 
N
G
 
G
M
 
T
S
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
G
G
 
A
R
 
K
F
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
S
 
E
E
 
G
Q
 
T
D
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
D
I
 
I
D
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
I
 
I
S
 
R
P
 
E
L
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
S
S
 
D
L
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
T
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
T
Q
 
E
I
 
K
T
 
R
L
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
L
V
 
I
A
 
F
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
T
D
 
E
H
 
K
L
 
V
V
 
V
M
 
V
M
 
L
R
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
H
A
 
A
K
 
D
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
Q
D
 
G
N
 
G
L
 
F
K
 
Y
A
 
A

7zdaC If(apo/asym) conformation of cyddc in adp+pi(cydc)/atp(cydd) bound state (dataset-2) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 6:229/267 of query aligns to 343:564/572 of 7zdaC

query
sites
7zdaC
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
P
 
N
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
H
T
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
 
T
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
T
H
 
R
M
 
A
L
 
W
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
N
G
 
D
K
 
S
R
 
P
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
Y
 
L
S
 
N
R
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
|
Q
R
 
R
T
 
V
T
 
H
S
 
L
P
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
T
S
 
L
V
 
R
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
-
F
 
-
P
 
P
W
 
G
Q
 
S
T
 
S
W
 
D
W
 
E
R
 
A
Q
 
L
W
 
S
S
 
E
E
 
I
Q
 
L
D
 
R
Q
 
R
Q
 
V
A
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
S
L
 
W
L
 
L
D
 
G
R
 
E
S
 
G
L
 
G
A
 
R
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
E
F
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
S
T
 
Q
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
A
D
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
R
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
R
Q
 
G
A
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
A
 
-
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
V
 
I
M
 
V
M
 
M
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
H
A
 
A
K
 
E
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
R
D
 
Q
N
 
G

Sites not aligning to the query:

Q5SSE9 ATP-binding cassette sub-family A member 13; EC 7.6.2.- from Mus musculus (Mouse) (see paper)
27% identity, 77% coverage: 20:224/267 of query aligns to 3829:4029/5034 of Q5SSE9

query
sites
Q5SSE9
V
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
T
I
 
F
P
 
H
E
 
R
G
 
D
R
 
Q
F
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
I
N
 
S
V
 
M
L
 
L
A
 
M
H
 
G
M
 
L
L
 
F
R
 
P
P
 
P
S
 
T
A
 
S
G
 
G
D
 
T
V
 
I
Q
 
T
L
 
I
S
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
N
L
 
L
G
 
-
Q
 
Q
Y
 
T
S
 
D
R
 
L
R
 
S
T
 
K
L
 
V
A
 
R
Q
 
E
H
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
V
L
 
C
P
 
P
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
D
T
 
V
S
 
L
P
 
L
A
 
D
G
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
H
V
 
L
M
 
M
Q
 
L
G
 
F
R
 
A
F
 
S
P
 
I
W
 
K
Q
 
A
T
 
P
W
 
W
W
 
W
R
 
T
Q
 
-
W
 
-
S
 
T
E
 
K
Q
 
E
D
 
L
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
V
D
 
N
R
 
K
A
 
T
I
 
L
D
 
D
L
 
E
A
 
V
G
 
E
I
 
L
S
 
T
P
 
Q
L
 
H
L
 
Q
D
 
H
R
 
K
S
 
P
L
 
A
A
 
G
T
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
L
 
K
Q
 
R
R
 
K
C
 
L
W
 
S
I
 
I
A
 
G
M
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
M
Q
 
G
D
 
M
T
 
S
P
 
K
V
 
T
I
 
V
L
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
S
F
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
P
A
 
C
H
 
S
Q
 
R
I
 
R
T
 
S
L
 
L
L
 
W
E
 
D
L
 
I
L
 
L
V
 
L
D
 
K
L
 
Y
R
 
R
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
F
V
 
T
L
x
T
H
 
H
D
 
H
L
 
L
N
 
D
Q
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
M
Y
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
V
V
 
A
M
 
V
M
 
L
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
L
L
 
R
A
 
C
Q
 
Y
G
 
A
A
 
P
P
 
P
A
 
A
K
 
D
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8hf7B Cryo-em structure of coma bound to its mature substrate csp peptide
29% identity, 87% coverage: 2:232/267 of query aligns to 332:558/563 of 8hf7B

query
sites
8hf7B
L
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
D
 
H
V
 
Y
R
 
K
L
 
Y
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
-
Q
 
R
Q
 
D
I
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
D
 
T
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
S
F
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
I
N
 
S
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
A
N
 
K
V
 
M
L
 
M
A
 
V
H
 
N
M
 
F
L
 
Y
R
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
V
R
 
N
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
P
T
 
Y
S
 
V
P
 
F
A
 
N
G
 
G
M
 
T
S
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
G
G
 
A
R
 
K
F
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
S
 
E
E
 
G
Q
 
T
D
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
D
I
 
I
D
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
I
 
I
S
 
R
P
 
E
L
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
S
S
 
D
L
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
T
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
T
Q
 
E
I
 
K
T
 
R
L
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
L
V
 
I
A
 
F
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
T
D
 
E
H
 
K
L
 
V
V
 
V
M
 
V
M
 
L
R
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
H
A
 
A
K
 
D
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
Q
D
 
G
N
 
G
L
 
F
K
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8k7aA Cryo-em structure of nucleotide-bound coma e647q mutant with mg2+
29% identity, 87% coverage: 2:232/267 of query aligns to 332:558/563 of 8k7aA

query
sites
8k7aA
L
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
D
 
H
V
 
Y
R
 
K
L
x
Y
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
-
Q
 
R
Q
 
D
I
 
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
D
 
T
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
S
F
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
I
N
 
S
G
 
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
A
N
 
K
V
 
M
L
 
M
A
 
V
H
 
N
M
 
F
L
 
Y
R
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
V
R
 
N
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
R
 
Q
T
 
P
T
 
Y
S
 
V
P
 
F
A
 
N
G
 
G
M
 
T
S
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
G
G
 
A
R
 
K
F
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
S
 
E
E
 
G
Q
 
T
D
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
D
I
 
I
D
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
I
 
I
S
 
R
P
 
E
L
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
S
S
 
D
L
 
G
A
 
A
T
x
G
L
 
I
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
T
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
T
Q
 
E
I
 
K
T
 
R
L
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
L
V
 
I
A
 
F
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
T
D
 
E
H
 
K
L
 
V
V
 
V
M
 
V
M
 
L
R
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
H
A
 
A
K
 
D
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
Q
D
 
G
N
 
G
L
 
F
K
 
Y
A
 
A

8hf6A Cryo-em structure of nucleotide-bound coma e647q mutant
29% identity, 87% coverage: 2:232/267 of query aligns to 332:558/563 of 8hf6A

query
sites
8hf6A
L
 
F
K
 
K
A
 
Q
T
 
V
D
 
H
V
 
Y
R
 
K
L
x
Y
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
-
Q
 
R
Q
 
D
I
x
V
L
 
L
N
 
S
G
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
D
 
T
I
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
S
F
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
I
N
x
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
A
N
 
K
V
 
M
L
 
M
A
 
V
H
 
N
M
 
F
L
 
Y
R
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
V
R
 
N
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
D
R
 
K
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
I
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
R
 
Q
T
 
P
T
 
Y
S
 
V
P
 
F
A
 
N
G
 
G
M
 
T
S
 
I
V
 
L
R
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
G
G
 
A
R
 
K
F
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
S
 
E
E
 
G
Q
 
T
D
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
D
I
 
I
D
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
E
I
 
I
S
 
R
P
 
E
L
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
S
S
 
D
L
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
T
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
T
Q
 
E
I
 
K
T
 
R
L
 
I
L
 
V
E
 
D
L
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
L
V
 
I
A
 
F
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
T
D
 
E
H
 
K
L
 
V
V
 
V
M
 
V
M
 
L
R
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
H
A
 
A
K
 
D
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
Q
D
 
G
N
 
G
L
 
F
K
 
Y
A
 
A

7zdtC Occ(apo/return) conformation of cyddc mutant (e500q.C) in atp(cydc) bound state (dataset-18) (see paper)
30% identity, 84% coverage: 6:229/267 of query aligns to 343:564/572 of 7zdtC

query
sites
7zdtC
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
L
 
L
N
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
P
 
N
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
H
T
 
I
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
x
T
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
T
H
 
R
M
 
A
L
 
W
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
S
 
N
G
 
D
K
 
S
R
 
P
L
 
I
G
 
A
Q
 
S
Y
 
L
S
 
N
R
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
|
Q
R
 
R
T
 
V
T
 
H
S
 
L
P
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
T
S
 
L
V
 
R
R
 
D
E
 
N
L
 
L
V
 
L
M
 
L
Q
 
A
G
 
S
R
 
-
F
 
-
P
 
P
W
 
G
Q
 
S
T
 
S
W
 
D
W
 
E
R
 
A
Q
 
L
W
 
S
S
 
E
E
 
I
Q
 
L
D
 
R
Q
 
R
Q
 
V
A
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
L
D
 
E
L
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
S
L
 
W
L
 
L
D
 
G
R
 
E
S
 
G
L
 
G
A
 
R
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
E
F
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
A
A
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
S
T
 
Q
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
A
D
 
E
L
 
M
R
 
M
E
 
R
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
T
 
T
I
 
V
V
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
R
L
 
L
N
 
R
Q
 
G
A
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
A
 
-
D
 
Q
H
 
Q
L
 
I
V
 
I
M
 
V
M
 
M
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
H
A
 
A
K
 
E
V
 
L
F
 
L
T
 
A
R
 
R
D
 
Q
N
 
G

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
33% identity, 84% coverage: 13:237/267 of query aligns to 11:232/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
E
 
E
Q
 
S
Q
 
T
I
x
R
L
 
L
N
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
G
D
 
E
I
 
V
P
 
R
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
I
T
 
L
A
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
A
V
 
R
L
 
M
A
 
A
H
 
G
M
 
M
L
 
-
R
 
T
P
 
S
S
 
G
A
 
K
G
 
G
D
 
S
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
S
 
A
G
 
G
K
 
Q
R
 
P
L
 
L
G
 
E
Q
 
A
Y
 
W
S
 
S
R
 
A
R
 
T
T
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
H
 
H
L
 
R
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
|
Q
R
 
Q
T
 
Q
T
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
A
W
 
T
Q
 
P
T
 
V
W
 
W
-
 
H
W
 
Y
R
 
L
Q
 
T
W
 
L
S
 
H
E
 
Q
Q
 
H
D
 
D
Q
 
K
Q
 
T
A
 
R
I
 
T
D
 
E
R
 
L
A
 
L
I
 
N
D
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
K
L
 
L
D
 
G
R
|
R
S
 
S
L
 
T
A
 
N
T
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
E
L
 
W
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
T
 
V
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
T
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
M
T
 
C
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
S
T
 
A
L
 
L
L
 
D
E
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
R
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
Q
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
A
 
A
D
 
H
H
 
R
L
 
A
V
 
W
M
 
L
M
 
L
R
 
K
E
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
R
P
 
R
A
 
E
K
 
E
V
 
V
F
 
L
T
 
T
R
 
P
D
 
P
N
 
N
L
 
L
K
 
A
A
 
Q
V
 
A
F
 
Y
D
 
G
L
 
M
D
 
N

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
33% identity, 84% coverage: 13:236/267 of query aligns to 11:231/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
E
 
E
Q
 
S
Q
 
T
I
 
R
L
 
L
N
 
G
G
 
P
V
 
L
S
 
S
L
 
G
D
 
E
I
 
V
P
 
R
E
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
I
T
 
L
A
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
A
V
 
R
L
 
M
A
 
A
H
 
G
M
 
M
L
 
T
R
 
S
P
 
-
S
 
G
A
 
K
G
 
G
D
 
S
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
S
 
A
G
 
G
K
 
Q
R
 
P
L
 
L
G
 
E
Q
 
A
Y
 
W
S
 
S
R
 
A
R
 
T
T
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
H
 
H
L
 
R
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
Q
T
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
A
W
 
T
Q
 
P
T
 
V
W
 
W
-
 
H
W
 
Y
R
 
L
Q
 
T
W
 
L
S
 
H
E
 
Q
Q
 
H
D
 
D
Q
 
K
Q
 
T
A
 
R
I
 
T
D
 
E
R
 
L
A
 
L
I
 
N
D
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
K
L
 
L
D
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
T
A
 
N
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
L
 
W
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
T
 
V
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
T
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
M
T
 
N
F
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
S
T
 
A
L
 
L
L
 
D
E
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
R
 
C
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
Q
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
A
 
A
D
 
H
H
 
R
L
 
A
V
 
W
M
 
L
M
 
L
R
 
K
E
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
R
P
 
R
A
 
E
K
 
E
V
 
V
F
 
L
T
 
T
R
 
P
D
 
P
N
 
N
L
 
L
K
 
A
A
 
Q
V
 
A
F
 
Y
D
 
G
L
 
M

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 12:221/267 of query aligns to 14:224/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
G
 
G
E
 
S
Q
 
R
Q
 
A
I
 
I
L
 
F
N
 
D
G
 
N
V
 
I
S
 
D
L
 
V
D
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
R
G
 
G
R
 
K
F
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
I
I
 
M
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
A
H
 
S
M
 
Q
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
V
Q
 
W
L
 
V
S
 
N
G
 
G
K
 
Q
R
 
N
L
 
L
G
 
P
Q
 
Q
Y
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
G
T
 
D
L
 
L
A
 
F
-
 
D
-
 
M
-
 
R
Q
 
K
H
 
Q
L
 
F
A