SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1851 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1851 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7o4tD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme with coenzyme a bound at the hydratase, thiolase active sites and possible additional binding site (coa(ech/had)) (see paper)
58% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:403/403 of 7o4tD

query
sites
7o4tD
M
 
M
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
|
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
|
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
x
R
P
 
P
A
 
D
T
|
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
|
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
|
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
x
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
|
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

O53871 Putative acyltransferase Rv0859; EC 2.3.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
58% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:403/403 of O53871

query
sites
O53871
M
 
M
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
x
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8opyD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-b-dnq
59% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:401/401 of 8opyD

query
sites
8opyD
M
 
M
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
-
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
|
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
x
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
|
E
R
 
R
L
 
V

8opuC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with sulfamethoxazole (fragment-b-e1)
59% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:399/399 of 8opuC

query
sites
8opuC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
|
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
x
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
|
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8oqmD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-10
59% identity, 100% coverage: 1:402/402 of query aligns to 1:399/399 of 8oqmD

query
sites
8oqmD
M
 
M
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
-
M
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
x
A
K
x
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
|
R
L
 
V

8pf8C Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-72
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:402/402 of 8pf8C

query
sites
8pf8C
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
x
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
x
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8oqsC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-83
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:402/402 of 8oqsC

query
sites
8oqsC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
|
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
x
F
V
|
V
P
 
P
Q
|
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
|
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8oqpC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-76
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:402/402 of 8oqpC

query
sites
8oqpC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
x
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
x
T
P
 
P
R
|
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
|
R
R
|
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

4b3iC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fatty acid beta-oxidation complex with coenzymea bound at the hydratase active sites (see paper)
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:402/402 of 4b3iC

query
sites
4b3iC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
|
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
L
G
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
x
H
Q
x
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
|
C
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8opxC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with trehalose (fragment-b-tre)
59% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:398/398 of 8opxC

query
sites
8opxC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
x
D
L
 
V
Q
x
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
-
A
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
|
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8oqlC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:397/397 of 8oqlC

query
sites
8oqlC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
x
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
x
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
G
M
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
x
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
|
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

8oqoC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49
58% identity, 100% coverage: 2:402/402 of query aligns to 1:398/398 of 8oqoC

query
sites
8oqoC
S
 
S
Q
 
E
A
 
E
V
 
A
F
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
S
L
 
L
Y
 
H
S
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
M
 
L
A
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
D
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
K
R
 
R
Y
 
H
-
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
S
 
N
R
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
V
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
M
D
 
P
E
 
V
S
 
T
V
 
S
P
 
G
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
W
 
M
I
 
G
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
A
 
N
F
 
Y
K
 
D
L
 
V
Q
 
M
S
 
F
V
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
x
T
L
 
I
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
E
A
 
A
R
 
W
D
 
S
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
A
R
 
K
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
D
L
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
L
E
 
D
R
 
H
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
M
K
 
R
P
 
P
A
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
E
A
 
-
M
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
P
 
H
Q
 
W
V
|
V
A
x
E
R
x
K
I
 
I
E
 
N
P
 
H
I
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
L
T
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
G
Q
 
K
Q
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
T
L
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
T
K
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Q
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
F
 
F
M
 
Q
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
N
I
 
I
S
 
P
P
 
D
E
 
E
I
 
K
T
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
N
L
 
A
K
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

6pccA Crystal structure of beta-ketoadipyl-coa thiolase mutant (h356a) in complex hexanoyl coenzyme a (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:402/402 of query aligns to 7:403/403 of 6pccA

query
sites
6pccA
V
 
V
F
 
F
I
 
I
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
-
G
 
-
K
 
I
G
 
G
K
 
R
K
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
R
P
 
A
V
 
D
H
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
V
L
 
P
L
 
L
T
 
K
E
 
A
L
 
L
Q
 
I
Q
 
E
R
 
R
Y
 
N
D
 
P
-
 
G
L
 
V
D
 
Q
T
 
W
S
 
D
R
 
Q
V
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
V
 
F
L
 
F
G
 
G
C
 
C
G
 
A
Q
x
N
P
 
Q
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
D
G
 
N
G
 
R
D
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
R
C
 
M
V
 
A
V
 
L
Q
 
L
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
L
D
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
L
C
|
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
V
N
 
G
Q
 
T
A
 
A
A
 
F
S
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
E
E
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
A
P
 
P
-
 
F
-
 
V
M
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
E
Q
 
S
A
 
A
W
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
M
-
 
K
I
 
L
Q
 
E
D
 
D
P
x
T
E
 
T
I
|
I
A
x
G
F
 
W
K
x
R
L
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
Q
 
D
S
 
S
V
 
M
P
 
P
Q
 
E
G
 
T
I
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
D
D
 
Y
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
A
D
 
D
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
A
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
D
 
A
R
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
-
 
I
-
 
A
D
 
H
L
 
K
N
 
K
G
 
G
L
 
E
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
E
R
 
R
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
L
K
x
R
P
 
P
A
 
E
T
|
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
N
R
 
G
I
 
P
E
 
D
P
 
K
I
 
T
H
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
V
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
M
L
 
I
L
 
L
G
 
A
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
V
Q
 
K
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
G
T
 
M
A
 
A
V
 
S
L
 
G
S
 
G
T
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
R
L
 
V
M
 
M
L
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
V
K
 
R
K
 
K
A
 
L
L
 
T
A
 
E
K
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
 
D
I
 
F
D
 
D
L
 
V
F
 
I
E
 
E
I
 
L
N
|
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
S
 
S
V
 
Q
V
 
G
L
 
L
R
 
A
F
 
V
M
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
D
 
D
I
 
D
S
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
-
N
 
N
V
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
x
A
P
 
P
I
x
L
G
 
G
A
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
D
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
S
N
 
G
L
 
G
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
M
C
|
C
V
 
V
G
|
G
G
 
V
G
 
G
M
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

6pcbA Crystal structure of beta-ketoadipyl-coa thiolase mutant (h356a) in complex with coa (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:402/402 of query aligns to 7:403/403 of 6pcbA

query
sites
6pcbA
V
 
V
F
 
F
I
 
I
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
-
G
 
-
K
 
I
G
 
G
K
 
R
K
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
R
P
 
A
V
 
D
H
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
V
L
 
P
L
 
L
T
 
K
E
 
A
L
 
L
Q
 
I
Q
 
E
R
 
R
Y
 
N
D
 
P
-
 
G
L
 
V
D
 
Q
T
 
W
S
 
D
R
 
Q
V
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
V
 
F
L
 
F
G
 
G
C
 
C
G
 
A
Q
 
N
P
 
Q
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
D
G
 
N
G
 
R
D
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
R
C
 
M
V
 
A
V
 
L
Q
 
L
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
L
D
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
L
C
|
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
V
N
 
G
Q
 
T
A
 
A
A
 
F
S
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
E
E
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
A
P
 
P
-
 
F
-
 
V
M
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
E
Q
 
S
A
 
A
W
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
M
-
 
K
I
 
L
Q
 
E
D
 
D
P
 
T
E
 
T
I
|
I
A
 
G
F
 
W
K
 
R
L
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
Q
 
D
S
 
S
V
 
M
P
 
P
Q
 
E
G
 
T
I
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
D
D
 
Y
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
A
D
 
D
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
A
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
D
 
A
R
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
-
 
I
-
 
A
D
 
H
L
 
K
N
 
K
G
 
G
L
 
E
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
E
R
 
R
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
L
K
x
R
P
 
P
A
 
E
T
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
N
R
 
G
I
 
P
E
 
D
P
 
K
I
 
T
H
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
|
G
I
 
V
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
M
L
 
I
L
 
L
G
 
A
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
V
Q
 
K
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
G
T
 
M
A
 
A
V
 
S
L
 
G
S
 
G
T
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
R
L
 
V
M
 
M
L
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
V
K
 
R
K
 
K
A
 
L
L
 
T
A
 
E
K
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
 
D
I
 
F
D
 
D
L
 
V
F
 
I
E
 
E
I
 
L
N
|
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
S
 
S
V
 
Q
V
 
G
L
 
L
R
 
A
F
 
V
M
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
D
 
D
I
 
D
S
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
-
N
 
N
V
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
x
A
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
D
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
S
N
 
G
L
 
G
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
M
C
|
C
V
 
V
G
|
G
G
 
V
G
 
G
M
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

6pcdA Crystal structure of beta-ketoadipyl-coa thiolase mutant (c90s-h356a) in complex octanoyl coenzyme a (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:402/402 of query aligns to 8:401/401 of 6pcdA

query
sites
6pcdA
V
 
V
F
 
F
I
 
I
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
-
G
 
-
K
 
I
G
 
G
K
 
R
K
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
R
P
 
A
V
 
D
H
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
V
L
 
P
L
 
L
T
 
K
E
 
A
L
 
L
Q
 
I
Q
 
E
R
 
R
Y
 
N
D
 
P
-
 
G
L
 
V
D
 
Q
T
 
W
S
 
D
R
 
Q
V
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
V
V
 
F
L
 
F
G
 
G
C
 
C
G
 
A
Q
x
N
P
 
Q
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
D
G
 
N
G
 
R
D
 
N
V
 
V
A
 
A
K
 
R
C
 
M
V
 
A
V
 
L
Q
 
L
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
W
 
L
D
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
L
C
x
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
V
N
 
G
Q
 
T
A
 
A
A
 
F
S
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
E
E
 
M
D
 
E
L
 
L
I
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
A
P
 
P
-
 
F
-
 
V
M
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
E
Q
 
S
A
 
A
W
 
Y
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
M
-
 
K
I
 
L
Q
 
E
D
 
D
P
x
T
E
x
T
I
|
I
A
x
G
F
 
W
K
x
R
L
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
Q
 
D
S
 
S
V
x
M
P
 
P
Q
 
E
G
 
T
I
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
D
D
 
Y
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
A
D
 
D
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
R
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
A
 
A
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
A
S
 
A
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
D
 
A
R
 
E
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
I
L
 
A
N
 
H
G
 
E
L
 
I
V
 
I
V
 
V
L
 
-
E
 
E
R
 
R
D
 
D
E
 
E
F
 
H
I
 
L
K
x
R
P
 
P
A
 
E
T
|
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
N
R
 
G
I
 
P
E
 
D
P
 
K
I
 
T
H
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
|
G
I
 
V
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
M
L
 
I
L
 
L
G
 
A
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
A
G
 
V
Q
 
K
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
G
T
 
M
A
 
A
V
 
S
L
 
G
S
 
G
T
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
R
L
 
V
M
 
M
L
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
V
K
 
R
K
 
K
A
 
L
L
 
T
A
 
E
K
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
 
D
I
 
F
D
 
D
L
 
V
F
 
I
E
 
E
I
 
L
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
Q
V
 
G
L
 
L
R
 
A
F
 
V
M
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
D
 
D
I
 
D
S
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
-
N
 
N
V
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
x
A
P
 
P
I
x
L
G
 
G
A
 
M
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
D
 
H
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
S
N
 
G
L
 
G
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
M
C
|
C
V
 
V
G
|
G
G
 
V
G
 
G
M
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
V

Q9BWD1 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic; Acetyl-CoA transferase-like protein; Cytosolic acetoacetyl-CoA thiolase; EC 2.3.1.9 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
36% identity, 100% coverage: 2:401/402 of query aligns to 5:396/397 of Q9BWD1

query
sites
Q9BWD1
S
 
S
Q
 
D
A
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
I
Y
 
V
D
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
I
R
 
-
G
 
-
K
 
I
G
 
G
K
 
S
K
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
V
 
V
K
 
P
P
 
V
V
 
Q
H
 
D
M
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
V
Q
 
L
Q
 
K
R
 
R
Y
 
A
D
 
T
L
 
V
D
 
A
T
 
P
S
 
E
R
 
D
V
 
V
D
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
F
G
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
-
 
N
P
 
P
V
 
V
G
 
R
E
 
Q
Q
 
A
G
 
S
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
V
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
P
E
 
Y
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
A
V
 
W
Q
 
S
I
 
C
D
 
Q
R
 
M
F
 
I
C
 
C
A
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
K
A
 
A
V
 
V
N
 
C
Q
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
Q
R
 
S
I
 
I
A
 
G
S
 
I
G
 
G
W
 
D
E
 
S
D
 
S
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
A
P
 
P
M
 
H
G
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
L
Q
 
R
A
 
T
W
 
G
I
 
V
Q
 
K
D
 
I
P
 
G
E
 
E
I
 
M
A
 
P
F
 
L
K
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
A
L
 
F
Q
 
H
S
 
N
V
 
C
P
 
H
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
K
D
 
W
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
Q
D
 
D
R
 
K
F
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
R
A
 
T
A
 
E
H
 
N
A
 
A
R
 
Q
D
 
K
S
 
A
G
 
G
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
-
 
V
R
 
S
D
 
T
L
 
R
N
x
K
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
E
L
 
V
E
 
K
R
 
T
D
 
D
E
 
E
F
 
F
I
 
P
K
x
R
P
 
H
A
 
G
T
x
S
T
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
Y
F
 
F
A
 
L
A
 
T
M
 
D
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
T
A
 
G
R
 
T
I
 
V
E
 
T
P
 
P
I
 
-
H
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
I
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
V
L
 
L
G
 
M
S
 
K
E
 
K
R
 
S
I
 
E
G
 
A
Q
 
D
Q
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
S
T
 
W
A
 
S
V
 
Q
L
 
V
S
 
G
T
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
M
 
M
L
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
I
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
W
S
 
S
V
 
L
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
S
L
 
A
R
 
A
F
 
I
M
 
V
R
 
K
D
 
E
L
 
L
D
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
K
T
 
V
N
 
N
V
 
I
N
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
C
M
 
R
L
 
I
V
 
L
G
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
T
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
M
N
 
G
L
 
R
K
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
V
I
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
M
I
 
C
I
 
V
E
 
Q
R
 
R

1wl4A Human cytosolic acetoacetyl-coa thiolase complexed with coa (see paper)
36% identity, 100% coverage: 2:401/402 of query aligns to 2:393/394 of 1wl4A

query
sites
1wl4A
S
 
S
Q
 
D
A
 
P
V
 
V
F
 
V
I
 
I
Y
 
V
D
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
I
R
 
-
G
 
-
K
 
I
G
 
G
K
 
S
K
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
V
 
V
K
 
P
P
 
V
V
 
Q
H
 
D
M
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
V
Q
 
L
Q
 
K
R
 
R
Y
 
A
D
 
T
L
 
V
D
 
A
T
 
P
S
 
E
R
 
D
V
 
V
D
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
F
G
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
P
 
N
V
 
P
G
 
V
E
 
R
Q
 
Q
G
 
A
G
 
S
D
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
Q
 
V
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
I
D
 
P
E
 
Y
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
A
V
 
W
Q
 
S
I
 
C
D
 
Q
R
 
M
F
 
I
C
|
C
A
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
K
A
 
A
V
 
V
N
 
C
Q
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
Q
R
 
S
I
 
I
A
 
G
S
 
I
G
 
G
W
 
D
E
 
S
D
 
S
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
A
P
 
P
M
 
H
G
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
L
Q
 
R
A
 
T
W
 
G
I
 
V
Q
 
K
D
 
I
P
 
G
E
 
E
I
 
M
A
 
P
F
 
L
K
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
G
-
x
L
-
 
T
-
 
D
-
 
A
L
 
F
Q
 
H
S
 
N
V
 
C
P
 
H
Q
x
M
G
 
G
I
 
I
G
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
K
D
 
W
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
Q
D
 
D
R
 
K
F
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
R
A
 
T
A
 
E
H
 
N
A
 
A
R
 
Q
D
 
K
S
 
A
G
 
G
Y
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
K
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
-
 
V
R
 
S
D
 
T
L
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
E
L
 
V
E
 
K
R
 
T
D
 
D
E
 
E
F
 
F
I
 
P
K
x
R
P
 
H
A
 
G
T
 
S
T
 
N
L
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
M
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
x
Y
F
 
F
A
 
L
A
 
T
M
 
D
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
T
A
 
G
R
 
T
I
 
V
E
 
T
P
|
P
I
 
-
H
 
-
T
 
-
A
 
-
G
x
A
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
I
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
V
L
 
L
G
 
M
S
 
K
E
 
K
R
 
S
I
 
E
G
 
A
Q
 
D
Q
 
K
L
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
T
P
 
P
R
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
S
T
 
W
A
 
S
V
 
Q
L
 
V
S
 
G
T
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
M
 
M
L
 
G
A
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
I
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
W
S
 
S
V
 
L
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
S
L
 
A
R
 
A
F
 
I
M
 
V
R
 
K
D
 
E
L
 
L
D
 
G
I
 
L
S
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
K
T
 
V
N
 
N
V
 
I
N
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
C
M
 
R
L
 
I
V
 
L
G
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
H
E
 
T
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
M
N
 
G
L
 
R
K
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
V
I
 
A
A
 
A
L
 
L
C
|
C
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
A
T
 
M
I
 
C
I
 
V
E
 
Q
R
 
R

2vu1A Biosynthetic thiolase from z. Ramigera. Complex of with o-pantheteine- 11-pivalate. (see paper)
36% identity, 99% coverage: 4:402/402 of query aligns to 3:391/391 of 2vu1A

query
sites
2vu1A
A
 
S
V
 
I
F
 
V
I
 
I
Y
 
A
D
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
-
R
 
-
G
 
A
K
 
V
G
 
G
K
 
S
K
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
A
S
 
N
V
 
T
K
 
P
P
 
A
V
 
H
H
 
E
M
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
S
E
 
A
L
 
V
Q
 
L
Q
 
E
R
 
R
Y
 
A
D
 
G
L
 
V
D
 
A
T
 
A
S
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
N
D
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
Q
G
 
V
Q
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
G
 
Q
D
 
N
V
 
P
A
 
A
K
 
R
C
 
Q
V
 
A
V
 
A
Q
 
M
Y
 
K
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
P
E
 
Q
S
 
E
V
 
A
P
 
T
G
 
A
V
 
W
Q
 
G
I
 
M
D
 
N
R
 
Q
F
 
L
C
|
C
A
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
A
Q
 
L
A
 
G
A
 
M
S
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
W
 
D
E
 
A
D
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
L
 
A
P
 
P
M
 
H
G
 
C
A
 
A
A
 
H
G
 
L
Q
 
R
A
 
G
W
 
G
I
 
V
Q
 
K
D
 
M
P
 
G
E
 
D
I
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
K
L
 
M
Q
 
-
S
 
-
V
 
I
P
 
D
Q
 
T
G
 
M
I
 
I
G
 
K
A
 
D
D
 
G
L
 
L
L
 
T
A
 
D
A
 
A
L
 
F
D
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
-
x
H
-
 
M
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
E
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
K
S
 
D
G
 
G
Y
 
R
F
 
F
D
 
K
R
 
D
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
-
 
F
-
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
G
L
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
D
V
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
K
 
R
P
 
H
A
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
P
S
 
A
F
|
F
A
 
D
A
 
K
M
 
E
G
 
G
K
 
T
L
 
V
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
M
S
 
S
E
 
E
R
 
A
I
 
E
G
 
A
Q
 
S
Q
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
S
T
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
G
T
 
V
E
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
V
M
 
M
L
 
G
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
S
K
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
Q
 
G
D
 
D
I
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
S
 
A
V
 
Q
V
 
A
L
 
C
R
 
A
F
 
V
M
 
N
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
G
I
 
W
S
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
T
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
I
V
 
L
G
 
N
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
A
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
L
C
|
C
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
M
I
 
C
I
 
I
E
 
E
R
 
S
L
 
L

2vu2A Biosynthetic thiolase from z. Ramigera. Complex with s-pantetheine-11- pivalate. (see paper)
36% identity, 99% coverage: 4:402/402 of query aligns to 1:389/389 of 2vu2A

query
sites
2vu2A
A
 
S
V
 
I
F
 
V
I
 
I
Y
 
A
D
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
A
R
 
-
G
 
-
K
 
V
G
 
G
K
 
S
K
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
A
S
 
N
V
 
T
K
 
P
P
 
A
V
 
H
H
 
E
M
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
S
E
 
A
L
 
V
Q
 
L
Q
 
E
R
 
R
Y
 
A
D
 
G
L
 
V
D
 
A
T
 
A
S
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
N
D
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
Q
G
 
V
Q
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
G
 
Q
D
 
N
V
 
P
A
 
A
K
 
R
C
 
Q
V
 
A
V
 
A
Q
 
M
Y
 
K
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
P
E
 
Q
S
 
E
V
 
A
P
 
T
G
 
A
V
 
W
Q
 
G
I
 
M
D
 
N
R
 
Q
F
 
L
C
|
C
A
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
A
Q
 
L
A
 
G
A
 
M
S
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
W
 
D
E
 
A
D
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
L
 
A
P
 
P
M
 
H
G
 
C
A
 
A
A
 
H
G
 
L
Q
 
R
A
 
G
W
 
G
I
 
V
Q
 
K
D
 
M
P
 
G
E
 
D
I
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
K
L
 
M
Q
 
-
S
 
-
V
 
I
P
 
D
Q
 
T
G
 
M
I
 
I
G
 
K
A
 
D
D
 
G
L
 
L
L
 
T
A
 
D
A
 
A
L
 
F
D
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
-
x
H
-
x
M
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
E
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
K
S
 
D
G
 
G
Y
 
R
F
 
F
D
 
K
R
 
D
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
-
 
F
-
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
G
L
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
D
V
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
K
 
R
P
 
H
A
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
P
S
 
A
F
|
F
A
 
D
A
 
K
M
 
E
G
 
G
K
 
T
L
 
V
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
|
G
I
 
L
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
M
S
 
S
E
 
E
R
 
A
I
 
E
G
 
A
Q
 
S
Q
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
S
T
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
G
T
 
V
E
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
V
M
 
M
L
 
G
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
S
K
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
Q
 
G
D
 
D
I
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
A
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
S
 
A
V
 
Q
V
 
A
L
 
C
R
 
A
F
 
V
M
 
N
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
G
I
 
W
S
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
T
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
I
V
 
L
G
 
N
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
A
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
L
C
|
C
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
M
I
 
C
I
 
I
E
 
E
R
 
S
L
 
L

1dm3A Acetylated biosynthetic thiolase from zoogloea ramigera in complex with acetyl-coa (see paper)
36% identity, 99% coverage: 4:402/402 of query aligns to 1:389/389 of 1dm3A

query
sites
1dm3A
A
 
S
V
 
I
F
 
V
I
 
I
Y
 
A
D
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
T
 
T
P
 
A
R
 
-
G
 
-
K
 
V
G
 
G
K
 
S
K
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
Y
 
A
S
 
N
V
 
T
K
 
P
P
 
A
V
 
H
H
 
E
M
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
S
E
 
A
L
 
V
Q
 
L
Q
 
E
R
 
R
Y
 
A
D
 
G
L
 
V
D
 
A
T
 
A
S
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
N
D
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
C
 
Q
G
 
V
Q
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
G
G
 
Q
D
 
N
V
 
P
A
 
A
K
 
R
C
 
Q
V
 
A
V
 
A
Q
 
M
Y
 
K
A
 
A
G
 
G
W
 
V
D
 
P
E
 
Q
S
 
E
V
 
A
P
 
T
G
 
A
V
 
W
Q
 
G
I
 
M
D
 
N
R
 
Q
F
 
L
C
|
C
A
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
A
Q
 
L
A
 
G
A
 
M
S
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
W
 
D
E
 
A
D
 
S
L
 
I
I
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
L
 
A
P
 
P
M
 
H
G
 
C
A
 
A
A
 
H
G
 
L
Q
 
R
A
 
G
W
 
G
I
 
V
Q
 
K
D
 
M
P
 
G
E
 
D
I
 
-
A
 
-
F
 
F
K
 
K
L
 
M
Q
 
-
S
 
-
V
 
I
P
 
D
Q
 
T
G
 
M
I
 
I
G
 
K
A
 
D
D
 
G
L
|
L
L
 
T
A
 
D
A
 
A
L
 
F
D
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
-
x
H
-
x
M
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
E
V
 
Q
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
H
 
A
A
 
A
R
 
Q
D
 
K
S
 
D
G
 
G
Y
 
R
F
 
F
D
 
K
R
 
D
S
 
E
V
 
I
V
 
V
P
 
P
-
 
F
-
 
I
V
 
V
R
 
K
D
 
G
L
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
D
V
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
K
x
R
P
 
H
A
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
x
S
L
x
M
S
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
R
P
 
P
S
 
A
F
 
F
A
 
D
A
 
K
M
 
E
G
 
G
K
 
T
L
 
V
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
V
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
M
S
 
S
E
 
E
R
 
A
I
 
E
G
 
A
Q
 
S
Q
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
S
T
 
W
A
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
G
T
 
V
E
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
V
M
|
M
L
 
G
A
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
S
K
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
Q
 
G
D
 
D
I
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
V
E
 
E
I
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
S
 
A
V
 
Q
V
 
A
L
 
C
R
 
A
F
 
V
M
 
N
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
G
I
 
W
S
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
T
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
M
 
R
L
 
I
V
 
L
G
 
N
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
A
K
 
R
R
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
T
L
 
L
C
|
C
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
M
I
 
C
I
 
I
E
 
E
R
 
S
L
 
L

Query Sequence

>Pf6N2E2_1851 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1851
MSQAVFIYDAVRTPRGKGKKDGALYSVKPVHMAAGLLTELQQRYDLDTSRVDDVVLGCGQ
PVGEQGGDVAKCVVQYAGWDESVPGVQIDRFCASGLEAVNQAASRIASGWEDLIVAGGVE
SMSRLPMGAAGQAWIQDPEIAFKLQSVPQGIGADLLAALDGYSREDVDRFALVSQQRAAH
ARDSGYFDRSVVPVRDLNGLVVLERDEFIKPATTLEALSQLKPSFAAMGKLGYSDVALRK
YPQVARIEPIHTAGNSSGIVDGASATLLGSERIGQQLGLAPRGRIIATAVLSTEPTLMLA
GPGPAAKKALAKAGLSVQDIDLFEINEAFASVVLRFMRDLDISPEITNVNGGAIALGHPI
GATGAMLVGTVLDELERRNLKRGLIALCVGGGMGIATIIERL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory