SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_1930 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1930 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 4 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9Y7Q9 Probable metabolite transporter C2H8.02 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
26% identity, 47% coverage: 6:218/456 of query aligns to 35:256/583 of Q9Y7Q9

query
sites
Q9Y7Q9
T
 
T
T
 
K
S
 
K
S
 
E
R
 
A
R
 
K
S
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
I
G
 
A
A
 
G
I
 
T
G
 
G
N
 
F
F
 
L
G
 
L
E
 
D
I
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
A
 
F
V
 
I
F
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
V
I
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
Y
H
 
L
F
 
Y
F
 
W
P
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
H
S
 
Q
D
 
D
R
 
Y
T
 
P
A
 
S
A
 
G
L
 
I
L
 
R
S
 
G
T
 
V
F
 
-
A
 
-
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
V
 
A
A
 
T
F
 
N
V
 
I
A
 
G
R
 
N
P
 
I
L
 
M
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
K
R
 
F
V
 
V
M
 
Y
A
 
G
M
 
K
T
 
E
V
 
M
W
 
M
L
 
V
M
 
V
A
 
I
L
 
I
G
 
A
T
 
T
A
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
I
L
 
C
L
 
L
P
 
P
T
 
D
Y
 
R
A
 
I
T
 
P
I
 
T
G
 
P
I
 
T
A
 
A
A
 
K
P
 
M
L
 
M
L
 
W
L
 
L
L
 
F
L
 
A
C
 
F
R
 
R
I
 
V
A
 
M
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
Y
T
 
P
G
 
M
S
 
S
T
 
A
S
 
S
Y
 
I
I
 
T
V
 
S
E
 
E
S
 
Q
A
 
S
P
 
L
E
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
W
 
L
L
 
L
G
 
A
F
 
W
T
 
-
L
 
-
I
 
I
F
 
F
S
 
S
H
 
N
L
 
Q
P
 
G
N
 
W
A
 
G
V
 
T
V
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
C
V
 
V
V
 
A
A
 
T
L
 
L
Q
 
I
L
 
I
G
 
L
A
 
A
-
 
C
-
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
R
G
 
G
D
 
E
Q
 
Y
A
 
T
Y
 
K
S
 
L
D
 
N
W
 
G
A
 
V
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
L
 
I
G
 
A
G
 
L
I
 
F
I
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
V
F
 
L
W
 
I
L
 
P
R
 
R
R
 
L
N
 
R
I
 
M
D
 
Q
E
 
E
P
 
S
E
 
E
E
 
Q
Y
 
F
K
 
K
Q
 
N
A
 
S
R
 
K
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

8fvzA Pipt y150a
26% identity, 90% coverage: 18:427/456 of query aligns to 11:421/433 of 8fvzA

query
sites
8fvzA
I
 
V
G
 
G
N
 
F
F
 
F
G
 
L
E
 
D
I
 
A
Y
 
Y
D
 
D
F
 
L
A
 
F
V
 
I
F
 
I
G
 
N
F
 
Q
S
 
V
I
 
A
P
 
P
I
 
M
L
 
L
S
 
A
V
 
Q
H
 
V
F
 
Y
F
 
F
P
 
P
G
 
K
S
 
T
D
 
G
R
 
L
T
 
P
A
 
A
A
 
Q
L
 
R
L
 
Q
S
 
D
T
 
L
F
 
-
A
 
-
V
 
M
Y
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
A
F
 
N
V
 
I
A
 
G
R
 
C
P
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
L
 
V
M
 
M
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
K
R
 
F
V
 
V
M
 
Y
A
 
G
M
 
K
T
 
E
V
 
L
W
 
I
L
 
L
M
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
T
 
T
A
 
I
I
 
F
I
 
Q
G
 
M
L
 
S
L
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
 
H
A
 
W
T
 
D
I
 
-
G
 
G
I
 
N
A
 
R
A
 
V
P
 
L
L
 
T
L
 
W
L
 
I
L
 
T
L
 
I
C
 
C
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
A
T
 
P
G
 
M
S
 
S
T
 
A
S
 
T
Y
 
V
I
 
V
V
 
S
E
 
D
S
 
R
A
 
A
P
 
N
E
 
I
N
 
H
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
T
W
 
L
L
 
L
G
 
C
F
 
F
T
 
-
L
 
-
I
 
I
F
|
F
S
 
A
H
 
N
L
 
Q
P
 
G
N
 
W
A
 
G
V
 
S
V
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
S
V
 
L
V
 
V
A
 
T
L
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
H
Q
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
S
G
 
G
D
 
H
Q
 
T
A
 
H
Y
 
D
S
 
V
D
 
D
W
 
K
A
 
A
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
-
F
 
-
L
 
L
L
 
I
G
 
G
-
 
L
G
 
S
I
 
L
I
 
I
G
 
P
V
 
A
V
 
F
G
 
G
F
 
T
W
 
L
L
 
Y
R
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
T
D
 
G
E
 
V
P
 
I
E
 
A
E
 
S
Y
 
K
K
 
K
Q
 
A
A
 
H
R
 
W
Q
 
Q
A
 
E
S
 
F
K
 
V
A
 
A
S
 
Y
K
 
F
I
 
S
K
 
T
K
 
W
N
 
N
P
 
H
L
 
F
I
 
R
A
 
N
A
 
L
I
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
G
G
 
S
M
 
M
L
 
L
H
 
G
V
x
W
F
 
F
M
 
L
V
 
V
Q
x
D
P
 
I
V
 
A
F
 
F
S
 
-
V
x
Y
G
 
G
A
 
I
Y
 
N
L
 
L
L
 
N
L
 
Q
G
 
S
F
 
V
M
 
V
Y
 
L
T
 
A
F
 
Q
L
 
I
I
 
G
E
 
F
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
-
 
G
D
 
D
S
 
V
T
 
Y
S
 
D
A
 
K
L
 
L
I
 
F
S
 
Q
N
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
V
 
N
I
 
I
V
 
I
L
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
F
L
 
L
G
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
-
 
L
L
 
F
L
 
L
S
 
I
D
 
D
R
 
I
F
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
R
 
K
V
 
L
L
 
Q
T
 
F
F
 
M
G
 
G
-
 
F
-
 
I
-
 
M
-
 
S
A
 
G
A
 
L
W
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
L
A
 
A
Y
 
G
P
 
E
A
 
I
M
 
D
Y
 
H
L
 
I
A
 
G
A
 
K
S
 
G
G
 
P
S
 
L
F
 
L
A
 
A
S
 
C
A
 
F
V
 
T
A
 
F
G
 
M
Q
 
Q
T
 
F
L
 
F
L
 
F
A
 
N
A
 
F
G
 
G
L
 
A
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
G
x
N
A
 
T
A
 
T
S
 
T
F
 
F
V
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
F
 
F
P
 
P
T
 
T
S
 
R
F
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
S
G
 
A
H
 
H
A
 
G
I
 
I
S
 
S
Y
 
A
Q
 
A
T
 
A
S
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
G
T
 
K
C
 
C
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
S
P
 
S
L
 
L
I
 
V
A
 
F
A
 
N
Y
 
Q
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
A
 
K
F
 
I
G
 
G
-
 
T
S
 
S
P
 
A
L
 
V
A
 
L
P
 
W
A
 
I
F
 
F
Y
 
F
V
 
S
T
 
T
L
 
C
I
 
I
A
 
-
V
 
-
L
 
L
C
 
G
L
 
F
I
 
I
T
 
S
T
 
T
Q
 
F
F
 
L
V
 
I
P
 
D
E
 
E
T
 
T
R
 
M
G
 
G
V
 
V
N
 
D

P25297 Inorganic phosphate transporter PHO84 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
24% identity, 45% coverage: 11:214/456 of query aligns to 64:277/587 of P25297

query
sites
P25297
R
 
K
S
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
I
G
 
A
A
 
G
I
 
V
G
 
G
N
 
F
F
 
L
G
 
T
E
 
D
I
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
I
A
 
F
V
 
A
F
 
I
G
 
N
F
 
L
S
 
G
I
 
I
P
 
T
I
 
M
L
 
M
S
 
S
V
 
Y
H
 
V
F
 
Y
F
 
W
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
M
P
 
P
G
 
G
S
 
P
D
 
S
R
 
Q
T
 
T
A
 
L
A
 
L
L
 
K
L
 
V
S
 
S
T
 
T
F
 
S
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
V
A
 
G
R
 
T
P
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
Q
L
 
F
M
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
I
L
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
K
R
 
R
V
 
I
M
 
Y
A
 
G
M
 
M
T
 
E
V
 
L
W
 
I
L
 
I
M
 
M
A
 
I
L
 
V
G
 
C
T
 
T
A
 
I
I
 
L
I
 
Q
G
 
T
L
 
T
L
 
V
P
 
A
T
 
H
Y
 
S
A
 
P
T
 
A
I
 
I
G
 
N
I
 
F
A
 
V
A
 
A
P
 
-
L
 
-
L
 
V
L
 
L
L
 
T
L
 
F
C
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
V
Q
 
M
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
T
 
Y
T
 
P
G
 
L
S
 
S
T
 
S
S
 
I
Y
 
I
I
 
T
V
 
S
E
 
E
S
 
F
A
 
A
P
 
T
E
 
T
N
 
K
R
 
W
R
 
R
G
 
G
Y
 
A
W
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
-
T
 
-
L
 
A
I
 
V
F
 
F
S
 
A
H
 
N
L
 
Q
P
 
A
N
 
W
A
 
G
V
 
Q
V
 
I
A
 
S
G
 
G
L
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
E
L
 
C
G
 
D
A
 
A
G
 
R
D
 
C
Q
 
Q
A
 
K
Y
 
A
S
 
C
D
 
D
W
 
Q
A
 
M
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
L
F
 
I
L
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
G
V
 
L
V
 
A
G
 
C
F
 
L
W
 
Y
L
 
F
R
 
R
R
 
L
N
 
T
I
 
I
D
 
P
E
 
E
P
 
S
E
 
P
E
 
R
Y
 
Y
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

P0AGF4 D-xylose-proton symporter; D-xylose transporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
23% identity, 95% coverage: 25:456/456 of query aligns to 26:490/491 of P0AGF4

query
sites
P0AGF4
Y
 
Y
D
 
D
F
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
S
F
 
G
S
 
T
I
 
V
P
 
E
I
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
T
H
 
V
F
 
F
F
 
V
P
 
A
G
 
P
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
S
T
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
G
F
 
F
A
 
C
V
 
V
Y
 
-
A
 
A
V
 
S
A
 
A
F
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
C
P
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
A
M
 
L
F
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
C
A
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
F
G
|
G
R
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
S
I
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
A
A
 
A
M
 
V
T
 
L
V
 
F
W
 
F
L
 
I
M
 
S
A
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
S
A
 
A
I
 
W
I
 
P
G
 
E
L
 
L
L
 
G
P
 
F
T
 
T
Y
 
S
A
 
I
T
 
N
I
 
P
G
 
D
I
 
N
A
 
T
A
 
V
P
 
P
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
F
L
 
V
L
 
I
C
 
Y
R
|
R
I
 
I
A
 
I
Q
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
L
E
 
A
T
 
S
T
 
M
G
 
L
S
 
S
T
 
P
S
 
M
Y
 
Y
I
 
I
V
 
A
E
|
E
S
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
A
N
 
H
R
 
I
R
|
R
G
 
G
Y
 
K
W
 
L
L
 
V
G
 
S
F
 
F
T
 
N
-
x
Q
-
 
F
-
 
A
L
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
P
 
L
N
 
V
A
 
Y
V
 
C
V
 
V
A
 
N
G
 
Y
L
 
F
V
 
I
V
 
A
A
 
R
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
S
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
A
 
S
Y
 
W
-
 
L
-
 
N
S
 
T
D
 
D
W
 
-
A
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
L
 
S
G
 
E
G
 
C
I
 
I
I
 
P
G
 
A
V
 
L
V
 
L
G
 
F
F
 
L
W
 
M
L
 
L
R
 
L
R
 
Y
N
 
T
I
 
V
D
 
P
E
 
E
P
 
S
E
 
P
E
 
R
Y
 
W
K
 
L
Q
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
G
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
Q
A
 
A
S
 
V
K
 
Q
I
 
E
K
 
I
K
 
K
N
 
H
P
 
S
L
 
L
I
 
D
A
 
H
A
 
G
I
 
R
R
 
K
C
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
R
R
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
V
G
 
G
M
 
V
L
 
I
H
 
V
V
 
I
F
 
G
M
 
V
V
 
M
Q
 
L
P
 
S
V
 
I
F
 
F
S
x
Q
-
x
Q
-
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
I
Y
x
N
L
 
V
L
 
V
L
 
L
G
x
Y
F
 
Y
M
 
A
Y
 
P
T
 
E
F
 
V
L
 
F
I
 
K
E
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
A
L
 
S
D
 
T
S
 
D
T
 
I
S
 
A
A
 
L
L
 
L
I
 
Q
S
 
T
N
 
I
A
 
I
I
 
V
A
 
G
V
 
V
I
 
I
V
x
N
L
 
L
S
 
T
A
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
I
L
 
M
L
 
T
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
|
G
R
|
R
K
 
K
R
 
P
V
 
L
L
 
Q
T
 
I
F
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
L
W
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
I
S
 
G
A
 
M
Y
 
F
P
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
T
A
 
A
M
 
F
Y
 
Y
L
 
T
A
 
Q
A
 
A
S
 
P
G
 
G
S
 
-
F
 
I
A
 
V
S
 
A
A
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
M
Q
 
L
T
 
F
L
 
Y
L
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
F
L
 
A
G
 
M
I
 
S
Y
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
C
F
x
W
V
 
V
A
 
L
A
 
L
A
 
S
E
|
E
F
 
I
F
 
F
P
 
P
T
 
N
S
 
A
F
 
I
R
|
R
A
 
G
T
 
K
G
 
A
H
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
A
Y
 
V
-
 
A
-
 
A
Q
|
Q
T
x
W
S
 
L
V
 
A
A
 
N
M
 
Y
F
 
F
-
 
V
G
 
S
G
 
W
T
 
T
C
 
F
P
 
P
L
 
M
I
 
M
A
 
D
-
 
K
-
 
N
A
 
S
Y
 
W
L
 
L
S
 
V
Q
 
A
A
 
H
F
 
F
G
 
H
S
 
N
P
 
G
L
 
F
A
 
S
P
 
Y
A
 
W
F
 
I
Y
 
Y
V
 
G
T
 
C
L
 
M
I
 
G
A
 
V
V
 
L
L
 
A
C
 
A
L
 
L
I
 
F
T
 
M
T
 
W
Q
 
K
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
K
T
 
T
S
 
L
N
 
E
K
 
E
A
 
L
S
 
E
E
 
A
L
 
L
P
 
W
Q
 
E
P
 
P
Q
 
E
K
 
T
A
 
K
M
 
K
R
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
T
S
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf6N2E2_1930 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_1930
MTKTKTTSSRRSLAAGAIGNFGEIYDFAVFGFSIPILSVHFFPGSDRTAALLSTFAVYAV
AFVARPLGGLMFGYLADRLGRIRVMAMTVWLMALGTAIIGLLPTYATIGIAAPLLLLLCR
IAQGLALGGETTGSTSYIVESAPENRRGYWLGFTLIFSHLPNAVVAGLVVALQLGAGDQA
YSDWAWRIPFLLGGIIGVVGFWLRRNIDEPEEYKQARQASKASKIKKNPLIAAIRCGGLR
GMLHVFMVQPVFSVGAYLLLGFMYTFLIEVGKLDSTSALISNAIAVIVLSALLPLGGLLS
DRFGRKRVLTFGAAWIALSAYPAMYLAASGSFASAVAGQTLLAAGLGIYGAASFVAAAEF
FPTSFRATGHAISYQTSVAMFGGTCPLIAAYLSQAFGSPLAPAFYVTLIAVLCLITTQFV
PETRGVNLRTSVGNKTSNKASELPQPQKAMRQELST

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory