SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_2276 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_2276 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

O23492 Inositol transporter 4; Myo-inositol-proton symporter INT4; Protein INOSITOL TRANSPORTER 4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 35% coverage: 75:224/432 of query aligns to 92:226/582 of O23492

query
sites
O23492
D
 
D
R
 
K
H
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
M
G
 
S
L
 
I
I
 
L
I
 
I
T
 
A
L
 
D
A
 
V
M
 
L
M
 
F
A
 
L
A
 
I
G
 
G
T
 
A
V
 
I
L
 
V
I
 
M
A
 
A
C
 
F
V
 
A
P
 
P
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
P
 
P
L
 
W
L
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
L
 
F
Q
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
M
E
 
A
L
 
S
G
 
M
G
 
T
V
 
S
S
 
P
V
 
L
Y
 
Y
L
 
I
A
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
S
T
 
P
P
 
A
G
 
R
R
 
I
K
 
R
G
 
G
F
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
S
W
 
T
Q
 
N
S
 
G
A
 
L
S
 
L
Q
 
I
Q
 
T
A
 
G
A
 
G
V
 
Q
V
 
F
F
 
F
A
 
S
G
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
N
V
 
L
G
 
A
L
 
F
N
 
V
H
 
H
W
 
-
L
 
-
S
 
T
P
 
P
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
G
E
 
T
W
 
W
G
 
R
W
 
W
R
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
M
V
 
L
G
 
G
C
 
V
M
 
A
I
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
-
 
V
-
 
Q
F
 
F
V
 
V
I
 
L
R
 
M
R
 
L
S
 
S
L
 
L
E
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
E
 
R
F
 
W
Q
 
L
A
 
Y
R
 
R
K
 
K
H
 
D
R
 
R
P
 
I
S
 
A
L
 
E
S
 
S
E
 
R
I
 
A
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6rw3A The molecular basis for sugar import in malaria parasites. (see paper)
24% identity, 70% coverage: 65:366/432 of query aligns to 50:385/437 of 6rw3A

query
sites
6rw3A
L
 
L
G
 
A
A
 
S
I
 
V
F
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
D
 
V
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
L
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
N
M
 
F
M
 
F
A
 
F
A
 
L
G
 
V
T
 
S
V
 
I
L
 
L
I
 
T
A
 
S
C
 
I
V
 
T
P
 
H
G
 
H
Y
 
F
A
 
H
T
 
T
L
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
L
 
F
G
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
G
F
 
F
S
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
L
E
 
V
L
 
T
G
 
V
G
 
S
V
 
V
S
 
P
V
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
S
E
 
E
I
 
M
S
 
T
T
 
H
P
 
K
G
 
D
R
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
A
F
 
Y
V
 
-
S
 
-
W
 
-
Q
 
-
S
 
G
A
 
V
S
 
M
Q
 
H
Q
|
Q
A
 
L
A
 
F
V
 
I
V
 
T
F
 
F
A
 
G
G
 
I
L
 
F
L
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
M
L
 
L
N
 
G
H
 
L
W
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
E
Q
 
T
E
 
S
M
 
F
G
 
A
E
 
K
W
 
L
G
 
W
W
 
W
R
 
R
V
 
L
P
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
F
G
 
P
C
 
S
M
 
V
I
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
V
 
I
P
 
L
A
 
A
I
 
L
F
 
V
V
 
V
I
 
F
R
 
F
R
 
K
S
 
-
L
 
-
E
 
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
E
 
Y
F
 
F
Q
 
L
A
 
F
R
 
E
K
 
K
H
 
G
R
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
D
P
 
E
S
 
P
L
 
L
S
 
N
E
 
A
I
 
I
V
 
K
R
 
E
S
 
A
I
 
V
G
 
E
Q
 
Q
N
 
N
F
 
E
G
 
S
I
 
A
V
 
K
L
 
K
A
 
N
G
 
S
M
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
S
M
 
A
T
 
L
T
 
K
V
 
I
S
 
P
F
 
S
Y
 
Y
-
 
R
-
 
Y
-
 
V
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
C
L
 
L
I
 
L
T
 
S
A
 
G
Y
 
L
T
x
Q
P
 
Q
T
 
F
F
 
T
G
 
G
-
x
I
-
x
N
-
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
N
K
 
S
A
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
Y
L
 
K
S
 
E
D
 
F
L
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
H
L
 
L
V
 
I
T
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
S
V
 
V
C
 
V
I
 
M
G
 
T
L
 
A
S
 
V
N
 
N
F
 
F
F
 
L
W
 
M
L
 
T
P
 
F
V
 
P
M
 
A
G
 
I
A
 
Y
L
 
I
S
 
V
D
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
W
A
 
G
T
 
C
V
 
V
L
 
-
A
 
G
I
 
V
L
 
L
T
 
V
A
 
A
Y
 
Y
P
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
P
W
 
T
L
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
P
 
E
S
 
N
F
 
F
S
 
V
H
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
S
V
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
T
-
 
F
E
 
V
L
 
M
W
 
I
L
 
I
S
 
S
F
|
F
L
 
A
Y
 
V
G
 
-
S
 
S
Y
 
Y
N
 
G
G
 
P
A
 
V
M
 
L
V
x
W
V
 
I
A
 
Y
L
 
L
T
 
H
E
 
E
I
 
M
M
 
F
P
 
P
V
 
S
E
 
E
V
 
I
R
 
K
T
 
D
T
 
S
G
 
A
F
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A

4gc0A The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to 6-bromo-6-deoxy-d-glucose (see paper)
23% identity, 58% coverage: 118:366/432 of query aligns to 129:407/475 of 4gc0A

query
sites
4gc0A
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Q
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
A
L
 
S
G
 
M
G
 
L
V
 
S
S
 
P
V
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
S
 
A
T
 
P
P
 
A
G
 
H
R
 
I
K
 
R
G
 
G
F
 
K
F
 
L
V
 
V
S
 
S
W
 
F
Q
 
N
S
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
A
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
V
V
 
Y
G
 
C
L
 
V
N
 
N
H
 
Y
W
 
F
L
 
I
S
 
A
P
 
R
Q
 
S
E
 
G
M
 
D
G
 
A
E
 
S
W
 
W
-
 
L
-
 
N
-
 
T
-
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
V
 
S
G
 
E
C
 
C
M
 
I
I
 
P
V
 
A
P
 
L
A
 
L
I
 
F
F
 
L
V
 
M
I
 
L
R
 
L
R
 
Y
S
 
T
L
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
E
 
R
F
 
W
Q
 
L
A
 
M
R
 
S
K
 
R
H
 
G
R
 
K
P
 
Q
S
 
E
L
 
Q
S
 
A
E
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
K
I
 
I
G
 
M
Q
 
G
N
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
G
F
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
M
L
 
L
V
 
S
V
 
I
M
 
F
T
x
Q
T
 
Q
-
 
F
V
 
V
S
 
G
F
 
I
Y
x
N
L
 
V
I
 
V
T
x
L
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
A
P
 
P
T
 
E
F
 
V
G
 
F
K
 
K
A
 
T
E
 
-
L
 
L
N
 
G
L
 
A
S
 
S
D
 
T
L
 
D
D
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
T
W
 
F
L
 
T
P
 
V
V
 
L
M
 
A
G
 
I
A
 
M
L
 
T
S
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
L
-
 
Q
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
G
T
 
M
A
 
F
Y
 
S
P
 
L
A
 
G
L
 
T
S
 
A
W
 
F
L
 
Y
V
 
T
A
 
Q
N
 
A
P
 
P
S
 
G
F
 
I
S
 
V
H
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
S
V
 
M
E
 
L
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
S
 
A
F
 
A
L
 
F
Y
 
A
G
 
M
S
 
S
Y
 
W
N
 
G
G
 
P
A
 
V
M
 
C
V
x
W
V
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
G
T
 
K
G
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A

4gbzA The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to d-glucose (see paper)
23% identity, 58% coverage: 118:366/432 of query aligns to 129:407/475 of 4gbzA

query
sites
4gbzA
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Q
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
A
L
 
S
G
 
M
G
 
L
V
 
S
S
 
P
V
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
S
 
A
T
 
P
P
 
A
G
 
H
R
 
I
K
 
R
G
 
G
F
 
K
F
 
L
V
 
V
S
 
S
W
 
F
Q
 
N
S
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
A
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
V
V
 
Y
G
 
C
L
 
V
N
 
N
H
 
Y
W
 
F
L
 
I
S
 
A
P
 
R
Q
 
S
E
 
G
M
 
D
G
 
A
E
 
S
W
 
W
-
 
L
-
 
N
-
 
T
-
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
V
 
S
G
 
E
C
 
C
M
 
I
I
 
P
V
 
A
P
 
L
A
 
L
I
 
F
F
 
L
V
 
M
I
 
L
R
 
L
R
 
Y
S
 
T
L
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
E
 
R
F
 
W
Q
 
L
A
 
M
R
 
S
K
 
R
H
 
G
R
 
K
P
 
Q
S
 
E
L
 
Q
S
 
A
E
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
K
I
 
I
G
 
M
Q
 
G
N
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
G
F
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
M
L
 
L
V
 
S
V
 
I
M
 
F
T
x
Q
T
 
Q
-
 
F
V
 
V
S
 
G
F
 
I
Y
x
N
L
 
V
I
 
V
T
 
L
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
A
P
 
P
T
 
E
F
 
V
G
 
F
K
 
K
A
 
T
E
 
-
L
 
L
N
 
G
L
 
A
S
 
S
D
 
T
L
 
D
D
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
T
W
 
F
L
 
T
P
 
V
V
 
L
M
 
A
G
 
I
A
 
M
L
 
T
S
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
L
-
 
Q
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
G
T
 
M
A
 
F
Y
 
S
P
 
L
A
 
G
L
 
T
S
 
A
W
 
F
L
 
Y
V
 
T
A
 
Q
N
 
A
P
 
P
S
 
G
F
 
I
S
 
V
H
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
S
V
 
M
E
 
L
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
S
 
A
F
 
A
L
 
F
Y
 
A
G
 
M
S
 
S
Y
 
W
N
 
G
G
 
P
A
 
V
M
 
C
V
x
W
V
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
G
T
 
K
G
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A

4gbyA The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to d-xylose (see paper)
23% identity, 58% coverage: 118:366/432 of query aligns to 129:407/475 of 4gbyA

query
sites
4gbyA
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Q
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
A
L
 
S
G
 
M
G
 
L
V
 
S
S
 
P
V
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
S
 
A
T
 
P
P
 
A
G
 
H
R
 
I
K
 
R
G
 
G
F
 
K
F
 
L
V
 
V
S
 
S
W
 
F
Q
 
N
S
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
A
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
V
V
 
Y
G
 
C
L
 
V
N
 
N
H
 
Y
W
 
F
L
 
I
S
 
A
P
 
R
Q
 
S
E
 
G
M
 
D
G
 
A
E
 
S
W
 
W
-
 
L
-
 
N
-
 
T
-
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
V
 
S
G
 
E
C
 
C
M
 
I
I
 
P
V
 
A
P
 
L
A
 
L
I
 
F
F
 
L
V
 
M
I
 
L
R
 
L
R
 
Y
S
 
T
L
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
E
 
R
F
 
W
Q
 
L
A
 
M
R
 
S
K
 
R
H
 
G
R
 
K
P
 
Q
S
 
E
L
 
Q
S
 
A
E
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
K
I
 
I
G
 
M
Q
 
G
N
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
G
F
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
M
L
 
L
V
 
S
V
 
I
M
 
F
T
x
Q
T
 
Q
-
 
F
V
 
V
S
 
G
F
 
I
Y
x
N
L
 
V
I
 
V
T
 
L
A
 
Y
Y
 
Y
T
 
A
P
 
P
T
 
E
F
 
V
G
 
F
K
 
K
A
 
T
E
 
-
L
 
L
N
 
G
L
 
A
S
 
S
D
 
T
L
 
D
D
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
T
W
 
F
L
 
T
P
 
V
V
 
L
M
 
A
G
 
I
A
 
M
L
 
T
S
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
L
-
 
Q
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
G
T
 
M
A
 
F
Y
 
S
P
 
L
A
 
G
L
 
T
S
 
A
W
 
F
L
 
Y
V
 
T
A
 
Q
N
 
A
P
 
P
S
 
G
F
 
I
S
 
V
H
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
S
V
 
M
E
 
L
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
S
 
A
F
 
A
L
 
F
Y
 
A
G
 
M
S
 
S
Y
 
W
N
 
G
G
 
P
A
 
V
M
 
C
V
x
W
V
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
G
T
 
K
G
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A

P0AGF4 D-xylose-proton symporter; D-xylose transporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
23% identity, 69% coverage: 70:366/432 of query aligns to 74:411/491 of P0AGF4

query
sites
P0AGF4
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
I
 
C
-
 
S
D
 
N
R
 
R
H
 
F
G
|
G
R
 
R
R
 
R
K
 
D
G
 
S
L
 
L
I
 
K
I
 
I
T
 
A
L
 
A
A
 
V
M
 
L
M
 
F
A
 
F
A
 
I
G
 
S
T
 
G
V
 
V
L
 
G
I
 
S
A
 
A
C
 
W
V
 
P
P
 
E
-
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
T
T
 
S
L
 
I
G
 
N
V
 
P
A
 
D
A
 
N
P
 
T
L
 
V
L
 
P
V
 
V
L
 
Y
L
 
L
G
 
A
R
 
G
L
 
Y
L
 
V
Q
 
P
G
 
E
F
 
F
S
 
V
A
 
I
G
 
Y
V
x
R
E
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
|
E
I
 
L
S
 
A
T
 
P
P
 
A
G
 
H
R
 
I
K
x
R
G
 
G
F
 
K
F
 
L
V
 
V
S
 
S
W
 
F
Q
 
N
S
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
A
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
V
V
 
Y
G
 
C
L
 
V
N
 
N
H
 
Y
W
 
F
L
 
I
S
 
A
P
 
R
Q
 
S
E
 
G
M
 
D
G
 
A
E
 
S
W
 
W
-
 
L
-
 
N
-
 
T
-
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
V
 
S
G
 
E
C
 
C
M
 
I
I
 
P
V
 
A
P
 
L
A
 
L
I
 
F
F
 
L
V
 
M
I
 
L
R
 
L
R
 
Y
S
 
T
L
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
E
 
R
F
 
W
Q
 
L
A
 
M
R
 
S
K
 
R
H
 
G
R
 
K
P
 
Q
S
 
E
L
 
Q
S
 
A
E
 
E
-
 
G
I
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
K
I
 
I
G
 
M
Q
 
G
N
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
G
F
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
M
L
 
L
V
 
S
V
 
I
M
 
F
T
x
Q
T
x
Q
-
 
F
V
 
V
S
 
G
F
 
I
Y
x
N
L
 
V
I
 
V
T
 
L
A
x
Y
Y
 
Y
T
 
A
P
 
P
T
 
E
F
 
V
G
 
F
K
 
K
A
 
T
E
 
-
L
 
L
N
 
G
L
 
A
S
 
S
D
 
T
L
 
D
D
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
Q
T
 
T
V
 
I
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
I
N
|
N
F
 
L
F
 
T
W
 
F
L
 
T
P
 
V
V
 
L
M
 
A
G
 
I
A
 
M
L
 
T
S
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
F
G
|
G
R
|
R
K
 
K
P
 
P
L
 
L
-
 
Q
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
G
T
 
M
A
 
F
Y
 
S
P
 
L
A
 
G
L
 
T
S
 
A
W
 
F
L
 
Y
V
 
T
A
 
Q
N
 
A
P
 
P
S
 
G
F
 
I
S
 
V
H
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
S
V
 
M
E
 
L
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
S
 
A
F
 
A
L
 
F
Y
 
A
G
 
M
S
 
S
Y
 
W
N
 
G
G
 
P
A
 
V
M
 
C
V
x
W
V
 
V
A
 
L
L
 
L
T
 
S
E
|
E
I
 
I
M
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
A
V
 
I
R
|
R
T
 
G
T
 
K
G
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf6N2E2_2276 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_2276
MSSQTSNGKAIFRVVSGNFLEMFDFMVYGFYATAIAKTFFPADSAFASLMLSLATFGAGF
LMRPLGAIFLGAYIDRHGRRKGLIITLAMMAAGTVLIACVPGYATLGVAAPLLVLLGRLL
QGFSAGVELGGVSVYLAEISTPGRKGFFVSWQSASQQAAVVFAGLLGVGLNHWLSPQEMG
EWGWRVPFLVGCMIVPAIFVIRRSLEETPEFQARKHRPSLSEIVRSIGQNFGIVLAGMAL
VVMTTVSFYLITAYTPTFGKAELNLSDLDALLVTVCIGLSNFFWLPVMGALSDKVGRKPL
LLGATVLAILTAYPALSWLVANPSFSHLLIVELWLSFLYGSYNGAMVVALTEIMPVEVRT
TGFSLAYSLATATFGGFTPAACTYLIHVLDNKAAPGIWLSGAAVLGLIATLVLFKGDRHE
LRTAQASVVGGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory