SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_2909 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_2909 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P08308 Ornithine carbamoyltransferase, catabolic; OTCase; EC 2.1.3.3 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 4 papers)
86% identity, 100% coverage: 1:336/336 of query aligns to 1:336/336 of P08308

query
sites
P08308
M
|
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
R
 
H
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
M
 
M
H
 
H
H
 
H
T
 
S
N
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
R
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
Q
H
 
H
L
 
L
K
 
K
G
 
R
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
T
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
N
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
|
E
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
K
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
F
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
V
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
R
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
 
N
M
 
M
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
W
P
 
P
H
 
H
Q
 
D
D
 
E
F
 
F
I
 
V
D
 
A
Q
 
Q
C
 
C
Q
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
L
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
F
I
 
V
H
 
H
T
 
T
D
 
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
E
M
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
 
C
L
 
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
S
E
 
E
T
 
T
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
Y
N
 
N
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I

4jhxA Crystal structure of anabolic ornithine carbamoyltransferase from vibrio vulnificus in complex with carbamoylphosphate and arginine
64% identity, 99% coverage: 1:334/336 of query aligns to 3:335/336 of 4jhxA

query
sites
4jhxA
M
 
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
T
R
 
K
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
x
D
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
|
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
L
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
V
I
 
G
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
G
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
Y
W
 
W
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
A
Q
 
A
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
A
Q
 
L
L
 
M
L
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
N
M
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
N
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
|
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
T
K
 
T
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
K
Y
 
F
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
M
N
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
E
A
 
H
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G

Q8DCF5 Ornithine carbamoyltransferase; OTCase; EC 2.1.3.3 from Vibrio vulnificus (strain CMCP6)
64% identity, 99% coverage: 1:334/336 of query aligns to 1:333/334 of Q8DCF5

query
sites
Q8DCF5
M
 
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
T
R
 
K
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
|
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
D
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
L
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
V
I
 
G
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
G
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
Y
W
 
W
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
A
Q
 
A
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
A
Q
 
L
L
 
M
L
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
N
M
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
N
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
T
K
 
T
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
K
Y
 
F
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
M
N
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
E
A
 
H
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G

4jqoA Crystal structure of anabolic ornithine carbamoyltransferase from vibrio vulnificus in complex with citrulline and inorganic phosphate
64% identity, 99% coverage: 1:334/336 of query aligns to 5:337/338 of 4jqoA

query
sites
4jqoA
M
 
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
T
R
 
K
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
x
D
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
L
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
V
I
 
G
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
G
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
Y
W
 
W
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
A
Q
 
A
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
A
Q
 
L
L
 
M
L
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
N
M
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
N
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
T
K
 
T
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
K
Y
 
F
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
M
N
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
E
A
 
H
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G

4h31A Crystal structure of anabolic ornithine carbamoyltransferase from vibrio vulnificus in complex with carbamoyl phosphate and l-norvaline
64% identity, 99% coverage: 1:334/336 of query aligns to 3:335/335 of 4h31A

query
sites
4h31A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
T
R
 
K
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
x
D
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
|
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
L
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
V
I
 
G
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
G
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
Y
W
 
W
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
A
Q
 
A
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
A
Q
 
L
L
 
M
L
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
N
M
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
N
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
T
K
 
T
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
K
Y
 
F
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
M
N
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
E
A
 
H
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G

4jfrB Crystal structure of anabolic ornithine carbamoyltransferase from vibrio vulnificus in complex with carbamoyl phosphate
64% identity, 99% coverage: 1:334/336 of query aligns to 7:339/340 of 4jfrB

query
sites
4jfrB
M
 
M
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
S
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
T
R
 
K
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
T
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
K
H
 
K
L
 
L
K
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
F
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
x
D
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
M
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
E
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
L
E
 
E
H
 
H
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
L
H
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
 
N
M
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
V
I
 
G
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
G
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
Y
W
 
W
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
A
Q
 
A
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
A
Q
 
L
L
 
M
L
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
N
M
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
N
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
 
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
T
K
 
T
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
K
Y
 
F
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
M
N
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
E
A
 
H
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G

1duvG Crystal structure of e. Coli ornithine transcarbamoylase complexed with ndelta-l-ornithine-diaminophosphinyl-n-sulphonic acid (psorn) (see paper)
59% identity, 97% coverage: 8:334/336 of query aligns to 6:332/333 of 1duvG

query
sites
1duvG
R
 
K
S
 
H
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
T
N
 
P
R
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
N
F
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
A
D
 
K
L
 
L
K
 
K
R
 
A
A
 
D
K
 
K
Y
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
K
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
H
 
K
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
D
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
I
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
Y
E
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
|
L
T
 
T
A
 
N
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
L
S
 
P
D
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
F
H
 
N
D
 
E
I
 
M
S
 
T
Y
 
L
A
 
V
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
M
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
M
L
 
L
M
 
E
I
 
A
G
 
A
A
 
A
K
 
L
L
 
T
G
 
G
M
 
L
D
 
D
V
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
C
W
 
W
P
 
P
H
 
E
Q
 
A
D
 
A
F
 
L
I
 
V
D
 
T
Q
 
E
C
 
C
Q
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
Q
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
A
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
V
K
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
V
K
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
A
V
 
K
E
 
E
A
 
K
W
 
W
D
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
L
 
R
P
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
S
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
Q
A
 
L
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
L
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
D
S
 
D
E
 
Q
T
 
T
K
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
E
Y
 
F
P
 
-
N
 
G
L
 
L
A
 
H
N
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
S

P04391 Ornithine carbamoyltransferase subunit I; OTCase-1; EC 2.1.3.3 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
59% identity, 97% coverage: 8:334/336 of query aligns to 7:333/334 of P04391

query
sites
P04391
R
 
K
S
 
H
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
T
N
 
P
R
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
N
F
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
A
D
 
K
L
 
L
K
 
K
R
 
A
A
 
D
K
 
K
Y
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
K
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
H
 
K
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
D
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
|
Q
I
 
I
G
 
G
H
 
H
K
|
K
E
 
E
S
 
S
M
 
I
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
Y
E
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
L
S
 
P
D
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
F
H
 
N
D
 
E
I
 
M
S
 
T
Y
 
L
A
 
V
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
M
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
M
L
 
L
M
 
E
I
 
A
G
 
A
A
 
A
K
 
L
L
 
T
G
 
G
M
 
L
D
 
D
V
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
C
W
 
W
P
 
P
H
 
E
Q
 
A
D
 
A
F
 
L
I
 
V
D
 
T
Q
 
E
C
 
C
Q
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
Q
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
A
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
V
K
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
V
K
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
A
V
 
K
E
 
E
A
 
K
W
 
W
D
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
L
 
R
P
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
S
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
Q
A
 
L
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
L
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
D
S
 
D
E
 
Q
T
 
T
K
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
E
Y
 
F
P
 
-
N
 
G
L
 
L
A
 
H
N
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
|
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
S

Sites not aligning to the query:

2otcA Ornithine transcarbamoylase complexed with n-(phosphonacetyl)-l- ornithine (see paper)
59% identity, 97% coverage: 8:334/336 of query aligns to 6:332/333 of 2otcA

query
sites
2otcA
R
 
K
S
 
H
L
 
F
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
L
H
 
D
H
 
F
T
 
T
N
 
P
R
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
N
F
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
R
 
A
D
 
K
L
 
L
K
 
K
R
 
A
A
 
D
K
 
K
Y
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
K
E
 
E
Q
 
E
P
 
A
H
 
K
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
D
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
C
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
P
 
P
V
 
S
S
 
G
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
H
|
H
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
I
K
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
F
 
Y
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
G
 
G
F
 
Y
E
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
E
F
 
Y
A
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
E
F
 
F
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
T
 
T
M
 
M
R
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
L
S
 
P
D
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
F
H
 
N
D
 
E
I
 
M
S
 
T
Y
 
L
A
 
V
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
N
|
N
M
 
M
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
M
L
 
L
M
 
E
I
 
A
G
 
A
A
 
A
K
 
L
L
 
T
G
 
G
M
 
L
D
 
D
V
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
C
W
 
W
P
 
P
H
 
E
Q
 
A
D
 
A
F
 
L
I
 
V
D
 
T
Q
 
E
C
 
C
Q
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
Q
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
A
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
V
K
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
V
K
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
E
P
 
A
V
 
K
E
 
E
A
 
K
W
 
W
D
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
L
 
R
P
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
S
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
Q
A
 
L
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
R
 
E
V
 
V
K
 
K
F
 
F
M
 
L
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
D
S
 
D
E
 
Q
T
 
T
K
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
E
R
 
E
Y
 
F
P
 
-
N
 
G
L
 
L
A
 
H
N
 
G
G
 
G
V
 
M
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
|
R
M
 
M
H
 
H
T
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
S

Q8G998 Ornithine carbamoyltransferase, catabolic; OTCase; EC 2.1.3.3 from Lentilactobacillus hilgardii (Lactobacillus hilgardii) (see paper)
49% identity, 99% coverage: 5:336/336 of query aligns to 10:338/343 of Q8G998

query
sites
Q8G998
M
 
F
R
 
Q
N
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
V
L
 
L
S
 
A
L
 
E
M
 
K
H
 
D
H
 
F
T
 
S
N
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
E
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
F
S
 
G
R
 
L
D
 
H
L
 
L
K
 
K
R
 
A
A
 
L
K
 
K
Y
 
K
T
 
A
G
 
G
T
 
I
E
 
P
Q
 
H
P
 
H
H
 
Y
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
L
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
S
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
T
V
 
T
A
 
A
A
 
S
H
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
H
|
H
V
 
P
T
 
E
Y
 
Y
I
 
L
D
 
G
P
 
Q
V
 
N
S
 
D
S
 
I
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
H
 
K
K
 
K
E
 
E
S
 
S
M
 
T
K
 
S
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
S
M
 
M
F
 
F
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
F
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
K
Q
 
Q
E
 
S
I
 
D
V
 
A
E
 
E
E
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
R
F
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
E
F
 
W
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
F
L
 
M
T
 
T
M
 
V
R
 
K
E
 
E
H
 
N
S
 
F
D
 
G
K
 
K
P
 
-
L
 
L
H
 
Q
D
 
G
I
 
L
S
 
T
Y
 
L
A
 
T
Y
 
F
L
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
G
R
 
R
Y
 
N
N
 
N
M
 
V
G
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
V
D
 
N
V
 
I
R
 
H
I
 
I
G
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
K
A
 
A
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
T
Q
 
E
D
 
E
F
 
T
I
 
Q
D
 
N
Q
 
I
C
 
A
Q
 
K
A
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
E
E
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
L
T
 
V
I
 
I
T
 
T
E
 
D
D
 
D
P
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
S
D
 
N
F
 
V
I
 
V
H
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
V
W
 
W
V
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
E
P
 
S
V
 
-
E
 
-
A
 
N
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
M
Q
 
E
M
 
A
M
 
M
K
 
K
A
 
K
S
 
T
G
 
G
N
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
D
R
 
Q
V
 
L
K
 
I
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
 
C
L
 
L
P
 
P
A
 
A
F
 
F
H
 
H
N
 
N
S
 
T
E
 
D
T
 
T
K
 
Q
V
 
Y
G
 
G
K
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
P
 
G
N
 
-
L
 
-
A
 
I
N
 
T
G
 
E
V
 
M
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
T
S
 
S
P
 
K
A
 
Y
N
 
A
I
 
R
A
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
M
 
M
H
 
H
T
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
M
V
 
A
S
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
G
D
x
N
I
x
L

Sites not aligning to the query:

Q51742 Ornithine carbamoyltransferase, anabolic; OTCase; EC 2.1.3.3 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see 3 papers)
38% identity, 100% coverage: 1:336/336 of query aligns to 1:313/315 of Q51742

query
sites
Q51742
M
|
M
A
 
V
F
 
V
N
 
S
M
 
L
R
 
A
N
 
G
R
 
R
S
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
C
L
 
L
M
 
Q
H
 
D
H
 
Y
T
 
T
N
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
I
H
x
W
F
 
T
L
 
I
L
 
L
D
x
E
L
 
T
S
 
A
R
 
K
D
x
M
L
 
F
K
 
K
R
 
I
A
x
W
K
 
Q
Y
 
K
T
 
I
G
 
G
T
 
K
E
 
P
Q
 
H
P
 
R
H
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
M
I
 
I
F
 
F
E
 
Q
K
 
K
T
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
 
V
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
M
H
 
A
D
 
H
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
V
 
A
T
 
L
Y
 
Y
I
 
L
D
 
N
P
 
A
V
 
Q
S
 
D
S
 
L
Q
 
Q
I
 
L
G
 
R
H
 
R
K
 
G
E
 
E
S
 
T
M
 
I
K
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
R
 
R
M
 
Y
F
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
M
Y
 
A
R
 
R
G
 
V
F
 
Y
E
 
D
Q
 
H
E
 
K
I
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
Y
A
 
A
G
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
D
E
 
F
F
 
S
H
 
H
P
 
P
T
 
C
Q
 
Q
M
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
Y
L
 
M
T
 
T
M
 
I
R
 
W
E
 
E
H
 
K
S
 
K
D
 
G
K
 
T
P
 
-
L
 
I
H
 
K
D
 
G
I
 
V
S
 
K
Y
 
V
A
 
V
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
G
R
 
N
Y
 
-
N
 
N
M
 
V
G
 
A
N
 
H
S
 
S
L
 
L
L
 
M
M
 
I
I
 
A
G
 
G
A
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
T
P
 
P
K
 
E
A
 
G
L
 
Y
W
 
E
P
 
P
H
 
D
Q
 
E
D
 
K
F
 
V
I
 
I
D
 
K
Q
 
W
C
 
A
Q
 
E
A
 
Q
F
 
N
A
 
A
V
 
A
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
S
I
 
F
T
 
E
I
 
L
T
 
L
E
 
H
D
 
D
P
 
P
K
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
D
V
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
I
H
x
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
V
W
 
W
V
 
A
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
Q
P
 
E
V
 
A
E
 
E
A
|
A
W
 
-
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
R
E
 
K
Q
 
I
L
 
F
L
 
R
P
 
P
Y
 
F
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
K
Q
 
D
M
 
L
M
 
V
K
 
K
A
 
-
S
 
H
G
 
A
N
 
K
P
 
P
R
 
D
V
 
Y
K
 
M
F
 
F
M
 
M
H
 
H
C
 
C
L
 
L
P
 
P
A
 
A
F
 
H
H
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
R
G
 
G
V
 
E
E
|
E
V
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
D
S
 
S
P
 
P
A
 
N
N
 
S
I
 
V
A
 
V
F
 
W
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
M
 
L
H
 
H
T
 
A
I
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
A
S
 
L
A
 
V
L
 
M
A
 
G
D
 
G
I
 
I

Q81M99 Ornithine carbamoyltransferase; OTCase; EC 2.1.3.3 from Bacillus anthracis
37% identity, 99% coverage: 5:336/336 of query aligns to 9:312/316 of Q81M99

query
sites
Q81M99
M
 
L
R
 
N
N
 
T
R
 
K
S
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
L
M
 
E
H
 
E
H
 
L
T
 
T
N
 
Q
R
 
E
E
 
E
L
 
I
H
 
I
F
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
F
S
 
A
R
 
I
D
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
N
K
 
K
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
Q
Q
 
E
P
 
P
H
 
L
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
I
I
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
D
K
 
K
T
 
H
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
V
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
A
A
 
G
A
 
M
H
 
V
D
 
Q
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
V
 
G
T
 
M
Y
 
F
I
 
L
D
 
N
P
 
G
V
 
K
S
 
E
S
 
M
Q
|
Q
I
 
M
G
 
G
H
 
R
K
 
G
E
 
E
S
 
T
M
 
V
K
 
S
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
S
R
 
H
M
 
Y
F
 
I
D
 
D
A
 
G
I
 
I
E
 
M
Y
 
I
R
|
R
G
 
T
F
 
F
E
 
S
Q
 
H
E
 
A
I
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
E
A
 
S
G
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
D
F
 
H
H
|
H
P
|
P
T
x
C
Q
|
Q
M
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
M
T
 
T
M
 
I
R
 
Y
E
 
E
H
 
E
S
 
T
D
 
N
K
 
-
P
 
T
L
 
F
H
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
K
Y
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
G
R
 
N
Y
 
-
N
|
N
M
 
V
G
 
C
N
 
H
S
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
I
 
A
G
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
M
 
M
D
 
H
V
 
M
R
 
T
I
 
V
G
 
A
A
 
T
P
 
P
K
 
V
A
 
G
L
 
Y
W
 
K
P
 
P
H
 
N
Q
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
V
D
 
K
Q
 
K
C
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
A
V
 
K
E
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
I
T
 
E
I
 
I
T
 
L
E
 
H
D
 
N
P
 
P
K
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
N
G
 
E
V
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
H
 
Y
T
 
T
D
|
D
I
 
V
W
 
W
V
 
M
S
|
S
M
|
M
G
 
G
E
 
Q
P
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
G
W
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
K
I
 
Y
E
 
T
Q
 
L
L
 
F
L
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
A
 
K
Q
 
E
M
 
L
M
 
V
K
 
K
A
 
H
S
 
A
G
 
-
N
 
K
P
 
Q
R
 
T
V
 
Y
K
 
H
F
 
F
M
 
L
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
A
 
A
F
 
-
H
 
H
N
 
R
S
 
E
E
 
E
T
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
T
E
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
I
E
 
D
S
 
G
P
 
P
A
 
Q
N
 
S
I
 
I
A
 
V
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
G
N
 
N
R
|
R
M
 
L
H
 
H
T
 
A
I
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
L
L
 
F
A
 
K
D
 
N
I
 
V

P00481 Ornithine transcarbamylase, mitochondrial; OTCase; Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial; EC 2.1.3.3 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
37% identity, 99% coverage: 5:335/336 of query aligns to 37:344/354 of P00481

query
sites
P00481
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
R
S
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
L
M
 
K
H
 
N
H
 
F
T
 
T
N
 
G
R
 
E
E
 
E
L
 
I
H
 
Q
F
 
Y
L
 
M
L
 
L
D
 
W
L
 
L
S
 
S
R
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
-
 
F
R
 
R
A
 
I
K
 
K
Y
 
Q
T
 
K
G
 
G
T
 
E
E
 
Y
Q
 
L
P
 
P
H
 
L
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
S
I
 
L
A
 
G
L
 
M
I
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
K
T
 
R
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
 
T
R
 
R
C
 
L
A
 
S
F
 
T
E
 
E
V
 
T
A
 
G
A
 
F
H
 
A
D
 
L
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
V
 
P
T
 
S
Y
 
F
I
 
L
D
 
T
P
 
T
V
 
Q
S
 
D
S
 
I
Q
 
H
I
 
L
G
 
G
H
 
V
K
 
N
E
 
E
S
 
S
M
 
L
K
 
T
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
R
 
S
M
 
M
F
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
L
Y
 
A
R
 
R
G
 
V
F
 
Y
E
 
K
Q
 
Q
E
 
S
I
 
D
V
 
L
E
 
D
E
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
E
A
 
A
G
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
I
F
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
D
E
 
L
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
T
 
I
Q
 
Q
M
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
Y
L
 
L
T
 
T
M
 
L
R
 
Q
E
 
E
H
 
H
S
 
Y
D
 
G
K
 
S
P
 
-
L
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
L
S
 
T
Y
 
L
A
 
S
Y
 
W
L
 
I
G
 
G
D
 
D
A
 
G
R
 
N
Y
 
-
N
 
N
M
 
I
G
 
L
N
 
H
S
 
S
L
 
I
L
 
M
M
 
M
I
 
S
G
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
H
V
 
L
R
 
Q
I
 
A
G
 
A
A
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
G
L
 
Y
W
 
E
P
 
P
H
 
D
Q
 
P
D
 
N
F
 
I
I
 
V
D
 
K
Q
 
L
C
 
A
Q
 
E
A
 
Q
F
 
Y
A
 
A
V
 
K
E
 
E
S
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
S
I
 
M
T
 
T
E
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
G
D
 
N
F
 
V
I
 
L
H
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
T
W
 
W
V
 
I
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
Q
P
 
E
V
 
D
E
 
E
A
 
K
W
 
-
D
 
K
E
 
K
R
 
R
I
 
L
E
 
Q
Q
 
A
L
 
F
L
 
Q
P
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
N
 
T
A
 
M
Q
 
K
M
 
T
M
 
A
K
 
K
A
 
V
S
 
A
G
 
A
N
 
S
P
 
D
R
 
W
V
 
T
K
 
-
F
 
F
M
 
L
H
 
H
C
|
C
L
 
L
P
 
P
A
 
-
F
 
-
H
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
Y
 
K
P
 
P
N
 
E
L
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
D
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
Y
S
 
S
P
 
P
A
 
R
N
 
S
I
 
L
A
 
V
F
 
F
E
 
P
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
M
 
K
H
 
W
T
 
T
I
 
I
K
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4nf2A Crystal structure of anabolic ornithine carbamoyltransferase from bacillus anthracis in complex with carbamoyl phosphate and l- norvaline
38% identity, 97% coverage: 5:331/336 of query aligns to 5:303/307 of 4nf2A

query
sites
4nf2A
M
 
L
R
 
N
N
 
T
R
 
K
S
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
L
M
 
E
H
 
E
H
 
L
T
 
T
N
 
Q
R
 
E
E
 
E
L
 
I
H
 
I
F
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
F
S
 
A
R
 
I
D
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
K
A
 
N
K
 
K
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
Q
Q
 
E
P
 
P
H
 
L
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
I
I
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
D
K
 
K
T
 
H
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
C
 
V
A
 
S
F
 
F
E
 
E
V
 
A
A
 
G
A
 
M
H
 
V
D
 
Q
Q
 
L
G
 
G
A
 
G
H
 
H
V
 
G
T
 
M
Y
 
F
I
 
L
D
 
N
P
 
G
V
 
K
S
 
E
S
 
M
Q
 
Q
I
 
M
G
 
Q
H
x
R
K
 
G
E
 
E
S
 
T
M
 
V
K
 
S
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G