SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_394 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_394 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4h15A Crystal structure of a short chain alcohol dehydrogenase-related dehydrogenase (target id nysgrc-011812) from sinorhizobium meliloti 1021 in space group p21
71% identity, 99% coverage: 4:258/258 of query aligns to 7:261/261 of 4h15A

query
sites
4h15A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
A
A
 
R
S
 
P
G
 
E
T
 
G
L
 
L
S
 
P
D
 
E
N
 
E
L
 
L
L
 
F
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
T
R
 
K
E
 
E
G
 
G
C
 
C
D
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
|
A
L
 
L
D
 
S
E
 
D
E
 
D
Q
x
D
W
 
W
Q
 
Y
R
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
S
L
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
D
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
K
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
L
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
|
S
I
 
I
Q
 
Q
S
 
R
R
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
S
T
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
S
 
A
L
 
M
S
 
S
K
 
K
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
|
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
L
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
M
 
M
Q
 
D
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
A
S
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
N
L
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
A
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
A

4h16A Crystal structure of a short chain alcohol dehydrogenase-related dehydrogenase (target id nysgrc-011812) from sinorhizobium meliloti 1021 in space group p6422
71% identity, 99% coverage: 4:258/258 of query aligns to 4:258/258 of 4h16A

query
sites
4h16A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
E
 
S
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
A
A
 
R
S
 
P
G
 
E
T
 
G
L
 
L
S
 
P
D
 
E
N
 
E
L
 
L
L
 
F
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
T
T
 
T
R
 
K
E
 
E
G
 
G
C
 
C
D
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
A
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
|
A
L
 
L
D
 
S
E
 
D
E
 
D
Q
x
D
W
 
W
Q
 
Y
R
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
S
L
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
D
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
K
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
L
 
V
H
 
H
V
 
V
T
 
T
S
|
S
I
 
I
Q
 
Q
S
 
R
R
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
S
T
 
T
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
S
 
A
L
 
M
S
 
S
K
 
K
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
|
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
L
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
M
 
M
Q
 
D
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
A
S
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
N
L
 
L
I
 
I
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
A
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
F
 
Y
V
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
A

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 1:262/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
L
 
M
N
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
x
S
K
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
G
F
 
F
L
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
L
 
V
T
 
L
S
 
V
A
|
A
R
|
R
K
x
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
R
T
 
S
L
 
L
S
 
K
D
 
E
N
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
V
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Q
 
A
A
x
V
D
|
D
L
x
V
S
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
G
 
G
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
 
S
R
 
S
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
 
A
G
|
G
G
 
T
S
 
G
S
 
S
A
 
N
P
 
E
G
 
T
G
 
I
G
 
M
F
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
-
D
 
-
E
 
D
E
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
Q
R
 
F
E
 
Y
L
 
W
N
 
E
L
 
L
N
 
H
L
 
V
F
 
M
P
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
G
M
 
M
L
 
R
E
 
A
R
 
R
K
 
G
E
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
H
 
H
V
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
Q
 
C
S
 
A
R
 
V
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
W
E
 
Y
A
 
E
T
 
P
T
 
I
A
 
-
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
A
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
M
T
 
M
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
T
L
 
L
S
 
A
K
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
I
P
 
K
K
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
N
R
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
 
G
W
 
L
V
x
I
E
 
L
T
|
T
E
 
P
A
 
D
S
x
W
V
 
I
A
 
K
L
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
E
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
G
D
 
D
Y
 
W
Q
 
K
G
 
G
G
 
Y
K
 
L
Q
 
Q
I
 
S
I
 
V
M
 
A
Q
 
D
A
 
E
L
 
H
G
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
P
 
F
S
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
F
I
 
F
G
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
T
S
 
Y
I
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
A
F
 
Y
V
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
M
V
 
L
P
 
K
T
 
T

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 1:262/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
L
 
M
N
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
x
S
K
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
G
F
 
F
L
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
L
 
V
T
 
L
S
 
V
A
|
A
R
|
R
K
x
Q
-
 
V
-
 
D
-
x
R
-
 
L
-
 
H
-
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
R
T
 
S
L
 
L
S
 
K
D
 
E
N
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
V
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Q
 
A
A
 
V
D
|
D
L
x
V
S
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
G
 
G
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
 
S
R
 
S
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
 
A
G
|
G
G
 
T
S
x
G
S
 
S
A
 
N
P
 
E
G
 
T
G
 
I
G
 
M
F
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
-
D
 
-
E
 
D
E
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
Q
R
 
F
E
 
Y
L
 
W
N
 
E
L
 
L
N
 
L
L
 
V
F
 
M
P
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
G
M
 
M
L
 
R
E
 
A
R
 
R
K
 
G
E
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
H
 
H
V
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
Q
 
C
S
 
A
R
 
V
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
W
E
 
Y
A
x
E
T
 
P
T
 
I
A
 
-
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
A
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
M
T
 
M
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
T
L
 
L
S
 
A
K
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
I
P
 
K
K
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
N
R
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
W
 
L
V
x
I
E
 
L
T
|
T
E
 
P
A
 
D
S
x
W
V
 
I
A
 
K
L
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
E
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
G
D
 
D
Y
 
W
Q
 
K
G
 
G
G
 
Y
K
 
L
Q
 
Q
I
 
S
I
 
V
M
 
A
Q
 
D
A
 
E
L
 
H
G
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
P
 
F
S
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
F
I
 
F
G
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
T
S
 
Y
I
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
S
E
x
A
F
 
Y
V
x
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
M
V
 
L
P
 
K
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:257/258 of query aligns to 1:262/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
L
 
M
N
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
x
S
K
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
G
F
 
F
L
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
L
 
V
T
 
L
S
 
V
A
|
A
R
|
R
K
x
Q
-
 
V
-
 
D
-
x
R
-
 
L
-
 
H
-
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
R
T
 
S
L
 
L
S
 
K
D
 
E
N
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
V
L
 
L
L
 
E
V
 
V
Q
 
A
A
x
V
D
|
D
L
x
V
S
 
A
T
 
T
R
 
P
E
 
E
G
 
G
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
 
S
R
 
S
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
A
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
 
A
G
|
G
G
 
T
S
x
G
S
 
S
A
 
N
P
 
E
G
 
T
G
 
I
G
 
M
F
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
-
D
 
-
E
 
D
E
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
Q
R
 
F
E
 
Y
L
 
W
N
 
E
L
 
L
N
 
L
L
 
V
F
 
M
P
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
D
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
G
M
 
M
L
 
R
E
 
A
R
 
R
K
 
G
E
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
H
 
H
V
x
N
T
 
A
S
|
S
I
 
I
Q
 
C
S
 
A
R
 
V
L
 
Q
P
 
P
L
|
L
P
 
W
E
 
Y
A
x
E
T
 
P
T
 
I
A
 
-
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
A
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
M
T
 
M
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
T
L
 
L
S
 
A
K
 
T
E
 
E
V
 
V
S
 
I
P
 
K
K
 
D
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
N
R
 
C
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
W
 
L
V
x
I
E
 
L
T
|
T
E
 
P
A
 
D
S
x
W
V
 
I
A
 
K
L
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
E
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
G
D
 
D
Y
 
W
Q
 
K
G
 
G
G
 
Y
K
 
L
Q
 
Q
I
 
S
I
 
V
M
 
A
Q
 
D
A
 
E
L
 
H
G
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
I
G
 
K
R
 
R
P
 
F
S
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
F
I
 
F
G
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
T
S
 
Y
I
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
S
E
 
A
F
 
Y
V
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
M
V
 
L
P
 
K
T
 
T

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
34% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 4:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
M
G
 
N
L
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
S
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
G
L
 
K
V
 
G
Q
 
M
A
 
A
-
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
N
R
 
P
E
 
E
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
R
 
T
Q
 
D
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
x
A
G
 
G
G
x
I
S
 
T
S
 
R
A
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
Q
 
S
R
 
D
E
 
I
L
 
M
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
T
P
 
S
A
 
I
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
|
V
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
A
x
M
S
 
T
V
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
N
E
 
D
R
 
E
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
T
G
 
A
T
 
T
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
D
P
 
P
S
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
32% identity, 96% coverage: 6:253/258 of query aligns to 2:239/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
L
 
E
S
 
A
D
 
I
N
 
S
L
 
G
L
 
Y
V
 
L
Q
 
G
A
 
A
D
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
L
-
x
N
L
x
V
S
 
K
T
 
D
R
 
A
E
 
Q
G
 
S
C
 
I
D
 
D
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
I
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
 
A
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
x
I
A
 
T
P
 
R
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
E
R
 
D
E
 
I
L
 
L
N
 
D
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
T
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
C
D
 
A
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
Y
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
D
R
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
S
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
P
 
P
S
 
G
S
 
D
P
 
A
S
 
K
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 1:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
M
G
 
S
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
S
 
S
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
L
 
G
V
 
A
Q
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
x
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
D
R
 
P
E
 
A
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
x
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
S
 
R
A
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
N
R
 
D
E
 
I
L
 
I
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
S
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
R
D
 
A
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
D
R
 
E
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
T
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
T
P
 
P
S
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 4:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
M
G
 
N
L
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
S
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
G
L
 
K
V
 
G
Q
 
M
A
 
A
-
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
N
R
 
P
E
 
E
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
R
 
T
Q
 
D
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
x
A
G
 
G
G
 
I
S
 
T
S
 
R
A
 
-
P
 
-
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
Q
 
S
R
 
D
E
 
I
L
 
M
N
 
E
L
 
T
N
|
N
L
 
L
F
 
T
P
 
S
A
 
I
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
 
V
T
x
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
A
 
M
S
 
N
V
 
D
A
 
-
L
 
-
A
 
E
E
 
Q
R
 
R
L
 
T
A
 
A
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
T
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
D
P
 
P
S
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3tzcA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg)(y155f) from vibrio cholerae (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 4:222/224 of 3tzcA

query
sites
3tzcA
L
 
M
G
 
N
L
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
|
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
S
 
G
D
 
D
N
 
N
L
 
G
L
 
K
V
 
G
Q
 
M
A
 
A
-
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
N
R
 
P
E
 
E
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
R
 
T
Q
 
D
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
 
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
S
 
R
A
 
M
P
 
R
G
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
Q
 
S
R
 
D
E
 
I
L
 
M
N
 
E
L
x
T
N
 
N
L
 
L
F
 
T
P
 
S
A
 
I
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
 
V
T
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
T
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
D
V
 
E
A
 
Q
L
 
R
A
 
T
E
 
A
R
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
D
P
 
P
S
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 1:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
M
G
 
N
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
T
x
S
K
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
N
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
S
 
S
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
L
 
G
V
 
A
Q
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
D
R
 
P
E
 
A
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
 
A
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
I
A
 
T
P
 
R
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
Q
 
N
R
 
D
E
 
I
L
 
I
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
S
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
R
D
 
A
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
G
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
R
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 96% coverage: 6:253/258 of query aligns to 2:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
N
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
S
 
S
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
L
 
G
V
 
A
Q
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
D
R
 
P
E
 
A
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
x
A
G
|
G
G
 
-
S
 
-
S
x
I
A
 
T
P
 
R
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
x
E
W
 
W
Q
 
N
R
 
D
E
 
I
L
 
I
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
S
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
R
D
 
A
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
G
A
 
G
T
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
R
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
x
E
E
x
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:253/258 of query aligns to 1:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
M
G
 
S
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
S
A
 
E
S
 
N
G
 
G
-
 
A
-
 
K
T
 
N
L
 
I
S
 
S
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
L
 
G
V
 
A
Q
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
L
D
 
N
L
 
V
S
 
T
T
 
D
R
 
P
E
 
A
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
I
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
 
A
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
I
A
 
T
P
 
R
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
N
R
 
D
E
 
I
L
 
I
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
S
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
R
D
 
A
M
|
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
C
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
R
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1o5iB Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase (tm1169) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
33% identity, 97% coverage: 5:253/258 of query aligns to 1:228/234 of 1o5iB

query
sites
1o5iB
G
 
G
L
 
I
S
 
R
G
 
D
K
 
K
R
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
L
G
x
A
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
S
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
L
 
T
T
 
I
S
 
C
A
 
A
R
|
R
K
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
N
A
 
E
D
 
E
L
 
L
S
 
L
T
 
K
R
 
R
E
 
S
G
 
G
C
 
H
D
 
R
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
C
A
x
D
T
x
L
R
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
Q
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
K
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
L
V
 
N
L
 
A
G
 
G
G
|
G
S
 
P
S
 
K
A
 
A
P
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
F
F
 
F
A
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
T
E
 
N
E
 
E
Q
 
D
W
 
F
Q
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
I
N
 
D
L
 
S
N
 
L
L
 
F
F
 
L
P
 
N
A
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
I
D
 
V
R
 
R
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
K
E
 
E
R
 
K
K
 
G
E
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
V
H
 
A
V
 
I
T
 
T
S
|
S
I
 
F
Q
 
S
S
 
V
R
 
I
L
 
S
P
 
P
L
 
I
P
 
E
E
 
N
A
x
L
T
x
Y
T
 
T
A
x
S
Y
 
-
A
 
N
A
 
S
A
 
A
K
x
R
A
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
T
T
 
G
Y
 
F
S
 
L
K
 
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
F
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
x
R
S
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
V
A
 
K
E
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
A
 
K
G
 
K
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
K
Q
 
Q
I
 
V
I
 
E
M
 
S
Q
 
Q
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
R
R
 
R
P
 
M
S
 
A
S
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
L
 
V
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
E
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
F
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
31% identity, 96% coverage: 6:253/258 of query aligns to 2:239/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
E
L
 
T
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
|
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
N
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
A
L
 
I
S
 
S
D
 
D
N
 
Y
L
 
L
L
 
G
V
 
A
Q
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
x
L
D
x
N
L
x
V
S
 
T
T
 
D
R
 
P
E
 
A
G
 
S
C
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
 
A
G
|
G
G
 
-
S
 
-
S
x
I
A
 
T
P
 
R
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
Q
 
N
R
 
D
E
 
I
L
 
I
N
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
S
P
 
S
A
 
V
V
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
M
P
 
R
D
 
A
M
 
M
L
 
M
E
 
K
R
 
K
K
 
R
E
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
G
A
 
G
T
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
I
T
 
G
Y
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
R
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
Q
E
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
A
I
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
T
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
32% identity, 97% coverage: 3:253/258 of query aligns to 2:237/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
N
 
S
L
 
M
G
 
S
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
K
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
L
L
 
E
F
 
L
L
 
G
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
K
D
 
A
N
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
E
Q
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
S
T
 
S
R
 
D
E
 
E
G
 
S
C
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
L
A
 
E
A
 
H
T
 
I
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
H
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
D
 
L
I
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
V
 
N
L
 
A
G
 
G
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
x
F
R
 
D
E
 
V
L
x
V
N
 
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
F
 
N
P
 
S
A
 
L
V
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
E
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
A
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
x
G
L
 
L
S
 
E
T
 
G
Y
x
F
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
P
E
 
E
R
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
A
 
E
G
 
A
T
 
L
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
Q
P
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
T
F
 
V
V
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4bnxA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 6-(4-(2-chloroanilino)- 1h-quinazolin-2-ylidene)cyclohexa-2, 4-dien-1-one at 2.3a resolution (see paper)
32% identity, 97% coverage: 3:253/258 of query aligns to 2:236/239 of 4bnxA

query
sites
4bnxA
N
 
S
L
 
M
G
 
S
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
K
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
L
L
 
E
F
 
L
L
 
G
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
K
D
 
A
N
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
E
Q
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
S
T
 
S
R
 
D
E
 
E
G
 
S
C
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
L
A
 
E
A
 
H
T
 
I
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
H
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
D
 
L
I
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
N
A
 
A
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
F
R
 
D
E
 
V
L
x
V
N
|
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
F
 
N
P
 
S
A
 
L
V
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
E
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
A
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
x
G
L
 
L
S
 
E
T
x
G
Y
x
F
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
P
E
 
E
R
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
A
 
E
G
 
A
T
 
L
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
Q
P
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
T
F
 
V
V
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4bnyA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 4-(2-phenylthieno(3,2-d) pyrimidin-4-yl)morpholine at 1.8a resolution (see paper)
32% identity, 97% coverage: 3:253/258 of query aligns to 1:235/239 of 4bnyA

query
sites
4bnyA
N
 
S
L
 
M
G
 
S
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
T
 
S
K
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
L
L
 
E
F
 
L
L
 
G
A
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
 
T
K
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
T
 
T
L
 
L
S
 
K
D
 
A
N
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
E
Q
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
S
T
 
S
R
 
D
E
 
E
G
 
S
C
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
L
A
 
E
A
 
H
T
 
I
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
H
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
D
 
L
I
 
I
I
 
V
V
 
V
H
 
N
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
N
A
 
A
A
 
R
L
 
M
D
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
|
W
Q
 
F
R
 
D
E
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
F
 
N
P
 
S
A
 
L
V
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
D
 
G
M
 
M
L
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
E
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
 
I
T
 
G
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
G
R
 
A
L
 
M
P
 
G
L
 
-
P
 
N
E
 
A
A
 
G
T
 
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
E
T
x
G
Y
x
F
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
P
E
 
E
R
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
A
 
E
G
 
A
T
 
L
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
Q
P
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
T
F
 
V
V
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1xkqA Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase of unknown function from caenorhabditis elegans with cofactor
30% identity, 97% coverage: 6:254/258 of query aligns to 3:261/272 of 1xkqA

query
sites
1xkqA
L
 
F
S
 
S
G
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
x
S
K
 
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
T
V
 
T
V
 
A
E
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
L
 
T
T
 
I
S
 
T
A
 
G
R
|
R
K
x
S
A
 
S
-
 
E
-
x
R
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
K
S
 
S
G
 
G
T
 
V
L
 
S
S
 
E
D
 
K
N
 
Q
L
 
V
-
 
N
L
 
S
V
 
V
Q
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
V
S
 
T
T
 
T
R
 
E
E
 
D
G
 
G
C
 
Q
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
S
T
 
T
R
 
L
Q
 
K
R
 
Q
L
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
x
A
G
|
G
G
 
A
S
 
A
S
 
I
A
 
P
P
 
D
G
 
A
G
 
F
G
 
G
F
 
T
A
 
T
A
 
G
L
 
T
D
 
D
E
 
Q
-
 
G
-
 
I
E
 
D
Q
 
I
W
 
Y
Q
 
H
R
 
K
E
 
T
L
 
L
N
 
K
L
|
L
N
 
N
L
 
L
F
 
Q
P
 
A
A
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
M
D
 
T
R
 
K
A
 
K
L
 
V
L
 
K
P
 
P
D
 
H
M
 
L
L
 
V
E
 
A
R
 
S
K
 
K
E
 
-
G
 
G
V
 
E
I
 
I
L
 
V
H
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
I
 
I
Q
 
V
S
 
A
R
 
G
L
 
P
P
 
Q
L
 
A
P
 
Q
E
 
P
A
 
D
T
x
F
T
 
L
A
 
Y
Y
|
Y
A
 
A
A
 
I
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
D
T
 
Q
Y
 
Y
S
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
T
S
 
A
K
 
I
E
 
D
V
 
L
S
 
A
P
 
K
K
 
F
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
N
R
 
S
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
M
V
|
V
E
 
E
T
|
T
E
x
G
A
x
F
S
 
T
V
 
N
A
 
A
L
 
M
A
 
G
-
 
M
-
 
P
E
x
D
R
 
Q
L
 
A
A
 
S
Q
 
Q
E
 
K
A
 
F
G
 
Y
T
 
N
D
 
F
Y
 
M
Q
 
A
G
 
S
G
 
H
K
 
K
Q
 
E
I
 
C
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
A
P
 
A
S
 
G
S
 
K
P
 
P
S
 
E
E
 
H
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
R
R
 
N
A
 
L
S
 
S
-
 
F
S
 
Y
I
 
I
T
 
L
G
 
G
S
 
Q
E
 
S
F
 
I
V
 
V
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
29% identity, 95% coverage: 9:253/258 of query aligns to 6:240/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
A
E
 
Q
L
 
Q
F
 
L
L
 
I
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
Q
 
F
V
 
V
L
 
V
T
 
G
S
 
T
A
 
A
R
x
T
K
 
S
A
 
E
S
 
S
G
 
G
T
 
A
-
 
Q
-
 
K
L
 
L
S
 
T
D
 
D
N
 
S
L
 
F
L
 
G
V
 
E
Q
 
Q
A
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
x
L
D
|
D
L
x
V
S
 
R
T
 
N
R
 
L
E
 
D
G
 
E
C
 
I
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
H
T
 
I
R
 
E
Q
 
Q
R
 
N
L
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
D
 
L
I
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
V
x
N
L
x
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
S
 
-
A
 
-
P
 
K
G
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
M
D
 
S
E
 
E
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
R
 
D
E
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
I
N
 
H
L
 
L
F
 
K
P
 
A
A
 
V
V
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
K
A
 
R
L
 
V
L
 
L
P
 
K
D
 
G
M
 
M
L
 
T
E
 
K
R
 
A
K
 
R
E
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
H
 
N
V
x
I
T
 
S
S
|
S
I
 
V
Q
 
V
S
 
A
R
 
H
L
 
F
P
 
A
L
 
N
P
 
P
E
 
-
A
 
G
T
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
I
S
 
E
T
 
A
Y
 
F
S
 
S
K
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
M
S
 
G
P
 
S
K
 
R
G
 
Q
V
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
R
 
S
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
M
S
 
T
V
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
D
L
 
I
A
 
R
Q
 
K
E
 
K
A
 
M
G
 
S
T
 
D
D
 
Q
Y
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
I
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
A
L
 
L
G
 
N
R
 
R
P
 
L
S
 
G
S
 
E
P
 
P
S
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
L
 
A
I
 
V
G
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
T
E
 
V
F
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Pf6N2E2_394 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_394
MLNLGLSGKRVLVTGGTKGIGKAVVELFLAEGAQVLTSARKASGTLSDNLLVQADLSTRE
GCDAVVAATRQRLGSVDIIVHVLGGSSAPGGGFAALDEEQWQRELNLNLFPAVRLDRALL
PDMLERKEGVILHVTSIQSRLPLPEATTAYAAAKAALSTYSKSLSKEVSPKGVRVVRVSP
GWVETEASVALAERLAQEAGTDYQGGKQIIMQALGGIPLGRPSSPSEVADLIGFLASPRA
SSITGSEFVIDGGTVPTA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory