SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_4681 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_4681 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
54% identity, 68% coverage: 4:271/392 of query aligns to 3:266/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
I
 
I
R
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
H
V
 
L
D
 
T
V
 
K
I
 
I
F
|
F
S
 
G
N
 
K
R
 
R
P
 
I
K
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
P
R
x
K
P
 
N
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
A
I
x
T
V
|
V
G
|
G
V
 
V
E
 
Y
K
 
D
A
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
E
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
F
V
 
V
L
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
R
L
 
L
N
 
I
T
 
E
V
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
I
F
 
F
V
 
I
E
 
D
H
 
N
E
 
Q
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
T
C
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
L
M
 
Q
M
 
V
R
 
R
T
 
R
K
 
K
R
 
T
I
 
M
A
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
M
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
V
Q
 
Q
G
 
N
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
R
V
 
A
D
 
E
E
 
K
K
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
T
 
L
Q
 
D
W
 
F
R
 
K
N
 
D
K
 
Q
K
 
Y
P
 
P
D
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
M
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
E
L
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
L
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
A
 
E
H
 
D
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
54% identity, 68% coverage: 4:271/392 of query aligns to 3:266/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
I
 
I
R
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
H
V
 
L
D
 
T
V
 
K
I
 
I
F
 
F
S
 
G
N
 
K
R
 
R
P
 
I
K
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
P
R
 
K
P
 
N
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
A
I
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
Y
K
 
D
A
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
E
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
F
V
 
V
L
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
R
L
 
L
N
 
I
T
 
E
V
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
I
F
 
F
V
 
I
E
 
D
H
 
N
E
 
Q
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
T
C
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
L
M
 
Q
M
 
V
R
 
R
T
 
R
K
 
K
R
 
T
I
 
M
A
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
M
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
V
Q
 
Q
G
 
N
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
R
V
 
A
D
 
E
E
 
K
K
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
T
 
L
Q
 
D
W
 
F
R
 
K
N
 
D
K
 
Q
K
 
Y
P
 
P
D
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
E
L
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
L
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
A
 
E
H
 
D
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
54% identity, 67% coverage: 4:265/392 of query aligns to 3:260/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
I
 
I
R
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
H
V
 
L
D
 
T
V
 
K
I
 
I
F
|
F
S
 
G
N
 
K
R
 
R
P
 
I
K
 
K
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
L
 
M
L
 
V
D
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
E
S
 
P
R
x
K
P
 
N
E
 
E
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
L
 
A
I
x
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
Y
K
 
D
A
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
E
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
C
 
F
V
 
V
L
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
R
L
 
L
N
 
I
T
 
E
V
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
I
F
 
F
V
 
I
E
 
D
H
 
N
E
 
Q
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
T
C
 
L
S
 
N
P
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
L
K
 
L
M
 
Q
M
 
V
R
 
R
T
 
R
K
 
K
R
 
T
I
 
M
A
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
M
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
S
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
V
Q
 
Q
G
 
N
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
R
V
 
A
D
 
E
E
 
K
K
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
T
 
L
Q
 
D
W
 
F
R
 
K
N
 
D
K
 
Q
K
 
Y
P
 
P
D
x
K
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
|
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
D
A
 
P
D
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
E
L
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
R
 
A
K
 
K
L
 
F
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
V
 
V
S
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
K

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
43% identity, 59% coverage: 43:275/392 of query aligns to 33:255/378 of P69874

query
sites
P69874
V
 
I
E
 
P
K
 
Q
A
 
L
S
 
D
L
 
L
S
 
T
I
 
I
E
 
N
K
 
N
G
 
G
E
 
E
I
x
F
C
 
L
V
 
T
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
D
R
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
I
F
 
M
V
x
L
E
 
D
H
 
N
E
 
E
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
I
A
 
T
S
 
H
C
 
V
S
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
N
K
 
R
M
 
Y
M
 
V
R
 
N
T
 
T
K
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
M
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
V
S
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
R
M
 
M
Q
 
Q
G
 
K
R
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
A
E
 
E
R
 
I
R
 
T
K
 
P
L
 
R
V
 
V
D
 
M
E
 
E
K
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
T
 
E
Q
 
T
W
 
F
R
 
A
N
 
Q
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
H
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
D
 
K
A
 
P
D
 
R
I
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
K
G
 
Q
L
 
M
Q
 
Q
D
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
A
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
L
 
L
Q
 
G
K
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
V
F
 
F
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
T
L
 
M
G
 
S
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
E
Q
 
Q
Y
 
D
S
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
V
 
Y
L
 
E
N
 
E
P
 
P
A
 
K
D
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
G
H
 
E
T
 
I
N
 
N
P
 
M
L
 
F
N
 
N

Sites not aligning to the query:

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
40% identity, 63% coverage: 33:277/392 of query aligns to 12:251/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
I
 
I
L
 
W
Q
 
K
Q
 
R
T
 
F
G
 
G
L
 
D
I
 
V
V
 
T
G
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
D
A
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
E
I
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
x
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
P
S
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
V
 
I
E
 
E
H
 
D
E
 
N
G
 
L
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
V
A
 
A
S
 
D
C
 
P
S
 
E
P
 
K
A
 
G
E
 
V
L
 
F
K
 
V
M
 
P
M
 
P
R
 
K
T
 
E
K
 
R
R
 
D
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
R
G
 
K
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
Q
E
 
E
R
 
I
R
 
D
K
 
K
L
 
R
V
 
V
D
 
R
E
 
E
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
I
M
 
R
D
 
R
A
 
P
D
 
K
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
K
L
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
L
 
L
Q
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
K
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
L
 
Y
N
 
K
P
 
P
A
 
V
D
 
N
D
 
T
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
G
H
 
-
T
 
S
N
 
P
P
 
P
L
 
M
N
 
N
V
 
F
L
 
L

1g291 Malk (see paper)
40% identity, 61% coverage: 38:277/392 of query aligns to 14:248/372 of 1g291

query
sites
1g291
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
T
G
 
A
V
 
V
E
 
R
K
 
E
A
 
M
S
 
S
L
 
L
S
 
E
I
 
V
E
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
M
V
 
I
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
x
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
P
S
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
V
 
I
E
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
D
Q
 
K
I
 
L
D
 
-
I
 
V
A
 
A
S
x
D
C
 
P
S
x
E
P
x
K
A
 
G
E
 
I
L
 
F
K
 
V
M
 
P
M
 
P
R
x
K
T
x
D
K
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
R
G
 
K
R
 
V
P
 
P
E
 
R
K
 
Q
E
 
E
R
 
I
R
 
D
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
R
E
 
E
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
D
 
K
A
 
P
D
 
Q
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
R
L
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
L
 
L
Q
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
M
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
R
G
 
G
K
 
V
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
S
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
V
V
x
Y
L
x
D
N
 
K
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
T
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
G
H
 
-
T
 
S
N
 
P
P
 
P
L
 
M
N
 
N
V
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 13:233/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
39% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 14:234/369 of P19566

query
sites
P19566
G
 
G
L
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
G
H
 
-
E
 
E
G
 
T
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
|
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
M
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
E
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
R
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
|
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 11:231/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
x
R
K
 
K
P
 
P
D
x
K
E
x
A
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
x
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

2awoA Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with adp-mg) (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 13:233/372 of 2awoA

query
sites
2awoA
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 13:233/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
x
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
x
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
x
A
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 13:233/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
x
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
x
A
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 13:233/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
 
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
K
 
V
L
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
x
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
x
A
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
x
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
38% identity, 59% coverage: 38:268/392 of query aligns to 14:234/371 of P68187

query
sites
P68187
G
 
G
L
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
E
 
K
K
 
D
A
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
E
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
V
V
 
V
L
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
E
 
-
H
 
G
E
 
E
G
 
K
R
 
R
Q
 
M
I
 
N
D
 
D
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
T
S
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
|
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
K
M
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
A
P
x
K
E
 
K
K
 
E
E
 
V
R
 
I
R
 
N
K
 
Q
L
 
R
V
|
V
D
 
N
E
 
Q
K
x
V
L
 
A
E
|
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
x
A
Q
 
H
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
|
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
A
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
F
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
I
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
A
T
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
M
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
S
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
H
N
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
x
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8hplC ABC transporter, ATP-binding protein SugC (see paper)
37% identity, 58% coverage: 42:268/392 of query aligns to 16:232/384 of 8hplC

query
sites
8hplC
G
x
A
V
 
V
E
 
K
K
 
E
A
 
F
S
 
S
L
 
M
S
 
T
I
 
I
E
 
A
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
I
V
 
I
L
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
L
F
 
R
V
 
I
E
 
G
H
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
E
Q
 
R
I
 
V
D
 
N
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
E
K
 
K
M
 
A
M
 
P
R
 
K
T
 
D
K
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
T
M
 
L
Q
 
A
G
 
K
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
T
L
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
S
Q
 
E
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
G
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
D
 
S
A
 
P
D
 
K
I
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8hprC ABC transporter, ATP-binding protein SugC (see paper)
32% identity, 83% coverage: 42:367/392 of query aligns to 18:342/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
G
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
E
A
 
F
S
 
S
L
 
M
S
 
T
I
 
I
E
 
A
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
I
V
 
I
L
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
L
F
 
R
V
 
I
E
 
G
H
 
G
E
 
E
G
 
R
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
V
E
 
N
L
 
E
K
 
K
M
 
A
M
 
P
R
 
K
T
 
D
K
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
T
M
 
L
Q
 
A
G
 
K
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
T
L
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
S
Q
 
E
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
 
R
K
 
K
P
 
P
D
x
G
E
x
Q
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
D
 
S
A
 
P
D
 
K
I
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
G
H
 
-
T
 
S
N
 
P
P
 
A
L
 
M
N
 
N
V
 
F
L
 
F
C
 
P
G
 
A
R
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
T
R
 
R
T
 
T
L
 
D
D
 
V
N
 
G
C
 
V
K
 
R
R
 
L
I
 
P
N
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
T
L
 
L
D
 
T
P
 
P
G
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
H
W
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
L
E
 
D
G
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
E
N
 
N
T
 
I
I
 
I
K
 
V
G
 
G
A
 
I
R
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
Q
 
E
N
 
D
G
 
S
A
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
A
L
 
L
Q
 
T
N
 
F
W
 
S
V
 
V
P
 
R
G
 
A
Q
 
D
A
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
D
P
 
K
T
 
Y
L
 
V
V
 
H
D
 
F
S
 
T
N
 
T
I
 
F
G
 
I
M
 
A
R
 
R
D
 
V
A
 
S
L
 
A
Q
 
D
I
 
S
R
 
R
Y
 
V
Q
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
E
K
 
Q
L
 
I
V
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8hprD ABC transporter, ATP-binding protein SugC (see paper)
37% identity, 58% coverage: 42:268/392 of query aligns to 18:234/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
G
 
A
V
 
V
E
 
K
K
 
E
A
 
F
S
 
S
L
 
M
S
 
T
I
 
I
E
 
A
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
I
V
 
I
L
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
 
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
N
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
I
S
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
E
L
 
L
F
 
R
V
 
I
E
 
G
H
 
G
E
 
E
G
 
R
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
V
E
 
N
L
 
E
K
 
K
M
 
A
M
 
P
R
 
K
T
 
D
K
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
M
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
T
M
 
L
Q
 
A
G
 
K
R
 
V
P
 
P
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
I
R
 
A
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
T
L
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
S
Q
 
E
W
 
L
R
 
L
N
 
D
K
x
R
K
 
K
P
 
P
D
x
G
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
D
 
S
A
 
P
D
 
K
I
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
M
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
V
G
 
Q
L
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
R
L
 
L
Q
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
Y
 
I
S
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
R
 
A
T
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
37% identity, 63% coverage: 35:279/392 of query aligns to 14:242/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
Q
 
K
Q
 
R
T
x
F
G
 
G
L
 
N
I
x
F
V
 
T
G
 
A
V
 
V
E
 
N
K
 
K
A
 
L
S
 
N
L
 
L
S
 
T
I
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
C
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
L
G
 
G
L
x
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
F
 
Y
V
 
F
E
 
G
H
 
D
E
 
R
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
V
A
 
T
S
 
Y
C
 
L
S
 
P
P
 
P
A
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
R
 
K
T
 
D
K
 
R
R
 
N
I
 
I
A
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
F
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
P
L
 
L
E
 
-
M
 
-
Q
 
K
G
 
K
R
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
D
E
 
E
R
 
I
R
 
D
K
 
K
L