SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_5026 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_5026 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ez3B Crystal structure acyl-coa dehydrogenase from brucella melitensis in complex with fad
51% identity, 98% coverage: 8:546/549 of query aligns to 1:539/541 of 5ez3B

query
sites
5ez3B
E
 
K
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
V
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
P
 
T
P
 
P
S
 
P
L
 
I
D
 
T
G
 
G
A
 
T
N
 
N
L
 
A
Y
 
Y
R
 
L
I
 
G
D
 
D
L
 
P
P
 
L
L
 
L
Q
 
M
Q
 
Q
W
 
I
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
P
A
 
K
G
 
E
W
 
L
A
 
H
Q
 
T
A
 
E
R
 
L
I
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
G
G
 
R
A
 
F
L
 
V
A
 
L
G
 
S
G
 
A
P
 
E
L
 
A
M
 
Q
E
 
D
A
 
L
G
 
A
F
 
R
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
N
 
E
K
 
L
P
 
P
V
 
K
F
 
L
S
 
R
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
R
Y
 
Q
G
 
G
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
Q
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
T
 
R
A
 
S
V
 
V
E
 
A
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
H
S
 
S
L
 
S
P
 
I
W
 
W
A
 
E
-
 
D
H
 
N
P
 
P
Q
 
L
P
 
E
G
 
S
A
 
G
-
 
R
-
 
R
H
 
H
V
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
A
M
 
R
T
 
F
Y
 
Y
L
 
L
H
 
T
S
 
A
Q
 
Q
A
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
H
G
 
L
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
M
 
M
T
 
T
F
 
S
A
 
A
S
 
S
V
 
L
P
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
M
L
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
V
A
 
Y
E
 
K
H
 
Q
W
 
W
V
 
S
P
 
P
K
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
R
E
 
K
Y
 
Y
D
 
D
P
 
F
R
 
S
N
 
Q
V
 
K
G
 
P
M
 
A
A
 
F
H
 
R
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
G
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
T
|
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
T
 
A
T
 
T
K
 
R
A
 
A
Y
 
E
P
 
P
V
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
A
P
 
I
G
 
G
Q
 
G
A
 
A
Y
 
W
E
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
 
M
S
|
S
A
 
A
P
 
P
M
 
M
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
D
 
K
K
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
H
 
L
R
 
G
P
 
E
D
 
K
D
 
G
T
 
E
R
 
S
N
 
N
Q
 
G
F
 
F
Y
 
F
I
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
F
 
F
R
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
G
W
 
Q
M
 
M
V
 
I
G
 
G
E
 
S
E
 
P
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
T
I
 
I
I
 
M
E
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
T
M
 
L
T
|
T
R
 
R
F
 
L
D
 
D
C
 
C
M
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
S
 
A
A
 
G
L
 
L
M
 
M
R
 
R
Q
 
S
A
 
G
L
 
L
T
 
A
Q
 
E
A
 
A
S
 
V
H
 
H
H
 
H
C
 
S
A
 
R
H
 
H
R
|
R
K
 
H
V
 
V
G
x
F
G
 
G
K
 
K
L
 
P
L
|
L
S
 
V
E
 
E
Q
|
Q
P
 
P
L
 
L
M
|
M
Q
 
Q
N
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
V
E
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
M
R
 
R
M
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
D
 
D
H
 
M
-
 
A
L
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
R
H
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
S
V
 
M
T
 
T
A
 
P
V
 
V
G
 
V
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
C
 
C
K
 
K
R
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
L
I
 
L
N
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
M
E
|
E
C
|
C
M
 
L
G
|
G
G
|
G
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
G
I
 
N
L
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
S
 
A
T
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
|
S
G
 
G
N
|
N
V
 
V
Q
 
M
C
 
A
L
|
L
D
 
D
V
 
V
L
 
A
R
|
R
A
 
V
L
 
L
S
 
S
K
 
R
E
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
D
V
 
W
L
 
I
F
 
S
S
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
P
R
 
R
L
 
G
A
 
Q
G
 
G
H
 
T
I
 
I
H
 
D
Q
 
V
L
 
L
H
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
L
K
 
Q
D
 
L
T
 
T
D
 
E
D
 
T
I
 
D
Q
 
Q
Y
 
G
R
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
A
V
 
F
G
 
A
L
 
A
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
R
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
N
 
A
S
 
D
D
 
D
V
 
I
S
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
L
G
 
W
R
 
R
-
 
T
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
M
L
 
L
P
 
D
R
 
A
G
 
R
L
 
H
N
 
N
V
 
A
E
 
M
A
 
R
I
 
I
V
 
I
T
 
D
R
 
Q
S
 
L
T
 
Y
P
 
P

P33224 Putative acyl-CoA dehydrogenase AidB; EC 1.3.99.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
47% identity, 84% coverage: 8:466/549 of query aligns to 4:461/541 of P33224

query
sites
P33224
E
 
Q
T
 
T
H
 
H
D
 
T
V
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
P
 
I
S
 
P
L
 
L
D
 
N
G
 
N
A
 
S
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
I
 
S
D
 
D
L
 
G
P
 
A
L
 
L
Q
 
C
Q
 
E
W
 
A
S
 
V
Q
 
T
R
 
R
F
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
W
A
 
D
Q
 
S
A
 
D
R
 
F
I
 
L
D
 
A
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
Q
-
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
T
G
 
A
P
 
E
L
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
R
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
V
N
 
N
K
 
P
P
 
P
V
 
E
F
 
L
S
 
L
S
 
R
H
 
Y
D
 
D
R
 
A
Y
 
Q
G
 
G
H
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
D
V
 
V
E
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
H
 
H
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
T
 
A
A
 
L
V
 
C
E
 
T
H
 
N
G
 
R
L
 
V
P
 
H
S
 
N
L
 
L
P
 
A
W
 
W
A
 
E
H
 
E
-
 
D
P
 
A
Q
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
A
M
 
R
T
 
F
Y
 
M
L
 
L
H
 
H
S
 
A
Q
 
Q
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
L
C
 
C
P
 
P
L
 
I
T
 
T
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
L
R
 
Q
L
 
M
Q
 
L
P
 
P
D
 
A
L
 
P
A
 
F
E
 
Q
H
 
D
W
 
W
V
 
T
P
 
T
K
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
D
E
 
R
Y
 
Y
D
 
D
P
 
S
R
 
H
N
 
L
V
 
L
G
 
P
M
 
G
A
 
G
H
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
L
L
 
I
G
 
G
M
|
M
A
x
G
M
|
M
T
|
T
E
|
E
K
|
K
Q
|
Q
G
|
G
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
V
R
 
M
A
 
S
N
 
N
T
 
T
T
 
T
K
 
R
A
 
A
Y
 
E
P
 
R
V
 
L
G
 
E
A
 
D
S
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
S
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
F
S
|
S
A
 
V
P
 
P
M
 
Q
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
H
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
D
 
A
K
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
F
L
 
V
P
 
P
R
 
R
H
 
F
R
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
G
T
 
Q
R
 
R
N
 
N
Q
 
A
F
 
I
Y
 
R
I
 
L
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
C
E
 
E
V
 
V
E
 
E
F
 
F
R
 
Q
G
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
G
W
 
W
M
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
R
T
 
L
I
 
I
I
 
L
E
 
K
M
 
M
V
 
G
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
M
 
A
V
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
A
 
A
L
 
M
M
 
M
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
S
 
I
H
 
Y
H
 
H
C
 
A
A
 
H
H
 
Q
R
 
R
K
 
H
V
 
V
G
 
F
G
 
G
K
 
N
L
 
P
L
 
L
S
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
M
 
M
Q
 
R
N
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
Q
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
L
L
 
F
R
 
R
M
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
W
D
 
D
H
 
R
L
 
R
S
 
A
D
 
D
E
 
A
H
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
L
F
 
W
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
A
G
 
A
K
 
K
Y
 
F
W
 
V
I
 
I
C
 
C
K
 
K
R
 
R
A
 
G
P
 
M
A
 
P
M
 
F
I
 
V
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
M
E
 
E
C
 
V
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
C
E
 
E
D
 
E
S
 
S
I
 
E
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
M
P
 
P
V
 
V
N
 
N
S
 
S
T
x
I
W
|
W
E
|
E
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
x
I
Q
x
M
C
|
C
L
|
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
L
 
L
S
 
N
K
 
K
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
V
 
L
L
 
L
F
 
S
S
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
V
D
 
E
G
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
Q
K
 
D
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3u33A Crystal structure of the e. Coli adaptive response protein aidb in the space group p3(2) (see paper)
47% identity, 84% coverage: 8:466/549 of query aligns to 4:461/540 of 3u33A

query
sites
3u33A
E
 
Q
T
 
T
H
 
H
D
 
T
V
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
P
 
P
P
 
I
S
 
P
L
 
L
D
 
N
G
 
N
A
 
S
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
I
 
S
D
 
D
L
 
G
P
 
A
L
 
L
Q
 
C
Q
 
E
W
 
A
S
 
V
Q
 
T
R
 
R
F
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
W
A
 
D
Q
 
S
A
 
D
R
 
F
I
 
L
D
 
A
A
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
Q
-
 
Q
L
 
L
A
 
G
G
 
T
G
 
A
P
 
E
L
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
R
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
V
N
 
N
K
 
P
P
 
P
V
 
E
F
 
L
S
 
L
S
 
R
H
 
Y
D
 
D
R
 
A
Y
 
Q
G
 
G
H
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
D
V
 
V
E
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
H
 
H
Q
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
Q
T
 
A
A
 
L
V
 
C
E
 
T
H
 
N
G
 
R
L
 
V
P
 
H
S
 
N
L
 
L
P
 
A
W
 
W
A
 
E
H
 
E
-
 
D
P
 
A
Q
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
S
 
A
M
 
R
T
 
F
Y
 
M
L
 
L
H
 
H
S
 
A
Q
 
Q
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
L
C
 
C
P
 
P
L
 
I
T
 
T
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
S
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
L
L
 
L
-
 
L
R
 
Q
L
 
M
Q
 
L
P
 
P
D
 
A
L
 
P
A
 
F
E
 
Q
H
 
D
W
 
W
V
 
T
P
 
T
K
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
D
E
 
R
Y
 
Y
D
 
D
P
 
S
R
 
H
N
 
L
V
 
L
G
 
P
M
 
G
A
 
G
H
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
V
 
L
T
 
L
L
 
I
G
 
G
M
|
M
A
 
G
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
V
R
 
M
A
 
S
N
 
N
T
 
T
T
 
T
K
 
R
A
 
A
Y
 
E
P
 
R
V
 
L
G
 
E
A
 
D
S
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
S
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
 
F
S
|
S
A
 
V
P
 
P
M
 
Q
C
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
H
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
D
 
A
K
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
C
F
 
F
L
 
F
L
 
V
P
 
P
R
 
R
H
 
F
R
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
G
T
 
Q
R
 
R
N
 
N
Q
 
A
F
 
I
Y
 
R
I
 
L
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
R
S
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
C
E
 
E
V
 
V
E
 
E
F
 
F
R
 
Q
G
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
G
W
 
W
M
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
R
T
 
L
I
 
I
I
 
L
E
 
K
M
 
M
V
 
G
A
 
G
M
 
M
T
|
T
R
 
R
F
 
F
D
 
D
C
 
C
M
 
A
V
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
A
 
A
L
 
M
M
 
M
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
S
 
I
H
 
Y
H
 
H
C
 
A
A
 
H
H
 
Q
R
|
R
K
 
H
V
 
V
G
x
F
G
 
G
K
 
N
L
 
P
L
|
L
S
 
I
E
 
Q
Q
|
Q
P
 
P
L
 
L
M
|
M
Q
 
R
N
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
R
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
Q
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
L
L
 
F
R
 
R
M
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
W
D
 
D
H
 
R
L
 
R
S
 
A
D
 
D
E
 
A
H
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
L
F
 
W
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
F
T
 
T
A
 
P
V
 
A
G
 
A
K
 
K
Y
 
F
W
 
V
I
 
I
C
 
C
K
 
K
R
 
R
A
 
G
P
 
M
A
 
P
M
 
F
I
 
V
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
M
E
|
E
C
x
V
M
 
L
G
|
G
G
|
G
A
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
C
E
 
E
D
 
E
S
 
S
I
 
E
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
A
 
M
P
 
P
V
 
V
N
 
N
S
 
S
T
 
I
W
|
W
E
|
E
G
|
G
S
|
S
G
 
G
N
|
N
V
 
I
Q
 
M
C
 
C
L
|
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
L
 
L
S
 
N
K
 
K
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
V
 
L
L
 
L
F
 
S
S
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
V
D
 
E
G
 
V
H
 
K
G
 
G
D
 
Q
K
 
D
R
 
R

6sdaB Bd2924 c10 acyl-coenzymea bound form (see paper)
33% identity, 70% coverage: 65:447/549 of query aligns to 57:444/503 of 6sdaB

query
sites
6sdaB
A
 
A
N
 
E
Q
 
S
N
 
Q
K
 
P
P
 
P
V
 
V
F
 
H
S
 
V
S
 
P
H
 
F
D
 
D
R
 
P
Y
 
W
G
 
G
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
D
V
 
I
E
 
K
F
 
T
H
 
S
P
 
H
A
 
G
Y
 
W
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
L
 
I
P
 
V
S
 
A
L
 
T
P
 
A
W
 
Y
A
 
D
H
 
R
P
 
R
Q
 
F
P
 
G
G
 
A
A
 
A
-
 
S
H
 
R
V
 
V
A
 
Y
R
 
Q
A
 
M
S
 
A
M
 
L
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
H
 
Y
S
 
S
Q
 
P
A
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
I
T
 
F
G
 
S
C
|
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
M
 
M
T
 
T
F
 
D
A
 
G
S
 
A
V
 
A
P
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
E
L
 
L
-
 
Y
-
 
A
Q
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
A
H
 
R
W
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
H
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
R
E
 
-
Y
 
-
D
 
D
P
 
P
R
 
K
N
 
T
V
 
F
G
 
W
M
 
T
A
 
A
H
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
T
G
 
G
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
V
R
 
S
A
 
G
N
 
T
T
 
S
T
 
T
K
 
D
A
 
A
Y
 
H
P
 
P
-
 
F
V
 
T
G
 
G
A
 
T
S
 
S
G
 
E
P
 
F
G
 
G
Q
 
A
A
 
T
Y
 
H
E
 
S
L
 
L
V
 
H
G
 
G
H
 
T
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
T
S
 
S
A
 
A
P
 
T
M
 
T
C
 
S
D
 
Q
A
 
M
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
T
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
x
S
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
F
L
 
L
P
 
E
R
 
L
H
 
R
R
 
N
P
 
D
D
 
K
D
 
G
T
 
E
R
 
L
N
 
N
Q
 
H
F
 
I
Y
 
Q
I
 
I
Q
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
T
C
 
K
S
 
A
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
S
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
T
L
 
P
A
 
A
W
 
R
M
 
M
V
 
I
G
 
G
E
 
G
E
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
|
V
P
 
K
T
 
R
I
 
I
I
x
A
E
 
S
M
 
V
V
x
L
A
x
N
M
 
I
T
|
T
R
|
R
F
 
I
D
 
Y
C
 
N
M
 
S
V
 
I
G
 
C
S
 
A
S
 
V
A
 
G
L
 
H
M
 
I
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
S
 
Q
H
 
D
H
 
Y
C
 
S
A
 
G
H
 
K
R
|
R
K
 
Q
V
 
A
G
x
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
|
L
S
 
K
E
 
D
Q
x
H
P
 
P
L
 
L
M
 
H
Q
 
K
N
 
S
V
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
E
L
 
A
E
 
D
S
 
F
E
 
R
A
 
K
A
 
C
L
 
I
A
 
A
L
 
F
S
 
S
L
 
F
R
 
F
M
 
V
G
 
A
R
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
G
H
 
Q
L
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
S
 
A
D
 
S
E
 
A
H
 
S
E
 
E
A
 
K
K
 
I
F
 
L
A
 
L
R
|
R
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
P
V
 
I
G
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
I
 
T
C
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
S
P
 
I
A
 
H
M
 
I
I
 
S
N
 
S
E
 
E
A
 
V
A
 
V
E
|
E
C
x
M
M
 
F
G
 
G
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
Q
V
 
V
N
 
F
S
 
S
T
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
|
N
V
 
V
Q
 
L
C
 
S
L
|
L
D
 
D
V
 
M
L
 
L
R
|
R
A
 
A
L
 
F
S
 
E
K
 
K
E
 
D

6sd8X Bd2924 apo-form (see paper)
33% identity, 70% coverage: 65:447/549 of query aligns to 57:444/503 of 6sd8X

query
sites
6sd8X
A
 
A
N
 
E
Q
 
S
N
 
Q
K
 
P
P
 
P
V
 
V
F
 
H
S
 
V
S
 
P
H
 
F
D
 
D
R
 
P
Y
 
W
G
 
G
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
D
V
 
I
E
 
K
F
 
T
H
 
S
P
 
H
A
 
G
Y
 
W
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
M
 
E
R
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
L
 
I
P
 
V
S
 
A
L
 
T
P
 
A
W
 
Y
A
 
D
H
 
R
P
 
R
Q
 
F
P
 
G
G
 
A
A
 
A
-
 
S
H
 
R
V
 
V
A
 
Y
R
 
Q
A
 
M
S
 
A
M
 
L
T
 
L
Y
 
Y
L
 
L
H
 
Y
S
 
S
Q
 
P
A
 
S
E
 
S
A
 
A
G
 
I
T
 
F
G
 
S
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
M
 
M
T
 
T
F
 
D
A
 
G
S
 
A
V
 
A
P
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
E
L
 
L
-
 
Y
-
 
A
Q
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
A
H
 
R
W
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
H
V
 
L
L
 
L
A
 
S
T
 
R
E
 
-
Y
 
-
D
 
D
P
 
P
R
 
K
N
 
T
V
 
F
G
 
W
M
 
T
A
 
A
H
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
R
Q
 
T
G
|
G
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
V
R
 
S
A
 
G
N
 
T
T
 
S
T
 
T
K
 
D
A
 
A
Y
 
H
P
 
P
-
 
F
V
 
T
G
 
G
A
 
T
S
 
S
G
 
E
P
 
F
G
 
G
Q
 
A
A
 
T
Y
 
H
E
 
S
L
 
L
V
 
H
G
 
G
H
 
T
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
T
S
 
S
A
 
A
P
 
T
M
 
T
C
 
S
D
 
Q
A
 
M
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
T
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
S
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
F
L
 
L
P
 
E
R
 
L
H
 
R
R
 
N
P
 
D
D
 
K
D
 
G
T
 
E
R
 
L
N
 
N
Q
 
H
F
 
I
Y
 
Q
I
 
I
Q
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
T
C
 
K
S
 
A
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
S
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
T
L
 
P
A
 
A
W
 
R
M
 
M
V
 
I
G
 
G
E
 
G
E
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
R
I
 
I
I
 
A
E
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
N
M
 
I
T
|
T
R
 
R
F
 
I
D
 
Y
C
 
N
M
 
S
V
 
I
G
 
C
S
 
A
S
 
V
A
 
G
L
 
H
M
 
I
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
D
Q
 
L
A
 
A
S
 
Q
H
 
D
H
 
Y
C
 
S
A
 
G
H
 
K
R
|
R
K
 
Q
V
 
A
G
x
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
|
L
S
 
K
E
 
D
Q
x
H
P
 
P
L
 
L
M
 
H
Q
 
K
N
 
S
V
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
E
L
 
A
E
 
D
S
 
F
E
 
R
A
 
K
A
 
C
L
 
I
A
 
A
L
 
F
S
 
S
L
 
F
R
 
F
M
 
V
G
 
A
R
 
N
A
 
L
L
 
L
D
 
G
H
 
Q
L
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
S
 
A
D
 
S
E
 
A
H
 
S
E
 
E
A
 
K
K
 
I
F
 
L
A
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
P
V
 
I
G
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
I
 
T
C
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
S
P
 
I
A
 
H
M
 
I
I
 
S
N
 
S
E
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
E
C
x
M
M
 
F
G
 
G
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
G
L
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
Q
V
 
V
N
 
F
S
 
S
T
 
I
W
|
W
E
 
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
 
N
V
|
V
Q
 
L
C
 
S
L
|
L
D
 
D
V
 
M
L
 
L
R
|
R
A
 
A
L
 
F
S
 
E
K
 
K
E
 
D

4y9jB Crystal structure of caenorhabditis elegans acdh-11 in complex with c11-coa (see paper)
30% identity, 88% coverage: 45:526/549 of query aligns to 52:525/593 of 4y9jB

query
sites
4y9jB
A
 
A
R
 
D
I
 
L
D
 
S
A
 
K
Y
 
F
G
 
G
A
 
D
L
 
R
A
 
I
G
 
T
G
 
S
P
 
E
L
 
V
M
 
E
E
 
H
A
 
L
G
 
G
F
 
R
L
 
Q
A
 
A
N
 
E
Q
 
L
N
 
E
K
 
Q
P
 
P
V
 
R
F
 
L
S
 
E
S
 
H
H
 
Q
D
 
D
R
 
A
Y
 
W
G
 
G
H
 
K
R
 
R
I
 
V
D
 
D
L
 
K
V
 
L
E
 
I
F
 
V
H
 
C
P
 
N
A
 
E
Y
 
W
H
 
H
Q
 
K
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
T
 
I
A
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
L
 
V
P
 
I
S
 
S
L
 
I
P
 
G
W
 
Y
A
 
E
H
 
D
P
 
S
-
 
V
Q
 
D
P
 
P
G
 
F
A
 
V
H
 
R
-
 
R
V
 
I
A
 
H
R
 
Q
A
 
V
S
 
A
M
 
K
T
 
L
Y
 
F
L
 
L
H
 
F
S
 
S
Q
 
P
A
 
S
E
 
A
A
 
G
G
 
L
T
 
V
G
x
S
C
 
C
P
 
P
L
 
M
T
x
A
M
 
M
T
 
T
F
 
D
A
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
T
L
 
S
Q
 
L
P
 
N
D
 
L
L
 
Y
A
 
G
E
 
K
H
 
H
W
 
-
V
 
-
P
 
-
K
 
-
V
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
Y
 
A
D
 
V
P
 
D
R
 
R
N
 
L
V
 
R
G
 
S
M
 
R
A
 
D
H
 
P
K
 
S
A
 
K
G
 
A
V
 
W
T
 
T
L
 
S
G
 
G
M
x
Q
A
 
W
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
V
R
 
-
A
 
A
N
 
G
T
 
G
T
 
C
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
P
 
A
V
 
V
G
 
Q
A
 
I
S
 
D
G
 
K
P
 
-
G
 
-
Q
 
D
A
 
T
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
H
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
W
 
W
F
|
F
C
x
S
S
|
S
A
 
A
P
 
V
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
T
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
G
D
x
S
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
K
R
 
I
H
 
R
R
 
D
P
 
E
D
 
S
D
 
G
T
 
N
R
 
L
N
 
N
Q
 
G
F
 
I
Y
 
Q
I
 
M
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
T
C
 
K
S
 
Q
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
W
 
E
M
 
R
V
 
I
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
|
R
G
 
G
V
|
V
P
 
A
T
 
G
I
 
I
I
x
S
E
 
N
M
 
M
V
x
L
A
x
N
M
 
I
T
|
T
R
|
R
F
 
I
D
 
H
C
 
N
M
 
A
V
 
V
G
x
A
S
 
S
S
 
L
A
 
G
L
 
Y
M
 
M
R
 
R
Q
 
R
A
 
I
L
 
I
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
S
 
R
H
 
D
H
 
Y
C
 
S
A
 
T
H
 
K
R
|
R
K
 
V
V
|
V
G
x
F
G
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
x
Q
S
 
S
E
 
K
Q
 
W
P
 
P
L
 
L
M
 
H
Q
 
T
N
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
M
A
 
E
L
 
V
E
 
D
S
 
T
E
 
R
A
 
G
A
 
S
L
 
M
A
 
L
L
 
L
S
 
L
L
 
F
R
 
E
M
 
A
G
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
L
D
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
A
H
 
G
L
 
K
S
 
S
D
 
S
E
 
D
H
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
M
F
 
M
A
 
L
R
|
R
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
P
V
 
V
G
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
I
 
A
C
 
G
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
P
 
V
A
 
P
M
 
M
I
 
V
N
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
I
E
|
E
C
|
C
M
 
F
G
|
G
G
|
G
A
 
Q
G
 
G
Y
|
Y
V
 
M
E
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
T
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
Q
V
 
V
N
 
T
S
 
P
T
 
I
W
|
W
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
T
N
 
N
V
|
V
Q
 
L
C
 
S
L
|
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
|
R
A
 
V
L
 
F
S
 
S
K
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
L
V
 
A
L
 
-
F
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
F
A
 
G
G
 
K
H
 
R
I
 
V
H
 
E
Q
 
Q
L
 
L
H
 
L
A
 
G
A
 
N
F
 
T
K
 
K
D
 
T
T
 
E
D
 
D
D
 
E
I
 
K
Q
 
L
Y
 
K
R
 
K
A
 
S
R
 
K
Q
 
E
L
 
A
T
 
V
E
 
E
D
 
S
I
 
A
A
 
L
V
 
K
G
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
K
A
 
A
G
 
S
N
 
D
S
 
S
D
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
G
A
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
I
G
 
D
S
 
S
V
 
V
G
 
A
R
 
R

Q9XWZ2 Acyl-CoA dehydrogenase family member 11; EC 1.3.99.- from Caenorhabditis elegans (see paper)
30% identity, 88% coverage: 45:526/549 of query aligns to 70:543/617 of Q9XWZ2

query
sites
Q9XWZ2
A
 
A
R
 
D
I
 
L
D
 
S
A
 
K
Y
 
F
G
 
G
A
 
D
L
 
R
A
 
I
G
 
T
G
 
S
P
 
E
L
 
V
M
 
E
E
 
H
A
 
L
G
 
G
F
 
R
L
 
Q
A
 
A
N
x
E
Q
 
L
N
 
E
K
 
Q
P
 
P
V
 
R
F
 
L
S
 
E
S
 
H
H
 
Q
D
 
D
R
 
A
Y
 
W
G
 
G
H
 
K
R
 
R
I
 
V
D
 
D
L
 
K
V
 
L
E
 
I
F
 
V
H
 
C
P
 
N
A
 
E
Y
 
W
H
 
H
Q
 
K
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
T
 
I
A
 
C
V
 
A
E
 
E
H
 
E
G
 
G
L
 
V
P
 
I
S
 
S
L
 
I
P
 
G
W
 
Y
A
 
E
H
 
D
P
 
S
-
 
V
Q
 
D
P
 
P
G
 
F
A
 
V
H
 
R
-
 
R
V
 
I
A
 
H
R
 
Q
A
 
V
S
 
A
M
 
K
T
 
L
Y
 
F
L
 
L
H
 
F
S
 
S
Q
 
P
A
x
S
E
 
A
A
x
G
G
 
L
T
 
V
G
 
S
C
 
C
P
 
P
L
 
M
T
 
A
M
 
M
T
 
T
F
 
D
A
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
T
L
 
S
Q
 
L
P
 
N
D
 
L
L
 
Y
A
 
G
E
 
K
H
 
H
W
 
-
V
 
-
P
 
-
K
 
-
V
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
Y
 
A
D
 
V
P
 
D
R
 
R
N
 
L
V
 
R
G
 
S
M
 
R
A
 
D
H
 
P
K
 
S
A
 
K
G
 
A
V
 
W
T
 
T
L
 
S
G
 
G
M
 
Q
A
 
W
M
 
M
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
G
|
G
T
 
S
D
 
D
V
 
V
R
 
-
A
 
A
N
 
G
T
 
G
T
 
C
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
P
 
A
V
 
V
G
 
Q
A
 
I
S
 
D
G
 
K
P
 
-
G
 
-
Q
 
D
A
 
T
Y
 
Y
E
 
R
L
 
L
V
 
H
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
W
 
W
F
 
F
C
 
S
S
 
S
A
 
A
P
 
V
M
 
D
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
T
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
G
D
 
S
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
K
R
 
I
H
 
R
R
 
D
P
 
E
D
 
S
D
 
G
T
 
N
R
 
L
N
 
N
Q
 
G
F
 
I
Y
 
Q
I
 
M
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
T
C
 
K
S
 
Q
N
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
W
 
E
M
 
R
V
 
I
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
A
T
 
G
I
 
I
I
 
S
E
 
N
M
 
M
V
 
L
A
 
N
M
 
I
T
 
T
R
 
R
F
 
I
D
 
H
C
 
N
M
 
A
V
 
V
G
 
A
S
 
S
S
 
L
A
 
G
L
 
Y
M
 
M
R
 
R
Q
 
R
A
 
I
L
 
I
T
 
S
Q
 
L
A
 
A
S
 
R
H
 
D
H
 
Y
C
 
S
A
 
T
H
 
K
R
 
R
K
 
V
V
 
V
G
 
F
G
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
 
Q
S
 
S
E
 
K
Q
 
W
P
 
P
L
 
L
M
 
H
Q
 
T
N
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
K
L
 
M
A
 
E
L
 
V
E
 
D
S
 
T
E
 
R
A
 
G
A
 
S
L
 
M
A
 
L
L
 
L
S
 
L
L
 
F
R
 
E
M
 
A
G
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
L
D
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
A
H
 
G
L
 
K
S
 
S
D
 
S
E
 
D
H
 
V
E
 
E
A
 
A
K
 
M
F
 
M
A
 
L
R
 
R
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
P
V
 
V
G
 
L
K
 
K
Y
 
L
W
 
Y
I
 
A
C
 
G
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
P
 
V
A
 
P
M
 
M
I
 
V
N
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
I
E
 
E
C
 
C
M
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
G
|
G
Y
 
Y
V
 
M
E
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
T
L
 
L
Y
 
L
R
|
R
E
 
D
A
 
A
P
 
Q
V
 
V
N
 
T
S
 
P
T
 
I
W
 
W
E
 
E
G
 
G
S
 
T
G
 
T
N
 
N
V
 
V
Q
 
L
C
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
V
L
 
F
S
 
S
K
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
L
V
 
A
L
 
-
F
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
F
A
 
G
G
 
K
H
 
R
I
 
V
H
 
E
Q
 
Q
L
 
L
H
 
L
A
 
G
A
 
N
F
 
T
K
 
K
D
 
T
T
 
E
D
 
D
D
 
E
I
 
K
Q
 
L
Y
 
K
R
 
K
A
 
S
R
 
K
Q
 
E
L
 
A
T
 
V
E
 
E
D
 
S
I
 
A
A
 
L
V
 
K
G
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
K
A
 
A
G
 
S
N
 
D
S
 
S
D
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
G
A
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
I
G
 
D
S
 
S
V
 
V
G
 
A
R
 
R

2pg0A Crystal structure of acyl-coa dehydrogenase from geobacillus kaustophilus
25% identity, 53% coverage: 155:444/549 of query aligns to 107:378/380 of 2pg0A

query
sites
2pg0A
E
 
Q
H
 
K
W
 
W
V
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
C
L
 
V
A
 
T
T
 
G
E
 
E
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
L
T
 
I
L
 
T
G
 
A
M
x
I
A
 
A
M
|
M
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
G
G
 
A
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
L
R
 
A
A
 
N
N
 
I
T
 
S
T
 
T
K
 
T
A
 
A
Y
 
V
P
 
K
V
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
D
G
 
G
Q
 
D
A
 
Y
Y
 
Y
E
 
I
L
 
V
V
 
N
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
T
F
|
F
C
x
I
S
x
T
A
 
N
P
 
G
M
 
I
-
 
H
C
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
I
L
 
V
T
 
V
L
 
A
A
 
C
Q
 
K
T
 
T
D
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
P
-
 
H
K
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
L
F
 
L
L
 
V
L
 
V
P
 
E
R
 
R
H
 
D
R
 
T
P
 
P
D
 
G
D
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
G
Q
 
-
F
 
-
Y
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
K
K
 
L
N
 
E
K
 
K
L
 
V
G
 
G
N
 
L
C
 
H
S
 
A
N
 
Q
A
 
D
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
L
E
 
F
F
 
F
R
 
Q
G
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
W
 
N
M
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
F
P
 
Y
T
 
Y
I
 
L
I
 
M
E
 
E
M
 
K
V
 
L
A
 
Q
M
 
Q
T
x
E
R
 
R
F
 
L
D
 
V
C
 
V
M
 
A
V
 
I
G
 
A
S
 
A
S
 
Q
A
 
T
L
 
A
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
A
 
M
L
 
F
T
 
S
Q
 
L
A
 
T
S
 
K
H
 
Q
H
 
Y
C
 
V
A
 
K
H
 
Q
R
|
R
K
 
T
V
 
A
G
x
F
G
 
G
K
 
K
L
 
R
L
 
V
S
 
S
E
 
E
Q
x
F
P
 
Q
L
 
T
M
 
V
Q
 
Q
N
 
F
V
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
M
A
 
A
L
 
T
E
 
E
S
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
I
R
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
T
-
 
F
L
 
V
D
 
D
H
 
R
L
 
V
S
 
I
D
 
E
E
 
E
H
 
H
E
 
M
A
 
A
K
 
G
F
 
-
A
 
K
R
 
Q
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
E
V
 
V
-
 
S
-
 
M
G
 
A
K
 
K
Y
 
W
W
 
W
I
 
I
C
 
T
K
 
E
R
 
M
A
 
A
P
 
K
A
 
R
M
 
V
I
 
A
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
M
E
x
Q
C
x
L
M
 
H
G
|
G
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
E
 
E
D
 
E
S
 
Y
I
 
E
L
 
I
P
 
A
R
 
R
L
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
A
 
I
P
 
P
V
|
V
N
 
S
S
 
A
T
x
I
W
x
Y
E
x
A
G
 
G
S
x
T
G
 
N
N
x
E
V
x
M
Q
 
M
C
 
K
L
 
T
D
 
I
V
 
I
L
 
A
R
|
R
A
 
Q
L
 
L

A3SI50 3-methylmercaptopropionyl-CoA dehydrogenase; MMPA-CoA dehydrogenase; EC 1.3.99.41 from Roseovarius nubinhibens (strain ATCC BAA-591 / DSM 15170 / ISM) (see paper)
26% identity, 54% coverage: 183:480/549 of query aligns to 161:491/591 of A3SI50

query
sites
A3SI50
M
|
M
A
 
N
M
 
L
T
 
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
H
G
 
C
G
 
G
T
|
T
D
 
D
V
 
L
R
 
G
A
 
L
N
 
M
T
 
R
T
 
S
K
 
K
A
 
A
Y
 
V
P
 
P
V
 
Q
G
 
D
A
 
D
S
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
S
Y
 
Y
E
 
A
L
 
I
V
 
S
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
I
F
|
F
C
 
I
S
|
S
A
 
A
P
 
G
M
 
E
C
 
H
D
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
I
A
 
I
F
 
H
L
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
T
 
I
D
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
I
K
|
K
G
 
G
L
 
V
T
 
S
C
 
L
F
 
F
L
 
I
L
 
V
P
 
P
R
 
K
H
 
F
-
 
L
-
 
V
R
 
K
P
 
E
D
 
D
D
 
G
T
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
E
R
 
R
N
 
N
Q
 
G
F
 
V
Y
 
K
I
 
C
Q
 
S
R
 
K
L
 
I
K
 
E
N
 
E
K
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
I
C
 
H
S
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
T
S
 
C
E
 
V
V
 
M
E
 
D
F
 
Y
R
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
W
 
W
M
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
x
H
R
x
K
G
 
G
V
 
M
P
x
R
T
 
A
I
 
M
I
x
F
E
 
T
M
 
M
V
 
M
A
 
N
M
 
E
T
 
A
R
 
R
F
 
I
D
 
G
C
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
Q
-
 
G
M
 
L
V
 
A
G
 
Q
S
 
A
S
 
E
A
 
V
L
 
A
M
 
Y
R
 
Q
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
D
Q
 
Y
A
 
A
S
 
R
H
 
D
H
 
R
C
 
L
A
 
Q
H
 
G
R
 
R
K
 
S
V
 
V
G
 
T
G
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
D
L
 
P
L
 
L
S
 
I
E
 
V
Q
 
H
P
 
P
L
 
D
M
 
I
Q
 
R
N
 
R
V
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
L
 
Q
A
 
K
L
 
S
E
 
F
S
 
I
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
R
A
 
A
L
 
F
S
 
L
L
 
L
R
 
W
M
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
M
L
 
I
D
 
D
H
 
R
L
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
G
S
 
K
D
 
D
E
 
E
H
 
A
E
 
A
A
 
H
K
 
G
F
 
M
A
 
V
R
 
S
L
 
L
V
 
L
T
 
T
A
 
P
V
 
V
G
 
I
K
 
K
Y
 
G
W
 
F
I
 
L
C
 
T
K
 
D
R
 
E
A
 
G
P
 
Y
A
 
D
M
 
M
I
 
T
N
 
V
E
 
Q
A
 
A
A
 
Q
E
 
Q
C
 
V
M
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
H
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
D
 
E
S
 
T
I
 
G
L
 
M
P
 
S
R
 
Q
L
 
F
Y
 
T
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
R
V
 
I
N
 
A
S
 
M
T
 
I
W
x
Y
E
|
E
G
 
G
S
 
A
G
 
N
N
 
G
V
 
V
Q
 
Q
C
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
V
-
 
G
R
|
R
A
 
K
L
 
L
S
 
A
K
 
Q
E
 
D
P
 
G
G
 
G
V
 
K
L
 
H
E
 
V
V
 
M
L
 
A
F
 
F
S
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
V
D
 
K
G
 
G
H
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
G
 
T
D
 
D
K
 
G
R
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
E
H
 
F
I
 
T
H
 
E
Q
 
P
L
 
L
H
 
K
A
 
S
A
 
A
F
 
S
K
 
K
D
 
D

2dvlA Crystal structure of project tt0160 from thermus thermophilus hb8
27% identity, 48% coverage: 185:446/549 of query aligns to 121:370/370 of 2dvlA

query
sites
2dvlA
M
x
L
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
Q
G
 
A
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
 
S
N
 
L
T
 
R
T
 
A
K
 
E
A
 
A
Y
 
R
P
 
R
V
 
V
G
 
K
A
 
G
S
 
G
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
F
E
 
V
L
 
L
V
 
N
G
 
G
H
 
V
K
 
K
-
 
S
W
|
W
F
x
I
C
x
T
S
 
S
A
 
A
P
 
G
M
 
H
C
 
A
D
 
H
A
 
L
F
 
Y
L
 
V
T
 
V
L
 
M
A
 
A
Q
 
R
T
 
T
D
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
E
R
 
K
H
 
G
R
 
T
P
 
P
D
 
G
D
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
L
Y
 
S
I
 
F
Q
 
G
R
 
R
L
 
P
K
 
E
N
 
E
K
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
L
C
 
H
S
 
A
N
 
A
A
 
H
S
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
R
F
 
L
R
 
E
G
 
E
A
 
V
L
 
F
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
E
W
 
N
M
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
L
P
 
A
T
 
Y
I
 
A
I
 
L
E
 
A
M
 
G
V
 
L
A
 
D
M
 
S
T
x
G
R
 
R
F
 
V
D
 
G
C
 
V
M
 
A
V
 
A
G
 
Q
S
 
A
S
 
V
A
 
G
L
 
I
M
 
A
R
 
R
Q
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
E
Q
 
I
A
 
A
S
 
K
H
 
A
H
 
Y
C
 
A
A
 
E
H
 
E
R
 
R
K
 
E
V
 
Q
G
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
K
L
 
L
S
 
K
E
 
E
Q
 
H
P
 
Q
L
 
A
M
 
I
Q
 
A
N
 
F
V
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
H
L
 
V
E
 
K
S
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
V
L
 
L
R
 
E
M
 
A
G
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
K
D
 
D
H
 
R
L
 
G
S
 
E
D
 
-
E
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
R
F
 
F
A
 
T
R
 
-
L
 
L
V
 
E
T
 
A
A
 
S
V
 
A
G
 
A
K
 
K
Y
 
L
W
 
F
I
 
A
C
 
S
K
 
A
R
 
A
A
 
A
P
 
V
A
 
E
M
 
V
I
 
T
N
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
C
 
V
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
V
 
H
E
 
R
D
 
D
S
 
Y
I
 
R
L
 
V
P
 
E
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
A
 
A
P
 
K
V
 
V
N
 
T
S
 
E
T
 
I
W
 
Y
E
|
E
G
 
G
S
x
T
G
 
S
N
x
E
V
 
I
Q
 
Q
C
 
R
L
 
L
D
 
V
V
 
I
L
 
A
R
|
R
A
 
E
L
 
L
S
 
Y
K
 
R

7p9xA Structure of cyclohex-1-ene-1-carboxyl-coa dehydrogenase complexed with cyclohex-1-ene-1-carboxyl-coa (see paper)
23% identity, 54% coverage: 151:444/549 of query aligns to 100:375/378 of 7p9xA

query
sites
7p9xA
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
H
 
R
W
 
Y
V
 
L
P
 
R
K
 
R
V
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
F
A
 
A
H
 
G
K
 
E
A
 
S
G
 
T
V
 
L
T
 
L
L
 
T
G
 
A
M
 
L
A
 
A
M
x
A
T
|
T
E
 
E
K
 
P
Q
 
A
G
 
A
G
|
G
T
x
S
D
 
D
V
x
L
R
 
L
A
 
A
N
 
M
T
 
K
T
 
T
K
 
R
A
 
A
Y
 
V
P
 
R
V
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
Q
G
 
G
Q
 
D
A
 
K
Y
 
Y
E
 
V
L
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
Q
K
 
K
W
 
C
F
|
F
C
x
I
S
x
T
-
 
N
A
 
G
P
 
S
M
 
V
C
 
A
D
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
A
 
A
Q
 
Y
T
 
T
D
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
S
K
|
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
C
 
A
F
 
F
L
 
V
L
 
V
P
 
E
R
 
K
H
 
G
R
 
T
P
 
P
D
 
G
D
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
L
Y
 
V
I
 
Y
Q
 
G
R
 
R
L
 
N
K
 
E
N
 
S
K
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
M
C
 
R
S
 
G
N
 
S
A
 
I
S
x
N
S
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
F
F
 
F
R
 
E
G
 
N
A
 
M
-
 
E
-
 
V
-
 
P
L
 
A
A
 
E
W
 
N
M
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
T
G
 
G
V
x
F