SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf6N2E2_5274 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_5274 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bt9C Crystal structure of folm alternative dihydrofolate reductase 1 from brucella canis complexed with NADP (see paper)
27% identity, 98% coverage: 4:235/236 of query aligns to 6:242/250 of 5bt9C

query
sites
5bt9C
A
 
A
T
 
N
A
 
C
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
Q
 
R
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
K
H
 
A
C
 
I
A
 
V
R
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
A
E
 
S
D
 
H
G
 
G
Q
 
F
P
 
P
V
 
V
-
 
A
I
 
I
A
 
H
T
x
C
Y
x
N
R
|
R
T
x
S
E
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
I
V
 
A
Q
 
N
T
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
S
G
 
G
A
 
G
V
 
N
M
 
A
L
 
C
F
 
V
A
 
V
D
 
Q
F
 
A
S
 
D
S
x
L
E
|
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
I
 
V
E
 
K
Q
 
Q
L
 
A
K
 
S
Q
 
D
H
 
R
T
 
I
D
 
G
R
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
L
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
L
W
 
F
L
 
Q
A
 
E
E
 
D
G
 
K
P
 
V
G
 
G
C
 
A
-
 
L
E
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
L
F
 
W
K
 
D
A
 
R
M
 
H
F
 
F
G
 
A
V
 
V
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
T
P
 
P
Y
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
E
L
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
K
S
 
A
T
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
L
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
I
D
 
D
D
 
Q
V
 
R
T
 
V
R
 
W
K
 
K
G
 
L
S
 
N
A
 
P
R
 
Q
H
 
F
I
 
F
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
L
T
 
S
K
|
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
E
 
W
S
 
N
L
 
A
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
F
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
P
L
x
T
L
|
L
F
 
P
N
 
S
P
 
E
E
 
R
D
 
Q
D
 
R
A
 
P
A
 
E
Y
 
D
R
 
F
A
 
E
K
 
R
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
K
 
K
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
Q
I
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
E
S
 
L
E
 
P
V
 
E
I
 
F
Y
 
G
Q
 
R
S
 
T
L
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
F
L
 
W
D
 
E
N
 
N
P
 
R
Y
 
S
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
M
L
 
I
T
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
V
 
L

4cmjA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cmjA

query
sites
4cmjA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cmcA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cmcA

query
sites
4cmcA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
x
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
 
L
F
x
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cmbA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cmbA

query
sites
4cmbA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cm4A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cm4A

query
sites
4cm4A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
x
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cm3A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cm3A

query
sites
4cm3A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4clxA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4clxA

query
sites
4clxA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cloA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cloA

query
sites
4cloA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
L
S
x
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
x
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cldA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cldA

query
sites
4cldA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
x
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cl8A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 4cl8A

query
sites
4cl8A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

3mcvA Structure of ptr1 from trypanosoma brucei in ternary complex with 2,4- diamino-5-[2-(2,5-dimethoxyphenyl)ethyl]thieno[2,3-d]-pyrimidine and NADP+ (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 3mcvA

query
sites
3mcvA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
|
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

2yhuA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor whf30 (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 2yhuA

query
sites
2yhuA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
|
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

2x9gA High resolution structure of tbptr1 in complex with pemetrexed (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 2x9gA

query
sites
2x9gA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
29% identity, 96% coverage: 9:234/236 of query aligns to 10:239/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
Q
 
S
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
H
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
M
L
 
A
E
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
A
P
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
T
Y
 
G
R
|
R
T
x
D
E
 
A
R
 
Q
P
x
R
G
 
G
V
 
E
Q
 
Q
T
 
A
L
 
A
R
 
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
H
V
 
G
M
 
A
L
 
R
F
 
F
A
 
-
D
 
-
F
 
V
S
 
Q
S
 
A
E
x
D
A
x
L
G
 
G
I
 
D
L
 
L
A
 
D
F
 
S
I
 
V
E
 
A
Q
 
D
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
H
 
Q
T
 
A
D
 
P
R
 
D
L
 
V
R
 
D
A
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
 
G
A
 
I
W
x
Y
-
 
P
L
 
Q
A
 
A
E
 
S
G
 
T
P
 
F
G
 
D
C
 
Q
E
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
F
K
 
Q
A
 
Q
M
 
L
F
 
F
G
 
D
V
 
T
H
 
N
M
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
T
Y
 
Y
L
 
F
I
 
L
N
 
V
L
 
A
H
 
A
G
 
A
A
 
A
E
 
K
L
 
G
L
 
M
R
 
V
R
 
A
S
 
R
T
 
G
P
 
H
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
T
D
x
T
D
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
H
K
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
P
R
 
G
H
x
T
I
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
E
F
 
F
-
 
G
A
 
A
P
 
N
A
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
 
G
L
x
P
L
x
T
-
 
R
-
x
T
-
 
P
-
x
T
-
x
T
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
L
 
L
F
 
G
N
 
D
P
 
F
E
 
I
D
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
A
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
K
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
R
I
 
R
E
 
T
P
 
A
G
 
A
S
 
P
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
-
 
P
-
 
R
N
 
A
P
 
S
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
G
H
 
Y

4clhA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:246/252 of 4clhA

query
sites
4clhA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
R
R
 
Q
R
 
K
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4cleA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:246/252 of 4cleA

query
sites
4cleA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
R
R
 
Q
R
 
K
S
 
S
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
 
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6geyA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 4g (f125) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 7:246/252 of 6geyA

query
sites
6geyA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
|
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6gdpA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 4l (f162) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 7:246/252 of 6gdpA

query
sites
6gdpA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
|
L
F
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6gcqA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 2b (f192) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 6gcqA

query
sites
6gcqA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
A
 
M
R
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
L
x
S
L
|
L
F
x
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

6gcpA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 2d (f186) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 6:245/251 of 6gcpA

query
sites
6gcpA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
Q
 
Y
P
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
T
x
N
E
x
S
R
 
A
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
E
R
 
R
D
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
C
F
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
S
 
N
E
 
S
A
 
N
G
 
V
I
 
L
L
 
P
A
 
A
F
 
S
I
 
C
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
K
 
I
Q
 
N
H
 
S
T
 
C
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
F
D
 
G
R
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
A
 
A
W
x
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
G
 
G
P
 
K
G
 
T
C
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
A
 
V
F
 
A
K
 
E
A
 
-
M
 
L
F
 
I
G
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
G
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
T
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
A
 
M
R
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
C
 
N
A
 
M
T
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
E
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
F
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
L
x
S
L
|
L
F
 
L
-
x
P
-
 
V
-
 
A
-
x
M
-
 
G
N
 
E
P
 
E
E
 
E
D
 
K
D
 
D
A
 
K
A
x
W
Y
 
R
R
 
R
A
 
K
K
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Pf6N2E2_5274 FitnessBrowser__pseudo6_N2E2:Pf6N2E2_5274
MSSATAPILITGAAQRVGLHCARRLLEDGQPVIATYRTERPGVQTLRDLGAVMLFADFSS
EAGILAFIEQLKQHTDRLRAIVHNASAWLAEGPGCEAAAFKAMFGVHMLAPYLINLHGAE
LLRRSTPADIVHISDDVTRKGSARHIAYCATKAGLESLTLSFAAKFAPAIKVNGIAPALL
LFNPEDDAAYRAKALAKSALGIEPGSEVIYQSLRYLLDNPYVTGTTLTVNGGRHVK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory