SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_1042 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1042 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2vhaA Debp (see paper)
53% identity, 90% coverage: 24:294/300 of query aligns to 1:271/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
A
 
A
P
 
P
L
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
N
N
 
G
S
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
-
D
 
D
H
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
M
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
N
L
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
G
x
T
V
 
N
T
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
T
F
 
I
I
 
F
Y
 
V
V
 
V
K
 
G
G
 
T
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
V
F
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
L
N
 
N
V
 
E
D
 
E
H
 
Q
K
 
K
I
 
M
D
 
N
M
 
M
F
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
Y
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
N
 
K
D
 
K
P
 
P
H
 
D
K
 
N
W
 
W
V
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
E
 
P
Q
 
Q
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
S
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
L
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
A
 
T
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
Y
 
Q
S
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
G
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
E
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
F
A
 
K
K
 
E
P
 
P

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
53% identity, 90% coverage: 24:294/300 of query aligns to 2:272/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
P
 
P
L
 
A
T
 
A
G
 
G
-
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
N
N
 
G
S
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
-
D
 
D
H
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
M
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
N
L
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
G
x
T
V
 
N
T
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
T
F
 
I
I
 
F
Y
 
V
V
 
V
K
 
G
G
 
T
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
V
F
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
L
N
 
N
V
 
E
D
 
E
H
 
Q
K
 
K
I
 
M
D
 
N
M
 
M
F
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
Y
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
N
 
K
D
 
K
P
 
P
H
 
D
K
 
N
W
 
W
V
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
E
 
P
Q
 
Q
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
S
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
L
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
A
 
T
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
Y
 
Q
S
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
G
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
E
 
N
F
 
F
P
 
E
M
 
L
T
 
S
S
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
L
I
 
F
A
 
K
K
 
E
P
 
P

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
52% identity, 81% coverage: 29:272/300 of query aligns to 5:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
T
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
K
A
 
N
N
 
G
S
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
H
R
|
R
D
 
E
A
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
-
D
 
D
H
 
N
S
 
Q
G
 
Q
K
 
K
P
 
V
M
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
A
I
 
V
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
N
L
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
 
T
G
x
T
V
 
N
T
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
T
F
 
I
I
 
F
Y
 
V
V
 
V
K
 
G
G
 
T
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
I
K
 
K
N
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
V
F
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
L
N
 
N
V
 
E
D
 
E
H
 
Q
K
 
K
I
 
M
D
 
N
M
 
M
F
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
Q
 
R
M
 
T
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
Y
 
M
M
 
M
D
|
D
D
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
N
 
K
D
 
K
P
 
P
H
 
D
K
 
N
W
 
W
V
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
E
 
P
Q
 
Q
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
S
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
L
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
A
 
T
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
Y
 
Q
S
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
E
G
 
K
I
 
W
Y
 
F
K
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
32% identity, 80% coverage: 30:268/300 of query aligns to 6:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
L
 
L
S
 
E
K
 
R
I
 
S
A
 
K
S
 
S
A
 
T
N
 
N
S
 
E
I
 
I
T
 
I
L
 
W
G
 
G
Y
 
V
R
 
K
D
 
Y
A
 
D
S
 
T
V
 
R
P
 
L
F
 
F
S
 
G
Y
 
M
V
 
M
G
 
D
D
 
I
H
 
E
S
 
S
G
 
R
K
 
T
P
 
V
M
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
T
E
 
K
R
 
K
I
 
I
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
P
 
G
D
 
D
L
 
N
-
 
G
K
 
K
V
 
T
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
E
V
 
V
T
 
T
S
|
S
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
V
F
 
Y
I
 
F
Y
 
D
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
K
 
K
N
 
S
F
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
N
G
 
A
K
 
S
-
 
T
N
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
A
T
 
V
A
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
A
R
 
A
F
 
N
L
 
I
K
 
R
S
 
Q
Y
 
H
N
 
A
V
 
P
D
 
D
H
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
-
M
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
L
S
 
E
A
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
T
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
A
 
D
A
 
A
F
 
M
Y
 
T
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
I
A
 
A
N
 
D
D
 
E
P
 
N
H
 
P
K
 
E
W
 
Y
V
 
E
V
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
G
E
 
T
Q
 
F
S
 
T
R
 
N
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
I
R
 
N
K
 
K
D
 
G
D
 
Q
P
 
E
Q
 
N
F
 
F
L
 
L
A
 
K
L
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
H
S
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
32% identity, 73% coverage: 49:268/300 of query aligns to 16:223/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
-
Y
 
F
V
 
E
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
Y
 
V
N
 
A
V
 
A
D
 
G
H
 
V
K
 
K
I
 
V
D
 
K
M
 
K
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
-
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
N
 
N
D
 
P
P
 
N
H
 
A
K
 
G
W
 
V
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
T
Q
 
F
S
 
S
R
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
S
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
32% identity, 73% coverage: 49:268/300 of query aligns to 16:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
-
Y
 
F
V
 
E
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
L
 
I
T
 
V
A
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
G
D
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
I
K
 
K
N
 
S
F
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
H
L
 
V
K
 
K
S
 
K
Y
 
V
N
 
A
V
 
K
D
 
D
H
 
A
K
 
G
I
 
V
D
 
K
M
 
-
F
 
-
V
 
V
I
 
K
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
-
R
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
N
 
N
D
 
P
P
 
N
H
 
A
K
 
G
W
 
V
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
T
Q
 
F
S
 
S
R
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
S
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
30% identity, 80% coverage: 29:269/300 of query aligns to 2:229/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
S
 
D
K
 
E
I
 
I
A
 
M
S
 
K
A
 
R
N
 
G
S
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
T
R
x
D
D
 
A
A
 
D
S
x
Y
V
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
-
G
 
K
D
 
D
H
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
Y
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
E
I
 
L
Q
 
G
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
P
V
 
T
T
 
T
S
x
W
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
M
Y
 
T
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
N
G
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
I
K
 
K
N
 
S
F
 
F
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
N
G
 
K
K
 
P
N
 
D
V
 
V
V
 
K
T
 
V
T
 
A
A
 
V
-
x
Q
-
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
F
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
E
Y
 
F
N
 
L
V
 
P
D
 
K
H
 
A
K
 
K
I
 
I
D
 
R
M
 
T
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
E
D
 
N
H
 
N
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
E
L
 
V
Q
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
A
 
A
F
 
M
Y
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
S
-
 
P
-
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
R
 
L
A
 
A
K
 
V
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
H
 
-
K
 
-
W
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
D
E
 
E
E
 
P
Q
 
F
S
 
T
R
 
H
E
 
E
I
 
P
Y
 
L
S
 
G
C
 
F
M
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
N
A
 
W
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
L
Y
 
Y
K
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
K

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 85% coverage: 21:274/300 of query aligns to 36:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
A
 
A
N
 
T
E
 
K
A
 
A
P
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
D
I
 
I
A
 
R
S
 
A
A
 
R
N
 
G
S
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
K
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
K
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
N
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
N
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
E
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 85% coverage: 21:274/300 of query aligns to 35:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
A
 
A
N
 
T
E
 
K
A
 
A
P
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
D
I
 
I
A
 
R
S
 
A
A
 
R
N
 
G
S
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
K
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
K
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
N
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
N
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
E
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 85% coverage: 21:274/300 of query aligns to 35:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
A
 
A
N
 
T
E
 
K
A
 
A
P
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
D
I
 
I
A
 
R
S
 
A
A
 
R
N
 
G
S
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
D
D
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
G
 
D
D
 
P
H
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
R
 
D
I
 
I
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
F
A
 
G
L
 
V
P
 
P
D
 
S
L
 
-
K
 
H
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
G
x
S
V
 
I
T
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
K
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
T
G
 
V
F
 
Y
I
 
L
Y
 
D
V
 
A
K
 
N
G
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
A
A
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
T
N
 
K
F
 
V
A
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
L
R
 
R
F
 
R
L
 
I
K
 
R
S
 
E
Y
 
I
N
 
A
V
 
P
D
 
P
H
 
P
K
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
V
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
E
 
-
R
 
-
A
 
L
K
 
V
A
 
E
N
 
E
D
 
D
P
 
P
H
 
Y
K
 
L
W
 
H
V
 
-
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
E
 
D
Q
 
M
S
 
A
R
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
S
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
Q
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
S
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
W
N
 
N
G
 
T
I
 
L
Y
 
Y
K
 
R
R
 
K
W
 
W
F
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
E
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
28% identity, 80% coverage: 28:266/300 of query aligns to 2:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
G
 
A
T
 
T
L
 
V
S
 
A
K
 
A
I
 
I
A
 
K
S
 
E
A
 
K
N
 
G
S
 
V
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
V
R
x
F
D
 
G
A
 
D
S
x
K
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
V
 
V
G
 
-
D
 
D
H
 
A
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
N
M
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
I
A
 
A
G
 
K
K
 
D
I
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
D
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
G
L
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
-
K
 
K
V
 
V
K
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
T
T
x
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
G
x
T
V
 
Q
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
A
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
M
Y
 
K
V
 
V
K
 
A
G
 
L
Q
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
S
A
 
P
K
 
K
D
 
N
S
 
K
G
 
P
I
 
I
K
 
T
N
 
D
F
 
M
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
Q
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
A
E
 
D
R
 
A
F
 
F
L
 
F
K
 
T
S
 
K
Y
 
S
N
x
H
V
 
P
D
x
E
H
 
V
K
 
K
I
 
L
D
 
L
M
 
K
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
x
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
Q
 
D
M
 
A
L
 
L
Q
 
K
S
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
A
 
V
A
 
A
F
 
L
Y
 
A
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
G
 
A
E
 
-
R
 
W
A
 
A
K
 
K
A
 
E
N
 
N
D
 
-
P
 
P
H
 
N
K
 
F
W
 
E
V
 
V
V
 
A
V
 
I
G
 
G
E
 
N
E
 
L
Q
 
G
S
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
F
Y
 
I
S
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
Q
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
A
Q
 
D
F
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
E
L
 
I
A
 
A
D
 
A
L
 
M
Y
 
K
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
L
N
 
K
G
 
A
I
 
A
Y
 
Y
K
 
E
R
 
K

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
29% identity, 80% coverage: 30:270/300 of query aligns to 3:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
S
 
D
K
 
E
I
 
I
A
 
K
S
 
S
A
 
R
N
 
G
S
 
Y
I
 
L
T
 
L
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
S
D
 
A
A
 
D
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
V
 
V
G
 
-
D
 
D
H
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
N
P
 
I
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
R
R
 
R
I
 
L
Q
 
G
Q
 
V
Q
 
E
L
 
L
A
 
K
L
 
I
P
 
V
D
 
D
L
 
M
K
 
-
V
 
-
K
 
-
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
T
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
P
F
 
Y
I
 
F
Y
 
D
V
 
A
K
 
G
G
 
Q
Q
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
V
A
 
R
K
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
D
I
 
F
-
 
R
-
 
P
K
 
K
N
 
T
F
 
Y
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
G
E
 
D
R
 
I
F
 
E
L
 
V
K
 
S
S
 
K
Y
 
Y
N
 
D
V
 
-
D
 
-
H
 
-
K
 
-
I
 
-
D
 
G
M
 
I
F
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
G
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
M
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
A
 
A
F
 
V
Y
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
A
Y
 
R
G
 
A
E
 
F
R
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
N
N
 
P
D
 
D
P
 
-
H
 
-
K
 
-
W
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
S
G
 
S
E
 
G
E
 
V
Q
 
L
S
 
S
R
 
S
E
 
E
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
E
D
 
D
P
 
T
Q
 
D
F
 
L
L
 
L
A
 
E
L
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
R
D
 
E
L
 
L
Y
 
K
S
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
Y
N
 
D
G
 
V
I
 
L
Y
 
I
K
 
E
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
S
Q
 
E

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
27% identity, 80% coverage: 28:267/300 of query aligns to 1:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
G
 
G
T
 
K
L
 
L
S
 
E
K
 
S
I
 
I
A
 
K
S
 
S
A
 
K
N
 
G
S
 
Q
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
Y
 
V
R
x
K
D
 
N
A
 
D
S
 
V
V
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
V
 
L
G
 
D
D
 
Q
H
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
M
 
K
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
K
K
 
L
I
 
L
V
 
A
E
 
K
R
 
S
I
 
I
Q
 
L
Q
 
G
Q
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
L
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
K
Y
 
L
N
 
V
L
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
 
F
G
x
T
V
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
R
Q
 
I
V
 
Y
A
 
N
F
 
F
S
 
S
Y
 
E
G
 
P
F
 
Y
I
 
Y
Y
 
Q
V
 
D
K
 
A
G
 
I
Q
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
V
A
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
K
G
 
K
I
 
Y
K
 
K
N
 
S
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
M
R
 
K
G
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
I
-
 
G
V
 
V
T
 
A
T
 
Q
A
 
A
G
x
A
T
|
T
T
 
T
N
 
K
E
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
K
Y
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
H
 
V
K
 
K
I
 
F
D
 
S
M
 
E
F
 
F
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
P
D
 
D
H
x
Y
G
 
P
E
 
S
A
 
I
F
 
K
Q
 
A
M
 
A
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
A
 
D
A
 
A
F
 
F
Y
 
S
M
 
V
D
|
D
D
 
K
A
 
S
L
x
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
E
 
Y
R
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
D
P
 
-
H
 
-
K
 
K
W
 
S
V
 
E
V
 
I
V
 
L
G
 
P
E
 
D
E
 
S
Q
 
F
S
 
E
R
 
P
E
 
Q
I
 
S
Y
 
Y
S
 
G
C
 
I
M
 
V
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
K
L
 
Y
V
 
V
N
 
D
G
 
D
A
 
F
L
 
V
A
 
K
D
 
E
L
 
-
Y
 
-
S
 
H
S
 
K
G
 
N
E
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
A
I
 
L
Y
 
A
K
 
K
R
 
K
W
 
W

4ohnA Crystal structure of an abc uptake transporter substrate binding protein from streptococcus pneumoniae with bound histidine
26% identity, 82% coverage: 31:275/300 of query aligns to 7:246/246 of 4ohnA

query
sites
4ohnA
S
 
S
K
 
K
I
 
Y
A
 
Q
S
 
S
A
 
N
N
 
K
S
 
S
I
 
I
T
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
 
F
R
x
D
D
 
S
A
 
T
S
x
F
V
 
V
P
 
P
F
 
M
S
 
G
Y
 
F
V
 
A
G
 
-
D
 
Q
H
 
K
S
 
D
G
 
G
K
 
S
P
 
Y
M
 
A
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
T
K
 
A
I
 
V
V
 
F
E
 
E
R
 
K
I
 
Y
Q
 
G
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
I
K
 
T
V
 
V
K
 
N
Y
 
W
N
 
Q
L
 
P
V
 
I
T
 
D
S
x
W
Q
 
D
T
 
L
R
 
K
I
 
E
P
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
T
N
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
W
G
x
N
S
x
G
T
 
Y
G
x
S
V
 
A
T
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
K
 
E
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
Y
 
N
G
 
S
F
 
Y
I
 
M
Y
 
K
V
 
N
K
 
E
G
 
Q
Q
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
A
 
K
K
 
K
D
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
K
 
T
N
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
M
R
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
L
V
 
G
T
 
A
T
x
Q
A
 
A
G
 
G
T
x
S
T
x
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
A
N
 
N
E
 
P
R
 
E
F
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
N
Y
 
I
N
 
V
V
 
A
D
 
N
H
 
K
K
 
E
I
 
A
D
 
N
M
 
Q
F
 
Y
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
Q
D
 
T
H
 
F
G
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
L
Q
 
I
M
 
D
L
 
L
Q
 
K
S
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
G
F
 
L
Y
 
L
M
 
I
D
|
D
D
 
R
-
 
V
-
 
Y
A
 
A
L
 
N
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
E
K
 
G
A
 
V
N
 
L
D
 
N
P
 
D
H
 
Y
K
 
N
W
 
V
V
 
F
V
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
L
E
 
E
Q
 
-
S
 
-
R
 
T
E
 
E
I
 
A
Y
 
F
S
 
A
C
 
V
M
 
G
V
 
S
R
 
R
K
 
K
D
 
E
D
 
D
P
 
T
Q
 
T
F
 
L
L
 
V
A
 
K
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
S
L
 
L
Y
 
Y
S
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
F
N
 
Q
G
 
E
I
 
I
Y
 
S
K
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
A
P
 
T
K
 
K

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
28% identity, 77% coverage: 39:270/300 of query aligns to 3:224/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
I
 
I
T
 
V
L
 
M
G
 
G
Y
 
T
R
x
S
D
 
A
A
x
D
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
V
 
H
G
 
K
D
 
V
H
 
E
S
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
D
-
 
E
-
 
I
M
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
R
 
K
I
 
L
Q
 
G
Q
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
E
L
 
I
P
 
K
D
 
D
L
 
M
K
 
D
V
x
F
K
 
K
Y
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
M
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
G
x
T
V
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
K
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
Y
 
D
G
 
L
F
 
Y
I
 
Y
Y
 
D
V
 
S
K
 
R
G
 
Q
Q
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
V
A
 
K
K
 
N
D
 
D
S
 
S
G
 
P
I
 
I
K
 
S
N
 
K
F
 
F
A
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
V
K
 
K
N
 
T
V
 
I
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
S
E
 
E
R
 
E
F
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
K
Y
 
I
-
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
K
H
 
L
K
 
K
I
 
-
D
 
-
M
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
Q
A
 
L
K
 
N
D
 
R
H
 
V
G
 
S
E
 
D
A
 
E
F
 
F
Q
 
M
M
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
A
 
D
A
 
A
F
 
I
Y
 
V
M
 
V
D
x
E
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
A
Y
 
K
G
 
A
E
 
Y
R
 
L
A
 
K
K
 
E
A
 
Y
N
 
K
D
 
D
P
 
-
H
 
M
K
 
K
W
 
I
V
 
L
V
 
Y
V
 
M
G
 
D
E
 
E
E
 
I
Q
 
N
S
 
N
R
 
V
E
 
E
I
 
N
Y
 
G
S
 
S
C
 
A
M
 
V
-
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
L
Y
 
K
S
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
N
 
D
G
 
K
I
 
L
Y
 
V
K
 
D
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
K
Q
 
Q

3vv5A Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l- cysteine (aec) (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 5:237/237 of 3vv5A

query
sites
3vv5A
T
 
S
L
 
F
S
 
E
K
 
E
I
 
I
A
 
K
S
 
R
A
 
S
N
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
x
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
S
 
R
G
 
N
K
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
|
S
T
 
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
N
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
N
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
 
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
K
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

3vvfA Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 9:241/241 of 3vvfA

query
sites
3vvfA
T
 
S
L
 
F
S
 
E
K
 
E
I
 
I
A
 
K
S
 
R
A
 
S
N
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
S
 
R
G
 
N
K
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
|
S
T
x
H
G
|
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
N
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
N
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
K
 
Q
R
 
K
W
 
W
F
 
F
E
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
R
P
 
C
K
 
K

3vveA Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine (see paper)
26% identity, 82% coverage: 29:275/300 of query aligns to 9:241/241 of 3vveA

query
sites
3vveA
T
 
S
L
 
F
S
 
E
K
 
E
I
 
I
A
 
K
S
 
R
A
 
S
N
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
T
R
x
E
D
 
G
A
 
A
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
N
Y
 
Y
V
 
F
G
 
-
D
 
D
H
 
E
S
 
R
G
 
N
K
 
Q
P
 
L
M
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
G
G
 
N
K
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
Q
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
P
K
 
R
Y
 
W
N
 
I
L
 
A
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
 
D
T
 
T
R
 
L
I
 
L
P
 
I
L
 
Q
V
 
L
Q
 
N
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
|
S
T
x
H
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
T
Y
 
N
G
 
P
F
 
H
I
 
-
Y
 
Y
V
 
C
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
L
 
I
T
 
V
A
 
S
K
 
R
D
 
K
S
 
G
G
 
G
I
 
P
K
 
R
N
 
T
F
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
N
 
-
E
 
-
R
 
-
F
x
Y
L
 
M
K
 
E
S
 
A
Y
 
A
N
 
Q
V
 
K
D
 
I
H
 
P
K
 
G
I
 
I
D
 
K
M
 
E
F
 
V
V
 
R
I
 
T
S
 
Y
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
H
 
P
G
 
-
E
 
D
A
 
A
F
 
L
Q
 
Q
M
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
A
 
D
A
 
T
F
 
-
Y
 
W
M
 
I
D
 
T
D
 
D
A
 
R
L
 
F
L
 
V
Y
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
N
 
R
D
 
K
P
 
L
H
 
E
K
 
N
W
 
T
V
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
L
Q
 
V
S
 
F
R
 
Q
E
|
E
I
 
R
Y
 
V
S
 
A
C
 
M
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
K
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
Y
 
M
S
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
N
 
A
G
 
R
I
 
I
Y
 
S
K
 
Q
R