SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_1397 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1397 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5iuwA Crystal structure of indole-3-acetaldehyde dehydrogenase in complexed with NAD+ and iaa (see paper)
52% identity, 99% coverage: 7:495/496 of query aligns to 7:495/495 of 5iuwA

query
sites
5iuwA
W
 
W
Q
 
E
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
N
L
 
L
R
 
K
F
 
I
P
 
E
D
 
G
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
I
 
I
D
 
Q
G
 
G
Q
 
E
R
 
Y
R
 
T
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
A
 
C
I
 
I
N
 
S
P
 
P
A
 
V
T
 
D
S
 
G
Q
 
R
C
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
C
G
 
D
E
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
Q
A
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
R
R
 
L
S
 
A
P
 
P
T
 
A
E
 
K
R
 
R
K
 
K
Q
 
A
V
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
R
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
S
 
T
L
 
L
N
 
D
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
S
Y
 
L
N
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
R
V
 
A
F
 
L
R
 
S
W
 
W
Y
 
S
A
 
G
E
 
E
S
 
A
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
A
S
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
D
V
 
Q
L
 
L
A
 
G
T
 
L
I
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
x
I
V
|
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
D
x
M
M
 
M
A
 
A
A
 
C
W
 
W
K
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
 
E
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
F
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
E
 
H
Q
 
T
T
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
M
D
 
D
V
 
V
D
 
D
C
 
T
L
 
V
V
 
V
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
K
V
x
I
G
 
A
K
 
K
Y
 
Q
F
 
L
M
 
M
Q
 
I
Y
|
Y
S
 
A
A
 
G
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
M
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
L
E
|
E
C
x
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
A
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
A
I
 
I
F
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
D
E
 
R
F
 
F
V
 
L
E
 
P
R
 
M
L
 
V
K
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
T
W
 
W
L
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
N
P
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
M
A
 
N
R
 
T
I
 
V
M
 
L
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
A
 
G
E
 
H
Q
 
T
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
R
R
 
L
I
 
V
C
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
S
 
I
I
 
L
I
 
Q
N
 
E
G
 
T
S
 
G
D
 
G
N
 
T
F
 
Y
I
 
V
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
F
 
F
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
N
P
 
N
D
 
A
M
 
M
P
 
R
L
 
I
F
 
A
R
 
Q
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
L
A
 
T
F
 
F
D
 
D
D
 
T
E
 
A
A
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
V
W
 
W
T
 
T
D
 
A
D
 
N
L
 
L
N
 
S
R
 
K
A
 
A
H
 
H
R
 
L
V
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
S
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
Q
V
 
Y
D
|
D
A
 
G
L
 
G
D
 
D
V
 
M
T
 
T
V
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
G
 
F
K
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
N
G
 
G
R
 
R
D
|
D
L
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
A
F
 
F
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
S
T
 
T
W
 
W
F
 
I
Q
 
K
L
 
L

5iuvA Crystal structure of indole-3-acetaldehyde dehydrogenase in complexed with NAD+ (see paper)
52% identity, 99% coverage: 7:495/496 of query aligns to 7:495/495 of 5iuvA

query
sites
5iuvA
W
 
W
Q
 
E
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
N
L
 
L
R
 
K
F
 
I
P
 
E
D
 
G
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
I
 
I
D
 
Q
G
 
G
Q
 
E
R
 
Y
R
 
T
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
A
 
C
I
 
I
N
 
S
P
 
P
A
 
V
T
 
D
S
 
G
Q
 
R
C
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
C
G
 
D
E
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
Q
A
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
R
R
 
L
S
 
A
P
 
P
T
 
A
E
 
K
R
 
R
K
 
K
Q
 
A
V
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
R
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
S
 
T
L
 
L
N
 
D
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
S
Y
 
L
N
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
R
V
 
A
F
 
L
R
 
S
W
 
W
Y
 
S
A
 
G
E
 
E
S
 
A
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
A
S
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
D
V
 
Q
L
 
L
A
 
G
T
 
L
I
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
x
I
V
|
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
M
M
 
M
A
 
A
A
 
C
W
 
W
K
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
x
S
E
 
E
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
F
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
E
 
H
Q
 
T
T
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
M
D
 
D
V
 
V
D
 
D
C
 
T
L
 
V
V
 
V
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
K
V
x
I
G
 
A
K
 
K
Y
 
Q
F
 
L
M
 
M
Q
 
I
Y
|
Y
S
 
A
A
 
G
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
M
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
L
E
|
E
C
x
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
A
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
A
I
 
I
F
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
C
|
C
S
 
T
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
D
E
 
R
F
 
F
V
 
L
E
 
P
R
 
M
L
 
V
K
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
T
W
 
W
L
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
N
P
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
M
A
 
N
R
 
T
I
 
V
M
 
L
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
A
 
G
E
 
H
Q
 
T
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
R
R
 
L
I
 
V
C
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
S
 
I
I
 
L
I
 
Q
N
 
E
G
 
T
S
 
G
D
 
G
N
 
T
F
 
Y
I
 
V
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
F
 
F
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
N
P
 
N
D
 
A
M
 
M
P
 
R
L
 
I
F
 
A
R
 
Q
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
L
A
 
T
F
 
F
D
 
D
D
 
T
E
 
A
A
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
V
W
 
W
T
 
T
D
 
A
D
 
N
L
 
L
N
 
S
R
 
K
A
 
A
H
 
H
R
 
L
V
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
S
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
Q
V
 
Y
D
 
D
A
 
G
L
 
G
D
 
D
V
 
M
T
 
T
V
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
F
K
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
N
G
 
G
R
 
R
D
|
D
L
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
A
F
 
F
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
S
T
 
T
W
 
W
F
 
I
Q
 
K
L
 
L

7jsoA P. Syringae alda indole-3-acetaldehyde dehydrogenase c302a mutant in complex with NAD+ and iaa (see paper)
52% identity, 99% coverage: 7:495/496 of query aligns to 7:495/495 of 7jsoA

query
sites
7jsoA
W
 
W
Q
 
E
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
N
L
 
L
R
 
K
F
 
I
P
 
E
D
 
G
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
I
 
I
D
 
Q
G
 
G
Q
 
E
R
 
Y
R
 
T
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
D
A
 
C
I
 
I
N
 
S
P
 
P
A
 
V
T
 
D
S
 
G
Q
 
R
C
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
C
G
 
D
E
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
Q
A
 
R
A
 
A
V
 
V
H
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
R
R
 
L
S
 
A
P
 
P
T
 
A
E
 
K
R
 
R
K
 
K
Q
 
A
V
 
T
L
 
M
L
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
R
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
S
 
T
L
 
L
N
 
D
M
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
S
Y
 
L
N
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
R
V
 
A
F
 
L
R
 
S
W
 
W
Y
 
S
A
 
G
E
 
E
S
 
A
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
A
S
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
D
V
 
Q
L
 
L
A
 
G
T
 
L
I
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
x
I
V
|
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
L
 
L
D
 
M
M
 
M
A
 
A
A
 
C
W
|
W
K
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
E
|
E
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
F
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
E
 
H
Q
 
T
T
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
H
 
H
P
 
M
D
 
D
V
 
V
D
 
D
C
 
T
L
 
V
V
 
V
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
K
V
x
I
G
 
A
K
 
K
Y
 
Q
F
 
L
M
 
M
Q
 
I
Y
 
Y
S
 
A
A
 
G
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
M
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
W
 
W
L
 
L
E
|
E
C
x
A
G
|
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
A
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
S
G
 
A
I
 
I
F
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
|
V
C
x
A
S
x
T
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
D
E
 
R
F
 
F
V
 
L
E
 
P
R
 
M
L
 
V
K
 
I
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
E
 
G
R
 
T
W
 
W
L
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
N
P
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
M
A
 
N
R
 
T
I
 
V
M
 
L
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
A
 
G
E
 
H
Q
 
T
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
R
R
 
L
I
 
V
C
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
S
 
I
I
 
L
I
 
Q
N
 
E
G
 
T
S
 
G
D
 
G
N
 
T
F
 
Y
I
 
V
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
F
 
F
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
N
P
 
N
D
 
A
M
 
M
P
 
R
L
 
I
F
 
A
R
 
Q
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
L
A
 
T
F
 
F
D
 
D
D
 
T
E
 
A
A
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
V
W
 
W
T
 
T
D
 
A
D
 
N
L
 
L
N
 
S
R
 
K
A
 
A
H
 
H
R
 
L
V
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
S
V
 
V
S
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
Q
V
 
Y
D
|
D
A
 
G
L
 
G
D
 
D
V
 
M
T
 
T
V
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
G
 
F
K
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
N
G
 
G
R
 
R
D
|
D
L
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
A
F
 
F
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
S
T
 
T
W
 
W
F
 
I
Q
 
K
L
 
L

7uyyA The crystal structure of the pseudomonas aeruginosa aldehyde dehydrogenase encoded by the pa4189 gene in complex with nadh (see paper)
49% identity, 99% coverage: 5:493/496 of query aligns to 8:493/496 of 7uyyA

query
sites
7uyyA
E
 
E
Y
 
E
W
 
Y
Q
 
A
R
 
A
K
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
L
R
 
D
F
 
L
P
 
P
D
 
Q
Q
 
R
A
 
A
V
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
R
 
F
R
 
R
P
 
D
A
 
A
Q
 
C
S
 
G
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
S
I
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
S
 
G
Q
 
E
C
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
D
E
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
V
H
 
A
N
 
S
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
V
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
D
G
 
G
T
 
R
W
 
W
A
 
R
A
 
S
R
 
R
S
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
R
 
R
K
 
K
Q
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
L
L
 
E
E
 
E
N
 
H
R
 
L
E
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
M
D
 
E
S
 
S
L
 
L
N
 
D
M
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
R
D
 
E
A
 
C
Y
 
Q
N
 
H
I
 
T
D
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
E
A
 
T
A
 
I
G
 
N
V
 
T
F
 
L
R
 
R
W
 
W
Y
 
H
A
 
A
E
 
E
S
 
L
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
S
V
 
T
A
 
A
P
 
P
S
 
V
A
 
G
Q
 
S
N
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
I
 
V
T
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
L
V
|
V
V
x
L
P
|
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
L
M
 
M
A
 
L
A
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
 
P
Q
 
E
S
 
T
P
 
S
F
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
G
G
|
G
E
 
R
Q
 
E
T
 
A
G
|
G
K
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
L
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
A
C
 
M
L
 
V
V
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
A
V
x
T
G
 
G
K
 
R
Y
x
L
F
|
F
M
 
L
Q
 
K
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
W
 
V
L
 
L
E
 
E
C
|
C
G
|
G
G
 
G
K
 
K
S
 
N
A
 
P
N
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
N
D
 
D
C
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
H
A
 
V
A
 
V
F
 
N
G
 
G
I
 
A
F
 
F
F
 
W
N
 
N
Q
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
N
C
|
C
S
 
S
A
 
A
N
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
V
Q
 
H
R
 
A
S
 
E
I
 
V
H
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
I
K
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
E
 
R
R
 
E
W
 
W
L
 
R
P
 
M
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
R
S
 
N
A
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
S
S
 
P
R
 
A
Q
x
H
T
 
F
A
 
E
R
x
K
I
 
V
M
 
R
K
 
A
F
 
Y
I
 
L
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
R
-
 
T
Q
 
E
Q
 
R
G
 
L
A
 
A
T
 
V
R
 
R
I
 
F
C
 
G
G
 
G
G
 
A
R
 
T
Q
 
E
S
 
A
I
 
G
I
 
I
N
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
-
F
 
F
I
 
V
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
V
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
H
M
 
S
P
 
R
L
 
L
F
 
F
R
 
R
D
 
E
E
 
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
S
F
 
F
D
 
D
D
 
D
E
 
I
A
 
D
H
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
A
W
 
Y
T
 
T
D
 
G
D
 
S
L
 
L
N
 
R
R
 
H
A
 
A
H
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
I
V
 
V
S
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
F
D
 
G
A
 
E
L
 
G
D
 
D
V
 
A
T
 
S
V
 
T
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
F
 
F
-
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
K
S
 
S
L
 
V
H
 
W
S
 
A
F
 
H
D
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
T
T
 
I
W
 
W
F
 
I

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
46% identity, 97% coverage: 14:496/496 of query aligns to 8:489/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
L
 
I
R
 
R
F
 
F
P
 
-
D
 
T
Q
 
K
A
 
L
V
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
S
R
 
F
R
 
V
P
 
D
A
 
A
Q
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
F
 
F
A
 
D
A
 
T
I
 
R
N
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
T
S
 
G
Q
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
E
C
 
A
G
 
D
E
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
R
N
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
V
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
H
G
 
G
T
 
E
W
 
W
A
 
P
A
 
R
R
 
M
S
 
S
P
 
G
T
 
S
E
 
E
R
 
R
K
 
G
Q
 
R
V
 
I
L
 
M
L
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
E
E
 
E
N
 
H
R
 
A
E
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
N
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
H
V
 
P
A
 
A
D
 
V
A
 
T
Y
 
R
N
 
A
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
G
G
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
S
F
 
L
R
 
R
W
 
Y
Y
 
F
A
 
A
E
 
G
S
 
A
L
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
H
D
 
G
Q
 
E
V
 
T
A
 
L
P
 
K
S
 
M
A
 
P
Q
 
G
N
 
Q
V
 
F
L
 
Q
A
 
G
T
 
H
I
 
T
T
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
A
A
 
G
A
 
V
V
x
I
V
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
T
M
|
M
A
 
F
A
 
A
W
 
V
K
 
K
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
A
V
 
L
I
 
V
L
 
V
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
Q
 
Q
S
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
F
G
|
G
E
 
P
Q
 
T
T
 
A
G
|
G
K
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
S
H
 
H
P
 
M
D
 
D
V
 
V
D
 
D
C
 
M
L
 
V
V
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
L
F
 
I
M
 
M
Q
 
K
Y
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
Q
 
P
V
 
V
W
 
Y
L
 
L
E
|
E
C
x
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
L
L
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
D
D
 
D
C
 
A
Q
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
K
 
L
A
 
A
A
 
V
F
 
G
G
 
A
I
 
S
F
 
F
F
 
F
N
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
A
C
|
C
S
 
V
A
 
A
N
 
A
S
 
S
R
 
R
L
 
V
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
R
 
E
S
 
R
I
 
V
H
 
Y
D
 
D
E
 
R
F
 
F
V
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
E
Q
 
R
A
 
M
E
 
R
R
 
S
W
 
W
L
 
V
P
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
-
 
S
D
 
D
P
 
P
S
 
R
S
 
A
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
K
R
 
A
Q
 
Q
T
 
Y
A
 
E
R
 
R
I
 
V
M
 
L
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
Q
 
D
Q
 
H
A
 
G
E
 
K
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
L
I
 
L
C
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
P
S
 
C
I
 
A
I
 
P
N
 
E
G
 
G
S
 
K
D
 
G
N
 
Y
F
 
Y
I
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
N
V
 
V
T
 
K
P
 
E
D
 
D
M
 
M
P
 
I
L
 
I
F
 
A
R
 
K
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
M
A
 
K
F
 
F
D
 
K
D
 
T
E
 
V
A
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
L
 
R
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
V
W
 
V
T
 
T
D
 
R
D
 
D
L
 
L
N
 
D
R
 
V
A
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
R
 
R
Q
 
S
L
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
V
S
 
W
V
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
Y
D
 
F
A
 
A
L
 
M
D
 
G
V
 
S
T
 
D
V
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
R
K
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
K
D
|
D
L
 
E
S
 
G
L
 
M
H
 
H
S
 
A
F
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
T
 
L
Q
 
A
L
 
V
K
 
K
T
 
S
T
 
V
W
 
V
F
 
T
Q
 
P
L
 
L
R
 
R

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
45% identity, 95% coverage: 22:490/496 of query aligns to 10:475/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
F
R
 
V
P
 
D
A
 
A
Q
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
A
 
E
A
 
T
I
 
R
N
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
T
S
 
G
Q
 
E
C
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
E
C
 
G
G
 
D
E
 
K
E
 
A
D
 
D
V
 
V
N
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
K
N
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
N
G
 
G
T
 
P
W
 
W
A
 
P
A
 
R
R
 
M
S
 
T
P
 
G
T
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
G
Q
 
R
V
 
I
L
 
L
L
 
H
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
D
E
 
E
N
 
H
R
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
T
L
 
V
N
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
F
A
 
A
D
 
V
A
 
G
Y
 
K
N
 
A
I
 
R
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
H
V
 
L
F
 
L
R
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
S
 
A
L
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
V
Y
 
H
D
 
G
Q
 
A
V
 
T
A
 
L
P
 
K
S
 
M
A
 
A
Q
 
Q
N
 
R
V
 
M
L
 
H
A
 
G
T
 
Y
I
 
T
T
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
H
V
x
I
V
|
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
T
D
 
T
M
 
M
A
 
F
A
 
F
W
 
F
K
 
K
L
 
V
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
A
V
 
V
I
 
V
L
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
Q
 
Q
S
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
F
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
F
G
|
G
E
 
P
Q
 
T
T
 
A
G
|
G
K
x
A
A
 
A
L
 
V
G
 
A
L
 
A
H
 
H
P
 
M
D
 
D
V
 
V
D
 
D
C
 
K
L
 
V
V
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
E
V
|
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
L
F
 
V
M
 
M
Q
 
R
Y
 
A
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
Q
 
P
V
 
V
W
 
S
L
 
L
E
|
E
C
 
L
G
|
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
V
L
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
D
D
 
D
C
 
A
Q
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
N
K
 
L
A
 
V
A
 
N
F
 
F
G
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
T
N
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
C
|
C
S
 
V
A
 
A
N
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
R
 
E
S
 
G
I
 
I
H
 
Y
D
 
D
E
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
K
R
 
K
L
 
A
K
 
A
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
E
 
S
R
 
K
W
 
S
L
 
V
P
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
N
P
 
P
S
 
S
S
 
V
A
 
S
A
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
K
R
 
D
Q
|
Q
T
 
Y
A
 
E
R
x
K
I
 
V
M
 
L
K
 
R
F
 
Y
I
 
I
Q
 
D
Q
 
I
A
 
G
E
 
K
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
L
I
 
V
C
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
K
Q
 
P
S
 
C
I
 
G
I
 
D
N
 
K
G
 
G
S
 
Y
D
 
-
N
 
-
F
 
Y
I
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
D
V
 
V
T
 
K
P
 
D
D
 
D
M
 
M
P
 
T
L
 
I
F
 
A
R
 
Q
D
 
D
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
L
T
 
M
A
 
K
F
 
F
D
 
K
D
 
T
E
 
V
A
 
E
H
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
 
Q
L
 
K
A
 
A
N
 
N
D
 
N
S
 
T
V
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
I
W
 
V
T
 
T
D
 
K
D
 
N
L
 
I
N
 
D
R
 
V
A
 
A
H
 
N
R
 
T
V
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
S
L
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
A
V
 
I
S
 
W
V
 
I
N
 
N
S
 
C
V
 
Y
D
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
V
 
P
T
 
D
V
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
K
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
K
D
|
D
L
 
M
S
 
G
L
 
M
H
 
D
S
 
A
F
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
T
 
L
Q
 
Q
L
 
T
K
 
K
T
 
T

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
42% identity, 96% coverage: 22:496/496 of query aligns to 21:491/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
R
 
V
P
 
S
A
 
A
Q
 
I
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
A
 
E
A
 
T
I
 
Y
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
S
 
E
Q
 
D
C
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
V
V
 
V
A
 
C
A
 
E
C
 
A
G
 
Q
E
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
K
N
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
E
R
 
M
S
 
T
P
 
T
T
 
A
E
 
E
R
 
R
K
 
A
Q
 
H
V
 
L
L
 
I
L
 
Y
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
E
E
 
E
N
 
H
R
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
E
S
 
A
L
 
L
N
 
D
M
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
A
 
Q
D
 
V
A
 
A
Y
 
L
N
 
D
I
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
S
G
 
A
A
 
T
A
 
V
G
 
E
V
 
N
F
 
Y
R
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
S
 
W
L
 
T
D
 
T
K
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
G
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
P
 
P
S
 
I
A
 
S
Q
 
K
N
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
N
T
 
Y
I
 
T
T
 
R
R
 
H
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
Q
V
x
I
V
 
I
P
|
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
S
W
 
W
K
 
K
L
 
M
A
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
I
I
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
|
A
E
|
E
Q
|
Q
S
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
Y
L
 
A
A
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
F
L
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
A
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
F
G
|
G
E
 
P
Q
 
E
T
 
A
G
|
G
K
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
H
D
 
D
V
 
I
D
 
D
C
 
K
L
 
V
V
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
V
V
x
T
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
F
 
I
M
 
M
Q
 
R
Y
 
Q
S
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
M
N
 
-
L
 
I
K
 
K
Q
 
H
V
 
V
W
 
T
L
 
L
E
|
E
C
x
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
I
F
 
L
A
 
E
D
 
D
C
 
A
Q
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
N
K
 
G
A
 
A
A
 
F
F
 
Q
G
 
G
I
 
I
F
 
M
F
 
Y
N
 
N
Q
 
H
G
 
G
E
 
Q
V
 
N
C
|
C
S
 
S
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
L
 
F
V
 
V
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
I
 
H
H
 
Y
D
 
E
E
 
T
F
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
L
K
 
V
A
 
K
Q
 
M
A
 
A
E
 
N
R
 
N
W
 
V
L
 
K
P
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
L
 
M
D
 
E
P
 
K
S
 
E
S
 
T
A
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
P
I
 
L
V
 
V
D
 
S
S
 
K
R
 
K
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
E
R
 
R
I
 
V
M
 
L
K
 
N
F
 
Y
I
 
I
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
G
E
 
K
Q
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
V
I
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
Q
 
R
S
 
A
I
 
L
I
 
E
N
 
K
G
 
G
S
 
Y
D
 
-
N
 
-
F
 
F
I
 
V
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
D
D
 
D
M
 
M
P
 
T
L
 
I
F
 
V
R
 
K
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
V
T
 
L
A
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
H
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
D
 
N
S
 
S
V
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
V
W
 
W
T
 
T
D
 
Q
D
 
N
L
 
I
N
 
K
R
 
T
A
 
G
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
N
Q
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
W
V
 
I
N
 
N
S
 
D
V
 
Y
D
 
N
A
 
L
L
 
E
D
 
N
V
 
A
T
 
A
V
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
R
D
x
E
L
 
L
S
 
G
L
 
S
H
 
Y
S
 
A
F
 
L
D
 
D
K
 
N
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
V
K
 
K
T
 
S
T
 
V
W
 
W
F
 
V
Q
 
N
L
 
I
R
 
K

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
42% identity, 96% coverage: 22:496/496 of query aligns to 21:491/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
R
 
F
R
 
V
P
 
S
A
 
A
Q
 
I
S
 
G
G
 
G
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
A
 
E
A
 
T
I
 
Y
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
S
 
E
Q
 
D
C
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
V
V
 
V
A
 
C
A
 
E
C
 
A
G
 
Q
E
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
K
N
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
E
R
 
M
S
 
T
P
 
T
T
 
A
E
 
E
R
 
R
K
 
A
Q
 
H
V
 
L
L
 
I
L
 
Y
R
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
E
E
 
E
N
 
H
R
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
D
 
E
S
 
A
L
 
L
N
 
D
M
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
A
 
Q
D
 
V
A
 
A
Y
 
L
N
 
D
I
 
D
D
 
D
V
 
I
P
 
S
G
 
A
A
 
T
A
 
V
G
 
E
V
 
N
F
 
Y
R
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
S
 
W
L
 
T
D
 
T
K
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
G
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
P
 
P
S
 
I
A
 
S
Q
 
K
N
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
N
T
 
Y
I
 
T
T
 
R
R
 
H
E
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
Q
V
x
I
V
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
S
W
 
W
K
 
K
L
 
M
A
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
I
I
 
V
L
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
A
E
|
E
Q
 
Q
S
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
Y
L
 
A
A
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
F
L
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
A
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
F
G
|
G
E
 
P
Q
 
E
T
 
A
G
|
G
K
x
A
A
 
A
L
 
I
G
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
H
D
 
D
V
 
I
D
 
D
C
 
K
L
 
V
V
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
E
 
V
V
x
T
G
 
G
K
 
K
Y
|
Y
F
 
I
M
 
M
Q
 
R
Y
 
Q
S
 
S
A
 
A
Q
 
E
S
 
M
N
 
-
L
 
I
K
 
K
Q
 
H
V
 
V
W
 
T
L
 
L
E
|
E
C
x
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
I
F
 
L
A
 
E
D
 
D
C
 
A
Q
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
I
E
 
N
K
 
G
A
 
A
A
 
F
F
 
Q
G
 
G
I
 
I
F
 
M
F
 
Y
N
 
N
Q
 
H
G
 
G
E
 
Q
V
 
N
C
|
C
S
 
S
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
L
 
F
V
 
V
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
I
 
H
H
 
Y
D
 
E
E
 
T
F
 
V
V
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
L
K
 
V
A
 
K
Q
 
M
A
 
A
E
 
N
R
 
N
W
 
V
L
 
K
P
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
L
 
M
D
 
E
P
 
K
S
 
E
S
 
T
A
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
P
I
 
L
V
 
V
D
 
S
S
 
K
R
 
K
Q
|
Q
T
 
Q
A
 
E
R
|
R
I
 
V
M
 
L
K
 
N
F
 
Y
I
 
I
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
G
E
 
K
Q
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
V
I
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
Q
 
R
S
 
A
I
 
L
I
 
E
N
 
K
G
 
G
S
 
Y
D
 
-
N
 
-
F
 
F
I
 
V
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
D
D
 
D
M
 
M
P
 
T
L
 
I
F
 
V
R
 
K
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
V
T
 
L
A
 
P
F
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
H
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
D
 
N
S
 
S
V
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
V
W
 
W
T
 
T
D
 
Q
D
 
N
L
 
I
N
 
K
R
 
T
A
 
G
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
N
Q
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
W
V
 
I
N
 
N
S
 
D
V
 
Y
D
 
N
A
 
L
L
 
E
D
 
N
V
 
A
T
 
A
V
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
R
 
R
D
x
E
L
 
L
S
 
G
L
 
S
H
 
Y
S
 
A
F
 
L
D
 
D
K
 
N
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
E
L
 
V
K
 
K
T
 
S
T
 
V
W
 
W
F
 
V
Q
 
N
L
 
I
R
 
K

O94788 Retinal dehydrogenase 2; RALDH 2; RalDH2; Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2; ALDH1A2; Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2; RALDH(II); EC 1.2.1.36 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
41% identity, 96% coverage: 22:495/496 of query aligns to 42:513/518 of O94788

query
sites
O94788
I
 
I
D
 
N
G
 
N
Q
 
E
R
 
W
R
 
Q
P
 
N
A
 
S
Q
x
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
V
F
 
F
A
 
P
A
 
V
I
 
Y
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
S
 
G
Q
 
E
C
 
Q
L
 
V
A
 
C
N
 
E
V
 
V
A
 
Q
A
 
E
C
 
A
G
 
D
E
 
K
E
 
A
D
 
D
V
 
I
N
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
Q
N
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
V
 
A
F
 
F
E
 
S
A
 
L
G
 
G
T
 
S
-
 
V
W
 
W
A
 
R
A
 
R
R
 
M
S
 
D
P
 
A
T
 
S
E
 
E
R
 
R
K
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
D
R
 
K
L
 
L
A
|
A
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
E
E
 
R
N
 
D
R
 
R
E
 
A
E
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
M
D
 
E
S
 
S
L
 
L
N
 
N
M
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
F
A
 
L
D
 
Q
A
 
A
Y
 
F
N
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
L
P
 
Q
G
 
G
A
 
V
A
 
I
G
 
K
V
 
T
F
 
F
R
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
S
 
W
L
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
I
Y
 
H
D
 
G
Q
 
M
V
 
T
A
 
I
P
 
P
S
 
V
A
 
D
Q
 
G
N
 
D
V
 
Y
L
 
F
A
 
T
T
 
F
I
 
T
T
 
R
R
 
H
E
 
E
A
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
C
A
 
G
A
x
Q
V
 
I
V
x
I
P
|
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
L
M
 
M
A
 
F
A
 
A
W
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
C
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
L
 
I
K
|
K
P
|
P
A
|
A
E
|
E
Q
 
Q
S
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
L
 
M
A
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
I
L
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
I
N
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
Q
 
T
T
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
L
 
I
G
 
A
L
 
S
H
 
H
P
 
I
D
 
G
V
 
I
D
 
D
C
 
K
L
 
I
V
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
|
T
E
|
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
F
 
I
M
 
Q
Q
 
E
Y
 
A
S
 
A
A
 
G
Q
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
W
 
T
L
 
L
E
 
E
C
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
P
N
 
N
L
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
A
D
 
D
C
 
A
Q
 
-
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
A
A
 
V
E
 
E
K
 
Q
A
 
A
A
 
H
F
 
Q
G
 
G
I
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
V
 
C
C
|
C
S
 
T
A
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
E
S
 
S
I
 
I
H
 
Y
D
 
E
E
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
R
R
 
R
L
 
S
K
 
V
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
K
R
 
R
W
x
R
L
x
V
P
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
L
 
F
D
 
D
P
 
P
S
 
T
S
 
T
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
V
 
I
D
 
D
S
 
K
R
x
K
Q
|
Q
T
x
Y
A
x
N
R
x
K
I
 
I
M
 
L
K
 
E
F
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
S
A
 
G
E
 
V
Q
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
|
A
T
 
K
R
 
L
I
 
E
C
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
K
Q
 
G
S
 
-
I
 
-
I
 
L
N
 
G
G
 
R
S
 
K
D
 
G
N
 
F
F
 
F
I
 
I
Q
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
F
 
F
T
 
S
G
 
N
V
 
V
T
 
T
P
 
D
D
 
D
M
 
M
P
 
R
L
 
I
F
 
A
R
 
K
D
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
Q
A
 
E
V
 
I
T
 
L
A
 
R
F
 
F
D
 
K
D
 
T
E
 
M
A
 
D
H
 
E
A
 
V
L
 
I
Q
x
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
D
 
N
S
 
S
V
 
D
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
V
W
 
F
T
 
T
D
 
N
D
 
D
L
 
I
N
 
N
R
 
K
A
 
A
H
 
L
R
 
T
V
 
V
A
x
S
R
 
S
Q
 
A
L
 
M
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
W
V
 
I
N
 
N
S
 
C
V
 
Y
D
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
N
V
 
A
T
 
Q
V
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
F
K
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
F
 
N
G
 
G
R
 
R
D
 
E
L
 
M