SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_1420 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1420 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3q2iA Crystal structure of the wlba dehydrognase from chromobactrium violaceum in complex with nadh and udp-glcnaca at 1.50 a resolution (see paper)
24% identity, 97% coverage: 2:342/351 of query aligns to 9:337/345 of 3q2iA

query
sites
3q2iA
N
 
D
S
 
R
P
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
x
C
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
A
Q
 
N
Q
 
N
H
 
H
Y
 
F
Q
 
G
H
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
K
L
 
H
T
 
A
E
 
D
-
 
R
A
 
A
T
 
E
L
 
L
C
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
C
D
|
D
P
x
I
G
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
K
L
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
-
 
R
W
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
R
C
 
G
F
 
H
A
 
A
D
 
S
H
 
L
R
 
T
Q
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
T
K
 
D
P
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
T
N
x
T
P
|
P
N
x
S
T
 
G
L
 
L
H
|
H
V
 
P
S
 
T
T
 
Q
A
 
S
L
 
I
D
 
E
C
 
C
L
 
S
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
H
V
 
V
L
 
M
L
 
T
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
M
G
 
A
V
 
T
H
 
R
L
 
W
D
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
L
E
 
E
L
 
M
V
 
V
T
 
K
A
 
A
S
 
A
K
 
D
A
 
K
S
 
A
G
 
K
V
 
K
P
 
H
V
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
V
H
 
K
H
x
Q
R
x
N
R
 
R
H
 
R
N
 
N
P
 
A
L
 
T
I
 
L
V
 
Q
R
 
L
A
 
L
H
 
K
E
 
R
L
 
A
V
 
M
H
 
Q
S
 
E
G
 
K
A
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
Y
T
 
M
V
 
V
T
 
N
A
 
V
L
 
N
W
 
V
Q
 
F
L
 
W
R
x
T
K
x
R
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
|
Y
F
 
Y
E
 
D
T
 
A
P
 
A
-
 
G
W
|
W
R
|
R
R
 
G
-
 
T
-
 
W
E
 
E
A
 
F
G
 
D
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
F
L
 
M
T
x
N
N
x
Q
L
 
A
I
 
S
H
|
H
D
 
Y
L
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
D
H
 
W
L
 
L
C
 
I
G
 
G
E
 
P
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
I
 
Y
T
 
T
S
 
A
N
 
T
A
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
N
F
 
I
A
 
E
N
 
V
E
 
E
D
 
D
C
 
T
A
 
G
A
 
T
V
 
V
L
 
S
L
 
V
Q
 
K
F
 
W
D
 
R
N
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
M
T
 
N
G
 
V
S
 
T
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
M
P
 
L
V
 
T
Y
 
Y
P
 
P
R
x
K
H
x
N
P
 
L
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
C
 
I
Y
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
T
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
V
G
 
G
A
 
G
L
 
V
S
 
A
I
 
V
P
 
N
Q
 
E
L
 
I
K
 
Q
R
 
H
W
 
W
H
 
E
Y
 
F
N
 
S
D
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
-
H
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
E
N
 
P
F
 
H
S
 
A
A
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
L
 
L
Q
 
Y
L
 
Y
Q
 
D
H
 
N
F
 
V
V
 
I
R
 
K
V
 
T
A
 
M
R
 
R
R
 
G
E
 
E
V
 
A
E
 
T
P
 
P
L
 
E
V
 
T
S
 
D
A
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
G
A
 
L
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
I
A
 
A
I
 
M
R
 
Y
E
 
L
A
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
D
G
 
G
R
 
R

3q2kC Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
25% identity, 97% coverage: 2:341/351 of query aligns to 5:339/347 of 3q2kC

query
sites
3q2kC
N
 
D
S
 
R
P
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
F
A
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
C
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
S
Q
 
K
Q
 
N
H
 
H
Y
 
I
Q
 
G
H
 
A
L
 
I
-
 
A
Q
 
Q
S
 
H
L
 
G
T
 
D
E
 
R
A
 
A
T
 
E
L
 
L
C
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
C
D
|
D
P
x
T
G
 
N
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
Q
L
 
A
A
 
A
-
 
E
A
 
A
Q
 
A
W
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
R
C
 
P
F
 
F
A
 
S
D
 
S
H
 
L
R
 
S
Q
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
G
K
 
N
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
L
A
|
A
N
x
T
P
 
P
N
x
S
T
 
G
L
 
L
H
|
H
V
 
P
S
 
W
T
x
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
E
C
 
V
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
R
P
 
H
V
 
V
L
 
V
L
 
S
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
M
G
 
A
V
 
T
H
 
R
L
 
W
D
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
K
E
 
R
L
 
M
V
 
V
T
 
K
A
 
A
S
 
C
K
 
D
A
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
V
H
 
K
H
x
Q
R
 
N
R
 
R
H
 
R
N
 
N
P
 
A
L
 
T
I
 
L
V
 
Q
R
 
L
A
 
V
H
 
K
E
 
K
L
 
A
V
 
I
H
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
Y
T
 
M
V
 
V
T
 
T
A
 
V
L
 
N
W
 
V
Q
 
F
L
x
W
R
x
T
K
x
R
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
|
Y
F
 
Y
E
 
D
T
 
A
P
 
A
-
 
R
W
|
W
R
|
R
R
 
G
-
 
K
-
 
W
E
 
E
A
 
W
G
 
D
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
F
L
 
M
T
x
N
N
x
Q
L
 
A
I
 
S
H
|
H
D
 
Y
L
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
D
H
 
W
L
 
L
C
 
V
G
 
G
E
 
P
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
Y
A
 
A
I
 
Y
T
 
T
S
 
A
N
 
T
A
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
R
F
 
I
A
 
E
N
 
A
E
 
E
D
 
D
C
 
T
A
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
A
L
 
L
Q
 
R
F
 
W
D
 
R
N
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
N
G
 
V
S
 
T
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
M
P
 
L
V
 
T
Y
 
Y
P
 
P
R
x
Q
H
x
N
P
 
L
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
C
 
I
Y
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
T
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
V
G
 
G
A
 
G
L
 
V
S
 
A
I
 
V
P
 
N
Q
 
R
L
 
I
K
 
D
R
 
E
W
 
W
H
 
K
Y
 
F
N
 
A
D
 
E
V
 
P
D
 
H
G
 
P
G
 
D
W
 
D
H
 
D
Q
 
K
P
 
I
L
 
R
L
 
E
A
 
A
T
 
N
Q
 
Y
E
 
E
N
 
T
F
 
T
S
 
S
A
 
V
-
 
Y
D
 
G
E
 
F
A
 
G
L
 
H
R
 
P
L
 
L
Q
 
Y
L
 
Y
Q
 
D
H
 
N
F
 
V
V
 
I
R
 
N
V
 
C
A
 
L
R
 
R
R
 
G
E
 
D
V
 
C
E
 
E
P
 
P
L
 
E
V
 
T
S
 
D
A
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
G
A
 
L
R
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
Y
E
 
R
A
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
D
G
 
G

3q2kK Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
25% identity, 96% coverage: 5:341/351 of query aligns to 3:314/322 of 3q2kK

query
sites
3q2kK
L
 
I
R
 
R
I
 
F
A
 
G
L
 
L
I
 
V
G
|
G
A
 
C
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
S
Q
 
K
Q
 
N
H
 
H
Y
 
I
Q
 
G
H
 
A
L
 
I
-
 
A
Q
 
Q
S
 
H
L
 
G
T
 
D
E
 
R
A
 
A
T
 
E
L
 
L
C
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
C
D
|
D
P
x
T
G
 
N
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
Q
L
 
A
A
 
A
-
 
E
A
 
A
Q
 
A
W
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
R
C
 
P
F
 
F
A
 
S
D
 
S
H
 
L
R
 
S
Q
 
D
M
 
M
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
G
K
 
N
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
A
N
x
T
P
|
P
N
x
S
T
 
G
L
|
L
H
|
H
V
 
P
S
 
W
T
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
E
C
 
V
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
R
P
 
H
V
 
V
L
 
V
L
 
S
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
M
G
 
A
V
 
T
H
 
R
L
 
W
D
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
K
E
 
R
L
 
M
V
 
V
T
 
K
A
 
A
S
 
C
K
 
D
A
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
V
H
 
K
H
x
Q
R
 
N
R
 
R
H
 
R
N
 
N
P
 
A
L
 
T
I
 
L
V
 
Q
R
 
L
A
 
V
H
 
K
E
 
K
L
 
A
V
 
I
H
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
Y
T
 
M
V
 
V
T
 
T
A
 
V
L
 
N
W
 
V
Q
 
F
L
 
W
R
x
T
K
x
R
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
|
Y
F
 
Y
E
 
D
T
 
A
P
 
A
-
 
R
W
|
W
R
|
R
R
 
G
-
 
K
-
 
W
E
 
E
A
 
W
G
 
D
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
F
L
 
M
T
x
N
N
x
Q
L
 
A
I
 
S
H
|
H
D
 
Y
L
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
D
H
 
W
L
 
L
C
 
V
G
 
G
E
 
P
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
Y
A
 
A
I
 
Y
T
 
T
S
 
A
N
 
T
A
 
L
I
 
A
R
 
R
G
 
R
F
 
I
A
 
E
N
 
A
E
 
E
D
 
D
C
 
T
A
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
A
L
 
L
Q
 
R
F
 
W
D
 
R
N
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
N
G
 
V
S
 
T
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
M
P
 
L
V
 
T
Y
 
Y
P
 
P
R
 
Q
H
x
N
P
 
L
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
C
 
I
Y
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
T
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
V
G
 
G
A
 
G
L
 
V
S
 
A
I
 
V
P
 
N
Q
 
R
L
 
I
K
 
D
R
 
E
W
 
W
H
 
K
Y
 
F
N
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
-
H
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
H
R
 
P
L
 
L
Q
 
Y
L
 
Y
Q
 
D
H
 
N
F
 
V
V
 
I
R
 
N
V
 
C
A
 
L
R
 
R
R
 
G
E
 
D
V
 
C
E
 
E
P
 
P
L
 
E
V
 
T
S
 
D
A
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
G
A
 
L
R
 
Q
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
Y
E
 
R
A
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
D
G
 
G

8qc8D Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ (see paper)
30% identity, 62% coverage: 5:221/351 of query aligns to 2:225/339 of 8qc8D

query
sites
8qc8D
L
 
I
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
H
M
|
M
G
 
A
Q
 
R
Q
 
E
H
 
H
Y
 
V
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
Q
 
A
S
 
L
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
S
T
 
L
L
 
I
C
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
P
|
P
G
x
T
P
 
P
Q
 
S
A
x
S
A
 
L
S
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
W
 
Y
G
 
D
V
 
V
A
 
Q
C
 
T
F
 
F
A
 
S
D
 
A
H
 
H
R
 
K
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
S
A
 
G
K
 
L
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
A
|
A
N
x
S
P
|
P
N
|
N
T
 
D
L
 
T
H
|
H
V
 
L
S
 
E
T
 
I
A
 
L
L
 
K
D
 
D
C
 
I
L
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
V
G
 
C
V
 
T
H
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
A
A
 
T
S
 
Y
G
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
M
H
x
E
R
 
Y
R
 
R
H
 
Y
N
 
M
P
 
P
L
 
P
I
 
V
V
 
Q
R
 
E
A
 
I
H
 
I
E
 
Q
L
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
N
L
 
I
T
 
H
T
 
M
V
 
L
T
 
S
A
 
-
L
 
I
W
 
V
Q
 
E
L
 
H
R
 
R
K
 
F
P
 
P
D
 
F
S
 
L
Y
 
H
F
x
K
E
x
V
T
 
D
P
 
A
W
|
W
R
 
N
R
 
R
-
 
F
-
 
A
E
 
E
A
 
R
G
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
N
 
K
L
 
C
I
 
C
H
 
H
D
 
F
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
R
 
R
-
 
L
H
 
I
L
 
L
C
 
Q
G
 
D
E
 
E
V
 
P
R
 
T
Q
 
R
V
 
I
Q
 
Y
A
 
A
I
 
S
T
 
G
S
 
G
N
 
H
A
 
D
I
 
V
R
 
N
G
 
H
F
 
S
A
 
D
N
 
M
E
 
V
D
 
D
C
 
N
A
 
A
A
 
Y
V
 
V
L
 
I
L
 
V
Q
 
D
F
 
F
D
 
K
N
 
G
G
 
G

8qc8B Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ (see paper)
32% identity, 52% coverage: 5:186/351 of query aligns to 6:193/367 of 8qc8B

query
sites
8qc8B
L
 
I
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
x
H
M
|
M
G
 
A
Q
 
R
Q
 
E
H
 
H
Y
 
V
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
Q
 
A
S
 
L
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
S
T
 
L
L
 
I
C
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
P
|
P
G
x
T
P
 
P
Q
 
S
A
x
S
A
 
L
S
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
W
 
Y
G
 
D
V
 
V
A
 
Q
C
 
T
F
 
F
A
 
S
D
 
A
H
 
H
R
 
K
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
S
A
 
G
K
 
L
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
A
|
A
N
x
S
P
|
P
N
|
N
T
 
D
L
 
T
H
|
H
V
 
L
S
 
E
T
 
I
A
 
L
L
 
K
D
 
D
C
 
I
L
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
V
G
 
C
V
 
T
H
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
A
A
 
T
S
 
Y
G
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
M
H
x
E
R
 
Y
R
 
R
H
 
Y
N
 
M
P
 
P
L
 
P
I
 
V
V
 
Q
R
 
E
A
 
I
H
 
I
E
 
Q
L
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
N
L
 
I
T
 
H
T
 
M
V
 
L
T
 
S
A
 
-
L
 
I
W
 
V
Q
 
E
L
 
H
R
 
R
K
 
F
P
 
P
D
 
F
S
 
L
Y
 
H
F
x
K
E
x
V
T
 
D
P
 
A
W
|
W
R
 
N
R
 
R
-
 
F
-
 
A
E
 
E
A
 
R
G
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
N
 
K
L
 
C
I
 
C
H
 
H
D
 
F
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8qc2A Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ and sulfoquinovose (sq) (see paper)
32% identity, 52% coverage: 5:186/351 of query aligns to 4:191/363 of 8qc2A

query
sites
8qc2A
L
 
I
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
H
M
|
M
G
 
A
Q
 
R
Q
 
E
H
 
H
Y
 
V
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
Q
 
A
S
 
L
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
S
T
 
L
L
 
I
C
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
P
|
P
G
x
T
P
 
P
Q
 
S
A
x
S
A
 
L
S
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
Q
 
R
-
 
E
-
 
I
-
 
G
W
 
Y
G
 
D
V
 
V
A
 
Q
C
 
T
F
 
F
A
 
S
D
 
A
H
 
H
R
 
K
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
S
A
 
G
K
 
L
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
A
|
A
N
x
S
P
|
P
N
|
N
T
 
D
L
 
T
H
|
H
V
 
L
S
 
E
T
 
I
A
 
L
L
 
K
D
 
D
C
 
I
L
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
V
G
 
C
V
 
T
H
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
A
A
 
T
S
 
Y
G
 
T
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
M
H
x
E
R
x
Y
R
 
R
H
 
Y
N
 
M
P
 
P
L
 
P
I
 
V
V
 
Q
R
 
E
A
 
I
H
 
I
E
 
Q
L
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
N
L
 
I
T
 
H
T
 
M
V
 
L
T
 
S
A
 
-
L
 
I
W
 
V
Q
 
E
L
 
H
R
|
R
K
 
F
P
 
P
D
x
F
S
x
L
Y
 
H
F
x
K
E
x
V
T
 
D
P
 
A
W
|
W
R
 
N
R
 
R
-
 
F
-
 
A
E
 
E
A
 
R
G
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
T
L
 
L
L
 
V
T
x
E
N
 
K
L
 
C
I
 
C
H
|
H
D
 
F
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3ceaA Crystal structure of myo-inositol 2-dehydrogenase (np_786804.1) from lactobacillus plantarum at 2.40 a resolution
24% identity, 97% coverage: 3:342/351 of query aligns to 3:336/342 of 3ceaA

query
sites
3ceaA
S
 
K
P
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
I
G
|
G
A
 
L
G
|
G
N
x
R
M
x
L
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
H
 
H
Y
 
A
Q
 
R
H
 
H
L
 
L
Q
 
V
S
 
N
L
 
K
T
 
I
E
 
Q
A
 
G
T
 
V
-
 
K
-
 
L
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
C
A
 
A
D
x
L
P
 
D
G
 
S
P
 
N
Q
|
Q
A
 
L
A
 
E
S
 
W
L
 
A
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
W
 
L
G
 
G
V
 
V
-
 
E
A
 
T
C
 
T
F
 
Y
A
 
T
D
 
N
H
 
Y
R
 
K
Q
 
D
M
 
M
L
 
I
E
 
D
Q
 
T
A
 
E
K
 
N
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
I
I
 
F
V
 
I
A
x
V
N
x
A
P
|
P
N
x
T
T
 
P
L
x
F
H
|
H
V
 
P
S
 
E
T
x
M
A
 
T
L
 
I
D
 
Y
C
 
A
L
 
M
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
N
V
 
V
L
 
F
L
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
L
H
 
D
L
 
F
D
 
N
E
 
E
A
 
V
R
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
A
T
 
K
A
 
V
S
 
I
K
 
K
A
 
S
S
 
H
G
 
P
V
 
N
P
 
Q
V
 
I
L
 
F
-
 
Q
V
 
S
G
 
G
H
 
F
H
x
M
R
 
R
R
 
R
H
 
Y
N
 
D
P
 
D
L
 
S
I
 
Y
V
 
R
R
 
Y
A
 
A
H
 
K
E
 
K
L
 
I
V
 
V
H
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
D
L
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
I
T
 
I
T
 
Y
V
 
M
T
 
R
A
 
G
L
 
Y
W
 
G
Q
 
-
L
 
-
R
 
I
K
 
D
P
 
P
D
 
I
S
 
S
Y
 
G
F
 
M
E
 
E
-
 
S
-
 
F
T
 
T
P
 
K
W
x
F
R
 
A
R
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
D
A
 
S
G
 
G
M
 
G
L
 
I
L
 
F
T
 
V
N
 
D
L
 
M
-
 
N
I
 
I
H
|
H
D
 
D
L
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
R
H
 
W
L
 
F
C
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
D
-
 
P
R
 
V
Q
 
Q
V
 
A
Q
 
Y
A
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
S
N
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
P
A
 
Q
I
 
L
R
 
A
G
 
D
F
 
I
A
 
G
N
 
E
E
 
F
D
 
E
C
 
T
A
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
Q
L
 
L
Q
 
K
F
 
M
D
 
S
N
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
I
G
 
A
S
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
G
D
 
R
A
 
H
V
 
A
A
 
A
A
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
H
P
 
G
D
 
N
Q
 
Q
P
 
V
C
 
E
Y
 
L
L
 
E
L
 
V
A
 
M
G
 
G
T
 
S
G
 
N
G
 
G
A
 
W
L
 
V
S
 
R
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
H
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
K
 
N
R
 
R
W
 
V
H
 
T
Y
 
V
N
 
F
D
 
N
V
 
D
D
 
Q
G
 
G
G
 
V
W
 
V
H
 
R
Q
 
P
P
 
S
L
 
L
L
 
Q
A
 
S
T
x
F
Q
 
G
E
 
E
N
 
R
F
 
F
S
 
-
A
 
-
D
 
D
E
 
T
A
 
A
L
 
F
R
 
T
L
 
D
Q
 
E
L
 
V
Q
 
Q
H
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
N
V
 
N
A
 
V
R
 
I
R
 
V
E
 
G
V
 
K
E
 
Q
P
 
P
L
 
E
V
 
V
S
 
T
A
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
G
A
 
I
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
I
 
A
E
 
K
A
 
A
I
 
C
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
E
 
N
T
 
I
G
 
G
R
 
K

7x2yA Crystal structure of cis-4,5-dihydrodiol phthalate dehydrogenase in complex with NAD+ and 3-hydroxybenzoate (see paper)
28% identity, 64% coverage: 5:227/351 of query aligns to 4:224/342 of 7x2yA

query
sites
7x2yA
L
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
L
 
V
I
 
A
G
|
G
A
 
L
G
|
G
N
x
R
M
x
A
G
 
F
Q
 
T
Q
 
L
H
 
M
Y
 
L
Q
 
P
H
 
T
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
D
T
 
P
E
 
R
A
 
I
T
 
K
L
 
L
C
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
C
D
|
D
P
|
P
-
x
R
G
 
G
P
 
S
Q
 
A
A
 
R
A
 
A
S
 
Q
L
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
W
 
F
G
 
R
V
 
A
A
 
P
C
 
V
F
 
Y
A
 
P
D
 
D
H
 
I
R
 
E
Q
 
G
M
 
L
L
 
A
E
 
S
Q
 
N
A
 
P
K
 
D
P
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
I
I
 
Y
V
 
I
A
|
A
N
x
S
P
|
P
N
 
H
T
 
Q
L
x
F
H
 
H
V
 
A
S
 
Q
T
x
Q
A
 
A
L
 
R
D
 
I
C
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
H
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
|
P
V
 
M
G
 
A
V
 
L
H
 
S
L
 
L
D
 
G
E
 
D
A
 
C
R
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
I
T
 
Q
A
 
H
S
 
C
K
 
R
A
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
H
V
 
L
L
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
H
 
C
R
 
H
R
 
S
H
 
F
N
 
D
P
 
T
L
 
P
I
 
Y
V
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
R
E
 
E
L
 
I
V
 
V
H
 
Q
S
 
S
G
 
G
A
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
P
L
 
V
T
 
R
T
 
M
V
 
V
T
 
H
A
 
A
L
 
L
W
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
K
 
N
P
 
Y
D
 
T
S
 
D
Y
 
F
F
 
L
E
 
Y
T
 
R
P
 
P
W
x
R
R
 
R
R
x
P
E
|
E
A
 
E
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
V
L
 
V
L
 
F
T
 
S
N
x
Q
L
 
A
I
 
A
H
|
H
D
 
Q
L
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
R
H
 
L
L
 
L
C
 
V
G
 
G
-
 
T
E
 
R
V
 
V
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
G
N
 
D
A
 
W
I
 
D
R
 
P
G
 
M
F
 
R
A
 
P
N
 
T
E
 
Q
D
 
G
C
 
A
A
 
Y
A
 
S
V
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
W
F
 
F
D
 
E
N
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
F
G
 
A
S
 
S
L
 
I
T
 
S

Sites not aligning to the query:

8qc6A Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from arthrobacter sp. U41 in complex with NAD+ and sulfoquinovose (sq) (see paper)
31% identity, 52% coverage: 5:186/351 of query aligns to 6:193/366 of 8qc6A

query
sites
8qc6A
L
 
I
R
 
R
I
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
x
H
M
|
M
G
 
A
Q
 
R
Q
 
E
H
 
H
Y
 
V
Q
 
R
H
 
N
L
 
L
Q
 
A
S
 
L
L
 
I
T
 
P
E
 
G
A
 
S
T
 
L
L
 
I
C
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
S
D
|
D
P
|
P
G
 
Q
P
 
P
Q
 
S
A
x
S
-
 
L
A
 
E
S
 
E
L
 
T
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
W
 
I
G
 
G
-
 
Y
-
 
E
V
 
V
A
 
T
C
 
T
F
 
F
A
 
P
D
 
D
H
 
H
R
 
R
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
V
Q
 
S
A
 
G
K
 
L
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
A
|
A
N
x
S
P
|
P
N
|
N
T
 
D
L
 
T
H
|
H
V
 
L
S
 
D
T
 
I
A
 
L
L
 
K
D
 
D
C
 
I
L
 
F
A
 
S
-
 
N
-
 
Q
A
 
M
G
 
K
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
V
G
 
C
V
 
T
H
 
T
L
 
A
D
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
E
T
 
S
A
 
L
S
 
A
K
 
A
A
 
G
S
 
Y
G
 
S
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
A
H
 
M
H
x
E
R
x
Y
R
 
R
H
 
Y
N
 
M
P
 
P
L
 
P
I
 
V
V
 
Q
R
 
E
A
 
L
H
 
I
E
 
Q
L
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
N
L
 
V
T
 
F
T
 
M
V
 
L
T
 
S
A
 
-
L
 
I
W
 
V
Q
 
E
L
 
H
R
|
R
K
 
F
P
 
P
D
x
F
S
x
L
Y
 
H
F
x
K
E
x
V
T
 
D
P
 
A
W
|
W
R
 
N
R
 
R
-
 
F
-
 
N
E
 
E
A
 
R
G
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
T
L
 
L
L
 
V
T
x
E
N
x
K
L
 
C
I
 
C
H
|
H
D
 
F
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1zh8A Crystal structure of oxidoreductase (tm0312) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
24% identity, 95% coverage: 5:338/351 of query aligns to 4:315/325 of 1zh8A

query
sites
1zh8A
L
 
I
R
 
R
I
 
L
A
 
G
L
 
I
I
 
V
G
|
G
A
x
C
G
|
G
N
x
I
M
x
A
G
 
A
Q
 
R
Q
 
E
H
 
L
Y
 
H
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
Q
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
S
S
 
H
L
 
L
T
 
F
E
 
E
A
 
I
T
 
T
L
 
-
C
 
A
A
 
V
V
 
T
A
x
S
D
x
R
P
x
T
G
 
R
P
 
S
Q
x
H
A
 
A
A
 
E
S
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
K
Q
 
M
W
 
V
G
 
G
V
 
N
-
 
P
A
 
A
C
 
V
F
 
F
A
 
D
D
 
S
H
 
Y
R
 
E
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
A
 
G
K
 
L
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
D
V
 
L
A
x
T
N
x
L
P
|
P
N
 
V
T
 
E
L
|
L
H
 
N
V
 
L
S
 
P
T
 
F
A
 
I
L
 
E
D
 
K
C
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
H
V
 
V
L
 
I
L
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
I
G
 
S
V
 
T
H
 
D
L
 
V
D
 
E
E
 
T
A
 
G
R
 
K
E
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
E
A
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
K
S
 
S
G
 
E
V
 
K
P
 
T
V
 
V
L
 
Y
V
 
I
G
 
A
H
 
E
H
x
N
R
 
F
R
 
R
H
 
H
N
 
V
P
 
P
L
 
A
I
 
F
V
 
W
R
 
K
A
 
A
H
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
H
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
-
L
 
-
T
 
D
T
 
P
V
 
V
T
 
F
A
 
M
L
 
N
W
 
W
Q
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
V
-
 
G
L
 
M
R
 
D
K
 
E
P
 
N
D
 
N
S
 
K
Y
|
Y
F
 
V
E
 
H
T
 
T
P
 
D
W
|
W
R
|
R
R
 
K
E
 
K
A
 
P
G
 
K
-
 
H
-
 
V
A
 
G
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
S
T
 
D
N
 
G
L
 
G
I
 
V
H
|
H
D
 
H
L
 
A
D
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
H
 
L
L
 
I
C
 
L
G
 
G
E
 
E
V
 
I
R
 
E
Q
 
W
V
 
I
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
T
 
A
S
 
K
N
 
D
A
 
L
I
 
S
R
 
P
G
 
L
F
 
L
A
 
G
N
 
G
E
 
M
D
 
D
C
 
F
A
 
L
A
 
S
V
 
S
L
 
I
L
 
F
Q
 
E
F
 
F
D
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
T
L
 
V
G
 
G
S
 
N
L
 
Y
T
 
T
G
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
I
S
 
S
W
 
Y
E
 
S
L
 
L
D
 
K
S
 
G
G
 
N
E
 
E
N
 
R
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
F
L
 
E
L
 
I
A
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
K
L
 
I
S
 
S
I
 
I
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
S
W
 
W
H
 
D
Q
 
K
P
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
N
T
 
E
Q
 
E
E
 
E
-
 
M
N
 
K
F
 
V
S
 
P
A
 
Q
D
 
E
E
 
N
A
 
S
L
x
Y
R
 
Q
L
 
K
Q
 
E
L
 
F
Q
 
E
H
 
D
F
 
F
V
 
Y
R
 
Q
-
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
G
E
 
K
V
 
P
E
 
N
P
 
D
L
 
L
V
 
G
S
 
S
A
 
P
A
 
V
D
 
Q
A
 
A
A
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
F
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
C
R
 
V
E
 
R
A
 
S
A
 
A

1evjA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase (gfor) delta1-22 s64d (see paper)
25% identity, 86% coverage: 40:342/351 of query aligns to 40:326/340 of 1evjA

query
sites
1evjA
Q
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
W
 
Y
G
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
K
-
 
I
A
 
Y
C
 
D
F
 
Y
A
 
S
D
 
N
H
 
F
R
 
D
Q
 
K
M
 
I
L
 
A
E
 
K
Q
 
D
A
 
P
K
 
K
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
Y
V
 
I
A
 
I
N
x
L
P
|
P
N
|
N
T
 
S
L
 
L
H
|
H
V
 
A
S
 
E
T
 
F
A
 
A
L
 
I
D
 
R
C
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
V
L
 
M
L
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
M
G
 
A
V
 
T
H
 
S
L
 
V
D
 
A
E
 
D
A
 
C
R
 
Q
E
 
R
L
 
M
V
 
I
T
 
D
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
N
V
 
K
P
 
K
V
 
L
L
 
M
V
 
I
G
 
G
H
 
Y
H
x
R
R
 
C
R
 
H
H
 
Y
N
 
D
P
 
P
L
 
M
I
 
N
V
 
R
R
 
A
A
 
A
H
 
V
E
 
K
L
 
L
V
 
I
H
 
R
S
 
E
G
 
N
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
L
T
 
G
T
 
M
V
 
V
T
 
T
A
 
T
L
 
D
W
 
N
Q
 
S
-
 
D
-
 
V
L
 
M
R
 
D
K
 
Q
P
 
N
D
 
D
S
 
P
Y
 
A
F
 
Q
E
 
Q
T
x
W
P
x
R
W
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
E
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
S
L
 
L
L
 
M
T
 
D
N
 
I
L
 
G
I
 
I
H
x
Y
D
 
G
L
 
L
D
 
N
L
 
G
L
 
T
R
 
R
H
 
Y
L
 
L
C
 
L
G
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
V
 
Y
Q
 
T
A
 
Y
I
 
S
T
 
D
S
 
P
N
 
N
A
 
D
I
 
E
R
 
R
G
 
F
F
 
V
A
 
E
N
 
V
E
 
E
D
 
D
C
 
R
A
 
I
A
 
I
V
 
W
L
 
Q
L
 
M
Q
 
R
F
 
F
D
 
R
N
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
S
S
 
H
L
 
G
T
 
A
G
 
S
S
 
S
D
 
Y
A
 
S
V
 
T
A
 
T
A
 
T
P
 
T
W
 
S
S
 
R
W
 
F
E
 
S
L
 
V
D
 
Q
S
 
G
G
 
-
E
 
-
N
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
D
Q
 
K
P
 
A
C
 
V
Y
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
I
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
D
V
 
P
D
 
A
G
 
T
G
 
G
W
x
Y
H
 
Y
Q
 
Q
P
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
S
T
 
V
Q
 
Q
E
 
T
N
 
P
F
 
M
S
 
P
A
 
A
D
 
N
E
 
N
A
 
Q
L
 
F
R
 
S
L
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
D
H
 
H
F
 
L
V
 
A
R
 
E
V
 
A
A
 
V
R
 
I
R
 
N
E
 
N
V
 
K
E
 
P
P
 
V
L
 
R
V
 
S
S
 
P
A
 
G
A
 
E
D
 
E
A
 
G
A
 
M
R
 
Q
T
 
D
L
 
V
A
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6jw6A The crystal structure of kand2 in complex with NAD (see paper)
32% identity, 63% coverage: 4:224/351 of query aligns to 1:224/341 of 6jw6A

query
sites
6jw6A
P
 
P
L
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
Q
 
G
Q
 
V
H
 
H
Y
 
A
Q
 
E
H
 
V
L
 
V
Q
 
A
S
 
A
L
 
H
T
 
P
E
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
C
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
|
D
P
x
L
G
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
W
 
R
G
 
A
V
 
E
A
 
P
C
 
S
F
 
W
A
 
A
D
 
D
H
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
D
A
 
P
K
 
A
P
 
I
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
I
A
x
T
N
x
T
P
|
P
N
|
N
T
 
G
L
|
L
H
|
H
V
 
H
S
 
R
T
x
Q
A
 
A
L
 
A
D
 
E
C
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
T
L
 
P
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
G
A
 
R
S
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
V
 
L
L
 
A
V
 
H
G
 
G
H
 
S
H
x
N
R
 
F
R
 
V
H
 
H
N
 
S
P
 
P
L
 
K
I
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
A
H
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
-
 
A
H
 
D
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
P
T
 
H
T
 
L
V
 
V
T
 
R
A
 
V
L
 
V
W
 
F
Q
 
R
L
 
N
R
 
S
K
 
G
P
 
P
D
 
E
S
 
A
Y
 
A
F
x
W
E
 
A
T
 
A
P
 
S
W
 
-
R
 
K
R
 
D
E
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
D
N
 
L
L
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
C
R
 
R
H
 
W
L
 
L
C
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
S
A
 
A
I
 
R
T
 
L
S
 
Q
N
 
R
A
 
-
I
 
V
R
 
R
G
 
P
F
 
P
A
 
A
N
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
Q
A
 
A
A
 
L
V
 
L
L
 
V
L
 
M
Q
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6jw8A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin b (see paper)
32% identity, 63% coverage: 4:224/351 of query aligns to 1:224/342 of 6jw8A

query
sites
6jw8A
P
 
P
L
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
Q
 
G
Q
 
V
H
 
H
Y
 
A
Q
 
E
H
 
V
L
 
V
Q
 
A
S
 
A
L
 
H
T
 
P
E
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
C
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
|
D
P
x
L
G
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
W
 
R
G
 
A
V
 
E
A
 
P
C
 
S
F
 
W
A
 
A
D
 
D
H
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
D
A
 
P
K
 
A
P
 
I
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
I
A
x
T
N
x
T
P
|
P
N
|
N
T
 
G
L
|
L
H
|
H
V
 
H
S
 
R
T
x
Q
A
 
A
L
 
A
D
 
E
C
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
T
L
 
P
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
G
A
 
R
S
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
V
 
L
L
 
A
V
 
H
G
 
G
H
 
S
H
x
N
R
 
F
R
 
V
H
 
H
N
 
S
P
 
P
L
 
K
I
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
A
H
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
-
 
A
H
 
D
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
P
T
 
H
T
 
L
V
 
V
T
 
R
A
 
V
L
 
V
W
x
F
Q
 
R
L
x
N
R
 
S
K
 
G
P
 
P
D
 
E
S
 
A
Y
 
A
F
x
W
E
 
A
T
 
A
P
 
S
W
 
-
R
 
K
R
 
D
E
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
T
x
D
N
x
L
L
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
C
R
 
R
H
 
W
L
 
L
C
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
S
A
 
A
I
 
R
T
 
L
S
 
Q
N
 
R
A
 
-
I
 
V
R
 
R
G
 
P
F
 
P
A
 
A
N
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
Q
A
 
A
A
 
L
V
 
L
L
 
V
L
 
M
Q
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6jw7A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin a (see paper)
32% identity, 63% coverage: 4:224/351 of query aligns to 1:224/342 of 6jw7A

query
sites
6jw7A
P
 
P
L
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
Q
 
G
Q
 
V
H
 
H
Y
 
A
Q
 
E
H
 
V
L
 
V
Q
 
A
S
 
A
L
 
H
T
 
P
E
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
L
C
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
H
D
|
D
P
x
L
G
 
D
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
A
Q
 
E
W
 
R
G
 
A
V
 
E
A
 
P
C
 
S
F
 
W
A
 
A
D
 
D
H
 
-
R
 
-
Q
 
-
M
 
L
L
 
L
E
 
A
Q
 
D
A
 
P
K
 
A
P
 
I
D
 
D
A
 
L
V
 
L
I
 
I
V
 
I
A
x
T
N
x
T
P
|
P
N
|
N
T
 
G
L
|
L
H
|
H
V
 
H
S
 
R
T
x
Q
A
 
A
L
 
A
D
 
E
C
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
V
L
 
L
L
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
T
L
 
P
D
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
E
A
 
L
S
 
A
K
 
G
A
 
R
S
 
H
G
 
D
V
 
R
P
 
V
V
 
L
L
 
A
V
 
H
G
 
G
H
 
S
H
x
N
R
 
F
R
 
V
H
 
H
N
 
S
P
 
P
L
 
K
I
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
A
H
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
-
 
A
H
 
D
S
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
P
T
 
H
T
 
L
V
 
V
T
 
R
A
 
V
L
 
V
W
 
F
Q
 
R
L
x
N
R
 
S
K
 
G
P
 
P
D
 
E
S
 
A
Y
 
A
F
x
W
E
 
A
T
 
A
P
 
S
W
 
-
R
 
K
R
 
D
E
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
L
T
x
D
N
 
L
L
 
G
I
 
C
H
|
H
D
 
A
L
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
C
R
 
R
H
 
W
L
 
L
C
 
L
-
 
D
-
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
V
 
V
Q
 
S
A
 
A
I
 
R
T
 
L
S
 
Q
N
 
R
A
 
-
I
 
V
R
 
R
G
 
P
F
 
P
A
 
A
N
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
Q
A
 
A
A
 
L
V
 
L
L
 
V
L
 
M
Q
 
E
F
 
F
D
 
A
N
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6a3iA Levoglucosan dehydrogenase, complex with nadh and levoglucosan (see paper)
27% identity, 64% coverage: 5:229/351 of query aligns to 3:249/372 of 6a3iA

query
sites
6a3iA
L
 
L
R
 
N
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
Q
 
K
Q
 
A
H
 
H
Y
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
S
L
 
L
T
 
A
E
 
Y
A
 
A
T
 
A
L
 
M
C
 
P
A
 
M
V
 
F
A
 
F
D
 
W
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Q
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
x
E
-
x
A
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
W
 
F
G
 
G
V
 
F
A
 
E
-
 
N
C
 
S
F
 
T
A
 
S
D
 
D
H
 
W
R
 
R
Q
 
S
M
 
I
L
 
I
E
 
D
Q
 
D
A
 
P
K
 
D
P
 
I
D
 
H
A
 
V
V
 
V
I
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
T
P
|
P
N
|
N
T
 
H
L
|
L
H
|
H
V
 
A
S
 
E
T
 
I
A
 
A
L
 
I
D
 
A
C
 
A
L
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
H
V
 
I
L
 
I
L
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
V
 
L
G
 
A
V
 
R
H
 
T
L
 
G
D
 
E
E
 
E
A
 
S
R
 
K
E
 
A
L
 
M
V
 
Y
T
 
D
A
 
A
S
 
V
K
 
K
A
 
D
S
 
K
G
 
N
V
 
I
P
 
V
V
 
H
L
 
M
V
 
V
G
 
A
H
 
F
H
 
N
R
x
Y
R
 
R
H
 
R
N
 
T
P
 
P
L
 
A
I
 
V
V
 
A
R
 
L
A
 
A
H
 
K
E
 
K
L
 
Y
V
 
I
H
 
E
S
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
I
T
 
L
T
 
S
V
 
F
T
 
R
A
 
G
L
 
T
W
x
Y
-
 
L
Q
|
Q
L
 
D
R
 
W
K
 
S
P
 
A
D
 
D
S
 
P
Y
 
N
F
 
S
E
 
P
T
 
L
P
 
S
W
|
W
R
|
R
R
 
F
E
 
Q
-
 
K
-
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
S
G
 
G
M
 
A
L
 
L
L
 
G
T
x
D
N
 
I
L
 
A
I
 
T
H
|
H
D
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
M
L
 
A
R
 
R
H
 
Y
L
 
L
C
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
F
R
 
S
Q
 
A
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
I
 
V
T
 
L
S
 
S
N
 
T
A
 
W
I
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
R
 
K
G
 
G
F
 
P
A
 
V
N
 
D
-
 
V
E
 
D
D
 
D
C
 
E
A
 
V
A
 
M
V
 
T
L
 
M
L
 
I
Q
 
R
F
 
F
D
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
V
T
 
E
G
 
A
S
 
T

6a3jC Levoglucosan dehydrogenase, complex with nadh and l-sorbose (see paper)
27% identity, 63% coverage: 5:226/351 of query aligns to 2:250/378 of 6a3jC

query
sites
6a3jC
L
 
L
R
 
N
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
Q
 
K
Q
 
A
H
 
H
Y
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
S
L
 
L
T
 
A
E
 
Y
A
 
A
T
 
A
L
 
M
C
 
P
A
 
M
V
 
F
A
 
F
D
 
W
P
 
P
G
 
A
P
 
P
Q
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
A