SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_1761 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1761 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
46% identity, 100% coverage: 2:232/232 of query aligns to 24:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
A
 
A
E
 
R
Y
 
V
F
 
F
A
 
M
G
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
Q
 
E
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
K
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
P
Y
 
G
L
 
V
C
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
D
E
 
R
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
H
H
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
L
 
M
L
 
L
L
 
S
K
|
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
P
K
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
N
 
Q
N
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
R
 
G
A
 
T
-
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
L
 
A
G
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
K
|
K
M
 
M
T
 
K
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
N
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
M
L
 
M

Sites not aligning to the query:

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
46% identity, 90% coverage: 23:230/232 of query aligns to 45:244/247 of P73574

query
sites
P73574
D
 
D
D
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
V
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
A
Y
 
V
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
N
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
D
H
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
Q
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
K
K
 
L
M
 
M
V
 
L
E
 
K
L
 
-
N
 
Q
N
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
-
 
G
R
 
M
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
E
G
 
N
M
 
L
K
x
N
P
 
A
E
 
E
A
 
P
L
 
I
E
 
L
K
 
Q
M
 
F
T
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
T
A
 
I
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
T
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
F
E
 
N
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
41% identity, 93% coverage: 18:232/232 of query aligns to 38:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
N
 
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
D
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
R
L
 
-
N
 
Q
N
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
G
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
A
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
51% identity, 74% coverage: 59:230/232 of query aligns to 75:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
D
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
E
 
E
M
 
V
I
 
V
K
 
K
-
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
P
K
 
H
M
 
M
V
 
I
E
 
A
L
 
-
N
 
A
N
 
K
T
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
N
I
 
A
S
 
S
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
L
 
Q
G
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
V
A
 
A
G
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
I
T
 
S
G
 
G
R
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
40% identity, 95% coverage: 8:228/232 of query aligns to 31:236/240 of P73826

query
sites
P73826
L
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
C
 
T
K
 
D
A
 
G
Q
 
G
G
 
N
V
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
T
N
 
D
E
 
L
E
 
E
Q
 
S
V
 
M
T
 
T
H
 
A
M
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
L
 
F
L
 
F
L
 
P
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
L
S
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
T
 
I
R
 
K
E
 
P
V
 
F
A
 
I
A
 
E
K
 
G
M
 
M
V
 
Y
E
 
E
L
 
-
N
 
R
N
 
K
T
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
-
 
G
R
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
M
V
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
G
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
T
A
 
K
G
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
F
K
 
R
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
R
M
 
V
D
 
N
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
41% identity, 93% coverage: 18:232/232 of query aligns to 35:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
N
x
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
D
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
x
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
R
L
 
-
N
 
Q
N
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
G
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
A
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

Sites not aligning to the query:

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:232/232 of query aligns to 24:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
I
A
 
A
E
 
Q
Y
 
V
F
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
Q
 
A
E
 
H
K
 
G
L
 
-
D
 
E
D
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
C
 
L
K
 
R
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
L
A
 
F
Y
 
I
L
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
A
 
A
N
 
E
E
 
K
E
 
T
Q
 
Q
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
L
L
 
H
K
 
K
V
 
L
K
 
T
D
 
E
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
A
 
I
K
 
R
M
 
M
V
 
R
E
 
E
L
 
-
N
 
R
N
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
L
 
R
G
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
K
 
I
M
 
M
T
 
V
A
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
H
 
E
S
 
C
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
N
M
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
43% identity, 86% coverage: 32:230/232 of query aligns to 53:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
V
R
 
E
A
 
A
Y
 
M
L
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
I
E
 
A
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
T
 
D
H
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
D
E
 
E
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
M
E
 
K
L
 
-
N
 
Q
N
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
G
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
A
 
V
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
44% identity, 83% coverage: 41:232/232 of query aligns to 52:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
C
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
V
E
 
T
Q
 
G
V
 
V
T
 
E
H
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
A
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
T
L
 
R
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
-
E
 
Q
L
 
T
N
 
N
N
 
G
T
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
L
 
K
G
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
V
A
 
A
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
N
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
40% identity, 88% coverage: 30:232/232 of query aligns to 48:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
D
A
 
F
R
 
Y
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
G
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
H
 
Q
M
 
A
V
 
F
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
A
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
R
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
-
N
 
R
N
 
G
T
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
 
Q
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
M
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
V
L
 
K
G
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
R
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
S
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
H
 
S
S
 
I
A
 
V
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
M
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
44% identity, 82% coverage: 41:230/232 of query aligns to 62:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
Q
E
 
E
E
 
S
Q
 
E
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
R
G
 
D
E
 
D
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
S
R
 
R
E
 
-
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
I
V
 
M
E
 
L
L
 
K
N
 
Q
N
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
S
M
 
L
T
 
L
A
 
E
G
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
V
A
 
V
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
E
 
N
M
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:232/232 of query aligns to 22:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
F
 
M
A
 
A
G
 
R
L
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
x
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
|
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
 
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
I
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
Q
L
 
-
N
 
Q
N
 
Q
T
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
|
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
G
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
A
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
37% identity, 100% coverage: 1:232/232 of query aligns to 18:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
F
 
M
A
 
A
G
 
R
L
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
 
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
x
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
I
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
Q
L
 
-
N
 
Q
N
 
Q
T
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
Y
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
K
G
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
A
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:230/232 of query aligns to 28:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
F
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
 
D
Q
 
R
E
 
A
K
 
A
L
 
A
D
 
Q
D
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
R
A
 
L
C
 
L
K
 
G
A
 
G
Q
 
P
G
 
G
V
 
S
E
 
N
A
 
H
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
Q
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
E
E
 
A
E
 
R
Q
 
A
V
 
A
T
 
R
H
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
P
H
 
P
G
 
S
L
 
V
I
 
V
-
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
H
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
E
A
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
M
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
N
N
 
G
N
 
C
T
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
A
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
P
M
|
M
T
 
T
L
 
Q
G
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
T
A
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
V
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
S
L
 
V
E
 
E
M
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:230/232 of query aligns to 26:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
F
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
 
D
Q
 
R
E
 
A
K
 
A
L
 
A
D
 
Q
D
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
R
A
 
L
C
 
L
K
 
P
A
 
P
Q
 
R
G
 
G
V
 
N
E
 
H
A
 
A
R
 
-
A
 
A
Y
 
F
L
 
Q
C
x
A
N
 
D
V
|
V
A
 
S
N
 
E
E
 
A
E
 
R
Q
 
A
V
 
A
T
 
R
H
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
P
H
 
P
G
 
S
L
 
V
I
 
V
-
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
H
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
E
A
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
M
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
N
N
 
G
N
 
C
T
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
A
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
x
P
M
|
M
T
|
T
L
 
Q
G
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
T
A
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
V
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
S
L
 
V
E
 
E
M
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 5:232/232 of query aligns to 25:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
F
A
 
A
G
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
 
I
N
 
D
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
D
 
R
D
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
C
 
F
K
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
R
 
L
A
 
G
Y
 
A
L
 
V
C
 
A
N
x
D
V
x
I
A
 
G
N
 
N
E
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
T
 
D
H
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
R
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
G
K
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
-
N
 
N
N
 
K
T
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
R
S
 
A
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
G
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
W
L
 
D
G
 
E
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
L
 
Q
E
 
Q
K
 
F
M
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
D
N
 
D
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
F
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
R
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:232/232 of query aligns to 24:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
F
A
 
A
G
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
x
I
N
 
D
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
D
 
R
D
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
C
 
F
K
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
R
 
L
A
 
G
Y
 
A
L
 
V
C
 
A
N
 
D
V
x
I
A
 
G
N
 
N
E
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
T
 
D
H
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
L
 
R
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
G
K
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
-
N
 
N
N
 
K
T
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
G
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
W
L
 
D
G
 
E
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
L
 
Q
E
 
Q
K
 
F
M
 
L
T
 
L
A
 
S
G
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
D
N
 
D
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
F
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
R
R
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
38% identity, 93% coverage: 18:232/232 of query aligns to 37:245/246 of P14697

query
sites
P14697
N
 
N
Q
 
S
E
 
P
K
x
R
L
 
R
D
 
E
D
 
K
A
 
W
V
 
L
A
 
E
A
x
Q
C
 
Q
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
D
A
 
F
R
 
I
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
H
 
T
M
 
A
V
 
F
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
S
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
x
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
R
K
|
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
V
 
A
E
 
D
L
 
-
N
 
R
N
 
G
T
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
x
Q
V
x
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
H
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
M
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
x
T
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
V
L
 
K
G
 
A
M
 
I
K
x
R
P
 
Q
E
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
I
A
 
C
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
F
 
S
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
M
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
L
 
M

Sites not aligning to the query:

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
38% identity, 93% coverage: 18:232/232 of query aligns to 40:248/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
N
 
N
Q
 
S
E
 
P
K
x
R
L
 
R
D
 
E
D
 
K
A
 
W
V
 
L
A
 
E
A
 
Q
C
 
Q
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
D
A
 
F
R
 
I
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
H
 
T
M
 
A
V
 
F
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
S
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
x
T
R
 
R
D
|
D
G
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
R
K
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
V
 
A
E
 
D
L
 
-
N
 
R
N
 
G
T
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
x
Q
V
x
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
H
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
M
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
|
M
T
x
V
L
 
K
G
 
A
M
 
I
K
x
R
P
 
Q
E
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
I
A
 
C
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
F
 
S
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
M
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
L
 
M

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 86% coverage: 33:232/232 of query aligns to 53:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
G
 
G
V
 
D
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
L
 
-
N
 
K
N
 
R
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
G
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
M
 
T
T
 
L
A
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PfGW456L13_1761 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1761
MAEYFAGLGAKLALVDLNQEKLDDAVAACKAQGVEARAYLCNVANEEQVTHMVAQVAEDF
GAIHGLINNAGILRDGLLLKVKDGEMIKMSLAQWQAVIDVNLTGVFLCTREVAAKMVELN
NTGAIINISSISRAGNVGQTNYSAAKAGVAAATVTWAKELARYGIRVAGIAPGFIETEMT
LGMKPEALEKMTAGIPLKRMGKPEEIAHSAAYIFENDYYTGRILEMDGGLRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory