SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_1849 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_1849 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q51422 Aspartate--tRNA(Asp/Asn) ligase; Aspartyl-tRNA synthetase; AspRS; Non-discriminating aspartyl-tRNA synthetase; ND-AspRS; EC 6.1.1.23 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
89% identity, 100% coverage: 1:591/591 of query aligns to 1:591/591 of Q51422

query
sites
Q51422
M
 
M
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
E
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
C
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
 
R
D
 
D
H
|
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
S
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
|
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
A
 
P
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
S
I
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
Q
S
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
L
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
E
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
A
R
 
R
M
 
I
T
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
E
 
D
N
 
N
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
R
T
 
T
H
 
Y
A
 
P
G
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
K
C
 
C
F
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
S
E
 
D
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
M
 
M
I
 
V
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
D
E
 
E
F
 
F
P
 
P
H
 
H
M
 
M
T
 
P
F
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
E
F
 
F
K
 
K
V
 
V
F
 
F
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
C
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
R
 
R
K
 
S
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
 
K
N
 
F
I
 
I
P
 
P
E
 
E
D
 
A
N
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
K
 
K
L
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
C
 
R
K
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
P
M
 
M
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
S
P
 
P
K
 
K
C
 
C
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
D
K
 
K
E
 
S
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
M
L
 
L
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
Q
P
 
P
K
 
K
A
 
A
E
 
E

4wj3M Crystal structure of the asparagine transamidosome from pseudomonas aeruginosa (see paper)
89% identity, 100% coverage: 2:590/591 of query aligns to 1:589/589 of 4wj3M

query
sites
4wj3M
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
E
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
C
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
H
R
 
R
R
 
R
R
|
R
D
|
D
H
|
H
G
 
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
F
|
F
L
 
L
D
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
|
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
|
R
S
 
S
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
|
A
T
 
R
N
|
N
A
 
P
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
S
I
 
I
E
|
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
Q
S
 
A
E
 
E
T
|
T
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
N
x
D
E
 
E
F
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
|
V
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
L
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
E
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
A
R
 
R
M
 
I
T
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
E
 
D
N
 
N
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
R
T
 
T
H
 
Y
A
 
P
G
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
K
C
 
C
F
 
F
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
S
E
 
D
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
M
 
M
I
 
V
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
D
E
 
E
F
 
F
P
 
P
H
 
H
M
 
M
T
 
P
F
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
E
F
 
F
K
 
K
V
 
V
F
 
F
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
C
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
R
 
R
K
 
S
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
 
K
N
 
F
I
 
I
P
 
P
E
 
E
D
 
A
N
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
K
 
K
L
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
C
 
R
K
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
P
M
 
M
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
S
P
 
P
K
 
K
C
 
C
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
D
K
 
K
E
 
S
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
L
V
 
V
M
 
M
L
 
L
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
Q
P
 
P
K
 
K
A
 
A

4wj4A Crystal structure of non-discriminating aspartyl-tRNA synthetase from pseudomonas aeruginosa complexed with tRNA(asn) and aspartic acid (see paper)
89% identity, 99% coverage: 2:586/591 of query aligns to 1:585/585 of 4wj4A

query
sites
4wj4A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
E
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
C
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
H
R
|
R
R
 
R
R
|
R
D
|
D
H
|
H
G
|
G
G
|
G
V
|
V
I
 
I
F
|
F
L
 
L
D
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
|
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
|
R
S
 
S
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
K
 
K
I
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
|
R
L
 
L
R
 
R
P
|
P
A
 
E
G
 
G
A
|
A
T
 
R
N
|
N
A
 
P
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
S
I
 
I
E
|
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
N
E
 
Q
S
 
A
E
 
E
T
|
T
P
 
P
P
|
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
N
x
D
E
|
E
F
 
Y
S
 
S
D
|
D
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
|
E
T
 
T
R
 
R
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
L
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
E
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
A
R
 
R
M
 
I
T
 
T
T
 
S
S
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
E
 
D
N
 
N
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
|
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
R
T
 
T
H
 
Y
A
 
P
G
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
|
S
P
 
P
Q
|
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
K
C
 
C
F
 
F
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
|
D
L
 
L
R
|
R
A
|
A
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
S
E
 
D
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
M
 
M
I
 
V
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
D
E
 
E
F
 
F
P
 
P
H
 
H
M
 
M
T
 
P
F
 
F
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
E
F
 
F
K
 
K
V
 
V
F
 
F
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
C
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
M
P
 
P
R
 
R
K
 
S
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
 
K
N
 
F
I
 
I
P
 
P
E
 
E
D
 
A
N
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
K
 
K
L
 
V
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
C
 
R
K
 
E
W
 
W
A
 
A
P
 
P
M
 
M
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
T
 
S
A
|
A
L
 
L
H
|
H
H
|
H
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
S
P
 
P
K
 
K
C
 
C
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
|
R
I
 
I
H
 
H
R
 
D
K
 
K
E
 
S
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
|
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
L
V
 
V
M
 
M
L
 
L
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
R
|
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
|
T
Q
|
Q
S
|
S
A
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E

1c0aA Crystal structure of the e. Coli aspartyl-tRNA synthetase : trnaasp : aspartyl-adenylate complex (see paper)
63% identity, 99% coverage: 2:584/591 of query aligns to 1:583/585 of 1c0aA

query
sites
1c0aA
M
 
M
R
 
R
S
 
T
H
 
E
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
R
E
 
L
S
 
S
L
 
H
D
 
V
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
C
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
N
R
|
R
R
 
R
R
|
R
D
|
D
H
x
L
G
|
G
G
x
S
V
x
L
I
 
I
F
|
F
L
 
I
D
 
D
I
 
M
R
 
R
D
 
D
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
I
A
 
V
Q
|
Q
V
 
V
V
x
F
F
 
F
D
|
D
P
|
P
D
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
D
T
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
E
V
 
L
R
|
R
S
 
N
E
 
E
Y
 
F
V
 
C
V
 
I
K
 
Q
I
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
T
V
 
V
R
|
R
L
 
A
R
|
R
P
 
D
A
 
E
G
 
K
A
x
N
T
 
I
N
|
N
A
 
R
N
 
D
M
|
M
A
 
A
S
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
I
E
|
E
V
 
V
L
 
L
G
 
A
Y
 
S
E
 
S
L
 
L
E
 
T
V
 
I
L
 
I
N
 
N
E
 
R
S
 
A
E
 
D
T
 
V
P
 
L
P
|
P
F
 
L
P
x
D
L
 
S
N
|
N
E
x
H
F
 
V
S
x
N
D
x
T
V
 
-
G
 
-
E
 
E
E
|
E
T
 
A
R
 
R
L
 
L
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
E
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
K
L
 
T
R
 
R
S
 
A
R
 
K
M
 
I
T
 
T
T
 
S
S
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
D
N
 
H
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
A
T
|
T
P
|
P
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
R
T
 
V
H
 
H
A
 
K
G
 
G
S
 
K
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
|
S
P
 
P
Q
|
Q
L
 
L
F
 
F
K
|
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
M
A
 
S
G
 
G
F
 
F
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
V
K
 
K
C
 
C
F
 
F
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
|
D
L
 
L
R
|
R
A
|
A
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
|
F
T
 
T
Q
|
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
V
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
F
L
 
M
D
 
T
E
 
A
K
 
P
E
 
Q
I
 
V
M
 
R
G
 
E
L
 
V
T
 
M
E
 
E
Q
 
A
M
 
L
I
 
V
R
 
R
N
 
H
L
 
L
F
 
W
K
 
L
E
 
E
V
 
V
L
 
K
G
 
G
L
 
V
E
 
D
F
 
L
G
 
G
E
 
D
F
 
F
P
 
P
H
 
V
M
 
M
T
 
T
F
 
F
E
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
N
P
 
P
L
 
M
E
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
S
V
 
V
D
 
E
F
|
F
K
 
A
V
|
V
F
 
F
S
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
N
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
K
C
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
L
P
 
T
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
D
 
E
Y
 
Y
T
 
G
K
 
N
F
 
F
V
 
V
G
 
K
I
|
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
 
L
A
|
A
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
I
Q
 
N
S
 
S
P
 
P
I
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
F
I
 
L
P
 
N
E
 
A
D
 
E
N
 
I
L
 
I
N
 
E
V
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
G
 
A
A
 
A
V
 
Q
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
F
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
L
K
 
K
L
 
V
G
 
G
H
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
G
L
 
L
L
 
T
-
 
D
T
 
E
C
 
S
K
 
K
W
 
W
A
 
A
P
 
P
M
 
L
W
 
W
V
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
D
N
 
D
D
 
G
D
 
E
G
 
G
S
 
G
F
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
M
H
|
H
H
|
H
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
S
P
 
P
K
 
K
-
 
D
C
 
M
T
 
T
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
K
A
 
A
N
 
A
P
 
P
A
 
E
G
 
N
A
 
A
L
 
V
S
 
A
R
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
Y
E
|
E
L
x
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
 
S
I
 
V
R
|
R
I
 
I
H
 
H
R
 
N
K
 
G
E
 
D
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
S
 
T
V
 
V
F
 
F
R
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
E
E
 
E
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
K
 
K
F
|
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
A
G
 
G
L
|
L
A
|
A
F
 
F
G
|
G
L
 
L
D
 
D
R
|
R
L
 
L
V
 
T
M
 
M
L
 
L
M
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
T
Q
 
D
S
 
N
I
 
I
R
|
R
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
|
T
Q
x
T
S
x
A
A
 
A
A
 
A
D
 
C
V
 
L
M
 
M
T
 
T
Q
 
E
A
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
F
V
 
A
D
 
N
A
 
P
K
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
E
 
E
L
 
L
H
 
S
I
 
I
R
 
Q
L
 
V

P56459 Aspartate--tRNA(Asp/Asn) ligase; Aspartyl-tRNA synthetase; AspRS; Non-discriminating aspartyl-tRNA synthetase; ND-AspRS; EC 6.1.1.23 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
52% identity, 99% coverage: 2:586/591 of query aligns to 1:577/577 of P56459

query
sites
P56459
M
 
M
R
 
R
S
 
S
H
 
H
Y
 
F
C
 
C
G
 
T
Q
 
E
L
 
I
N
 
S
E
 
E
S
 
K
L
 
D
D
 
V
G
 
G
Q
 
K
E
 
I
I
 
V
T
 
K
L
 
V
C
 
A
G
 
G
W
 
W
V
 
C
H
 
N
R
 
T
R
 
Y
R
 
R
D
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
V
 
L
V
 
V
F
 
C
D
 
D
P
 
P
D
 
S
R
 
-
A
 
S
E
 
K
T
 
A
F
 
Y
A
 
E
A
 
K
A
 
A
D
 
L
R
 
E
V
 
V
R
 
R
S
 
S
E
 
E
Y
 
F
V
 
V
V
 
L
K
 
V
I
 
A
T
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
R
P
 
G
A
 
A
G
 
G
A
x
L
T
 
E
N
 
N
A
 
P
N
 
K
M
x
L
A
 
K
S
 
T
G
 
G
M
 
K
I
 
I
E
 
E
V
 
I
L
 
V
G
 
L
Y
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
I
V
 
I
L
 
E
N
 
N
E
 
K
S
 
S
E
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
F
 
I
P
 
E
L
 
I
N
 
G
E
 
N
F
 
-
S
 
K
D
 
H
V
 
V
G
 
N
E
 
E
E
 
D
T
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
S
P
 
P
E
 
N
M
 
S
A
 
Y
E
 
E
K
 
I
L
 
F
R
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
A
T
 
L
S
 
I
I
 
T
R
 
R
R
 
N
F
 
T
L
 
L
D
 
A
E
 
Q
N
 
K
G
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
E
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
R
T
 
V
H
 
H
A
 
E
G
 
G
S
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
M
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
C
F
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
A
E
 
E
T
 
M
S
 
S
F
 
F
L
 
C
D
 
D
E
 
E
K
 
N
E
 
D
I
 
V
M
 
M
G
 
G
L
 
V
T
 
V
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
I
 
L
R
 
Q
N
 
E
L
 
I
F
 
F
K
 
K
E
 
A
V
 
V
L
 
G
G
 
H
L
 
T
E
 
I
F
 
S
G
 
K
E
 
P
F
 
F
P
 
K
H
 
R
M
 
M
T
 
P
F
 
Y
E
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
E
R
 
N
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
F
P
 
E
L
 
L
E
 
P
L
 
L
V
 
I
D
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
Q
 
C
L
 
F
K
 
R
E
 
D
V
 
S
D
 
S
F
 
N
K
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
N
P
 
T
A
 
A
N
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
K
C
 
N
-
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
N
V
 
V
P
 
K
G
 
G
G
 
A
-
 
D
A
 
A
S
 
L
M
 
F
P
 
S
R
 
R
K
 
S
Q
 
V
I
 
L
D
 
K
D
 
E
Y
 
L
T
 
E
K
 
E
F
 
F
V
 
V
G
 
R
I
 
Q
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
K
 
Q
V
 
I
N
 
K
E
 
E
R
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
D
G
 
E
L
 
I
Q
 
K
S
 
G
P
 
P
I
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
F
I
 
L
P
 
S
E
 
E
D
 
K
N
 
G
L
 
L
N
 
K
V
 
N
I
 
I
L
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
T
G
 
D
A
 
A
V
 
Q
D
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
G
K
 
D
A
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
L
E
 
D
A
 
Y
L
 
M
G
 
G
A
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
L
K
 
K
L
 
V
G
 
A
H
 
E
D
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
D
C
 
K
K
 
D
W
 
A
A
 
L
P
 
N
-
 
F
M
 
L
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
N
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
K
N
 
T
D
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
-
F
 
Y
T
 
H
A
 
A
L
 
A
H
 
H
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
M
P
 
P
K
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
E
C
 
C
T
 
E
P
 
D
-
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
H
P
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
K
K
 
E
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
Q
 
K
S
 
K
V
 
V
F
 
F
R
 
E
L
 
K
L
 
I
G
 
N
I
 
I
N
 
H
E
 
E
A
 
E
E
 
E
Q
 
A
E
 
Q
E
 
K
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
I
G
 
G
L
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
I
M
 
M
L
 
L
M
 
M
T
 
T
G
 
K
A
 
S
Q
 
H
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
S
 
K
A
 
A
A
 
S
D
 
C
V
 
L
M
 
L
T
 
T
Q
 
N
A
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
V
 
I
D
 
N
A
 
E
K
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
H
 
H
I
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
K

4rmfA Biochemical and structural characterization of mycobacterial aspartyl- tRNA synthetase asps, a promising tb drug target (see paper)
49% identity, 98% coverage: 2:579/591 of query aligns to 1:577/579 of 4rmfA

query
sites
4rmfA
M
 
L
R
 
R
S
 
T
H
 
H
Y
 
A
C
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
P
S
 
A
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
A
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
R
D
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
R
P
 
-
D
 
-
R
 
E
A
 
G
E
 
D
T
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
H
R
 
R
V
 
L
R
 
R
S
 
A
E
 
E
Y
 
F
V
 
C
V
 
V
K
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
E
L
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
N
T
 
E
N
 
N
A
 
P
N
 
E
M
 
I
A
 
P
S
 
T
G
 
G
M
 
Q
I
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
N
G
 
A
Y
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
A
T
 
P
P
 
L
P
 
P
F
 
F
P
 
Q
L
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
-
S
 
-
D
 
Q
V
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
R
L
 
L
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
G
M
 
P
A
 
G
E
 
N
K
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
K
M
 
V
T
 
N
T
 
A
S
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
S
F
 
V
L
 
L
D
 
A
E
 
E
N
 
H
G
 
D
F
 
F
L
 
V
D
 
E
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
A
R
 
R
T
 
L
H
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
C
F
 
Y
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
I
 
M
E
 
E
T
 
M
S
 
S
F
 
F
L
 
V
D
 
E
E
 
A
K
 
D
E
 
D
I
 
V
M
 
I
G
 
A
L
 
I
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
M
 
V
I
 
L
R
 
K
N
 
A
L
 
V
F
 
W
K
 
A
E
 
-
V
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
E
 
D
F
 
L
G
 
P
-
 
L
E
 
P
F
 
L
P
 
P
H
 
R
M
 
I
T
 
S
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
F
P
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
A
 
T
D
 
E
Q
 
Y
L
 
F
K
 
K
E
 
D
V
 
T
D
 
T
F
 
F
K
 
R
V
 
V
F
 
F
S
 
Q
G
 
A
P
 
P
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
C
 
-
R
 
Y
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
V
V
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
Q
P
 
P
R
 
R
K
 
R
Q
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
G
Y
 
W
T
 
Q
K
 
E
F
 
F
V
 
A
G
 
K
I
 
Q
Y
 
R
G
 
G
A
 
H
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
K
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
R
 
D
A
 
G
K
 
T
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
Q
 
G
S
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
P
 
S
E
 
D
D
 
A
N
 
E
L
 
R
N
 
D
V
 
G
I
 
L
L
 
V
D
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
N
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
C
V
 
I
F
 
F
F
 
F
G
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
P
A
 
A
K
 
K
I
 
G
V
 
A
S
 
R
E
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
T
R
 
R
I
 
I
K
 
E
L
 
I
G
 
A
H
 
K
D
 
R
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
D
C
 
P
K
 
N
-
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
F
M
 
T
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
A
N
 
A
D
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
S
G
 
G
S
 
A
F
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
M
H
|
H
H
 
H
P
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
A
P
 
P
K
 
K
C
 
P
-
 
D
T
 
S
P
 
V
Q
 
D
E
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
S
N
 
D
P
 
P
A
 
G
G
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
M
 
I
V
 
V
L
 
C
N
 
N
G
 
G
T
 
N
E
|
E
L
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
K
 
R
E
 
D
M
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
R
V
 
V
F
 
F
R
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
I
 
I
N
 
D
E
 
H
A
 
D
E
 
E
Q
 
A
E
 
Q
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
S
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
W
D
 
D
R
|
R
L
 
I
V
 
T
M
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
 
S
Q
 
G
S
 
G
A
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
P
M
 
L
T
 
T
Q
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
A
Q
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
P
K
 
Q
A
 
Q
L
 
R
R
 
K
E
 
E

4o2dA Crystal structure of aspartyl-tRNA synthetase from mycobacterium smegmatis with bound aspartic acid (see paper)
49% identity, 98% coverage: 1:582/591 of query aligns to 1:579/580 of 4o2dA

query
sites
4o2dA
M
 
V
M
 
L
R
 
R
S
 
T
H
 
H
Y
 
A
C
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
N
 
R
E
 
P
S
 
A
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
A
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
R
D
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
D
 
R
P
 
-
D
 
-
R
 
E
A
 
G
E
 
D
T
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
H
R
 
R
V
 
L
R
 
R
S
 
A
E
 
E
Y
 
F
V
 
C
V
 
V
K
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
E
L
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
N
T
 
E
N
 
N
A
 
P
N
 
E
M
 
I
A
 
P
S
 
T
G
 
G
M
 
Q
I
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
N
G
 
A
Y
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
A
T
 
P
P
 
L
P
 
P
F
 
F
P
 
Q
L
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
-
S
 
-
D
 
Q
V
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
R
L
 
L
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
G
M
 
P
A
 
G
E
 
N
K
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
K
M
 
V
T
 
N
T
 
A
S
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
S
F
 
V
L
 
L
D
 
A
E
 
E
N
 
H
G
 
D
F
 
F
L
 
V
D
 
E
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
T
 
T
P
 
P
E
|
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
A
R
 
R
T
 
L
H
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
|
S
P
 
P
Q
|
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
C
F
 
Y
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
 
D
L
 
F
R
 
-
A
 
-
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
|
Q
I
 
L
D
 
D
I
 
M
E
 
E
T
 
M
S
 
S
F
 
F
L
 
V
D
 
E
E
 
A
K
 
D
E
 
D
I
 
V
M
 
I
G
 
A
L
 
I
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
M
 
V
I
 
L
R
 
K
N
 
A
L
 
V
F
 
W
K
 
A
E
 
-
V
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
E
 
D
F
 
L
G
 
P
-
 
L
E
 
P
F
 
L
P
 
P
H
 
R
M
 
I
T
 
S
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
F
P
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
A
 
T
D
 
E
Q
 
Y
L
 
F
K
 
K
E
 
D
V
 
T
D
 
T
F
 
F
K
 
R
V
 
V
F
 
F
S
 
Q
G
 
A
P
 
P
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
C
 
-
R
 
Y
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
V
V
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
Q
P
 
P
R
 
R
K
 
R
Q
 
T
I
 
L
D
 
D
D
 
G
Y
 
W
T
 
Q
K
 
E
F
 
F
V
 
A
G
 
K
I
 
Q
Y
 
R
G
 
G
A
 
H
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
K
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
R
 
D
A
 
G
K
 
T
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
Q
 
G
S
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
L
P
 
S
E
 
D
D
 
A
N
 
E
L
 
R
N
 
D
V
 
G
I
 
L
L
 
V
D
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
N
D
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
C
V
 
I
F
 
F
F
 
F
G
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
P
A
 
A
K
 
K
I
 
G
V
 
A
S
 
R
E
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
T
R
 
R
I
 
I
K
 
E
L
 
I
G
 
A
H
 
K
D
 
R
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
D
C
 
P
K
 
N
-
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
F
M
 
T
W
 
W
V
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
F
P
 
P
M
 
M
F
 
F
E
 
E
E
 
A
N
 
A
D
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
S
G
 
G
S
 
A
F
 
W
T
 
T
A
 
A
L
 
M
H
|
H
H
|
H
P
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
A
P
 
P
K
 
K
C
 
P
-
 
D
T
 
S
P
 
V
Q
 
D
E
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
S
N
 
D
P
 
P
A
 
G
G
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
I
V
 
V
L
 
C
N
 
N
G
 
G
T
 
N
E
|
E
L
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
|
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
K
 
R
E
 
D
M
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
R
V
 
V
F
 
F
R
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
I
 
I
N
 
D
E
 
H
A
 
D
E
 
E
Q
 
A
E
 
Q
E
 
E
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
S
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
P
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
L
x
I
A
|
A
F
 
F
G
 
G
L
 
W
D
 
D
R
|
R
L
 
I
V
 
T
M
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
S
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
K
 
K
T
 
S
Q
 
G
S
 
G
A
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
P
M
 
L
T
 
T
Q
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
A
Q
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
P
K
 
Q
A
 
Q
L
 
R
R
 
K
E
 
E
L
 
S
H
 
G
I
 
I

5w25A Crystal structure of aspartyl-tRNA synthetase from mycobacterium tuberculosis complexed with l-aspartic acid
49% identity, 98% coverage: 1:579/591 of query aligns to 2:582/583 of 5w25A

query
sites
5w25A
M
 
V
M
 
L
R
 
R
S
 
S
H
 
H
Y
 
A
C
 
A
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
N
 
R
E
 
E
S
 
G
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
L
 
L
C
 
A
G
 
G
W
 
W
V
 
V
H
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
R
D
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
F
 
F
L
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
A
D
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
-
 
R
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
R
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
D
 
H
R
 
R
V
 
L
R
 
R
S
 
A
E
 
E
Y
 
F
V
 
C
V
 
V
K
 
S
I
 
V
T
 
A
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
E
L
 
I
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
N
T
 
A
N
 
N
A
 
P
N
 
E
M
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
G
M
 
E
I
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
N
G
 
A
Y
 
T
E
 
S
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
G
E
 
E
S
 
C
E
 
A
T
 
P
P
 
L
P
 
P
F
 
F
P
 
Q
L
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
-
S
 
-
D
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
P
 
D
E
 
D
M
 
P
A
 
A
E
 
A
K
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
S
R
 
R
M
 
V
T
 
N
T
 
A
S
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
V
L
 
L
D
 
A
E
 
R
N
 
H
G
x
D
F
 
F
L
 
V
D
 
E
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
T
L
 
I
T
 
T
R
 
R
A
 
S
T
 
T
P
 
P
E
|
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
Y
 
F
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
A
R
 
R
T
 
L
H
 
H
A
 
P
G
 
G
S
 
S
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
P
 
P
Q
|
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
R
|
R
Y
 
Y
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
K
 
R
C
 
C
F
 
Y
R
|
R
D
 
D
E
|
E
D
 
D
L
 
F
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
|
R
Q
|
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
I
 
M
E
 
E
T
 
M
S
 
S
F
 
F
L
 
V
D
 
D
E
 
A
K
 
E
E
 
D
I
 
I
M
 
I
G
 
A
L
 
I
T
 
S
E
 
E
Q
 
E
M
 
V
I
 
L
R
 
T
N
 
E
L
 
L
F
 
W
K
 
A
E
 
L
V
 
I
L
 
G
G
 
Y
L
 
R
E
 
I
F
 
P
G
 
T
E
 
P
F
 
I
P
 
P
H
 
R
M
 
I
T
 
G
F
 
Y
E
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
D
 
D
K
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
N
 
F
P
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
E
V
 
C
A
 
T
D
 
D
Q
 
F
L
 
F
K
 
S
E
 
D
V
 
T
D
 
T
F
 
F
K
 
R
V
 
V
F
 
F
S
 
Q
G
 
A
P
 
P