SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2328 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2328 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

A0A0H2VG78 Glucose transporter GlcP; Glucose/H(+) symporter from Staphylococcus epidermidis (strain ATCC 12228 / FDA PCI 1200) (see paper)
25% identity, 81% coverage: 71:440/459 of query aligns to 49:434/446 of A0A0H2VG78

query
sites
A0A0H2VG78
A
 
S
S
 
S
A
 
M
Y
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
S
F
 
S
G
 
G
H
 
P
F
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
R
S
 
R
M
 
L
L
 
V
L
 
M
I
 
L
S
 
I
L
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
A
A
 
I
T
 
V
F
 
F
A
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
A
L
 
L
P
 
I
D
 
L
F
 
A
A
 
A
T
 
S
I
 
T
G
 
N
I
 
L
W
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
I
L
 
I
L
 
G
R
|
R
V
 
L
V
 
I
Q
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
S
W
 
M
G
 
S
G
 
T
A
 
V
V
 
P
L
 
V
M
 
Y
A
 
L
V
 
S
E
|
E
H
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
T
N
 
E
K
 
Y
R
 
R
G
 
G
L
 
S
Y
 
L
G
 
G
S
 
S
W
 
L
V
 
N
Q
|
Q
I
 
L
G
 
M
V
 
I
P
 
T
A
 
I
G
 
G
T
 
I
M
 
L
I
 
A
A
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
V
N
 
N
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
L
 
A
L
 
D
I
 
I
A
 
E
A
 
G
W
 
W
L
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
R
W
 
W
G
 
M
W
 
L
R
 
G
I
 
L
P
 
A
F
 
V
L
 
V
A
 
P
S
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
L
A
 
-
V
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
I
 
F
R
 
-
L
 
-
N
 
-
I
 
M
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
W
-
 
L
-
 
L
-
 
E
N
 
N
K
 
R
V
 
N
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
A
V
 
R
Q
 
Q
V
 
V
-
 
M
-
 
K
-
 
I
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
I
K
 
D
M
 
K
P
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
-
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
W
-
 
T
V
 
V
F
 
I
R
 
K
K
 
S
Y
 
P
W
 
W
-
 
L
-
 
G
K
 
R
Q
 
I
V
 
L
L
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
C
I
 
I
-
 
F
A
 
A
T
 
I
M
 
F
S
x
Q
T
x
Q
G
 
F
A
 
I
S
 
G
F
 
I
N
|
N
I
 
A
I
 
V
V
 
I
A
 
F
F
 
Y
G
 
S
L
 
S
T
 
S
-
 
I
Y
 
F
G
 
A
T
 
K
Q
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
E
S
 
A
R
 
A
S
 
S
V
 
I
M
 
L
L
 
G
G
 
S
V
 
V
V
 
G
L
 
I
L
 
G
S
 
T
C
 
I
A
 
N
W
 
V
C
 
L
I
 
V
V
 
T
M
 
I
L
 
V
P
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
-
A
 
-
L
 
V
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
I
G
 
D
R
 
R
K
 
K
P
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
I
G
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
M
F
 
A
P
 
I
M
 
L
F
 
I
W
 
W
L
 
T
M
 
I
D
 
G
T
 
I
K
 
A
E
 
S
L
 
S
S
 
A
M
 
W
V
 
I
V
 
I
F
 
I
G
 
V
Y
 
C
L
 
L
-
 
S
L
 
L
L
 
F
M
 
I
T
 
V
A
 
F
F
 
F
A
 
G
A
 
I
N
 
S
Y
 
W
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
L
-
x
W
T
 
V
F
 
M
L
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
P
T
 
M
R
 
R
V
 
A
R
 
R
Y
 
G
S
 
A
G
 
A
L
 
T
S
 
G
I
 
I
S
 
S
Y
 
A
M
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
N
L
 
I
S
 
G
G
 
T
L
 
L
L
 
I
G
 
V
S
 
S
A
 
L
A
 
F
T
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
L
T
 
S
T
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
S
V
 
T
A
 
E
W
 
W
Y
 
V
M
 
F
I
 
L
G
 
I
A
 
F
A
 
A
L
 
F
I
 
I
S
 
G
L
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
M
L
 
I
-
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
K
L
 
F
L
 
L
T
 
P
E
 
E
T
 
T
F
 
R
K
 
G
K
 
R
D
 
S
I
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
P
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9Y7Q9 Probable metabolite transporter C2H8.02 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
28% identity, 35% coverage: 71:230/459 of query aligns to 90:256/583 of Q9Y7Q9

query
sites
Q9Y7Q9
A
 
A
S
 
A
A
 
T
Y
 
N
L
 
I
A
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
M
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
F
F
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
F
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
F
M
 
V
L
 
Y
L
 
G
I
 
K
S
 
E
L
 
M
L
 
M
T
 
V
M
 
V
G
 
I
A
 
I
A
 
A
T
 
T
F
 
I
A
 
L
I
 
I
G
 
I
L
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
R
A
 
I
T
 
P
I
 
T
G
 
P
I
 
T
W
 
A
A
 
K
P
 
M
I
 
M
L
 
W
L
 
L
L
 
F
L
 
A
L
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
M
Q
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
W
 
Y
G
 
P
G
 
M
A
 
S
V
 
A
L
 
S
M
 
I
A
 
T
V
 
S
E
 
E
H
 
Q
A
 
S
P
 
L
A
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
A
Y
 
L
G
 
L
S
 
A
W
 
W
V
 
I
Q
 
F
I
 
S
G
 
N
V
 
Q
P
 
G
A
 
W
G
 
G
T
 
T
M
 
L
I
 
A
A
 
G
N
 
C
L
 
V
A
 
A
F
 
T
L
 
L
L
 
I
I
 
I
-
 
L
A
 
A
A
 
C
W
 
F
L
 
E
S
 
K
P
 
P
E
 
L
D
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
L
 
K
L
 
L
A
 
N
W
 
G
G
 
V
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
Q
F
 
F
L
 
G
A
 
I
S
 
A
V
 
L
L
 
F
L
 
P
I
 
A
A
 
V
V
 
I
G
 
V
L
 
L
Y
 
I
I
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
R
I
 
M
S
 
Q
E
 
E
T
 
S
P
 
E
A
 
Q
F
 
F
N
 
K
K
 
N
V
 
S
K
 
K
E
 
N

Sites not aligning to the query:

P0AGF4 D-xylose-proton symporter; D-xylose transporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
23% identity, 86% coverage: 62:458/459 of query aligns to 54:490/491 of P0AGF4

query
sites
P0AGF4
G
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
-
T
 
C
F
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
C
G
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
F
G
|
G
R
 
R
K
 
R
S
 
D
M
 
S
L
 
L
L
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
A
L
 
V
T
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
G
M
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
W
F
 
P
A
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
N
A
 
T
T
 
V
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
Y
R
|
R
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
L
E
 
A
W
 
S
G
 
M
G
 
L
A
 
S
V
 
P
L
 
M
M
 
Y
A
 
I
V
 
A
E
|
E
H
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
H
K
 
I
R
|
R
G
 
G
L
 
K
Y
 
L
G
 
V
S
 
S
W
 
F
V
 
N
Q
|
Q
I
 
F
G
 
A
V
 
I
P
 
I
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
V
N
 
Y
L
 
C
A
 
V
F
 
N
L
 
Y
L
 
F
I
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
S
 
N
P
 
T
E
 
D
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
A
 
S
S
 
E
V
 
C
L
 
I
L
 
P
I
 
A
A
 
L
V
 
L
G
 
F
L
 
L
Y
 
M
I
 
L
R
 
L
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
W
-
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
R
N
 
G
K
 
K
V
 
Q
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
E
K
 
I
M
 
K
P
 
H
L
 
S
A
 
L
E
 
D
V
 
H
F
 
G
R
 
R
K
 
K
Y
 
T
W
 
G
K
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
M
G
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
G
T
 
V
M
 
I
S
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
M
F
 
L
N
 
S
I
 
I
I
 
F
V
x
Q
A
x
Q
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
x
N
-
 
V
G
 
V
L
 
L
T
x
Y
Y
 
Y
G
 
A
T
 
P
Q
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
T
N
 
D
L
 
I
G
 
A
F
 
L
S
 
L
R
 
Q
S
 
T
V
 
I
M
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
x
N
L
 
L
S
 
T
C
 
F
A
 
T
W
 
V
C
 
L
I
 
A
V
 
I
M
 
M
L
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
T
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
|
G
R
|
R
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
Q
V
 
I
G
 
I
G
 
G
I
 
A
I
 
L
A
 
G
E
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
G
A
 
M
F
 
F
P
 
S
M
 
L
F
 
G
W
 
T
L
 
A
M
 
F
D
 
Y
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
L
 
P
S
 
G
M
 
I
V
 
V
-
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
S
Y
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
Y
M
 
V
T
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
M
N
 
S
Y
 
W
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
C
-
x
W
T
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
S
E
|
E
L
 
I
F
 
F
G
 
P
T
 
N
R
 
A
V
 
I
R
|
R
Y
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
S
 
A
Y
x
Q
M
x
W
L
 
L
S
 
A
G
 
N
L
 
Y
L
 
F
G
 
V
S
 
S
A
 
W
A
 
T
T
 
F
P
 
P
I
 
M
V
 
M
-
 
D
-
 
K
T
 
N
T
 
S
A
 
W
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
H
T
 
F
G
 
H
K
 
N
G
 
G
S
 
F
S
 
S
V
 
Y
A
 
W
W
 
I
Y
 
Y
M
 
G
I
 
C
G
 
M
A
 
G
A
 
V
L
 
L
I
 
A
S
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
M
L
 
W
L
 
K
L
 
F
L
 
V
T
 
P
E
 
E
T
 
T
F
 
K
K
 
G
K
 
K
D
 
T
I
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
L
P
 
E
S
 
A
V
 
L
V
 
W
P
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
T
G
 
K
K
 
K
P
 
T
F
 
Q
K
 
Q
S
 
T
A
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4gc0A The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to 6-bromo-6-deoxy-d-glucose (see paper)
23% identity, 70% coverage: 62:381/459 of query aligns to 50:407/475 of 4gc0A

query
sites
4gc0A
G
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
-
T
 
C
F
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
C
G
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
S
 
D
M
 
S
L
 
L
L
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
A
L
 
V
T
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
G
M
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
W
F
 
P
A
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
N
A
 
T
T
 
V
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
Y
R
 
R
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
L
E
 
A
W
 
S
G
 
M
G
 
L
A
 
S
V
 
P
L
 
M
M
 
Y
A
 
I
V
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
H
K
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
K
Y
 
L
G
 
V
S
 
S
W
 
F
V
 
N
Q
|
Q
I
 
F
G
 
A
V
 
I
P
 
I
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
V
N
 
Y
L
 
C
A
 
V
F
 
N
L
 
Y
L
 
F
I
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
S
 
N
P
 
T
E
 
D
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
A
 
S
S
 
E
V
 
C
L
 
I
L
 
P
I
 
A
A
 
L
V
 
L
G
 
F
L
 
L
Y
 
M
I
 
L
R
 
L
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
W
-
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
R
N
 
G
K
 
K
V
 
Q
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
Q
Q
 
E
V
 
I
K
 
K
M
 
H
P
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
H
V
 
G
F
 
-
R
 
R
K
 
K
Y
 
T
W
 
G
K
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
M
G
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
G
T
 
V
M
 
I
S
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
M
F
 
L
N
 
S
I
 
I
I
 
F
V
x
Q
A
 
Q
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
x
N
-
 
V
G
 
V
L
|
L
T
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
T
 
P
Q
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
T
N
 
D
L
 
I
G
 
A
F
 
L
S
 
L
R
 
Q
S
 
T
V
 
I
M
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
N
L
 
L
S
 
T
C
 
F
A
 
T
W
 
V
C
 
L
I
 
A
V
 
I
M
 
M
L
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
T
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
Q
V
 
I
G
 
I
G
 
G
I
 
A
I
 
L
A
 
G
E
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
G
A
 
M
F
 
F
P
 
S
M
 
L
F
 
G
W
 
T
L
 
A
M
 
F
D
 
Y
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
L
 
P
S
 
G
M
 
I
V
 
V
-
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
S
Y
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
Y
M
 
V
T
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
M
N
 
S
Y
 
W
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
C
-
x
W
T
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
P
T
 
N
R
 
A
V
 
I
R
 
R
Y
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
I
S
 
A

4gbzA The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to d-glucose (see paper)
23% identity, 70% coverage: 62:381/459 of query aligns to 50:407/475 of 4gbzA

query
sites
4gbzA
G
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
-
T
 
C
F
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
C
G
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
S
 
D
M
 
S
L
 
L
L
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
A
L
 
V
T
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
G
M
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
W
F
 
P
A
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
N
A
 
T
T
 
V
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
Y
R
 
R
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
L
E
 
A
W
 
S
G
 
M
G
 
L
A
 
S
V
 
P
L
 
M
M
 
Y
A
 
I
V
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
H
K
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
K
Y
 
L
G
 
V
S
 
S
W
 
F
V
 
N
Q
|
Q
I
 
F
G
 
A
V
 
I
P
 
I
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
V
N
 
Y
L
 
C
A
 
V
F
 
N
L
 
Y
L
 
F
I
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
S
 
N
P
 
T
E
 
D
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
A
 
S
S
 
E
V
 
C
L
 
I
L
 
P
I
 
A
A
 
L
V
 
L
G
 
F
L
 
L
Y
 
M
I
 
L
R
 
L
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
W
-
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
R
N
 
G
K
 
K
V
 
Q
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
Q
Q
 
E
V
 
I
K
 
K
M
 
H
P
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
H
V
 
G
F
 
-
R
 
R
K
 
K
Y
 
T
W
 
G
K
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
M
G
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
G
T
 
V
M
 
I
S
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
M
F
 
L
N
 
S
I
 
I
I
 
F
V
x
Q
A
 
Q
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
x
N
-
 
V
G
 
V
L
 
L
T
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
T
 
P
Q
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
T
N
 
D
L
 
I
G
 
A
F
 
L
S
 
L
R
 
Q
S
 
T
V
 
I
M
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
N
L
 
L
S
 
T
C
 
F
A
 
T
W
 
V
C
 
L
I
 
A
V
 
I
M
 
M
L
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
T
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
Q
V
 
I
G
 
I
G
 
G
I
 
A
I
 
L
A
 
G
E
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
G
A
 
M
F
 
F
P
 
S
M
 
L
F
 
G
W
 
T
L
 
A
M
 
F
D
 
Y
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
L
 
P
S
 
G
M
 
I
V
 
V
-
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
S
Y
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
Y
M
 
V
T
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
M
N
 
S
Y
 
W
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
C
-
x
W
T
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
P
T
 
N
R
 
A
V
 
I
R
 
R
Y
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
I
S
 
A

4gbyA The structure of the mfs (major facilitator superfamily) proton:xylose symporter xyle bound to d-xylose (see paper)
23% identity, 70% coverage: 62:381/459 of query aligns to 50:407/475 of 4gbyA

query
sites
4gbyA
G
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
G
F
 
F
G
 
-
T
 
C
F
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
I
A
 
G
R
 
C
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
C
G
 
S
D
 
N
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
R
S
 
D
M
 
S
L
 
L
L
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
A
L
 
V
T
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
G
M
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
A
T
 
W
F
 
P
A
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
N
A
 
T
T
 
V
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
F
L
 
V
L
 
I
L
 
Y
R
 
R
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
L
E
 
A
W
 
S
G
 
M
G
 
L
A
 
S
V
 
P
L
 
M
M
 
Y
A
 
I
V
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
H
K
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
K
Y
 
L
G
 
V
S
 
S
W
 
F
V
 
N
Q
|
Q
I
 
F
G
 
A
V
 
I
P
 
I
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
V
N
 
Y
L
 
C
A
 
V
F
 
N
L
 
Y
L
 
F
I
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
D
A
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
S
 
N
P
 
T
E
 
D
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
Y
P
 
M
F
 
F
L
 
A
A
 
S
S
 
E
V
 
C
L
 
I
L
 
P
I
 
A
A
 
L
V
 
L
G
 
F
L
 
L
Y
 
M
I
 
L
R
 
L
L
 
Y
N
 
T
I
 
V
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
W
-
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
R
N
 
G
K
 
K
V
 
Q
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
Q
Q
 
E
V
 
I
K
 
K
M
 
H
P
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
H
V
 
G
F
 
-
R
 
R
K
 
K
Y
 
T
W
 
G
K
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
M
G
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
G
T
 
V
M
 
I
S
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
V
S
 
M
F
 
L
N
 
S
I
 
I
I
 
F
V
x
Q
A
 
Q
F
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
x
N
-
 
V
G
 
V
L
 
L
T
 
Y
Y
 
Y
G
 
A
T
 
P
Q
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
T
N
 
D
L
 
I
G
 
A
F
 
L
S
 
L
R
 
Q
S
 
T
V
 
I
M
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
N
L
 
L
S
 
T
C
 
F
A
 
T
W
 
V
C
 
L
I
 
A
V
 
I
M
 
M
L
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
T
S
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
Q
V
 
I
G
 
I
G
 
G
I
 
A
I
 
L
A
 
G
E
 
M
A
 
A
L
 
I
V
 
G
A
 
M
F
 
F
P
 
S
M
 
L
F
 
G
W
 
T
L
 
A
M
 
F
D
 
Y
T
 
T
K
 
Q
E
 
A
L
 
P
S
 
G
M
 
I
V
 
V
-
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
S
Y
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
Y
M
 
V
T
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
M
N
 
S
Y
 
W
G
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
C
-
x
W
T
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
P
T
 
N
R
 
A
V
 
I
R
 
R
Y
 
G
S
 
K
G
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
I
S
 
A

Q8NLB7 Gentisate transporter from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
25% identity, 44% coverage: 36:236/459 of query aligns to 56:233/444 of Q8NLB7

query
sites
Q8NLB7
Y
 
Y
D
|
D
L
 
L
F
 
I
V
 
V
F
 
Y
A
 
G
T
 
T
A
 
V
S
 
Q
A
 
S
L
 
A
V
 
L
F
 
A
N
 
K
K
 
E
V
 
W
F
 
N
F
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
A
T
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
T
F
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
-
A
 
-
S
 
T
A
 
A
Y
 
F
L
 
F
A
 
G
R
 
M
I
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
F
F
 
I
G
 
G
H
 
R
F
 
L
G
 
S
D
 
D
R
|
R
L
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
A
M
 
A
L
 
V
L
 
I
I
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
I
M
 
L
G
 
S
A
 
V
A
 
F
T
 
T
F
 
M
A
 
L
I
 
C
G
 
A
L
 
F
L
 
A
P
 
P
D
 
N
F
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
W
L
 
V
L
 
F
L
 
G
L
 
A
L
 
F
R
 
R
V
 
F
V
 
I
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
L
W
 
V
G
 
P
G
 
S
A
 
V
V
 
N
L
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
S
E
 
D
H
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
R
N
 
K
K
 
T
R
 
M
G
 
S
L
 
A
Y
 
W
G
 
A
S
 
T
W
 
V
V
 
M
Q
 
M
I
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
I
G
 
G
T
 
G
M
 
S
I
 
I
A
 
A
N
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
P
W
 
-
L
 
-
S
 
S
P
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
W
G
 
G
W
 
W
R
 
R
I
 
F
P
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
I
S
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
P
I
 
L
A
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
P
I
 
I
R
 
A
L
 
M
N
 
K
I
 
V
S
 
I
E
 
P
T
 
S
P
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
D
K
 
K
V
 
A
K
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
D
V
 
H
Q
 
D
V
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

P25297 Inorganic phosphate transporter PHO84 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
25% identity, 82% coverage: 72:449/459 of query aligns to 110:564/587 of P25297

query
sites
P25297
S
 
S
A
 
T
Y
 
S
L
 
V
A
 
G
R
 
T
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
F
L
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
T
F
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
I
L
 
V
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
R
M
 
I
L
 
Y
L
 
G
I
 
M
S
 
E
L
 
L
L
 
I
T
 
I
M
 
M
G
 
I
A
 
V
A
 
C
T
 
T
F
 
I
A
 
L
I
 
Q
G
 
T
L
 
T
L
 
V
P
 
A
D
 
H
F
 
S
A
 
P
T
 
A
I
 
I
G
 
N
I
 
F
W
 
V
A
 
A
P
 
-
I
 
-
L
 
V
L
 
L
L
 
T
L
 
F
L
 
Y
R
 
R
V
 
I
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
L
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
D
W
 
Y
G
 
P
G
 
L
A
 
S
V
 
S
L
 
I
M
 
I
A
 
T
V
 
S
E
 
E
H
 
F
A
 
A
P
 
T
A
 
T
N
 
K
K
 
W
R
 
R
G
 
G
L
 
A
-
 
I
-
 
M
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
A
Y
 
N
G
 
Q
S
 
A
W
 
W
V
 
G
Q
 
Q
I
 
I
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
S
G
 
G
T
 
G
M
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
L
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
W
 
Y
L
 
K
S
 
G
P
 
E
E
 
L
D
 
E
L
 
Y
L
 
A
A
 
N
W
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
-
 
C
-
 
D
-
 
Q
-
 
M
W
 
W
R
 
R
I
 
I
P
 
L
F
 
I
-
 
G
L
 
L
A
 
G
S
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
G
I
 
L
A
 
A
V
 
C
G
 
-
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
R
 
R
L
 
L
N
 
T
I
 
I
S
 
P
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
Y
N
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
Q
A
 
L
E
 
D
V
 
V
Q
 
N
V
 
A
K
 
K
M
 
L
P
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
x
K
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
N
-
 
H
-
 
P
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
F
E
 
K
V
 
D
F
 
F
R
 
C
K
 
R
Y
 
H
W
 
F
K
 
G
Q
 
Q
V
 
W
L
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
A
 
L
T
 
L
M
 
G
S
 
T
T
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
W
F
 
F
N
 
T
I
 
L
I
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
F
-
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
S
Y
 
L
G
 
N
T
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
L
Q
 
Q
N
 
T
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
S
 
A
R
 
G
S
 
S
V
 
K
M
 
N
L
 
V
G
 
Y
V
 
K
V
 
K
L
 
L
L
 
Y
S
 
D
C
 
T
A
 
A
W
 
V
C
 
G
I
 
N
V
 
L
M
 
I
L
 
L
P
 
I
V
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
P
-
 
G
-
 
Y
-
 
W
-
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
V
D
 
D
R
 
I
F
 
I
G
 
G
R
 
R
K
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
Q
V
 
L
G
 
A
G
 
G
-
 
F
I
 
I
I
 
I
A
 
L
E
 
T
A
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
C
-
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
F
P
 
A
M
 
Y
F
 
H
W
 
K
L
 
L
M
 
G
D
 
D
T
 
H
K
 
G
E
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
L
V
 
Y
V
 
V
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
I
T
 
C
A
 
Q
F
 
F
A
 
F
A
 
Q
N
 
N
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
-
 
N
I
 
T
A
 
T
T
 
T
F
 
F
L
 
I
-
 
V
-
 
P
A
 
G
E
 
E
L
 
C
F
 
F
G
 
P
T
 
T
R
 
R
V
 
Y
R
 
R
Y
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
S
I
 
T
S
 
A
Y
 
H
M
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
A
L
 
A
L
 
S
G
 
G
S
 
K
A
 
V
A
 
G
T
 
A
P
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
H
-
 
N
L
 
C
A
 
A
A
 
R
T
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
P
S
 
T
S
 
N
V
 
C
-
 
W
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
I
-
 
F
A
 
A
W
 
L
Y
 
F
M
 
M
I
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
I
 
L
S
 
G
L
 
I
V
 
F
A
 
T
L
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
I
T
 
P
E
 
E
T
 
T
F
 
K
K
 
R
K
 
K
D
 
T
I
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
P
 
N
S
 
E
V
 
L
V
 
Y
P
 
H
T
 
D
D
 
E
-
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P36035 Carboxylic acid transporter protein homolog from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
23% identity, 70% coverage: 77:398/459 of query aligns to 188:513/616 of P36035

query
sites
P36035
R
 
R
I
 
S
V
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
L
F
 
W
G
 
T
D
 
D
R
 
K
L
 
S
G
 
S
R
 
R
K
 
K
S
 
W
M
 
P
L
 
Y
L
 
I
I
 
T
S
 
C
L
 
L
L
 
F
T
 
L
M
 
F
G
 
V
A
 
I
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
A
 
C
I
 
T
G
 
P
L
 
W
L
 
C
P
 
D
D
 
T
F
 
Y
A
 
E
T
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
-
W
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
L
L
 
G
L
 
V
R
 
R
V
 
W
V
 
I
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
E
 
I
W
 
Y
G
 
G
G
 
C
A
 
A
V
 
S
L
 
A
M
 
T
A
 
A
V
 
I
E
 
E
H
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
V
N
 
K
K
 
A
R
 
R
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
F
S
 
S
W
 
A
V
 
Y
Q
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
M
 
F
I
 
I
A
 
F
N
 
A
L
 
I
A
 
I
F
 
F
L
 
Y
L
 
R
I
 
A
A
 
F
A
 
G
W
 
Y
L
 
F
S
 
R
P
 
D
E
 
D
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
G
W
 
W
R
 
K
I
 
I
P
 
L
F
 
F
L
 
W
A
 
F
S
 
S
V
 
I
L
 
F
L
 
L
I
 
P
A
 
I
V
 
L
G
 
L
L
 
I
Y
 
F
I
 
W
R
 
R
L
 
L
N
 
L
I
 
W
S
 
P
E
 
E
T
 
T
P
 
K
A
 
Y
F
 
F
N
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
L
E
 
K
A
 
A
E
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
x
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
F
V
 
K
Q
 
Q
V
 
K
K
 
M
M
 
V
P
 
S
L
 
M
A
 
K
E
 
R
V
 
T
F
 
V
R
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
K
 
-
Q
 
-
V
 
L
L
 
L
L
 
F
G
 
A
G
 
Y
I
 
L
A
 
V
T
 
V
M
 
L
S
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
N
F
 
Y
N
 
-
I
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
L
T
 
T
Y
 
H
G
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
L
S
 
S
R
 
K
S
 
D
V
 
A
M
 
V
L
 
T
G
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
L
 
V
S
 
T
C
 
N
A
 
I
W
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
C
M
 
G
L
 
G
P
 
M
V
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
L
 
F
S
 
M
D
 
E
R
 
V
F
 
T
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
L
I
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
I
G
 
A
I
 
C
I
 
T
A
 
M
E
 
G
A
 
G
L
 
C
V
 
F
A
 
T
F
 
Y
P
 
P
M
 
A
F
 
F
W
 
M
L
 
L
M
 
R
D
 
S
T
 
E
K
 
K
E
 
-
L
 
-
S
 
A
M
 
I
V
 
L
V
 
G
F
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
M
L
 
L
L
 
Y
M
 
F
T
 
C
A
 
V
F
 
F
A
 
G
A
 
V
N
 
-
Y
 
W
G
 
G
P
 
I
I
 
L
A
 
P
T
 
I
F
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
P
T
 
A
R
 
D
V
 
A
R
 
R
Y
 
A
S
 
L
G
 
V
L
 
A
S
 
G
I
 
L
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
N
L
 
L
L
 
A
G
 
S
S
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
S
P
 
T
I
 
I
V
 
E
T
 
T
T
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q9VCA2 Organic cation transporter protein from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
25% identity, 69% coverage: 75:389/459 of query aligns to 139:468/548 of Q9VCA2

query
sites
Q9VCA2
L
 
L
A
 
G
R
 
V
I
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
L
L
 
I
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
F
 
M
G
 
S
D
 
D
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
K
S
 
P
M
 
T
L
 
F
L
 
F
I
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
V
T
 
L
M
 
Q
G
 
L
A
 
I
A
 
F
T
 
G
F
 
V
A
 
L
I
 
A
G
 
A
L
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
E
F
 
Y
A
 
F
T
 
S
I
 
Y
G
 
T
I
 
I
W
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
S
R
 
R
V
 
M
V
 
I
Q
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
T
L
 
T
G
 
S
G
 
G
E
 
V
W
 
F
G
 
L
G
 
V
A
 
A
V
 
Y
L
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
L
E
 
E
H
 
M
A
 
V
P
 
G
A
 
S
N
 
S
K
 
Y
R
 
R
G
 
L
L
 
F
Y
 
A
G
 
G
S
 
V
W
 
A
V
 
M
Q
 
Q
I
 
M
G
 
F
V
 
F
P
 
S
A
 
V
G
 
G
T
 
F
M
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
I
 
I
A
 
H
N
 
D
L
 
W
A
 
R
F
 
W
L
 
L
L
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
P
P
 
G
E
 
L
D
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
C
W
 
Y
G
 
Y
W
 
W
R
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
E
L
 
S
A
 
A
S
 
R
V
 
W
L
 
L
L
 
L
-
 
M
-
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
F
I
 
V
A
 
I
V
 
I
G
 
E
L
 
K
Y
 
A
I
 
A
R
 
K
L
 
E
N
 
N
I
 
K
S
 
V
E
 
E
T
 
V
P
 
P
A
 
N
F
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
A
N
 
E
K
 
K
V
 
K
K
 
K
E
 
Q
A
 
D
E
 
E
V
 
M
Q
 
A
V
 
A
K
 
S
M
 
Q
P
 
P
L
 
A
A
 
A
E
 
T
V
 
V
F
 
F
R
 
D
K
 
L
Y
 
L
W
 
R
K
 
Y
Q
 
P
V
 
N
L
 
L
L
 
R
G
 
R
G
 
K
I
 
T
A
 
L
T
 
L
M
 
I
S
 
F
T
 
F
G
 
D
A
 
W
S
 
F
F
 
V
N
 
N
I
 
S
I
 
G
V
 
V
A
 
Y
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
S
Y
 
W
G
 
N
T
 
T
Q
 
N
N
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
G
S
 
N
R
 
Q
S
 
L
V
 
V
M
 
N
L
 
F
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
M
L
 
I
S
 
S
C
 
G
A
 
A
W
 
-
C
 
-
I
 
-
V
 
V
M
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
G
F
 
Y
G
 
T
A
 
L
L
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
T
S
 
L
D
 
N
R
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
K
 
R
P
 
S
I
 
I
I
 
L
V
 
C
G
 
G
-
 
T
-
 
M
-
 
M
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
I
G
 
S
I
 
L
I
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
I
L
 
F
V
 
V
A
 
P
F
 
S
P
 
D
M
 
M
F
 
N
W
 
W
L
 
L
M
 
I
D
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
V
S
 
A
M
 
C
V
 
A
V
 
M
F
 
I
G
 
G
Y
 
K
L
 
L
L
 
-
L
 
-
M
 
-
T
 
-
A
 
A
F
 
I
A
 
T
A
 
S
N
 
S
Y
 
Y
G
 
G
P
 
T
I
 
I
A
 
Y
T
 
I
F
 
F
L
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
Q
F
 
F
G
 
P
T
 
T
R
 
V
V
 
V
R
 
R
Y
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
I
 
A
S
 
S
Y
 
S
M
 
M
L
 
V
S
 
A
G
 
R
L
 
V
L
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PfGW456L13_2328 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2328
MSDLSSAEKSGAPPEVAISMKKVAVASVIGTTVEWYDLFVFATASALVFNKVFFPDFVPL
IGTLLAFGTFASAYLARIVGAALFGHFGDRLGRKSMLLISLLTMGAATFAIGLLPDFATI
GIWAPILLLLLRVVQGLALGGEWGGAVLMAVEHAPANKRGLYGSWVQIGVPAGTMIANLA
FLLIAAWLSPEDLLAWGWRIPFLASVLLIAVGLYIRLNISETPAFNKVKEAEVQVKMPLA
EVFRKYWKQVLLGGIATMSTGASFNIIVAFGLTYGTQNLGFSRSVMLGVVLLSCAWCIVM
LPVFGALSDRFGRKPIIVGGIIAEALVAFPMFWLMDTKELSMVVFGYLLLMTAFAANYGP
IATFLAELFGTRVRYSGLSISYMLSGLLGSAATPIVTTALLAATGKGSSVAWYMIGAALI
SLVALLLLTETFKKDISEIPSVVPTDDPAPGKPFKSATA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory