SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2423 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2423 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P33164 Phthalate dioxygenase reductase; PDR; EC 1.-.-.- from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see paper)
28% identity, 84% coverage: 54:355/358 of query aligns to 55:322/322 of P33164

query
sites
P33164
R
 
R
R
|
R
S
x
T
Y
 
Y
S
 
S
I
 
L
C
 
C
T
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
N
D
 
D
G
 
S
E
 
Q
L
 
E
R
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
Y
-
 
V
I
 
I
A
|
A
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
 
D
T
 
S
G
 
N
G
 
G
R
|
R
F
x
G
S
x
G
A
x
S
F
 
I
A
 
S
N
 
F
-
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
T
K
 
S
A
 
E
G
 
G
H
 
D
T
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
S
P
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
E
F
 
F
C
 
P
V
 
L
E
 
D
L
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
K
R
 
R
H
 
A
G
 
K
N
 
S
Y
 
F
L
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
I
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
M
I
 
A
K
 
R
T
 
Q
T
 
-
L
 
L
E
 
R
T
 
A
E
 
E
P
 
G
H
 
L
S
 
R
R
 
S
V
 
F
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
L
N
 
T
R
 
R
S
 
D
S
 
P
S
 
E
G
 
G
A
 
T
L
 
A
F
 
F
R
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
E
 
T
D
 
S
L
 
D
K
 
E
N
 
W
R
 
R
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
F
 
-
V
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
K
L
 
I
Y
 
H
N
 
H
G
 
D
R
 
H
I
 
G
N
 
D
A
 
P
E
 
T
K
 
K
C
 
A
E
 
F
Q
 
D
L
 
F
F
 
W
S
 
S
R
 
V
W
 
F
L
 
E
D
 
K
I
 
S
K
 
K
A
 
P
L
 
A
D
 
Q
A
 
H
A
 
V
F
 
Y
I
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
A
M
 
L
T
 
M
E
 
D
T
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
M
K
 
T
G
 
G
M
 
H
A
 
W
P
 
P
E
 
S
-
 
G
R
 
T
I
 
V
H
 
H
F
 
F
E
 
E
L
 
S
F
|
F
A
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
N
S
 
T
Q
 
N
Q
 
A
K
 
R
R
 
E
E
 
N
A
 
T
R
 
P
E
 
F
A
 
T
A
 
V
R
 
R
Q
 
L
V
 
S
D
 
R
S
 
S
A
 
G
V
 
T
S
 
S
Q
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
A
N
 
N
S
 
-
Q
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
A
 
V
G
 
L
N
 
R
A
 
D
Q
 
A
G
 
N
A
 
V
E
 
R
L
 
V
P
 
P
Y
 
S
S
 
S
C
|
C
K
 
E
A
x
S
G
 
G
V
 
T
C
|
C
S
 
G
T
 
S
C
|
C
K
 
K
C
 
T
K
 
A
V
 
L
I
 
C
E
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
E
 
D
M
 
H
D
 
-
S
 
R
N
 
D
H
 
M
A
 
V
L
 
L
E
 
R
D
 
D
Y
 
D
E
 
E
V
 
K
A
 
G
A
 
T
G
 
-
Y
 
Q
V
 
I
L
 
M
S
 
V
C
|
C
Q
 
V
A
 
S
F
 
R
P
 
A
I
 
K
S
 
S
D
 
A
K
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
L

2piaA Phthalate dioxygenase reductase: a modular structure for electron transfer from pyridine nucleotides to [2fe-2s] (see paper)
28% identity, 84% coverage: 54:355/358 of query aligns to 54:321/321 of 2piaA

query
sites
2piaA
R
 
R
R
|
R
S
x
T
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
C
T
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
N
D
 
D
G
 
S
E
 
Q
L
 
E
R
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
Y
-
 
V
I
 
I
A
|
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
V
 
D
T
 
S
G
 
N
G
|
G
R
|
R
F
 
G
S
x
G
A
x
S
F
 
I
A
 
S
N
 
F
-
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
T
K
 
S
A
 
E
G
 
G
H
 
D
T
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
S
P
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
E
F
 
F
C
 
P
V
 
L
E
 
D
L
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
K
R
 
R
H
 
A
G
 
K
N
 
S
Y
 
F
L
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
I
 
M
L
 
L
S
 
S
I
 
M
I
 
A
K
 
R
T
 
Q
T
 
-
L
 
L
E
 
R
T
 
A
E
 
E
P
 
G
H
 
L
S
 
R
R
 
S
V
 
F
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
L
N
 
T
R
 
R
S
 
D
S
 
P
S
 
E
G
 
G
A
 
T
L
 
A
F
 
F
R
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
E
 
T
D
 
S
L
 
D
K
 
E
N
 
W
R
 
R
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
I
 
-
F
 
-
V
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
K
L
 
I
Y
 
H
N
 
H
G
 
D
R
 
H
I
 
G
N
 
D
A
 
P
E
 
T
K
 
K
C
 
A
E
 
F
Q
 
D
L
 
F
F
 
W
S
 
S
R
 
V
W
 
F
L
 
E
D
 
K
I
 
S
K
 
K
A
 
P
L
 
A
D
 
Q
A
 
H
A
 
V
F
 
Y
I
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
E
 
A
M
 
L
T
 
M
E
 
D
T
 
T
V
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
M
K
 
T
G
 
G
M
 
H
A
 
W
P
 
P
E
 
S
-
 
G
R
 
T
I
 
V
H
 
H
F
 
F
E
|
E
L
 
S
F
|
F
A
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
N
S
 
T
Q
 
N
Q
 
A
K
 
R
R
 
E
E
 
N
A
 
T
R
 
P
E
 
F
A
 
T
A
 
V
R
 
R
Q
 
L
V
 
S
D
 
R
S
 
S
A
 
G
V
 
T
S
 
S
Q
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
A
N
 
N
S
 
-
Q
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
A
 
V
G
 
L
N
 
R
A
 
D
Q
 
A
G
 
N
A
 
V
E
 
R
L
 
V
P
 
P
Y
x
S
S
 
S
C
|
C
K
x
E
A
 
S
G
|
G
V
 
T
C
|
C
S
x
G
T
 
S
C
|
C
K
 
K
C
 
T
K
 
A
V
 
L
I
 
C
E
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
E
 
D
M
 
H
D
 
-
S
 
R
N
 
D
H
 
M
A
 
V
L
 
L
E
 
R
D
 
D
Y
 
D
E
 
E
V
 
K
A
 
G
A
 
T
G
 
-
Y
 
Q
V
 
I
L
 
M
S
 
V
C
|
C
Q
 
V
A
 
S
F
 
R
P
 
A
I
 
K
S
 
S
D
 
A
K
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
L

Sites not aligning to the query:

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
27% identity, 68% coverage: 4:245/358 of query aligns to 154:397/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
F
 
W
H
 
R
S
 
T
L
 
F
T
 
V
I
 
I
K
 
R
D
 
E
V
 
K
R
 
R
A
 
P
E
 
E
T
 
S
R
 
D
D
 
V
A
 
I
V
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
-
P
 
P
Q
 
A
D
 
D
L
 
G
Q
 
G
D
 
P
S
 
V
F
 
V
H
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
T
V
 
S
M
 
V
R
 
A
T
 
I
Q
 
D
L
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
V
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
S
T
 
D
G
 
M
V
 
P
N
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
T
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
A
 
N
F
 
L
A
 
L
N
 
H
E
 
D
Q
 
H
L
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
M
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
V
 
I
E
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
K
R
 
T
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
I
 
M
L
 
V
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
A
E
 
P
P
 
P
H
 
R
S
 
-
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
S
 
S
S
 
A
G
 
V
A
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
-
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
-
F
 
F
V
 
V
F
 
F
S
 
Y
R
 
D
E
 
Q
Q
 
P
Q
 
L
D
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
N
 
D
A
 
V
E
 
K
K
 
Q
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
I
K
 
L
A
 
L
L
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
P
M
 
F
T
 
M
E
 
R
T
 
M
V
 
Q
R
 
H
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
K
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
H
P
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
x
V
F
|
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
27% identity, 68% coverage: 4:245/358 of query aligns to 154:397/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
F
 
W
H
 
R
S
 
T
L
 
F
T
 
V
I
 
I
K
 
R
D
 
E
V
 
K
R
 
R
A
 
P
E
 
E
T
 
S
R
 
D
D
 
V
A
 
I
V
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
-
P
 
P
Q
 
A
D
 
D
L
 
G
Q
 
G
D
 
P
S
 
V
F
 
V
H
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
T
V
 
S
M
 
V
R
 
A
T
 
I
Q
 
D
L
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
V
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
S
T
 
D
G
 
M
V
 
P
N
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
T
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
A
 
N
F
 
L
A
 
L
N
 
H
E
 
D
Q
 
H
L
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
M
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
V
 
I
E
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
K
R
 
T
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
I
 
M
L
 
V
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
A
E
 
P
P
 
P
H
 
R
S
 
-
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
S
 
S
S
 
A
G
 
V
A
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
-
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
-
F
 
F
V
 
V
F
 
F
S
 
Y
R
 
D
E
 
Q
Q
 
P
Q
 
L
D
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
N
 
D
A
 
V
E
 
K
K
 
Q
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
I
K
 
L
A
 
L
L
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
P
M
 
F
T
 
M
E
 
R
T
 
M
V
 
Q
R
 
H
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
K
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
H
P
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
 
V
F
|
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
27% identity, 68% coverage: 4:245/358 of query aligns to 154:397/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
F
 
W
H
 
R
S
 
T
L
 
F
T
 
V
I
 
I
K
 
R
D
 
E
V
 
K
R
 
R
A
 
P
E
 
E
T
 
S
R
 
D
D
 
V
A
 
I
V
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
-
P
 
P
Q
 
A
D
 
D
L
 
G
Q
 
G
D
 
P
S
 
V
F
 
V
H
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
T
V
 
S
M
 
V
R
 
A
T
 
I
Q
 
D
L
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
V
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
S
T
 
D
G
 
M
V
 
P
N
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
T
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
A
 
N
F
 
L
A
 
L
N
 
H
E
 
D
Q
 
H
L
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
M
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
V
 
I
E
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
K
R
 
T
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
V
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
A
E
 
P
P
 
P
H
 
R
S
 
-
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
S
 
S
S
 
A
G
 
V
A
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
-
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
-
F
 
F
V
 
V
F
 
F
S
 
Y
R
 
D
E
 
Q
Q
 
P
Q
 
L
D
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
N
 
D
A
 
V
E
 
K
K
 
Q
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
I
K
 
L
A
 
L
L
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
P
M
 
F
T
 
M
E
 
R
T
 
M
V
 
Q
R
 
H
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
K
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
H
P
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
F
 
Y
E
|
E
L
x
V
F
 
F
A
x
G

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
27% identity, 68% coverage: 4:245/358 of query aligns to 154:397/403 of P39662

query
sites
P39662
F
 
W
H
 
R
S
 
T
L
 
F
T
 
V
I
 
I
K
 
R
D
 
E
V
 
K
R
 
R
A
 
P
E
 
E
T
 
S
R
 
D
D
 
V
A
 
I
V
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
-
P
 
P
Q
 
A
D
 
D
L
 
G
Q
 
G
D
 
P
S
 
V
F
 
V
H
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
 
Y
L
 
T
V
 
S
M
 
V
R
 
A
T
 
I
Q
 
D
L
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
V
 
Q
R
 
I
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
I
 
L
C
 
S
T
 
D
G
 
M
V
 
P
N
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
E
T
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
G
R
 
Y
F
 
V
S
 
S
A
 
N
F
 
L
A
 
L
N
 
H
E
 
D
Q
 
H
L
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
M
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
V
 
I
E
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
K
R
 
T
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
V
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
A
E
 
P
P
 
P
H
 
R
S
 
-
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
S
 
S
S
 
A
G
 
V
A
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
-
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
-
F
 
F
V
 
V
F
 
F
S
 
Y
R
 
D
E
 
Q
Q
 
P
Q
 
L
D
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
N
 
D
A
 
V
E
 
K
K
 
Q
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
I
K
 
L
A
 
L
L
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
P
M
 
F
T
 
M
E
 
R
T
 
M
V
 
Q
R
 
H
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
K
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
H
P
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
27% identity, 68% coverage: 4:245/358 of query aligns to 154:397/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
F
 
W
H
 
R
S
 
T
L
 
F
T
 
V
I
 
I
K
 
R
D
 
E
V
 
K
R
 
R
A
 
P
E
 
E
T
 
S
R
 
D
D
 
V
A
 
I
V
 
T
S
 
S
I
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
I
 
-
P
 
P
Q
 
A
D
 
D
L
 
G
Q
 
G
D
 
P
S
 
V
F
 
V
H
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
H
x
Y
L
 
T
V
 
S
M
 
V
R
 
A
T
 
I
Q
 
D
L
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
V
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
S
T
 
D
G
 
M
V
 
P
N
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
T
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
T
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
x
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
A
 
N
F
 
L
A
 
L
N
 
H
E
 
D
Q
 
H
L
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
M
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
V
 
I
E
 
D
L
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
K
R
 
T
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
S
A
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
M
L
 
V
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
T
 
A
E
 
P
P
 
P
H
 
R
S
 
-
R
 
Q
V
 
V
T
 
V
L
 
F
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
S
 
S
S
 
A
G
 
V
A
 
H
L
 
A
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
Y
 
Y
L
 
-
Q
 
E
R
 
N
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
-
F
 
F
V
 
V
F
 
F
S
 
Y
R
 
D
E
 
Q
Q
 
P
Q
 
L
D
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
Y
 
Y
N
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
V
N
 
D
A
 
V
E
 
K
K
 
Q
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
S
I
 
I
K
 
L
A
 
L
L
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
P
M
 
F
T
 
M
E
 
R
T
 
M
V
 
Q
R
 
H
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
K
 
L
G
 
G
M
 
I
A
 
H
P
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
F
 
Y
E
 
E
L
x
V
F
 
F
A
x
G

Sites not aligning to the query:

1krhA X-ray structure of benzoate dioxygenase reductase (see paper)
27% identity, 68% coverage: 2:246/358 of query aligns to 103:336/337 of 1krhA

query
sites
1krhA
S
 
T
K
 
K
F
 
I
H
 
H
S
 
H
L
 
F
T
 
E
I
 
G
K
 
T
D
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
V
E
 
E
T
 
N
R
 
L
D
 
S
A
 
D
V
 
S
S
 
T
I
 
I
A
 
T
F
 
F
E
 
D
I
 
I
P
 
Q
-
 
L
Q
 
D
D
 
D
L
 
G
Q
 
Q
D
 
P
S
 
D
F
 
I
H
 
H
F
 
F
T
 
L
Q
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
x
Y
L
 
V
V
 
-
M
 
-
R
 
N
T
 
V
Q
 
T
L
 
L
D
 
P
G
 
G
E
 
T
E
 
T
V
 
E
R
 
T
R
|
R
S
|
S
Y
|
Y
S
|
S
I
 
F
C
 
S
T
 
S
G
 
Q
V
 
P
N
 
G
D
 
N
G
 
R
E
 
L
L
 
T
R
 
G
I
 
F
A
x
V
V
|
V
K
 
R
R
 
N
V
 
V
T
 
P
G
 
Q
G
|
G
R
x
K
F
x
M
S
|
S
A
 
E
F
 
Y
A
 
L
N
 
S
E
 
V
Q
 
Q
L
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
D
T
 
K
L
 
M
E
 
S
V
 
F
M
 
T
P
 
G
P
 
P
A
 
F
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
Y
V
 
L
E
 
R
L
 
-
D
 
D
P
 
V
A
 
K
R
 
R
H
 
-
G
 
-
N
 
P
Y
 
V
L
 
L
A
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
I
T
 
A
P
 
P
I
 
F
L
 
L
S
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
Q
T
 
V
T
 
L
L
 
E
E
 
Q
T
 
K
E
 
G
P
 
S
H
 
E
S
 
H
R
 
P
V
 
V
T
 
R
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
T
S
 
Q
S
 
D
S
 
C
G
 
D
A
 
L
L
 
V
F
 
A
R
 
L
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
D
D
 
A
L
 
L
K
 
Q
N
 
Q
R
 
K
-
 
L
-
 
P
Y
 
W
L
 
F
Q
 
E
R
 
Y
L
 
R
N
 
T
L
 
V
I
 
V
F
 
A
V
 
H
F
 
A
S
 
E
R
 
S
E
 
Q
Q
 
H
Q
 
E
D
 
R
V
 
K
D
 
G
L
 
Y
Y
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
I
N
 
E
A
 
Y
E
 
D
K
 
-
C
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
W
L
 
L
D
 
N
I
 
G
K
 
G
A
 
E
L
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
-
F
 
Y
I
 
L
C
|
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
V
E
 
P
M
 
M
T
 
V
E
 
E
T
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
S
S
 
W
L
 
L
K
 
D
A
 
T
K
 
Q
G
 
G
M
 
I
A
 
Q
P
 
P
E
 
A
R
 
N
I
 
F
H
 
L
F
 
F
E
|
E
L
 
K
F
|
F
A
x
S
A
|
A

Sites not aligning to the query:

1rfkB Crystal structure of 2fe2s ferredoxin from thermophilic cyanobacterium mastigocladus laminosus (see paper)
43% identity, 25% coverage: 265:352/358 of query aligns to 1:89/97 of 1rfkB

query
sites
1rfkB
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
E
G
 
A
R
 
E
A
 
G
L
 
L
-
 
N
-
 
K
A
 
T
F
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
D
S
 
D
Q
 
Q
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
I
E
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
V
V
 
I

7ylrA Structure of a bacteria protein
28% identity, 89% coverage: 36:354/358 of query aligns to 36:326/326 of 7ylrA

query
sites
7ylrA
F
 
F
T
 
A
Q
 
A
G
 
G
Q
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
R
M
 
V
R
 
Q
T
 
V
Q
 
S
L
 
L
-
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
R
E
 
T
V
 
D
R
 
W
R
|
R
S
x
H
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
F
C
 
A
T
 
T
G
 
A
V
 
R
N
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
A
D
 
P
G
 
T
E
 
E
L
 
Y
R
 
V
I
 
I
A
|
A
V
|
V
K
x
R
R
 
K
V
 
E
T
 
A
G
 
E
G
|
G
R
|
R
F
 
G
-
x
G
S
|
S
A
 
R
F
 
F
A
 
M
N
 
H
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
E
G
 
G
H
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
A
V
 
I
M
 
E
P
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
N
H
 
D
F
 
F
C
 
P
V
 
L
E
 
H
L
 
T
D
 
G
P
 
P
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
N
 
G
Y
 
S
L
 
V
A
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
I
 
V
T
|
T
P
 
P
I
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
-
I
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
M
Y
 
A
G
 
A
N
 
R
R
 
R
S
 
R
S
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
P
F
 
V
R
 
R
E
 
M
Q
 
H
L
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
R
 
-
Y
 
Y
L
 
A
Q
 
G
R
 
R
L
 
S
N
 
R
L
 
E
I
 
L
F
 
M
V
 
A
F
 
F
S
 
L
R
 
P
E
 
E
Q
 
L
Q
 
Q
D
 
A
V
 
L
D
 
L
L
 
G
Y
 
D
N
 
D
G
 
L
R
 
R
I
 
V
N
 
H
A
 
A
E
 
D
K
 
A
C
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
E
F
 
A
S
 
G
R
 
A
W
 
P
L
 
L
D
 
D
I
 
I
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
D
 
D
A
 
R
A
 
L
F
 
Y
I
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
E
 
V
M
 
M
T
 
L
E
 
D
T
 
A
V
 
V
R
 
L
D
 
A
S
 
R
L
 
T
K
 
Q
A
 
A
K
 
R
G
 
G
M
 
W
A
 
E
P
 
H
E
 
D
R
 
R
I
 
V
H
 
H
F
 
F
E
|
E
L
 
L
F
|
F
A
 
T
A
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
E
|
E
A
 
P
A
 
V
R
 
A
Q
 
E
V
 
G
D
 
D
S
 
Q
A
 
P
V
 
F
S
 
-
Q
 
E
I
 
V
T
 
E
V
 
L
I
 
A
S
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
-
L
 
-
A
 
R
F
 
F
D
 
T
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
A
S
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
C
G
 
L
N
 
I
A
 
E
Q
 
H
G
 
G
A
 
C
E
 
D
L
 
P
P
 
M
Y
 
F
S
 
D
C
|
C
K
|
K
A
x
R
G
|
G
V
 
E
C
|
C
S
x
G
T
 
V
C
|
C
K
 
A
C
 
V
K
 
P
V
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
E
 
D
M
 
-
D
 
H
S
 
R
N
 
D
H
 
Y
A
 
V
L
 
L
E
 
T
D
 
A
Y
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
N
V
 
V
L
 
M
S
 
Q
-
 
I
C
|
C
Q
 
I
A
 
S
F
 
R
P
 
A
I
 
K
S
 
G
D
 
A
K
 
R
V
 
L
V
 
V
L
 
L
D
 
D

6khi1 Supercomplex for cylic electron transport in cyanobacteria (see paper)
41% identity, 25% coverage: 265:353/358 of query aligns to 2:90/98 of 6khi1

query
sites
6khi1
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
V
-
 
R
S
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
S
A
 
E
L
 
T
A
 
T
F
 
I
D
 
D
L
 
V
P
 
P
R
 
E
N
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
K
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
L
|
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
R
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
K
V
 
I
L
 
L

7fixR1 Photosystem I reaction center subunit PsaK (see paper)
41% identity, 25% coverage: 265:353/358 of query aligns to 1:89/97 of 7fixR1

query
sites
7fixR1
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
V
-
 
R
S
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
S
A
 
E
L
 
T
A
 
T
F
 
I
D
 
D
L
 
V
P
 
P
R
 
E
N
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
x
F
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
K
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
L
|
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
R
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
K
V
 
I
L
 
L

3b2gA Leptolyngbya boryana ferredoxin (see paper)
42% identity, 24% coverage: 268:353/358 of query aligns to 4:90/98 of 3b2gA

query
sites
3b2gA
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
E
G
 
T
R
 
E
A
 
G
L
 
L
-
 
N
-
 
T
A
 
T
F
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
D
S
 
D
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
T
E
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
T
V
 
I
L
 
L

7s3dX Structure of photosystem i with bound ferredoxin from synechococcus sp. Pcc 7335 acclimated to far-red light (see paper)
49% identity, 19% coverage: 285:353/358 of query aligns to 21:89/97 of 7s3dX

query
sites
7s3dX
N
 
D
S
 
D
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
T
V
 
V
L
 
M

P0A3C7 Ferredoxin-1; Ferredoxin I from Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) (see paper)
41% identity, 25% coverage: 265:352/358 of query aligns to 2:90/99 of P0A3C7

query
sites
P0A3C7
A
 
A
V
 
T
S
 
F
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
-
 
N
-
 
E
S
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
T
A
 
K
L
 
H
A
 
E
F
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
D
S
 
D
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
C
 
C
K
x
R
A
 
A
G
 
G
V
 
A
C
 
C
S
 
S
T
|
T
C
 
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
x
F
L
 
L
E
 
D
D
|
D
Y
x
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
 
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
V
V
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1ewyC Anabaena pcc7119 ferredoxin:ferredoxin-NADP+-reductase complex (see paper)
41% identity, 25% coverage: 265:352/358 of query aligns to 1:89/98 of 1ewyC

query
sites
1ewyC
A
 
A
V
 
T
S
 
F
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
-
 
N
-
 
E
S
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
T
A
 
K
L
 
H
A
 
E
F
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
D
S
 
D
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
x
F
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
x
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
x
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
|
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
V
V
 
V
V
 
I

1czpA Anabaena pcc7119 [2fe-2s] ferredoxin in the reduced and oxixized state at 1.17 a (see paper)
41% identity, 25% coverage: 265:352/358 of query aligns to 1:89/98 of 1czpA

query
sites
1czpA
A
 
A
V
 
T
S
 
F
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
I
-
 
N
-
 
E
S
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
T
A
 
K
L
 
H
A
 
E
F
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
-
N
 
D
S
 
D
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
x
F
S
 
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
V
V
 
V
V
 
I

6xtfD Crystal structure a thioredoxin reductase from gloeobacter violaceus bound to its electron donor (see paper)
40% identity, 24% coverage: 265:349/358 of query aligns to 1:84/96 of 6xtfD

query
sites
6xtfD
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
Q
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
L
I
 
V
S
 
T
D
 
P
G
 
S
R
 
G
A
 
K
L
 
K
A
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
C
P
 
P
R
 
S
N
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
M
I
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
I
E
 
D
M
 
Q
D
 
G
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
N

7y5eNN Phycobilisome 31.8 kDa linker polypeptide, phycoerythrin-associated, rod (see paper)
51% identity, 18% coverage: 289:353/358 of query aligns to 27:91/99 of 7y5eNN

query
sites
7y5eNN
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
C
|
C
K
x
R
A
|
A
G
|
G
V
x
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
S
E
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
I
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
D
Y
 
D
E
 
Q
V
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
T
V
 
I
L
 
L

3ab5A Crystal structure of the 2fe 2s ferredoxin from cyanidioschyzon merolae
45% identity, 18% coverage: 287:352/358 of query aligns to 23:88/97 of 3ab5A

query
sites
3ab5A
Q
 
Q
S
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
A
N
 
E
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
C
|
C
K
x
R
A
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
S
 
S
T
 
T
C
|
C
K
 
A
C
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
V
E
 
D
M
 
Q
D
 
S
S
 
D
N
 
Q
H
 
S
A
 
F
L
 
L
E
 
D
D
 
E
Y
 
D
E
 
Q
V
 
I
A
 
S
A
 
K
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
T
C
|
C
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
C
V
 
V
V
 
I

Query Sequence

>PfGW456L13_2423 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2423
MSKFHSLTIKDVRAETRDAVSIAFEIPQDLQDSFHFTQGQHLVMRTQLDGEEVRRSYSIC
TGVNDGELRIAVKRVTGGRFSAFANEQLKAGHTLEVMPPAGHFCVELDPARHGNYLAVAA
GSGITPILSIIKTTLETEPHSRVTLLYGNRSSSGALFREQLEDLKNRYLQRLNLIFVFSR
EQQDVDLYNGRINAEKCEQLFSRWLDIKALDAAFICGPQEMTETVRDSLKAKGMAPERIH
FELFAAAGSQQKREAREAARQVDSAVSQITVISDGRALAFDLPRNSQSILDAGNAQGAEL
PYSCKAGVCSTCKCKVIEGEVEMDSNHALEDYEVAAGYVLSCQAFPISDKVVLDFDQL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory