SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2523 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2523 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6laaA Crystal structure of full-length cyp116b46 from tepidiphilus thermophilus (see paper)
34% identity, 78% coverage: 67:345/360 of query aligns to 486:739/753 of 6laaA

query
sites
6laaA
T
 
S
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
C
S
 
S
S
 
D
P
 
P
L
 
E
A
 
N
D
 
R
A
 
D
L
 
A
P
 
W
K
 
R
V
 
V
T
 
A
V
 
V
K
x
Q
R
 
R
V
 
D
D
 
P
G
 
A
G
x
S
R
|
R
V
 
G
-
x
G
S
|
S
N
 
R
W
 
W
M
 
I
N
 
H
E
 
E
-
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
P
G
 
G
D
 
M
W
 
L
L
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
R
P
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
S
F
 
F
C
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
E
Q
 
H
A
 
A
D
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
L
 
R
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
-
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
M
S
 
T
I
 
M
L
 
A
K
 
A
S
 
R
V
 
A
L
 
K
H
 
E
S
 
L
S
 
G
R
 
T
R
 
-
P
 
D
I
 
Y
K
 
E
L
 
L
I
 
H
Y
 
Y
A
 
S
N
 
V
R
 
R
D
 
S
E
 
R
A
 
T
S
 
S
V
 
L
I
 
I
F
 
F
K
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
R
Q
 
Q
L
 
I
I
 
-
K
 
-
A
 
-
H
 
H
P
 
G
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
H
 
H
V
 
V
V
 
-
H
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
Y
L
 
V
T
 
S
D
 
E
H
 
E
Q
 
G
V
 
V
R
 
R
H
 
N
L
 
D
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
R
R
 
R
G
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
T
D
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
I
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
P
 
R
F
 
M
M
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
L
L
 
I
L
 
E
A
 
N
V
 
R
G
 
P
E
 
E
A
 
V
A
 
T
E
 
L
R
 
R
I
 
-
H
 
-
V
 
V
E
|
E
R
 
H
F
|
F
V
 
F
S
 
G
P
 
E
P
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
K
L
 
E
L
 
R
A
 
P
E
 
F
E
 
Q
A
 
V
V
 
V
A
 
L
R
 
R
A
 
N
A
 
S
A
 
G
M
 
-
D
 
-
S
 
-
Q
 
-
C
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
I
 
T
V
 
V
E
 
E
L
 
V
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
H
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
C
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
A
D
 
D
-
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
S
 
V
C
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
Y
G
 
N
L
 
I
D
 
E
V
 
V
P
 
Q
S
|
S
S
 
D
C
|
C
E
|
E
E
 
E
G
|
G
F
 
L
C
|
C
G
|
G
A
 
T
C
|
C
M
 
E
C
 
V
V
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
D
L
 
-
A
 
H
R
 
R
N
 
D
D
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
R
K
 
A
E
 
E
L
 
R
A
 
R
D
 
E
G
 
N
W
 
R
T
 
R
L
 
M
A
 
M
C
 
C

Sites not aligning to the query:

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
32% identity, 55% coverage: 48:245/360 of query aligns to 184:396/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
R
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
I
R
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
Q
L
 
Q
T
 
I
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
S
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
W
 
L
M
 
L
N
 
H
E
 
D
-
 
H
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
S
 
A
S
 
P
R
 
P
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
K
 
V
L
 
F
I
 
V
Y
 
H
A
 
G
N
 
A
R
 
R
D
 
N
E
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
L
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
T
H
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
Q
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
V
 
F
H
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
P
D
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
R
L
 
D
T
 
Y
D
 
D
H
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
I
L
 
E
R
 
K
G
 
S
S
 
I
-
 
L
-
 
L
A
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
D
 
R
T
 
M
V
 
Q
E
 
H
R
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
H
A
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
x
V
F
|
F

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
32% identity, 55% coverage: 48:245/360 of query aligns to 184:396/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
R
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
I
R
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
Q
L
 
Q
T
 
I
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
S
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
W
 
L
M
 
L
N
 
H
E
 
D
-
 
H
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
S
 
A
S
 
P
R
 
P
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
K
 
V
L
 
F
I
 
V
Y
 
H
A
 
G
N
 
A
R
 
R
D
 
N
E
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
L
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
T
H
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
Q
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
V
 
F
H
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
P
D
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
R
L
 
D
T
 
Y
D
 
D
H
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
I
L
 
E
R
 
K
G
 
S
S
 
I
-
 
L
-
 
L
A
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
D
 
R
T
 
M
V
 
Q
E
 
H
R
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
H
A
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
 
V
F
|
F

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
32% identity, 55% coverage: 48:245/360 of query aligns to 184:396/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
R
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
I
R
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
Q
L
 
Q
T
 
I
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
S
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
W
 
L
M
 
L
N
 
H
E
 
D
-
 
H
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
S
 
A
S
 
P
R
 
P
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
K
 
V
L
 
F
I
 
V
Y
 
H
A
 
G
N
 
A
R
 
R
D
 
N
E
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
L
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
T
H
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
Q
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
V
 
F
H
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
P
D
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
R
L
 
D
T
 
Y
D
 
D
H
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
I
L
 
E
R
 
K
G
 
S
S
 
I
-
 
L
-
 
L
A
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
D
 
R
T
 
M
V
 
Q
E
 
H
R
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
H
A
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
|
E
R
x
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
32% identity, 55% coverage: 48:245/360 of query aligns to 184:396/403 of P39662

query
sites
P39662
R
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
I
R
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
Q
L
 
Q
T
 
I
R
 
R
C
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
M
 
L
A
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
S
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
G
R
 
Y
V
 
V
S
 
S
N
 
N
W
 
L
M
 
L
N
 
H
E
 
D
-
 
H
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
S
 
A
S
 
P
R
 
P
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
K
 
V
L
 
F
I
 
V
Y
 
H
A
 
G
N
 
A
R
 
R
D
 
N
E
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
L
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
T
H
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
Q
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
V
 
F
H
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
P
D
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
R
L
 
D
T
 
Y
D
 
D
H
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
I
L
 
E
R
 
K
G
 
S
S
 
I
-
 
L
-
 
L
A
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
D
 
R
T
 
M
V
 
Q
E
 
H
R
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
H
A
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
 
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
32% identity, 55% coverage: 48:245/360 of query aligns to 184:396/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
R
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
L
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
I
R
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
Q
L
 
Q
T
 
I
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
S
S
 
D
S
 
M
P
 
P
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
T
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
x
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
x
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
W
 
L
M
 
L
N
 
H
E
 
D
-
 
H
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
H
 
S
F
 
F
C
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
K
K
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
M
L
 
L
K
 
K
S
 
V
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
S
 
A
S
 
P
R
 
P
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
K
 
V
L
 
F
I
 
V
Y
 
H
A
 
G
N
 
A
R
 
R
D
 
N
E
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
L
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
T
H
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
Q
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
V
 
F
H
 
Y
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
V
 
L
L
 
P
D
 
E
S
 
D
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
R
L
 
D
T
 
Y
D
 
D
H
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
Q
 
D
V
 
V
R
 
K
H
 
Q
L
 
I
L
 
E
R
 
K
G
 
S
S
 
I
-
 
L
-
 
L
A
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
P
F
 
F
M
 
M
D
 
R
T
 
M
V
 
Q
E
 
H
R
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
K
A
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
I
A
 
H
A
 
E
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
x
V
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6kbhA Crystal structure of an intact type iv self-sufficient cytochrome p450 monooxygenase
32% identity, 81% coverage: 66:358/360 of query aligns to 497:765/765 of 6kbhA

query
sites
6kbhA
L
 
V
T
 
S
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
C
S
 
G
S
 
D
P
 
P
L
 
H
A
 
D
D
 
R
A
 
T
L
 
T
P
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
x
A
V
 
V
-
x
L
-
 
H
-
 
D
K
 
R
R
 
E
V
x
S
D
x
R
G
 
G
G
|
G
R
 
-
V
 
-
S
|
S
N
 
R
W
 
W
M
 
I
N
 
H
-
 
T
E
 
E
V
 
L
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
A
W
 
T
L
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
R
P
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
H
F
 
F
C
 
K
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
D
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
K
P
 
R
L
 
Y
V
 
V
L
 
F
F
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
V
 
V
F
 
I
S
 
A
I
 
M
L
 
A
K
 
D
S
 
Q
V
 
V
L
 
-
H
 
K
S
 
A
S
 
A
R
 
G
R
 
G
P
 
D
I
 
Y
K
 
E
L
 
I
I
 
H
Y
 
Y
A
 
A
N
 
G
R
 
R
D
 
S
E
 
R
A
 
T
S
 
S
V
 
M
I
 
A
F
 
F
K
 
L
D
 
D
E
 
R
L
 
L
C
 
A
Q
 
R
L
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
D
Q
 
H
L
 
G
H
 
E
V
 
S
V
 
V
H
 
R
V
 
V
L
 
Y
D
 
P
S
 
G
V
 
D
Q
 
E
G
 
G
F
 
V
L
 
R
T
 
M
D
 
D
H
 
L
Q
 
P
V
 
S
R
 
L
H
 
-
L
 
F
L
 
A
R
 
D
G
 
P
S
 
E
A
 
D
G
 
G
G
 
T
D
 
Q
Y
 
V
F
 
Y
I
 
S
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
-
P
 
-
F
 
-
M
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
R
T
 
L
L
 
L
L
 
S
A
 
A
V
 
L
G
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
T
-
 
A
-
 
H
-
 
W
-
 
P
-
 
D
E
 
D
R
 
T
I
 
L
H
 
H
V
 
V
E
|
E
R
 
H
F
|
F
V
 
S
S
 
S
P
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
E
E
 
L
A
 
D
V
 
P
A
 
S
R
 
K
A
 
E
A
 
H
A
 
G
M
 
F
D
 
D
S
 
-
Q
 
-
C
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
V
 
V
E
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
D
Q
 
S
Q
 
G
H
 
I
E
 
T
I
 
V
A
 
P
C
 
V
K
 
A
P
 
A
G
 
D
D
 
Q
T
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
C
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
I
D
 
D
V
 
A
P
 
Q
S
 
S
S
 
D
C
|
C
E
|
E
E
 
E
G
|
G
F
x
I
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
M
 
E
C
 
V
V
 
P
V
 
V
R
 
L
E
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
D
L
 
-
A
 
H
R
 
R
N
 
D
D
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
K
K
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
A
D
 
A
G
 
G
W
 
K
T
 
T
-
 
M
L
 
M
A
 
T
C
|
C
Q
 
C
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
C
G
 
G
A
 
D
R
 
K
V
 
L
R
 
T
L
 
L
K
 
Q
F
 
L

Sites not aligning to the query:

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
31% identity, 55% coverage: 49:245/360 of query aligns to 34:235/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
Y
 
Y
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
L
 
I
S
 
G
F
 
I
R
 
E
V
 
V
P
 
T
F
 
P
A
 
E
G
 
G
K
 
S
L
 
D
L
 
Y
-
 
R
-
 
E
T
 
I
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
S
S
 
H
S
 
A
P
 
S
L
 
N
A
 
G
D
 
R
A
 
E
L
 
Y
P
 
-
K
 
R
V
 
I
T
x
S
V
|
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
D
D
x
N
G
 
P
G
|
G
R
x
L
V
|
V
S
|
S
N
 
H
W
 
Y
M
 
L
-
 
H
N
 
N
E
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
S
L
 
V
E
 
K
V
 
L
L
 
Y
P
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
H
 
D
F
 
F
C
 
F
L
 
Y
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
D
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
R
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
S
G
 
A
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
A
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
Q
S
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
H
S
 
T
V
 
L
L
 
A
H
 
K
S
 
Q
S
 
N
R
 
K
R
 
S
P
 
G
I
 
V
K
 
T
L
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
N
 
C
R
 
N
D
 
S
E
 
A
A
 
K
S
 
E
V
 
H
I
 
T
F
 
F
K
 
A
D
 
Q
E
 
E
L
 
T
C
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
Q
H
 
Q
P
 
G
D
 
W
Q
 
M
L
 
Q
H
 
Q
V
 
V
V
 
W
H
 
Y
V
 
R
L
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
A
Q
 
D
G
 
D
F
 
V
L
 
L
T
 
Q
-
 
G
D
 
E
H
 
M
Q
 
Q
V
 
L
R
 
A
H
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
L
G
 
P
S
 
I
A
 
E
G
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
F
 
Y
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
I
P
 
G
F
 
F
M
 
M
D
 
Q
T
 
Y
V
 
V
E
 
V
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
V
A
 
D
A
 
K
E
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
|
E
R
 
V
F
|
F

2piaA Phthalate dioxygenase reductase: a modular structure for electron transfer from pyridine nucleotides to [2fe-2s] (see paper)
26% identity, 86% coverage: 49:356/360 of query aligns to 39:319/321 of 2piaA

query
sites
2piaA
Y
 
F
K
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
A
F
x
N
L
 
L
S
 
T
F
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
N
A
 
G
G
 
S
K
 
R
L
 
-
L
 
-
T
 
-
R
|
R
C
x
T
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
C
S
 
N
S
 
D
P
 
S
L
 
Q
A
 
E
D
 
R
A
 
N
L
 
R
P
 
Y
K
 
V
V
 
I
T
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
V
 
D
D
 
S
G
 
N
G
|
G
R
|
R
V
 
G
S
x
G
N
x
S
-
 
I
-
 
S
W
 
F
M
 
I
N
 
D
E
 
D
V
 
T
Q
 
S
V
 
E
G
 
G
D
 
D
W
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
S
P
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
E
F
 
F
C
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
D
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
K
P
 
S
L
 
F
V
 
I
L
 
L
F
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
L
S
 
S
I
 
M
L
 
A
K
 
R
S
 
Q
V
 
L
L
 
R
H
 
A
S
 
E
S
 
G
R
 
L
R
 
R
P
 
S
I
 
F
K
 
R
L
 
L
I
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
N
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
P
A
 
E
S
 
G
V
 
T
I
 
A
F
 
F
K
 
F
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
W
-
 
R
Q
 
S
L
 
D
I
 
V
K
 
K
A
 
I
H
 
H
P
 
H
D
 
D
Q
 
H
L
 
G
H
 
D
V
 
P
V
 
T
H
 
K
V
 
A
L
 
F
D
 
D
S
 
F
V
 
W
Q
 
S
G
 
V
F
 
F
L
 
E
T
 
K
D
 
S
H
 
K
Q
 
P
V
 
A
R
 
Q
H
 
H
L
 
V
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
F
 
Y
I
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
P
 
A
F
 
L
M
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
-
R
 
R
T
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
G
V
 
H
G
 
W
E
 
P
A
 
S
A
 
G
E
 
T
R
 
-
I
 
V
H
 
H
V
 
F
E
|
E
R
 
S
F
|
F
V
 
-
S
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
G
V
 
A
A
 
T
R
 
N
A
 
T
A
 
N
A
 
A
M
 
R
D
 
E
S
 
N
Q
 
T
C
 
P
E
 
F
A
 
T
L
 
V
I
 
R
V
 
L
E
 
S
L
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
T
Q
 
S
H
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
P
C
 
A
K
 
N
P
 
-
G
 
-
D
 
R
T
 
S
L
 
I
L
 
L
Q
 
E
S
 
V
C
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
A
G
 
N
L
 
V
D
 
R
V
 
V
P
 
P
S
|
S
S
 
S
C
|
C
E
|
E
E
 
S
G
|
G
F
 
T
C
|
C
G
|
G
A
 
S
C
|
C
M
 
K
C
 
T
V
 
A
V
 
L
R
 
C
E
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
Q
 
D
L
 
-
A
 
H
R
 
R
N
 
D
D
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
R
P
 
D
K
 
D
E
 
E
L
 
K
A
 
G
D
 
T
G
 
Q
W
 
-
T
 
I
L
 
M
A
 
V
C
|
C
Q
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
G
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
L

P33164 Phthalate dioxygenase reductase; PDR; EC 1.-.-.- from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see paper)
25% identity, 86% coverage: 49:356/360 of query aligns to 40:320/322 of P33164

query
sites
P33164
Y
 
F
K
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
A
F
 
N
L
 
L
S
 
T
F
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
N
A
 
G
G
 
S
K
 
R
L
 
-
L
 
-
T
 
-
R
|
R
C
x
T
Y
 
Y
S
 
S
M
 
L
A
 
C
S
 
N
S
 
D
P
 
S
L
 
Q
A
 
E
D
 
R
A
 
N
L
 
R
P
 
Y
K
 
V
V
 
I
T
x
A
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
 
D
D
 
S
G
 
N
G
 
G
R
|
R
V
x
G
S
x
G
N
x
S
-
 
I
-
 
S
W
 
F
M
 
I
N
 
D
E
 
D
V
 
T
Q
 
S
V
 
E
G
 
G
D
 
D
W
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
S
P
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
N
H
 
E
F
 
F
C
 
P
L
 
L
D
 
D
P
 
K
Q
 
R
A
 
A
D
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
K
P
 
S
L
 
F
V
 
I
L
 
L
F
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
L
S
 
S
I
 
M
L
 
A
K
 
R
S
 
Q
V
 
L
L
 
R
H
 
A
S
 
E
S
 
G
R
 
L
R
 
R
P
 
S
I
 
F
K
 
R
L
 
L
I
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
N
 
T
R
 
R
D
 
D
E
 
P
A
 
E
S
 
G
V
 
T
I
 
A
F
 
F
K
 
F
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
W
-
 
R
Q
 
S
L
 
D
I
 
V
K
 
K
A
 
I
H
 
H
P
 
H
D
 
D
Q
 
H
L
 
G
H
 
D
V
 
P
V
 
T
H
 
K
V
 
A
L
 
F
D
 
D
S
 
F
V
 
W
Q
 
S
G
 
V
F
 
F
L
 
E
T
 
K
D
 
S
H
 
K
Q
 
P
V
 
A
R
 
Q
H
 
H
L
 
V
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
F
 
Y
I
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
Q
P
 
A
F
 
L
M
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
-
R
 
R
T
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
G
V
 
H
G
 
W
E
 
P
A
 
S
A
 
G
E
 
T
R
 
-
I
 
V
H
 
H
V
 
F
E
 
E
R
 
S
F
|
F
V
 
-
S
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
G
V
 
A
A
 
T
R
 
N
A
 
T
A
 
N
A
 
A
M
 
R
D
 
E
S
 
N
Q
 
T
C
 
P
E
 
F
A
 
T
L
 
V
I
 
R
V
 
L
E
 
S
L
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
T
Q
 
S
H
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
P
C
 
A
K
 
N
P
 
-
G
 
-
D
 
R
T
 
S
L
 
I
L
 
L
Q
 
E
S
 
V
C
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
A
G
 
N
L
 
V
D
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
S
C
|
C
E
 
E
E
x
S
G
 
G
F
 
T
C
|
C
G
 
G
A
 
S
C
|
C
M
 
K
C
 
T
V
 
A
V
 
L
R
 
C
E
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
Q
 
D
L
 
-
A
 
-
R
 
H
N
 
R
D
 
D
V
 
M
L
 
V
T
 
L
P
 
R
K
 
D
E
 
D
L
 
E
A
 
K
D
 
G
G
 
T
W
 
Q
T
 
I
L
 
M
A
 
V
C
|
C
Q
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
G
 
S
A
 
A
R
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
L

5ylyB Crystal structure of the cytochrome b5 reductase domain of ulva prolifera nitrate reductase (see paper)
32% identity, 37% coverage: 90:223/360 of query aligns to 96:247/269 of 5ylyB

query
sites
5ylyB
D
 
E
G
|
G
G
|
G
R
x
K
V
x
F
S
|
S
N
 
Q
W
 
I
M
 
L
N
 
E
E
 
A
V
 
L
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
T
L
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
I
G
 
G
H
 
H
F
 
F
C
 
H
L
 
Y
D
 
D
P
 
R
Q
 
P
A
 
G
D
 
H
T
 
Y
E
 
K
-
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
V
K
 
K
P
 
R
L
 
I
V
 
N
L
 
M
F
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
A
V
 
I
L
 
L
H
 
S
-
 
N
-
 
P
S
 
S
S
 
D
R
 
L
R
 
T
P
 
E
I
 
I
K
 
R
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
R
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
D
 
P
E
 
E
L
 
L
C
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
A
K
 
K
A
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
H
 
K
V
 
I
V
 
H
H
 
Y
V
 
T
L
 
V
D
 
D
S
 
R
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
Y
V
 
S
Q
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
T
 
D
-
 
L
D
 
D
H
 
M
Q
 
C
V
 
E
R
 
R
H
 
A
L
 
L
L
 
F
R
 
R
G
 
Y
S
 
E
A
 
P
G
 
G
G
 
T
D
 
I
Y
 
S
F
 
V
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
F
 
M
M
 
L

Sites not aligning to the query:

1cnfA Structural studies on corn nitrate reductase: refined structure of the cytochrome b reductase fragment at 2.5 angstroms, its adp complex and an active site mutant and modeling of the cytochrome b domain (see paper)
30% identity, 45% coverage: 63:223/360 of query aligns to 47:238/260 of 1cnfA

query
sites
1cnfA
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
C
T
 
M
R
|
R
C
x
A
Y
|
Y
S
x
T
M
 
P
A
 
T
S
 
S
S
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
I
P
 
G
L
 
H
A
 
F
D
 
D
A
 
L
L
|
L
P
 
V
K
|
K
V
 
V
T
x
Y
V
 
F
K
 
K
R
 
N
V
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
x
F
-
 
P
D
 
N
G
|
G
G
|
G
R
x
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
W
 
Y
M
 
L
N
 
D
E
 
S
V
 
L
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
S
W
 
Y
L
 
I
E
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
L
G
 
G
H
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
F
 
F
C
 
V
L
 
I
D
 
N
P
 
G
Q
 
K
A
 
Q
D
 
R
T
 
N
E
 
A
K
 
R
P
 
R
L
 
L
V
 
A
L
 
M
F
 
I
G
 
C
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
|
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
R
S
 
D
S
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
R
 
H
R
 
T
P
 
E
I
 
M
K
 
H
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
|
N
R
 
R
D
 
T
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
D
Q
 
R
L
 
W
I
 
A
K
 
A
A
 
E
H
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
H
 
K
V
 
V
V
 
W
H
 
Y
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
Q
V
 
V
Q
 
K
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
V
T
 
T
D
 
E
H
 
A
Q
 
V
V
 
L
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
V
L
 
P
R
 
E
G
 
G
S
 
G
A
 
D
G
 
D
G
 
T
D
 
L
Y
 
A
F
 
L
I
 
A
C
|
C
G
 
G
P
|
P
G
 
P
P
|
P
F
x
M
M
 
I

Sites not aligning to the query:

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
28% identity, 65% coverage: 13:246/360 of query aligns to 95:330/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
H
 
H
T
 
P
T
 
L
A
 
R
S
 
D
V
 
L
S
 
T
L
 
A
Q
 
T
V
 
V
C
 
L
A
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
D
E
 
I
T
 
A
L
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
R
S
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
L
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
E
R
 
P
F
 
L
R
 
A
Y
 
F
K
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
L
 
V
S
 
E
F
 
L
R
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
-
L
 
-
T
 
R
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
A
S
 
N
S
 
T
P
 
A
L
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
V
P
 
L
K
 
E
V
 
L
T
x
H
V
|
V
K
 
R
R
 
R
V
|
V
D
 
P
G
 
G
G
|
G
R
x
V
V
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
W
 
W
M
 
L
-
 
F
N
 
D
E
 
G
V
 
L
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
R
L
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
T
P
 
G
P
 
P
A
 
L
G
 
G
H
 
D
F
 
F
C
 
H
L
 
L
D
 
P
P
 
P
-
 
P
Q
 
D
A
 
E
D
 
D
T
 
D
E
 
G
K
 
G
P
 
P
L
 
M
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
V
 
L
F
 
V
S
 
G
I
 
I
L
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
S
R
 
R
R
 
E
P
 
-
I
 
V
K
 
L
L
 
L
I
 
Y
Y
 
H
A
 
G
N
 
V
R
 
R
D
 
G
E
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
L
I
 
Y
F
 
D
K
 
L
D
 
G
E
 
R
L
 
F
C
 
A
Q
 
E
L
 
I
I
 
A
K
 
E
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
G
Q
 
F
L
 
R
H
 
F
V
 
V
V
 
P
H
 
V
V
 
L
L
 
S
D
 
D
S
 
E
V
 
P
Q
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
P
T
 
T
D
 
D
H
 
A
Q
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
D
L
 
V
L
 
P
R
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
-
G
 
G
G
 
W
D
 
S
Y
 
G
F
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
A
F
 
M
M
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
G
E
 
V
R
 
K
T
 
A
L
 
F
L
 
K
A
 
R
V
 
R
G
 
R
E
 
M
A
 
S
A
 
P
E
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
R
E
 
E
R
 
K
F
|
F
V
 
T

Sites not aligning to the query:

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
28% identity, 65% coverage: 13:246/360 of query aligns to 96:331/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
H
 
H
T
 
P
T
 
L
A
 
R
S
 
D
V
 
L
S
 
T
L
 
A
Q
 
T
V
 
V
C
 
L
A
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
D
E
 
I
T
 
A
L
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
R
S
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
L
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
G
L
 
L
R
 
A
E
 
E
R
 
P
F
 
L
R
 
A
Y
 
F
K
 
E
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
V
S
 
E
F
 
L
R
 
V
V
 
V
P
 
P
F
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
A
L
 
-
L
 
-
T
 
R
R
|
R
C
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
M
 
L
A
 
A
S
 
N
S
 
T
P
 
A
L
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
V
P
 
L
K
 
E
V
 
L
T
x
H
V
|
V
K
x
R
R
 
R
V
 
V
D
 
P
G
 
G
G
 
G
R
x
V
V
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
W
 
W
M
 
L
-
 
F
N
 
D
E
 
G
V
 
L
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
R
L
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
T
P
 
G
P
 
P
A
 
L
G
 
G
H
 
D
F
 
F
C
 
H
L
 
L
D
 
P
P
 
P
-
 
P
Q
 
D
A
 
E
D
 
D
T
 
D
E
 
G
K
 
G
P
 
P
L
 
M
V
 
V
L
 
L
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
V
 
L
F
 
V
S
 
G
I
 
I
L
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
S
R
 
R
R
 
E
P
 
-
I
 
V
K
 
L
L
 
L
I
 
Y
Y
 
H
A
 
G
N
 
V
R
 
R
D
 
G
E
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
L
I
 
Y
F
 
D
K
 
L
D
 
G
E
 
R
L
 
F
C
 
A
Q
 
E
L
 
I
I
 
A
K
 
E
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
G
Q
 
F
L
 
R
H
 
F
V
 
V
V
 
P
H
 
V
V
 
L
L
 
S
D
 
D
S
 
E
V
 
P
Q
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
P
T
 
T
D
 
D
H
 
A
Q
 
F
V
 
V
R
 
E
H
 
D
L
 
V
L
 
P
R
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
-
G
 
G
G
 
W
D
 
S
Y
 
G
F
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
A
F
 
M
M
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
G
E
 
V
R
 
K
T
 
A
L
 
F
L
 
K
A
 
R
V
 
R
G
 
R
E
 
M
A
 
S
A
 
P
E
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
V
 
R
E
 
E
R
 
K
F
|
F
V
 
T

Sites not aligning to the query:

A0A286R227 Nitrate reductase [NADH]; NR; EC 1.7.1.1 from Ulva prolifera (Green seaweed) (Enteromorpha prolifera) (see paper)
32% identity, 37% coverage: 90:223/360 of query aligns to 690:841/863 of A0A286R227

query
sites
A0A286R227
D
 
E
G
 
G
G
 
G
R
x
K
V
x
F
S
|
S
N
 
Q
W
 
I
M
 
L
N
 
E
E
 
A
V
 
L
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
T
L
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
I
G
 
G
H
 
H
F
 
F
C
 
H
L
 
Y
D
 
D
P
 
R
Q
 
P
A
 
G
D
 
H
T
 
Y
E
 
K
-
 
N
-
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
V
K
 
K
P
 
R
L
 
I
V
 
N
L
 
M
F
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
V
L
 
M
K
 
K
S
 
A
V
 
I
L
 
L
H
 
S
-
 
N
-
 
P
S
 
S
S
 
D
R
 
L
R
 
T
P
 
E
I
 
I
K
 
R
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
R
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
D
 
P
E
 
E
L
 
L
C
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
A
K
 
K
A
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
H
 
K
V
 
I
V
 
H
H
 
Y
V
 
T
L
 
V
D
 
D
S
 
R
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
Y
V
 
S
Q
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
T
 
D
-
 
L
D
 
D
H
 
M
Q
 
C
V
 
E
R
 
R
H
 
A
L
 
L
L
 
F
R
 
R
G
 
Y
S
 
E
A
 
P
G
 
G
G
 
T
D
 
I
Y
 
S
F
 
V
I
 
L
C
|
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
F
 
M
M
 
L

Sites not aligning to the query:

P17571 Nitrate reductase [NADH] 1; NR; EC 1.7.1.1 from Zea mays (Maize) (see 3 papers)
30% identity, 45% coverage: 63:223/360 of query aligns to 408:599/621 of P17571

query
sites
P17571
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
C
T
 
M
R
|
R
C
x
A
Y
|
Y
S
x
T
M
 
P
A
 
T
S
 
S
S
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
I
P
 
G
L
 
H
A
 
F
D
 
D
A
 
L
L
|
L
P
x
V
K
|
K
V
 
V
T
 
Y
V
x
F
K
 
K
R
 
N
V
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
P
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
x
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
W
 
Y
M
 
L
N
 
D
E
 
S
V
 
L
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
S
W
 
Y
L
 
I
E
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
L
G
 
G
H
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
F
 
F
C
 
V
L
 
I
D
 
N
P
 
G
Q
 
K
A
 
Q
D
 
R
T
 
H
E
 
A
K
 
S
P
 
R
L
 
L
V
 
A
L
 
M
F
 
I
G
 
C
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
R
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
S
 
E
S
 
D
R
 
H
R
 
T
P
 
E
I
 
M
K
 
H
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
R
 
R
D
 
T
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
D
Q
 
R
L
 
W
I
 
A
K
 
A
A
 
E
H
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
H
 
K
V
 
V
V
 
W
H
 
Y
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
Q
V
 
V
Q
 
K
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
V
T
 
T
D
 
E
H
 
A
Q
 
V
V
 
L
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
V
L
 
P
R
 
E
G
 
G
S
 
G
A
 
D
G
 
D
G
 
T
D
 
L
Y
 
A
F
 
L
I
 
A
C
|
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
F
 
M
M
 
I

1cneA Structural studies on corn nitrate reductase: refined structure of the cytochrome b reductase fragment at 2.5 angstroms, its adp complex and an active site mutant and modeling of the cytochrome b domain (see paper)
29% identity, 45% coverage: 63:223/360 of query aligns to 47:238/260 of 1cneA

query
sites
1cneA
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
C
T
 
M
R
|
R
C
x
A
Y
|
Y
S
x
T
M
 
P
A
 
T
S
 
S
S
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
I
P
 
G
L
 
H
A
 
F
D
 
D
A
 
L
L
|
L
P
x
V
K
 
K
V
 
V
T
x
Y
V
 
F
K
 
K
R
 
N
V
 
E
-
x
H
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
P
D
 
N
G
|
G
G
 
G
R
 
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
W
 
Y
M
 
L
N
 
D
E
 
S
V
 
L
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
S
W
 
Y
L
 
I
E
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
L
G
 
G
H
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
F
 
F
C
 
V
L
 
I
D
 
N
P
 
G
Q
 
K
A
 
Q
D
 
R
T
 
N
E
 
A
K
 
R
P
 
R
L
 
L
V
 
A
L
 
M
F
 
I
G
 
C
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
R
S
 
D
S
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
R
 
H
R
 
T
P
 
E
I
 
M
K
 
H
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
R
 
R
D
 
T
E
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
L
C
 
D
Q
 
R
L
 
W
I
 
A
K
 
A
A
 
E
H
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
H
 
K
V
 
V
V
 
W
H
 
Y
V
 
V
L
 
I
D
 
D
S
 
Q
V
 
V
Q
 
K
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
V
T
 
T
D
 
E
H
 
A
Q
 
V
V
 
L
R
 
R
-
 
E
H
 
H
L
 
V
L
 
P
R
 
E
G
 
G
S
 
G
A
 
D
G
 
D
G
 
T
D
 
L
Y
 
A
F
 
L
I
 
A
C
x
S
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
F
 
M
M
 
I

Sites not aligning to the query:

7ylrA Structure of a bacteria protein
30% identity, 75% coverage: 87:356/360 of query aligns to 82:325/326 of 7ylrA

query
sites
7ylrA
K
 
K
R
 
E
V
 
A
D
 
E
G
|
G
G
x
R
R
 
G
V
x
G
S
|
S
N
 
R
W
 
F
M
 
M
N
 
H
E
 
E
-
 
G
V
 
L
Q
 
N
V
 
E
G
 
G
D
 
D
W
 
T
L
 
L
E
 
A
V
 
I
L
 
E
P
 
A
P
 
P
A
 
K
G
 
N
H
 
D
F
 
F
C
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
Q
 
L
A
 
H
D
 
T
T
 
G
E
 
P
K
 
G
P
 
G
L
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
I
 
V
T
|
T
P
 
P
V
 
L
F
 
-
S
 
A
I
 
T
L
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
R
L
 
R
H
 
R
S
 
A
S
 
E
R
 
G
R
 
A
P
 
P
I
 
V
K
 
R
L
 
M
I
 
H
Y
 
Y
A
 
A
N
 
G
R
 
R
D
 
S
E
 
R
A
 
E
S
 
L
V
 
M
I
 
A
F
 
F
K
 
L
D
 
P
E
 
E
L
 
L
C
 
Q
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
G
A
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
H
 
R
V
 
V
V
 
-
H
 
H
V
 
A
L
 
-
D
 
D
S
 
A
V
 
E
Q
 
A
G
 
G
F
 
A
L
 
P
T
 
L
D
 
D
H
 
-
Q
 
-
V
 
I
R
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
G
 
G
S
 
V
A
 
P
G
 
A
G
 
G
D
 
D
-
 
R
Y
 
L
F
 
Y
I
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
K
P
 
V
F
 
M
M
 
L
D
 
D
T
 
A
V
 
V
E
 
L
R
 
A
T
 
R
L
 
T
L
 
Q
A
 
A
V
 
R
G
 
G
E
 
W
A
 
E
A
 
H
E
 
D
R
 
R
I
 
V
H
 
H
V
 
F
E
|
E
R
 
L
F
|
F
V
 
T
S
x
E
P
 
P
P
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
G
D
 
D
S
 
Q
Q
 
P
C
 
F
E
 
E
A
 
-
L
 
-
I
 
-
V
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
A
G
 
Q
Q
 
S
Q
 
G
H
 
Q
E
 
R
I
 
F
A
 
T
C
 
V
K
 
P
P
 
A
G
 
G
D
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
Q
 
D
S
 
C
C
 
L
K
 
I
A
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
C
D
 
D
V
 
P
P
 
M
S
 
F
S
 
D
C
|
C
E
x
K
E
x
R
G
|
G
F
 
E
C
|
C
G
|
G
A
 
V
C
|
C
M
 
A
C
 
V
V
 
P
V
 
V
R
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Q
 
D
L
 
-
A
 
H
R
 
R
N
 
D
D
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
W
 
N
T
 
V
L
 
M
A
 
Q
-
 
I
C
|
C
Q
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
A
T
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
R
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9ZNT1 NADH--cytochrome b5 reductase 1; EC 1.6.2.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 43% coverage: 83:238/360 of query aligns to 113:276/281 of Q9ZNT1

query
sites
Q9ZNT1
K
 
E
V
 
L
T
 
V
V
 
I
K
 
K
R
 
M
V
 
Y
D
 
P
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
M
S
 
S
N
 
H
W
 
H
M
 
F
N
 
R
E
 
E
V
 
M
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
W
 
H
L
 
L
E
 
A
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
H
 
R
F
 
F
C
 
K
L
 
Y
D
 
Q
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
D
 
G
T
 
Q
E
 
F
K
 
R
P
 
A
L
 
F
V
 
G
L
 
M
F
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
M
F
 
F
S
 
Q
I
 
V
L
 
A
K
 
R
S
 
A
V
 
I
L
 
L
H
 
E
-
 
N
-
 
P
S
 
T
S
 
D
R
 
K
R
 
T
P
 
K
I
 
V
K
 
H
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
R
 
V
D
 
T
E
 
Y
A
 
D
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
L
C
 
E
Q
 
G
L
 
L
I
 
T
K
 
T
A
 
N
H
 
Y
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
L
 
F
H
 
K
V
 
I
V
 
F
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
W
D
 
D
S
 
G
V
 
G
Q
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
V
T
 
S
D
 
K
H
 
E
Q
 
M
V
 
I
R
 
Q
-
 
T
H
 
H
L
 
C
L
 
P
R
 
A
G
 
P
S
 
A
A
 
S
G
 
D
G
 
I
D
 
Q
Y
 
I
F
 
L
I
 
R
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
P
F
 
M
M
 
N
D
 
K
T
 
A
V
 
M
E
 
A
R
 
A
T
 
N
L
 
L
L
 
E
A
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
Y
A
 
S
A
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7romA Crystal structure of saccharomyces cerevisiae nadh-cytochrome b5 reductase 1 (cbr1) fragment (residues 28-284) bound to fad
26% identity, 51% coverage: 52:234/360 of query aligns to 45:238/255 of 7romA

query
sites
7romA
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
L
 
I
S
 
V
F
 
I
R
 
K
V
 
A
P
 
N
F
 
I
A
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
D
L
 
I
T
 
T
R
|
R
C
x
S
Y
|
Y
S
x
T
M
 
P
A
 
T
S
 
S
S
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
D
P
 
T
K
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
E
V
 
L
T
x
L
V
|
V
K
 
K
R
 
S
V
x
Y
D
 
P
G
x
T
G
|
G
R
x
N
V
|
V
S
|
S
N
 
K
W
 
M
M
 
I
N
 
G
E
 
E
V
 
L
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
D
W
 
S
L
 
I
E
 
Q
V
 
I
L
 
K
P
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
G
H
 
N
F
 
Y
C
 
H
L
 
Y
D
 
E
P
 
R
Q
 
N
A
 
C
D
 
R
T
 
S
E
 
H
K
 
-
P
 
-
L
 
L
V
 
G
L
 
M
F
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
I
T
x
A
P
 
P
V
 
M
F
 
Y
S
 
Q
I
 
I
L
 
M
K
 
K
S
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
P
H
 
H
S
 
D
S
 
T
R
 
T
R
 
K
P
 
-
I
 
V
K
 
S
L
 
L
I
 
V
Y
 
F
A
 
G
N
 
N
R
 
V
D
 
H
E
 
E
A
 
E
S
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
K
D
 
K
E
 
E
L
 
L
C
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
A
A
 
M
H
 
K
P
 
P
D
 
S
Q
 
Q
L
 
F
H
 
K
V
 
I
V
 
V
H
 
Y
V
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
S
V
 
P
Q
 
D
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
V
G
 
G
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
D
 
K
H
 
D
Q
 
V
V
 
I
R
 
K
H
 
E
L
 
H
L
 
L
R
 
P
G
 
A
S
 
A
A
 
T
G
 
M
G
 
D
D
 
N
-
 
V
-
 
Q
Y
 
I
F
 
L
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
P
P
 
A
F
 
M
M
 
V
D
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
R
R
 
R
T
 
S
L
 
T
L
 
V
A
 
D
V
 
L
G
 
G

Query Sequence

>PfGW456L13_2523 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2523
MGTQQQNLTPAEHTTASVSLQVCAVIDETLDARSLVLDVPPALRERFRYKPGQFLSFRVP
FAGKLLTRCYSMASSPLADALPKVTVKRVDGGRVSNWMNEVQVGDWLEVLPPAGHFCLDP
QADTEKPLVLFGGGSGITPVFSILKSVLHSSRRPIKLIYANRDEASVIFKDELCQLIKAH
PDQLHVVHVLDSVQGFLTDHQVRHLLRGSAGGDYFICGPGPFMDTVERTLLAVGEAAERI
HVERFVSPPDPDELLAEEAVARAAAMDSQCEALIVELDGQQHEIACKPGDTLLQSCKAAG
LDVPSSCEEGFCGACMCVVREGEVQLARNDVLTPKELADGWTLACQSRPTGARVRLKFPD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory