SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2536 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2536 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

I6YCA3 Acyl-CoA dehydrogenase FadE26; ACAD; 3-oxocholest-4-en-26-oyl-CoA dehydrogenase alpha subunit; EC 1.3.99.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:388/388 of query aligns to 1:398/400 of I6YCA3

query
sites
I6YCA3
M
 
M
D
 
R
L
 
I
T
 
S
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
E
F
 
L
R
 
R
F
 
R
D
 
E
A
 
L
R
 
R
T
 
S
W
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
N
 
L
V
 
M
P
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
R
S
 
R
E
 
E
P
 
A
L
 
L
Q
 
S
S
 
S
F
 
V
D
 
Q
T
 
G
E
 
E
Q
 
Y
G
 
G
F
 
V
A
 
G
E
 
N
-
 
V
H
 
Y
R
 
R
A
 
E
W
 
T
E
 
I
A
 
A
K
 
Q
L
 
M
N
 
G
E
 
R
G
 
D
R
 
G
W
 
W
G
 
L
M
 
A
V
 
L
T
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
R
D
 
S
L
 
A
I
 
M
E
 
D
W
 
Q
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
T
E
 
D
E
 
E
Y
 
A
Y
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
-
R
 
-
V
 
V
N
 
P
Q
 
F
N
 
L
G
 
T
I
 
I
F
 
N
L
 
S
L
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
M
 
M
E
 
A
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
D
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
R
R
 
F
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
I
A
 
A
T
 
A
G
 
G
E
 
D
D
 
L
I
 
H
W
 
F
A
 
S
Q
x
I
A
x
G
W
x
Y
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
N
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
M
W
 
W
S
 
T
T
x
S
R
 
L
A
 
I
V
 
Q
W
 
Y
A
 
A
D
 
D
W
 
Y
A
 
V
F
 
W
G
 
L
I
 
A
F
 
V
R
 
R
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
K
R
 
K
H
 
H
H
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
V
I
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
T
N
 
T
T
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
F
T
 
S
V
 
W
R
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
H
Q
 
T
L
 
M
N
 
A
G
 
G
L
 
-
P
 
P
G
 
D
F
 
T
A
 
S
E
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
Y
D
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
N
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
G
G
 
E
E
 
E
G
 
N
M
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
V
 
L
A
 
V
M
 
T
S
 
N
T
 
Q
A
 
L
G
 
N
F
 
H
E
|
E
R
 
R
G
 
-
L
 
V
L
 
A
L
 
L
R
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
A
R
 
P
F
 
I
Q
 
F
E
 
-
T
 
G
A
 
C
K
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
L
 
E
Y
 
W
L
 
A
A
 
Q
N
 
N
R
 
T
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
D
 
G
R
 
G
D
 
T
P
 
R
A
 
L
I
 
I
G
 
D
E
 
S
A
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
V
 
L
M
 
A
R
 
R
A
 
V
W
 
H
L
 
A
D
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
V
Y
 
L
T
 
K
L
 
L
G
 
I
T
 
N
Y
 
W
M
 
E
T
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
S
L
 
Q
V
 
S
Q
 
G
G
 
P
G
 
K
K
 
D
I
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
A
E
 
D
S
 
A
S
 
S
T
 
A
N
 
A
K
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
D
 
A
Q
 
T
R
 
E
M
 
A
H
 
Y
D
 
R
T
 
L
A
 
L
M
 
M
S
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
T
R
 
A
G
 
A
E
 
T
L
 
L
L
 
R
P
 
Q
Q
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
R
G
 
G
D
 
R
V
 
V
G
 
E
H
 
R
W
 
M
L
 
H
E
 
R
G
 
A
F
 
C
L
 
L
F
 
I
A
 
L
Q
 
T
A
 
F
G
 
G
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
 
G
G
 
G
T
|
T
N
|
N
E
|
E
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
N
 
D
I
 
I
I
 
I
A
 
G
E
 
M
R
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A

4x28A Crystal structure of the chse4-chse5 complex from mycobacterium tuberculosis (see paper)
32% identity, 100% coverage: 1:388/388 of query aligns to 1:385/386 of 4x28A

query
sites
4x28A
M
 
M
D
 
R
L
 
I
T
 
S
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
E
F
 
L
R
 
R
F
 
R
D
 
E
A
 
L
R
 
R
T
 
S
W
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
T
N
 
L
V
 
M
P
 
T
S
 
P
E
 
E
P
 
R
L
 
R
Q
 
E
S
 
A
F
 
L
D
 
S
T
 
S
E
 
V
Q
 
N
G
 
V
F
 
Y
A
 
R
E
 
E
H
 
T
R
 
I
A
 
A
W
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
Q
L
 
M
N
 
G
E
 
R
G
 
D
R
 
G
W
 
W
G
 
L
M
 
A
V
 
L
T
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
R
D
 
S
L
 
A
I
 
M
E
 
D
W
 
Q
L
 
L
I
 
I
F
 
F
E
 
T
E
 
D
E
 
E
Y
 
A
Y
 
A
R
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
-
R
 
-
V
 
V
N
 
P
Q
 
F
N
 
L
G
 
T
I
 
I
F
 
N
L
 
S
L
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
M
 
M
E
 
A
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
D
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
R
R
 
F
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
I
A
 
A
T
 
A
G
 
G
E
 
D
D
 
L
I
 
H
W
 
F
A
 
S
Q
x
I
A
 
G
W
x
Y
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
N
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
M
W
|
W
S
 
T
T
x
S
R
 
L
A
 
I
V
 
Q
W
 
Y
A
 
A
D
 
D
W
 
Y
A
 
V
F
 
W
G
 
L
I
 
A
F
 
V
R
 
R
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
K
R
 
K
H
 
H
H
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
V
I
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
T
N
 
T
T
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
F
T
 
S
V
 
W
R
 
T
P
 
P
I
 
V
P
 
H
Q
 
T
L
 
M
N
 
A
G
 
G
L
 
-
P
 
P
G
 
D
F
 
T
A
 
S
E
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
Y
D
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
N
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
G
G
 
E
E
 
E
G
 
N
M
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
V
 
L
A
 
V
M
 
T
S
 
N
T
 
Q
A
 
L
G
 
N
F
 
H
E
|
E
R
 
R
G
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
S
S
 
P
P
 
A
A
 
P
R
 
I
F
 
F
Q
 
G
E
 
-
T
 
-
A
 
C
K
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
L
 
E
Y
 
W
L
 
A
A
 
Q
N
 
N
R
 
T
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
D
 
G
R
 
G
D
 
T
P
 
R
A
 
L
I
 
I
G
 
D
E
 
S
A
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
Q
-
 
L
-
 
N
V
 
L
M
 
A
R
 
R
A
 
V
W
 
H
L
 
A
D
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
V
Y
 
L
T
 
K
L
 
L
G
 
I
T
 
N
Y
 
W
M
 
E
T
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
S
G
 
Q
G
 
G
K
 
P
I
 
S
G
 
P
P
 
A
E
 
D
S
 
A
S
 
S
T
 
A
N
 
A
K
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
D
 
A
Q
 
T
R
 
E
M
 
A
H
 
Y
D
 
R
T
 
L
A
 
L
M
 
M
S
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
T
R
 
A
G
 
A
E
 
T
L
 
L
L
 
R
P
 
Q
Q
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
R
G
 
G
D
 
R
V
 
V
G
 
E
H
 
R
W
 
M
L
 
H
E
 
R
G
 
A
F
 
C
L
 
L
F
 
I
A
 
L
Q
 
T
A
x
F
G
 
G
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
x
G
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
x
V
Q
 
Q
R
 
R
N
 
D
I
 
I
I
 
I
A
 
G
E
x
M
R
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A

P96855 Acyl-CoA dehydrogenase FadE34; ACAD; 3-oxochol-4-en-24-oyl-CoA dehydrogenase; EC 1.3.99.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
33% identity, 85% coverage: 58:387/388 of query aligns to 398:711/711 of P96855

query
sites
P96855
W
 
W
P
 
P
T
 
A
E
 
P
L
 
Y
G
 
G
G
 
-
R
 
R
G
 
G
C
 
A
D
 
S
L
 
P
I
 
A
E
 
E
W
 
Q
L
 
L
I
 
L
F
 
I
E
 
D
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
A
A
 
A
R
 
K
V
 
V
N
 
E
Q
 
R
N
 
P
G
 
D
I
 
L
F
 
V
L
 
I
-
 
G
-
 
W
-
 
W
L
 
A
G
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
I
M
 
L
E
 
E
Y
 
H
G
 
G
S
 
T
E
 
P
E
 
E
Q
 
Q
K
 
I
A
 
E
R
 
R
F
 
F
L
 
V
P
 
P
R
 
A
M
 
T
A
 
M
T
 
R
G
 
G
E
 
E
D
 
F
I
 
L
W
 
W
A
 
C
Q
 
Q
A
 
L
W
 
F
S
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
K
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
A
G
 
D
D
 
G
H
 
G
Y
 
W
V
 
L
I
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
V
W
 
W
S
 
T
T
 
S
R
 
A
A
 
A
V
 
H
W
 
K
A
 
A
D
 
R
W
 
W
A
 
G
F
 
V
G
 
C
I
 
L
F
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
S
 
A
Q
 
P
R
 
K
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
F
 
Y
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
D
L
 
M
N
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
I
R
 
R
P
 
P
I
 
L
P
 
R
Q
 
E
L
 
I
N
 
T
G
 
G
L
 
D
P
 
S
G
 
L
F
 
F
A
 
N
E
 
E
I
 
V
F
 
F
F
 
L
D
 
D
D
 
N
V
 
V
K
 
F
V
 
V
P
 
P
V
 
D
E
 
E
N
 
M
A
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
A
E
 
V
G
 
N
M
 
D
G
 
G
W
 
W
H
 
R
V
 
L
A
 
A
M
 
R
S
 
T
T
 
T
A
 
L
G
 
A
F
 
N
E
|
E
R
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
T
G
 
G
L
 
T
L
 
A
L
 
L
R
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
-
R
 
-
F
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
L
A
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
L
V
 
G
Q
 
D
L
 
M
Y
 
E
L
 
L
A
 
-
N
 
D
R
 
V
E
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
D
 
D
R
 
R
D
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
L
M
 
G
R
 
R
A
 
L
W
 
I
L
 
L
D
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
Y
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
L
T
 
D
Y
 
R
M
 
R
T
 
I
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
V
 
V
Q
 
G
G
 
G
G
 
Q
K
 
D
I
 
P
G
 
G
P
 
A
E
 
Q
S
 
S
S
 
S
T
 
V
N
 
R
K
 
K
I
 
L
F
 
I
W
 
G
S
 
V
E
 
R
L
 
Y
D
 
R
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
H
 
A
D
 
E
T
 
Y
A
 
L
M
 
M
S
 
E
I
 
V
L
 
S
G
 
D
L
 
G
R
 
G
G
 
G
E
 
L
L
 
V
L
 
E
P
 
N
Q
 
R
A
 
A
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
V
E
 
Y
G
 
D
F
 
F
L
 
L
F
 
N
A
 
T
Q
 
R
A
 
C
G
 
L
P
 
T
I
 
I
Y
 
A
A
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
E
E
 
Q
I
 
I
Q
 
L
R
 
L
N
 
T
I
 
V
I
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
L
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6wy8B Tcur3481-tcur3483 steroid acad (see paper)
28% identity, 100% coverage: 1:388/388 of query aligns to 1:384/384 of 6wy8B

query
sites
6wy8B
M
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
R
Y
 
E
T
 
P
P
 
A
A
 
A
Q
 
L
Q
 
S
A
 
E
F
 
L
R
 
R
F
 
A
D
 
E
A
 
L
R
 
R
T
 
A
W
 
Y
L
 
F
A
 
N
A
 
G
N
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
A
E
 
D
P
 
E
L
 
R
Q
 
R
S
 
R
F
 
V
D
 
G
T
 
-
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
G
E
 
G
H
 
E
R
 
R
A
 
F
W
 
R
E
 
E
A
 
V
-
 
V
-
 
K
K
 
M
L
 
L
N
 
G
E
 
S
G
 
D
R
 
G
W
 
W
G
 
L
M
 
G
V
 
Y
T
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
R
D
 
S
L
 
I
I
 
S
E
 
E
W
 
Q
L
 
Y
I
 
V
F
 
L
E
 
F
E
 
D
E
 
E
Y
 
V
Y
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
L
P
 
P
-
 
F
-
 
P
-
 
F
A
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
N
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
V
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
L
M
 
M
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
K
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
G
M
 
I
A
 
L
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
I
I
 
V
W
 
F
A
 
A
Q
x
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
T
S
 
T
K
 
R
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
E
Y
 
F
V
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
T
 
I
W
x
F
S
 
T
T
x
S
R
 
G
A
 
A
V
 
N
W
 
T
A
 
A
D
 
D
W
 
Y
A
 
I
F
 
W
G
 
L
I
 
A
F
 
C
R
 
R
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
S
 
A
Q
 
P
R
 
K
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
I
I
 
I
L
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
T
N
 
D
T
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
F
T
 
S
V
 
W
R
 
S
P
 
P
I
 
I
P
 
Q
Q
 
T
L
 
V
N
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
 
-
F
 
V
A
 
T
E
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
Y
D
 
S
D
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
S
N
 
E
A
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
E
E
 
I
G
 
N
M
 
G
G
 
G
W
 
W
H
 
K
V
 
L
A
 
I
M
 
T
S
 
T
T
 
Q
A
 
L
G
 
N
F
 
H
E
|
E
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
L
L
 
A
R
 
A
S
 
L
P
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
M
Q
 
I
E
 
R
T
 
L
A
 
W
K
 
E
R
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
A
L
 
-
Y
 
-
L
 
W
A
 
A
N
 
R
R
 
D
E
 
N
Q
 
G
A
 
V
D
 
L
R
 
E
D
 
Q
P
 
P
A
 
W
I
 
V
G
 
R
E
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
A
R
 
R
A
 
T
W
 
Y
L
 
A
D
 
K
A
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
M
T
 
R
L
 
L
G
 
L
T
 
N
Y
 
W
M
 
K
T
 
M
A
 
T
S
 
I
Q
 
A
L
 
V
V
 
E
Q
 
N
G
 
D
G
 
E
K
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
A
E
 
D
S
 
A
S
 
G
T
 
A
N
 
T
K
 
K
I
 
A
F
 
Y
W
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
T
D
 
H
Q
 
I
R
 
D
M
 
V
H
 
Q
D
 
R
T
 
T
A
 
L
M
 
T
S
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
R
P
 
P
Q
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
V
D
 
L
V
 
A
G
 
G
H
 
Q
W
 
I
L
 
E
E
 
Q
G
 
L
F
 
S
L
 
R
F
 
Q
A
 
G
Q
 
I
A
x
V
G
 
N
P
 
T
I
x
F
Y
x
G
A
 
G
G
 
G
T
x
V
N
 
N
E
|
E
I
 
V
Q
 
L
R
 
R
N
 
D
I
 
M
I
 
V
A
 
A
E
x
T
R
 
L
M
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
P
R
 
R
A
 
S

P71858 Acyl-CoA dehydrogenase FadE29; ACAD; 3-oxo-23,24-bisnorchol-4-en-22-oyl-CoA dehydrogenase beta subunit; 3-oxo-4-pregnene-20-carboxyl-CoA dehydrogenase beta subunit; EC 1.3.99.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:388/388 of query aligns to 1:385/387 of P71858

query
sites
P71858
M
 
M
D
 
F
L
 
I
T
 
D
Y
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
Q
F
 
A
D
 
E
A
 
I
R
 
R
T
 
Q
W
 
Y
L
 
F
A
 
S
A
 
N
N
 
L
V
 
I
P
 
S
S
 
P
E
 
D
P
 
E
L
 
R
Q
 
T
S
 
E
F
 
M
D
 
E
T
 
K
E
 
D
Q
 
R
G
 
H
F
 
G
A
 
P
E
 
A
H
 
Y
R
 
R
A
 
A
W
 
V
E
 
I
A
 
R
K
 
R
L
 
M
-
 
G
N
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
R
W
 
L
G
 
G
M
 
-
V
 
V
T
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
G
C
 
F
D
 
G
L
 
P
I
 
I
E
 
E
W
 
Q
L
 
Q
I
 
I
F
 
F
E
 
V
E
 
N
E
 
E
Y
 
A
Y
 
H
R
 
R
S
 
A
G
 
D
A
 
V
P
 
P
A
 
-
R
 
-
V
 
L
N
 
P
Q
 
A
N
 
V
G
 
T
I
 
L
F
 
Q
L
 
T
L
 
V
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
L
M
 
Q
E
 
A
Y
 
H
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
L
Q
 
Q
K
 
K
A
 
K
R
 
K
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
A
M
 
I
A
 
L
T
 
A
G
 
G
E
 
E
D
 
A
I
 
H
W
 
F
A
 
A
Q
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
 
T
E
 
E
P
 
P
G
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
V
W
 
F
S
 
T
T
 
T
R
 
G
A
 
A
V
 
H
W
 
D
A
 
A
D
 
D
W
 
Y
A
 
I
F
 
W
G
 
L
I
 
A
F
 
C
R
 
R
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
N
S
 
A
Q
 
A
R
 
K
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
I
I
 
L
L
 
I
L
 
V
P
 
D
L
 
T
N
 
K
T
 
D
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
T
 
S
V
 
W
R
 
T
P
 
P
I
 
I
P
 
I
Q
 
L
L
 
A
N
 
D
G
 
G
L
 
A
P
 
H
G
 
H
F
 
T
A
 
N
E
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
Y
D
 
N
D
 
D
V
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
D
N
 
M
A
 
L
L
 
V
G
 
G
G
 
K
E
 
E
G
 
N
M
 
D
G
 
G
W
 
W
H
 
R
V
 
L
A
 
I
M
 
T
S
 
T
T
 
Q
A
 
L
G
 
N
F
 
N
E
|
E
R
 
R
G
 
-
L
 
V
L
 
M
L
 
L
R
 
G
S
 
P
P
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
A
E
 
S
T
 
I
A
 
Y
K
 
D
R
 
R
L
 
-
V
 
V
Q
 
H
L
 
A
Y
 
W
L
 
A
A
 
S
N
 
V
R
 
P
E
 
G
Q
 
G
A
 
N
D
 
G
R
 
V
D
 
T
P
 
P
A
 
I
I
 
D
G
 
H
E
 
D
A
 
D
V
 
V
M
 
K
R
 
R
A
 
A
W
 
L
L
 
G
D
 
E
A
 
I
E
 
R
A
 
A
Y
 
I
T
 
W
L
 
R
G
 
I
T
 
N
Y
 
E
M
 
L
T
 
L
A
 
N
S
 
W
Q
 
Q
L
 
V
V
 
A
Q
 
S
G
 
A
G
 
G
K
 
E
I
 
D
-
 
I
-
 
N
G
 
M
P
 
A
E
 
D
S
 
A
S
 
A
T
 
A
N
 
T
K
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
R
D
 
V
Q
 
Q
R
 
R
M
 
A
H
 
G
D
 
R
T
 
L
A
 
A
M
 
E
S
 
E
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
K
R
 
Y
G
 
G
E
 
N
L
 
-
L
 
-
P
 
P
Q
 
A
A
 
E
P
 
P
A
 
D
A
 
T
G
 
A
D
 
E
V
 
L
G
 
L
H
 
R
W
 
W
L
 
L
E
 
D
G
 
A
F
 
Q
L
 
T
F
 
K
A
 
R
Q
 
N
A
 
L
G
 
V
P
 
I
I
 
T
Y
 
F
-
 
G
A
 
G
G
 
G
T
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Q
 
M
R
 
R
N
 
E
I
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
A
R
 
S
M
 
G
L
 
L
G
 
K
M
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
V

6wy9A Tcur3481-tcur3483 steroid acad g363a variant (see paper)
28% identity, 98% coverage: 8:388/388 of query aligns to 4:380/380 of 6wy9A

query
sites
6wy9A
A
 
A
Q
 
L
Q
 
S
A
 
E
F
 
L
R
 
R
F
 
A
D
 
E
A
 
L
R
 
R
T
 
A
W
 
Y
L
 
F
A
 
N
A
 
G
N
 
L
V
 
L
P
 
P
S
 
A
E
 
D
P
 
E
L
 
R
Q
 
R
S
 
R
F
 
V
D
 
G
T
 
-
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
G
E
 
G
H
 
E
R
 
R
A
 
F
W
 
R
E
 
E
A
 
V
-
 
V
-
 
K
K
 
M
L
 
L
N
 
G
E
 
S
G
 
D
R
 
G
W
 
W
G
 
L
M
 
G
V
 
Y
T
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
C
 
R
D
 
S
L
 
I
I
 
S
E
 
E
W
 
Q
L
 
Y
I
 
V
F
 
L
E
 
F
E
 
D
E
 
E
Y
 
V
Y
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
L
P
 
P
-
 
F
-
 
P
-
 
F
A
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
Q
 
T
N
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
V
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
L
M
 
M
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
K
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
G
M
 
I
A
 
L
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
I
I
 
V
W
 
F
A
 
A
Q
x
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
T
S
 
T
K
 
R
A
 
A
E
 
V
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
E
Y
 
F
V
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
T
 
I
W
x
F
S
 
T
T
x
S
R
 
G
A
 
A
V
 
N
W
 
T
A
 
A
D
 
D
W
 
Y
A
 
I
F
 
W
G
 
L
I
 
A
F
 
C
R
 
R
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
S
 
A
Q
 
P
R
 
K
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
I
I
 
I
L
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
T
N
 
D
T
 
A
P
 
E
G
 
G
I
 
F
T
 
S
V
 
W
R
 
S
P
 
P
I
 
I
P
 
Q
Q
 
T
L
 
V
N
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
 
-
F
 
V
A
 
T
E
 
A
I
 
T
F
 
Y
F
 
Y
D
 
S
D
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
S
N
 
E
A
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
E
E
 
I
G
 
N
M
 
G
G
 
G
W
 
W
H
 
K
V
 
L
A
 
I
M
 
T
S
 
T
T
 
Q
A
 
L
G
 
N
F
 
H
E
|
E
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
L
L
 
A
R
 
A
S
 
L
P
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
M
Q
 
I
E
 
R
T
 
L
A
 
W
K
 
E
R
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
A
L
 
-
Y
 
-
L
 
W
A
 
A
N
 
R
R
 
D
E
 
N
Q
 
G
A
 
V
D
 
L
R
 
E
D
 
Q
P
 
P
A
 
W
I
 
V
G
 
R
E
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
A
R
 
R
A
 
T
W
 
Y
L
 
A
D
 
K
A
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
M
T
 
R
L
 
L
G
 
L
T
 
N
Y
 
W
M
 
K
T
 
M
A
 
T
S
 
I
Q
 
A
L
 
V
V
 
E
Q
 
N
G
 
D
G
 
E
K
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
A
E
 
D
S
 
A
S
 
G
T
 
A
N
 
T
K
 
K
I
 
A
F
 
Y
W
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
T
D
 
H
Q
 
I
R
 
D
M
 
V
H
 
Q
D
 
R
T
 
T
A
 
L
M
 
T
S
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
G
E
 
R
L
 
I
L
 
R
P
 
P
Q
 
E
A
 
S
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
V
D
 
L
V
 
A
G
 
G
H
 
Q
W
 
I
L
 
E
E
 
Q
G
 
L
F
 
S
L
 
R
F
 
Q
A
 
G
Q
 
I
A
 
V
G
 
N
P
 
T
I
x
F
Y
 
A
A
 
G
G
 
G
T
x
V
N
 
N
E
|
E
I
 
V
Q
 
L
R
 
R
N
 
D
I
 
M
I
 
V
A
 
A
E
x
T
R
 
L
M
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
P
R
 
R
A
 
S

2pg0A Crystal structure of acyl-coa dehydrogenase from geobacillus kaustophilus
31% identity, 88% coverage: 42:382/388 of query aligns to 39:378/380 of 2pg0A

query
sites
2pg0A
R
 
R
A
 
S
W
 
F
E
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
M
N
 
G
E
 
E
G
 
N
R
 
G
W
 
F
G
 
-
M
 
L
V
 
C
T
 
P
W
 
W
P
 
V
T
 
D
E
 
E
-
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
N
C
 
A
D
 
D
L
 
F
I
 
A
E
 
Y
W
 
S
L
 
V
I
 
V
F
 
I
E
 
N
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
Y
 
E
R
 
K
S
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
S
A
 
L
R
 
V
V
 
G
N
 
I
Q
 
G
N
 
L
G
 
H
I
 
N
F
 
D
L
 
I
L
 
V
G
 
T
P
 
P
T
 
Y
L
 
I
M
 
A
E
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
K
F
 
W
L
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
C
A
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
L
I
 
I
W
 
T
A
 
A
Q
x
I
A
 
A
W
x
M
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
N
I
 
I
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
K
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
T
W
x
F
S
x
I
T
|
T
R
 
N
A
 
G
V
 
I
W
 
H
A
 
A
D
 
D
W
 
L
A
 
I
F
 
V
G
 
V
I
 
A
F
 
C
R
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
S
 
A
Q
 
K
-
 
P
R
 
P
H
 
H
H
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
L
I
 
L
L
 
V
L
 
V
P
 
E
L
 
R
N
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
T
V
 
R
R
 
G
P
 
R
I
 
K
P
 
L
Q
 
E
L
 
K
N
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
H
G
 
A
-
 
Q
-
 
D
F
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
L
F
 
F
F
 
F
D
 
Q
D
 
D
V
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
Y
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
G
 
G
W
 
F
H
 
Y
V
 
Y
A
 
L
M
 
M
S
 
E
T
 
K
A
 
L
G
 
Q
F
 
Q
E
|
E
R
 
R
G
 
L
L
 
V
L
 
V
L
 
A
R
 
I
S
 
A
P
 
A
A
 
Q
R
 
T
F
 
A
Q
 
A
E
 
E
T
 
V
A
 
M
K
 
F
R
 
S
L
 
L
V
 
T
Q
 
K
L
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
A
 
K
N
 
Q
R
|
R
E
 
T
Q
 
A
A
x
F
D
 
G
R
 
K
D
 
R
P
 
V
A
 
S
I
 
E
G
x
F
E
 
Q
A
 
T
V
 
V
-
 
Q
M
 
F
R
 
R
A
 
L
W
 
A
L
 
E
D
 
M
A
 
A
E
 
T
A
 
E
Y
 
I
T
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
R
T
 
T
Y
 
F
M
 
V
-
 
D
-
 
R
T
 
V
A
 
I
S
 
E
Q
 
E
L
 
H
V
 
M
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
K
 
Q
I
 
I
G
 
V
P
 
T
E
 
E
S
 
V
S
 
S
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
W
F
 
W
W
 
I
S
 
T
E
 
E
L
 
M
D
 
A
Q
 
K
R
 
R
M
 
V
H
 
A
D
 
A
T
 
E
A
 
A
M
 
M
S
x
Q
I
x
L
L
 
H
G
|
G
L
x
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
W
 
Y
L
 
M
E
 
E
G
 
E
F
 
Y
L
 
E
F
 
I
A
 
A
Q
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
I
-
 
P
A
x
V
G
 
S
P
 
A
I
|
I
Y
|
Y
A
|
A
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
x
M
Q
 
M
R
 
K
N
 
T
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
x
R
R
 
Q
M
 
L

1ukwB Crystal structure of medium-chain acyl-coa dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
31% identity, 99% coverage: 1:384/388 of query aligns to 1:378/379 of 1ukwB

query
sites
1ukwB
M
 
I
D
 
D
L
 
F
T
 
S
Y
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
Q
F
 
A
D
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
R
W
 
F
L
 
-
A
 
A
A
 
K
N
 
E
V
 
V
P
 
I
S
 
L
E
 
P
P
 
V
L
 
A
Q
 
Q
S
 
E
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
E
 
K
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
E
H
 
E
R
 
V
A
 
P
W
 
W
E
 
P
A
 
V
-
 
I
-
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
H
E
 
E
G
 
V
R
 
G
W
 
L
G
 
L
M
 
N
V
 
A
T
 
I
W
 
I
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
M
G
 
G
C
 
L
D
 
K
L
 
M
I
 
L
E
 
D
W
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
V
E
 
G
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
-
 
A
Y
 
Y
R
 
A
S
 
C
G
 
M
A
 
G
P
 
I
A
 
Y
R
 
T
V
 
I
N
 
P
Q
 
M
N
 
A
G
 
S
I
 
D
F
 
L
L
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
P
T
 
V
L
 
L
M
 
L
E
 
A
Y
 
-
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
R
R
 
P
M
 
L
A
 
T
T
 
E
G
 
K
E
 
P
D
 
A
I
 
L
W
 
A
A
 
A
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
K
S
 
T
K
 
R
A
 
A
E
 
I
R
 
R
V
 
Q
G
 
G
D
|
D
H
|
H
Y
 
Y
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
M
W
|
W
S
 
I
T
x
S
R
 
N
A
 
G
V
 
G
W
 
E
A
 
A
D
 
E
W
 
W
A
 
V
F
 
V
G
 
-
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
T
D
 
V
P
 
N
Q
 
P
S
 
E
Q
 
L
R
 
R
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
V
T
 
V
F
 
A
I
 
L
L
 
V
L
 
V
P
 
E
L
 
R
N
 
G
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
K
V
 
A
R
 
I
P
 
K
I
 
I
P
 
H
Q
 
G
L
x
K
N
 
M
G
 
G
-
 
Q
-
 
R
L
 
A
P
 
S
G
 
G
F
 
T
A
 
Y
E
 
E
I
 
L
F
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
E
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
 
N
F
 
K
E
x
T
R
 
R
G
 
I
L
 
P
L
 
V
L
 
A
R
 
A
S
 
G
P
 
S
A
 
V
R
 
G
F
 
V
Q
 
A
E
 
R
T
 
R
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
E
V
 
A
Q
 
R
L
 
K
Y
 
Y
L
 
A
A
 
K
N
 
E
R
 
R
E
 
E
Q
 
A
A
 
F
D
 
G
R
 
E
D
 
P
P
 
I
A
 
A
I
 
N
G
 
F
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
M
 
Q
R
 
F
A
 
K
W
 
L
L
 
V
D
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
I
-
 
G
A
 
I
E
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
R
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
M
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
W
Q
 
L
L
 
A
V
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
L
K
 
P
I
 
H
G
 
A
P
 
H
E
 
A
S
 
S
S
 
A
T
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
F
 
Y
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
I
D
 
A
Q
 
F
R
 
E
M
 
A
H
 
A
D
 
N
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
 
Q
I
 
I
L
 
H
G
 
G
L
 
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
Y
L
 
V
-
 
R
-
 
E
L
 
F
P
 
P
Q
 
V
A
 
E
P
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
R
D
 
D
V
 
V
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
x
L
G
 
N
P
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
A
x
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
x
L
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
x
R
R
 
H
M
 
I
L
 
L
G
 
A

1ukwA Crystal structure of medium-chain acyl-coa dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
31% identity, 99% coverage: 1:384/388 of query aligns to 1:378/379 of 1ukwA

query
sites
1ukwA
M
 
I
D
 
D
L
 
F
T
 
S
Y
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
Q
F
 
L
R
 
Q
F
 
A
D
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
R
W
 
F
L
 
-
A
 
A
A
 
K
N
 
E
V
 
V
P
 
I
S
 
L
E
 
P
P
 
V
L
 
A
Q
 
Q
S
 
E
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
E
 
K
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
E
H
 
E
R
 
V
A
 
P
W
 
W
E
 
P
A
 
V
-
 
I
-
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
H
E
 
E
G
 
V
R
 
G
W
 
L
G
 
L
M
 
N
V
 
A
T
 
I
W
 
I
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
M
G
 
G
C
 
L
D
 
K
L
 
M
I
 
L
E
 
D
W
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
V
E
 
G
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
-
 
A
Y
 
Y
R
 
A
S
 
C
G
 
M
A
 
G
P
 
I
A
 
Y
R
 
T
V
 
I
N
 
P
Q
 
M
N
 
A
G
 
S
I
 
D
F
 
L
L
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
P
T
 
V
L
 
L
M
 
L
E
 
A
Y
 
-
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
R
R
 
P
M
 
L
A
 
T
T
 
E
G
 
K
E
 
P
D
 
A
I
 
L
W
 
A
A
 
A
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
K
S
 
T
K
 
R
A
 
A
E
 
I
R
 
R
V
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
M
W
|
W
S
 
I
T
x
S
R
 
N
A
 
G
V
 
G
W
 
E
A
 
A
D
 
E
W
 
W
A
 
V
F
 
V
G
 
-
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
T
D
 
V
P
 
N
Q
 
P
S
 
E
Q
 
L
R
 
R
H
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
V
T
 
V
F
 
A
I
 
L
L
 
V
L
 
V
P
 
E
L
 
R
N
 
G
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
K
V
 
A
R
 
I
P
 
K
I
 
I
P
 
H
Q
 
G
L
 
K
N
 
M
G
 
G
-
 
Q
-
 
R
L
 
A
P
 
S
G
 
G
F
 
T
A
 
Y
E
 
E
I
 
L
F
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
E
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
 
N
F
 
K
E
x
T
R
 
R
G
 
I
L
 
P
L
 
V
L
 
A
R
 
A
S
 
G
P
 
S
A
 
V
R
 
G
F
 
V
Q
 
A
E
 
R
T
 
R
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
E
V
 
A
Q
 
R
L
 
K
Y
 
Y
L
 
A
A
 
K
N
 
E
R
 
R
E
 
E
Q
 
A
A
 
F
D
 
G
R
 
E
D
 
P
P
 
I
A
 
A
I
 
N
G
 
F
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
M
 
Q
R
 
F
A
 
K
W
 
L
L
 
V
D
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
I
-
 
G
A
 
I
E
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
R
L
 
M
G
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
M
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
W
Q
 
L
L
 
A
V
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
L
K
 
P
I
 
H
G
 
A
P
 
H
E
 
A
S
 
S
S
 
A
T
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
F
 
Y
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
I
D
 
A
Q
 
F
R
 
E
M
 
A
H
 
A
D
 
N
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
 
Q
I
 
I
L
 
H
G
 
G
L
 
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
Y
L
 
V
-
 
R
-
 
E
L
 
F
P
 
P
Q
 
V
A
 
E
P
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
R
D
 
D
V
 
V
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
K
A
x
L
G
 
N
P
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
A
x
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
x
L
I
 
I
I
 
I
A
 
A
E
x
R
R
 
H
M
 
I
L
 
L
G
 
A

5lnxD Crystal structure of mmgc, an acyl-coa dehydrogenase from bacillus subtilis.
31% identity, 86% coverage: 51:384/388 of query aligns to 43:374/374 of 5lnxD

query
sites
5lnxD
G
 
G
R
 
K
W
 
H
G
 
G
M
 
L
-
 
M
-
 
G
V
 
I
T
 
P
W
 
V
P
 
P
T
 
E
E
 
Q
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
V
E
 
S
W
 
Y
L
 
I
I
 
L
F
 
A
E
 
I
E
 
H
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
I
G
 
S
A
 
A
P
 
A
A
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
L
N
 
S
G
 
V
I
 
H
F
 
T
L
 
S
L
 
V
G
 
G
P
 
T
T
 
N
-
 
P
L
 
I
M
 
L
E
 
Y
Y
 
F
G
 
G
S
 
N
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
M
R
 
K
F
 
Y
L
 
I
P
 
P
R
 
N
M
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
H
I
 
L
W
 
G
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
W
x
L
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
H
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
S
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
K
V
 
K
G
 
N
D
 
G
H
 
K
Y
 
Y
V
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
T
 
I
W
x
F
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
G
V
 
G
W
 
A
A
 
A
D
 
D
W
 
I
A
 
Y
F
 
I
G
 
T
I
 
F
F
 
A
R
 
L
T
 
T
D
 
A
P
 
P
Q
 
D
S
 
Q
Q
 
G
R
 
R
H
 
-
H
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
I
L
 
V
P
 
E
L
 
K
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
T
V
 
V
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
R
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
Y
G
 
G
-
 
S
-
 
N
F
 
T
A
 
T
E
 
E
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
D
D
 
N
V
 
A
K
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
E
E
 
A
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
D
G
 
G
W
 
F
H
 
H
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
A
T
 
N
A
 
L
G
 
N
F
 
V
E
x
G
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
A
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
L
R
 
E
L
 
H
V
 
A
Q
 
V
L
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
K
N
 
Q
R
|
R
E
 
V
Q
|
Q
A
x
F
D
 
G
R
 
R
D
 
P
P
x
I
A
 
A
I
 
A
G
x
N
E
 
Q
A
 
G
V
x
I
M
 
S
R
 
F
A
 
K
W
 
L
L
 
A
D
 
D
-
 
M
-
 
A
-
 
T
-
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
A
T
 
R
L
 
H
G
 
L
T
 
V
Y
 
Y
M
 
-
T
 
H
A
 
A
S
 
A
Q
 
D
L
 
L
V
 
H
Q
 
N
G
 
R
G
 
L
K
 
N
I
 
C
G
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
S
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
Q
F
 
F
W
 
A
S
 
S
E
 
D
L
 
A
D
 
A
Q
 
V
R
 
K
M
 
A
H
 
L
D
 
D
T
 
-
A
 
A
M
 
V
S
x
Q
I
|
I
L
 
Y
G
 
G
L
x
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
Y
L
 
M
L
 
K
P
 
D
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
Y
W
 
P
L
 
V
E
 
E
G
 
R
F
 
L
L
 
L
F
 
R
-
 
D
A
 
A
Q
 
K
A
 
V
G
 
T
P
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
A
x
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
I
I
 
I
A
 
S
E
x
K
R
 
Y
M
 
L
L
 
L
G
 
G

8hk0B Crystal structure of fic32-33 complex from streptomyces ficellus nrrl 8067 (see paper)
33% identity, 63% coverage: 1:244/388 of query aligns to 1:244/379 of 8hk0B

query
sites
8hk0B
M
 
M
D
 
R
L
 
Y
T
 
G
Y
 
F
T
 
T
P
 
E
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
R
F
 
F
R
 
R
F
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
R
T
 
Q
W
 
A
L
 
L
-
 
R
A
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
V
P
 
R
S
 
A
E
 
A
P
 
V
L
 
A
Q
 
D
S
 
A
F
 
T
D
 
P
T
 
A
E
 
D
Q
 
G
G
 
V
F
 
E
A
 
P
E
 
D
H
 
M
R
 
R
A
 
T
W
 
L
E
 
Y
A
 
R
K
 
L
L
 
L
N
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
K
W
 
L
G
 
G
M
 
L
-
 
L
-
 
A
V
 
V
T
 
H
W
 
W
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
A
G
 
D
C
 
R
D
 
P
L
 
L
I
 
T
E
 
D
W
 
A
L
 
A
I
 
I
F
 
V
E
 
A
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
Y
 
V
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
D
R
 
T
V
 
L
N
 
H
Q
 
V
N
 
N
G
 
T
I
 
I
F
 
Q
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
Q
T
 
F
L
 
L
M
 
L
E
 
M
Y
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
A
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
R
R
 
R
F
 
H
L
 
L
P
 
P
R
 
A
M
 
L
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
E
 
E
D
 
R
I
 
F
W
 
A
A
 
S
Q
x
V
A
 
L
W
x
Y
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
D
A
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
A
 
G
A
 
A
I
 
L
R
 
R
S
 
T
K
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
P
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
G
Y
 
Y
V
 
R
I
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
V
W
x
F
S
|
S
T
x
L
R
 
K
A
 
T
V
 
R
W
 
F
A
 
V
D
 
D
W
 
L
A
 
G
F
 
L
G
 
C
I
 
A
F
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
T
P
 
P
Q
 
G
S
 
A
Q
 
G
R
 
K
H
 
Y
H
 
Q
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
L
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
D
L
 
L
N
 
T
T
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
S
P
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
G
L
 
V
N
 
S
G
 
D
L
 
-
P
 
E
G
 
Q
F
 
F
A
 
H
E
 
R
I
 
V
F
 
D
F
 
L
D
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
P
V
 
V
P
 
S
V
 
G
E
 
D
N
 
D
A
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
A
E
 
R
G
 
D
M
 
Q
G
 
G
W
 
W
H
 
P
V
 
L
A
 
L
M
 
N
S
 
E
T
 
A
A
 
L
G
 
A
F
 
I
E
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8sgsA Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial (see paper)
32% identity, 84% coverage: 59:383/388 of query aligns to 55:377/381 of 8sgsA

query
sites
8sgsA
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
 
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
K
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
A
F
 
W
L
 
V
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
x
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
A
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
A
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
 
A
W
 
S
A
 
A
F
 
A
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
A
Q
 
L
R
 
Q
H
x
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
S
F
 
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
D
N
 
S
A
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
x
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
|
M
S
 
Q
T
 
T
A
x
L
G
 
D
F
 
M
E
 
G
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
N
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
E
 
-
Q
 
M
A
 
A
D
x
F
R
 
G
D
 
A
P
 
P
A
x
L
I
 
T
G
 
K
E
x
L
A
 
Q
V
 
V
M
 
I
R
 
Q
A
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
D
E
 
M
A
 
A
Y
 
L
T
 
A
L
 
L
G
 
E
T
 
S
-
 
A
-
 
R
Y
 
L
M
 
L
T
 
T
-
 
W
-
 
R
A
 
A
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
Q
 
D
G
 
N
G
 
K
K
 
K
-
 
P
I
 
F
G
x
I
P
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
 
L
G
|
G
L
x
G
R
 
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
Q
 
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
R
H
 
H
W
 
Y
L
 
R
E
 
D
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
 
R
A
x
I
G
 
T
P
 
E
I
|
I
Y
|
Y
A
x
E
G
|
G
T
|
T
N
 
S
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

P16219 Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; SCAD; Butyryl-CoA dehydrogenase; EC 1.3.8.1 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
31% identity, 84% coverage: 59:383/388 of query aligns to 85:407/412 of P16219

query
sites
P16219
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
|
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
M
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
 
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
K
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
A
F
 
W
L
 
V
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
|
A
W
x
L
S
|
S
E
|
E
P
|
P
G
|
G
A
x
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
x
R
R
 
A
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
x
I
T
|
T
R
 
N
A
 
A
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
x
A
W
 
S
A
 
A
F
 
A
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
A
Q
 
L
R
 
Q
H
 
N
H
 
K
G
|
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
S
F
 
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
D
N
 
S
A
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
 
D
F
 
M
E
 
G
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
N
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
G
E
 
A
Q
 
P
A
 
L
D
 
T
R
 
K
D
 
L
P
x
Q
A
 
V
I
 
I
G
 
Q
E
 
F
A
 
K
V
 
L
M
 
A
R
 
D
A
 
M
W
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
S
Y
 
A
T
x
R
L
 
L
G
 
L
T
 
T
Y
 
W
M
 
R
T
 
A
A
 
A
S
 
M
Q
 
L
L
 
K
V
 
D
Q
 
N
G
 
K
G
 
K
K
 
P
I
 
F
G
 
I
P
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
|
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
|
L
G
|
G
L
x
G
R
 
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
Q
 
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
x
R
H
 
H
W
 
Y
L
 
R
E
 
D
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
 
R
A
 
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
 
E
G
 
G
T
|
T
N
x
S
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7y0bA Crystal structure of human short-chain acyl-coa dehydrogenase
32% identity, 84% coverage: 59:383/388 of query aligns to 58:380/385 of 7y0bA

query
sites
7y0bA
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
 
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
K
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
A
F
 
W
L
 
V
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
A
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
A
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
 
A
W
 
S
A
 
A
F
 
A
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
A
Q
 
L
R
 
Q
H
 
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
S
F
 
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
D
N
 
S
A
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
 
D
F
 
M
E
 
G
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
N
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
E
 
-
Q
 
M
A
 
A
D
x
F
R
 
G
D
 
A
P
 
P
A
 
L
I
 
T
G
 
K
E
x
L
A
 
Q
V
|
V
M
 
I
R
 
Q
A
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
D
E
 
M
A
 
A
Y
 
L
T
 
A
L
 
L
G
 
E
T
 
S
-
 
A
-
 
R
Y
 
L
M
 
L
T
 
T
-
 
W
-
 
R
A
 
A
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
Q
 
D
G
 
N
G
 
K
K
 
K
-
 
P
I
 
F
G
 
I
P
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
x
G
R
x
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
x
T
Q
x
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
R
H
 
H
W
 
Y
L
 
R
E
 
D
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
 
R
A
x
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
|
Y
A
 
E
G
 
G
T
|
T
N
 
S
E
|
E
I
|
I
Q
 
Q
R
 
R
N
x
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

4iv6B X-ray crystal structure of an isovaleryl-coa dehydrogenase from mycobacterium smegmatis (see paper)
34% identity, 75% coverage: 92:383/388 of query aligns to 86:376/383 of 4iv6B

query
sites
4iv6B
G
 
G
I
 
H
F
 
T
L
 
V
L
 
V
G
 
S
P
 
K
T
 
L
L
 
L
M
 
L
E
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
L
I
 
R
W
 
A
A
 
T
Q
 
M
A
 
A
W
x
L
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
A
 
Q
A
 
A
I
 
M
R
 
R
S
 
T
K
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
R
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
T
 
T
W
|
W
S
x
I
T
x
S
R
 
N
A
 
A
V
 
R
W
 
R
A
 
S
D
 
D
W
 
L
A
 
V
F
 
A
G
 
L
I
 
M
F
 
C
R
 
K
T
 
T
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
S
 
A
Q
 
Q
R
 
P
H
 
A
H
 
H
G
 
K
L
 
G
T
 
V
F
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
L
P
 
V
L
 
E
N
 
K
T
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
D
V
 
V
-
 
S
R
 
R
P
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
N
 
-
G
 
G
L
 
Y
P
 
K
G
 
G
F
 
V
-
 
E
-
 
S
A
 
C
E
 
E
I
 
L
F
 
N
F
 
F
D
 
T
D
 
D
V
 
A
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
S
N
 
S
A
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
D
G
 
D
E
 
E
G
 
G
M
 
R
G
 
G
W
 
F
H
 
A
V
 
Q
A
 
M
M
 
M
S
 
K
T
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
L
E
 
E
R
 
V
G
|
G
L
 
-
L
 
R
L
 
L
R
 
Q
S
 
V
P
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
Q
 
T
E
 
G
T
 
V
A
 
A
K
 
R
R
 
A
L
 
A
V
 
F
Q
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
L
L
 
R
Y
 
Y
L
 
S
A
 
Q
N
 
E
R
|
R
E
 
E
Q
x
S
A
x
F
D
 
G
R
 
K
-
 
P
-
x
I
-
 
W
-
 
Q
D
x
H
P
 
Q
A
 
S
I
x
V
G
 
G
E
 
N
A
 
-
V
 
-
M
 
M
R
 
L
A
 
A
W
 
D
L
 
M
D
 
G
A
 
T
E
 
K
A
 
L
Y
 
Y
T
 
A
L
 
A
G
 
R
T
 
S
Y
 
L
M
 
L
-
 
L
-
 
S
T
 
A
A
 
A
S
 
E
Q
 
K
L
 
F
V
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
Q
K
 
R
I
 
C
G
 
D
P
 
M
E
 
E
S
 
A
S
 
G
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
F
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
T
D
 
A
Q
 
M
R
 
Q
M
 
I
H
 
A
D
 
L
T
 
D
A
 
A
M
 
V
S
x
R
I
x
V
L
 
H
G
 
G
L
x
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
Y
P
 
S
A
 
T
A
 
E
G
 
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
E
H
 
R
W
 
Y
L
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
F
L
 
R
F
 
D
A
 
A
Q
 
P
A
x
L
G
 
M
P
 
I
I
 
V
Y
x
G
A
x
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
|
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
x
K
R
 
Q
M
 
L
L
 
V

7y0aC Crystal structure of human short-chain acyl-coa dehydrogenase
32% identity, 84% coverage: 59:383/388 of query aligns to 61:383/387 of 7y0aC

query
sites
7y0aC
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
M
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
 
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
K
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
A
F
 
W
L
 
V
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
A
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
A
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
 
A
W
 
S
A
 
A
F
 
A
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
A
Q
 
L
R
 
Q
H
 
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
P
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
S
F
x
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
D
N
 
S
A
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
 
D
F
 
M
E
 
G
R
 
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
T
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
N
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
E
 
-
Q
 
M
A
 
A
D
x
F
R
 
G
D
 
A
P
 
P
A
x
L
I
 
T
G
 
K
E
x
L
A
 
Q
V
|
V
M
 
I
R
 
Q
A
 
F
W
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
D
E
 
M
A
 
A
Y
 
L
T
 
A
L
 
L
G
 
E
T
 
S
-
 
A
-
 
R
Y
 
L
M
 
L
T
 
T
-
 
W
-
 
R
A
 
A
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
Q
 
D
G
 
N
G
 
K
K
 
K
-
 
P
I
 
F
G
 
I
P
 
K
E
 
E
S
 
A
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
x
G
R
 
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
Q
 
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
R
H
 
H
W
 
Y
L
 
R
E
 
D
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
 
R
A
x
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
|
Y
A
 
E
G
 
G
T
|
T
N
 
S
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
x
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

P15651 Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; SCAD; Butyryl-CoA dehydrogenase; EC 1.3.8.1 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
30% identity, 84% coverage: 59:383/388 of query aligns to 85:407/412 of P15651

query
sites
P15651
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
S
I
 
I
F
 
A
E
 
L
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
 
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
Q
F
 
W
L
 
I
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
|
A
W
x
L
S
|
S
E
|
E
P
|
P
G
|
G
A
x
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
x
I
T
|
T
R
 
N
A
 
S
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
 
A
W
 
S
A
 
A
F
 
T
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
S
Q
 
R
R
 
Q
H
 
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
-
 
R
-
 
A
P
 
S
G
 
S
F
 
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
Q
T
 
T
A
 
L
G
x
D
F
x
M
E
x
G
R
|
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
S
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
K
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
E
 
H
Q
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
A
 
L
D
 
T
R
 
K
D
 
L
P
 
Q
A
 
N
I
 
I
G
 
Q
E
 
F
A
 
K
V
 
L
M
 
A
R
 
D
A
 
M
W
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
S
Y
 
A
T
 
R
L
 
L
G
 
L
T
 
T
Y
 
W
M
 
R
T
 
A
A
 
A
S
 
M
Q
 
L
L
 
K
V
 
D
Q
 
N
G
 
K
G
 
K
K
 
P
I
 
F
G
 
T
P
 
K
E
 
E
S
 
S
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
|
L
G
|
G
L
x
G
R
 
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
Q
 
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
R
G
 
Y
F
 
Y
L
 
R
F
 
D
A
 
A
Q
 
R
A
 
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
x
E
G
 
G
T
|
T
N
x
S
E
|
E
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1jqiA Crystal structure of rat short chain acyl-coa dehydrogenase complexed with acetoacetyl-coa (see paper)
30% identity, 86% coverage: 51:383/388 of query aligns to 48:380/384 of 1jqiA

query
sites
1jqiA
G
 
G
R
 
E
W
 
L
G
 
G
M
 
L
V
 
L
T
 
A
W
 
M
-
 
D
-
 
V
P
 
P
T
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
G
 
G
C
 
L
D
 
D
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
W
 
Y
L
 
S
I
 
I
F
 
A
E
 
L
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
Y
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
C
A
 
A
P
 
S
A
 
T
R
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
M
N
 
S
Q
 
V
N
 
N
G
 
N
I
 
S
F
x
L
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
-
L
 
I
M
 
L
E
 
K
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
Q
F
 
W
L
 
I
P
 
T
R
 
P
M
 
F
A
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
D
 
K
I
 
I
W
 
G
A
 
C
Q
x
F
A
 
A
W
x
L
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
N
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
A
R
 
S
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
R
R
 
E
V
 
E
G
 
G
D
 
D
H
 
S
Y
 
W
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
T
 
A
W
|
W
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
S
V
 
-
W
 
W
A
 
E
D
 
A
W
 
S
A
 
A
F
 
T
G
 
V
I
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
S
D
 
T
P
 
D
Q
 
R
S
 
S
Q
 
R
R
 
Q
H
 
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
L
R
 
G
P
 
K
I
 
K
P
 
E
Q
 
D
L
 
K
N
 
L
G
 
G
L
 
I
-
 
R
-
 
A
P
 
S
G
 
S
F
 
T
A
 
A
E
 
N
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
E
E
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
W
x
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
|
M
S
x
Q
T
 
T
A
x
L
G
x
D
F
 
M
E
 
G
R
|
R
G
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
S
S
 
Q
P
 
A
A
 
L
R
 
G
F
 
I
Q
 
A
E
 
Q
T
 
A
A
 
S
K
 
L
R
 
D
L
 
C
V
 
A
Q
 
V
L
 
K
Y
 
Y
L
 
A
A
 
E
N
 
N
R
|
R
E
 
H
Q
 
A
-
x
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
A
 
L
D
 
T
R
 
K
D
x
L
P
 
Q
A
 
N
I
 
I
G
 
Q
E
 
F
A
 
K
V
 
L
M
 
A
R
 
D
A
 
M
W
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
S
Y
 
A
T
 
R
L
 
L
G
 
L
T
 
T
Y
 
W
M
 
R
T
 
A
A
 
A
S
 
M
Q
 
L
L
 
K
V
 
D
Q
 
N
G
 
K
G
 
K
K
 
P
I
 
F
G
 
T
P
 
K
E
 
E
S
 
S
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
A
W
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
A
D
 
A
Q
 
T
R
 
A
M
 
I
H
 
S
D
 
H
T
 
Q
A
 
A
M
 
I
S
x
Q
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
x
G
R
 
M
G
 
G
E
 
-
L
 
Y
L
 
V
P
 
T
Q
 
E
A
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
R
G
 
Y
F
 
Y
L
 
R
F
 
D
A
 
A
Q
 
R
A
x
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
|
Y
A
x
E
G
|
G
T
|
T
N
 
S
E
|
E
I
|
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
E
x
G
R
 
H
M
 
L
L
 
L

1egcA Structure of t255e, e376g mutant of human medium chain acyl-coa dehydrogenase complexed with octanoyl-coa (see paper)
29% identity, 87% coverage: 41:379/388 of query aligns to 45:378/387 of 1egcA

query
sites
1egcA
H
 
R
R
 
R
A
 
A
W
 
W
E
 
E
A
 
L
K
 
G
L
 
L
N
 
M
E
 
N
G
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
-
M
 
-
V
 
T
T
 
H
W
 
I
P
 
P
T
 
E
E
 
N
L
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
G
C
 
L
D
 
G
L
 
T
I
 
F
E
 
D
W
 
A
L
 
C
I
 
L
F
 
I
E
 
S
E
 
E
E
 
E
-
 
L
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
G
R
 
C
S
 
T
G
 
G
A
 
V
P
 
Q
A
 
T
R
 
A
V
 
I
N
x
E
Q
 
G
N
 
N
G
 
S
I
x
L
F
 
G
L
 
Q
L
 
M
G
 
-
P
 
P
T
 
I
L
 
I
M
 
I
E
 
A
Y
 
-
G
 
G
S
 
N
E
 
D
E
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
A
 
K
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
P
 
G
R
 
R
M
 
M
A
 
T
T
 
E
G
 
E
E
 
P
D
 
L
I
 
M
W
 
C
A
 
A
Q
x
Y
A
 
C
W
x
V
S
x
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
x
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
K
S
 
T
K
 
K
A
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
K
G
 
G
D
 
D
H
 
E
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
T
 
M
W
|
W
S
 
I
T
|
T
R
 
N
A
 
G
V
 
G
W
 
K
A
 
A
D
 
N
W
 
W
A
 
Y
F
 
F
G
 
L
I
 
L
F
 
A
R
 
R
T
 
S
-
 
D
-
 
P
D
 
D
P
 
P
Q
 
K
S
 
A
Q
 
P
R
 
A
H
x
N
H
 
K
G
 
A
L
 
F
T
 
T
F
 
G
I
 
F
L
 
I
L
 
V
P
 
E
L
 
A
N
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
V
 
I
-
 
G
-
 
R
R
 
K
P
 
E
I
 
L
P
 
N
Q
 
M
L
 
G
N
 
Q
G
 
R
L
 
C
P
 
S
G
 
D
F
 
T
A
 
R
E
 
G
I
 
I
F
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
V
L
 
L
G
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
M
 
A
G
 
G
W
x
F
H
 
K
V
 
V
A
 
A
M
|
M
S
 
G
T
 
A
A
x
F
G
x
D
F
 
K
E
|
E
R
|
R
G
 
P
L
 
V
L
 
V
L
 
A
R
 
A
S
 
G
P
 
A
A
 
V
R
 
G
F
 
L
Q
 
A
E
 
Q
T
 
R
A
 
A
K
 
L
R
 
D
L
 
E
V
 
A
Q
 
T
L
 
K
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
N
 
E
R
|
R
E
 
K
Q
x
T
A
x
F
D
 
G
R
 
K
-
 
L
-
x
L
-
 
V
-
 
E
D
x
H
P
 
Q
A
 
A
I
|
I
G
 
S
E
 
F
A
 
M
V
 
L
M
 
A
R
 
E
A
 
M
W
 
A
L
 
M
D
 
K
A
 
V
E
 
E
A
 
L
Y
 
A
T
 
R
L
 
M
G
 
S
T
 
Y
Y
 
Q
M
 
R
T
 
A
A
 
A
S
 
W
Q
 
E
L
 
V
V
 
D
Q
 
S
G
 
G
G
 
R
K
 
R
I
 
N
G
 
T
P
 
Y
E
 
Y
S
 
A
S
 
S
T
 
I
N
 
A
K
 
K
I
 
A
F
 
F
W
 
A
S
 
G
E
 
D
L
 
I
D
 
A
Q
 
N
R
 
Q
M
 
L
H
 
A
D
 
T
T
 
D
A
 
A
M
 
V
S
x
Q
I
|
I
L
 
L
G
 
G
L
x
G
R
 
N
G
 
G
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
F
D
 
N
V
 
T
G
 
E
H
 
Y
W
 
P
L
 
V
E
 
E
G
 
K
F
 
L
L
 
M
F
 
R
-
 
D
A
 
A
Q
 
K
A
x
I
G
 
Y
P
 
Q
I
|
I
Y
|
Y
A
x
G
G
|
G
T
|
T
N
 
S
E
x
Q
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
N
 
L
I
 
I
I
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5ol2F The electron transferring flavoprotein/butyryl-coa dehydrogenase complex from clostridium difficile (see paper)
28% identity, 92% coverage: 27:383/388 of query aligns to 24:377/378 of 5ol2F

query
sites
5ol2F
E
 
K
P
 
P
L
 
L
Q
 
A
S
 
T
-
x
E
F
 
L
D
 
D
T
 
E
E
|
E
Q
 
E
G
x
R
F
 
F
A
 
P
E
 
-
H
 
Y
R
 
E
A
 
T
W
 
V
E
 
E
A
 
K
K
 
M
L
 
A
N
 
K
E
 
A
G
 
G
R
 
M
W
 
M
G
 
G
M
 
-
V
 
I
T
 
P
W
 
Y
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
E
G
 
G
C
 
G
D
 
D
L
 
T
I
 
V
E
 
G
W
 
Y
L
 
I
I
 
M
F
 
A
E
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
Y
 
S
R
 
R
S
 
V
G
 
C
A
 
G
P
 
T
A
 
T
R
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
L
N
 
S
G
 
A
I
 
H
F
 
T
L
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
S
-
 
W
T
 
P
L
 
I
M
 
Y
E
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
S
 
N
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
A
 
Q
R
 
K
F
 
F
L
 
L
P
 
R
R
 
P
M
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
K
I
 
L
W
 
G
A
 
A
Q
x
F
A
 
G
W
x
L
S
x
T
E
 
E
P
|
P
G
 
N
A
 
A
G
 
G
S
x
T
D
 
D
M
 
A
A
 
S
A
 
G
I
 
Q
R
 
Q
S
 
T
K
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
L
V
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
E
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
T
 
I
W
x
F
S
x
I
T
|
T
R
 
N
A
 
A
V
 
I
W
 
A
A
 
G
D
 
D
W
 
I
A
 
Y
F
 
V
G
 
V
I
 
M
F
 
A
R
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
-
Q
 
K
S
 
S
Q
 
K
R
 
G
H
 
N
H
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
S
F
 
A
I
 
F
L
 
I
L
 
V
P
 
E
L
 
K
N
 
G
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
S
V
 
F
R
 
G
P
 
V
I
 
K
P
x
E
Q
 
K
L
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
I
P
 
R
G
 
G
F
 
S
A
 
A
-
 
T
-
 
S
E
 
E
I
 
L
F
 
I
F
 
F
D
 
E
D
 
D
V
 
C
K
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
Q
G
 
G
W
 
F
H
 
K
V
 
I
A
 
A
M
 
M
S
 
S
T
 
T
-
x
L
-
 
D
-
 
G
-
x
G
-
x
R
A
 
I
G
 
G
F
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
Q
L
 
A
L
 
L
L
 
G
R
 
L
S
 
A
P
 
Q
A
 
G
R
 
A
F
 
L
Q
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
V
K
 
K
R
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
Y
L
 
V
A
 
K
N
 
E
R
|
R
E
 
V
Q
 
Q
A
x
F
D
 
G
R
 
R
D
 
P
P
x
L
A
 
S
I
 
K
G
x
F
E
 
Q
A
 
N
V
 
T
M
 
Q
R
 
F
A
 
Q
W
 
L
L
 
A
D
 
D
A
 
M
E
 
E
A
 
V
Y
 
K
T
 
V
L
 
Q
G
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
T
 
V
Y
 
Y
M
 
Q
T
 
A
A
 
A
S
 
I
Q
 
N
L
 
K
V
 
D
Q
 
L
G
 
G
G
 
K
K
 
P
I
 
Y
G
 
G
P
 
V
E
 
E
S
 
A
S
 
A
T
 
M
N
 
A
K
 
K
I
 
L
F
 
F
W
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
T
D
 
A
Q
 
M
R
 
E
M
 
V
H
 
T
D
 
T
T
 
K
A
 
A
M
 
V
S
x
Q
I
x
L
L
 
H
G
|
G
L
x
G
R
 
Y
G
 
G
E
 
Y
L
 
T
-
 
R
-
 
D
L
 
Y
P
 
P
Q
 
V
A
 
E
P
 
R
A
 
M
A
 
M
G
 
R
D
 
D
V
 
-
G
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
Q
 
K
A
 
I
G
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
|
Y
A
x
E
G
|
G
T
|
T
N
 
S
E
|
E
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
N
 
M
I
 
V
I
 
I
A
 
S
E
x
G
R
 
K
M
 
L
L
 
L

Query Sequence

>PfGW456L13_2536 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2536
MDLTYTPAQQAFRFDARTWLAANVPSEPLQSFDTEQGFAEHRAWEAKLNEGRWGMVTWPT
ELGGRGCDLIEWLIFEEEYYRSGAPARVNQNGIFLLGPTLMEYGSEEQKARFLPRMATGE
DIWAQAWSEPGAGSDMAAIRSKAERVGDHYVINGQKTWSTRAVWADWAFGIFRTDPQSQR
HHGLTFILLPLNTPGITVRPIPQLNGLPGFAEIFFDDVKVPVENALGGEGMGWHVAMSTA
GFERGLLLRSPARFQETAKRLVQLYLANREQADRDPAIGEAVMRAWLDAEAYTLGTYMTA
SQLVQGGKIGPESSTNKIFWSELDQRMHDTAMSILGLRGELLPQAPAAGDVGHWLEGFLF
AQAGPIYAGTNEIQRNIIAERMLGMPRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory