SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2974 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2974 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

Q4U331 Delta(1)-pyrroline-2-carboxylate/Delta(1)-piperideine-2-carboxylate reductase; Pyr2C/Pip2C reductase; N-methyl-L-amino acid dehydrogenase; EC 1.5.1.21; EC 1.4.1.17 from Pseudomonas syringae pv. tomato (see paper)
75% identity, 100% coverage: 1:345/346 of query aligns to 1:342/343 of Q4U331

query
sites
Q4U331
M
 
M
S
 
S
A
 
A
P
 
S
H
 
H
D
 
A
H
 
D
A
 
Q
S
 
P
T
 
T
A
 
Q
V
 
T
P
 
-
S
 
-
H
 
-
L
 
V
S
 
S
L
 
Y
E
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
I
A
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
R
K
 
R
I
 
I
F
 
F
L
 
V
R
 
V
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
C
 
C
A
 
A
C
 
S
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
S
H
 
H
S
 
S
H
 
H
G
 
G
V
 
I
F
 
F
R
 
R
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
T
 
S
L
 
L
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
W
V
 
V
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
S
 
S
H
 
H
H
|
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
L
|
L
W
 
W
P
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
M
V
 
V
N
 
N
S
 
S
M
 
M
T
 
T
C
 
C
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
A
E
 
G
G
 
G
G
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
|
D
L
|
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
R
L
 
D
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
H
|
H
K
|
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
D
W
 
W
K
 
S
N
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
W
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
M
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
Q
K
 
E
R
|
R
L
|
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
R
|
R
R
|
R
H
 
Y
H
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
V
L
 
I
D
 
A
A
 
Q
R
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
E
N
 
R
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G

2cwfB Crystal structure of delta1-piperideine-2-carboxylate reductase from pseudomonas syringae complexed with NADPH (see paper)
77% identity, 95% coverage: 16:345/346 of query aligns to 7:336/337 of 2cwfB

query
sites
2cwfB
L
 
V
S
 
S
L
 
Y
E
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
I
A
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
R
K
 
R
I
 
I
F
 
F
L
 
V
R
 
V
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
C
 
C
A
 
A
C
 
S
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
S
H
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
F
R
 
R
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
T
 
S
L
 
L
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
W
V
 
V
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
S
 
S
H
 
H
H
|
H
F
 
F
A
|
A
A
|
A
L
|
L
W
 
W
P
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
M
V
 
V
N
 
N
S
 
S
M
 
M
T
 
T
C
 
C
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
A
E
 
G
G
 
G
G
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
|
F
D
|
D
L
|
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
|
A
H
 
H
G
 
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
R
L
 
D
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
H
|
H
K
|
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
D
W
 
W
K
 
S
N
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
W
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
M
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
Q
K
 
E
R
|
R
L
 
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
R
|
R
R
|
R
H
 
Y
H
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
V
L
 
I
D
 
A
A
 
Q
R
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
E
N
 
R
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G

2cwhA Crystal structure of delta1-piperideine-2-carboxylate reductase from pseudomonas syringae complexed with NADPH and pyrrole-2-carboxylate (see paper)
77% identity, 95% coverage: 16:344/346 of query aligns to 4:332/332 of 2cwhA

query
sites
2cwhA
L
 
V
S
 
S
L
 
Y
E
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
I
A
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
R
K
 
R
I
 
I
F
 
F
L
 
V
R
 
V
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
V
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
C
 
C
A
 
A
C
 
S
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
S
H
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
F
R
|
R
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
T
 
S
L
 
L
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
W
V
 
V
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
S
 
S
H
 
H
H
|
H
F
 
F
A
|
A
A
|
A
L
|
L
W
 
W
P
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
M
V
 
V
N
 
N
S
|
S
M
|
M
T
 
T
C
 
C
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
|
H
G
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
A
E
 
G
G
 
G
G
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
|
F
D
|
D
L
|
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
|
A
H
|
H
G
|
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
R
L
 
D
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
H
|
H
K
|
K
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
S
M
 
M
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
D
W
 
W
K
 
S
N
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
W
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
S
 
S
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
M
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
Q
K
 
E
R
|
R
L
 
L
P
|
P
G
|
G
D
 
D
R
|
R
R
|
R
H
 
Y
H
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
V
L
 
I
D
 
A
A
 
Q
R
 
A
T
 
D
L
 
L
A
 
E
N
 
R
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A

1vbiA Crystal structure of type 2 malate/lactate dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
35% identity, 93% coverage: 21:343/346 of query aligns to 8:332/340 of 1vbiA

query
sites
1vbiA
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
W
L
 
A
E
 
E
K
 
A
I
 
L
F
 
L
L
 
R
R
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
A
S
 
D
V
 
E
E
 
P
V
 
S
A
 
A
R
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
W
N
 
A
C
 
L
A
 
V
C
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
R
G
 
G
A
x
V
H
 
G
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
L
F
 
L
R
 
R
I
 
L
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
R
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
G
 
G
W
 
L
V
 
V
N
 
N
-
 
P
G
 
S
Q
 
P
A
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
E
E
 
E
D
 
R
V
 
G
A
 
P
S
 
V
G
 
A
F
 
L
V
 
L
R
 
-
V
 
-
D
 
D
A
 
G
N
 
E
N
 
H
G
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
P
P
 
R
A
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
A
L
 
A
V
 
Q
Q
 
S
K
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
R
A
 
H
G
 
G
I
 
L
A
 
G
V
 
A
L
 
V
A
 
G
I
 
V
R
 
R
N
 
R
S
 
S
H
 
T
H
|
H
F
|
F
A
x
G
A
x
M
L
x
A
W
 
G
P
 
L
D
 
Y
V
 
A
E
 
E
P
 
K
F
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
W
S
 
V
V
 
T
V
x
T
N
 
N
S
 
A
M
 
E
T
 
P
C
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
F
G
 
G
A
 
G
D
 
R
R
 
E
P
 
K
L
 
A
F
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
-
A
 
A
E
 
P
G
 
Q
G
 
G
P
 
I
I
 
L
V
|
V
F
x
A
D
|
D
L
|
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
E
I
 
S
A
 
A
H
 
M
G
 
G
D
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
L
A
 
A
A
 
R
R
 
E
E
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
E
 
P
G
 
S
M
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
R
L
 
E
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
D
D
 
D
P
 
P
K
 
H
A
 
R
I
 
V
L
 
Y
E
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
L
 
L
L
 
R
P
 
P
F
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
L
M
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
G
F
 
V
S
 
A
F
 
H
E
 
G
F
 
I
D
 
G
W
 
R
K
 
M
N
 
Y
H
 
D
P
 
E
G
 
W
A
 
D
K
 
R
T
 
P
P
 
Q
W
 
D
T
 
V
G
 
G
Q
 
H
L
 
F
L
 
L
I
 
L
V
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
G
K
 
R
A
 
F
A
 
V
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
S
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
M
Q
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
W
R
 
Q
Q
 
A
M
 
L
H
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
P
G
 
G
V
 
H
G
 
E
L
 
E
K
 
V
R
x
F
L
|
L
P
|
P
G
|
G
D
 
E
R
x
L
R
x
E
H
 
A
H
 
R
Q
 
R
R
 
R
A
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
G
 
G
I
 
M
E
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
E
R
 
R
T
 
V
L
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
A
L
 
L

2x06A Sulfolactate dehydrogenase from methanocaldococcus jannaschii (see paper)
29% identity, 95% coverage: 16:344/346 of query aligns to 3:332/344 of 2x06A

query
sites
2x06A
L
 
L
S
 
K
L
 
P
E
 
E
A
 
N
L
 
E
S
 
K
A
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
I
K
 
D
I
 
V
F
 
L
L
 
K
R
 
K
H
 
F
G
 
G
T
 
V
S
 
P
V
 
E
E
 
E
V
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
I
L
 
T
A
 
A
Q
 
D
N
 
V
C
 
F
A
 
V
C
 
D
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
K
G
 
G
A
x
F
H
 
T
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
G
R
 
R
I
 
F
P
 
P
G
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
S
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
K
S
 
L
G
 
G
W
 
N
V
 
I
N
 
N
G
 
P
Q
 
K
A
 
P
-
 
D
V
 
I
P
 
K
L
 
I
V
 
V
E
 
K
D
 
E
V
 
S
A
 
P
S
 
A
G
 
T
F
 
A
V
 
V
R
 
-
V
 
I
D
 
D
A
 
G
N
 
D
N
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
V
L
 
G
A
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
A
V
 
I
Q
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
K
S
 
N
A
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
T
R
 
R
N
 
N
S
 
A
H
 
N
H
|
H
F
|
F
A
x
G
A
x
I
L
x
A
W
 
G
P
 
Y
D
 
Y
V
 
S
E
 
E
P
 
L
F
 
A
A
 
M
E
 
N
E
 
Q
G
 
D
L
 
M
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
T
V
 
I
V
x
T
N
 
N
S
x
T
M
 
E
T
 
P
C
 
A
V
 
M
V
 
A
P
 
P
H
x
F
G
 
G
A
 
G
D
 
K
R
 
E
P
 
K
L
 
I
F
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
F
P
 
-
R
 
K
A
 
G
E
 
N
G
 
K
G
 
Y
P
 
K
I
 
F
V
 
S
F
x
L
D
|
D
L
x
M
A
|
A
T
 
T
S
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
R
G
 
G
D
 
K
V
 
I
Q
 
L
I
 
E
A
 
A
A
 
L
R
 
R
E
 
K
G
 
K
E
 
I
R
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
G
 
G
M
 
C
G
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
K
 
A
A
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
-
G
 
G
A
 
C
L
 
I
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
H
x
P
K
|
K
G
 
G
S
x
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
A
M
 
L
M
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
-
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
G
G
 
G
G
 
A
N
 
E
F
 
V
S
 
G
F
 
T
E
 
K
F
 
V
D
 
K
W
 
G
K
 
T
N
 
A
H
 
N
P
 
P
G
 
E
A
 
E
K
 
R
T
 
C
P
 
-
W
 
T
T
 
K
G
 
G
Q
 
D
L
 
L
L
 
F
I
 
I
V
 
A
I
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
K
 
F
A
 
F
A
 
M
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
K
E
 
R
R
 
K
S
 
V
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
D
Q
 
E
M
 
I
H
 
K
G
 
N
V
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
A
-
 
E
G
 
G
L
 
F
K
 
E
R
 
I
L
|
L
-
x
I
P
|
P
G
|
G
D
 
E
R
x
I
R
x
E
H
 
E
H
 
R
Q
 
N
R
 
K
A
 
M
R
 
K
S
 
R
L
 
-
A
 
K
N
 
D
G
 
G
I
 
F
E
 
E
L
 
I
D
 
D
A
 
K
R
 
N
T
 
L
L
 
Y
A
 
N
N
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
C

P30178 Hydroxycarboxylate dehydrogenase B; 2-oxoglutarate reductase; Hydroxyphenylpyruvate reductase; Phenylpyruvate reductase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.237 from Escherichia coli (strain K12)
33% identity, 91% coverage: 19:334/346 of query aligns to 10:332/361 of P30178

query
sites
P30178
E
 
Q
A
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
S
L
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
A
I
 
V
F
 
F
L
 
R
R
 
Q
H
 
M
G
 
G
T
 
S
S
 
E
V
 
E
E
 
Q
V
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
N
 
H
C
 
L
A
 
I
C
 
A
A
 
A
E
 
N
R
 
L
D
 
A
G
 
G
A
 
H
H
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
G
R
 
M
I
 
I
P
 
P
G
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
R
T
 
S
L
 
W
Q
 
S
S
 
Q
G
 
G
-
 
H
-
 
L
W
 
Q
V
 
I
N
 
N
G
 
H
Q
 
H
A
 
A
V
 
K
P
 
T
L
 
V
V
 
K
E
 
E
D
 
-
V
 
-
A
 
A
S
 
G
G
 
A
F
 
A
V
 
V
R
 
T
V
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
D
N
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
A
L
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
H
S
 
Q
A
 
H
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
L
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
H
N
 
N
S
 
S
H
 
H
H
 
H
F
 
I
A
x
G
A
x
R
L
x
I
W
 
G
P
 
Y
D
 
W
V
 
A
E
 
E
P
 
Q
F
 
C
A
 
A
E
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
V
A
 
S
L
 
I
S
 
H
V
 
F
V
 
V
N
 
S
-
 
V
-
 
V
S
 
G
M
 
I
T
 
P
C
 
M
V
 
V
V
 
A
P
 
P
-
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
R
D
 
D
R
 
S
P
 
-
L
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
F
A
 
C
F
 
V
A
 
V
A
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
K
E
 
D
G
 
N
G
 
F
P
 
P
I
 
L
V
x
L
F
x
L
D
|
D
L
x
Y
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
F
G
 
G
D
 
K
V
 
T
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
W
R
 
H
E
 
K
G
 
G
E
 
V
R
 
P
L
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
G
M
 
C
G
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
P
 
P
K
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
Q
E
 
E
G
 
S
-
 
P
-
 
L
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
T
F
 
F
G
 
A
G
 
E
H
|
H
K
 
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
A
M
 
M
V
 
C
E
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
K
F
 
T
S
 
T
F
 
H
E
 
Q
F
 
E
D
 
T
W
 
L
K
 
Q
N
 
T
H
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
A
K
 
I
T
 
L
P
 
-
W
 
-
T
x
N
G
 
C
Q
 
M
L
 
T
L
 
T
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
C
K
 
N
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
Q
 
E
S
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
W
S
 
V
Q
 
K
E
 
A
L
 
S
V
 
P
R
 
H
Q
 
D
M
 
D
H
 
D
G
 
K
V
 
P
G
 
I
L
 
L
K
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
G
|
G
D
x
E
R
x
W
R
x
E
H
 
V
H
 
N
Q
 
T
R
 
R
A
 
R
R
 
E
S
 
R
L
 
Q
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A

2g8yA The structure of a putative malate/lactate dehydrogenase from e. Coli.
32% identity, 91% coverage: 19:334/346 of query aligns to 8:330/359 of 2g8yA

query
sites
2g8yA
E
 
Q
A
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
S
L
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
A
I
 
V
F
 
F
L
 
R
R
 
Q
H
 
M
G
 
G
T
 
S
S
 
E
V
 
E
E
 
Q
V
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
N
 
H
C
 
L
A
 
I
C
 
A
A
 
A
E
 
N
R
 
L
D
 
A
G
 
G
A
x
H
H
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
G
R
 
M
I
 
F
P
 
P
G
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
R
T
 
S
L
 
W
Q
 
S
S
 
Q
G
 
G
-
 
H
-
 
L
W
 
Q
V
 
I
N
 
N
G
 
H
Q
 
H
A
 
A
V
 
K
P
 
T
L
 
V
V
 
K
E
 
E
D
 
-
V
 
-
A
 
A
S
 
G
G
 
A
F
 
A
V
 
V
R
 
T
V
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
D
N
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
A
L
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
H
S
 
Q
A
 
H
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
L
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
H
N
 
N
S
 
S
H
 
H
H
|
H
F
 
I
A
x
G
A
x
R
L
x
I
W
 
G
P
 
Y
D
 
W
V
 
A
E
 
E
P
 
Q
F
 
C
A
 
A
E
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
V
A
 
S
L
 
I
S
 
H
V
 
F
V
 
V
N
 
S
-
 
V
-
 
V
S
 
G
M
 
I
T
 
P
C
 
M
V
 
V
V
 
A
P
 
P
-
x
F
H
|
H
G
 
G
A
 
R
D
 
D
R
 
S
P
 
-
L
 
R
F
 
F
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
F
A
 
C
F
 
V
A
 
V
A
 
F
P
 
P
R
 
R
A
 
K
E
 
D
G
 
N
G
 
F
P
 
P
I
 
L
V
x
L
F
x
L
D
|
D
L
x
Y
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
|
A
H
 
F
G
 
G
D
 
K
V
 
T
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
W
R
 
H
E
 
K
G
 
G
E
 
V
R
 
P
L
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
G
M
 
C
G
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
P
 
P
K
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
Q
E
 
E
G
 
S
-
 
P
-
 
L
G
 
G
A
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
T
F
 
F
G
 
A
G
 
E
H
|
H
K
|
K
G
 
G
S
x
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
A
M
 
M
V
 
C
E
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
K
F
 
T
S
 
T
F
 
H
E
 
Q
F
 
E
D
 
T
W
 
L
K
 
Q
N
 
T
H
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
A
K
 
I
T
 
L
P
 
-
W
 
-
T
x
N
G
 
C
Q
 
M
L
 
T
L
 
T
I
 
I
V
 
I
I
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
C
K
 
N
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
Q
 
E
S
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
R
 
W
S
 
V
Q
 
K
E
 
A
L
 
S
V
 
P
R
 
H
Q
 
D
M
 
D
H
 
D
G
 
K
V
 
P
G
 
I
L
|
L
K
 
-
R
 
-
L
 
L
P
|
P
G
|
G
D
 
E
R
x
W
R
x
E
H
 
V
H
 
N
Q
 
T
R
 
R
A
 
R
R
 
E
S
 
R
L
 
Q
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A

4fjuA Crystal structure of ureidoglycolate dehydrogenase in ternary complex with nadh and glyoxylate (see paper)
31% identity, 92% coverage: 16:332/346 of query aligns to 3:323/338 of 4fjuA

query
sites
4fjuA
L
 
I
S
 
S
L
 
R
E
 
E
A
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
K
 
N
I
 
K
F
 
L
L
 
C
R
 
Q
H
 
A
G
 
G
T
 
L
S
 
K
V
 
R
E
 
E
V
 
H
A
 
A
R
 
A
V
 
T
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
N
 
V
C
 
L
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
A
D
 
R
G
 
G
A
x
I
H
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
A
F
 
V
R
|
R
I
 
V
P
 
E
G
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
S
 
E
T
 
R
L
 
I
Q
 
S
S
 
K
G
 
G
W
 
G
V
 
T
N
 
N
G
 
R
Q
 
E
A
 
P
V
 
E
P
 
F
L
 
R
V
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
T
A
 
G
S
 
P
G
 
C
F
 
S
V
 
A
R
 
I
V
 
L
D
 
H
A
 
A
N
 
D
N
 
N
G
 
A
F
 
A
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
M
A
 
G
R
 
M
E
 
E
L
 
H
L
 
A
V
 
I
Q
 
K
K
 
T
A
 
A
R
 
Q
S
 
Q
A
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
G
I
 
I
R
 
S
N
 
R
S
 
M
H
 
G
H
|
H
F
 
S
A
x
G
A
|
A
L
x
I
W
 
S
P
 
Y
D
 
F
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
M
V
x
C
N
 
Q
S
|
S
M
x
D
T
 
P
C
 
M
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
x
F
G
 
G
A
 
G
D
 
A
R
 
E
P
 
I
L
 
Y
F
 
Y
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
-
A
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
D
P
 
E
I
 
I
V
 
L
-
 
T
F
|
F
D
|
D
L
x
M
A
|
A
T
 
T
S
 
T
A
 
V
I
 
Q
A
|
A
H
 
W
G
 
G
D
 
K
V
 
V
Q
 
L
I
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
S
E
 
R
G
 
N
E
 
M
R
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
D
G
 
T
M
 
W
G
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
N
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
K
 
F
A
 
A
I
 
V
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
A
G
 
A
G
 
G
H
x
P
K
|
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
M
M
 
M
M
 
M
V
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
G
 
L
N
 
P
F
 
F
S
 
G
F
 
R
E
 
Q
F
 
V
D
 
S
W
 
S
K
x
M
N
 
Y
H
 
D
P
 
D
G
 
L
A
 
H
K
 
A
T
 
G
P
 
R
W
 
N
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
H
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
N
-
 
F
K
 
F
A
 
S
A
 
S
G
 
S
Q
 
E
S
 
L
F
 
F
A
 
R
E
 
Q
R
 
H
S
 
L
Q
 
S
E
 
Q
L
 
T
V
 
M
R
 
R
Q
 
E
M
 
L
H
 
N
G
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
P
G
 
G
L
 
F
K
 
N
R
 
Q
L
 
V
-
x
Y
-
x
Y
P
|
P
G
|
G
D
 
Q
R
x
D
R
x
Q
H
 
D
H
 
I
Q
 
K
R
 
Q
A
 
R
R
 
K
S
 
A
L
 
A
A
 
V
N
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
I

P77555 Ureidoglycolate dehydrogenase (NAD(+)); EC 1.1.1.350 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 92% coverage: 16:332/346 of query aligns to 3:323/349 of P77555

query
sites
P77555
L
 
I
S
 
S
L
 
R
E
 
E
A
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
E
K
 
N
I
 
K
F
 
L
L
 
C
R
 
Q
H
 
A
G
 
G
T
 
L
S
 
K
V
 
R
E
 
E
V
 
H
A
 
A
R
 
A
V
 
T
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
N
 
V
C
 
L
A
 
V
C
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
I
H
 
H
S
|
S
H
|
H
G
 
G
V
 
A
F
 
V
R
|
R
I
 
V
P
 
E
G
 
Y
Y
|
Y
V
 
A
S
 
E
T
 
R
L
 
I
Q
 
S
S
 
K
G
 
G
W
 
G
V
 
T
N
 
N
G
 
R
Q
 
E
A
 
P
V
 
E
P
 
F
L
 
R
V
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
T
A
 
G
S
 
P
G
 
C
F
 
S
V
 
A
R
 
I
V
 
L
D
 
H
A
 
A
N
 
D
N
 
N
G
 
A
F
 
A
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
M
A
 
G
R
 
M
E
 
E
L
 
H
L
 
A
V
 
I
Q
 
K
K
 
T
A
 
A
R
 
Q
S
 
Q
A
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
G
I
 
I
R
 
S
N
 
R
S
 
M
H
 
G
H
|
H
F
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
I
W
 
S
P
 
Y
D
 
F
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
M
V
 
C
N
 
Q
S
|
S
M
x
D
T
 
P
C
 
M
V
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
F
G
 
G
A
 
G
D
 
A
R
 
E
P
 
I
L
 
Y
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
-
A
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
D
P
 
E
I
 
I
V
 
L
-
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
M
A
 
A
T
 
T
S
 
T
A
 
V
I
 
Q
A
 
A
H
 
W
G
 
G
D
 
K
V
 
V
Q
 
L
I
 
D
A
 
A
A
 
R
R
 
S
E
 
R
G
 
N
E
 
M
R
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
D
G
 
T
M
 
W
G
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
N
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
K
 
F
A
 
A
I
 
V
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
A
G
 
A
G
 
G
H
 
P
K
 
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
M
M
 
M
M
 
M
V
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
G
 
L
N
 
P
F
 
F
S
 
G
F
 
R
E
 
Q
F
 
V
D
 
S
W
 
S
K
x
M
N
 
Y
H
 
D
P
 
D
G
 
L
A
 
H
K
 
A
T
 
G
P
x
R
W
 
N
T
 
L
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
H
I
 
I
V
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
N
-
 
F
K
 
F
A
 
S
A
 
S
G
 
S
Q
 
E
S
 
L
F
 
F
A
 
R
E
 
Q
R
 
H
S
 
L
Q
 
S
E
 
Q
L
 
T
V
 
M
R
 
R
Q
 
E
M
 
L
H
 
N
G
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
P
G
 
G
L
 
F
K
 
N
R
 
Q
L
 
V
-
 
Y
-
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
Q
R
 
D
R
 
Q
H
 
D
H
 
I
Q
 
K
R
 
Q
A
 
R
R
 
K
S
 
A
L
 
A
A
 
V
N
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
I

1z2iA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens malate dehydrogenase, new york structural genomics consortium
32% identity, 95% coverage: 18:344/346 of query aligns to 6:339/350 of 1z2iA

query
sites
1z2iA
L
 
L
E
 
D
A
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
R
L
 
F
L
 
C
E
 
R
K
 
A
I
 
V
F
 
F
L
 
L
R
 
A
H
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
A
A
 
T
Q
 
R
N
 
A
C
 
M
A
 
M
C
 
H
A
 
G
E
 
T
R
 
R
D
 
L
G
 
G
A
x
V
H
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
F
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
A
G
 
H
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
T
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
G
G
 
G
W
 
R
V
 
L
N
 
N
G
 
R
Q
 
R
A
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
Q
V
 
I
E
 
S
D
 
R
V
 
V
A
 
-
S
 
S
G
 
G
F
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
V
V
 
E
R
 
T
V
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
D
N
 
H
G
 
A
F
 
H
A
 
G
Q
 
A
P
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
M
E
 
E
L
 
N
L
 
A
V
 
M
Q
 
A
K
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
K
A
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
A
L
 
V
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
S
 
S
H
 
S
H
|
H
F
|
F
A
x
G
A
x
P
L
x
A
W
 
G
P
 
A
D
 
Y
V
 
A
E
 
L
P
 
E
F
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
F
V
x
C
N
 
N
S
 
S
M
 
D
T
 
S
C
 
F
V
 
V
V
 
R
P
 
L
H
 
H
G
 
D
A
 
G
D
 
A
R
 
M
P
 
R
L
 
F
F
 
H
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
V
P
 
P
R
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
D
G
 
M
P
 
P
I
 
W
V
 
L
F
x
L
D
|
D
L
x
M
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
V
A
x
P
H
 
Y
G
 
N
D
 
R
V
 
V
Q
 
L
I
 
L
A
 
Y
A
 
R
R
 
S
E
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
M
 
V
G
 
A
V
 
S
D
 
D
S
 
G
L
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
D
T
 
T
T
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
E
A
 
M
L
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
E
-
 
F
-
 
G
-
x
F
K
|
K
G
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
G
M
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
F
A
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
M
N
 
R
F
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
D
F
 
L
D
 
A
W
 
P
K
 
M
N
 
G
H
 
G
P
 
P
G
 
D
A
 
F
K
 
S
T
 
T
P
 
P
W
 
R
-
 
G
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
L
 
F
L
 
V
I
 
L
V
 
A
I
 
L
D
 
K
P
 
P
D
 
E
K
 
A
A
 
F
A
 
L
G
 
E
Q
 
R
S
 
D
-
 
V
F
 
F
A
 
D
E
 
E
R
 
S
S
 
M
Q
 
K
E
 
R
L
 
Y
V
 
L
R
 
E
Q
 
V
M
 
L
H
 
R
G
 
G
V
 
S
G
 
P
L
 
A
K
 
R
R
 
E
-
 
D
-
 
C
-
 
K
-
 
V
-
x
M
L
 
A
P
|
P
G
|
G
D
 
D
R
|
R
R
x
E
H
 
W
H
 
A
Q
 
V
R
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
R
L
 
E
A
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
A
E
 
P
L
 
V
D
 
D
A
 
P
R
 
V
T
 
T
L
 
R
A
 
A
N
 
A
L
 
F
R
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
A

3i0pA Crystal structure of malate dehydrogenase from entamoeba histolytica
25% identity, 96% coverage: 14:346/346 of query aligns to 3:354/361 of 3i0pA

query
sites
3i0pA
S
 
K
H
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
I
E
 
D
A
 
T
L
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
F
L
 
M
E
 
Y
K
 
Q
I
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
V
G
 
G
T
 
S
S
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
N
A
 
A
R
 
R
V
 
M
L
 
V
A
 
R
Q
 
D
N
 
T
C
 
L
A
 
I
C
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
 
R
G
 
G
A
x
M
H
 
D
S
 
T
H
|
H
G
 
G
V
 
I
F
 
Q
R
 
R
I
 
F
P
 
K
G
 
T
-
 
V
Y
 
Y
V
 
I
S
 
D
T
 
R
L
 
I
Q
 
K
S
 
K
G
 
G
W
 
M
V
 
I
N
 
N
G
 
P
Q
 
T
A
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
S
V
 
I
E
 
I
D
 
R
V
 
E
A
 
T
S
 
S
G
 
T
F
 
T
V
 
C
R
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
N
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
H
P
 
V
A
 
N
L
 
G
A
 
T
A
 
I
A
 
G
R
 
M
E
 
K
L
 
M
L
 
A
V
 
I
Q
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
K
S
 
K
A
 
Y
G
 
G
I
 
M
A
 
G
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
V
R
 
R
N
 
N
S
 
S
H
 
T
H
|
H
F
|
F
A
x
G
A
x
I
L
x
A
W
 
G
P
 
Y
D
 
Y
V
 
S
E
 
L
P
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
C
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
C
V
 
G
V
x
T
N
 
N
S
 
A
M
 
R
T
 
S
C
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
A
H
 
T
G
 
F
A
 
G
D
 
D
R
 
E
P
 
P
L
 
I
F
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
A
 
I
P
 
P
R
 
S
A
 
D
E
 
E
G
 
A
G
 
F
P
 
P
I
 
Y
V
x
C
F
|
F
D
|
D
L
x
G
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
I
I
 
S
A
x
P
H
 
T
G
 
G
D
x
R
V
 
F
Q
 
E
I
 
K
A
 
Y
A
 
V
R
 
R
E
 
M
G
 
G
E
 
K
R
 
T
L
 
V
P
 
D
E
 
K
G
 
S
M
 
W
G
 
A
V
 
S
D
 
M
S
 
K
L
 
G
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
T
 
I
T
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
A
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
K
G
 
G
G
 
K
A
 
A
L
 
Y
L
 
L
-
 
H
P
 
P
F
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
S
H
 
H
K
 
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
C
L
 
L
S
 
S
M
 
E
M
 
F
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
A
 
S
A
 
S
A
 
C
L
 
L
T
 
S
G
 
I
G
 
A
N
 
N
F
 
F
S
 
L
F
 
N
E
 
H
F
 
I
D
 
E
W
 
E
K
 
E
N
 
K
H
 
E
P
 
K
G
 
S
A
 
G
K
 
K
T
 
F
P
 
S
W
 
L
T
 
-
G
 
G
Q
 
H
L
 
F
L
 
F
I
 
I
V
 
A
I
 
I
D
 
N
P
 
V
D
 
E
K
 
C
A
 
F
A
 
R
G
 
D
-
 
L
Q
 
N
S
 
E
F
 
F
A
 
K
E
 
K
R
 
N
S
 
V
Q
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
N
R
 
R
Q
 
T
M
 
L
H
 
R
G
 
N
V
 
T
G
 
-
L
 
-
K
 
D
R
 
K
L
 
L
P
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
x
Y
-
x
T
-
x
A
G
|
G
D
 
E
R
x
K
R
x
E
H
 
Y
H
 
E
Q
 
T
R
 
E
A
 
Q
R
 
K
S
 
R
L
 
R
A
 
K
N
 
F
G
 
G
I
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
P
A
 
L
R
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
N
N
 
E
L
 
M
R
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
S
L
 
F

1v9nA Structure of malate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
28% identity, 87% coverage: 6:305/346 of query aligns to 8:295/348 of 1v9nA

query
sites
1v9nA
D
 
D
H
 
E
A
 
N
S
 
Y
T
 
I
A
 
R
V
 
V
P
 
P
S
 
K
H
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
D
A
 
R
L
 
L
S
 
F
A
 
S
L
 
F
L
 
I
E
 
V
K
 
R
I
 
V
F
 
L
L
 
T
R
 
K
H
 
L
G
 
G
T
 
V
S
 
P
V
 
E
E
 
E
V
 
D
A
 
A
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
D
N
 
N
C
 
L
A
 
V
C
 
M
A
 
A
E
 
D
R
 
L
D
x
R
G
 
G
A
x
V
H
 
E
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
F
 
Q
R
 
R
I
 
L
P
 
K
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
T
 
G
L
 
I
Q
 
I
S
 
S
G
 
G
W
 
G
V
 
V
N
 
N
G
 
L
Q
 
H
A
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
K
V
 
I
E
 
R
D
 
V
V
 
I
A
 
R
S
 
E
G
 
G
-
 
P
-
 
S
F
 
Y
V
 
A
R
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
G
N
 
D
N
 
E
G
 
G
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
A
 
V
L
 
G
A
 
Y
A
 
R
A
 
S
R
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
A
V
 
I
Q
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
K
S
 
D
A
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
I
L
 
V
A
 
I
I
 
A
R
 
R
N
 
N
S
 
S
H
 
N
H
|
H
F
 
Y
A
x
G
A
x
I
L
x
A
W
 
G
P
 
Y
D
 
Y
V
 
A
E
 
L
P
 
M
F
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
M
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
M
V
x
T
N
 
N
S
 
S
M
 
R
T
 
P
C
 
L
V
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
I
R
 
E
P
 
R
L
 
I
F
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
T
A
 
K
E
 
D
G
 
-
G
 
K
P
 
P
I
 
F
V
x
L
F
x
L
D
|
D
L
x
M
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
V
I
 
V
A
x
P
H
 
I
G
 
G
D
 
K
V
 
L
Q
 
E
I
 
W
A
 
A
A
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
D
 
N
S
 
R
L
 
E
G
 
G
Q
 
N
P
 
I
T
 
T
T
 
T
D
 
K
P
 
V
K
 
E
A
 
E
I
 
V
L
 
F
E
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
L
 
G
L
 
E
P
 
L
F
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
H
K
 
K
G
 
G
S
 
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
S
M
 
L
M
 
M
V
 
V
E
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
G
A
 
I
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
T
F
 
W
S
 
S
F
 
-
E
 
-
F
 
-
D
 
K
W
 
Y
K
 
V
N
 
K
H
 
N
P
 
T
G
 
S
A
 
E
K
 
K
T
 
G
P
 
S
W
 
N
T
 
V
G
 
C
Q
 
H
L
 
F
L
 
F
I
 
M
V
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
I
D
 
E
K
 
H
A
 
F
A
 
I
G
 
P
-
 
L
Q
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
K
E
 
E
R
 
K
S
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
M
V
 
I
R
 
E
Q
 
E
M
 
I

Sites not aligning to the query:

1s20G A novel NAD binding protein revealed by the crystal structure of e. Coli 2,3-diketogulonate reductase (yiak) northeast structural genomics consortium target er82 (see paper)
26% identity, 95% coverage: 15:343/346 of query aligns to 2:332/335 of 1s20G

query
sites
1s20G
H
 
K
L
 
V
S
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
F
E
 
N
K
 
R
I
 
V
F
 
L
L
 
I
R
 
S
H
 
R
G
 
G
T
 
V
S
 
D
V
 
S
E
 
E
V
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
N
 
M
C
 
F
A
 
A
C
 
R
A
 
T
E
 
T
R
 
E
D
 
S
G
 
G
A
 
V
H
 
Y
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
F
 
N
R
 
R
I
 
F
P
 
P
G
 
R
Y
 
F
V
 
I
S
 
Q
T
 
Q
L
 
L
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
W
 
D
V
 
I
N
 
I
G
 
P
Q
 
D
A
 
A
V
 
Q
P
 
P
L
 
K
V
 
R
E
 
I
D
 
T
V
 
S
A
 
L
S
 
G
G
 
A
F
 
I
V
 
E
R
 
Q
V
 
W
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
N
 
R
G
 
S
F
 
I
A
 
G
Q
 
N
P
 
L
A
 
T
L
 
A
A
 
K
A
 
K
A
 
M
R
 
M
E
 
D
L
 
R
L
 
A
V
 
I
Q
 
E
K
 
L
A
 
A
R
 
A
S
 
D
A
 
H
G
 
G
I
 
I
A
 
G
V
 
L
L
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
R
N
 
N
S
 
A
H
 
N
H
|
H
F
x
W
A
 
M
A
 
R
L
 
G
W
 
G
P
 
S
D
 
Y
V
 
G
E
 
W
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
A
 
G
L
 
I
S
 
C
V
 
W
V
 
T
N
 
N
S
 
S
M
 
I
T
 
A
C
 
V
V
 
M
V
 
P
P
 
P
H
x
W
G
 
G
A
 
A
D
 
K
R
 
E
P
 
C
L
 
R
F
 
I
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
P
R
 
S
A
 
T
E
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
I
V
 
T
F
x
M
-
x
V
D
|
D
L
x
M
A
x
S
T
 
M
S
 
S
A
 
M
I
 
F
A
 
S
H
 
Y
G
 
G
D
 
M
V
 
L
Q
 
E
I
 
V
A
 
N
A
 
R
R
 
L
E
 
A
G
 
G
E
 
R
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
V
G
 
D
M
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
D
L
 
E
G
 
G
Q
 
N
P
 
L
T
 
T
T
 
K
D
 
E
P
 
P
K
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
E
E
 
K
G
 
N
G
 
R
A
 
R
L
 
I
L
 
L
P
 
P
F
 
M
G
 
G
G
 
Y
H
x
W
K
|
K
G
 
G
S
 
S
A
 
G
L
 
M
S
 
S
M
 
I
M
 
V
V
 
L
E
 
D
L
 
M
L
 
I
A
 
A
A
 
T
A
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
D
G
 
G
N
 
A
F
 
S
S
 
V
F
 
A