SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2989 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2989 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dz4B X-ray crystal structure of a hypothetical agmatinase from burkholderia thailandensis (see paper)
60% identity, 98% coverage: 1:314/319 of query aligns to 4:318/323 of 4dz4B

query
sites
4dz4B
M
 
M
D
 
N
V
 
E
P
 
T
M
 
L
Q
 
Y
N
 
G
D
 
D
Q
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
R
R
 
R
D
 
P
S
 
S
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
S
A
 
I
E
 
E
S
 
N
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
L
S
 
S
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
N
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R
D
 
D
L
 
L
R
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
L
D
 
D
T
 
L
A
 
A
T
 
T
S
 
T
N
 
F
R
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
S
G
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
G
 
Q
I
 
L
A
 
A
W
 
E
E
 
L
R
 
N
H
 
P
W
 
Y
P
 
P
W
 
W
T
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
P
F
 
F
D
 
D
H
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
C
 
C
D
 
W
F
 
F
D
 
D
Y
 
A
G
 
H
S
 
H
P
 
P
Q
 
L
S
 
S
T
 
I
P
 
K
E
 
P
M
 
A
I
 
I
E
 
V
A
 
E
H
 
H
A
 
A
E
 
R
H
 
T
I
 
I
L
 
L
N
 
Q
A
 
S
G
 
D
T
 
A
A
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
A
 
K
-
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
L
I
 
I
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
C
D
|
D
T
 
T
W
 
W
P
 
A
D
 
D
E
 
D
E
 
A
G
 
P
K
 
D
R
 
S
I
 
L
D
 
N
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
W
 
Y
H
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
K
R
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
W
N
 
N
D
 
D
D
 
D
H
 
Y
Q
 
L
G
 
G
F
 
I
E
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
A
Q
 
W
V
 
V
H
 
H
R
 
E
R
 
H
G
 
G
C
 
A
E
 
R
A
 
A
I
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
I
R
 
E
A
 
S
R
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
G
N
 
R
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
T
 
S
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
G
I
 
V
N
 
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
H
L
 
V
A
 
A
M
 
C
E
 
D
M
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Y
 
W
A
 
R
A
 
Q
R
 
R

7lolA The structure of agmatinase from e. Coli at 1.8 a displaying urea and agmatine (see paper)
56% identity, 85% coverage: 44:314/319 of query aligns to 24:293/294 of 7lolA

query
sites
7lolA
D
 
D
V
 
W
A
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
T
 
M
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
G
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
A
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
N
I
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
R
 
H
H
 
N
-
 
R
W
 
F
P
 
P
W
 
W
T
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
M
F
 
R
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Y
 
C
G
 
G
D
 
D
C
 
L
D
 
V
F
 
Y
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
D
P
 
A
Q
 
R
S
 
E
T
 
M
P
 
S
E
 
E
M
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
L
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
K
A
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
F
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
H
H
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
T
D
|
D
T
 
T
W
x
Y
P
 
A
D
 
N
E
 
-
E
 
-
G
 
G
K
 
C
R
 
E
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
W
 
Y
H
 
T
A
 
A
A
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
N
R
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
E
N
 
F
D
 
D
D
 
K
H
 
D
Q
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
C
Q
 
Q
V
 
V
H
 
N
R
 
D
R
 
R
G
 
S
C
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
V
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
Y
L
 
I
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K

P60651 Agmatinase; Agmatine ureohydrolase; AUH; EC 3.5.3.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
56% identity, 85% coverage: 44:314/319 of query aligns to 34:303/306 of P60651

query
sites
P60651
D
 
D
V
 
W
A
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
T
 
M
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
G
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
A
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
N
I
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
R
 
H
H
 
N
-
 
R
W
 
F
P
 
P
W
 
W
T
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
M
F
 
R
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Y
 
C
G
 
G
D
 
D
C
 
L
D
 
V
F
 
Y
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
D
P
 
A
Q
 
R
S
 
E
T
 
M
P
 
S
E
 
E
M
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
L
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
K
A
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
 
H
F
 
F
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
H
H
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
H
 
H
S
 
T
D
 
D
T
 
T
W
 
Y
P
 
A
D
 
N
E
 
-
E
 
-
G
 
G
K
 
C
R
 
E
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
W
 
Y
H
 
T
A
 
A
A
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
N
R
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
E
N
 
F
D
 
D
D
 
K
H
 
D
Q
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
C
Q
 
Q
V
 
V
H
 
N
R
 
D
R
 
R
G
 
S
C
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
D
 
D
I
 
I
D
 
D
C
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
V
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
Y
L
 
I
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K

7lbaB E. Coli agmatinase (see paper)
56% identity, 85% coverage: 44:314/319 of query aligns to 41:310/310 of 7lbaB

query
sites
7lbaB
D
 
D
V
 
W
A
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
T
 
M
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
G
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
A
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
N
I
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
R
 
H
H
 
N
-
 
R
W
 
F
P
 
P
W
 
W
T
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
M
F
 
R
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Y
 
C
G
 
G
D
 
D
C
 
L
D
 
V
F
 
Y
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
D
P
 
A
Q
 
R
S
 
E
T
 
M
P
 
S
E
 
E
M
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
L
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
K
A
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
F
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
H
H
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
T
D
|
D
T
 
T
W
 
Y
P
 
A
D
 
N
E
 
-
E
 
-
G
 
G
K
 
C
R
 
E
I
 
F
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
W
 
Y
H
 
T
A
 
A
A
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
N
R
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
E
N
 
F
D
 
D
D
 
K
H
 
D
Q
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
C
Q
 
Q
V
 
V
H
 
N
R
 
D
R
 
R
G
 
S
C
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
V
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
Y
L
 
I
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K

7loxA The structure of agmatinase from e. Coli at 3.2 a displaying guanidine in the active site (see paper)
55% identity, 85% coverage: 44:314/319 of query aligns to 20:283/284 of 7loxA

query
sites
7loxA
D
 
D
V
 
W
A
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
T
 
A
A
 
-
T
 
-
S
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
G
A
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
A
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
V
S
 
S
A
 
T
G
 
N
I
 
L
A
 
A
W
 
W
E
 
E
R
 
H
H
 
N
-
 
R
W
 
F
P
 
P
W
 
W
T
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
M
F
 
R
D
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Y
 
C
G
 
G
D
 
D
C
 
L
D
 
V
F
 
Y
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
D
P
 
A
Q
 
R
S
 
E
T
 
M
P
 
S
E
 
E
M
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
L
L
 
L
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
K
A
 
R
M
 
M
L
 
L
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
F
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
K
 
H
H
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
M
S
 
A
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
T
D
|
D
T
 
T
W
 
Y
P
 
A
D
 
N
E
 
-
E
 
-
G
 
G
K
 
C
R
 
E
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
M
F
 
F
W
 
Y
H
 
T
A
 
A
A
 
P
R
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
N
R
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
E
N
 
F
D
 
D
D
 
K
H
 
D
Q
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
R
 
C
Q
 
Q
V
 
V
H
 
N
R
 
D
R
 
R
G
 
S
C
 
V
E
 
D
A
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
A
A
 
Q
I
 
V
R
 
K
A
 
Q
R
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
S
V
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
Y
L
 
I
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K

Q9I3S3 Guanidinobutyrase; EC 3.5.3.7 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
44% identity, 90% coverage: 25:310/319 of query aligns to 17:312/319 of Q9I3S3

query
sites
Q9I3S3
Y
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
A
S
 
T
F
 
M
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
H
S
 
V
R
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
A
A
 
A
V
 
F
S
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
L
D
 
D
T
 
I
A
 
G
T
 
T
S
 
S
N
 
L
R
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
E
S
 
S
A
 
V
G
 
M
I
 
I
A
 
R
W
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
P
W
 
Y
T
 
N
F
 
M
D
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
H
 
S
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
A
D
 
D
Y
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
A
F
 
I
D
 
N
Y
 
T
G
 
F
S
 
N
P
 
L
Q
 
L
S
 
E
T
 
A
P
 
V
E
 
R
M
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
H
 
E
A
 
Y
E
 
D
H
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
G
A
 
H
G
 
G
T
 
I
A
 
L
M
 
P
L
 
L
T
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
T
I
 
I
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
I
A
 
K
R
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
K
L
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
A
D
|
D
T
 
V
W
 
N
P
 
D
D
 
H
E
x
M
E
 
F
G
 
G
K
 
E
R
 
K
I
 
I
D
 
A
H
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
T
F
 
F
W
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
D
P
 
C
S
 
D
R
 
R
S
 
V
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
Y
T
 
T
N
 
A
D
 
E
D
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
W
-
 
S
-
 
R
H
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
E
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
V
 
C
H
 
W
R
 
H
R
 
K
G
 
S
C
 
L
E
 
E
A
 
P
I
 
L
V
 
M
E
 
A
A
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
G
N
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
G
 
R
G
 
G
L
 
C
R
 
Q
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
C
D
 
D
V
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
A
 
T
E
 
G
I
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
L
M
 
Y
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
C
L
 
V

3nioA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinobutyrase (see paper)
44% identity, 90% coverage: 25:310/319 of query aligns to 14:309/316 of 3nioA

query
sites
3nioA
Y
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
A
S
 
T
F
 
M
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
H
S
 
V
R
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
A
D
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
A
A
 
A
V
 
F
S
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
L
D
 
D
T
 
I
A
 
G
T
 
T
S
 
S
N
 
L
R
 
R
P
 
S
G
 
G
A
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
E
S
 
S
A
 
V
G
 
M
I
 
I
A
 
R
W
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
P
W
 
Y
T
 
N
F
 
M
D
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
H
 
S
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
A
D
 
D
Y
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
A
F
 
I
D
 
N
Y
 
T
G
 
F
S
 
N
P
 
L
Q
 
L
S
 
E
T
 
A
P
 
V
E
 
R
M
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
H
 
E
A
 
Y
E
 
D
H
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
G
A
 
H
G
 
G
T
 
I
A
 
L
M
 
P
L
 
L
T
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
T
I
 
I
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
I
A
 
K
R
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
K
L
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
V
H
 
H
F
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
A
D
|
D
T
 
V
W
 
N
P
 
D
D
 
H
E
 
M
E
 
F
G
 
G
K
 
E
R
 
K
I
 
I
D
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
T
F
 
F
W
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
D
P
 
C
S
 
D
R
 
R
S
 
V
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
Y
T
 
T
N
 
A
D
 
E
D
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
W
-
 
S
-
 
R
H
 
K
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
E
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
V
 
C
H
 
W
R
 
H
R
 
K
G
 
S
C
 
L
E
 
E
A
 
P
I
 
L
V
 
M
E
 
A
A
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
G
N
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
G
 
R
G
 
G
L
 
C
R
 
Q
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
C
D
 
D
V
 
L
V
 
V
E
|
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
A
 
T
E
 
G
I
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
L
M
 
Y
E
 
E
M
 
M
L
 
L
C
 
C
L
 
V

P0DJQ3 Proclavaminate amidinohydrolase; Proclavaminic acid amidino hydrolase; EC 3.5.3.22 from Streptomyces clavuligerus (see paper)
41% identity, 92% coverage: 25:316/319 of query aligns to 12:310/313 of P0DJQ3

query
sites
P0DJQ3
Y
 
Y
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
H
S
 
D
R
 
P
D
 
Q
L
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
T
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
S
N
 
Y
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
S
A
 
E
S
 
S
A
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
H
G
 
G
I
 
V
A
 
G
W
 
I
E
 
D
R
 
R
H
 
-
W
 
G
P
 
P
W
 
G
T
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
L
F
 
I
D
 
N
H
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
C
I
 
V
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
I
D
 
N
F
 
L
D
 
T
Y
 
P
G
 
F
S
 
D
P
 
M
Q
 
N
S
 
I
T
 
A
P
 
I
E
 
D
M
 
T
I
 
A
E
 
Q
A
 
S
H
 
H
A
 
L
E
 
S
H
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
G
 
N
T
 
A
A
 
A
M
 
F
L
 
L
T
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
S
I
 
L
T
 
T
Y
 
V
P
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
P
L
 
L
S
 
A
L
 
V
I
 
V
H
 
H
F
 
L
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
S
D
|
D
T
 
T
W
 
N
P
 
P
D
 
A
E
 
F
E
 
Y
G
 
G
K
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
H
H
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
P
F
 
F
W
 
R
H
 
H
A
 
G
A
 
I
R
 
D
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
A
R
 
A
S
 
M
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
G
T
 
H
N
 
N
D
 
P
D
 
K
H
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
G
Q
 
H
G
 
G
F
 
V
E
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
T
A
 
A
R
 
D
Q
 
E
V
 
F
H
 
G
R
 
E
R
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
G
A
 
G
I
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
Q
N
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
V
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
A
C
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
S
V
 
R
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
R
G
 
C
L
 
V
R
 
G
G
 
D
I
 
L
N
 
K
L
 
P
V
 
V
G
 
G
M
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
L
Y
 
Y
D
 
D
S
 
H
A
 
G
E
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
T
T
 
E
L
 
I
A
 
G
M
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
C
 
Y
L
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
R
 
A
H
 
H
K
 
R

1gq6B Proclavaminate amidino hydrolase from streptomyces clavuligerus (see paper)
41% identity, 91% coverage: 25:315/319 of query aligns to 4:301/301 of 1gq6B

query
sites
1gq6B
Y
 
Y
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
H
S
 
D
R
 
P
D
 
Q
L
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
S
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
T
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
S
N
 
Y
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
S
A
 
E
S
 
S
A
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
H
G
 
G
I
 
V
A
 
G
W
 
I
E
 
D
R
 
R
H
 
-
W
 
G
P
 
P
W
 
G
T
 
T
F
 
F
D
 
D
P
 
L
F
 
I
D
 
N
H
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
C
I
 
V
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
I
D
 
N
F
 
L
D
 
T
Y
 
P
G
 
F
S
 
D
P
 
M
Q
 
N
S
 
I
T
 
A
P
 
I
E
 
D
M
 
T
I
 
A
E
 
Q
A
 
S
H
 
H
A
 
L
E
 
S
H
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
G
 
N
T
 
A
A
 
A
M
 
F
L
 
L
T
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
S
I
 
L
T
 
T
Y
 
V
P
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
A
H
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
P
L
 
L
S
 
A
L
 
V
I
 
V
H
 
H
F
 
L
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
S
D
|
D
T
 
T
W
 
N
P
 
P
D
 
A
E
 
F
E
 
Y
G
 
G
K
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
H
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
P
F
 
F
W
 
R
H
 
H
A
 
G
A
 
I
R
 
D
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
A
R
 
A
S
 
M
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
G
T
 
H
N
 
N
D
 
P
D
 
K
H
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
G
Q
 
H
G
 
G
F
 
V
E
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
T
A
 
A
R
 
D
Q
 
E
V
 
F
H
 
G
R
 
E
R
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
G
A
 
G
I
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
R
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
Q
N
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
V
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
A
C
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
S
V
 
R
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
R
G
 
C
L
 
V
R
 
G
G
 
D
I
 
L
N
 
K
L
 
P
V
 
V
G
 
G
M
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
|
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
L
Y
 
Y
D
 
D
S
 
H
A
 
G
E
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
L
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
T
T
 
E
L
 
I
A
 
G
M
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
C
 
Y
L
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
R
R
 
A
H
 
H

Q9I6K2 Guanidinopropionase; EC 3.5.3.17 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:312/319 of query aligns to 1:311/318 of Q9I6K2

query
sites
Q9I6K2
M
 
M
Q
 
S
N
 
N
D
 
D
Q
 
H
A
 
P
L
 
Q
T
 
P
R
 
L
D
 
D
S
 
A
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
E
E
 
I
S
 
P
T
 
R
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
A
S
 
F
R
 
T
D
 
D
L
 
P
R
 
A
G
 
A
V
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
V
 
L
S
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
W
D
 
D
T
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
T
N
 
N
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
A
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
-
I
 
L
A
 
M
W
 
R
E
 
K
R
 
V
H
 
H
W
 
H
P
 
V
W
 
S
T
 
R
F
 
I
D
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
H
 
L
L
 
V
A
 
R
V
 
V
I
 
G
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
D
 
D
C
 
A
D
 
P
F
 
V
D
 
N
Y
 
P
G
 
I
S
 
D
P
 
L
Q
 
L
S
 
D
T
 
S
P
 
L
E
 
R
M
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
G
H
 
F
A
 
Y
E
 
R
H
 
Q
I
 
V
L
 
H
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
L
M
 
P
L
 
L
T
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
L
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
F
K
 
R
A
 
A
H
 
L
A
 
G
R
 
R
K
 
E
H
 
R
G
 
-
A
 
P
L
 
L
S
 
G
L
 
M
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
S
D
|
D
T
 
T
W
 
N
P
 
D
D
 
R
E
x
Y
E
 
F
G
 
G
K
 
D
R
 
N
-
 
P
I
 
Y
D
 
T
H
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
P
F
 
F
W
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
L
R
 
R
S
 
T
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
T
 
S
T
 
P
N
 
D
D
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
R
H
 
E
Q
 
C
G
 
G
F
 
I
E
 
R
V
 
V
L
 
I
D
 
H
A
 
M
R
 
E
Q
 
E
V
 
F
H
 
V
R
 
E
R
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
R
R
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
C
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
T
 
S
V
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
F
D
 
D
S
 
V
A
 
G
E
 
G
I
 
A
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
M
M
 
F
E
 
E
M
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Y
 
L
A
 
A

3nipB Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase complexed with 1,6-diaminohexane (see paper)
42% identity, 90% coverage: 25:312/319 of query aligns to 15:309/316 of 3nipB

query
sites
3nipB
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
A
S
 
F
R
 
T
D
 
D
L
 
P
R
 
A
G
 
A
V
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
V
 
L
S
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
W
D
 
D
T
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
T
N
 
N
R
|
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
A
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
-
I
 
L
A
 
M
W
 
R
E
 
K
R
 
V
H
 
H
W
 
H
P
 
V
W
 
S
T
 
R
F
 
I
D
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
H
 
L
L
 
V
A
 
R
V
 
V
I
 
G
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
D
 
D
C
 
A
D
 
P
F
 
V
D
 
N
Y
 
P
G
 
I
S
 
D
P
 
L
Q
 
L
S
 
D
T
 
S
P
 
L
E
 
R
M
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
G
H
 
F
A
 
Y
E
 
R
H
 
Q
I
 
V
L
 
H
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
L
M
 
P
L
 
L
T
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
L
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
F
K
 
R
A
 
A
H
 
L
A
 
G
R
 
R
K
 
E
H
 
R
G
 
-
A
 
P
L
 
L
S
 
G
L
 
M
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
S
D
|
D
T
 
T
W
 
N
P
 
D
D
 
R
E
 
Y
E
 
F
G
 
G
K
 
D
R
 
N
-
 
P
I
 
Y
D
 
T
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
P
F
 
F
W
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
L
R
 
R
S
 
T
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
T
 
S
T
 
P
N
 
D
D
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
R
H
 
E
Q
 
C
G
 
G
F
 
I
E
 
R
V
 
V
L
 
I
D
 
H
A
 
M
R
 
E
Q
 
E
V
 
F
H
 
V
R
 
E
R
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
R
R
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
C
 
V
L
 
L
D
 
D
P
|
P
A
 
A
F
|
F
A
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
T
 
S
V
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
F
D
 
D
S
 
V
A
 
G
E
 
G
I
x
A
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
x
V
A
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
M
M
 
F
E
 
E
M
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Y
 
L
A
 
A

3niqA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase (see paper)
42% identity, 90% coverage: 25:312/319 of query aligns to 14:308/315 of 3niqA

query
sites
3niqA
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
R
 
L
R
 
P
Y
 
A
S
 
F
R
 
T
D
 
D
L
 
P
R
 
A
G
 
A
V
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
V
 
L
S
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
W
D
 
D
T
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
T
N
 
N
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
A
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
-
I
 
L
A
 
M
W
 
R
E
 
K
R
 
V
H
 
H
W
 
H
P
 
V
W
 
S
T
 
R
F
 
I
D
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
H
 
L
L
 
V
A
 
R
V
 
V
I
 
G
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
D
 
D
C
 
A
D
 
P
F
 
V
D
 
N
Y
 
P
G
 
I
S
 
D
P
 
L
Q
 
L
S
 
D
T
 
S
P
 
L
E
 
R
M
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
G
H
 
F
A
 
Y
E
 
R
H
 
Q
I
 
V
L
 
H
N
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
L
M
 
P
L
 
L
T
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
L
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
F
K
 
R
A
 
A
H
 
L
A
 
G
R
 
R
K
 
E
H
 
R
G
 
-
A
 
P
L
 
L
S
 
G
L
 
M
I
 
V
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
S
D
|
D
T
 
T
W
 
N
P
 
D
D
 
R
E
 
Y
E
 
F
G
 
G
K
 
D
R
 
N
-
 
P
I
 
Y
D
 
T
H
|
H
G
 
G
T
 
T
M
 
P
F
 
F
W
 
R
H
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
L
R
 
R
S
 
T
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
T
 
S
T
 
P
N
 
D
D
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
R
H
 
E
Q
 
C
G
 
G
F
 
I
E
 
R
V
 
V
L
 
I
D
 
H
A
 
M
R
 
E
Q
 
E
V
 
F
H
 
V
R
 
E
R
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
R
R
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
A
N
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
C
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T
T
 
S
V
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
I
 
L
L
 
V
G
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
F
D
 
D
S
 
V
A
 
G
E
 
G
I
 
A
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
M
M
 
F
E
 
E
M
 
L
L
 
L
C
 
C
L
 
L
Y
 
L
A
 
A

7esrA Crystal structure of synechocystis sp pcc6803 guanidinium hydrolase (r32) (see paper)
35% identity, 89% coverage: 25:308/319 of query aligns to 54:351/378 of 7esrA

query
sites
7esrA
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
N
S
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
K
R
 
A
R
 
P
Y
 
Y
S
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
R
G
 
E
V
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
I
S
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
H
D
 
D
T
 
S
A
 
G
T
 
T
S
 
T
N
 
Y
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
L
H
 
Y
W
 
T
P
 
P
W
 
Y
T
 
N
F
 
F
-
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
V
D
 
D
P
 
L
F
 
R
D
 
E
H
 
Q
L
 
I
A
 
S
V
 
L
I
 
C
D
 
D
Y
 
V
G
 
G
D
 
D
C
 
I
D
 
F
F
 
T
D
 
I
Y
 
P
G
 
A
S
 
N
P
 
N
Q
 
E
S
 
K
T
 
S
P
 
F
E
 
D
M
 
Q
I
 
I
E
 
S
A
 
K
H
 
G
A
 
I
E
 
A
H
 
H
I
 
I
L
 
F
N
 
S
A
 
S
G
 
G
T
 
A
A
 
F
M
 
P
L
 
I
T
 
I
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
F
 
S
I
 
I
T
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
T
L
 
V
K
 
R
A
 
G
H
 
I
A
 
C
R
 
R
K
 
H
H
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
K
A
 
K
L
 
V
S
 
G
L
 
I
I
 
I
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
R
H
|
H
S
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
Q
P
 
E
D
 
T
E
 
D
E
 
L
G
 
D
K
 
E
R
 
R
I
 
M
D
 
-
H
 
H
G
 
T
T
 
C
M
 
P
F
 
W
W
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
T
R
 
N
E
 
M
G
 
A
L
 
N
V
 
A
D
 
P
P
 
A
S
 
K
R
 
N
S
 
L
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
G
T
 
G
T
 
W
N
 
Q
D
 
V
D
 
P
H
 
R
Q
 
Q
G
 
G
F
 
V
E
 
K
V
 
V
L
 
C
D
 
R
A
 
E
R
 
R
Q
 
A
V
 
T
H
 
N
R
 
I
R
 
L
G
 
T
C
 
V
E
 
T
A
 
D
I
 
I
V
 
T
E
 
E
-
 
M
-
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
A
A
 
I
I
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
T
V
 
D
G
 
G
D
 
T
N
 
D
P
 
C
V
 
V
Y
 
W
L
 
I
T
 
S
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
C
 
C
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
G
F
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
W
P
 
P
V
 
E
C
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
L
T
 
P
V
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
G
 
K
G
 
R
-
 
I
L
 
I
R
 
R
G
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
V
V
 
C
G
 
G
M
 
M
D
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
I
A
 
S
E
 
D
I
 
M
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
M
A
 
A
A
 
T
T
 
R
L
 
V
A
 
I
M
 
C
E
 
D
M
 
T
L
 
M

Q57757 Agmatinase; EC 3.5.3.11 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
33% identity, 83% coverage: 46:310/319 of query aligns to 24:282/284 of Q57757

query
sites
Q57757
A
 
V
V
 
I
S
 
F
G
 
S
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
A
 
T
T
 
T
S
 
S
N
 
F
R
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
E
G
 
G
P
 
G
R
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
W
G
 
G
I
 
L
A
 
-
W
 
-
E
 
E
R
 
T
H
 
Y
W
 
S
P
 
P
W
 
I
T
 
L
F
 
D
D
 
R
P
 
D
F
 
L
D
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
K
V
 
Y
I
x
C
D
 
D
Y
 
L
G
 
K
D
 
D
C
 
L
D
 
D
F
 
L
D
 
-
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
P
 
Q
Q
 
E
S
 
E
T
 
I
P
 
F
E
 
G
M
 
T
I
 
I
E
 
H
A
 
S
H
 
V
A
 
S
E
 
R
H
 
E
I
 
I
L
 
L
N
 
K
A
 
E
G
 
N
T
 
K
A
 
K
M
 
I
L
 
I
T
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
E
H
 
H
F
 
S
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
L
 
I
K
 
K
A
 
A
H
 
V
A
 
K
R
 
D
K
 
I
H
 
Y
G
 
D
A
 
D
L
 
F
S
 
I
L
 
V
I
 
I
H
 
Q
F
 
F
D
 
D
A
 
A
H
 
H
S
x
C
D
 
D
T
 
L
W
 
R
P
 
D
D
 
E
E
 
Y
E
 
L
G
 
G
K
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
S
H
 
H
G
 
A
T
x
C
M
 
V
F
 
M
W
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
R
G
 
V
L
 
Y
V
 
E
D
 
L
P
 
T
S
 
K
R
 
N
S
 
I
V
 
F
Q
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
S
T
 
G
N
 
-
D
 
-
D
 
D
H
 
K
Q
 
E
G
 
E
F
 
W
E
 
D
V
 
L
L
 
A
D
 
R
A
 
K
R
 
N
Q
 
N
V
 
L
H
 
Y
R
 
L
R
 
K
G
 
M
-
 
D
-
 
L
-
 
M
C
 
N
E
 
K
A
 
D
I
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
Y
I
 
I
R
 
K
A
 
S
R
 
L
V
 
-
G
 
-
D
 
D
N
 
K
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
F
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
D
C
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
P
G
x
C
G
 
G
L
 
F
S
 
S
T
 
T
V
 
R
Q
 
E
A
 
L
L
 
F
E
 
N
I
 
S
L
 
L
G
 
Y
G
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
E
I
 
V
-
 
K
-
 
D
N
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
F
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
I
Y
 
Y
D
 
D
S
 
I
A
 
A
E
 
N
I
 
I
T
 
T
S
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
K
L
 
I
A
 
A
M
 
R
E
 
E
M
 
L
L
 
M
C
 
L
L
 
M

3lhlA Crystal structure of a putative agmatinase from clostridium difficile
31% identity, 84% coverage: 44:310/319 of query aligns to 6:269/276 of 3lhlA

query
sites
3lhlA
D
 
N
V
 
L
A
 
I
V
 
V
S
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
G
A
 
T
T
 
T
S
 
S
N
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
P
 
S
R
 
S
G
 
S
I
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
E
S
 
F
A
 
Y
G
 
G
I
 
L
A
 
-
W
 
-
E
 
E
R
 
T
H
 
Y
W
 
S
P
 
P
W
 
F
T
 
L
F
 
D
D
 
L
P
 
D
F
 
L
D
 
E
H
 
D
L
 
Y
A
 
N
V
 
I
I
 
C
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
C
 
L
D
 
E
F
 
I
D
 
S
Y
 
V
G
 
G
S
 
S
P
 
T
Q
 
E
S
 
Q
T
 
V
P
 
L
E
 
K
M
 
E
I
 
I
E
 
Y
A
 
Q
H
 
E
A
 
T
E
 
Y
H
 
K
I
 
I
L
 
V
N
 
R
A
 
D
G
 
S
T
 
K
A
 
V
M
 
P
L
 
F
T
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
E
H
|
H
F
 
L
I
 
V
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
A
H
 
V
A
 
H
R
 
E
K
 
K
H
 
Y
G
 
N
A
 
D
L
 
I
S
 
Y
L
 
V
I
 
I
H
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
S
 
T
D
|
D
T
 
L
W
 
R
P
 
E
D
 
E
E
 
Y
E
 
N
G
 
N
K
 
S
R
 
K
I
 
N
D
 
S
H
|
H
G
 
A
T
 
T
M
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
F
 
I
W
 
W
H
 
D
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
I
V
 
V
D
 
G
P
 
D
S
 
N
R
 
K
S
 
I
V
 
F
Q
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
S
T
 
G
N
 
T
D
 
K
D
 
E
H
 
E
Q
 
F
G
 
K
F
 
F
E
 
A
V
 
T
L
 
E
D
 
E
A
 
K
R
 
H
Q
 
T
V
 
Y
H
 
M
R
 
E
R
 
I
G
 
G
C
 
G
E
 
I
A
 
D
I
 
T
V
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
V
A
 
N
R
 
M
V
 
L
G
 
N
D
 
G
N
 
K
P
 
N
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
F
 
I
D
|
D
I
 
L
D
|
D
C
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
A
A
 
S
F
 
V
A
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
E
C
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
N
T
 
Y
V
 
R
Q
 
E
A
 
F
L
 
Q
E
 
E
I
 
I
L
 
F
G
 
K
G
 
I
L
 
I
R
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
C
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
|
E
V
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
A
 
T
E
 
G
I
 
V
T
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
C
T
 
K
L
 
I
A
 
L
M
 
R
E
 
E
M
 
-
L
 
L
C
 
C
L
 
L

1wogA Crystal structure of agmatinase reveals structural conservation and inhibition mechanism of the ureohydrolase superfamily (see paper)
32% identity, 91% coverage: 21:309/319 of query aligns to 3:296/303 of 1wogA

query
sites
1wogA
A
 
A
E
 
H
S
 
L
T
 
P
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
P
S
 
T
F
 
F
M
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
P
Y
 
L
S
 
V
R
 
Q
-
 
P
-
 
D
-
 
G
D
 
D
L
 
W
R
 
Q
G
 
A
V
 
-
D
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
A
S
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
T
 
I
A
 
A
T
 
L
S
 
G
N
 
F
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
E
A
 
A
S
 
S
A
 
L
G
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
R
H
 
S
W
 
V
P
 
P
W
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
P
F
 
F
D
 
T
H
 
G
L
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
A
 
T
V
 
F
I
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
V
D
 
I
F
 
L
D
 
P
Y
 
S
G
 
L
S
 
E
P
 
P
Q
 
Q
S
 
L
T
 
A
P
 
H
E
 
D
M
 
R
I
 
I
E
 
T
A
 
E
H
 
A
A
 
A
E
 
R
H
 
Q
I
 
V
L
 
R
N
 
G
A
 
R
G
 
C
T
 
R
A
 
V
M
 
P
L