SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_3497 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_3497 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 93% coverage: 12:310/321 of query aligns to 10:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
I
 
M
N
 
S
E
 
T
Y
 
Y
L
 
L
P
 
E
I
 
Q
L
 
E
E
 
L
H
 
D
Q
 
K
G
 
R
F
 
F
H
 
K
L
 
L
I
 
F
L
 
R
A
 
Y
P
 
W
T
 
T
P
 
Q
A
 
P
E
 
A
R
 
Q
A
 
R
E
 
D
A
 
F
I
 
L
A
 
A
H
 
L
H
 
Q
A
 
A
G
 
E
Q
 
S
I
 
I
D
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
R
 
N
G
 
S
P
 
N
L
 
A
G
 
G
L
 
A
Y
 
D
A
 
A
D
 
E
E
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
S
V
 
S
I
 
F
G
 
S
A
x
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
H
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
I
A
 
K
A
 
C
A
 
E
N
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
R
I
 
I
P
 
C
R
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
K
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
K
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
I
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
S
 
K
L
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
D
M
 
C
A
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
Q
x
S
H
 
K
R
 
K
S
 
P
D
 
N
V
 
T
P
 
N
Y
 
Y
T
 
T
F
 
Y
C
 
Y
S
 
G
T
 
S
P
 
V
T
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
L
 
P
G
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
G
R
|
R
A
 
G
S
 
P
V
 
H
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
R
E
|
E
P
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
F
T
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
G
G
 
S
L
 
G
S
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
T
T
 
R
Q
 
K
G
 
V
T
 
M
V
 
A
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
40% identity, 93% coverage: 12:310/321 of query aligns to 12:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
I
 
M
N
 
S
E
 
T
Y
 
Y
L
 
L
P
 
E
I
 
Q
L
 
E
E
 
L
H
 
D
Q
 
K
G
 
R
F
 
F
H
 
K
L
 
L
I
 
F
L
 
R
A
 
Y
P
 
W
T
 
T
P
 
Q
A
 
P
E
 
A
R
 
Q
A
 
R
E
 
D
A
 
F
I
 
L
A
 
A
H
 
L
H
 
Q
A
 
A
G
 
E
Q
 
S
I
 
I
D
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
R
 
N
G
 
S
P
 
N
L
 
A
G
 
G
L
 
A
Y
 
D
A
 
A
D
 
E
E
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
S
V
 
S
I
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
H
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
I
A
 
K
A
 
C
A
 
E
N
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
T
S
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
R
I
 
I
P
 
C
R
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
K
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
K
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
I
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
S
 
K
L
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
D
M
 
C
A
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
Q
x
S
H
 
K
R
 
K
S
 
P
D
 
N
V
 
T
P
 
N
Y
 
Y
T
 
T
F
 
Y
C
 
Y
S
 
G
T
 
S
P
 
V
T
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
A
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
L
 
P
G
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
R
 
R
A
 
G
S
 
P
V
 
H
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
R
E
 
E
P
 
P
K
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
F
T
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
G
S
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
T
T
 
R
Q
 
K
G
 
V
T
 
M
V
 
A
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
37% identity, 83% coverage: 37:304/321 of query aligns to 37:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
L
H
 
E
H
 
K
A
 
V
G
 
K
Q
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
R
x
M
G
x
L
P
 
S
L
 
E
G
 
R
L
 
I
Y
 
D
A
 
Q
D
 
E
E
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
L
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
x
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
H
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
V
R
 
K
C
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
I
 
F
M
 
L
R
 
G
P
 
Y
S
 
E
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
A
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
 
T
H
 
R
R
 
K
S
 
S
D
 
Q
V
 
A
P
 
E
Y
 
K
T
 
E
F
 
L
C
 
G
S
 
A
T
 
E
P
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
A
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
L
 
K
G
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
T
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
T
G
 
A
F
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
D
T
 
T
T
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
T
 
S
L
 
L
S
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
T
P
 
F
E
 
E
A
 
A
T
 
R
Q
 
E
G
 
A
T
 
M
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
S
 
R
G
 
G
Q
 
E

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
41% identity, 77% coverage: 64:310/321 of query aligns to 58:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
A
 
A
L
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
I
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
H
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
C
 
H
S
 
P
T
 
T
P
 
L
T
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
L
 
A
G
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
G
R
|
R
A
 
G
S
 
S
V
 
T
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
V
 
V
I
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
T
 
R
Q
 
N
G
 
A
T
 
M
V
 
S
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
T
Q
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
41% identity, 77% coverage: 64:310/321 of query aligns to 58:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
A
 
A
L
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
I
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
H
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
C
 
H
S
 
P
T
 
T
P
 
L
T
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
L
 
A
G
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
A
 
G
S
 
S
V
 
T
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
V
 
V
I
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
T
 
R
Q
 
N
G
 
A
T
 
M
V
 
S
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
T
Q
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
41% identity, 77% coverage: 64:310/321 of query aligns to 60:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
A
 
A
L
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
I
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
H
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
C
 
H
S
 
P
T
 
T
P
 
L
T
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
L
 
A
G
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
A
 
G
S
 
S
V
 
T
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
V
 
V
I
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
T
 
R
Q
 
N
G
 
A
T
 
M
V
 
S
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
T
Q
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
41% identity, 77% coverage: 64:310/321 of query aligns to 59:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
A
 
A
L
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
L
I
 
L
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
E
A
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
I
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
-
N
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
M
 
V
A
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
H
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
T
 
T
F
 
Y
C
 
H
S
 
P
T
 
T
P
 
L
T
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
L
 
A
G
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
K
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
F
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
A
 
G
S
 
S
V
 
T
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
N
E
|
E
P
 
P
K
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
V
 
V
I
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
x
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
T
x
R
Q
 
N
G
 
A
T
 
M
V
 
S
E
 
D
M
 
L
V
 
V
G
 
V
K
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
T
Q
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
38% identity, 83% coverage: 37:304/321 of query aligns to 36:314/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
L
H
 
E
H
 
K
A
 
V
G
 
K
Q
 
D
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
L
P
 
S
L
 
E
G
 
K
L
 
I
Y
 
D
A
 
R
D
 
E
E
 
V
I
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
V
R
 
K
C
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
M
-
 
F
M
 
L
R
 
G
P
 
Y
S
 
D
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
A
R
|
R
Q
x
S
H
 
R
R
x
K
S
 
P
D
 
E
V
 
A
P
 
E
Y
 
K
T
 
E
F
 
L
C
 
G
S
 
A
T
 
E
P
 
F
T
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
L
 
K
G
x
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
R
T
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
T
G
 
A
F
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
D
T
 
T
T
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
T
 
A
L
 
L
S
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
T
P
 
F
E
 
G
A
 
A
T
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
M
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
S
 
N
G
 
G
Q
 
E

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
38% identity, 83% coverage: 37:304/321 of query aligns to 37:315/334 of O58320

query
sites
O58320
E
 
E
A
 
I
I
 
L
A
 
L
H
 
K
H
 
K
A
 
V
G
 
K
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
L
P
 
S
L
 
E
G
 
R
L
 
I
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
E
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
L
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
T
S
 
D
S
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
V
R
 
K
C
 
G
D
 
D
A
 
R
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
I
 
F
M
 
L
R
 
G
P
 
Y
S
 
D
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
A
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
x
T
H
 
R
R
 
K
S
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
E
Y
 
R
T
 
E
F
 
L
C
 
N
S
 
A
-
 
E
-
 
F
T
 
K
P
 
P
T
 
L
E
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
L
 
R
G
 
E
T
 
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
T
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
N
 
T
G
 
A
F
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
D
T
 
T
T
 
N
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
x
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
G
A
 
A
T
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
M
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
S
 
R
G
 
G
Q
 
E

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
38% identity, 83% coverage: 37:304/321 of query aligns to 37:315/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
E
 
E
A
 
I
I
 
L
A
 
L
H
 
K
H
 
K
A
 
V
G
 
K
Q
 
E
I
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
L
P
 
S
L
 
E
G
 
R
L
 
I
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
E
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
L
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
S
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
H
I
 
V
P
 
V
R
 
K
C
 
G
D
 
D
A
 
R
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
I
 
F
M
 
L
R
 
G
P
 
Y
S
 
D
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
-
N
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
N
M
 
M
A
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
x
T
H
 
R
R
 
K
S
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
E
Y
 
R
T
 
E
F
 
L
C
 
N
S
 
A
-
 
E
-
 
F
T
 
K
P
 
P
T
 
L
E
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
L
 
R
G
 
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
T
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
N
 
T
G
 
A
F
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
D
T
 
T
T
 
N
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
G
A
 
A
T
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
M
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
S
 
R
G
 
G
Q
 
E

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
31% identity, 90% coverage: 16:303/321 of query aligns to 14:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
I
P
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
K
H
 
D
Q
 
A
G
 
G
F
 
L
H
 
E
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
E
P
 
E
T
 
Y
P
 
P
A
 
D
E
 
E
R
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
R
I
 
L
A
 
V
H
 
E
H
 
L
A
 
V
G
 
K
Q
 
D
I
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
K
L
 
P
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
R
D
 
R
E
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
L
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
K
I
 
V
I
 
I
C
 
A
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
N
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
V
T
 
V
N
 
N
G
 
A
A
 
P
G
 
A
V
 
A
N
x
S
A
 
S
S
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
A
M
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
F
A
 
S
L
 
V
V
 
A
R
 
R
D
 
K
I
 
I
P
 
A
R
 
F
C
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
K
V
 
M
R
 
R
R
 
E
G
 
G
E
 
V
W
 
W
P
 
A
K
 
K
-
 
K
-
 
E
I
 
A
M
 
M
R
 
G
P
 
I
S
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
-
A
 
I
A
 
A
N
 
N
G
 
A
F
 
L
D
 
G
M
 
M
A
 
N
V
 
I
-
 
L
-
 
L
-
x
Y
-
x
D
S
x
P
Y
 
Y
H
 
P
N
 
N
R
 
E
Q
 
E
H
 
R
R
 
A
S
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
N
Y
 
G
T
 
K
F
 
F
C
 
V
S
 
D
T
 
L
P
 
E
T
 
T
E
 
-
L
 
L
A
 
L
R
 
K
A
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
V
L
 
V
I
 
T
V
 
I
A
 
H
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
V
L
 
E
G
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
K
T
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
N
 
T
G
 
A
F
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
S
R
|
R
A
 
G
S
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
D
T
 
T
T
 
N
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
K
 
L
V
 
P
P
 
K
D
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
K
 
T
T
 
K
L
 
F
S
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
E
G
 
R
T
 
A
V
 
G
E
 
V
M
 
E
V
 
V
G
 
A
K
 
E
N
 
K
L
 
V
V
 
V
A
 
K
F
 
I
F
 
L
S
 
K
G
 
G

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
32% identity, 78% coverage: 59:309/321 of query aligns to 71:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
A
 
A
D
 
D
E
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
H
L
 
L
P
 
P
N
 
S
-
 
S
L
 
L
K
 
K
I
 
V
I
 
F
C
 
A
V
 
A
I
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
E
 
D
H
 
W
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
A
 
N
N
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
A
V
 
F
T
 
A
N
 
N
G
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
x
G
A
 
D
S
 
T
S
 
A
V
x
T
A
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
L
A
 
Y
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
V
V
 
F
R
 
R
D
 
L
I
 
A
P
 
S
R
 
Y
C
 
S
D
 
E
A
 
R
A
 
A
V
 
A
R
 
R
R
 
T
G
 
G
E
 
D
W
 
P
P
 
E
K
 
T
I
 
F
M
 
N
R
 
R
P
 
V
S
 
H
L
 
L
A
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
R
G
 
G
K
 
H
R
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
|
A
V
x
I
G
 
Q
M
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
V
N
 
H
G
 
G
F
 
L
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
L
S
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
D
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
D
R
 
A
Q
 
E
H
 
T
R
 
E
S
 
K
D
 
A
V
 
L
P
 
G
Y
 
A
T
 
E
F
 
R
C
 
V
S
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
R
S
 
S
D
 
D
F
 
C
L
 
V
I
 
S
V
 
V
A
 
S
T
x
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
L
 
K
G
 
L
T
|
T
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
F
L
 
F
D
 
A
T
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
S
F
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
S
T
 
Q
T
 
D
D
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
D
 
E
A
 
F
E
|
E
P
 
P
K
 
Q
V
 
V
P
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
K
 
I
T
 
E
L
 
M
S
 
K
N
 
H
V
 
V
I
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
T
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
|
G
L
 
V
S
 
A
P
 
I
E
 
E
A
 
T
T
 
F
Q
 
H
G
 
E
T
 
F
V
 
E
E
 
R
M
 
L
V
 
T
G
 
M
K
 
T
N
 
N
L
 
I
V
 
D
A
 
R
F
 
F
-
 
L
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P

2gsdA NAD-dependent formate dehydrogenase from bacterium moraxella sp.C2 in complex with NAD and azide (see paper)
30% identity, 90% coverage: 19:306/321 of query aligns to 63:361/399 of 2gsdA

query
sites
2gsdA
L
 
L
E
 
E
H
 
S
Q
 
Q
G
 
G
F
 
H
H
 
E
L
 
L
I
 
V
L
 
V
A
 
T
P
 
S
T
 
S
P
 
K
A
 
D
E
 
G
R
 
P
A
 
D
E
 
S
A
 
E
I
 
L
A
 
E
H
 
K
H
 
H
A
 
L
G
 
H
Q
 
D
I
 
A
D
 
E
A
 
V
V
 
I
L
 
I
T
 
S
R
 
Q
-
x
P
-
x
F
G
 
W
P
 
P
L
 
A
G
 
Y
L
 
L
Y
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
K
I
 
L
I
 
A
C
 
L
V
 
T
I
 
A
G
 
G
A
x
I
G
 
G
Y
 
S
E
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
D
R
 
N
G
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
V
T
 
A
N
 
E
G
 
V
A
 
T
G
 
Y
V
 
C
N
|
N
A
 
S
S
 
N
S
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
H
 
H
A
 
V
M
 
V
A
 
M
L
 
M
L
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
N
-
 
Y
I
 
I
P
 
P
R
 
S
C
 
H
D
 
D
A
 
W
A
 
A
V
 
-
R
 
R
R
 
N
G
 
G
E
 
G
W
 
W
-
 
N
-
 
I
-
 
A
P
 
D
K
 
C
I
 
V
M
 
A
R
 
R
P
 
S
-
 
Y
S
 
D
L
 
V
A
 
E
G
 
G
K
 
M
R
 
H
L
 
V
G
 
G
I
 
T
L
 
V
G
x
A
L
 
A
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
L
K
 
R
R
 
L
A
 
L
A
 
A
N
 
P
G
 
-
F
 
F
D
 
D
M
 
M
A
 
H
V
 
L
S
 
H
Y
 
Y
H
 
T
N
x
D
R
|
R
Q
 
-
H
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
E
S
 
K
D
 
E
V
 
L
P
 
N
Y
 
L
T
 
T
F
 
W
C
 
H
S
 
A
T
 
T
P
 
R
T
 
E
E
 
D
L
 
M
A
 
Y
R
 
G
A
 
A
S
 
C
D
 
D
F
 
V
L
 
V
I
 
T
V
 
L
A
 
N
T
 
C
P
|
P
G
 
L
G
x
H
L
 
P
G
 
E
T
|
T
R
 
E
H
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
D
A
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
K
T
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
N
 
G
G
 
A
F
 
Y
I
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
K
V
 
L
I
 
C
V
 
D
T
 
R
T
 
D
D
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
S
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
D
 
F
A
 
P
E
x
Q
P
 
P
K
 
A
V
 
P
P
 
N
D
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
W
K
 
R
T
 
T
L
 
M
S
 
P
N
 
H
V
 
N
I
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
S
G
|
G
L
 
T
S
 
S
P
 
L
E
 
S
A
 
A
T
 
Q
Q
 
T
G
 
R
T
 
Y
V
 
A
E
 
A
M
 
G
V
 
T
G
 
R
K
 
E
N
 
I
L
 
L
V
 
E
A
 
C
F
 
Y
F
 
F
S
 
E
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
32% identity, 80% coverage: 47:304/321 of query aligns to 49:310/533 of O43175

query
sites
O43175
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
x
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
 
P
Q
 
I
H
 
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
 
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
A
x
G
G
x
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
D
F
 
M
F
 
V
S
 
K
G
 
G
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
30% identity, 89% coverage: 18:303/321 of query aligns to 18:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
V
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
 
I
H
 
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
x
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
D
F
 
M
F
 
V
S
 
K
G
 
G

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
31% identity, 83% coverage: 18:285/321 of query aligns to 16:285/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
V
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
H
x
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
30% identity, 88% coverage: 18:298/321 of query aligns to 14:296/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
 
R
V
x
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
H
x
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
|
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
30% identity, 88% coverage: 18:298/321 of query aligns to 16:298/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
|
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
H
 
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
A
x
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
30% identity, 88% coverage: 18:298/321 of query aligns to 17:299/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
|
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
 
P
Q
 
I
H
 
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
30% identity, 88% coverage: 18:298/321 of query aligns to 17:299/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
I
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
D
Q
 
G
G
 
G
F
 
L
H
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
E
A
 
K
P
 
Q
T
 
N
P
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
L
A
 
I
H
 
A
H
 
E
A
 
L
G
 
Q
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
Q
C
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
I
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
A
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
 
R
V
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
A
 
Q
N
 
S
G
 
-
F
 
F
D
 
G
M
 
M
A
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
H
x
I
R
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
T
 
S
F
 
F
C
 
G
S
 
V
T
 
Q
P
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
L
T
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
A
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
 
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
L
 
P
G
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
A
 
N
V
 
T
L
 
F
D
 
A
T
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
F
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
S
 
G
V
 
I
I
 
V
V
 
D
T
 
E
T
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
T
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
Q
Q
 
S
G
 
R
T
 
C
V
 
G
E
 
E
M
 
E
V
 
I
G
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V

Query Sequence

>PfGW456L13_3497 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_3497
MPVTVLVLVETINEYLPILEHQGFHLILAPTPAERAEAIAHHAGQIDAVLTRGPLGLYAD
EIAALPNLKIICVIGAGYEHVDLQAAANRGITVTNGAGVNASSVADHAMALLLALVRDIP
RCDAAVRRGEWPKIMRPSLAGKRLGILGLGAVGMAIAKRAANGFDMAVSYHNRQHRSDVP
YTFCSTPTELARASDFLIVATPGGLGTRHLINKAVLDTLGPNGFIVNIARASVIVTTDLI
SALEQRRIAGAALDVFDAEPKVPDALKTLSNVILTPHVAGLSPEATQGTVEMVGKNLVAF
FSGQPVLTPIELPSAQSQLAH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory