SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_3595 Citrate-sodium symport to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 4 hits to proteins with known functional sites (download)

5a1sD Crystal structure of the sodium-dependent citrate symporter secits form salmonella enterica. (see paper)
31% identity, 95% coverage: 25:448/448 of query aligns to 3:432/434 of 5a1sD

query
sites
5a1sD
S
 
D
L
 
L
C
 
L
A
 
R
Y
 
F
E
 
K
I
 
I
G
 
F
V
 
G
I
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
G
 
F
I
 
A
A
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
H
H
 
F
L
 
Y
G
 
N
F
 
A
L
 
I
P
 
P
K
 
T
N
 
D
M
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
L
I
 
M
M
 
F
T
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
A
F
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
M
 
I
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
-
 
N
K
 
K
E
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
A
 
P
I
 
V
L
 
M
C
 
I
L
 
F
M
 
L
L
 
V
P
 
A
S
 
A
I
 
Y
L
 
F
V
 
V
F
 
Y
Y
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
Q
A
 
K
T
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
I
K
 
S
M
 
N
L
 
V
M
 
M
K
 
D
E
 
K
A
 
S
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
F
 
L
V
 
F
I
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
S
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
K
I
 
L
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
G
 
S
M
 
L
L
 
L
R
 
G
M
 
Y
F
 
I
I
 
P
P
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
T
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
S
A
 
L
S
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
C
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
S
 
P
F
 
V
H
 
D
H
 
R
T
 
I
F
 
M
F
 
M
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
V
 
L
P
 
P
I
|
I
I
x
M
G
|
G
G
 
G
G
 
G
I
 
N
G
 
G
E
 
A
G
 
G
I
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
H
A
 
S
I
 
V
L
 
T
G
 
G
G
 
R
T
 
S
P
 
R
D
 
E
I
 
E
Y
 
Y
V
 
Y
A
 
S
Q
 
T
L
 
A
A
 
I
P
 
A
A
 
I
A
 
L
V
 
T
V
 
I
G
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
I
C
 
F
A
 
A
G
 
A
Y
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
M
L
 
V
A
 
G
L
 
K
K
 
K
R
 
Y
P
 
T
T
 
W
I
 
L
N
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
S
 
E
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
F
K
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
D
D
 
D
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
E
D
 
K
T
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
V
 
T
D
 
H
F
 
-
R
 
R
V
 
E
M
 
T
G
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
V
V
 
L
I
 
S
C
 
T
A
 
T
F
 
C
F
 
F
V
 
L
L
 
L
G
 
A
G
 
Y
L
 
V
L
 
V
E
 
A
K
 
K
V
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
G
V
 
V
G
 
S
I
 
I
P
 
H
G
 
Y
P
 
F
V
 
A
M
 
W
M
 
M
I
 
V
L
 
L
A
 
I
A
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
L
K
 
N
Y
 
A
L
 
S
R
 
G
V
 
L
L
 
C
P
 
S
E
 
P
K
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
S
 
R
F
 
L
Y
 
S
K
 
D
L
 
F
V
 
F
S
 
S
S
 
K
A
 
Q
F
 
L
I
x
L
W
 
W
P
 
V
V
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
M
 
V
L
 
C
Y
 
Y
V
 
T
P
 
D
L
 
L
D
 
Q
S
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
D
V
 
A
F
 
L
S
 
T
V
 
F
G
 
A
Y
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
I
C
 
A
V
 
A
S
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
F
 
A
F
 
I
I
 
G
G
 
G
N
 
W
L
 
L
M
 
I
K
 
G
M
 
F
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
S
I
 
I
V
 
T
T
 
A
-
 
G
C
 
L
C
|
C
H
x
M
S
x
A
G
x
N
L
 
R
G
|
G
G
|
G
T
x
S
G
 
G
D
|
D
V
 
L
A
 
E
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
C
N
 
N
R
 
R
M
 
M
S
 
N
L
 
L
M
 
I
P
 
S
F
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
T
x
S
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
I
T
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
V
L
 
F
R
 
S
L
 
M
F
 
M
V
 
V

5x9rA Structural insights into the elevator-like mechanism of the sodium/citrate symporter cits (see paper)
30% identity, 92% coverage: 34:443/448 of query aligns to 6:412/416 of 5x9rA

query
sites
5x9rA
I
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
G
 
F
I
 
A
A
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
H
H
 
F
L
 
Y
G
 
N
F
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
T
N
 
D
M
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
I
I
 
M
M
 
F
T
 
I
M
 
I
G
 
G
V
 
A
F
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
M
 
I
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
-
 
N
K
 
K
E
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
A
 
P
I
 
V
L
 
M
C
 
I
L
 
F
M
 
L
L
 
V
P
 
A
S
 
A
I
 
Y
L
 
F
V
 
V
F
 
Y
Y
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
Q
A
 
K
T
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
I
K
 
S
M
 
N
L
 
V
M
 
M
K
 
D
E
 
K
A
 
S
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
F
 
L
V
 
F
I
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
x
A
I
 
I
L
 
L
G
 
S
M
x
V
S
 
N
R
 
R
F
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
G
 
S
M
 
L
L
 
L
R
 
G
M
 
Y
F
 
I
I
 
P
P
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
S
A
 
I
S
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
V
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
S
 
P
F
 
V
H
 
D
H
 
R
T
 
I
F
 
M
F
 
M
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
V
 
L
P
 
P
I
 
I
I
 
M
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
x
N
G
 
G
E
 
A
G
 
G
I
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
H
A
 
S
I
 
V
L
 
T
G
 
G
G
 
R
T
 
S
P
 
R
D
 
E
I
 
E
Y
 
Y
V
 
Y
A
 
S
Q
 
T
L
 
A
A
 
I
P
 
A
A
 
I
A
 
L
V
 
T
V
 
I
G
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
C
 
F
A
 
A
G
 
A
Y
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
K
K
 
K
R
 
H
P
 
T
T
 
W
I
 
L
N
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
S
x
E
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
N
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
E
D
 
K
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
V
 
T
D
 
H
F
 
-
R
 
R
V
 
E
M
 
T
G
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
V
V
 
L
I
 
S
C
 
T
A
 
T
F
 
C
F
 
F
V
 
L
L
 
L
G
 
A
G
 
Y
L
 
V
L
 
V
E
 
A
K
 
K
V
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
I
P
 
H
G
 
Y
P
 
F
V
 
A
M
 
W
M
 
M
I
 
V
L
 
L
A
 
I
A
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
L
K
 
N
Y
 
A
L
 
S
R
 
G
V
 
L
L
 
C
P
 
S
E
 
P
K
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
S
 
R
F
 
L
Y
 
S
K
 
D
L
 
F
V
 
F
S
 
S
S
 
K
A
 
Q
F
 
L
I
 
L
W
 
W
P
 
V
V
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
M
 
V
L
 
C
Y
|
Y
V
 
T
P
 
D
L
 
L
D
 
Q
S
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
N
V
 
A
F
 
I
S
 
T
V
 
F
G
 
A
Y
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
I
C
 
A
V
 
A
S
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
G
G
 
A
F
 
A
F
 
I
I
 
G
G
 
G
N
 
W
L
 
L
M
 
M
K
 
G
M
 
F
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
T
T
 
A
-
 
G
C
 
L
C
 
C
H
 
M
S
 
A
G
 
N
L
x
R
G
 
G
G
|
G
T
x
S
G
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
E
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
C
N
 
N
R
 
R
M
 
M
S
x
N
L
 
L
M
 
I
P
 
S
F
x
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
T
 
S
R
|
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
I
T
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
V

5xarD Structural insights into the elevator-like mechanism of the sodium/citrate symporter cits (see paper)
28% identity, 96% coverage: 21:448/448 of query aligns to 1:411/411 of 5xarD

query
sites
5xarD
Q
 
K
R
 
G
L
 
V
R
 
S
S
 
D
L
 
L
C
 
L
A
 
G
Y
 
F
E
 
K
I
 
I
G
 
F
V
 
G
I
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
G
 
F
I
 
A
A
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
H
H
 
F
L
 
Y
G
 
N
F
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
T
N
 
D
M
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
I
I
 
M
M
 
F
T
 
I
M
 
I
G
 
G
V
 
A
F
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
M
 
I
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
-
 
N
K
 
K
E
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
A
 
P
I
 
V
L
 
M
C
 
I
L
 
F
M
 
L
L
 
V
P
 
A
S
 
A
I
 
Y
L
 
F
V
 
V
F
 
Y
Y
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
Q
A
 
K
T
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
I
K
 
S
M
 
N
L
 
V
M
 
M
K
 
D
E
 
K
A
 
S
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
F
 
L
V
 
F
I
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
S
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
G
 
S
M
 
L
L
 
L
R
 
G
M
 
Y
F
 
I
I
 
P
P
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
S
A
 
I
S
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
V
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
S
 
P
F
 
V
H
 
D
H
 
R
T
 
I
F
 
M
F
 
M
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
V
 
L
P
 
P
I
|
I
I
x
M
G
|
G
G
 
G
G
 
G
I
 
N
G
 
G
E
 
A
G
 
G
I
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
H
A
 
S
I
 
V
L
 
T
G
 
G
G
 
R
T
 
S
P
 
R
D
 
E
I
 
E
Y
 
Y
V
 
Y
A
 
S
Q
 
T
L
 
A
A
 
I
P
 
A
A
 
I
A
x
L
V
 
T
V
 
I
G
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
C
 
F
A
 
A
G
 
A
Y
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
K
K
 
K
R
 
H
P
 
T
T
 
W
I
 
I
N
 
T
G
 
H
E
 
R
G
 
E
S
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
G
A
 
L
K
 
V
D
 
L
E
 
S
N
 
T
D
 
T
Q
 
C
F
 
F
L
 
L
V
 
L
K
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
-
C
 
-
A
 
A
F
 
Y
F
 
V
V
 
V
L
 
A
G
 
K
G
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
P
K
 
S
V
 
I
-
 
G
-
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
I
P
 
H
G
 
Y
P
 
F
V
 
A
M
 
W
M
 
M
I
 
V
L
 
L
A
 
I
A
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
L
K
 
N
Y
 
A
L
 
S
R
 
G
V
 
L
L
 
C
P
 
S
E
 
P
K
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
S
 
R
F
 
L
Y
 
S
K
 
D
L
 
F
V
 
F
S
 
S
S
 
K
A
 
Q
F
 
L
I
 
L
W
 
W
P
 
V
V
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
M
 
V
L
 
C
Y
 
Y
V
 
T
P
 
D
L
 
L
D
 
Q
S
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
N
V
 
A
F
 
I
S
 
T
V
 
F
G
 
A
Y
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
I
C
 
A
V
 
A
S
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
G
G
 
A
F
 
A
F
 
I
I
 
G
G
 
G
N
 
W
L
 
L
M
 
M
K
 
G
M
 
F
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
T
T
 
A
-
 
G
C
 
L
C
 
C
H
x
M
S
x
A
G
x
N
L
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
E
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
C
N
 
N
R
 
R
M
 
M
S
 
N
L
 
L
M
 
I
P
 
S
F
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
T
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
I
T
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
V
L
 
F
R
 
G
L
 
M
F
 
M
V
 
I

5xasB Structural insights into the elevator-like mechanism of the sodium/citrate symporter cits (see paper)
28% identity, 95% coverage: 25:448/448 of query aligns to 2:407/407 of 5xasB

query
sites
5xasB
S
 
D
L
 
L
C
 
L
A
 
G
Y
 
F
E
 
K
I
 
I
G
 
F
V
 
G
I
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
G
 
F
I
 
A
A
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
L
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
H
H
 
F
L
 
Y
G
 
N
F
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
T
N
 
D
M
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
A
V
 
I
I
 
M
M
 
F
T
 
I
M
 
I
G
 
G
V
 
A
F
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
M
 
I
G
 
G
S
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
-
 
N
K
 
K
E
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
A
 
P
I
 
V
L
 
M
C
 
I
L
 
F
M
 
L
L
 
V
P
 
A
S
 
A
I
 
Y
L
 
F
V
 
V
F
 
Y
Y
 
A
G
 
G
F
 
I
F
 
F
G
 
T
P
 
Q
A
 
K
T
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
I
K
 
S
M
 
N
L
 
V
M
 
M
K
 
D
E
 
K
A
 
S
N
 
N
F
 
F
L
 
L
Y
 
N
F
 
L
V
 
F
I
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
S
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
G
 
S
M
 
L
L
 
L
R
 
G
M
 
Y
F
 
I
I
 
P
P
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
S
A
 
I
S
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
V
V
 
F
G
 
G
Y
 
I
S
 
P
F
 
V
H
 
D
H
 
R
T
 
I
F
 
M
F
 
M
F
 
L
I
 
Y
I
 
V
V
 
L
P
 
P
I
|
I
I
x
M
G
|
G
G
 
G
G
 
G
I
 
N
G
 
G
E
 
A
G
 
G
I
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
H
A
 
S
I
 
V
L
 
T
G
 
G
G
 
R
T
 
S
P
 
R
D
 
E
I
 
E
Y
 
Y
V
 
Y
A
 
S
Q
 
T
L
 
A
A
 
I
P
 
A
A
 
I
A
 
L
V
 
T
V
 
I
G
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
C
 
F
A
 
A
G
 
A
Y
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
-
K
 
K
R
 
K
P
 
H
T
 
T
I
 
I
N
 
T
G
 
H
E
 
R
G
 
E
S
 
T
L
 
A
I
 
V
R
 
G
A
 
L
K
 
V
D
 
L
E
 
S
N
 
T
D
 
T
Q
 
C
F
 
F
L
 
L
V
 
L
K
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
-
C
 
-
A
 
A
F
 
Y
F
 
V
V
 
V
L
 
A
G
 
K
G
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
P
K
 
S
V
 
I
-
 
G
-
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
I
P
 
H
G
 
Y
P
 
F
V
 
A
M
 
W
M
 
M
I
 
V
L
 
L
A
 
I
A
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
L
K
 
N
Y
 
A
L
 
S
R
 
G
V
 
L
L
 
C
P
 
S
E
 
P
K
 
E
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
S
 
R
F
 
L
Y
 
S
K
 
D
L
 
F
V
 
F
S
 
S
S
 
K
A
 
Q
F
 
L
I
x
L
W
 
W
P
 
V
V
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
G
M
 
V
L
 
C
Y
 
Y
V
 
T
P
 
D
L
 
L
D
 
Q
S
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
N
V
 
A
F
 
I
S
 
T
V
 
F
G
 
A
Y
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
I
C
 
A
V
 
A
S
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
G
M
 
A
T
 
V
V
 
L
A
 
G
G
 
A
F
 
A
F
 
I
I
 
G
G
 
G
N
 
W
L
 
L
M
 
M
K
 
G
M
 
F
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
T
T
 
A
-
 
G
C
 
L
C
 
C
H
x
M
S
x
A
G
x
N
L
 
R
G
 
G
G
|
G
T
x
S
G
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
E
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
C
N
 
N
R
 
R
M
 
M
S
 
N
L
 
L
M
 
I
P
 
S
F
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
T
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
I
T
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
V
L
 
F
R
 
G
L
 
M
F
 
M
V
 
I

Query Sequence

>PfGW456L13_3595 Citrate-sodium symport
MNKPYEQSLKIETASDGGFVQRLRSLCAYEIGVIPLPIFLGIAVIVYLSAHLGFLPKNMI
GGLAVIMTMGVFFGQMGSRLPILKEIGGGAILCLMLPSILVFYGFFGPATIDATKMLMKE
ANFLYFVIASLVVGSILGMSRFILVQGMLRMFIPLLVGTLAAVASGLIVGKLVGYSFHHT
FFFIIVPIIGGGIGEGILPLSLAYSAILGGTPDIYVAQLAPAAVVGNIVAIICAGYLARL
ALKRPTINGEGSLIRAKDENDQFLVKEDTGTIVDFRVMGAGVLVICAFFVLGGLLEKVVG
IPGPVMMILAAVLFKYLRVLPEKLEKGANSFYKLVSSAFIWPVMIGLGMLYVPLDSVVKV
FSVGYVLVCVSVVVSMTVAGFFIGNLMKMYPIESAIVTCCHSGLGGTGDVAILSASNRMS
LMPFAQISTRIGGASTVILATILLRLFV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory