SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_3775 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_3775 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

P0AAF1 Putrescine transporter PotE; Putrescine-proton symporter / putrescine-ornithine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
67% identity, 93% coverage: 1:430/461 of query aligns to 1:432/439 of P0AAF1

query
sites
P0AAF1
M
 
M
S
 
S
V
 
Q
A
 
A
K
 
K
-
 
S
-
 
N
K
 
K
M
 
M
S
 
G
V
 
V
G
 
V
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
M
V
 
V
N
 
N
M
 
M
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
M
L
 
L
P
 
P
T
 
T
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
T
I
 
I
S
 
S
I
 
I
L
 
I
S
 
S
W
 
W
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
W
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
K
C
|
C
G
 
G
M
 
M
L
 
F
S
 
S
R
 
R
K
|
K
T
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
Y
|
Y
T
 
A
F
 
F
G
 
G
K
|
K
A
 
S
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
I
 
M
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
T
 
T
Y
|
Y
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
A
I
 
I
T
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
G
Q
 
T
V
 
E
L
 
L
F
 
L
G
 
G
I
 
A
E
 
S
L
 
L
D
 
S
S
 
P
L
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
G
L
 
V
L
 
L
W
 
W
I
 
I
T
 
C
T
 
T
F
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
R
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
G
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
W
 
W
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
G
V
 
L
S
 
C
T
 
I
V
 
I
G
 
G
W
 
W
F
 
F
W
 
W
F
 
F
D
 
S
S
 
P
S
 
T
V
 
L
Y
 
Y
A
 
V
A
 
D
G
 
S
W
 
W
N
 
N
P
 
P
H
 
H
D
 
H
K
 
A
G
 
P
W
 
F
F
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
M
T
 
T
L
 
L
W
|
W
A
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
C
|
C
A
 
A
N
 
N
T
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
V
E
 
E
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
I
 
I
F
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
P
N
 
N
E
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
M
 
M
F
 
F
T
 
T
P
 
P
M
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
K
I
 
V
V
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
L
M
 
M
V
 
V
L
 
M
A
 
S
C
|
C
I
x
C
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
W
|
W
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Y
 
F
K
|
K
S
 
S
S
 
S
A
 
S
D
 
D
T
 
E
G
 
G
Y
|
Y
F
 
F
L
 
P
P
 
K
I
 
I
F
 
F
A
 
S
K
 
R
G
 
V
N
 
T
K
 
K
A
 
V
G
 
D
T
 
A
P
 
P
I
 
V
V
 
Q
G
 
G
M
 
M
L
 
L
V
 
T
L
 
I
L
 
V
A
 
I
A
 
I
Q
 
Q
T
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
M
T
 
T
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
S
L
 
L
S
 
N
K
 
S
Q
 
Q
F
 
F
D
 
N
T
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
L
 
I
V
 
I
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
V
T
 
I
M
 
I
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
S
 
A
N
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
V
T
 
A
N
 
N
V
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
M
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
F
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
L
 
M
M
 
L
L
 
Y
G
 
G
G
 
S
V
 
I
A
 
V
T
 
T
I
 
F
V
 
L
G
 
G
Y
x
W
T
 
T
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
P
R
 
R
L
 
F

Sites not aligning to the query:

5j4nA Crystal structure of the l-arginine/agmatine antiporter adic in complex with agmatine at 2.6 angstroem resolution (see paper)
36% identity, 93% coverage: 4:432/461 of query aligns to 3:429/437 of 5j4nA

query
sites
5j4nA
A
 
A
K
 
H
K
 
K
M
 
V
S
 
G
V
 
L
G
 
I
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
M
T
 
V
A
 
S
V
 
G
N
 
N
M
x
I
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
V
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
L
 
Y
S
 
G
W
 
W
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
I
T
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
C
 
M
G
 
S
M
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
P
K
 
S
T
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
S
G
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
Y
 
R
T
 
C
F
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
F
G
 
L
N
 
G
Y
 
Y
I
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
V
T
 
L
Y
 
Y
G
 
W
L
 
L
S
x
A
L
x
C
L
 
W
I
 
I
A
x
G
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
x
M
S
 
V
I
 
V
T
 
I
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
S
V
 
Y
L
 
F
F
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
L
L
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
I
A
 
T
T
 
C
I
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
L
W
 
W
I
 
I
T
 
F
T
 
V
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
I
G
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
I
G
 
T
R
 
R
I
 
V
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
V
 
T
W
 
V
G
 
L
V
 
A
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
G
V
 
I
S
 
A
T
 
V
V
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
F
W
 
W
F
 
F
D
 
R
S
 
G
S
 
E
V
 
T
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
G
 
A
W
 
W
N
 
N
P
 
V
H
 
S
D
 
G
K
 
L
G
 
G
W
 
T
F
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T
V
 
L
A
 
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
W
 
W
A
 
S
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
A
C
 
S
A
 
V
N
 
A
T
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
V
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
L
G
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
C
Y
 
Y
I
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
N
 
T
V
 
A
I
 
I
F
 
M
G
 
G
I
 
M
V
 
I
G
 
P
N
 
N
E
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
D
V
 
A
F
 
A
A
 
R
K
 
M
M
 
A
F
 
L
T
 
G
P
 
D
M
 
T
V
 
A
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
S
A
 
F
A
 
C
M
 
A
V
 
A
L
 
A
A
 
G
C
 
C
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
G
G
 
G
W
|
W
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
I
 
A
A
 
G
Q
 
Q
V
 
T
Y
 
A
K
 
K
S
 
A
S
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
D
G
 
G
Y
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
R
G
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
L
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
G
A
 
I
A
 
L
Q
 
M
T
 
T
A
 
I
L
 
F
A
 
Q
L
 
L
L
 
S
T
 
S
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
N
L
 
A
S
 
T
K
 
K
Q
 
E
F
 
F
D
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
S
N
 
S
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
I
T
 
F
N
 
T
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
S
 
T
M
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
L
M
 
L
Q
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
G
N
 
H
V
 
G
P
 
H
E
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
V
N
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
S
 
C
Y
 
I
L
 
W
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
S
G
 
F
V
 
V
A
 
T
T
 
L
I
 
M
V
 
V
G
 
I
Y
 
T
T
 
A
L
 
M
F
 
Y
G
 
A
F
 
L
V
 
N
N
 
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
H
R
 
K

P60061 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
36% identity, 93% coverage: 4:432/461 of query aligns to 7:433/445 of P60061

query
sites
P60061
A
 
A
K
 
H
K
 
K
M
 
V
S
 
G
V
 
L
G
 
I
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
M
T
 
V
A
 
S
V
 
G
N
 
N
M
x
I
L
 
M
G
 
G
S
|
S
G
 
G
I
 
V
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
L
 
Y
S
 
G
W
 
W
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
I
T
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
C
 
M
G
 
S
M
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
P
K
 
S
T
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
S
G
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
Y
 
R
T
 
C
F
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
F
G
 
L
N
 
G
Y
 
Y
I
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
V
T
 
L
Y
|
Y
G
 
W
L
 
L
S
x
A
L
x
C
L
 
W
I
 
I
A
 
G
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
x
M
S
 
V
I
 
V
T
 
I
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
S
V
 
Y
L
 
F
F
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
L
L
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
I
A
 
T
T
 
C
I
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
L
W
 
W
I
 
I
T
 
F
T
 
V
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
I
G
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
I
G
 
T
R
 
R
I
 
V
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
V
 
T
W
 
V
G
 
L
V
 
A
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
G
V
 
I
S
 
A
T
 
V
V
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
F
W
 
W
F
 
F
D
 
R
S
 
G
S
 
E
V
 
T
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
G
 
A
W
 
W
N
 
N
P
 
V
H
 
S
D
 
G
K
 
L
G
 
G
W
 
T
F
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T
V
 
L
A
 
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
W
|
W
A
x
S
F
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
A
C
 
S
A
 
V
N
 
A
T
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
V
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
L
G
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
C
Y
 
Y
I
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
N
 
T
V
 
A
I
 
I
F
 
M
G
 
G
I
 
M
V
 
I
G
 
P
N
 
N
E
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
D
V
 
A
F
 
A
A
 
R
K
 
M
M
 
A
F
 
L
T
 
G
P
 
D
M
 
T
V
 
A
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
S
A
 
F
A
 
C
M
 
A
V
 
A
L
 
A
A
 
G
C
 
C
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
G
G
 
G
W
|
W
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
I
 
A
A
 
G
Q
 
Q
V
 
T
Y
 
A
K
 
K
S
 
A
S
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
D
G
 
G
Y
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
R
G
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
L
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
G
A
 
I
A
 
L
Q
 
M
T
 
T
A
 
I
L
 
F
A
 
Q
L
 
L
L
 
S
T
 
S
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
N
L
 
A
S
 
T
K
 
K
Q
 
E
F
 
F
D
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
S
N
 
S
L
 
V
A
x
S
V
 
V
V
 
I
T
 
F
N
 
T
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
S
 
T
M
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
L
M
 
L
Q
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
G
N
 
H
V
 
G
P
 
H
E
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
V
N
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
S
 
C
Y
 
I
L
 
W
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
S
G
 
F
V
 
V
A
 
T
T
 
L
I
 
M
V
 
V
G
 
I
Y
 
T
T
 
A
L
 
M
F
 
Y
G
 
A
F
 
L
V
 
N
N
 
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
H
R
 
K

P60063 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli O157:H7 (see 3 papers)
36% identity, 93% coverage: 4:432/461 of query aligns to 7:433/445 of P60063

query
sites
P60063
A
 
A
K
 
H
K
 
K
M
 
V
S
 
G
V
 
L
G
 
I
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
M
T
 
V
A
 
S
V
 
G
N
|
N
M
x
I
L
 
M
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
 
V
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
L
 
Y
S
 
G
W
 
W
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
I
T
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
C
 
M
G
 
S
M
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
P
K
 
S
T
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
S
G
x
Y
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
Y
 
R
T
 
C
F
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
F
G
 
L
N
 
G
Y
|
Y
I
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
V
T
 
L
Y
|
Y
G
 
W
L
 
L
S
x
A
L
x
C
L
 
W
I
 
I
A
 
G
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
 
M
S
 
V
I
 
V
T
 
I
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
S
V
 
Y
L
 
F
F
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
L
L
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
L
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
I
A
 
T
T
 
C
I
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
L
W
 
W
I
 
I
T
 
F
T
 
V
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
I
G
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
I
G
 
T
R
 
R
I
 
V
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
V
 
T
W
 
V
G
 
L
V
 
A
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
G
V
 
I
S
 
A
T
 
V
V
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
F
W
 
W
F
 
F
D
 
R
S
 
G
S
 
E
V
 
T
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
G
 
A
W
 
W
N
 
N
P
 
V
H
 
S
D
 
G
K
 
L
G
 
G
W
 
T
F
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T
V
 
L
A
 
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
W
|
W
A
 
S
F
 
F
L
x
I
G
|
G
L
x
V
E
|
E
S
|
S
A
|
A
C
 
S
A
 
V
N
 
A
T
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
V
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
L
G
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
C
Y
 
Y
I
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
N
 
T
V
 
A
I
 
I
F
 
M
G
 
G
I
 
M
V
 
I
G
 
P
N
 
N
E
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
D
V
 
A
F
 
A
A
 
R
K
 
M
M
 
A
F
 
L
T
 
G
P
 
D
M
 
T
V
 
A
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
S
A
 
F
A
 
C
M
 
A
V
 
A
L
 
A
A
 
G
C
 
C
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
G
G
 
G
W
|
W
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
I
 
A
A
 
G
Q
 
Q
V
 
T
Y
 
A
K
 
K
S
 
A
S
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
D
G
 
G
Y
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
R
G
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
L
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
G
A
 
I
A
 
L
Q
 
M
T
 
T
A
 
I
L
x
F
A
 
Q
L
 
L
L
 
S
T
 
S
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
N
L
 
A
S
 
T
K
 
K
Q
 
E
F
 
F
D
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
S
N
 
S
L
 
V
A
x
S
V
 
V
V
 
I
T
 
F
N
 
T
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
I
 
L
L
 
Y
S
 
T
M
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
L
M
 
L
Q
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
G
N
 
H
V
 
G
P
 
H
E
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
V
N
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
S
 
C
Y
 
I
L
 
W
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
S
G
 
F
V
 
V
A
 
T
T
 
L
I
 
M
V
 
V
G
 
I
Y
 
T
T
 
A
L
 
M
F
 
Y
G
 
A
F
 
L
V
 
N
N
 
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
H
R
 
K

3l1lA Structure of arg-bound escherichia coli adic (see paper)
35% identity, 93% coverage: 4:432/461 of query aligns to 1:416/423 of 3l1lA

query
sites
3l1lA
A
 
A
K
 
H
K
 
K
M
 
V
S
 
G
V
 
L
G
 
I
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
L
 
M
T
 
V
A
 
S
V
 
G
N
 
A
M
x
I
L
 
M
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
 
V
V
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
L
 
Y
S
 
G
W
 
W
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
I
T
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
C
 
M
G
 
S
M
 
F
L
 
L
S
 
D
R
 
P
K
 
S
T
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
S
G
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
Y
 
R
T
 
C
F
 
F
G
 
G
K
 
P
A
 
F
G
 
L
N
 
G
Y
 
Y
I
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
V
T
 
L
Y
 
Y
G
 
W
L
 
L
S
 
A
L
 
C
L
 
W
I
 
I
A
x
G
N
|
N
V
 
I
A
 
A
I
 
M
S
 
V
I
 
V
T
 
I
A
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
S
V
 
Y
L
 
F
F
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
L
L
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
W
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
I
A
 
T
T
 
C
I
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
L
W
 
W
I
 
I
T
 
F
T
 
V
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
I
G
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
K
I
 
M
T
 
I
G
 
T
R
 
R
I
 
V
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
V
 
T
W
 
V
G
 
L
V
 
A
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
V
L
 
G
V
 
I
S
 
A
T
 
V
V
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
F
W
 
W
F
 
F
D
 
R
S
 
G
S
 
E
V
 
T
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
G
 
-
W
 
-
N
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
I
G
 
Q
A
 
S
S
 
T
V
 
L
A
 
N
I
 
V
T
 
T
L
 
L
W
|
W
A
x
S
F
 
F
L
x
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
A
C
 
S
A
 
V
N
 
A
T
 
A
D
 
G
A
 
V
V
 
V
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
L
G
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
C
Y
 
Y
I
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
N
 
T
V
 
A
I
 
I
F
 
M
G
 
G
I
 
M
V
 
I
G
 
P
N
 
N
E
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
V
S
 
S
T
 
A
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
D
V
 
A
F
 
A
A
 
R
K
 
M
M
 
A
F
 
L
T
 
G
P
 
D
M
 
T
V
 
A
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
S
A
 
F
A
 
C
M
 
A
V
 
A
L
 
A
A
 
G
C
 
C
I
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
G
G
 
G
W
|
W
Q
 
T
F
 
L
T
 
L
I
 
A
A
 
G
Q
 
Q
V
 
T
Y
 
A
K
 
K
S
 
A
S
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
D
G
 
G
Y
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
R
G
 
V
N
 
N
K
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
A
G
 
G
M
 
L
L
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
G
A
 
I
A
 
L
Q
 
M
T
 
T
A
 
I
L
 
F
A
 
Q
L
 
L
L
 
S
T
 
S
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
N
L
 
A
S
 
T
K
 
K
Q
 
E
F
 
F
D
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
S
N
 
S
L
 
V
A
 
S
V
 
V
V
 
I
T
 
F
N
 
T
L
 
L
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
L
 
Y
S
 
T
M
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
T
 
L
M
 
L
Q
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
G
N
 
H
V
 
G
P
 
H
E
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
A
T
 
V
N
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
F
I
 
L
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
Y
S
 
C
Y
 
I
L
 
W
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
A
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
S
G
 
F
V
 
V
A
 
T
T
 
L
I
 
M
V
 
V
G
 
I
Y
 
T
T
 
A
L
 
M
F
 
Y
G
 
A
F
 
L
V
 
N
N
 
Y
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
H
R
 
K

P0AAE8 Cadaverine/lysine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:449/461 of query aligns to 1:444/444 of P0AAE8

query
sites
P0AAE8
M
 
M
S
 
S
V
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
K
M
 
I
S
 
G
V
 
L
G
 
F
Q
 
A
L
x
C
T
 
T
M
 
G
L
 
V
T
 
V
A
 
A
V
 
G
N
 
N
M
 
M
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
S
 
A
I
 
I
L
x
W
S
 
G
W
|
W
L
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
I
T
 
I
G
 
G
S
 
A
L
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
F
x
Y
A
 
A
R
 
R
C
 
L
G
 
A
M
 
T
L
 
K
S
 
N
R
 
P
K
 
Q
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
P
G
 
I
G
 
A
Y
|
Y
A
 
A
E
 
G
Y
 
-
T
x
E
F
 
I
G
 
S
K
 
P
A
 
A
G
 
F
N
 
G
Y
 
F
I
 
Q
T
 
T
N
 
G
Y
 
V
T
 
L
Y
|
Y
G
x
Y
L
 
H
S
 
A
L
 
N
L
 
W
I
 
I
A
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
S
Y
|
Y
I
 
L
Q
 
S
V
 
T
L
 
F
F
 
F
G
 
P
I
 
V
E
 
L
L
 
N
D
 
D
S
 
P
L
 
V
Q
 
P
V
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
T
x
C
I
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
V
W
 
W
I
 
V
T
 
F
T
 
T
F
 
F
A
 
V
N
 
N
F
 
M
G
 
L
G
 
G
A
 
G
S
 
T
I
 
W
T
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
T
A
 
T
V
 
I
T
 
G
V
 
L
W
 
V
G
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
M
V
 
T
S
 
A
T
 
I
V
 
V
G
 
G
W
 
W
F
 
H
W
 
W
F
 
F
D
 
D
S
 
A
S
 
A
V
 
T
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
N
W
 
W
N
 
N
P
 
T
H
 
A
D
 
D
K
 
T
G
 
T
W
x
D
F
 
G
E
 
H
A
 
A
A
 
I
G
 
I
A
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
L
I
 
L
T
x
C
L
 
L
W
 
W
A
 
A
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
V
E
|
E
S
 
S
A
 
A
C
 
A
A
 
V
N
 
S
T
 
T
D
 
G
A
 
M
V
 
V
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
R
N
 
T
V
 
V
P
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
M
G
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
G
G
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
V
Y
|
Y
I
 
I
V
 
A
S
 
A
T
 
T
N
 
Q
V
 
V
I
 
L
F
 
S
G
 
G
I
 
M
V
x
Y
G
 
P
N
 
S
E
 
S
E
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
G
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
A
L
 
I
V
 
S
F
 
A
A
 
S
K
 
T
M
 
I
F
 
L
T
 
G
P
 
N
M
 
W
V
 
A
G
 
A
D
 
P
I
 
L
V
 
V
M
 
S
A
 
A
A
 
F
M
 
T
V
 
A
L
 
F
A
 
A
C
|
C
I
 
L
G
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
G
G
 
S
W
 
W
Q
 
M
F
 
M
T
 
L
I
 
V
A
 
G
Q
 
Q
V
 
A
Y
 
G
K
 
V
S
x
R
S
 
A
A
 
A
D
 
N
T
x
D
G
 
G
Y
 
N
F
 
F
L
 
P
P
 
K
I
 
V
F
x
Y
A
 
G
K
 
E
G
 
V
N
 
D
K
 
S
A
 
N
G
 
G
T
 
I
P
 
P
I
 
K
V
 
K
G
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
A
L
 
A
A
 
V
A
 
K
Q
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
I
L
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
L
-
 
M
-
 
N
T
 
S
I
 
A
S
 
G
P
 
G
D
 
K
L
 
A
S
 
S
K
 
D
Q
 
L
F
 
F
D
 
G
T
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
G
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
L
T
 
L
N
 
T
L
 
M
V
 
L
P
 
P
Y
|
Y
I
 
F
L
x
Y
S
 
S
M
x
C
A
 
V
A
 
D
L
 
L
M
 
I
T
 
R
M
 
F
Q
x
E
K
 
G
V
 
V
S
 
-
N
 
N
V
 
I
P
 
R
E
 
N
G
 
F
K
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
x
C
N
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
G
L
x
C
I
 
V
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
F
S
x
C
Y
 
F
L
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
S
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
A
Q
 
S
A
 
S
L
 
F
M
x
E
L
 
L
G
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
-
T
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
S
Y
 
L
T
 
I
L
 
I
F
 
L
G
 
M
F
 
F
V
x
Y
N
 
A
N
 
R
R
 
K
L
 
M
I
 
-
R
 
-
L
 
H
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
N
 
S
N
 
H
S
 
S
V
 
M
P
 
D
T
 
N
Q
 
H
T
 
T
V
 
A
S
 
S
A
 
N
Q
 
A
H
 
H

P39277 L-methionine/branched-chain amino acid exporter YjeH from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
24% identity, 62% coverage: 3:287/461 of query aligns to 4:283/418 of P39277

query
sites
P39277
V
 
L
A
 
K
K
 
Q
K
 
E
M
 
L
S
 
G
V
 
L
G
 
A
Q
 
Q
L
 
G
T
 
I
M
 
G
L
 
L
T
 
L
A
 
S
V
 
T
N
 
S
M
 
L
L
 
L
G
 
G
S
x
T
G
|
G
I
 
V
-
 
F
V
 
A
L
 
V
L
 
P
P
 
A
T
 
L
K
 
A
L
 
A
A
 
L
E
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
N
I
 
N
S
 
S
I
 
L
L
 
W
S
 
A
W
 
W
L
 
P
I
 
V
T
 
L
A
 
I
T
 
I
G
 
L
S
 
V
L
 
F
A
 
P
L
 
I
A
 
A
Y
 
I
A
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
I
C
 
L
G
 
G
M
 
R
L
 
H
S
 
Y
R
 
P
K
 
S
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
V
G
 
A
G
 
H
Y
 
F
A
 
V
E
 
G
Y
 
M
T
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
S
A
 
R
G
 
L
N
 
E
Y
 
R
I
 
V
T
 
T
N
 
G
Y
 
W
T
 
L
Y
 
F
G
 
-
L
 
L
S
 
S
L
 
V
L
 
I
I
 
P
A
 
V
N
 
G
V
 
L
A
 
P
I
 
A
S
 
A
I
 
L
T
 
Q
-
 
I
A
 
A
V
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
M
F
 
F
G
 
G
I
 
W
E
 
H
L
 
S
D
 
W
S
 
Q
L
 
L
Q
 
L
V
 
L
G
 
A
-
 
E
L
 
L
A
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
W
 
W
I
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
Y
A
 
I
N
 
G
F
 
T
G
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
S
T
 
S
G
 
A
R
 
N
I
 
L
G
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
I
V
 
A
W
 
G
G
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
A
P
 
L
V
 
I
V
 
V
L
 
A
V
 
I
S
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
-
W
 
W
F
 
W
D
 
A
S
 
G
S
 
D
V
 
I
Y
 
K
A
 
P
A
 
A
G
 
N
W
 
I
N
 
P
P
 
F
H
 
P
D
 
A
K
 
P
G
 
G
W
 
N
F
 
I
E
 
E
A
 
L
A
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
F
A
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
I
 
V
T
 
M
L
 
F
W
|
W
A
 
C
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
F
C
 
A
A
 
H
N
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
E
V
 
F
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
R
N
 
D
V
 
F
P
 
P
I
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
M
G
 
I
G
 
G
T
 
L
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
V
Y
 
Y
I
 
W
V
 
G
S
 
C
T
 
T
N
 
V
V
 
V
I
 
V
F
 
L
G
 
H
I
 
F
V
 
D
G
 
A
N
 
Y
E
 
G
E
 
E
L
 
K
A
 
M
A
 
A
S
 
A
T
 
A
A
 
A
P
 
S
F
 
L
G
 
P
L
 
K
V
 
I
F
 
V
A
 
V
K
 
Q
M
 
L
F
 
F
T
 
G
P
 
-
M
 
-
V
 
V
G
 
G
D
 
A
I
 
L
V
 
W
M
 
I
A
 
A
A
 
C
M
 
V
V
 
I
-
 
G
-
 
Y
L
 
L
A
 
A
C
 
C
I
 
F
G
 
A
S
 
S
L
 
L

6f2wA Bacterial asc transporter crystal structure in open to in conformation (see paper)
23% identity, 80% coverage: 8:374/461 of query aligns to 3:370/433 of 6f2wA

query
sites
6f2wA
S
 
E
V
 
V
G
 
S
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
M
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
G
N
 
T
M
x
V
L
 
I
G
|
G
S
x
A
G
|
G
I
 
I
V
 
F
L
 
F
L
 
K
P
 
P
T
 
T
K
 
A
L
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
A
A
 
A
E
 
G
V
 
A
G
 
P
A
 
G
I
 
L
S
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
A
W
 
W
L
 
F
I
 
V
T
 
A
A
 
G
T
 
I
G
 
I
S
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
G
A
 
G
Y
 
L
A
 
T
F
 
V
A
 
A
R
 
E
C
 
I
G
 
G
M
 
T
L
 
I
S
 
Y
R
 
P
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
M
G
 
I
Y
 
Y
A
 
L
E
 
E
Y
 
K
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
K
 
R
A
 
W
G
 
L
N
 
G
Y
 
F
I
 
L
T
 
V
N
 
G
Y
 
W
T
 
A
Y
 
Q
G
 
M
L
 
V
S
 
I
L
 
Y
L
 
Y
I
 
P
A
 
A
N
 
N
V
 
I
A
 
A
-
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
I
T
 
I
A
 
F
V
 
A
G
 
T
Y
 
Q
I
 
F
Q
 
V
V
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
A
I
 
L
E
 
S
L
 
-
D
 
D
S
 
S
L
 
T
Q
 
I
V
 
V
G
 
P
L
 
T
A
 
A
T
 
I
I
 
L
A
 
T
L
 
S
L
 
I
W
 
F
I
 
L
T
 
M
T
 
G
F
 
-
A
 
V
N
 
N
F
 
F
G
 
L
G
 
G
A
 
T
S
 
K
I
 
Y
T
 
S
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
Q
A
 
T
V
 
L
T
 
A
V
 
T
W
 
I
G
 
L
V
 
K
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
I
S
 
I
T
 
V
V
 
A
G
 
G
W
 
L
F
 
L
W
 
Y
F
 
P
D
 
G
S
 
G
S
 
G
V
 
V
Y
 
I
A
 
R
-
 
L
A
 
V
G
 
P
W
 
F
N
 
S
P
 
V
H
 
E
D
 
T
K
 
H
G
 
P
W
 
V
F
 
L
E
 
T
A
 
S
A
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
A
V
 
L
A
 
I
I
 
A
T
 
T
L
 
L
W
x
F
A
|
A
F
 
Y
L
x
D
G
 
G
L
 
W
E
 
I
S
 
N
A
 
V
C
 
G
A
 
T
N
 
L
T
 
A
D
 
G
A
 
E
V
 
M
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
G
R
 
K
N
 
M
V
 
L
P
 
P
I
 
K
A
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
L
L
 
S
G
 
I
A
 
V
A
 
M
V
 
A
I
 
V
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
S
 
T
T
 
N
N
 
I
V
 
A
I
 
Y
F
 
L
G
 
F
I
 
V
V
 
L
G
 
D
N
 
S
E
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
G
S
 
T
T
 
D
A
 
T
P
 
P
F
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
A
A
 
S
K
 
H
M
 
L
F
 
F
T
 
E
P
 
G
M
 
I
V
 
G
G
 
S
D
 
K
I
 
L
V
 
V
M
 
T
A
 
I
A
 
G
M
 
I
V
 
L
L
 
I
A
 
S
C
 
V
I
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
I
L
 
N
G
 
G
W
 
Y
Q
 
I
F
 
I
T
 
S
I
 
G
A
 
L
Q
 
R
V
 
V
Y
 
P
K
 
Y
S
 
A
S
 
L
A
 
A
D
 
-
T
 
T
G
 
Q
Y
 
K
F
 
M
L
 
L
P
 
P
I
 
F
-
 
S
-
 
D
-
 
W
F
 
F
A
 
A
K
 
R
G
 
I
N
 
N
-
 
P
K
 
K
A
 
T
G
 
N
T
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
N
G
 
G
M
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
M
I
 
I
S
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
T
K
 
G
Q
 
Q
F
 
F
D
 
N
T
 
Q
L
 
L
V
 
T
N
 
D
L
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
F
T
 
V
N
 
I
L
 
W
V
 
F
P
 
F
Y
 
I
I
 
T
L
 
L
S
 
T
M
 
F
A
 
I
A
 
A
L
 
V
M
 
I
T
 
I
M
 
L
Q
 
R
K
 
K

O34739 Serine/threonine exchanger SteT from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
23% identity, 90% coverage: 6:419/461 of query aligns to 9:422/438 of O34739

query
sites
O34739
K
 
K
M
 
K
S
 
E
V
 
I
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
T
 
F
M
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
-
 
I
-
 
G
N
 
T
M
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
V
V
 
F
L
 
M
L
 
K
P
 
P
-
 
G
T
 
A
K
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
Y
V
 
S
G
 
G
-
 
D
-
 
S
A
 
K
I
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
F
S
 
A
W
 
W
L
 
L
I
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
I
G
 
L
S
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
G
A
 
G
Y
 
L
A
 
T
F
 
I
A
 
A
R
 
E
C
 
I
G
 
G
M
 
T
L
 
Q
S
 
I
R
 
P
K
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
Y
G
 
T
Y
 
Y
A
 
L
E
 
E
Y
 
E
T
 
V
F
 
Y
G
 
G
K
 
E
A
 
F
G
 
W
N
 
G
Y
 
F
I
 
L
T
x
C
N
 
G
Y
 
W
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
V
S
 
Q
L
 
I
L
 
I
I
 
I
A
 
Y
N
 
G
V
 
P
A
 
A
I
 
I
S
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
I
G
 
G
Y
 
A
I
 
L
Q
 
G
V
 
L
L
 
Y
F
 
F
G
 
G
I
 
S
E
 
L
L
 
M
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
W
-
 
G
D
 
S
S
 
G
L
 
L
Q
 
S
V
 
K
G
 
V
L
 
I
A
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
A
L
 
V
L
 
L
W
 
F
I
 
L
T
x
C
T
 
V
F
 
I
A
 
-
N
 
N
F
 
I
G
 
I
G
 
G
A
 
T
S
 
K
I
 
Y
T
 
G
G
 
G
R
 
F
I
 
V
G
 
Q
A
 
T
V
 
L
T
 
T
V
 
T
W
 
I
G
 
G
V
 
K
I
 
L
A
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
A
L
x
C
V
 
I
S
 
I
T
 
V
V
 
F
G
 
G
W
 
L
F
 
W
W
 
K
F
 
G
D
 
D
S
 
Q
S
 
H
V
 
I
Y
 
F
A
 
T
A
 
A
-
 
V
G
 
N
W
 
E
N
 
S
P
 
I
H
 
S
D
 
D
K
 
M
G
 
N
W
 
F
F
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
A
S
 
A
V
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
L
 
L
W
 
F
A
 
A
F
 
Y
L
 
D
G
 
G
L
 
W
E
 
I
S
 
L
A
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
L
T
 
G
D
 
G
A
 
E
V
 
M
E
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
E
R
 
K
N
 
L
V
 
L
P
 
P
I
 
R
A
 
A
V
 
M
L
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
L
L
 
L
G
 
I
A
 
V
A
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
F
S
 
I
T
 
N
N
 
F
V
 
A
I
 
L
F
 
L
G
 
H
I
 
I
V
 
L
G
 
S
N
 
A
E
 
N
E
 
E
L
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
N
A
 
A
A
 
T
S
 
S
T
 
T
A
 
A
P
 
A
F
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
T
K
 
M
M
 
L
F
 
F
T
 
G
P
 
S
M
 
I
V
 
G
G
 
G
D
 
K
I
 
L
V
 
I
M
 
S
A
 
V
A
 
G
M
 
I
V
 
I
L
 
V
A
 
S
C
 
I
I
 
F
G
 
G
S
x
C
L
 
L
L
 
N
G
 
G
W
 
K
Q
 
V
F
 
L
T
 
S
I
 
F
A
 
P
Q
 
R
V
 
V
Y
 
S
K
 
F
S
 
A
S
 
M
A
 
A
D
 
E
T
 
R
G
 
K
Y
 
Q
F
 
-
L
 
L
P
 
P
I
 
F
F
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
L
N
 
S
K
 
H
A
 
V
G
 
H
T
 
P
P
 
S
I
 
F
V
 
R
G
 
T
M
 
P
L
 
W
V
 
I
L
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
F
Q
 
Q
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
I
T
 
M
I
 
M
S
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
I
K
 
S
Q
 
N
F
 
P
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
S
N
 
E
L
 
I
A
 
S
V
 
I
V
 
F
T
 
M
N
 
I
L
 
Y
V
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
V
L
 
M
S
 
A
M
 
F
A
 
F
A
 
A
L
 
V
M
 
F
T
 
I
M
 
L
Q
 
R
K
 
K
V
 
R
S
 
A
N
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
K
 
E
A
 
K
L
 
R
A
 
A
T
 
Y
N
 
S
V
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
-
 
F
I
 
M
A
 
P
L
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
I
A
 
A
Y
 
G
S
 
S
Y
 
F
L
 
F
A
 
V
L
 
L
Y
 
G
S
 
S
S
 
T
G
 
L
E
 
I
Q
 
T
A
 
D
L
 
T
M
 
M
L
 
S
G
x
C
G
 
G
V
 
L
A
 
S
T
 
I
I
 
L
V
 
I
G
 
G

6f34A Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue bound to arginine. (see paper)
27% identity, 54% coverage: 2:252/461 of query aligns to 22:281/458 of 6f34A

query
sites
6f34A
S
 
S
V
 
L
A
 
R
K
 
K
K
 
E
M
 
L
S
x
G
V
 
A
G
x
F
Q
x
D
L
 
L
T
 
T
M
|
M
L
 
L
T
 
G
A
 
I
V
 
G
N
 
A
M
x
I
L
 
I
G
|
G
S
x
T
G
|
G
I
 
I
V
 
F
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
G
K
 
V
L
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
E
 
H
V
 
A
G
 
G
A
 
P
I
 
A
S
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
S
W
 
F
L
 
I
I
 
L
T
 
S
A
 
G
T
 
L
G
 
A
S
 
C
L
 
V
A
 
F
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
A
 
C
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
C
 
F
G
 
A
M
 
S
L
 
T
S
 
V
R
 
P
K
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
S
M
 
A
G
 
Y
G
 
T
Y
 
Y
A
 
S
E
 
Y
Y
 
A
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
E
A
 
L
G
 
I
N
 
A
Y
 
W
I
 
I
T
 
L
N
 
G
Y
 
W
T
 
D
Y
 
L
G
 
I
L
 
L
S
x
E
L
x
Y
L
 
G
I
 
V
A
|
A
N
 
S
V
 
S
A
 
A
I
 
V
S
 
A
I
 
V
T
 
G
A
 
W
V
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
Q
V
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
S
I
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
P
S
 
K
L
 
A
Q
 
L
V
 
T
G
 
S
L
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
P
A
 
A
T
 
I
I
 
I
A
 
I
L
 
V
L
 
L
W
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
F
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
L
G
 
G
G
 
-
A
 
A
S
 
K
I
 
K
T
 
S
G
x
A
R
|
R
I
 
F
G
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
I
V
 
V
W
x
A
G
x
I
V
 
K
I
 
V
A
|
A
P
 
V
V
 
V
V
 
L
L
|
L
V
 
F
S
 
L
T
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
-
F
 
V
W
|
W
F
x
Y
D
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
V
Y
 
K
A
 
P
A
 
E
G
 
N
W
 
W
N
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
M
K
 
P
G
 
Y
W
 
G
F
 
F
E
 
S
A
 
G
A
 
V
G
 
A
A
 
T
S
 
G
V
 
A
A
 
A
I
 
T
T
 
V
L
 
F
W
x
F
A
|
A
F
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
F
E
 
D
S
 
A
A
 
V
C
 
S
A
 
T
N
 
A
T
 
A
D
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
N
 
D
V
 
M
P
 
P
I
 
I
A
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
V
A
 
C
A
 
T
V
 
L
I
 
L
Y
 
Y
I
 
I
V
 
A
S
 
V
T
 
S
N
 
L
V
 
V
I
 
L
F
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
P
N
 
Y
E
 
E
E
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5oqtA Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue (see paper)
27% identity, 54% coverage: 2:252/461 of query aligns to 20:279/456 of 5oqtA

query
sites
5oqtA
S
 
S
V
 
L
A
 
R
K
 
K
K
x
E
M
 
L
S
x
G
V
 
A
G
x
F
Q
x
D
L
 
L
T
 
T
M
|
M
L
 
L
T
 
G
A
 
I
V
 
G
N
 
A
M
x
I
L
 
I
G
|
G
S
x
T
G
|
G
I
 
I
V
 
F
L
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
G
K
 
V
L
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
E
 
H
V
 
A
G
 
G
A
 
P
I
 
A
S
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
S
W
 
F
L
 
I
I
 
L
T
 
S
A
 
G
T
 
L
G
 
A
S
 
C
L
 
V
A
 
F
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
A
 
C
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
C
 
F
G
 
A
M
 
S
L
 
T
S
 
V
R
 
P
K
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
S
M
 
A
G
 
Y
G
 
T
Y
 
Y
A
 
S
E
 
Y
Y
 
A
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
E
A
 
L
G
 
I
N
 
A
Y
 
W
I
 
I
T
 
L
N
 
G
Y
 
W
T
 
D
Y
 
L
G
 
I
L
 
L
S
 
E
L
 
Y
L
 
G
I
 
V
A
 
A
N
 
S
V
 
S
A
 
A
I
 
V
S
 
A
I
 
V
T
 
G
A
 
W
V
 
S
G
 
G
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
Q
V
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
S
I
 
G
E
 
E
L
 
L
D
 
P
S
 
K
L
 
A
Q
 
L
V
 
T
G
 
S
L
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
P
A
 
A
T
 
I
I
 
I
A
 
I
L
 
V
L
 
L
W
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
F
F
 
L
A
 
L
N
 
N
F
 
L
G
 
G
G
 
-
A
 
A
S
 
K
I
 
K
T
 
S
G
x
A
R
|
R
I
 
F
G
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
I
V
 
V
W
x
A
G
 
I
V
 
K
I
 
V
A
|
A
P
 
V
V
 
V
V
 
L
L
|
L
V
 
F
S
 
L
T
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
-
F
 
V
W
 
W
F
 
Y
D
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
V
Y
 
K
A
 
P
A
 
E
G
 
N
W
 
W
N
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
M
K
 
P
G
 
Y
W
 
G
F
 
F
E
 
S
A
 
G
A
 
V
G
 
A
A
 
T
S
 
G
V
 
A
A
 
A
I
 
T
T
 
V
L
 
F
W
x
F
A
|
A
F
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
F
E
 
D
S
 
A
A
 
V
C
 
S
A
 
T
N
 
A
T
 
A
D
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
N
 
D
V
 
M
P
 
P
I
 
I
A
 
G
V
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
V
A
 
C
A
 
T
V
 
L
I
 
L
Y
 
Y
I
 
I
V
 
A
S
 
V
T
 
S
N
 
L
V
 
V
I
 
L
F
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
P
N
 
Y
E
 
E
E
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q22397 Amino acid transporter protein 6 from Caenorhabditis elegans (see paper)
23% identity, 77% coverage: 19:373/461 of query aligns to 32:391/523 of Q22397

query
sites
Q22397
N
 
N
M
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
F
L
 
I
L
 
T
P
 
P
T
 
T
K
 
S
L
 
I
A
 
I
E
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
-
I
 
L
S
 
S
I
 
L
L
 
A
S
 
I
W
 
W
L
 
I
I
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
F
G
 
I
S
 
S
L
 
M
A
 
L
L
 
G
A
 
S
Y
 
F
A
 
C
F
 
Y
A
 
V
R
 
E
C
 
L
G
 
G
M
 
T
L
 
S
S
 
I
R
 
R
K
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
D
Y
 
F
A
 
A
E
 
Y
Y
 
L
T
 
C
F
 
F
G
 
M
K
 
K
A
 
W
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
I
 
-
T
 
-
N
 
-
Y
 
Y
T
 
P
Y
 
V
G
 
A
L
 
F
S
 
A
L
 
F
L
 
M
I
 
C
A
 
I
N
 
G
V
 
C
A
 
T
I
 
I
S
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
A
I
 
V
T
 
Q
A
 
A
V
 
Q
G
 
T
Y
 
F
I
 
A
Q
 
E
V
 
Y
L
 
V
F
 
F
-
 
R
-
 
G
-
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
E
L
 
T
Q
 
S
-
 
E
-
 
F
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
S
T
 
L
I
 
I
A
 
I
L
 
L
L
 
L
W
 
M
I
 
F
T
 
M
T
 
N
F
 
F
A
 
-
N
 
-
F
 
F
G
 
S
G
 
L
A
 
K
S
 
T
I
 
F
T
 
V
G
 
Q
R
 
R
I
 
F
G
 
S
A
 
I
V
 
L
T
 
A
V
 
S
W
 
L
G
 
A
V
 
K
I
 
I
A
 
A
P
 
A
V
 
T
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
I
T
 
I
V
 
T
G
 
G
W
 
F
F
 
Y
W
 
Y
F
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
H
-
 
W
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
D
 
E
S
 
E
S
 
P
V
 
F
Y
 
K
A
 
G
A
 
S
G
 
N
W
 
W
N
 
N
P
 
P
H
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
G
W
 
P
F
 
F
E
 
V
A
 
N
A
 
A
G
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
L
A
 
F
I
 
A
T
 
G
L