SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_4494 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_4494 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
30% identity, 84% coverage: 46:304/310 of query aligns to 41:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
L
 
F
G
 
G
Q
 
P
P
 
G
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
F
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
P
 
D
Q
 
A
W
 
F
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
T
 
D
W
 
W
A
 
V
G
 
H
I
 
C
T
 
I
P
x
R
L
x
A
L
x
G
A
 
Y
D
 
D
G
 
E
L
 
F
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
A
H
 
G
Y
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
N
A
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
F
x
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
T
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
T
 
G
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
G
 
T
H
 
F
E
 
A
R
 
R
E
 
R
V
 
L
L
 
H
A
 
A
R
 
Y
L
 
R
V
 
D
S
 
A
Q
 
Q
V
 
H
E
 
D
R
 
H
K
 
A
W
 
W
E
 
D
S
 
L
R
 
P
Q
 
R
V
 
Y
Q
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
F
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
T
x
L
G
|
G
D
x
T
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
V
Q
 
D
F
 
R
L
 
A
V
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
A
x
R
S
x
R
S
|
S
A
 
G
R
 
D
E
 
P
Q
 
V
A
 
D
P
 
N
F
 
V
I
 
S
E
 
T
V
 
V
G
 
Y
S
 
T
M
x
P
A
 
D
D
 
R
L
 
L
P
 
H
R
 
E
L
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
D
 
G
V
 
M
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
Q
 
T
F
x
M
K
 
R
P
 
E
T
 
D
G
 
A
L
 
S
F
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
V
 
P
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
x
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
S
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
W
 
E
G
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
|
S
A
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
K
-
x
Y
-
 
H
S
 
E
M
 
D
M
 
V
V
 
A
K
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
T
G
 
N
E
 
R
V
 
V

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
30% identity, 84% coverage: 46:304/310 of query aligns to 41:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
L
 
F
G
 
G
Q
 
P
P
 
G
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
F
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
P
 
D
Q
 
A
W
 
F
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
T
 
D
W
 
W
A
 
V
G
 
H
I
 
C
T
 
I
P
x
R
L
x
A
L
x
G
A
 
Y
D
 
D
G
 
E
L
 
F
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
A
H
 
G
Y
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
N
A
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
F
x
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
T
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
T
 
G
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
G
 
T
H
 
F
E
 
A
R
 
R
E
 
R
V
 
L
L
 
H
A
 
A
R
 
Y
L
 
R
V
 
D
S
 
A
Q
 
Q
V
 
H
E
 
D
R
 
H
K
 
A
W
 
W
E
 
D
S
 
L
R
 
P
Q
 
R
V
 
Y
Q
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
F
S
x
T
L
 
L
A
|
A
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
T
x
L
G
|
G
D
x
T
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
V
Q
 
D
F
 
R
L
 
A
V
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
A
x
R
S
x
R
S
|
S
A
 
G
R
 
D
E
 
P
Q
 
V
A
 
D
P
 
N
F
 
V
I
 
S
E
 
T
V
 
V
G
 
Y
S
 
T
M
x
P
A
 
D
D
 
R
L
 
L
P
 
H
R
 
E
L
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
D
 
G
V
 
M
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
L
 
E
F
 
F
K
 
E
Q
 
T
F
 
M
K
 
R
P
 
E
T
 
D
G
 
A
L
 
S
F
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
V
 
P
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
S
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
W
 
E
G
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
|
S
A
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
K
-
x
Y
-
 
H
S
 
E
M
 
D
M
 
V
V
 
A
K
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
T
G
 
N
E
 
R
V
 
V

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
30% identity, 84% coverage: 46:304/310 of query aligns to 41:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
L
 
F
G
 
G
Q
 
P
P
 
G
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
F
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
P
 
D
Q
 
A
W
 
F
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
T
 
D
W
 
W
A
 
V
G
 
H
I
 
C
T
 
I
P
x
R
L
x
A
L
x
G
A
 
Y
D
 
D
G
 
E
L
 
F
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
A
H
 
G
Y
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
N
A
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
F
x
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
T
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
T
 
G
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
G
 
T
H
 
F
E
 
A
R
 
R
E
 
R
V
 
L
L
 
H
A
 
A
R
 
Y
L
 
R
V
 
D
S
 
A
Q
 
Q
V
 
H
E
 
D
R
 
H
K
 
A
W
 
W
E
 
D
S
 
L
R
 
P
Q
 
R
V
 
Y
Q
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
F
S
x
T
L
 
L
A
|
A
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
|
G
T
x
L
G
|
G
D
x
T
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
V
Q
 
D
F
 
R
L
 
A
V
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
A
x
R
S
x
R
S
|
S
A
 
G
R
 
D
E
 
P
Q
 
V
A
 
D
P
 
N
F
 
V
I
 
S
E
 
T
V
 
V
G
 
Y
S
 
T
M
 
P
A
 
D
D
 
R
L
 
L
P
 
H
R
 
E
L
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
D
 
G
V
 
M
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
Q
 
T
F
x
M
K
 
R
P
 
E
T
 
D
G
 
A
L
 
S
F
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
V
 
P
A
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
x
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
S
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
W
 
E
G
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
|
S
A
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
K
-
x
Y
-
 
H
S
 
E
M
 
D
M
 
V
V
 
A
K
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
T
G
 
N
E
 
R
V
 
V

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
30% identity, 84% coverage: 46:304/310 of query aligns to 39:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
L
 
F
G
 
G
Q
 
P
P
 
G
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
F
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
P
 
D
Q
 
A
W
 
F
L
 
L
Q
 
D
S
 
A
T
 
D
W
 
W
A
 
V
G
 
H
I
 
C
T
 
I
P
x
R
L
x
A
L
x
G
A
 
Y
D
 
D
G
 
E
L
 
F
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
Y
-
 
E
-
 
E
R
 
A
H
 
G
Y
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
N
A
 
S
V
x
T
G
 
G
I
 
I
F
x
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
T
M
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
L
 
A
T
 
G
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
G
 
T
H
 
F
E
 
A
R
 
R
E
 
R
V
 
L
L
 
H
A
 
A
R
 
Y
L
 
R
V
 
D
S
 
A
Q
 
Q
V
 
H
E
 
D
R
 
H
K
 
A
W
 
W
E
 
D
S
 
L
R
 
P
Q
 
R
V
 
Y
Q
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
F
S
x
T
L
 
L
A
|
A
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
L
G
|
G
D
x
T
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
V
Q
 
D
F
 
R
L
 
A
V
 
A
P
 
A
F
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
R
S
x
R
S
 
S
A
 
G
R
 
D
E
 
P
Q
 
V
A
 
D
P
 
N
F
 
V
I
 
S
E
 
T
V
 
V
G
 
Y
S
 
T
M
 
P
A
 
D
D
 
R
L
 
L
P
 
H
R
 
E
L
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
D
V
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
N
 
L
L
 
A
L
 
T
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
D
D
 
E
T
|
T
H
 
E
D
 
G
V
 
M
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
Q
 
T
F
x
M
K
 
R
P
 
E
T
 
D
G
 
A
L
 
S
F
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
V
x
P
A
 
V
V
|
V
V
 
V
D
x
E
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
x
D
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
x
S
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
D
A
 
F
W
 
E
G
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
|
S
A
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
K
-
x
Y
-
 
H
S
 
E
M
 
D
M
 
V
V
 
A
K
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
E
A
 
K
Y
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
T
G
 
N
E
 
R
V
 
V

5bqfA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADP, hepes and l(+)-tartaric acid
32% identity, 69% coverage: 97:310/310 of query aligns to 100:317/317 of 5bqfA

query
sites
5bqfA
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
M
Y
 
Q
M
 
C
L
 
L
G
 
M
H
 
H
E
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
Q
L
 
Y
A
 
G
R
 
H
L
 
D
V
 
S
S
 
H
Q
 
Q
V
 
R
E
 
R
R
 
R
K
 
E
W
 
W
E
 
A
S
 
K
R
 
L
Q
 
I
V
 
A
Q
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
V
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
M
G
|
G
T
x
L
G
|
G
D
x
I
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
A
A
 
V
Q
 
A
F
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
V
F
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
-
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
T
A
 
I
P
 
E
F
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
T
G
 
F
S
 
D
M
 
A
A
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
L
G
 
A
E
 
K
V
 
T
D
 
D
Y
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
T
D
 
G
V
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
A
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
K
 
R
P
 
R
T
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
V
 
K
A
 
S
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
Q
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
E
A
 
L
W
 
E
G
 
N
L
 
V
L
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
D
S
 
A
A
|
A
P
 
V
T
 
S
S
 
E
P
 
E
S
 
N
M
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
R
L
 
H
F
 
V
V
 
E
E
 
M
N
 
Q
L
 
I
R
 
A
A
 
R
Y
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
Q
G
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

4xcvA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH
32% identity, 69% coverage: 97:310/310 of query aligns to 100:317/317 of 4xcvA

query
sites
4xcvA
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
M
Y
 
Q
M
 
C
L
 
L
G
 
M
H
 
H
E
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
Q
L
 
Y
A
 
G
R
 
H
L
 
D
V
 
S
S
 
H
Q
 
Q
V
 
R
E
 
R
R
 
R
K
 
E
W
 
W
E
 
A
S
 
K
R
 
L
Q
 
I
V
 
A
Q
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
V
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
M
G
|
G
T
x
L
G
|
G
D
x
I
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
A
A
 
V
Q
 
A
F
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
V
F
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
-
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
x
K
Q
 
T
A
 
I
P
 
E
F
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
T
G
 
F
S
 
D
M
 
A
A
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
L
G
 
A
E
 
K
V
 
T
D
 
D
Y
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
T
D
 
G
V
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
A
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
K
 
R
P
 
R
T
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
V
 
K
A
 
S
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
Q
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
E
A
 
L
W
 
E
G
 
N
L
 
V
L
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
D
S
 
A
A
|
A
P
 
V
T
 
S
S
 
E
P
 
E
S
 
N
M
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
R
L
 
H
F
 
V
V
 
E
E
 
M
N
 
Q
L
 
I
R
 
A
A
 
R
Y
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
Q
G
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

5tsdA Crystal structure of NADPH-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH and oxalate
32% identity, 69% coverage: 97:310/310 of query aligns to 99:316/316 of 5tsdA

query
sites
5tsdA
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
M
Y
 
Q
M
 
C
L
 
L
G
 
M
H
 
H
E
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
Q
L
 
Y
A
 
G
R
 
H
L
 
D
V
 
S
S
 
H
Q
 
Q
V
 
R
E
 
R
R
 
R
K
 
E
W
 
W
E
 
A
S
 
K
R
 
L
Q
 
I
V
 
A
Q
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
V
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
M
G
|
G
T
x
L
G
|
G
D
x
I
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
A
A
 
V
Q
 
A
F
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
V
F
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
-
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
x
K
Q
 
T
A
 
I
P
 
E
F
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
T
G
 
F
S
 
D
M
 
A
A
 
G
D
 
E
L
 
L
P
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
L
G
 
A
E
 
K
V
 
T
D
 
D
Y
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
T
D
 
G
V
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
A
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
K
 
R
P
 
R
T
 
D
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
V
 
K
A
 
S
V
 
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
Q
 
T
R
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
E
A
 
L
W
 
E
G
 
N
L
 
V
L
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
D
S
 
A
A
 
A
P
 
V
T
 
S
S
 
E
P
 
E
S
 
N
M
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
R
L
 
H
F
 
V
V
 
E
E
 
M
N
 
Q
L
 
I
R
 
A
A
 
R
Y
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
Q
G
 
F
E
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
33% identity, 70% coverage: 93:310/310 of query aligns to 98:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
F
x
M
G
 
S
Q
 
Q
V
 
M
M
|
M
A
 
A
E
 
S
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
T
 
F
Y
 
C
M
 
V
L
 
L
G
 
R
H
 
H
E
 
A
R
 
R
E
 
D
V
 
I
L
 
P
A
 
T
R
 
F
L
 
E
V
 
R
S
 
A
Q
 
Q
V
 
R
E
 
E
R
 
G
K
 
R
W
 
W
E
 
H
S
 
Y
R
 
V
Q
 
H
V
 
P
Q
 
R
S
 
T
L
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
G
T
x
L
G
|
G
D
|
D
I
x
L
G
 
G
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
F
 
E
L
 
L
V
 
A
P
 
R
F
 
H
G
 
G
V
 
F
E
 
D
L
 
V
Y
 
R
G
 
G
V
x
W
A
x
S
S
x
R
S
x
T
A
 
P
R
x
K
E
 
A
Q
 
L
A
 
E
P
 
G
F
 
V
I
 
S
E
 
C
V
 
F
G
 
H
S
 
G
M
 
L
A
 
E
D
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
G
L
 
F
V
 
L
G
 
A
E
 
G
V
 
S
D
 
E
Y
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
V
L
 
M
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
|
T
H
 
R
D
 
G
V
 
L
Y
 
M
D
 
N
A
 
A
A
 
E
L
 
R
F
 
L
K
 
A
Q
 
H
F
 
L
K
 
P
P
 
R
T
 
G
G
 
A
L
 
K
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
x
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
V
 
P
A
 
V
V
 
V
V
 
D
D
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
S
G
 
G
H
 
H
L
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
T
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
V
R
 
G
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
A
A
 
M
W
 
D
G
 
N
L
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
L
S
x
A
A
x
S
P
 
I
T
 
A
S
 
I
P
 
P
S
 
R
M
 
T
M
 
A
V
 
A
K
 
P
L
 
Q
F
 
I
V
 
V
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
R
A
 
R
Y
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
V
R
 
L
G
 
N
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
P
D
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

4z0pA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
31% identity, 86% coverage: 44:310/310 of query aligns to 49:316/316 of 4z0pA

query
sites
4z0pA
V
 
V
W
|
W
L
 
K
G
 
S
Q
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
S
T
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
R
G
 
A
H
 
P
Q
 
D
P
 
L
Q
 
K
W
 
V
L
 
V
Q
 
F
S
 
S
T
 
G
W
x
G
A
|
A
G
|
G
I
 
V
T
 
D
P
 
H
L
 
V
L
 
L
A
 
T
-
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
-
H
 
D
Y
 
V
R
 
P
L
 
L
T
 
V
R
|
R
A
 
F
V
 
V
G
 
D
-
 
R
I
 
T
F
x
L
G
 
T
Q
 
T
V
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
M
T
 
M
Y
 
Q
M
 
C
L
 
L
G
 
L
H
 
H
E
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
x
H
L
x
R
A
 
A
R
 
Y
L
 
E
V
 
A
S
 
L
Q
 
A
V
 
K
E
 
K
R
 
H
K
 
E
W
 
W
E
 
R
S
 
D
R
 
L
Q
 
S
V
 
Q
Q
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
V
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
M
G
 
G
T
x
M
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
L
V
 
A
P
 
A
F
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
K
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
x
W
A
x
S
S
x
R
S
|
S
A
 
K
R
|
R
E
 
-
Q
 
V
A
 
I
P
 
E
F
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
T
G
 
Y
S
 
D
M
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
P
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
E
 
R
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
D
T
 
T
H
 
R
D
 
G
V
 
I
Y
 
F
D
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
A
Q
 
K
F
 
L
K
 
S
P
 
R
T
 
N
G
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
V
 
G
A
 
S
V
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
L
D
 
E
A
 
C
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
V
L
 
L
A
x
G
G
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
Q
 
P
R
 
E
H
 
S
P
 
R
F
 
F
W
 
W
T
 
D
A
 
M
W
 
P
G
 
N
L
 
V
L
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
x
A
A
|
A
P
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
V
S
 
R
M
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
V
L
 
H
F
 
V
V
 
E
E
 
H
N
 
Q
L
 
I
R
 
A
A
 
R
Y
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
L
A
 
P
L
 
L
R
 
E
G
 
H
E
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
K
D
 
V
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4weqA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and sulfate (see paper)
31% identity, 86% coverage: 44:310/310 of query aligns to 49:316/316 of 4weqA

query
sites
4weqA
V
 
V
W
 
W
L
 
K
G
 
S
Q
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
S
T
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
R
G
 
A
H
 
P
Q
 
D
P
 
L
Q
 
K
W
 
V
L
 
V
Q
 
F
S
 
S
T
 
G
W
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
D
P
 
H
L
 
V
L
 
L
A
 
T
-
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
-
H
 
D
Y
 
V
R
 
P
L
 
L
T
 
V
R
|
R
A
 
F
V
 
V
G
 
D
-
 
R
I
 
T
F
x
L
G
 
T
Q
 
T
V
 
R
M
|
M
A
 
S
E
 
E
Y
 
W
V
 
V
L
 
M
T
 
M
Y
 
Q
M
 
C
L
 
L
G
 
L
H
 
H
E
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
H
L
 
R
A
 
A
R
 
Y
L
 
E
V
 
A
S
 
L
Q
 
A
V
 
K
E
 
K
R
 
H
K
 
E
W
 
W
E
 
R
S
 
D
R
 
L
Q
 
S
V
 
Q
Q
 
P
S
 
E
L
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
V
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
I
V
 
M
G
 
G
T
x
M
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
L
V
 
A
P
 
A
F
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
K
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
x
W
A
x
S
S
x
R
S
|
S
A
 
K
R
|
R
E
 
-
Q
 
V
A
 
I
P
 
E
F
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
T
G
 
Y
S
 
D
M
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
P
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
E
 
R
V
 
T
D
 
D
Y
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
D
T
 
T
H
 
R
D
 
G
V
 
I
Y
 
F
D
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
A
Q
 
K
F
 
L
K
 
S
P
 
R
T
 
N
G
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
V
 
G
A
 
S
V
 
Q
V
 
V
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
L
D
 
E
A
 
C
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
V
L
 
L
A
x
G
G
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
Q
 
P
R
 
E
H
 
S
P
 
R
F
 
F
W
 
W
T
 
D
A
 
M
W
 
P
G
 
N
L
 
V
L
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
x
A
A
 
A
P
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
V
S
 
R
M
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
V
L
 
H
F
 
V
V
 
E
E
 
H
N
 
Q
L
 
I
R
 
A
A
 
R
Y
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
L
A
 
P
L
 
L
R
 
E
G
 
H
E
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
K
D
 
V
R
 
A
G
 
G
Y
|
Y

7jqiA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with alpha-ketoglutarate and NADP+
30% identity, 70% coverage: 93:310/310 of query aligns to 95:312/312 of 7jqiA

query
sites
7jqiA
F
 
M
G
 
G
Q
 
E
V
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
T
 
S
Y
 
Q
M
 
V
L
 
L
G
 
H
H
 
W
E
 
F
R
 
R
E
 
R
V
 
F
L
 
D
A
 
D
R
 
Y
L
 
R
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
V
 
N
E
 
S
R
 
S
K
 
H
W
 
W
E
 
Q
S
 
P
R
 
L
Q
 
P
V
 
E
Q
 
Y
S
 
H
L
 
R
A
 
E
G
 
D
R
 
F
R
 
T
V
 
I
L
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
T
x
A
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
S
S
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
F
 
S
L
 
L
V
 
Q
P
 
T
F
 
W
G
 
R
V
 
F
E
 
P
L
 
L
Y
 
R
G
 
-
V
 
C
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
x
K
Q
 
S
A
 
W
P
 
P
F
 
G
I
 
V
E
 
Q
-
 
S
V
 
F
G
 
A
S
 
G
M
 
R
A
 
E
D
 
E
L
 
L
P
 
S
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
S
E
 
Q
V
 
C
D
 
R
Y
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
V
D
 
G
V
 
I
Y
 
I
D
 
N
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
Q
 
K
F
 
L
K
 
P
P
 
D
T
 
G
G
 
A
L
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
N
Q
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
P
R
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
Q
A
 
H
W
 
P
G
 
R
L
 
V
L
 
T
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
 
A
A
|
A
P
 
I
T
 
T
S
 
R
P
 
P
S
 
A
M
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
E
L
 
Y
F
 
I
V
 
S
E
 
R
N
 
T
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
C
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

6p35A 2.5 angstrom structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with 2-keto arginine and NADP
30% identity, 70% coverage: 93:310/310 of query aligns to 95:312/312 of 6p35A

query
sites
6p35A
F
 
M
G
 
G
Q
 
E
V
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
T
 
S
Y
 
Q
M
 
V
L
 
L
G
 
H
H
 
W
E
 
F
R
 
R
E
 
R
V
 
F
L
 
D
A
 
D
R
 
Y
L
 
R
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
V
 
N
E
 
S
R
 
S
K
 
H
W
 
W
E
 
Q
S
 
P
R
 
L
Q
 
P
V
 
E
Q
 
Y
S
 
H
L
 
R
A
 
E
G
 
D
R
 
F
R
 
T
V
 
I
L
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
T
x
A
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
S
S
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
F
 
S
L
 
L
V
 
Q
P
 
T
F
 
W
G
 
R
V
 
F
E
 
P
L
 
L
Y
 
R
G
 
-
V
 
C
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
x
K
Q
 
S
A
 
W
P
 
P
F
 
G
I
 
V
E
 
Q
-
 
S
V
 
F
G
 
A
S
 
G
M
 
R
A
 
E
D
 
E
L
 
L
P
 
S
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
S
E
 
Q
V
 
C
D
 
R
Y
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
V
D
 
G
V
 
I
Y
 
I
D
 
N
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
Q
 
K
F
 
L
K
 
P
P
 
D
T
 
G
G
 
A
L
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
N
Q
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
P
R
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
Q
A
 
H
W
 
P
G
 
R
L
 
V
L
 
T
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
x
A
A
|
A
P
 
I
T
|
T
S
 
R
P
 
P
S
 
A
M
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
E
L
 
Y
F
 
I
V
 
S
E
 
R
N
 
T
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
C
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

7jqhA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with phosphate and NADP+
30% identity, 70% coverage: 93:310/310 of query aligns to 96:313/313 of 7jqhA

query
sites
7jqhA
F
 
M
G
 
G
Q
 
E
V
 
Q
M
|
M
A
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
V
 
A
L
 
V
T
 
S
Y
 
Q
M
 
V
L
 
L
G
 
H
H
 
W
E
 
F
R
 
R
E
 
R
V
 
F
L
 
D
A
 
D
R
 
Y
L
 
R
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
V
 
N
E
 
S
R
 
S
K
 
H
W
 
W
E
 
Q
S
 
P
R
 
L
Q
 
P
V
 
E
Q
 
Y
S
 
H
L
 
R
A
 
E
G
 
D
R
 
F
R
 
T
V
 
I
L
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
T
x
A
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
S
S
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
F
 
S
L
 
L
V
 
Q
P
 
T
F
 
W
G
 
R
V
 
F
E
 
P
L
 
L
Y
 
R
G
 
-
V
 
C
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
T
R
 
R
E
x
K
Q
 
S
A
 
W
P
 
P
F
 
G
I
 
V
E
 
Q
-
 
S
V
 
F
G
 
A
S
 
G
M
 
R
A
 
E
D
 
E
L
 
L
P
 
S
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
S
E
 
Q
V
 
C
D
 
R
Y
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
E
T
 
T
H
 
V
D
 
G
V
 
I
Y
 
I
D
 
N
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
Q
 
K
F
 
L
K
 
P
P
 
D
T
 
G
G
 
A
L
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
N
Q
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
P
R
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
Q
A
 
H
W
 
P
G
 
R
L
 
V
L
 
T
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
V
S
 
A
A
|
A
P
 
I
T
 
T
S
 
R
P
 
P
S
 
A
M
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
E
L
 
Y
F
 
I
V
 
S
E
 
R
N
 
T
L
 
I
R
 
A
A
 
Q
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
K
L
 
V
R
 
C
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

3kboA 2.14 angstrom crystal structure of putative oxidoreductase (ycdw) from salmonella typhimurium in complex with NADP
36% identity, 55% coverage: 139:310/310 of query aligns to 141:312/312 of 3kboA

query
sites
3kboA
I
 
I
V
 
M
G
|
G
T
x
A
G
|
G
D
x
V
I
x
L
G
 
G
Q
 
A
S
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
F
 
S
L
 
L
V
 
Q
P
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
F
E
 
P
L
 
L
Y
 
R
G
 
-
V
 
C
A
x
W
S
|
S
S
x
R
A
x
S
R
 
R
E
x
K
Q
 
S
A
 
W
P
 
P
F
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
S
-
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
R
M
 
-
A
 
E
D
 
E
L
 
L
P
 
R
R
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
N
E
 
Q
V
 
T
D
 
R
Y
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
L
|
L
L
 
L
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
D
 
Q
T
 
T
H
 
V
D
 
G
V
 
I
Y
 
I
D
 
N
A
 
S
A
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
D
Q
 
Q
F
 
L
K
 
P
P
 
D
T
 
G
G
 
A
L
 
Y
F
 
V
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
V
 
V
A
 
H
V
 
V
V
 
Q
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
M
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
F
R
 
S
Q
 
Q
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
R
 
E
H
 
S
P
 
P
F
 
L
W
 
W
T
 
R
A
 
H
W
 
P
G
 
R
L
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
P
H
|
H
S
 
I
S
 
A
A
|
A
P
 
V
T
 
T
S
 
R
P
 
P
S
 
A
M
 
E
M
 
A
V
 
I
K
 
D
L
 
Y
F
 
I
V
 
S
E
 
R
N
 
T
L
 
I
R
 
T
A
 
Q
Y
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
F
 
R
D
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

4zqbB Crystal structure of NADP-dependent dehydrogenase from rhodobactersphaeroides in complex with NADP and sulfate
29% identity, 80% coverage: 64:310/310 of query aligns to 69:316/316 of 4zqbB

query
sites
4zqbB
W
 
W
L
 
I
Q
 
H
S
 
S
T
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
P
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
E
G
 
L
L
 
G
P
 
H
R
 
L
H
 
A
Y
 
R
R
 
P
L
 
I
T
 
V
R
|
R
A
 
L
V
 
V
G
 
D
I
 
P
-
 
E
F
x
L
G
 
A
Q
 
R
V
 
T
M
|
M
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
T
 
A
Y
 
W
M
 
T
L
 
Y
G
 
Y
H
 
L
E
 
F
R
 
R
E
 
D
V
 
M
L
 
P
A
 
A
R
 
Y
L
 
A
V
 
A
S
 
Q
Q
 
Q
V
 
R
E
 
A
R
 
R
K
 
V
W
 
W
E
 
K
S
 
G
R
 
L
Q
 
P
V
 
Y
Q
 
K
S
 
R
L
 
P
A
 
E
G
 
R
R
 
T
R
 
T
V
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
L
G
|
G
T
x
L
G
|
G
D
x
E
I
x
L
G
 
G
Q
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
F
 
R
L
 
L
V
 
R
P
 
D
F
 
A
G
 
G
V
 
F
E
 
D
L
 
V
Y
 
H
G
 
G
V
x
W
A
x
S
S
x
R
S
|
S
A
 
P
R
x
K
E
 
E
Q
 
I
A
 
A
P
 
G
F
 
V
I
 
T
E
 
C
V
 
H
G
 
A
S
 
G
M
 
E
A
 
E
D
 
T
L
 
L
P
 
E
R
 
R
L
 
M
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
D
 
E
Y
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
C
L
 
L
L
|
L
P
|
P
N
 
L
T
 
T
P
 
G
D
 
E
T
 
T
H
 
R
D
 
G
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
R
L
 
R
F
 
L
K
 
A
Q
 
C
F
 
L
K
 
P
P
 
E
T
 
G
G
 
A
L
 
Q
F
 
I
I
 
V
N
 
N
A
x
F
G
 
A
R
|
R
G
 
G
V
 
P
A
 
I
V
 
L
V
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
S
G
 
G
H
 
R
L
 
I
A
 
G
G
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
 
V
C
 
F
R
 
E
Q
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
A
H
 
S
P
 
P
F
 
F
W
 
W
T
 
G
A
 
H
W
 
P
G
 
K
L
 
V
L
 
T
L
 
V
T
 
L
G
 
P
H
|
H
S
 
I
S
|
S
A
|
A
P
 
A
T
 
T
S
 
D
P
 
P
S
 
E
M
 
T
M
 
A
V
 
S
K
 
A
L
 
I
F
 
V
V
 
G
E
 
A
N
 
H
L
 
V
R
 
A
A
 
D
Y
 
Y
E
 
R
A
 
A
G
 
T
E
 
G
A
 
R
L
 
I
R
 
P
G
 
P
E
 
S
V
 
V
D
 
D
F
 
L
D
 
T
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
34% identity, 54% coverage: 139:306/310 of query aligns to 154:324/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
I
 
I
V
 
I
G
|
G
T
 
L
G
|
G
D
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
R
L
 
L
V
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
R
Y
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
G
|
G
V
x
R
A
 
Q
S
 
P
S
x
R
A
 
P
R
 
E
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
P
 
E
F
 
F
I
 
-
E
 
-
V
 
Q
G
 
A
S
 
E
M
 
F
A
 
V
D
 
S
L
 
T
P
 
P
R
 
E
L
 
L
V
 
A
G
 
A
E
 
Q
V
 
S
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
V
 
V
N
 
V
L
 
A
L
x
C
P
x
S
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
A
T
|
T
H
 
E
D
 
G
V
 
L
Y
 
C
D
 
N
A
 
K
A
 
D
L
 
F
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
F
 
M
K
 
K
P
 
E
T
 
T
G
 
A
L
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
x
I
G
 
S
R
|
R
G
 
G
V
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
N
D
 
Q
A
 
D
D
 
D
L
 
L
V
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
C
 
T
R
 
S
Q
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Q
 
T
R
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
L
W
 
L
T
 
T
A
 
L
W
 
K
G
 
N
L
 
C
L
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
P
H
|
H
S
 
I
S
x
G
A
 
S
P
 
A
T
 
T
-
 
H
-
 
R
S
 
T
P
 
R
S
 
N
M
 
T
M
 
M
V
 
S
K
 
L
L
 
L
F
 
A
V
 
A
E
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
L
A
 
A
Y
 
G
E
 
L
A
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
M
R
 
P
G
 
S
E
 
E
V
 
L
D
 
K
F
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 54% coverage: 139:306/310 of query aligns to 158:328/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
I
 
I
V
 
I
G
 
G
T
 
L
G
|
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
V
 
I
A
 
A
Q
 
R
F
 
R
L
 
L
V
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
R
Y
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
G
 
G
V
x
R
A
x
Q
S
x
P
S
x
R
A
 
P
R
 
E
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
P
 
E
F
 
F
I
 
-
E
 
-
V
 
Q
G
 
A
S
 
E
M
 
F
A
 
V
D
 
S
L
 
T
P
 
P
R
 
E
L
 
L
V
 
A
G
 
A
E
 
Q
V
 
S
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
V
 
V
N
 
V
L
 
A
L
 
C
P
x
S
N
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
A
T
 
T
H
 
E
D