SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_4567 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_4567 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6r5nA The crystal structure of glycoside hydrolase bglx from p. Aeruginosa in complex with 1-deoxynojirimycin (see paper)
63% identity, 96% coverage: 29:763/763 of query aligns to 2:733/733 of 6r5nA

query
sites
6r5nA
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
M
T
 
S
L
 
N
D
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
P
 
A
E
 
D
M
 
H
P
 
P
R
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
R
 
M
K
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
I
F
 
F
N
 
N
S
 
T
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
I
R
 
R
P
 
A
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
A
 
V
M
 
R
R
 
H
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
F
F
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
V
 
V
I
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
R
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
S
F
|
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
|
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
S
R
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
|
K
H
|
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
L
V
 
P
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
M
|
M
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
R
W
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
I
S
 
S
D
|
D
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
V
F
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
N
G
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
N
M
 
M
N
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
S
K
 
T
E
 
W
L
 
L
P
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
R
A
 
A
V
 
C
R
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
D
D
 
D
D
 
P
P
 
P
V
 
F
D
 
D
T
 
T
Y
 
N
A
 
A
D
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
S
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
D
D
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
I
 
R
D
 
D
M
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
S
W
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
K
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
S
L
 
Y
N
 
N
F
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
E
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
S
 
A
H
 
H
E
 
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
I
 
L
L
 
G
E
 
W
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
L
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
M
T
 
D
P
 
H
G
 
D
K
 
N
P
 
P
G
 
G
N
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
T
 
N
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
P
M
 
L
A
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
E
T
 
R
L
 
L
N
 
A
K
 
R
T
 
G
G
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
S
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
E
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
D
|
D
E
 
P
T
x
V
G
 
A
S
 
S
M
 
L
I
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
G
F
 
F
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
Q
 
S
K
 
R
V
 
E
V
 
I
H
 
V
F
 
F
T
 
R
I
 
L
T
 
G
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Y
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
E
F
 
F
N
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
A
D
 
Q
V
 
T
T
 
E
Q
 
S
Q
 
R
S
 
S
F
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
L

6r5iA The crystal structure of the glycoside hydrolase bglx from p. Aeruginosa (see paper)
63% identity, 96% coverage: 29:763/763 of query aligns to 2:733/733 of 6r5iA

query
sites
6r5iA
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
M
T
 
S
L
 
N
D
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
P
 
A
E
 
D
M
 
H
P
 
P
R
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
R
 
M
K
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
I
F
 
F
N
 
N
S
 
T
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
I
R
 
R
P
 
A
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
A
 
V
M
 
R
R
 
H
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
F
F
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
R
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
S
F
 
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
S
R
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
 
K
H
 
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
L
V
 
P
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
R
W
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
D
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
V
F
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
N
G
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
N
M
 
M
N
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
S
K
 
T
E
 
W
L
 
L
P
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
R
A
 
A
V
 
C
R
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
D
D
 
D
D
 
P
P
 
P
V
 
F
D
 
D
T
 
T
Y
 
N
A
 
A
D
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
S
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
D
D
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
I
 
R
D
 
D
M
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
S
W
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
K
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
S
L
 
Y
N
 
N
F
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
E
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
S
 
A
H
 
H
E
 
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
I
 
L
L
 
G
E
 
W
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
L
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
M
T
 
D
P
 
H
G
 
D
K
 
N
P
 
P
G
 
G
N
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
T
 
N
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
P
M
 
L
A
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
E
T
 
R
L
 
L
N
 
A
K
 
R
T
 
G
G
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
S
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
E
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
D
|
D
E
 
P
T
x
V
G
 
A
S
 
S
M
 
L
I
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
G
F
 
F
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
Q
 
S
K
 
R
V
 
E
V
 
I
H
 
V
F
 
F
T
 
R
I
 
L
T
 
G
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Y
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
E
F
 
F
N
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
A
D
 
Q
V
 
T
T
 
E
Q
 
S
Q
 
R
S
 
S
F
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
L

6r5tA The crystal structure of glycoside hydrolase bglx inactive mutant d286n from p. Aeruginosa in complex with lactose (see paper)
63% identity, 96% coverage: 29:763/763 of query aligns to 2:733/733 of 6r5tA

query
sites
6r5tA
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
M
T
 
S
L
 
N
D
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
P
 
A
E
 
D
M
 
H
P
 
P
R
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
R
 
M
K
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
I
F
|
F
N
 
N
S
 
T
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
I
R
 
R
P
 
A
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
A
 
V
M
 
R
R
 
H
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
F
F
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
V
 
V
I
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
R
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
S
F
 
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
|
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
S
R
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
|
K
H
|
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
L
V
 
P
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
R
W
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
I
S
 
S
D
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
A
I
 
V
F
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
N
G
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
N
M
 
M
N
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
S
K
 
T
E
 
W
L
 
L
P
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
R
A
 
A
V
 
C
R
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
D
D
 
D
D
 
P
P
 
P
V
 
F
D
 
D
T
 
T
Y
 
N
A
 
A
D
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
S
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
D
D
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
I
 
R
D
 
D
M
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
S
W
|
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
K
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
S
L
 
Y
N
 
N
F
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
E
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
S
 
A
H
 
H
E
|
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
I
 
L
L
 
G
E
 
W
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
L
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
M
T
 
D
P
 
H
G
 
D
K
 
N
P
 
P
G
 
G
N
 
K
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
T
 
N
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
P
M
 
L
A
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
E
T
 
R
L
 
L
N
 
A
K
 
R
T
 
G
G
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
S
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
E
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
D
|
D
E
 
P
T
x
V
G
 
A
S
 
S
M
 
L
I
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
G
F
 
F
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
Q
 
S
K
 
R
V
 
E
V
 
I
H
 
V
F
 
F
T
 
R
I
 
L
T
 
G
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Y
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
E
F
 
F
N
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
A
D
 
Q
V
 
T
T
 
E
Q
 
S
Q
 
R
S
 
S
F
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
L

6r5vA The crystal structure of glycoside hydrolase bglx inactive mutant d286n from p. Aeruginosa in complex with xylotriose (see paper)
63% identity, 96% coverage: 29:763/763 of query aligns to 2:730/730 of 6r5vA

query
sites
6r5vA
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
M
T
 
S
L
 
N
D
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
P
 
A
E
 
D
M
 
H
P
 
P
R
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
R
 
M
K
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
I
F
 
F
N
 
N
S
 
T
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
I
R
 
R
P
 
A
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
A
 
V
M
 
R
R
 
H
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
F
F
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
V
 
V
I
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
R
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
S
F
 
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
|
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
S
R
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
|
K
H
|
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
L
V
 
P
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
R
W
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
I
S
 
S
D
x
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
V
F
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
N
G
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
N
M
 
M
N
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
S
K
 
T
E
 
W
L
 
L
P
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
R
A
 
A
V
 
C
R
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
D
D
 
D
D
 
P
P
 
P
V
 
F
D
 
D
T
 
T
Y
 
N
A
 
A
D
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
S
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
D
D
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
I
 
R
D
 
D
M
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
S
W
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
K
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
S
L
 
Y
N
 
N
F
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
E
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
S
 
A
H
 
H
E
 
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
I
 
L
L
 
G
E
 
W
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
L
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
M
T
 
D
P
 
P
G
 
G
K
 
K
P
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
T
 
N
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
P
M
 
L
A
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
E
T
 
R
L
 
L
N
 
A
K
 
R
T
 
G
G
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
S
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
E
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
D
|
D
E
 
P
T
x
V
G
 
A
S
 
S
M
 
L
I
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
G
F
 
F
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
Q
 
S
K
 
R
V
 
E
V
 
I
H
 
V
F
 
F
T
 
R
I
 
L
T
 
G
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Y
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
E
F
 
F
N
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
A
D
 
Q
V
 
T
T
 
E
Q
 
S
Q
 
R
S
 
S
F
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
L

6r5oA The crystal structure the glycoside hydrolase bglx inactive mutant d286n from p. Aeruginosa in complex with two glucose molecules (see paper)
63% identity, 96% coverage: 29:763/763 of query aligns to 2:730/730 of 6r5oA

query
sites
6r5oA
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
M
T
 
S
L
 
N
D
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
P
 
A
E
 
D
M
 
H
P
 
P
R
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
L
R
 
M
K
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
R
A
 
A
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
I
F
 
F
N
 
N
S
 
T
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
I
R
 
R
P
 
A
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
A
 
V
M
 
R
R
 
H
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
F
F
 
H
A
 
A
Y
 
Y
D
|
D
V
 
V
I
 
A
H
 
H
G
 
G
H
 
H
R
 
R
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
P
D
 
E
A
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
R
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
S
F
|
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
|
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
Y
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
S
R
 
L
I
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
V
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
A
V
 
V
K
|
K
H
|
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
L
V
 
P
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
S
L
 
L
N
 
N
S
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
R
W
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
I
S
 
S
D
x
N
H
|
H
G
 
G
A
 
A
I
 
V
F
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
N
G
 
E
R
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
N
M
 
M
N
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
S
K
 
T
E
 
W
L
 
L
P
 
P
G
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
S
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
R
A
 
A
V
 
C
R
 
R
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
A
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
D
D
 
D
D
 
P
P
 
P
V
 
F
D
 
D
T
 
T
Y
 
N
A
 
A
D
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
E
S
 
G
Q
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
N
 
D
D
 
G
T
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
P
 
Q
I
 
R
D
 
D
M
 
V
M
 
I
G
 
G
S
 
S
W
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
S
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
K
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
F
 
S
L
 
Y
N
 
N
F
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
E
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
S
A
 
A
N
 
E
V
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
S
 
A
H
 
H
E
 
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
I
 
L
L
 
G
E
 
W
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Q
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
T
I
 
M
S
 
S
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
L
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
M
T
 
D
P
 
P
G
 
G
K
 
K
P
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
Q
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
T
 
N
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
P
M
 
L
A
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
E
T
 
R
L
 
L
N
 
A
K
 
R
T
 
G
G
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
S
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
E
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
D
|
D
E
 
P
T
 
V
G
 
A
S
 
S
M
 
L
I
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
G
F
 
F
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
Q
 
S
K
 
R
V
 
E
V
 
I
H
 
V
F
 
F
T
 
R
I
 
L
T
 
G
E
 
E
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
D
T
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
R
Y
 
H
A
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
P
G
|
G
K
x
E
F
 
F
N
 
K
V
 
V
Q
 
F
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
A
D
 
Q
V
 
T
T
 
E
Q
 
S
Q
 
R
S
 
S
F
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
L

3u48B From soil to structure: a novel dimeric family 3-beta-glucosidase isolated from compost using metagenomic analysis
50% identity, 96% coverage: 33:763/763 of query aligns to 5:735/742 of 3u48B

query
sites
3u48B
F
 
F
V
 
I
S
 
N
N
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
A
Q
 
K
M
 
M
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
P
S
 
G
I
 
A
G
 
G
P
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
G
E
 
Q
M
 
A
P
 
S
R
 
S
E
 
S
M
 
G
I
 
I
R
 
A
K
 
Q
E
 
K
I
 
I
A
 
K
A
 
E
G
 
G
N
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
L
F
 
F
N
 
N
S
 
I
I
 
K
T
 
S
R
 
V
P
 
T
E
 
K
N
 
I
R
 
K
P
 
E
M
 
V
Q
 
Q
D
 
R
A
 
I
A
 
A
M
 
V
R
 
E
-
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
L
F
 
F
A
 
G
Y
 
M
D
|
D
V
 
V
I
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
E
T
 
T
I
 
A
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
C
S
 
T
W
 
W
D
 
D
M
 
M
D
 
E
A
 
L
I
 
I
G
 
E
L
 
K
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
I
D
 
C
I
 
W
T
 
T
F
 
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
S
R
 
R
D
 
D
P
 
P
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
|
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
P
Y
 
Y
L
 
L
V
 
G
S
 
A
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
G
 
K
V
 
A
M
 
M
V
 
V
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
K
G
 
D
A
 
F
N
 
S
A
 
D
A
 
N
D
 
T
S
 
S
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
C
V
 
V
K
|
K
H
|
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
R
V
 
V
K
 
R
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
N
D
 
E
Y
 
Y
L
 
F
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
G
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
T
A
 
S
L
x
F
N
 
N
S
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
G
N
 
N
T
 
K
W
 
W
L
 
L
M
 
M
N
 
T
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
R
W
 
I
G
 
G
-
 
A
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
F
A
 
V
V
 
V
S
 
T
D
|
D
H
 
Y
G
 
T
A
 
A
I
 
I
F
 
N
E
 
E
L
 
M
I
 
I
K
 
D
H
 
H
G
 
G
V
 
M
A
 
-
A
 
G
D
 
D
G
 
L
R
 
Q
E
 
T
A
 
V
A
 
S
K
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
K
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
D
M
 
M
N
 
V
D
 
G
T
 
E
L
 
G
Y
 
F
G
 
L
K
 
T
E
 
T
L
 
L
P
 
K
G
 
K
L
 
S
L
 
L
K
 
Q
S
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
I
Q
 
T
Q
 
Q
S
 
A
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
C
R
 
K
A
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
E
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
K
M
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
K
K
 
Y
A
 
C
E
 
N
D
 
E
D
 
E
P
 
R
V
 
A
D
 
R
T
 
T
Y
 
Q
A
 
I
D
 
F
S
 
T
R
 
P
L
 
E
H
 
H
R
 
R
A
 
K
E
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
A
R
 
Q
S
 
S
Q
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
D
N
 
N
D
 
N
T
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
S
A
 
G
K
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
N
P
 
R
I
 
V
D
 
N
M
 
M
M
 
P
G
 
G
S
 
T
W
 
W
A
 
S
A
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
K
P
 
H
A
 
A
Q
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
S
L
 
L
F
 
L
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
K
N
 
K
A
 
A
L
 
A
G
 
G
D
 
N
K
 
D
S
 
A
T
 
R
L
 
I
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
N
I
 
L
T
 
D
S
 
E
D
 
D
P
 
K
K
 
S
I
 
L
L
 
I
G
 
E
Y
 
R
L
 
A
N
 
T
F
 
M
L
 
F
N
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
G
P
 
K
E
 
T
V
 
L
V
 
K
D
 
Y
D
 
D
P
 
P
R
 
R
P
 
P
A
 
K
N
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
D
A
 
I
A
 
A
K
 
N
D
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
A
G
 
E
M
 
M
S
 
S
H
 
G
E
|
E
S
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
T
 
S
D
 
N
L
 
I
N
 
E
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
L
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
A
I
 
L
L
 
T
E
 
W
E
 
E
K
 
H
E
 
E
Q
 
N
A
 
V
D
 
P
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
N
T
 
V
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
A
G
 
G
N
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
D
 
V
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
P
 
S
I
 
A
S
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
T
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
L
 
K
T
 
N
I
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
F
 
L
T
 
P
P
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
W
-
 
F
G
 
Q
N
 
K
Y
 
F
T
 
R
S
 
S
Q
 
N
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
D
 
V
T
 
P
T
 
N
G
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
E
 
K
F
 
F
S
 
T
L
 
Y
S
 
G
D
 
D
M
 
L
A
 
K
L
 
L
S
 
S
S
 
S
T
 
T
T
 
N
L
 
L
N
 
K
K
 
G
T
 
N
G
 
Q
K
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
E
V
 
L
K
 
T
N
 
N
T
 
S
G
 
G
K
 
D
R
 
Y
D
 
D
G
 
G
E
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
R
D
|
D
E
 
L
T
x
V
G
 
G
S
 
S
M
 
T
I
 
T
R
 
R
P
 
P
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
G
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
M
 
F
I
 
L
K
 
K
A
 
K
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
K
 
K
V
 
T
V
 
I
H
 
T
F
 
F
T
 
K
I
 
I
T
 
T
E
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
T
 
Y
Q
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
A
 
D
A
 
W
E
 
E
P
|
P
G
 
G
K
 
E
F
 
F
N
 
V
V
 
I
Q
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
G
D
 
N
S
 
S
E
 
R
D
 
D
V
 
L
T
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
S
 
K
F
 
I
E
 
N
L
 
W
L
 
L

5tf0A Crystal structure of glycosil hydrolase family 3 n-terminal domain protein from bacteroides intestinalis
48% identity, 96% coverage: 28:762/763 of query aligns to 1:733/733 of 5tf0A

query
sites
5tf0A
E
 
Q
N
 
D
K
 
M
E
 
D
A
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
D
N
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
M
 
M
T
 
T
L
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
P
S
 
V
I
 
S
G
 
G
P
 
S
E
 
D
M
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
I
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
K
I
 
I
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
L
F
 
L
N
 
N
S
 
L
I
 
K
T
 
G
R
 
V
P
 
E
E
 
K
N
 
I
R
 
R
P
 
D
M
 
V
Q
 
Q
D
 
K
A
 
L
A
 
A
M
 
I
-
 
E
R
 
K
S
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
L
F
 
I
F
 
F
A
 
G
Y
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
V
H
 
H
G
 
G
H
 
Y
R
 
E
T
 
T
I
 
I
F
 
F
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
C
S
 
S
W
 
W
D
 
D
M
 
M
D
 
E
A
 
A
I
 
I
G
 
R
L
 
K
S
 
S
G
 
A
R
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
D
 
D
S
 
G
L
 
I
D
 
S
I
 
W
T
 
T
F
 
F
A
 
S
P
 
P
M
 
M
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
S
R
 
R
D
 
D
P
 
P
R
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
T
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
N
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
P
Y
 
F
L
 
L
V
 
G
S
 
G
R
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
K
V
 
A
M
 
M
V
 
V
K
 
S
A
 
G
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
I
G
 
D
A
 
L
N
 
N
A
 
N
A
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
N
D
 
D
S
 
E
I
 
I
M
 
M
A
 
A
S
 
C
V
 
V
K
 
K
H
 
H
F
 
F
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
M
S
 
S
P
 
R
V
 
N
K
 
R
M
 
M
Y
 
F
Q
 
N
D
 
E
Y
 
Y
L
 
M
P
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
G
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
A
A
 
S
L
 
F
N
 
N
S
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
T
 
K
W
 
W
L
 
L
M
 
M
N
 
T
D
 
D
L
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
W
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
D
G
 
G
L
 
F
A
 
V
V
 
V
S
 
T
D
|
D
H
 
F
G
 
T
A
 
G
I
 
I
F
 
S
E
 
E
L
 
M
I
 
I
K
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
G
A
 
-
D
 
D
G
 
L
R
 
Q
E
 
T
A
 
V
A
 
S
K
 
A
L
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
M
 
M
S
 
D
M
 
M
N
 
V
D
 
S
T
 
E
L
 
G
Y
 
F
G
 
T
K
 
G
E
 
T
L
 
I
P
 
K
G
 
K
L
 
S
L
 
I
K
 
D
S
 
E
G