SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_698 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_698 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3urhB Crystal structure of a dihydrolipoamide dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021
56% identity, 98% coverage: 4:458/466 of query aligns to 1:458/465 of 3urhB

query
sites
3urhB
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
I
 
V
L
x
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
C
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
K
A
 
V
A
 
A
C
 
V
V
 
V
E
|
E
G
x
K
R
 
R
A
 
S
T
 
T
L
x
Y
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
Y
 
F
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
K
 
Q
G
 
H
A
 
G
E
 
-
F
 
L
A
 
E
N
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
V
 
V
-
 
A
K
 
N
P
 
P
V
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
Q
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
A
Q
 
H
K
 
K
D
 
D
E
 
A
S
 
T
V
 
V
T
 
K
G
 
S
L
 
N
T
 
V
K
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
S
F
 
F
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
 
D
W
 
G
I
 
F
R
 
Q
G
 
G
W
x
T
G
|
G
H
 
K
I
 
V
D
 
L
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
S
V
 
V
T
 
T
D
 
N
S
 
E
A
 
K
G
 
G
G
 
E
K
 
E
T
 
Q
E
 
V
L
 
L
S
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
N
I
 
V
I
 
V
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
D
P
 
V
T
 
A
P
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
E
I
 
V
-
 
A
-
 
F
D
 
D
N
 
E
K
 
K
R
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
E
E
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
A
H
 
S
L
 
M
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
D
 
D
R
 
T
I
 
I
C
 
L
P
 
G
G
 
G
V
 
M
D
 
D
I
 
G
E
 
E
A
 
V
G
 
A
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
S
 
M
L
 
L
S
 
T
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
S
 
G
A
 
A
T
 
V
T
 
K
S
 
S
A
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
A
Q
 
K
L
 
V
S
 
T
I
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
A
E
 
T
L
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
A
D
 
E
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
I
 
T
G
 
G
R
|
R
R
 
K
P
 
P
Y
 
S
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
A
N
 
K
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
V
T
 
L
D
 
D
K
 
S
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
V
A
 
E
N
 
I
K
 
D
G
 
R
H
 
H
-
 
F
R
 
Q
T
 
T
E
 
S
A
 
I
V
 
A
G
 
G
V
 
V
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
R
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
G
M
 
V
A
 
A
C
 
V
V
 
A
E
 
E
Q
 
I
M
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
N
 
D
L
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
A
N
 
N
S
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
R
I
 
A
N
 
M
H
 
L
E
 
Q
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
F
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
R
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
G
H
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
F
S
 
G
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
I
G
 
H
E
 
E
Y
 
I
C
 
A
V
 
V
A
 
L
M
 
M
E
 
E
F
 
F
S
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
G
L
 
R
T
 
T
C
 
C
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
M
S
 
S
E
|
E
A
 
A
L
 
V
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
N
 
S

P31023 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; Pyruvate dehydrogenase complex E3 subunit; E3; PDC-E3; EC 1.8.1.4 from Pisum sativum (Garden pea) (Lathyrus oleraceus) (see 2 papers)
56% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 39:492/501 of P31023

query
sites
P31023
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
T
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
|
R
A
x
G
T
x
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
S
S
 
S
E
 
H
L
 
M
Y
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
S
E
 
-
F
 
F
A
 
A
N
 
N
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
V
K
 
S
P
 
N
V
 
V
-
 
E
L
 
I
N
 
D
L
 
L
N
 
A
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
K
 
G
Q
 
Q
K
 
K
D
 
D
E
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
G
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
T
W
 
Y
I
 
V
R
 
K
G
 
G
W
 
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
F
D
 
V
G
 
S
P
 
P
G
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
D
D
 
T
S
 
I
A
 
E
G
 
G
G
 
E
K
 
N
T
 
T
E
 
V
L
 
V
S
 
K
A
 
G
R
 
K
D
 
H
I
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
D
P
 
V
T
 
K
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
K
R
 
K
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
S
E
 
E
V
 
I
P
 
P
K
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
S
Q
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
A
D
 
S
R
 
E
I
 
I
C
 
V
P
 
P
G
 
T
V
 
M
D
 
D
I
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
K
S
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
S
 
G
A
 
V
T
 
D
T
 
T
S
 
S
A
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
T
I
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
Q
E
 
T
L
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
T
P
 
P
Y
 
F
T
 
T
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
R
 
L
G
 
G
-
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
V
N
 
N
K
 
E
G
 
R
H
 
F
R
 
S
T
 
T
E
 
N
A
 
V
V
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
I
S
 
P
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
G
M
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
Y
M
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
H
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
N
 
D
L
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
K
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
T
G
 
G
R
 
V
A
 
E
Y
 
Y
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
A
N
 
I
H
 
D
E
 
N
T
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
K
R
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
L
 
I
V
 
M
G
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
G
 
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
Q
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
P
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
T
R
 
M
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M

Sites not aligning to the query:

1dxlA Dihydrolipoamide dehydrogenase of glycine decarboxylase from pisum sativum (see paper)
56% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 5:458/467 of 1dxlA

query
sites
1dxlA
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
L
x
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
T
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
|
R
A
 
G
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
S
S
 
S
E
 
H
L
 
M
Y
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
S
E
 
-
F
 
F
A
 
A
N
 
N
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
V
K
 
S
P
 
N
V
 
V
-
 
E
L
 
I
N
 
D
L
 
L
N
 
A
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
K
 
G
Q
 
Q
K
 
K
D
 
D
E
 
K
S
 
A
V
 
V
T
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
G
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
T
W
 
Y
I
 
V
R
 
K
G
 
G
W
x
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
F
D
 
V
G
 
S
P
 
P
G
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
S
V
 
V
T
 
D
D
 
T
S
 
I
A
 
E
G
 
G
G
 
E
K
 
N
T
 
T
E
 
V
L
 
V
S
 
K
A
 
G
R
 
K
D
 
H
I
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
D
P
 
V
T
 
K
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
K
R
 
K
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
S
E
 
E
V
 
I
P
 
P
K
 
K
H
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
x
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
S
Q
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
A
D
 
S
R
 
E
I
 
I
C
 
V
P
 
P
G
 
T
V
 
M
D
 
D
I
 
A
E
 
E
A
 
I
G
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
E
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
K
S
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
S
 
G
A
 
V
T
 
D
T
 
T
S
 
S
A
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
L
 
L
S
 
T
I
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
E
A
 
Q
E
 
T
L
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
R
|
R
R
 
T
P
 
P
Y
 
F
T
 
T
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
N
L
 
L
E
 
D
N
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
E
T
 
T
D
 
D
K
 
K
R
 
L
G
 
G
-
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
V
N
 
N
K
 
E
G
 
R
H
 
F
R
 
S
T
 
T
E
 
N
A
 
V
V
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
I
S
 
P
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
G
M
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
Y
M
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
G
E
 
H
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
N
 
D
L
 
K
I
 
V
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
K
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
E
E
 
T
G
 
G
R
 
V
A
 
E
Y
 
Y
K
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
A
N
 
I
H
 
D
E
 
N
T
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
K
R
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
L
 
I
V
 
M
G
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
G
 
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
Q
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
M
S
 
S
E
|
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M

1zmdA Crystal structure of human dihydrolipoamide dehydrogenase complexed to nadh (see paper)
55% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 6:462/472 of 1zmdA

query
sites
1zmdA
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
V
L
x
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
V
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
A
 
E
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
H
A
 
M
A
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
T
E
 
D
F
 
F
A
 
A
N
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
M
K
 
S
P
 
E
V
 
V
-
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
D
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
D
 
S
E
 
T
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
V
W
 
H
I
 
V
R
 
N
G
 
G
W
x
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
K
G
 
N
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
T
D
 
K
S
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
T
T
 
Q
E
 
V
L
 
I
S
 
D
A
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
I
I
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
E
P
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
K
E
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
|
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
|
E
F
|
F
L
|
L
D
 
G
R
 
H
I
 
V
C
 
G
-
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
M
E
 
E
A
 
I
G
 
S
K
 
K
T
 
N
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
I
L
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
N
S
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
S
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
K
S
 
K
A
 
S
T
 
D
G
 
G
-
 
K
V
 
I
Q
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
|
I
G
|
G
R
|
R
R
 
R
P
 
P
Y
x
F
T
 
T
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
P
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
I
-
 
P
A
 
V
N
 
N
K
 
T
G
 
R
H
 
F
R
 
Q
T
 
T
E
 
K
A
 
I
V
 
P
G
 
N
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
G
M
 
I
A
 
I
C
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
A
G
 
V
E
 
H
V
 
I
N
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
|
V
V
 
I
Y
|
Y
T
 
T
K
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
I
A
 
E
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
M
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
E
 
K
R
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
G
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
V
G
 
N
E
 
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L

1zmcA Crystal structure of human dihydrolipoamide dehydrogenase complexed to NAD+ (see paper)
55% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 6:462/472 of 1zmcA

query
sites
1zmcA
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
V
L
x
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
V
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
A
 
E
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
H
A
 
M
A
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
T
E
 
D
F
 
F
A
 
A
N
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
M
K
 
S
P
 
E
V
 
V
-
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
D
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
D
 
S
E
 
T
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
V
W
 
H
I
 
V
R
 
N
G
 
G
W
x
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
K
G
 
N
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
T
D
 
K
S
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
T
T
 
Q
E
 
V
L
 
I
S
 
D
A
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
I
I
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
E
P
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
K
E
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
|
V
E
|
E
F
|
F
L
|
L
D
 
G
R
 
H
I
 
V
C
 
G
-
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
M
E
 
E
A
 
I
G
 
S
K
 
K
T
 
N
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
I
L
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
N
S
 
T
K
|
K
V
|
V
T
 
T
S
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
K
S
 
K
A
 
S
T
 
D
G
 
G
-
 
K
V
 
I
Q
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
|
I
G
|
G
R
|
R
R
 
R
P
 
P
Y
x
F
T
 
T
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
P
R
|
R
G
 
G
M
 
R
L
 
I
-
 
P
A
 
V
N
 
N
K
 
T
G
 
R
H
 
F
R
 
Q
T
 
T
E
 
K
A
 
I
V
 
P
G
 
N
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
G
M
 
I
A
 
I
C
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
A
G
 
V
E
 
H
V
 
I
N
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
K
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
I
A
 
E
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
M
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
E
 
K
R
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
G
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
V
G
 
N
E
 
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L

P09622 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; EC 1.8.1.4 from Homo sapiens (Human) (see 14 papers)
55% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 43:499/509 of P09622

query
sites
P09622
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
V
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
A
x
E
T
|
T
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
M
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
H
A
 
M
A
 
A
K
 
H
G
 
G
A
x
K
E
 
D
F
 
F
A
 
A
N
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
M
K
 
S
P
 
E
V
 
V
-
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
D
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
D
 
S
E
 
T
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
V
W
 
H
I
 
V
R
 
N
G
 
G
W
 
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
K
G
 
N
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
T
D
 
K
S
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
T
T
 
Q
E
 
V
L
 
I
S
 
D
A
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
I
I
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
|
S
E
 
E
P
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
K
E
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
|
G
L
x
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
|
E
F
 
F
L
 
L
D
 
G
R
 
H
I
 
V
C
 
G
-
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
M
E
 
E
A
 
I
G
 
S
K
 
K
T
 
N
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
I
L
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
N
S
 
T
K
 
K
V
|
V
T
 
T
S
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
K
S
 
K
A
 
S
T
 
D
G
 
G
-
 
K
V
 
I
Q
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
|
G
R
 
R
R
 
R
P
 
P
Y
 
F
T
 
T
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
P
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
I
-
 
P
A
 
V
N
 
N
K
 
T
G
 
R
H
 
F
R
 
Q
T
 
T
E
 
K
A
 
I
V
 
P
G
 
N
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
G
M
 
I
A
 
I
C
 
C
V
 
V
E
|
E
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
A
G
 
V
E
x
H
V
 
I
N
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
K
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
I
A
 
E
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
M
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
E
 
K
R
 
S
T
 
T
D
|
D
E
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
G
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
V
G
 
N
E
|
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
x
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
C
E
 
E
D
|
D
I
 
I
A
 
A
L
x
R
T
 
V
C
 
C
H
|
H
P
 
A
H
 
H
P
|
P
T
 
T
R
 
L
S
|
S
E
|
E
A
 
A
L
 
F
R
|
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6hg8B Crystal structure of the r460g disease-causing mutant of the human dihydrolipoamide dehydrogenase.
55% identity, 97% coverage: 5:457/466 of query aligns to 16:472/482 of 6hg8B

query
sites
6hg8B
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
V
L
x
I
G
 
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
V
C
 
C
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
x
N
A
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
H
A
 
M
A
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
K
E
 
D
F
 
F
A
 
A
N
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
M
K
 
S
P
 
E
V
 
V
-
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
D
Q
 
K
M
 
M
M
 
M
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
D
 
S
E
 
T
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
F
 
H
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
Q
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
V
W
 
H
I
 
V
R
 
N
G
 
G
W
x
Y
G
|
G
H
 
K
I
 
I
D
 
T
G
 
G
P
 
K
G
 
N
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
T
D
 
K
S
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
T
T
 
Q
E
 
V
L
 
I
S
 
D
A
 
T
R
 
K
D
 
N
I
 
I
I
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
E
P
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
D
R
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
K
E
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
E
H
 
K
L
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
D
 
G
R
 
H
I
 
V
C
 
G
-
 
G
P
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
M
E
 
E
A
 
I
G
 
S
K
 
K
T
 
N
L
 
F
Q
 
Q
R
 
R
S
 
I
L
 
L
S
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
S
 
K
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
N
S
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
S
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
K
S
 
K
A
 
S
T
 
D
G
 
G
-
 
K
V
 
I
Q
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
E
 
E
P
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
 
G
R
|
R
R
 
R
P
 
P
Y
x
F
T
 
T
Q
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
P
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
I
-
 
P
A
 
V
N
 
N
K
 
T
G
 
R
H
 
F
R
 
Q
T
 
T
E
 
K
A
 
I
V
 
P
G
 
N
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
G
M
 
I
A
 
I
C
 
C
V
 
V
E
 
E
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
A
G
 
V
E
 
H
V
 
I
N
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
C
I
 
V
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
K
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
I
A
 
E
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
T
N
 
N
H
 
A
E
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
M
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
E
 
K
R
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
G
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
V
G
 
N
E
 
E
Y
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
C
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
L
S
 
S
E
|
E
A
 
A
L
 
F
R
 
G
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
L

6uziC Crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from elizabethkingia anophelis nuhp1
50% identity, 99% coverage: 1:461/466 of query aligns to 4:464/470 of 6uziC

query
sites
6uziC
M
 
M
S
 
N
T
 
Q
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
V
L
x
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
C
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
T
A
 
V
C
 
I
V
 
I
E
|
E
G
x
K
R
 
Y
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
H
Y
 
F
D
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
K
G
 
H
A
 
T
E
 
-
F
 
F
A
 
A
N
 
T
L
 
H
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
I
-
 
D
K
 
E
P
 
P
V
 
K
L
 
V
N
 
D
L
 
I
N
 
A
Q
 
Q
M
 
M
M
 
I
K
 
S
Q
 
R
K
 
K
D
 
N
E
 
D
S
 
V
V
 
V
T
 
D
G
 
Q
L
 
T
T
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
N
F
 
F
L
 
L
F
 
M
R
 
D
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
I
D
 
T
W
 
V
I
 
L
R
 
Q
G
 
G
W
x
V
G
|
G
H
 
S
I
 
F
D
 
E
G
 
S
P
 
A
G
 
T
K
 
Q
V
 
I
T
 
K
V
 
V
T
 
T
D
 
K
S
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
S
K
 
S
T
 
E
E
 
V
L
 
I
S
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
N
I
 
T
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
E
 
K
P
 
P
T
 
S
P
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
F
V
 
I
D
 
T
I
 
L
D
 
D
N
 
K
K
 
E
R
 
R
I
 
V
L
 
I
D
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
L
T
 
K
E
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
I
C
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
M
D
 
D
I
 
G
E
 
T
A
 
L
G
 
S
K
 
K
T
 
E
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
S
 
T
L
 
L
S
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
S
 
K
F
 
F
K
 
M
L
 
L
S
 
S
S
 
T
K
 
A
V
 
V
T
 
S
S
 
G
A
 
V
T
 
E
T
 
R
S
 
N
A
 
G
T
 
D
G
 
T
V
 
V
Q
 
K
L
 
V
S
 
T
I
 
A
E
 
K
P
 
D
A
 
K
A
 
K
G
 
G
G
 
E
A
 
D
A
 
V
E
 
-
L
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
C
L
 
L
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
R
|
R
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
K
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
E
T
 
L
D
 
D
K
 
E
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
V
A
 
K
N
 
T
K
 
N
G
 
D
H
 
H
-
 
L
R
 
Q
T
 
T
E
 
N
A
 
V
V
 
P
G
 
N
V
 
I
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
S
 
K
G
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
G
M
 
V
A
 
F
C
 
V
V
 
A
E
 
E
Q
 
T
M
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
K
G
 
P
E
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
G
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
K
 
W
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
V
 
T
G
 
G
K
 
S
F
 
F
P
 
P
F
 
M
T
 
R
A
 
A
N
 
L
S
 
G
R
 
R
A
 
S
K
 
R
I
 
A
N
 
S
H
 
M
E
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
K
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
L
 
M
V
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
R
V
 
A
S
 
A
E
 
D
M
 
M
I
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
C
 
V
V
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
E
F
 
F
S
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
I
C
 
S
H
 
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
T
E
|
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
T
G
 
G

P09624 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; DLD; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E3; OGDC-E3; OGDHC subunit E3; Alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex subunit E3; alpha-KGDHC subunit E3; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Dihydrolipoamide:NAD(+) oxidoreductase; Glycine decarboxylase complex subunit L; GDC subunit L; Lipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase complex; Pyruvate dehydrogenase complex E3 component; PDC subunit E3; PDH complex subunit E3; EC 1.8.1.4 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
52% identity, 98% coverage: 3:457/466 of query aligns to 26:490/499 of P09624

query
sites
P09624
T
 
S
Y
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
N
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
N
A
 
T
A
 
A
C
 
C
V
 
V
E
|
E
G
x
K
R
|
R
A
x
G
T
x
K
L
|
L
G
|
G
G
|
G
T
|
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
M
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
N
A
 
N
S
 
S
E
 
H
L
 
L
Y
 
F
D
 
H
A
 
Q
A
 
M
K
 
H
G
 
-
A
 
T
E
 
E
F
 
A
A
 
Q
N
 
K
L
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
D
V
 
V
K
 
N
P
 
G
V
 
D
L
 
I
N
 
K
L
 
I
N
 
N
-
 
V
-
 
A
Q
 
N
M
 
F
M
 
Q
K
 
K
Q
 
A
K
 
K
D
 
D
E
 
D
S
 
A
V
 
V
T
 
K
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
L
L
 
L
F
 
F
R
 
K
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
T
W
 
Y
I
 
Y
R
 
K
G
 
G
W
 
N
G
|
G
H
 
S
I
 
F
D
 
E
G
 
D
P
 
E
G
 
T
K
 
K
V
 
I
T
 
R
V
 
V
T
 
T
-
 
P
-
 
V
D
 
D
S
 
G
A
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
T
T
 
V
E
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
V
R
 
K
D
 
N
I
 
I
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
P
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
E
K
 
E
R
 
K
I
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
K
E
 
E
V
 
I
P
 
P
K
 
K
H
 
R
L
 
L
V
 
T
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
V
W
 
Y
R
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
Q
D
 
P
R
 
Q
I
 
I
C
 
G
P
 
A
G
 
S
V
 
M
D
 
D
I
 
G
E
 
E
A
 
V
G
 
A
K
 
K
T
 
A
L
 
T
Q
 
Q
R
 
K
S
 
F
L
 
L
S
 
K
K
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
S
S
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
I
S
 
S
A
 
A
-
 
K
-
 
R
T
 
N
T
 
D
S
 
D
A
 
K
T
 
N
G
 
V
V
 
V
Q
 
E
L
 
I
S
 
V
I
 
V
E
 
E
P
 
D
A
 
T
A
 
K
G
 
T
G
 
N
A
 
K
A
 
Q
E
 
E
L
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
A
D
 
E
Y
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
R
 
R
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
T
 
I
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
E
 
E
N
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
G
 
G
M
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
I
N
 
D
K
 
D
G
 
Q
H
 
F
R
 
N
T
 
S
E
 
K
A
 
F
V
 
P
G
 
H
V
 
I
W
 
K
V
 
V
I
 
V
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
T
S
 
F
G
 
G
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
E
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
G
M
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
M
M
 
L
V
 
K
G
 
T
K
 
G
A
 
H
G
 
G
E
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
L
 
N
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
V
 
M
Y
 
Y
T
 
S
K
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
I
A
 
D
Y
 
Y
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
K
F
 
F
P
 
P
F
 
F
T
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
S
R
 
R
A
 
A
K
 
K
I
 
T
N
 
N
H
 
Q
E
 
D
T
 
T
E
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
K
T
 
T
D
 
E
E
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
N
V
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
C
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
F
 
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
L
 
R
T
 
V
C
 
C
H
 
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
R
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
N
M
 
M

Sites not aligning to the query:

1v59A Crystal structure of yeast lipoamide dehydrogenase complexed with NAD+
52% identity, 98% coverage: 3:457/466 of query aligns to 5:469/478 of 1v59A

query
sites
1v59A
T
 
S
Y
 
H
D
 
D
V
 
V
V